Mario Inostroza-Ponta

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  • Última atualização do currículo em 18/05/2018


Mario Inostroza-Ponta obteve seu mestrado em 2000 pela Universidad de Santiago, no Chile e seu PhD em 2008 pela Universidade de Newcastle, na Austrália. Ele é membro do Departamento de Ingeniería Informática, Universidad de Santiago de Chile, desde 2002. Além disso, ele tem experiência de trabalho da indústria no desenvolvimento e integração de plataformas de provisionamento. Sua principal experiência é em Engenharia de Computação e Ciência da Computação, especificamente nas áreas de heurísticas e metaheurísticas aplicadas a problemas de otimização combinatória na programação e bioinformática, entre outros. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Mario Inostroza-Ponta
Nome em citações bibliográficas
INOSTROZA-PONTA, M.;Inostroza-Ponta, Mario;Inostroza, M;Mario Inostroza-Ponta

Endereço


Endereço Profissional
Universidad de Santiago de Chile, Facultad de Ingeniería, Departamento de Ingeniería Informática.
Av Ecuador 3659.
Estación Central
Santiago, - Chile
Telefone: (562) 7180914


Formação acadêmica/titulação


2004 - 2008
Doutorado em PhD Computer Science.
The University of Newcastle Australia, NEWCASTLE, Austrália.
Título: An integrated and scalable approach based on combinatorial optimization techniques for the analysis of microarray data, Ano de obtenção: 2008.
Orientador: Pablo Moscato.
Bolsista do(a): University of Newcastle Research Scholarship, UNRS, Austrália.
Palavras-chave: bioinformatica; clustering; gene expression; functional analysis; metaheuristic; quadratic assignment problem.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Bioinformática.
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Optimización combinatoria.
1998 - 2000
Mestrado profissional em Magister en Ingeniería Informática.
Universidad de Santiago de Chile, USACH, Chile.
Título: Scheduler para un compilador paralelo de multiprocesadores con memoria compartida, Ano de Obtenção: 2001.
Orientador: Mauricio Solar Fuentes.
Bolsista do(a): Departamento de Ingeniería Informática, DIINF-USACH, Chile.
Palavras-chave: dag; graph partition; parallel computing; scheduling.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Teoria da Computação / Especialidade: Análise de Algoritmos e Complexidade de Computação.
1994 - 2000
Graduação em Ingeniería Civil en Informática.
Universidad de Santiago de Chile, USACH, Chile.
Título: Scheduler para un compilador paralelo de multiprocesadores con memoria compartida.
Orientador: Mauricio Solar Fuentes.


Pós-doutorado


2012 - 2013
Pós-Doutorado.
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Bioinformática.


Formação Complementar


2010 - 2011
Diplomado en Docencia Universitaria.
Universidad de Santiago de Chile, USACH, Chile.


Atuação Profissional



Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.
Vínculo institucional

2013 - Atual
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Investigador


The University of Newcastle Australia, NEWCASTLE, Austrália.
Vínculo institucional

2007 - 2007
Vínculo: Profesor contratado, Enquadramento Funcional: Profesor de Laboratorio, Carga horária: 4


Universidad de Santiago de Chile, USACH, Chile.
Vínculo institucional

2016 - Atual
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Director de Desarrollo Institucional, Carga horária: 44

Vínculo institucional

2015 - Atual
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Profesor Asociado, Carga horária: 44

Vínculo institucional

2002 - 2015
Vínculo: , Enquadramento Funcional: Profesor Asistente, Carga horária: 40
Outras informações
Departamento de Ingeniería Informática

Atividades

02/2010 - Atual
Ensino, Magister en Ingeniería Informática, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Introducción a Bioinformática
12/2008 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , VRID, DICYT.

07/2002 - Atual
Ensino, Ingeniería Civil en Informática, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Proyecto de Seminario de Título
Sistemas Operativos
Organización de Computadores
Estructura de Computadores
Autómatas y Lenguajes Formales
Sistemas Distribuidos
Algoritmos y Estructuras de Datos
07/2009 - 06/2011
Direção e administração, Facultad de Ingeniería, Departamento de Ingeniería Informática.

Cargo ou função
Subdirector de Extensión.
08/2008 - 06/2009
Direção e administração, Facultad de Ingeniería, Departamento de Ingeniería Informática.

Cargo ou função
Jefe de Carrera Ing de Ejecución.

NorthSupply Chile, NORTHSUPPLY, Chile.
Vínculo institucional

2001 - 2002
Vínculo: Empregado, Enquadramento Funcional: Engenheiro de Projeto, Carga horária: 40


INACAP Chile, INACAP, Chile.
Vínculo institucional

1998 - 2002
Vínculo: Horista, Enquadramento Funcional: Professor por hora, Carga horária: 6

Atividades

03/1998 - 06/2002
Ensino, Ing Gestión en Informática, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Fundamentos de Programación
Análisis de Algoritmos


Linhas de pesquisa


1.
Metaheurísticas
2.
Optimización Combinatorial
3.
Bioinformática


Projetos de pesquisa


2017 - Atual
PaDMetBio: Parallel and Distributed Metaheuritics for Structural Bioinformatics
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (2) .
Integrantes: Mario Inostroza-Ponta - Coordenador / DORN, MÁRCIO - Integrante.
2016 - Atual
Metaheurísticas robustas para enfrentar problemas de optimización multiobjetivos en bioinformática
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2013 - Atual
Federated Cloud Computing for Bioinformatics: Infrastructure, Algorithms and Applications
Descrição: This international collaborative project involves three research areas: High Performance Computing, Data Storage/Retrieval and Bioinformatics applications. It will integrate the efforts of the INRIA-Saclay, Mines ParisTech, Universidade de Brasília, Universidade Federal Fluminense, Embrapa-Cenargen and Universidad de Santiago de Chile in order to achieve the following goals: investigate which characteristics of Bioinformatics Applications have to be considered when choosing/proposing a Federated Cloud infrastructure; characteristics such as large-scale data management, workflow orchestration/integration and resource federation will be studied in detail. Investigate and propose new Bioinformatics tools that are adapted to the Federated Cloud environment; investigate and propose new Bioinformatics algorithms that deal with huge data sets, aiming to reduce execution time and/or the amount of memory needed, making them suitable for Federated Cloud Computing environments; investigate which performance metrics must be taken into consideration when running applications on a Federated Cloud environment; joint publications in Journals and Conferences in the areas of Computer Science and Bioinformatics. Fazem parte do projeto, as seguintes instituições: Brasil - UnB, Embrapa/CENARGEN e UFF; França - Mines ParisTech e INRIA/Paris-Sud University; Chile: Universidad de Santiago de Chile...
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2013 - Atual
Aplicação de Técnicas de Aprendizagem de Máquina e Otimização no Desenvolvimento de Estratégias Computacionais para a Predição em Silico da Estrutura Tridimensional de Proteínas
Descrição: As proteínas ou polipeptídeos são macromoléculas que estão envolvidas na maior parte das transformações moleculares que ocorrem nos seres vivos. Estas transformações representam as funções que uma dada proteína exerce no organismo (transporte, de catálise, entre outras). Uma proteína é constituída por uma seqüência de aminoácidos, comumente denominada estrutura primária, que forma uma cadeia polipeptídica por meio da polimerização representada por uma reação de condensação. A ligação CO-NH (grupo carboxílico - grupo amino) resultante, entre aminoácidos contíguos, é conhecida como ligação peptídica. A cadeia polipeptídica de uma proteína, em seu estado nativo, enovela-se assumindo uma conformação única (estrutura terciária). Esta conformação ou estrutura tridimensional (3D) determina a função que a proteína irá exercer na célula ou organismo. Este conhecimento é de fundamental importância no desenvolvimento de compostos químicos (fármacos) que possam inibir ou ativar a função de desta proteína no organismo. Experimentalmente, a estrutura tridimensional de uma proteína pode ser obtida através de técnicas de cristalografia por difração de raios X ou por espectroscopia de ressonância magnética nuclear (NMR, sigla em inglês). Entretanto, devido às diversas dificuldades, incluindo o alto custo e o elevado tempo demandado por estas técnicas, a determinação da estrutura 3D de proteínas ainda é um problema que desafia os cientistas. Cientistas de áreas como a ciência da computação, engenharia, bioinformática, matemática, física e química estão empenhados na construção de métodos e estratégias computacionais que possam determinar a estrutura tridimensional de polipeptídeos a partir da seqüência primária da proteína. Este projeto de pesquisa tem como objetivo o estudo, desenvolvimento e aplicação de técnicas aprendizagem de máquina e otimização na construção de estratégias computacionais para predição em sílico da estrutura tridimensional de polipeptídeos.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2013 - Atual
Desenvolvimento de métodos e estratégias computacionais para a predição da estrutura tridimensional de polipeptídeos
Descrição: Este projeto de pesquisa visa o estudo e o desenvolvimento de estratégias computacionais para a predição in-silico da estrutura tridimensional de polipeptídeos. Este projeto de pesquisa tem os seguintes objetivos específicos: (a) Estudo do problema da predição da estrutura 3D de proteínas in-silico e o desenvolvimento de estratégias computacionais para extração e manipulação de grandes quantidades de dados estruturais de polipeptídeos/proteínas determinados por meios experimentais (NMR e Raios X); (b) Estudo do problema da glicosilação de proteínas. Desenvolvimento de estratégias computacionais para manipulação de estruturas de carboidratos e simulação computacional da formação de gliconjugados; (c) Desenvolvimento de métodos e ferramentas computacionais que permitam o estudo do impacto na estrutura 3D de uma proteína quando da presença de carboidratos; (d) Estudo, desenvolvimento e aplicação de técnicas de otimização (metaheurísticas) e de aprendizagem de máquina no desenvolvimento de estratégias computacionais para a predição da estrutura 3D de proteínas; (e) Investigação e desenvolvimento de técnicas mais robustas para busca do espaço conformacional de polipeptídeos. Melhoria de métodos atuais que realizam a predição da estrutura 3D aproximada de polipeptídeos; e (f) Desenvolvimento e disponibilização a comunidade científica de ferramentas computacionais para o estudo e manipulação de dados biológicos (proteínas e gliconjugados)...
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2012 - Atual
Designing and constructing a scalable pipeline of graph-based methods for the analysis of gene expression data
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2009 - 2010
Uso de algoritmos de grafos, optimización combinatorial y bases de datos biológicas para el análisis de datos de expresión genética
Descrição: En este proyecto se estudia la relación existente entre los resultados computacionales obtenidos al utilizar métodos y algoritmos basados en grafos y optimización combinatoria, para los problemas de agrupamiento ("clustering") y visualización sobre datos de expresión genética..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado profissional: (1) .
Integrantes: Mario Inostroza-Ponta - Coordenador.Financiador(es): Universidad de Santiago de Chile - Bolsa.
Número de produções C, T & A: 1 / Número de orientações: 5


Revisor de periódico


2009 - Atual
Periódico: Bioinformatics (Oxford. Online)
2010 - Atual
Periódico: IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (Print)
2009 - Atual
Periódico: Journal of Organizational Computing and Electronic Commerce (Online)
2011 - Atual
Periódico: Optimization Letters - 1862-4472


Áreas de atuação


1.
Grande área: Engenharias / Área: Engenharia Elétrica / Subárea: Sistemas Informáticos e Computação.
2.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: ENGENHARIAS EN INFORMÁTICA.
3.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Bioinformática.


Idiomas


Espanhol
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Português
Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.


Prêmios e títulos


2008
Profesor destacado, Facultad de Ingeniería,Universidad de Santiago de Chile.


Produções



Produção bibliográfica
Citações

Web of Science
Total de trabalhos:13
Total de citações:169
Fator H:6
Inostroza-Ponta, Mario  Data: 28/10/2015

Artigos completos publicados em periódicos

1.
VILLALOBOS-CID, MANUEL2016VILLALOBOS-CID, MANUEL ; Chacón, Max ; ZITKO, PEDRO ; Inostroza-Ponta, Mario . A New Strategy to Evaluate Technical Efficiency in Hospitals Using Homogeneous Groups of Casemix. Journal of Medical Systems, v. 40, p. 103, 2016.

2.
BORGUESAN, BRUNO2016BORGUESAN, BRUNO ; Inostroza-Ponta, Mario ; DORN, MÁRCIO . NIAS-Server: Neighbors Influence of Amino acids and Secondary Structures in Proteins. JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY, v. epub, p. Epub ahead of p, 2016.

3.
CORREA, LEONARDO2016CORREA, LEONARDO ; BORGUESAN, BRUNO ; FARFAN, CAMILO ; Inostroza-Ponta, Mario ; DORN, MARCIO . A Memetic Algorithm for 3-D Protein Structure Prediction Problem. IEEE-ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, v. epub, p. 1-1, 2016.

4.
BORGUESAN, BRUNO2015 BORGUESAN, BRUNO ; E SILVA, MARIEL BARBACHAN ; GRISCI, BRUNO ; Inostroza-Ponta, Mario ; DORN, MÁRCIO . APL: An angle probability list to improve knowledge-based metaheuristics for the three-dimensional protein structure prediction. Computational Biology and Chemistry (Print), v. 59, p. 142-157, 2015.

5.
RAMÍREZ-CASTRILLÓN, MAURICIO2014RAMÍREZ-CASTRILLÓN, MAURICIO ; MENDES, SANDRA DENISE CAMARGO ; Inostroza-Ponta, Mario ; VALENTE, PATRICIA . (GTG)5 MSP-PCR Fingerprinting as a Technique for Discrimination of Wine Associated Yeasts?. Plos One, v. 9, p. e105870, 2014.

6.
Clark, M. B.2012 Clark, M. B. ; Johnston, R. L. ; INOSTROZA-PONTA, M. ; Fox, A. H. ; Fortini, E. ; Moscato, P. ; Dinger, M. E. ; Mattick, J. S. . Genome-wide analysis of long noncoding RNA stability. Genome Research, v. 22, p. 885-898, 2012.

7.
Inostroza-Ponta, Mario2011 Inostroza-Ponta, Mario; Berretta, Regina ; Moscato, Pablo . QAPgrid: A Two Level QAP-Based Approach for Large-Scale Data Analysis and Visualization. Plos One, v. 6, p. e14468, 2011.

8.
Riveros, Carlos2010 Riveros, Carlos ; Mellor, Drew ; Gandhi, Kaushal S. ; McKay, Fiona C. ; Cox, Mathew B. ; Berretta, Regina ; Vaezpour, S. Yahya ; Inostroza-Ponta, Mario ; Broadley, Simon A. ; Heard, Robert N. ; Vucic, Stephen ; Stewart, Graeme J. ; Williams, David W. ; Scott, Rodney J. ; Lechner-Scott, Jeanette ; Booth, David R. ; Moscato, Pablo . A Transcription Factor Map as Revealed by a Genome-Wide Gene Expression Analysis of Whole-Blood mRNA Transcriptome in Multiple Sclerosis. Plos One, v. 5, p. e14176, 2010.

9.
Capp, Anne2009 Capp, Anne ; Inostroza-Ponta, Mario ; Bill, Dana ; Moscato, Pablo ; Lai, Chi ; Christie, David ; Lamb, David ; Turner, Sandra ; Joseph, David ; Matthews, John ; Atkinson, Chris ; North, John ; Poulsen, Michael ; Spry, Nigel A. ; Tai, Keen-Hun ; Wynne, Chris ; Duchesne, Gillian ; Steigler, Allison ; Denham, James W. . Is there more than one proctitis syndrome? A revisitation using data from the TROG 96.01 trial. Radiotherapy and Oncology, v. 90, p. 400-407, 2009.

Capítulos de livros publicados
1.
Warren, Chloe ; Inostroza-Ponta, Mario ; Moscato, Pablo . Using the QAPgrid Visualization Approach for Biomarker Identification of Cell-Specific Transcriptomic Signatures. Methods in Molecular Biology. 1ed.: Springer New York, 2017, v. , p. 271-297.

2.
Inostroza-Ponta, Mario; de Vries, Natalie Jane ; Moscato, Pablo . World s Best Universities and Personalized Rankings. Handbook of Heuristics. 1ed.: Springer International Publishing, 2016, v. , p. 1-37.

Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1.
PARRAGA-ALAVA, JORGE ; DORN, MARCIO ; Inostroza-Ponta, Mario . Using local search strategies to improve the performance of NSGA-II for the Multi-Criteria Minimum Spanning Tree problem. In: 2017 IEEE Congress on Evolutionary Computation (CEC), 2017, Donostia. 2017 IEEE Congress on Evolutionary Computation (CEC), 2017. p. 1119.

2.
DE LIMA CORREA, LEONARDO ; Inostroza-Ponta, Mario ; DORN, MARCIO . An evolutionary multi-agent algorithm to explore the high degree of selectivity in three-dimensional protein structures. In: 2017 IEEE Congress on Evolutionary Computation (CEC), 2017, Donostia. 2017 IEEE Congress on Evolutionary Computation (CEC), 2017. p. 1111.

3.
ESCOBAR, IVAN ; HIDALGO, NICOLAS ; Inostroza-Ponta, Mario ; MARIN, MAURICIO ; ROSAS, ERIKA ; DORN, MARCIO . Evaluation of a combined energy fitness function for a distributed memetic algorithm to tackle the 3D protein structure prediction problem. In: 2016 35th International Conference of the Chilean Computer Science Society (SCCC), 2016, Valparaíso. 2016 35th International Conference of the Chilean Computer Science Society (SCCC), 2016. p. 1.

4.
PARRAGA-ALAVA, JORGE ; Inostroza-Ponta, Mario . A bi-objective model for gene clustering combining expression data and external biological knowledge. In: 2016 XLII Latin American Computing Conference (CLEI), 2016, Valparaíso. 2016 XLII Latin American Computing Conference (CLEI), 2016. p. 1.

5.
HARRIS, MATTHEW ; Berretta, Regina ; Inostroza-Ponta, Mario ; Moscato, Pablo . A memetic algorithm for the quadratic assignment problem with parallel local search. In: 2015 IEEE Congress on Evolutionary Computation (CEC), 2015, Sendai. 2015 IEEE Congress on Evolutionary Computation (CEC), 2015. p. 838-845.

6.
DORN, MARCIO ; Inostroza-Ponta, Mario ; BURIOL, LUCIANA S. ; VERLI, HUGO . A knowledge-based genetic algorithm to predict three-dimensional structures of polypeptides. In: 2013 IEEE Congress on Evolutionary Computation (CEC), 2013, Cancun. 2013 IEEE Congress on Evolutionary Computation. p. 1233.

7.
Ahmed Shamsul Arefin ; Inostroza-Ponta, Mario ; Luke Mathieson ; Berretta, Regina ; Moscato, Pablo . Clustering Nodes in Large-Scale Biological Networks Using External Memory Algorithms. In: Algorithms and Architectures for Parallel Processing 11th International Conference, ICA300 2011, 2011, Melbourne. Lecture Notes in Computer Science. Berlin Heidelberg: Springer-Verlag, 2011. v. 7017. p. 375-386.

8.
MENESES, HUGO ; Inostroza-Ponta, Mario . Evaluating Memory Schemas in a Memetic Algorithm for the Quadratic Assignment Problem. In: 2011 30th International Conference of the Chilean Computer Science Society (SCCC 2011), 2011, Curico. 2011 30th International Conference of the Chilean Computer Science Society, 2011. p. 14-18.

9.
Inostroza-Ponta, Mario; Mendes, Alexandre ; Berretta, Regina ; Moscato, Pablo . An integrated QAP-based approach to visualize patterns of gene expression similarity. In: Progress in Artificial Life Third Australian Conference; ACAL 2007, 2007, Gold Coast. Lecture Notes in Computer Science. Berlin Heidelberg: Springer-Verlag, 2007. v. 4828. p. 156-167.

10.
Inostroza-Ponta, Mario; Berretta, Regina ; Mendes, Alexandre ; Moscato, Pablo . An automatic graph layout procedure to visualize correlated data. In: Artificial Intelligence in Theory and Practice IFIP 19th World Computer Congress, TC 12: IFIP AI 2006 Stream, 2006, Santiago. Artificial Intelligence in Theory and Practice. Berlin Heidelberg: Springer, 2006. v. 217. p. 179-188.

11.
Solar, M ; Inostroza, M . A Scheduling Algorithm to Optimize Real-World Applications. In: 24th International Conference on Distributed Computing Systems, 2004, Tokyo, Japan. Proceedings of the 24th International Conference on Distributed Computing Systems Workshops - W7: EC (ICDCSW'04). Washington, DC, USA: IEEE Computer Society, 2004. v. 7. p. 858-862.

12.
Pinacho, Pedro ; Solar, M ; Inostroza, M ; Muñoz, Rosa . Using Genetic Algorithms and Tabu Search Parallel Models to Solve the Scheduling Problem. In: IFIP 18th World Computer Congress, 2004, Toulouse, Francia. Artificial Intelligence Applications and Innovations, 2004. v. 154. p. 343-357.

13.
Solar, M ; Inostroza, M . An Automatic Scheduler for Parallel Machines. In: 8th International Euro-Par Conference, 2002, Paderborn. Proceedings of the 8th International Euro-Par Conference on Parallel Processing. London: Springer-Verlag, 2002. p. 212-216.

14.
Solar, M ; Inostroza, M . A parallel compiler scheduler. In: XXI International Conference of the Chilean Computer Science Society, 2001, Punta Arenas. Computer Science Society, 2001. SCCC 2001. Proceedings. XXI Internatinal Conference of the Chilean, 2001. p. 256q-263.

Resumos expandidos publicados em anais de congressos
1.
Inostroza-Ponta, Mario; FARFÁN, CAMILO ; DORN, MÁRCIO . A Memetic Algorithm for Protein Structure Prediction based on Conformational Preferences of Aminoacid Residues. In: the Companion Publication of the 2015, 2015, Madrid. Proceedings of the Companion Publication of the 2015 on Genetic and Evolutionary Computation Conference - GECCO Companion '15, 2015. p. 1403.

2.
Bastías, S ; Inostroza, M ; Ortiz, C ; Villanueva, M . Metaheurísticas para Coloración de Aristas de Grafos. In: III Congreso Chileno de Investigación Operativa OPTIMA'99, 1999, Arica. Actas de Resumenes Extendidos OPTIMA 99, 1999. p. 15-21.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
Inostroza-Ponta, Mario; Moscato, Pablo . Estudio de robustez del algoritmo de clustering basado en grafos MSTkNN. In: Encuentro Chileno de Computación, JCC2008, 2008, Punta Arenas. Jornadas Chilenas de Computación 2008 - Acta de Resúmenes, 2008.

2.
Inostroza, M; Solar, M . Un Algoritmo de Scheduling para Multiprocesadores con Memoria Compartida. In: Conferencia Latinoamericana de Informática (CLEI 2003), 2003, La Paz. CLEI 2003, 2003.

Apresentações de Trabalho
1.
Pozo-Rojas, N ; Inostroza-Ponta, Mario ; Moscato, Pablo . Towards a taxonomy of centrality measures for gene expression data sets.. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

2.
Inostroza-Ponta, Mario; REGINA, B. ; Moscato, Pablo . Incorporating Memory in a Structured Population Based MA for the QAP. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

3.
Inostroza-Ponta, Mario; Berretta, Regina ; Moscato, Pablo . A Memetic Algorithm for the Visualization of Relationships in Gene Expression Data Sets. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
RITT, M.; BOERES, C.; Mario Inostroza-Ponta. Participação em banca de Bruno Menegola. A Study of the k-way Graph Partitioning Problem. 2012. Dissertação (Mestrado em PPGC - Programa de Pós Graduação em Computação UFRGS) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

2.
VALENTE, P.; Mario Inostroza-Ponta. Participação em banca de Mauricio Ramírez CAstrillón. Tipagem molecular de leveduras associadas a vinhos do sul do Brasil: padronização do MSP-PCR fingerprinting usando o primer (GTG)5. 2012. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

3.
Chacón, Max; Inostroza-Ponta, Mario; Allende, Hector. Participação em banca de Juan Iturbe Araya. MODIFICACIÓN DE LOS ALRITMOS BASADOS EN LA METÁFORA DEL SISTEMA INMUNOLÇOGICO PARA LA DETECCIÓN DINÁMICA DE INTRUSOS EN REDES DE DATOS. 2010. Dissertação (Mestrado em Magister en Ingeniería Informática) - Universidad de Santiago de Chile.

4.
Jara, JL; Inostroza-Ponta, Mario; González, Danilo. Participação em banca de Cristopher Oporto. ESTUDIO DE MÉTRICAS PARA CLUSTERING EN REDES DE ASOCIACIÓN FUNCIONAL DE PROTEINAS PARA GENOMAS MICROBIANOS. 2009. Dissertação (Mestrado em Magister en Ingeniería Informática) - Universidad de Santiago de Chile.

5.
Parada, Victor; Inostroza-Ponta, Mario; Albornoz, V. Participação em banca de Sebastián Morales Droguett. METODO BÚSQUEDA TABÚ Y LENGUAJE DE ESPECIFICACIÓN PARA PROGRAMACIÓN ENTERA MIXTA EN TS++. 2009. Dissertação (Mestrado em Magister en Ingeniería Informática) - Universidad de Santiago de Chile.

6.
Chacón, Max; Inostroza-Ponta, Mario; Curilem, Millaray. Participação em banca de Daniel Najera. MODELAMIENTO PARA LA PREDICCION DINAMICA NO INVASIVA DE LA PRESIÓN INTRACRANEAL UTILIZANDO MAQUINAS DE VECTOR SOPORTE. 2009. Dissertação (Mestrado em Magister en Ingeniería Informática) - Universidad de Santiago de Chile.

7.
Parada, Victor; Inostroza-Ponta, Mario; Weber, Richard. Participação em banca de Pablo Schwarzenberg. GENERACIÓN AUTOMÁTICA DE PROGRAMAS PARA RESOLVER PROBLEMAS DE OPTIMIZACIÓN COMBINATORIA. 2008. Dissertação (Mestrado em Magister en Ingeniería Informática) - Universidad de Santiago de Chile.

8.
URRUTIA, A.; Inostroza-Ponta, Mario; Gutierrez, Claudio. Participação em banca de Reinaldo Medina Aravena. PROPUESTA DE UN DATA WAREHOUSE ESPACIAL PARA LA GESTION DE DISTRITOS TERRITORIALES. 2008. Dissertação (Mestrado em Magister en Ingeniería Informática) - Universidad de Santiago de Chile.

9.
Chacón, Max; Inostroza-Ponta, Mario; Curilem, Millaray. Participação em banca de Felipe Lazo Gallardo. ANALISIS DE LA PROVENIENCIA GÉNICA MEDIANTE MÉTODOS DE AGRUPAMINETO. 2008. Dissertação (Mestrado em Magister en Ingeniería Informática) - Universidad de Santiago de Chile.

10.
Chacón, Max; Inostroza-Ponta, Mario; Cerpa, N. Participação em banca de Rodrigo Sagredo Berrios. BÚSQUEDA DE PROMOTORES PROCARIONTES DEPENDIENTES DEL FACTOR σ 70 MEDIANTE MODELOS DE MARKOV. 2003. Dissertação (Mestrado em Magister en Ingeniería Informática) - Universidad de Santiago de Chile.

Teses de doutorado
1.
Hugo Verli; INOSTROZA-PONTA, M.; Leandro Krug Wives. Participação em banca de Marcio Dorn. MOIRAE: A Computational Strategy to Predict 3-D Structures of Polypeptides. 2012. Tese (Doutorado em PPGC - Programa de Pós Graduação em Computação UFRGS) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.




Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
ALIO-INFORMS InternationalMeeting. Incorporating Memory in a Structured Population Based MA for the QAP. 2010. (Congresso).

2.
ALIO-INFORMS InternationalMeeting. A Memetic Algorithm for the Visualization of Relationships in Gene Expression Data Sets. 2010. (Congresso).

3.
ISCB LatinAmerican 2010. Towards a taxonomy of centrality measures for gene expression data sets.. 2010. (Congresso).

4.
Workshop de Sistemas Distribuidos y Paralelismo, (WSDP-JCC2010). Framework de evaluación de crawling focalizado distribuido. 2010. (Congresso).

5.
Encuentro Chileno de Computación, JCC2008. Estudio de robustez del algoritmo de clustering basado en grafos MSTkNN. 2008. (Congresso).

6.
ACAL 2007 - The Third Australian Conference on Artificial Life.. An integrated QAP-based approach to visualize patterns of gene expression similarity. 2007. (Congresso).

7.
IFIP 19th World Computer Congress. An automatic graph layout procedure to visualize correlated data. 2006. (Congresso).

8.
Conferencia Latinoamericana de Informática (CLEI 2003). Un Algoritmo de Scheduling para Multiprocesadores con Memoria Compartida. 2003. (Congresso).

9.
XXI Internatinal Conference of the Chilean Computer Science Society. A parallel compiler scheduler. 2001. (Congresso).



Orientações



Orientações e supervisões em andamento
Dissertação de mestrado
1.
Camilo Muñoz. Algoritmo para la visualización de datos de experimentos de microarrays basados en anotaciones biológicas y expresiones genéticas. Início: 2013. Dissertação (Mestrado em Magister en Ingeniería Informática) - Universidad de Santiago de Chile. (Orientador).

2.
Daniel Pavez. Incorporación de anotaciones genéticas en el algoritmo de agrupamiento MST-kNN. Início: 2013. Dissertação (Mestrado em Magister en Ingeniería Informática) - Universidad de Santiago de Chile. (Orientador).


Orientações e supervisões concluídas
Dissertação de mestrado
1.
Roberto Sandoval. Algoritmos Memético para el problema de Asignación Cuadrática Bi-objetivo. 2017. Dissertação (Mestrado em Magister en Ingeniería Informática) - Universidad de Santiago de Chile, . Orientador: Mario Inostroza-Ponta.

2.
Benjamín Ruiz-Tagle. Metaheurística basada en conocimiento para el problema de Docking Molecular. 2017. Dissertação (Mestrado em Magister en Ingeniería Informática) - Universidad de Santiago de Chile, . Orientador: Mario Inostroza-Ponta.

3.
Felipe González. Algoritmo Memético para el Problema de Docking de Proteína Rígida y Ligando Flexible. 2016. Dissertação (Mestrado em Magister en Ingeniería Informática) - Universidad de Santiago de Chile, . Orientador: Mario Inostroza-Ponta.

4.
Cristian Cornejo. Algoritmo de agrupamiento para datos de expresión génica de RNA-Seg con la incorporación de anotaciones biológicas. 2015. Dissertação (Mestrado em Magister en Ingeniería Informática) - Universidad de Santiago de Chile, . Orientador: Mario Inostroza-Ponta.

5.
Daniel Pavez. Incorporación De Anotaciones Génicas En El Algoritmo De Agrupamiento Mst-Knn,. 2013. Dissertação (Mestrado em Magister en Ingeniería Informática) - Universidad de Santiago de Chile, . Orientador: Mario Inostroza-Ponta.

6.
Camilo Muñoz. Algoritmo Para La Visualización De Datos De Experimentos De Microarrays Basado En Anotaciones Biológicas Y Expresión Genética. 2013. Dissertação (Mestrado em Magister en Ingeniería Informática) - Universidad de Santiago de Chile, . Orientador: Mario Inostroza-Ponta.

7.
Cristóbal Acosta. RESOLUCIÓN DE SITUACIONES DE KO UTILIZANDO HEURISTICAS EN MONTECARLO GO. 2012. Dissertação (Mestrado em Magister en Ingeniería Informática) - Universidad de Santiago de Chile, . Orientador: Mario Inostroza-Ponta.

8.
Hugo Meneses Ponce. EVALUACIÓN DE ESQUEMAS DE MEMORIA EN UN ALGORITMO MEMÉTICO PARA EL PROBLEMA DE ASIGNACIÓN CUADRÁTICA. 2011. Dissertação (Mestrado em Magister en Ingeniería Informática) - Universidad de Santiago de Chile, Departamento de Ingeniería Informática. Orientador: Mario Inostroza-Ponta.

9.
Nicolás Pozo Rojas. ESTUDIO EXPLORATORIO SOBRE CENTRALIDADES EN REDES DE EXPRESIONES GENÉTICAS REPRESENTADA POR MICROARRAYS. 2010. Dissertação (Mestrado em Magister en Ingeniería Informática) - Universidad de Santiago de Chile, Departamento de Ingeniería Informática. Orientador: Mario Inostroza-Ponta.

Trabalho de conclusão de curso de graduação
1.
Christian Oviedo. Control de Cadena de Ingresos. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ingeniería Civil en Informática) - Universidad de Santiago de Chile. Orientador: Mario Inostroza-Ponta.

2.
Esteban Muñoz. EVALUACIÓN DE TECNOLOGÍAS PARA EL DESARROLLO DE UNA APLICACIÓN DE EVALUACIÓN NEUROLÓGICA. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ingeniería Civil en Informática) - Universidad de Santiago de Chile. Orientador: Mario Inostroza-Ponta.

3.
Felipe Ignacio Acuña Suazo. Sistema Web para el Cálculo de Centralidad de Redes Biológicas Considerando el Costo de la Aristas. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ingeniería de Ejecución en Comp e Informática) - Universidad de Santiago de Chile. Orientador: Mario Inostroza-Ponta.

4.
Jorge Bossa. Caracterizador Biológico de Grupos de Genes Utilizando Información Genética. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ingeniería Civil en Informática) - Universidad de Santiago de Chile. Orientador: Mario Inostroza-Ponta.

5.
Paulina Fernanda Espinoza Salazar. Comparación y Evaluación de Algoritmos de Clustering Basados en Grafos para Datos de Expresión Genética. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ingeniería Civil en Informática) - Universidad de Santiago de Chile. Orientador: Mario Inostroza-Ponta.

6.
Carlos Eduardo Vega Hernández. Desarrollo de un Sistema Web Para la Administración de consultas de Términos de Ontología Génica Utilizando Genes Humanos. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ingeniería de Ejecución en Comp e Informática) - Universidad de Santiago de Chile. Orientador: Mario Inostroza-Ponta.

7.
José Luis Parra García. UN ALGORITMO PARALELO BASADO EN SIMULATED ANNEALING PARA EL PROBLEMA DE SCHEDULING. 2003. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ingeniería Civil en Informática) - Universidad de Santiago de Chile. Orientador: Mario Inostroza-Ponta.

8.
Héctor Muñoz Vallejos. SISTEMA DE CONTROL DE ACTIVIDADES. 2003. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ingeniería de Ejecución en Comp e Informática) - Universidad de Santiago de Chile. Orientador: Mario Inostroza-Ponta.

9.
Fernando Allendes Fernández. DISEÑO Y CONSTRUCCIÓN DE UNA HERRAMIENTA PARA EL MANEJO DE FIREWALLS BASADOS EN IPTABLES. 2003. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ingeniería de Ejecución en Comp e Informática) - Universidad de Santiago de Chile. Orientador: Mario Inostroza-Ponta.



Outras informações relevantes


University of Newcastle Research Scholarship for PhD studies 2004
Beca Magister Departamento de Ingeniería Informática, 1998



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