Renato Renison Moreira Oliveira

Bolsista de Desenvolvimento Tecnológico Industrial do CNPq - Nível B

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  • Última atualização do currículo em 13/01/2019


Doutorando em Bionformática pela Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG), Mestre em Ciência da Computação (2017) pela Universidade Federal do Pará (UFPA) na Linha de Pesquisa de Sistemas Inteligentes e Bioinformática; Bacharel em Ciência da Computação pela UFPA (2014), Técnico em Informática pelo Instituto Federal do Pará (2010). Obteve o primeiro lugar nacional no Prêmio Técnico Empreendedor em 2009, com o projeto mRoutes. Estagiou no período de junho de 2010 à junho de 2012 na Companhia de Pesquisa em Recursos Minerais, como programador Java e suporte TI. Foi bolsista do programa Ciência Sem Fronteiras, estudando na Faculdade de Ciências da Universidade do Porto o curso de Mestrado em Engenharia de Redes e Sistemas Informáticos no período de 08/2012 a 08/2013. Atualmente é pesquisador voluntário no grupo de pesquisa de Bioinformática da UFPA, realizando pesquisas nas áreas da Genômica, Biologia de Sistemas, e buscando a aproximação da Computação Evolucionária à Bioinformática. Além disso, é bolsista de Desenvolvimento Tecnológico DTI-B, no Instituto Tecnológico Vale - Desenvolvimento Sustentável (ITV-DS), onde atua como Bioinformata, participando de projetos envolvendo análise de diversidade 16S de microbiomas, montagem e anotação de genomas microbianos e de plantas, análises metagenômicas e códigos de barras de DNA. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Renato Renison Moreira Oliveira
Nome em citações bibliográficas
OLIVEIRA, R. R. M.;OLIVEIRA, RENATO;OLIVEIRA, RENATO R. M.;OLIVEIRA, RENATO RENISON MOREIRA


Formação acadêmica/titulação


2018
Doutorado em andamento em Bioinformática.
Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.
Orientador: Guilherme Corrêa de Oliveira.
Coorientador: Thomas Sicheritz-Ponten.
2015 - 2017
Mestrado em Ciência da Computação.
Universidade Federal do Pará, UFPA, Brasil.
Título: GAVGA: Um algoritmo genético para montagem de genomas virais,Ano de Obtenção: 2017.
Orientador: Claudomiro de Souza de Sales Júnior.
Coorientador: Regiane Silva Kawasaki Francês.
Palavras-chave: bioinformática; Inteligência artificial; Montagem de genomas; Vírus; Algoritmos Genéticos.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas Inteligentes.
2010 - 2014
Graduação em Ciência da Computação.
Universidade Federal do Pará, UFPA, Brasil.
Título: Técnica Aglomerativa Baseada em População para a Realização da Montagem de Genomas.
Orientador: Regiane Silva Kawasaki Francês.
2006 - 2009
Curso técnico/profissionalizante.
Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Pará, IFPA, Brasil.




Formação Complementar


2006 - 2009
Inglês. (Carga horária: 520h).
American School of Languages, ASLAN, Brasil.


Atuação Profissional



Companhia de Pesquisa em Recursos Minerais, CPRM, Brasil.
Vínculo institucional

2010 - 2012
Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Programador e Suporte TI, Carga horária: 20, Regime: Dedicação exclusiva.


Universidade Federal do Pará, UFPA, Brasil.
Vínculo institucional

2014 - 2015
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Bioinformata, Carga horária: 20
Outras informações
O estágio envolveu as seguintes atividades: Programar scripts em Perl; Sincronizar banco de dados biológicos; Configurar estações Linux; Pesquisar informações em bancos de dados biológicos (NCBI, KEGG, MetaCyc etc.); Estudar métodos matemáticos específicos; Programar métodos matemáticos em uma linguagem específica; Apresentar seminários; Contribuir na elaboração de artigos científicos.

Vínculo institucional

2013 - 2014
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Programador Java, Carga horária: 20
Outras informações
Bolsa de Iniciação Científica no Laboratório de Engenharia de Software (LABES)


Instituto Tecnológico Vale - Desenvolvimento Sustentável, ITV-DS, Brasil.
Vínculo institucional

2015 - Atual
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bolsista TIC - Nível F como Bioinformata, Carga horária: 24, Regime: Dedicação exclusiva.



Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação.
2.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Bioinformática.
3.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas Inteligentes.
4.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação.
5.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: ..


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.
Alemão
Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.


Prêmios e títulos


2018
Prêmio MAIS Bio, Vale.
2016
Melhor Pôster do Workshop de Bolsistas ITV DS, Instituto Tecnológico Vale.
2015
Destaque Acadêmico do Curso de Bacharelado em Ciência da Computação, Faculdade de Computação da Universidade Federal do Pará.
2014
3º Lugar no Desafio de Ideias Inovadoras StartNow, com o site "Mais Barato", Universitec/UEPA.
2011
Honorable Mention, Association for Computing Machinery.
2010
1º Lugar no I Desafio de Programação, Faculdade de Computação da Universidade Federal do Pará.
2009
1º Lugar no Prêmio Técnico Empreendedor, Categoria Técnico, Tema Livre, Etapa Nacional, MEC, Mapa, SEBRAE e Banco do Brasil.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
COSTA DIAS, MARIANA2019COSTA DIAS, MARIANA ; OLIVEIRA, RENATO RENISON MOREIRA ; VASCONCELOS, SANTELMO ; PIRES, EDER SOARES ; PROUS, XAVIER ; PIETROBON, THADEU ; OLIVEIRA, GUILHERME . Complete mitochondrial genome of a troglophile ( ). Mitochondrial DNA Part B, v. 4, p. 420-422, 2019.

2.
OLIVEIRA, RENATO RENISON MOREIRA2018 OLIVEIRA, RENATO RENISON MOREIRA; NUNES, GISELE LOPES ; DE LIMA, TALVÂNE GLAUBER LOPES ; OLIVEIRA, GUILHERME ; ALVES, RONNIE . PIPEBAR and OverlapPER: tools for a fast and accurate DNA barcoding analysis and paired-end assembly. BMC BIOINFORMATICS, v. 19, p. 297, 2018.

3.
NUNES, GISELE LOPES2018NUNES, GISELE LOPES ; OLIVEIRA, RENATO RENISON MOREIRA ; GUIMARÃES, JOSÉ TASSO FELIX ; GIULIETTI, ANA MARIA ; CALDEIRA, CECÍLIO ; VASCONCELOS, SANTELMO ; PIRES, EDER ; DIAS, MARIANA ; WATANABE, MAURÍCIO ; PEREIRA, JOVANI ; JAFFÉ, RODOLFO ; BANDEIRA, CINTHIA HELENA M. M. ; CARVALHO-FILHO, NELSON ; DA SILVA, EDILSON FREITAS ; RODRIGUES, TARCÍSIO MAGEVSKI ; DOS SANTOS, FERNANDO MARINO GOMES ; FERNANDES, TAÍS ; CASTILHO, ALEXANDRE ; SOUZA-FILHO, PEDRO WALFIR M. ; IMPERATRIZ-FONSECA, VERA ; SIQUEIRA, JOSÉ OSWALDO ; ALVES, RONNIE ; OLIVEIRA, GUILHERME . Quillworts from the Amazon: A multidisciplinary populational study on Isoetes serracarajensis and Isoetes cangae. PLoS One, v. 13, p. e0201417, 2018.

4.
OLIVEIRA, RENATO RENISON MOREIRA2018OLIVEIRA, RENATO RENISON MOREIRA; VASCONCELOS, SANTELMO ; PIRES, EDER SOARES ; PIETROBON, THADEU ; PROUS, XAVIER ; OLIVEIRA, GUILHERME . Complete mitochondrial genomes of three troglophile cave spiders ( , pholcidae). Mitochondrial DNA Part B, v. 4, p. 251-252, 2018.

5.
ROZAS, ENRIQUE E.2017ROZAS, ENRIQUE E. ; MENDES, MARIA A. ; NASCIMENTO, CLAUDIO A.O. ; ESPINOSA, DENISE C.R. ; OLIVEIRA, RENATO ; OLIVEIRA, GUILHERME ; CUSTODIO, MARCIO R. . Bioleaching of electronic waste using bacteria isolated from the marine sponge Hymeniacidon heliophila (Porifera). Journal of Hazardous Materials (Print), v. 329, p. 120-130, 2017.

6.
DALL?AGNOL, HIVANA2016DALL?AGNOL, HIVANA ; ÑANCUCHEO, IVAN ; JOHNSON, D. BARRIE ; OLIVEIRA, RENATO ; LEITE, LAURA ; PYLRO, VICTOR S. ; HOLANDA, ROSEANNE ; GRAIL, BARRY ; CARVALHO, NELSON ; NUNES, GISELE LOPES ; TZOTZOS, GEORGE ; FERNANDES, GABRIEL ROCHA ; DUTRA, JULLIANE ; ORELLANA, SARA CUADROS ; OLIVEIRA, GUILHERME . Draft Genome Sequence of - Acidibacillus ferrooxidans - ITV01, a Novel Acidophilic Firmicute Isolated from a Chalcopyrite Mine Drainage Site in Brazil. Genome Announcements, v. 4, p. e01748-15, 2016.

7.
ÑANCUCHEO, IVAN2016ÑANCUCHEO, IVAN ; OLIVEIRA, RENATO ; DALL?AGNOL, HIVANA ; JOHNSON, D. BARRIE ; GRAIL, BARRY ; HOLANDA, ROSEANNE ; NUNES, GISELE LOPES ; CUADROS-ORELLANA, SARA ; OLIVEIRA, GUILHERME . Draft Genome Sequence of a Novel Acidophilic Iron-Oxidizing Firmicutes Species, - Acidibacillus ferrooxidans - (SLC66 T ). Genome Announcements, v. 4, p. e00383-16, 2016.

Capítulos de livros publicados
1.
OLIVEIRA, RENATO R. M.; Damasceno, Filipe ; Souza, Ronald ; Santos, Reginaldo ; Lima, Manoel ; Kawasaki, Regiane ; Sales, Claudomiro . GAVGA: A Genetic Algorithm for Viral Genome Assembly. Lecture Notes in Computer Science. 1ed.: Springer International Publishing, 2017, v. 10423, p. 395-407.


Produção técnica

Demais tipos de produção técnica
1.
OLIVEIRA, R. R. M.. Montagem e Anotação de Genomas Procariotos. 2016. (Curso de curta duração ministrado/Outra).



Patentes e registros



Programa de computador
1.
OLIVEIRA, R. R. M.; NUNES, GISELE LOPES ; ALVES, R. ; OLIVEIRA, GUILHERME . OVERLAPPER - UM ALGORITMO PARA MONTAGEM DE PARES DE SEQUÊNCIAS DE DNA. 2016.
Patente: Programa de Computador. Número do registro: BR512017000222-3, data de registro: 13/08/2016, título: "OVERLAPPER - UM ALGORITMO PARA MONTAGEM DE PARES DE SEQUÊNCIAS DE DNA" , Instituição de registro: INPI - Instituto Nacional da Propriedade Industrial.



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Trabalhos de conclusão de curso de graduação
1.
FRANCES, R. S. K.; COUTO, D. C. C.; OLIVEIRA, R. R. M.. Participação em banca de Wendel Renan Macedo dos Santos.Modelagem da Via de Regulação Gênica de Ácidos Graxos da Bactéria Escherichia coli K12 Utilizando Redes Booleanas. 2018. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal do Pará.

2.
COUTO, D. C. C.; OLIVEIRA, R. R. M.; FRANCES, R. S. K.; SALES JUNIOR, C. S.. Participação em banca de Roberto Brito Xavier Junior.Fatores de Transcrição em Cianobactérias: Predição por Genômica Comparativa. 2018. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal do Pará.

3.
Kawasaki, Regiane; OLIVEIRA, R. R. M.; XAVIER, L. P; COUTO, D. C. C.. Participação em banca de Ronald Assunção Souza.sARCASM - Uma Ferramenta Semi-Automática para Recosntrução e Análise de Matrizes Estequiométricas. 2018. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal do Pará.

4.
SALES JUNIOR, C. S.; SANTOS FILHO, R. C.; SILVA, M. R. L. F. E.; OLIVEIRA, R. R. M.. Participação em banca de George Tassiano Melo Pereira.Otimização Multimodal Através de Algoritmos genéticos modificados por operadores não convencionais: um estudo comparativo. 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal do Pará.

5.
Kawasaki, Regiane; LIMA, A. R. J.; COUTO, D. C. C.; OLIVEIRA, R. R. M.. Participação em banca de Ariane Elizabeth Nunes Garcia.Montagem dos Genomas da Cultura Não-Axênica de Nostoc sp. CACIAM 19 Utilizando Técnicas da Metagenômica. 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal do Pará.

6.
FRANCES, R. S. K.; OLIVEIRA, R. R. M.; SALES JUNIOR, C. S.; COUTO, D. C. C.; LIMA, A. R. J.. Participação em banca de Derick Eduardo Dias Rosa.Comparação de Ferramentas Para Análise de Metagenomas Virais do Intestino Humano. 2016. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal do Pará.




Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
1st MCAA Brazil-Europe Workshop (BREUW).IDENTIFICATION OF TERPENE SYNTHASES OBTAINED FROM CYANOBACTERIAS THROUGH HIDDEN MARKOV MODELS. 2017. (Oficina).

2.
1st MCAA Brazil-Europe Workshop (BREUW).BIOINFORMATIC ANALYSIS OF THE GENOME OF A BACTERIAL LINEAGE ISOLATED FROM MINING ENVIRONMENT. 2017. (Oficina).

3.
1st MCAA Brazil-Europe Workshop (BREUW).Genome assembly and metabolic model reconstruction of an Amazonian cyanobacterium with high potential for free fatty acid production. 2017. (Oficina).

4.
1st MCAA Brazil-Europe Workshop (BREUW).Usability Assessment for the Cyanobr Database. 2017. (Oficina).

5.
1st MCAA Brazil-Europe Workshop (BREUW).ASSEMBLY OF NON-AXENIC CULTIVATION CYANOBACTERIA GENOME USING METAGENOMIC TECHNIQUES. 2017. (Oficina).

6.
29º Congresso Brasileiro de Microbiologia. MICROBIOME OF CAVES FROM SERRA DOS CARAJÁS. 2017. (Congresso).

7.
II Simpósio Norte-Nordeste de Bioinformática.sARCASM: Uma Ferramenta para a Reconstrução e Análise semi-Automática de Matrizes Estequiométricas. 2017. (Simpósio).

8.
II Simpósio Norte-Nordeste de Bioinformática.Um Estudo Comparativo de Ferramentas voltadas para a Análise Taxonômica de Metagenomas Virais. 2017. (Simpósio).

9.
XXV Seminário de Iniciação Científica da UFPA.Formalismos e Mecanismos para Modelagem do Processo de Software. 2014. (Seminário).

10.
XXXII Congresso da Sociedade Brasileira de Computação. 2012. (Congresso).

11.
XIV Semana de Informática da UFPA. 2011. (Encontro).

12.
XXXI Congresso da Sociedade Brasileira de Computação. 2011. (Congresso).

13.
SBQS 2010 - IX Simpósio Brasileiro de Qualidade de Software. 2010. (Simpósio).

14.
Forum Mundial de Educação Profissional e Tecnológica. 2009. (Congresso).

15.
I Seminário de Informática: Tendências de TI. 2008. (Seminário).

16.
X Olimpíada Brasileira de Informática. 2008. (Outra).

17.
XXVIII Congresso da Sociedade brasileira de Computação. 2008. (Congresso).

18.
A Evolução Histórica dos Números Racionais. 2007. (Oficina).



Inovação



Programa de computador registrado
1.
OLIVEIRA, R. R. M.; NUNES, GISELE LOPES ; ALVES, R. ; OLIVEIRA, GUILHERME . OVERLAPPER - UM ALGORITMO PARA MONTAGEM DE PARES DE SEQUÊNCIAS DE DNA. 2016.
Patente: Programa de Computador. Número do registro: BR512017000222-3, data de registro: 13/08/2016, título: "OVERLAPPER - UM ALGORITMO PARA MONTAGEM DE PARES DE SEQUÊNCIAS DE DNA" , Instituição de registro: INPI - Instituto Nacional da Propriedade Industrial.




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