Edwin Rafael Villanueva Talavera

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  • Última atualização do currículo em 27/01/2016


Possui graduação em Engenharia Eletrônica - Universidad Nacional de San Agustín de Arequipa - Peru (2000), mestrado em Engenharia Elétrica pela Universidade de São Paulo (2007) e doutorado na Escola de Engenharia de São Carlos - USP (2012). Tem experiência na área de modelos gráficos probabilísticos, aprendizagem de maquina, processamento de sinais, computação paralela e bioinformática, atuando principalmente nas seguintes linhas de pesquisa: aprendizagem de modelos gráficos probabilísticos, redes Bayesianas, meta-aprendizado, comitês de classificadores, aplicação de modelos gráficos probabilísticos em bioinformática, sistemas de aprendizagem evolutivos, computação distribuída, agrupamento de dados, processamento de sinais e redução dimensional. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Edwin Rafael Villanueva Talavera
Nome em citações bibliográficas
VILLANUEVA-TALAVERA, E. R.;Villanueva, E.;VILLANUEVA, EDWIN;TALAVERA, EDWIN VILLANUEVA

Endereço


Endereço Profissional
Universidade de São Paulo, Escola de Engenharia de São Carlos, Departamento de Engenharia Elétrica.
Avenida Trabalhador São Carlense 400
Centro
13566-590 - Sao Carlos, SP - Brasil
Telefone: (16) 33738745
Fax: (16) 33739371
URL da Homepage: http://www.sel.eesc.usp.br


Formação acadêmica/titulação


2007 - 2012
Doutorado em Engenharia Elétrica.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Sistema evolutivo eficiente para aprendizagem estrutural de redes Bayesianas, Ano de obtenção: 2012.
Orientador: Carlos Dias Maciel.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Palavras-chave: Redes Bayesianas; Modelos gráficos probabilísticos; inteligência computacional; analise de dados genéticos; bioinformática.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação / Especialidade: Aprendizagem de maquina.
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Bioinformatica.
Setores de atividade: Pesquisa e desenvolvimento científico.
2006 - 2007
Mestrado em Engenharia Elétrica.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Métodos Bayesianos aplicados em taxonomia molecular,Ano de Obtenção: 2007.
Orientador: Carlos Dias Maciel.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Palavras-chave: Agrupamento; Agrupamento hierárquico; Modelos gráficos probabilísticos; Modelos probabilísticos.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Probabilidade e Estatística / Subárea: Estatística / Especialidade: Análise Multivariada.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.
Setores de atividade: Pesquisa e desenvolvimento científico.
1995 - 1999
Graduação em Ingenieria Electrónica.
Universidad Nacional de San Agustín de Arequipa, UNSA, Peru.
Título: Control de Motores DC.
Orientador: German Echaiz.


Pós-doutorado


2015
Pós-Doutorado.
Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação - USP, ICMC/USP, Brasil.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação / Especialidade: Mineração de dados.
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Bioinformatica.
2014 - 2015
Pós-Doutorado.
Universität Regensburg, UNI/Regensburg, Alemanha.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação / Especialidade: Aprendizagem de maquina.
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação / Especialidade: Mineração de dados.
2013 - 2015
Pós-Doutorado.
Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação - USP, ICMC/USP, Brasil.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Bioinformatica.
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Probabilidade e Estatística / Subárea: Probabilidade e Estatística Aplicadas / Especialidade: modelos gráficos probabilísticos.


Formação Complementar


2001 - 2003
Extensão universitária em Segunda especialidad en Ingenieria de Sistemas. (Carga horária: 300h).
Universidad Nacional de San Agustín de Arequipa, UNSA, Peru.
2002 - 2002
Extensão universitária em Curso de Extensão Universitaria em Telecomunicaçõe. (Carga horária: 150h).
Organismo Supervisor de la Inversion Privada en Telecomunicaciones, OSIPTEL, Peru.


Atuação Profissional



Universität Regensburg, UNI/Regensburg, Alemanha.
Vínculo institucional

2014 - 2015
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisador posdoc, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.


Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Vínculo institucional

2008 - 2009
Vínculo: Estagio, Enquadramento Funcional: Estagiario do Programa PAE, Carga horária: 6

Atividades

02/2009 - 06/2009
Estágios , Escola de Engenharia de São Carlos, Departamento de Engenharia Elétrica.

Estágio realizado
Participante do Programa de Aperfeiçoamento de Ensino (PAE) colaborando junto à disciplina Processamento Digital de Sinais.
02/2008 - 06/2008
Estágios , Escola de Engenharia de São Carlos, Departamento de Engenharia Elétrica.

Estágio realizado
Participante do Programa de Aperfeiçoamento de Ensino (PAE) colaborando junto à disciplina Controle não Linear Aplicado.

VOXIVA Inc, VOXIVA, Peru.
Vínculo institucional

2004 - 2006
Vínculo: Outro (Funcionario), Enquadramento Funcional: ANALISTA DESENVOLVEDOR, Carga horária: 40

Atividades

03/2004 - 03/2006
Serviços técnicos especializados , Research and Development, .

Serviço realizado
Desenvolvimento de um "browser de voz" baseado no padrão VoiceXml para sistemas IVR (Interactive Voice Response), desenvolvido em C/C++. Desenvolvimento de um "framework" de aplicações para telefonía e Internet (desenvolvido em C#)..

Organismo Supervisor de la Inversion Privada en Telecomunicaciones, OSIPTEL, Peru.
Vínculo institucional

2003 - 2004
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Consultor de projetos de Telecomunicações

Vínculo institucional

2002 - 2003
Vínculo: Estagio, Enquadramento Funcional: Estagio em Telecomunicações, Carga horária: 40

Atividades

06/2003 - 08/2004
Conselhos, Comissões e Consultoria, Fondo de Inversion en Telecomunicaciones - FITEL, .

Cargo ou função
Consultor do sistema de informação geográfico. Elaboração de projetos de telecomunicações rurais. Consultor do sistema de informação para a tomada de desições em projetos de telecomunicações rurais. Supervisão de projetos de Telecomunicações rurais..
04/2002 - 04/2003
Estágios , Fondo de Inversion en Telecomunicaciones - FITEL, .

Estágio realizado
Estudos de telecomunicações rurais com o sistema de informação geográfico (SIG). Desenvolvimento de sistemas de informação para tomada de desições..

Universidad Nacional de San Agustín de Arequipa, UNSA, Peru.
Vínculo institucional

2000 - 2000
Vínculo: Outro (especifique), Enquadramento Funcional: Estagiario TI, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

01/2000 - 09/2000
Estágios , Instituto de Informática, .

Estágio realizado
Participação no projeto da rede ATM do campus universitário. Configuração de switchs ATM. Administração de servidores Linux da universidade. Desenvolvimento de aplicações Web e banco de dados..

Oficina Registral Region Arequipa, ORRA, Peru.
Vínculo institucional

2000 - 2001
Vínculo: Outro (estagiario), Enquadramento Funcional: Analista e desenvolvedor, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

10/2000 - 9/2001
Estágios , Gerência de Informática, .

Estágio realizado
Desenvolvimento de um sistema IVR (interactive voice response) em C++.


Projetos de pesquisa


2014 - 2015
Detection of functional gene-gene interactions from observational gene expression data using classifier ensembles and Metalearning
Descrição: Predict whether or not a gene will respond to the intervention of another gene only from their freely observed expression profiles is of great value in medical research. However, this is a challenging task because the randomness of the biological systems, the elevated noise levels of the data collection technologies and the high dimensionality involved. In this project we propose to apply machine learning (ML) approaches to learn the subtle differences in observational gene-expression patterns that could characterize gene-gene causal interactions. Specifically, we will study ways to take advantage of two promising approaches: Ensemble of Classifiers (EoC) and Metalearning. EoC have often shown their superiority in relation to single methods. Metalearning studies how learning algorithms could increase their efficiency through experience, having the potential to transform how ML methods are employed, although it has been little explored in bioinformatics applications. We believe that by properly joining the mentioned approaches we can obtain classification system that can accurately identify patterns of functional gene-gene interactions from observational gene expression data.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2013 - 2015
Meta-aprendizado e redes bayesianas na criação de comitês de classificação de dados de expressão gênica
Descrição: Neste projeto pretende-se estudar de que maneira o potencial das metodologias de meta-aprendizado e redes Bayesianas poderia ser usado para facilitar a tarefa de criação de comitês de classificadores de expressão gênica, metodologias que têm sido bem sucedidas em diversos domínios, mas muito pouco exploradas no problema em estudo..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação/Especialidade: Aprendizagem de maquina.
2.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Probabilidade e Estatística / Subárea: Probabilidade e Estatística Aplicadas/Especialidade: modelos gráficos probabilísticos.
3.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação/Especialidade: Mineração de dados.
4.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação/Especialidade: Computação Distribuida.
5.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Bioinformatica.
6.
Grande área: Engenharias / Área: Engenharia Elétrica / Subárea: Processamento de sinais.


Idiomas


Espanhol
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Português
Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Bem.
Inglês
Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Bem.


Prêmios e títulos


2007
Travel Grant para asistir à 4ta escola latinoamericana de Inteligencia Computacional EVIC2007 - Santiago de Chile 2007, IEEE Computational Intelligence Society.
2002
Carta de felicitação por ocupar o segundo lugar no V curso de extensão universitária em Telecomunicações 2002, Organismo de la Inversión Privada en Telecomunicaciones - Osiptel.
2000
Diploma de Honra por graduar-se no terceiro lugar da turma 1995-1999 na Escola profissional de Engenharia Eletrônica - UNSA, Universidad Nacional de San Agustín de Arequipa - UNSA.
1994
Diploma de honra por ocupar o segundo lugar no concurso de excelências e valores escolares, Arequipa - Perú, Direccion regional de Educación de Arequipa.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
VILLANUEVA, EDWIN2014 VILLANUEVA, EDWIN; MACIEL, CARLOS DIAS . Efficient methods for learning Bayesian network super-structures. Neurocomputing (Amsterdam), v. 123, p. 3-12, 2014.

2.
ESPEZUA, SOLEDAD2014ESPEZUA, SOLEDAD ; VILLANUEVA, EDWIN ; MACIEL, CARLOS D. . Towards an efficient genetic algorithm optimizer for sequential projection pursuit. Neurocomputing (Amsterdam), v. 123, p. 40-48, 2014.

3.
ESPEZUA, SOLEDAD2014 ESPEZUA, SOLEDAD ; VILLANUEVA, EDWIN ; MACIEL, CARLOS D. ; CARVALHO, ANDRÉ . A Projection Pursuit framework for supervised dimension reduction of high dimensional small sample datasets. Neurocomputing (Amsterdam), v. 149, p. 767-776, 2014.

4.
VILLANUEVA-TALAVERA, E. R.;Villanueva, E.;VILLANUEVA, EDWIN;TALAVERA, EDWIN VILLANUEVA2010 VILLANUEVA-TALAVERA, E. R.; MACIEL, C. D. . Modeling associations between genetic markers using Bayesian networks. Bioinformatics (Oxford. Print), v. 26, p. i632-i637, 2010.

Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1.
Villanueva, E.; MACIEL, C. D. . Optimized Algorithm for Learning Bayesian Network Super-Structures. In: Internation Conference on Pattern Recognition Applications and Methods ICPRAM 2012, 2012, Vilamoura. Proceedings of the 1st Internation Conference on Pattern Recognition Applications and Methods ICPRAM 2012, 2012. p. 217-222.

2.
ESPEZUA, S. ; Villanueva, E. ; MACIEL, C. D. . On the Crossover Operator for GA-based Optimizers In Sequential Projection Pursuit. In: International Conference on Pattern Recognition Applications and Methods (ICPRAM 2012), 2012, Vilamoura. Proceedings of the 1st International Conference on Pattern Recognition Applications and Methods, 2012. p. 93-102.

3.
VILLANUEVA-TALAVERA, E. R.; Espezua-Llerena, S . Aprendizagem Estrutural de Redes Bayesianas usando Algoritmos Genéticos e Computação Paralela. In: XVI Congreso Internacional de Ingeniería Eléctrica, Electrónica y Sistemas - INTERCON 2009, 2009, Arequipa. Memoria de ponencias del XVI Congreso Internacional de Ingeniería Eléctrica, Electrónica y Sistemas - INTERCON 2009, 2009.

4.
VILLANUEVA-TALAVERA, E. R.; MACIEL, C. D. ; OLIVEIRA, V. A. . Analysis of the level of fuzziness in kernelized Fuzzy C-means. In: XVII Congresso Brasileiro de Automática - CBA2008, 2008, Juiz de Fora. Anais do XVII Congresso Brasileiro de Automática, 2008.

5.
CHRIST, RAFAEL EDUARDO RUVIARO ; TALAVERA, EDWIN VILLANUEVA ; MACIEL, CARLOS DIAS . Gaussian Hierarchical Bayesian Clustering Algorithm. In: Seventh International Conference on Intelligent Systems Design and Applications (ISDA 2007), 2007, Rio de Janeiro. Seventh International Conference on Intelligent Systems Design and Applications (ISDA 2007). p. 133-137.

6.
VILLANUEVA-TALAVERA, E. R.; MACIEL, C. D. ; BOAVENTURA, M. . Inferring molecular taxonomies from gel-electrophoresis images using Bayesian hierarchical clustering. In: 6th Brazilian Conference on Dynamics, Control and their Applications, 2007, São José do Rio Preto. Proceedings of the 6th Brazilian Conference on Dynamics, Control and Their Applications, DINCON' 2007.. São José do Rio Preto - SP: Universidade Estadual Paulista, 2007. p. 1297-1302.

7.
VILLANUEVA-TALAVERA, E. R.; Christ R.E.R ; MACIEL, C. D. . Classificador Bayesiano Hierarquico Utilizando Modelos Gaussianos. In: VIII Simposio Brasileiro de Automaçao Inteligente, 2007, Florianópolis. Anais do VIII Simposio Brasileiro de Autamação Inteligente, 2007.

Apresentações de Trabalho
1.
PEIXOTO, A. M. ; DELBEM, A. ; Villanueva, E. ; SANTOS, L. B. ; FERREIRA, M. D. ; SAMPAIO, R. R. ; MONTEIRO, R. L. S. ; MELLO, R. ; ESPEZUA, SOLEDAD ; VAZ, Y. . Wearable myography-based hand controller. 2015. (Apresentação de Trabalho/Outra).

2.
Villanueva, E.. Redes Neuronales y Clasificadores. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

3.
Villanueva, E.; MACIEL, C. D. . Optimized Algorithm for Learning Bayesian Network Super-Structures. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

4.
ESPEZUA, SOLEDAD ; Villanueva, E. ; MACIEL, C. D. . On the Crossover Operator for GA-based Optimizers in Sequential Projection Pursuit. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

5.
Villanueva, E.; MACIEL, C. D. . Aprendizagem de Redes Bayesianas de Alta Dimensionalidade e sua Aplicação na Análise de Dados de Genótipo. 2011. (Apresentação de Trabalho/Outra).

6.
Villanueva, E.; MACIEL, C. D. . Redes Bayesianas aplicadas na modelagem de associações entre marcadores genéticos. 2010. (Apresentação de Trabalho/Outra).

7.
Villanueva, E.; MACIEL, C. D. . Modeling associations between genetic markers using Bayesian networks. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

8.
Villanueva, E.; MACIEL, C. D. . Modelos gráficos probabilísticos aplicados na análise de dados gnômicos SSR. 2009. (Apresentação de Trabalho/Outra).

9.
Villanueva, E.; MACIEL, C. D. . Descobrindo relações entre marcadores genéticos SSR usando Redes Bayesianas. 2009. (Apresentação de Trabalho/Outra).

10.
Villanueva, E.; MACIEL, C. D. . Analysis of the level of fuzziness in kernelized Fuzzy C-means. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

11.
Villanueva, E.; MACIEL, C. D. . Classificador Bayesiano Hierarquico Utilizando Modelos Gaussianos. 2007. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

12.
Villanueva, E.; MACIEL, C. D. . Taxonomia de Organismos usando Redes Gaussianas Condicionais. 2007. (Apresentação de Trabalho/Outra).

13.
Villanueva, E.; MACIEL, C. D. . Inferring molecular taxonomies from gel-electrophoresis images using Bayesian hierarchical clustering. 2007. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Trabalhos de conclusão de curso de graduação
1.
VILLANUEVA-TALAVERA, E. R.; André C. P. L. F. Carvalho. Participação em banca de Thiago Correa Camargo.Desenvolvimento de jogos para web e mobile usando Actionscript e .NET. 2015. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado em Ciências de Computação) - Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação - USP.

2.
VILLANUEVA-TALAVERA, E. R.; BATISTA, G.. Participação em banca de Caio Cesar Benatti Silverio de Sousa.Estratégias para tratar o problema de covariate shift em aprendizado de máquina. 2013. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado em Ciências de Computação) - Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação - USP.




Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
International Conference on Pattern Recognition Applications and Methods (ICPRAM 2012). On the Crossover Operator for GA-based optimizers in Sequential Projection Pursuit. 2012. (Congresso).

2.
International Conference on Pattern Recognition Applications and Methods (ICPRAM 2012). Optimized Algorithm for Learning Bayesian Network Super-Structures. 2012. (Congresso).

3.
9th European Conference on Computational Biology (ECCB 2010). Modeling associations between genetic markers using Bayesian networks. 2010. (Congresso).

4.
5th Southern Conference on Programmable Logic. 2009. (Congresso).

5.
II Oficina Interna em Controle e Reconhecimento de Padrões para Agricultura.Descobrindo relações entre marcadores genéticos SSR usando Redes Bayesianas. 2009. (Oficina).

6.
II Workshop de Pos Graduaçao em Engenharia Elétrica.Modelos gráficos probabilísticos aplicados na análise de dados genômicos SSR. 2009. (Oficina).

7.
XVI Congreso Internacional de Ingeniería Eléctrica, Electrónica y Sistemas - INTERCON 2009. Aprendizagem Estrutural de Redes Bayesianas usando Algoritmos Genéticos e Computação Paralela. 2009. (Congresso).

8.
XVII Congresso Brasileiro de Automática - CBA2008. Analysis of the level of fuzziness in kernelized Fuzzy C-means. 2008. (Congresso).

9.
4ta Escuela de Verano Latinoamericana en Inteligencia Computacional.Analysis of the level of fuzziness in kernelized Fuzzy C-means. 2007. (Outra).

10.
6th Brazilian Conference on Dynamics, Control and their Applications. Inferring molecular taxonomies from gel-electrophoresis images using Bayesian hierarchical clustering. 2007. (Congresso).

11.
I Oficina em Controle e Reconhecimento de Padrões para Agricultura de Precisão.Taxonomia de Organismos Usando Redes Gaussianas Condicionais. 2007. (Oficina).

12.
VIII Simposio Brasileiro de Automaçao Inteligente.Classificador Bayesiano Hierarquico Utilizando Modelos Gaussianos. 2007. (Simpósio).




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