Rodrigo Pereira Rocha

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  • Última atualização do currículo em 27/09/2018


A modelagem analítica e computacional e a interpretação teórica de fenômenos naturais a partir de dados empíricos e experimentais no ramo da biologia, ecologia e neurociência, estão no centro da minha atuação profissional. Graças a dois estágios de pesquisa na Itália, que totalizam 3 anos, mantenho colaborações internacionais com grandes centros de pesquisa europeus, que produzem continuamente dados empíricos que alimentam as pesquisas que desenvolvo e a sua continuidade. Sou bolsista da FAPESP de Pós-doutorado no Centro de Pesquisa, Inovação e Difusão em Neuromatemática - Departamento de Física da USP (Ribeirão Preto). Tenho experiência na área de Física, com ênfase em Física Estatística e Neurociência Computacional, atuando principalmente nos seguintes temas: dinâmica estocástica em sistemas complexos interagentes (redes ecológicas e redes neurais), plasticidade neural em pacientes com acidente vascular cerebral (AVC), localização de Anderson e transporte de carga em sistemas moleculares desordenados. Possuo o título de Bacharel em Física (2009) e Mestrado em Física (2009) pela Universidade Federal do Paraná; Doutorado em Física (2015) pela Universidade Federal de Santa Catarina com estágio sanduíche no período de um ano no Laboratory of Interdisciplinary Physics sob supervisão do Prof. Amos Maritan (Università degli Studi di Padova/UNIPD, Itália). Pós-doutorado (2016-2018) no Laboratory of Interdisciplinary Physics (UNIPD, Itália). Coorientei estudantes de mestrado e graduação em Física, com temas na área de modelagem computacional de sistemas neurais. Atuei como Professor substituto nos Departamentos de Física da Universidade Federal de Santa Catarina (2011-2013) e da Universidade do Estado de Santa Catarina (2015-2016); Departamento de Engenharia da Mobilidade da Universidade Federal de Santa Catarina (2015-2016). e na tutoria de física (2015) e matemática (2014) para o curso de Licenciatura em Física na modalidade a distância da UFSC. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Rodrigo Pereira Rocha
Nome em citações bibliográficas
ROCHA, RODRIGO P.

Endereço


Endereço Profissional
Universidade de São Paulo, Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto.
Avenida Bandeirantes 3900
Vila Monte Alegre
14040030 - Ribeirão Preto, SP - Brasil
Telefone: (16) 33153718


Formação acadêmica/titulação


2011 - 2015
Doutorado em Física.
Universidade Federal de Santa Catarina, UFSC, Brasil.
com período sanduíche em Università degli Studi di Padova (Orientador: Amos Maritan).
Título: Tempo de Relaxação em Sistemas Moleculares Desordenados, Ano de obtenção: 2015.
Orientador: Wagner Figueiredo.
Coorientador: José Arruda de Oliveira Freire.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
2009 - 2011
Mestrado em Física.
Universidade Federal do Paraná, UFPR, Brasil.
Título: Modelo de Equação Mestra para o Experimento de Tempo de Voo,Ano de Obtenção: 2011.
Orientador: José Arruda de Oliveira Freire.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
2005 - 2009
Graduação em Física Bacharelado.
Universidade Federal do Paraná, UFPR, Brasil.


Pós-doutorado


2018
Pós-Doutorado.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Grande área: Engenharias
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Neurociência Computacional.
2017 - 2018
Pós-Doutorado.
Università degli Studi di Padova, UNIPD, Itália.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
2016 - 2017
Pós-Doutorado.
Università degli Studi di Padova, UNIPD, Itália.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
2015 - 2016
Pós-Doutorado.
Universidade Federal de Santa Catarina, UFSC, Brasil.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra


Formação Complementar


2014 - 2014
Spring College on the Physics of Complex Systems. (Carga horária: 100h).
International Centre For Theoretical Physics, ICTP, Itália.
2011 - 2011
Eletrônica Orgânica. (Carga horária: 15h).
Universidade Federal de Santa Catarina, UFSC, Brasil.
2010 - 2010
The analysis of photoionized media. (Carga horária: 15h).
Universidade Federal de Santa Catarina, UFSC, Brasil.
2010 - 2010
Gravitational lenses. (Carga horária: 15h).
Universidade Federal de Santa Catarina, UFSC, Brasil.
2009 - 2009
Escola de Verão - Física. (Carga horária: 20h).
Pontifícia Universidade Católica do Rio de Janeiro, PUC-Rio, Brasil.
2008 - 2008
Extensão universitária em Atualização para Professores de Matemática. (Carga horária: 40h).
Universidade Federal do Paraná, UFPR, Brasil.
2008 - 2008
Tendências em Educação Matemática. (Carga horária: 20h).
Universidade Federal do Paraná, UFPR, Brasil.
2008 - 2008
Conjuntos de von Neumann e Aplicações. (Carga horária: 30h).
Universidade Federal do Paraná, UFPR, Brasil.


Atuação Profissional



Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Vínculo institucional

2018 - Atual
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-doutorado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.


Università degli Studi di Padova, UNIPD, Itália.
Vínculo institucional

2016 - 2018
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-doutorado, Regime: Dedicação exclusiva.


Universidade Federal de Santa Catarina, UFSC, Brasil.
Vínculo institucional

2015 - 2016
Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Prof. Substituto, Depto. Eng. da Mobilidade, Carga horária: 20

Vínculo institucional

2015 - 2015
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Monitor de Lab. de Física I, Curso EaD Física, Carga horária: 20

Vínculo institucional

2013 - 2014
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Monitor de Cáculo I - Curso EaD Física, Carga horária: 20

Vínculo institucional

2011 - 2013
Vínculo: , Enquadramento Funcional: Professor Substituto do Depto. de Física, Carga horária: 20

Atividades

11/2015 - 02/2016
Ensino, Abi - Engenharia da Mobilidade, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Geometria Analítica
03/2013 - 07/2013
Ensino, Meteorologia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Física Geral II-A
03/2013 - 07/2013
Ensino, Engenharia Elétrica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Física I (Teoria e Laboratório)
08/2012 - 12/2012
Ensino, Engenharia Química, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Física III
08/2011 - 12/2012
Ensino, Engenharia Mecânica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Ondas e Calor
08/2011 - 08/2012
Ensino, Engenharia de Produção Elétrica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Ondas e Calor
08/2011 - 08/2012
Ensino, Engenharia de Produção Civil, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Ondas e Calor

Governo do Estado do Paraná, GOVERNO/PR, Brasil.
Vínculo institucional

2008 - 2009
Vínculo: Professor Substituto - PSS, Enquadramento Funcional: Professor de Física - CEBEJA, Carga horária: 20


Universidade do Estado de Santa Catarina, UDESC, Brasil.
Vínculo institucional

2015 - 2016
Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor Substituto do Depto. de Física, Carga horária: 4

Atividades

09/2015 - 02/2016
Ensino, Engenharia Mecânica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Física III


Projetos de pesquisa


2018 - Atual
Modelização cerebral personalizada em pacientes com acidente vascular cerebral
Descrição: O cérebro humano é um sistema complexo caracterizado por muitas escalas espaço-temporais. Em larga escala, as fibras de substância branca derivadas a partir de técnicas de imagem de difusão por ressonância magnética definem o conectoma humano, ou seja, a rede de conexões estruturais (ou anatômicas) de substância branca que ligam distintas regiões mesoscópicas do cérebro. Por outro lado, a atividade neuronal de larga escala pode ser acessada através de ressonância magnética funcional (fMRI), que é uma técnica de imagem não-invasiva quadri-dimensional que mede alterações no nível de oxigênio no sangue (BOLD) ao longo do tempo. Em condições normais de saúde, as séries temporais BOLD se comportam como flutuações espontâneas de baixa frequência ( < 0.1 Hz) e exibem padrões espaço-temporais de correlação em diferentes áreas do cérebro, seja em estado de repouso ou durante a execução de uma determinada função (cognitiva, motória, auditiva etc). Pacientes sujeitos à patologias cerebrais, como o acidente vascular cerebral (AVC), podem exibir aberrações nos padrões de correlação, e o desenvolvimento de algumas funções podem ser seriamente comprometidas. Do ponto de vista teórico, as conexões estruturais são o principal ingrediente de modelos cerebrais de larga escala, que visam compreender como esses padrões de correlação espaço-temporais, também chamados de conectividade funcional, emergem. O presente projeto de pequisa propõe uma abordagem híbrida, inspirado em um modelo dinâmico baseado na mecânica estatística e na análise de dados empíricos, para investigar a relação entre conectividade estrutural e funcional em pacientes que sofreram acidente vascular cerebral. Além disso, pretendemos desenvolver um marco biológico, baseado na criticalidade do cérebro, capaz de prever, de modo confiável, a performance comportamental e funcional, assim como a sua evolução temporal devido a intervenções terapêuticas..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado: (1) .
Integrantes: Rodrigo Pereira Rocha - Coordenador / Antonio C. Roque - Integrante.
2016 - Atual
Redes de interação e padrões ecológicos emergentes
Descrição: A disponibilidade recente de grandes volumes de dados ecológicos e biológicos que abrangem uma ampla gama de escalas, tornou evidente que, apesar da sua diversidade, os ecossistemas são caracterizados por padrões (regularidades) que se repetem de escalas microscópicas até escalas globais, e este fato pode representar a assinatura da universalidade dos processos intrínsecos à evolução dos ecossistemas. Embora a intensidade das interações ecológicas seja amplamente desconhecida, a arquitetura das redes de interação ecológicas parecem desempenhar um papel fundamental na formação e regulação da dinâmica de comunidades ecológicas e da diversidade dos padrões emergentes auto-organizados. Apesar dos esforços dirigidos para explicar a estrutura das redes ecológicas, a conjectura de um mecanismo fundamental que governe as arquiteturas de rede tem sido evasiva. Infelizmente, a ausência de uma teoria geral que leve em conta a estrutura das interações, a estabilidade e a persistência das espécies impede uma avaliação quantitativa das implicações de tais padrões de rede para a biodiversidade. Uma abordagem de física estatística na modelagem de sistemas ecológicos pode fornecer uma poderosa representação das interações entre as espécies, e pode potencialmente preencher essa lacuna. Este projeto tem como objetivo explorar como esses fenômenos recorrentes emergem como resultado de interações entre os seus elementos constituintes (como por exemplo, espécies), usando uma combinação de abordagens inspiradas pela física estatística e sistemas dinâmicos..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física Geral/Especialidade: Física Estatística e Termodinâmica.
2.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Neurociência Computacional.
3.
Grande área: Engenharias / Área: Engenharia Biomédica / Subárea: Bioengenharia/Especialidade: Modelagem de Fenômenos Biológicos.
4.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física da Matéria Condensada/Especialidade: Propriedades de Transportes de Matéria Condensada (Não Eletrônica).


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Bem.
Italiano
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Pouco.


Prêmios e títulos


2018
Bolsa de Pós-doutorado, FAPESP.
2017
Postdoctoral fellowship (University of Padua), Istituto Nazionale di Fisica Nucleare.
2015
Bolsa de Pós-doutorado, CNPq.
2014
Bolsa de doutorado Sanduíche, Ciência sem fronteiras, CAPES.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
Chengyi Tu2018 Chengyi Tu ; ROCHA, RODRIGO P. ; Maurizio Corbetta ; Sandro Zampieri ; Marco Zorzi ; SUWEIS, SAMIR . Warnings and caveats in brain controllability. NEUROIMAGE, v. 176, p. 83-91, 2018.

2.
ROCHA, RODRIGO P.2016 ROCHA, RODRIGO P.; FIGUEIREDO, WAGNER ; SUWEIS, SAMIR ; MARITAN, AMOS . Species survival and scaling laws in hostile and disordered environments. PHYSICAL REVIEW E, v. 94, p. 042404, 2016.

3.
ROCHA, RODRIGO P.2015 ROCHA, RODRIGO P.; FREIRE, JOSÉ A. . Relaxation time in disordered molecular systems. JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS, v. 142, p. 204109, 2015.

4.
ROCHA, RODRIGO P.2012 ROCHA, RODRIGO P.; FREIRE, JOSE A. . The time-of-flight experiment and the average transit-time. JOURNAL OF APPLIED PHYSICS, v. 112, p. 083717, 2012.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
ROCHA, RODRIGO P.. Critical dynamics in whole-brain systems. In: V ComplexNet, 2018, Cachoeira Paulista. V ComplexNet, 2018.

2.
ROCHA, RODRIGO P.. Studying the effects of network nodes sensitivity in a model of brain dynamics poised at criticality. In: BIFI International conference 2018, 2018, Zaragoza (Spain). Abstracts compilation, 2018.

3.
ROCHA, RODRIGO P.. Surviving in hostile and inhomogeneous environments. In: Conference on Complex Systems, 2016, Amsterdam. Abstracts compilation, 2016.

4.
ROCHA, RODRIGO P.. Surviving in hostile and heterogeneous environments. In: XXI Convegno Nazionale di Fisica Statistica e dei Sistemi Complessi, 2016, Parma. Programma, 2016.

5.
ROCHA, RODRIGO P.. Intrinsic mobility in the time-of-flight experiment (TOF). In: XI Brazilian MRS Meeting, 2012, Florianópolis. SBPmat, 2012.

6.
ROCHA, RODRIGO P.. Model for the time-of-flight experiment. In: INEO, 2011, Atibaia. Poster Presentation Abstracts, 2011.

7.
ROCHA, RODRIGO P.. Model for the time-of-flight experiment. In: Encontro de Física, 2011, Foz do Iguaçú. Programa geral, 2011.

8.
ROCHA, RODRIGO P.. Cálculo da integral de transferência para pentacenos. In: EVINCI, 2009, Curitiba. Livro de resumos, 2009.

9.
ROCHA, RODRIGO P.. Calculation of the Pentacene Transfer Integral. In: XXXII Brazilian Meeting on Condensed Matter Physics, 2009, Águas de Lindóia. XXXII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2009.

Artigos aceitos para publicação
1.
ROCHA, RODRIGO P.; Loren Kocillari ; SUWEIS, S. ; Maurizio Corbetta ; MARITAN, AMOS . Homeostatic plasticity and emergence of functional networks in a whole-brain model at criticality. Scientific Reports, 2018.

Apresentações de Trabalho
1.
ROCHA, RODRIGO P.. Modelos computacionais para a dinâmica neuronal de larga escala: aplicações para o estudo de doenças neurológicas. 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

2.
ROCHA, RODRIGO P.. Contribuições da mecânica estatística para a modelagem cerebral personalizada. 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

3.
ROCHA, RODRIGO P.; MARITAN, A. ; SUWEIS, S. . Criticality unveiling subject variability in brain functional activity. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

4.
ROCHA, RODRIGO P.; SUWEIS, S. ; MARITAN, A. . Subject variability in brain functional activity in healthy and stroked conditions. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

5.
ROCHA, RODRIGO P.; SUWEIS, S. ; MARITAN, A. . Signatures of criticality in neural systems. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

6.
ROCHA, RODRIGO P.; FREIRE, J.A . Model for the time-of-flight experiment. 2011. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

7.
ROCHA, RODRIGO P.. Introdução à Física Quântica. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

8.
ROCHA, RODRIGO P.; FREIRE, J.A . Calculation of the Pentacene Transfer Integral. 2009. (Apresentação de Trabalho/Seminário).


Produção técnica
Programas de computador sem registro
1.
ROCHA, RODRIGO P.. Point process in large-scale fMRI. 2018.

2.
ROCHA, RODRIGO P.. Controllability of brain networks. 2017.

3.
ROCHA, RODRIGO P.. Stochastic neural dynamics. 2016.

4.
ROCHA, RODRIGO P.. Localization in hostile and disordered environments. 2015.


Demais tipos de produção técnica
1.
ROCHA, RODRIGO P.. PratiCoNeuro 2018 ? II Curso Prático de Modelagem Computacional em Neurociência. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Outra).



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
V ComplexNet - Workshop and School on Dynamics, Transport and Control in Complex Networks.Critical dynamics in whole-brain systems. 2018. (Outra).

2.
Lipari School on Complex Networks: From Socio-Economic Systems to Biology and Brain. Subject variability in brain functional activity in healthy and stroked conditions. 2017. (Congresso).

3.
XVI International Meeting on "Selected Topics in Nuclear and Atomic Physics".Signatures of criticality in neural systems. 2017. (Encontro).

4.
XXII National Conference on Statistical Physics and Complex Systems. Criticality unveiling subject variability in brain functional activity. 2017. (Congresso).

5.
Analysis and Control on networks: trends and perspectives. 2016. (Congresso).

6.
Conference on Complex Systems. Surviving in hostile and inhomogeneous environments. 2016. (Congresso).

7.
XXI National Conference on Stat. Physics and Complex Sys.. Surviving in hostile and heterogeneous environments. 2016. (Congresso).

8.
III Encontro de Pós-Graduação em Física e Astronomia da UFSC.Tempo de difusão e termalização em sistemas desordenados moleculares. 2015. (Encontro).

9.
IV Encontro de Formação de Tutores Curso de Licenciatura em Física. 2015. (Encontro).

10.
Conference on Field Theory Methods in Low-Dimensional Strongly Correlated Quantum Systems. 2014. (Outra).

11.
European Conference on Complex Systems. 2014. (Congresso).

12.
I Encontro de Pós-Graduação em Física e Astronomia da UFSC. 2013. (Encontro).

13.
XI Encontro da SBPMat.Intrinsic mobility in the time-of-flight experiment. 2012. (Encontro).

14.
Encontro de Física (Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada).Model for the time-of-flight experiment. 2011. (Encontro).

15.
Instituto Nacional de Eletrônica Orgânica.Model for the time-of-flight experiment. 2011. (Outra).

16.
Instituto Nacional de Eletrônica Orgânica. 2010. (Outra).

17.
VIII Workshop em Física Molecular e Espectroscopia. 2010. (Outra).

18.
EVINCI.Calculation of the Pentacene Transfer Integral. 2009. (Encontro).

19.
XXXII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada.Calculation of the Pentanece Transfer Integral. 2009. (Encontro).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
ROQUE, A. C. ; ROCHA, RODRIGO P. ; Cecília Romaro ; BORGES, F. S. ; Fernanda Dellajustina ; Mauricio Girardi-Schappo ; KAMIJI, N. L. ; Paulo Protachevicz ; SHIMOURA, R. O. ; PENA, R. F. O. ; CORDEIRO, V. L. . PratiCoNeuro 2018 ? II Curso Prático de Modelagem Computacional em Neurociência. 2018. (Outro).



Orientações



Orientações e supervisões concluídas
Dissertação de mestrado
1.
Federico Lisi. Statistical Mechanics Approach to Neural Networks. 2017. Dissertação (Mestrado em Engenharia Matemática) - Università degli Studi di Padova, . Coorientador: Rodrigo Pereira Rocha.

Trabalho de conclusão de curso de graduação
1.
Francesco D'Angelo. Approccio meccanico statistico per la modellizzazione dell?attività del cervello a riposo. 2018. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Física) - Università degli Studi di Padova. Orientador: Rodrigo Pereira Rocha.



Educação e Popularização de C & T



Programa de Computador sem registro de patente
1.
ROCHA, RODRIGO P.. Point process in large-scale fMRI. 2018.

2.
ROCHA, RODRIGO P.. Controllability of brain networks. 2017.

3.
ROCHA, RODRIGO P.. Stochastic neural dynamics. 2016.

4.
ROCHA, RODRIGO P.. Localization in hostile and disordered environments. 2015.



Outras informações relevantes


Aprovado em Concurso para Provimento de Cargos da Carreira do Magistério Superior da Universidade Federal da Fronteira Sul (UFFS) - campus Cerro Largo - RS. Portaria de nomeação No. 357/GR/UFFS/2014. Aprovado em Concurso Público (03/2015) para Provimento de Cargos da Carreira do Magistério Superior da Universidade do Estado de Santa Catarina - Campus Lages - SC. Portaria de homologação No. 1618 de 27/11/2015.



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