Amanda Rusiska Piovezani

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  • Última atualização do currículo em 17/10/2018


Possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade Estadual do Norte do Paraná, mestrado e doutorado em Bioinformática pela Universidade de São Paulo. Tem experiência nas áreas de Análise de Dados, Genética com ênfase em Bioinformática, atuando principalmente nos temas: redes complexas, análise de sequências biológicas, integração de dados e predição de alvos de microRNAs. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Amanda Rusiska Piovezani
Nome em citações bibliográficas
PIOVEZANI, A. R.;PIOVEZANI, AMANDA RUSISKA

Endereço


Endereço Profissional
Universidade de São Paulo, Instituto de Matemática e Estatística, Interunidades de Bioinformática.
Rua do matao, 1010
Butantã
05508090 - São Paulo, SP - Brasil
Telefone: (011) 30919980
Ramal: 9980
URL da Homepage: http://www.ime.usp.br/posbioinfo


Formação acadêmica/titulação


2013 - 2017
Doutorado em Bioinformática.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: DESENVOLVIMENTO DE UMA FERRAMENTA DE BIOINFORMÁTICA PARA INTEGRAÇÃO DAS ESCALAS DE TRANSCRIÇÃO GÊNICA, PROTEÔMICA E FISIOLOGIA UTILIZANDO SORGO E CANA-DE-AÇÚCAR COMO SISTEMAS MODELOS, Ano de obtenção: 2017.
Orientador: Marcos Silveira Buckeridge.
Coorientador: Fabrício Martins Lopes.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
2010 - 2013
Mestrado em Bioinformática.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Predição computacional de alvos de microRNAs associados a fenótipos de interesse.,Ano de Obtenção: 2013.
Orientador: Ariane Machado Lima.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Palavras-chave: Bioinformática.
Grande área: Ciências Biológicas
2005 - 2009
Graduação em Ciências Biológicas.
Universidade Estadual do Norte do Paraná, UENP, Brasil.
Título: Caracterização de Análogos de Genes de Resistência e sua Associação com Resistência à Ferrugem Asiática da Soja..
Orientador: Ricardo Vilela Abdelnoor.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.




Formação Complementar


2014 - 2014
Análise de Dados de RNA-Seq via Bioconductor. (Carga horária: 3h).
Sociedade Brasileira de Genética, SBG, Brasil.
2013 - 2013
Curso de Escrita Científica. (Carga horária: 8h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2011 - 2011
2 Curso de Tópicos em Biologia Computacional.
Universidade Tecnológica Federal do Paraná, UTFPR, Brasil.
2011 - 2011
IT Workshop.
Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, AB3C, Brasil.
2011 - 2011
De Novo Assembly.
Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, AB3C, Brasil.
2011 - 2011
Bioinformática Aplicada à Genômica de Procariotos. (Carga horária: 24h).
Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, EMBRAPA SOJA, Brasil.
2011 - 2011
Biopolímeros microbianos. (Carga horária: 20h).
Universidade Estadual de Londrina, UEL, Brasil.
2011 - 2011
Bioinformatics Practical Course.
Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, AB3C, Brasil.
2011 - 2011
Next Generation Sequencing. (Carga horária: 36h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2010 - 2010
VI Genética nas férias. (Carga horária: 10h).
Universidade Estadual de Londrina, UEL, Brasil.
2010 - 2010
Engenharia Genética de Plantas e Bioinformática. (Carga horária: 10h).
Universidade Estadual de Londrina, UEL, Brasil.
2010 - 2010
Ferr. Biotec. Aplic. Estu. Expr. Gên. em Plant. (Carga horária: 10h).
Universidade Estadual de Londrina, UEL, Brasil.
2008 - 2010
Extensão universitária em Estágio em Biotecnologia Vegetal. (Carga horária: 2407h).
Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, EMBRAPA SOJA, Brasil.
2009 - 2009
Bases para publicaçao científica internacional. (Carga horária: 24h).
Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, EMBRAPA, Brasil.
2009 - 2009
Curso de Verão em Bioinformática. (Carga horária: 30h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2009 - 2009
Curso de Inverno: V Genética nas Férias. (Carga horária: 11h).
Universidade Estadual de Londrina, UEL, Brasil.
2009 - 2009
Utilização Marc. Mol. no estudo de Pop. vegetais. (Carga horária: 10h).
Universidade Estadual de Londrina, UEL, Brasil.
2009 - 2009
Bionformática: Análises em Genômica e Transcript.. (Carga horária: 24h).
Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, EMBRAPA SOJA, Brasil.
2008 - 2008
PCR quantitativo em tempo real. Met. e Aplicações. (Carga horária: 21h).
Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, EMBRAPA, Brasil.
2007 - 2007
Epigenética: Novos Rumos na Genética Humana. (Carga horária: 3h).
Sociedade Brasileira de Genética, SBG, Brasil.
2006 - 2007
Extensão universitária em Microbiologia. (Carga horária: 2312h).
Universidade Estadual do Norte do Paraná, UENP, Brasil.
2006 - 2006
Extensão universitária em 11ºCONEB da UNE. (Carga horária: 20h).
União Nacional dos Estudantes, UNE, Brasil.
2006 - 2006
A citogenética como Ferr. na Caract. de Germoplasm. (Carga horária: 8h).
Universidade Estadual de Maringá, UEM, Brasil.
2006 - 2006
Manejo de Animais Silvestres. (Carga horária: 8h).
Sociedade Brasileira de Zoologia, SBZ, Brasil.
2006 - 2006
Epífitas Vasculares: adaptações Morf e Anat.. (Carga horária: 8h).
Universidade Estadual de Maringá, UEM, Brasil.
2006 - 2006
Genética de Fungos Filamentosos. (Carga horária: 10h).
Universidade Estadual de Londrina, UEL, Brasil.
2006 - 2006
Citogenética Animal. (Carga horária: 10h).
Universidade Estadual de Londrina, UEL, Brasil.
2006 - 2006
A citogenética como Ferr. na Caract. de Germoplasm. (Carga horária: 8h).
Universidade Estadual de Maringá, UEM, Brasil.
2006 - 2006
Epífitas Vasculares: Adapt. Morf e Anat. (Carga horária: 8h).
Universidade Estadual de Maringá, UEM, Brasil.


Atuação Profissional



Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Vínculo institucional

2013 - Atual
Vínculo: Pós-Graduação, Enquadramento Funcional: Doutorado, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

2010 - 2013
Vínculo: Pós-Graduação, Enquadramento Funcional: Mestrado, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

02/2010 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Matemática e Estatística, Interunidades de Bioinformática.


Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, EMBRAPA, Brasil.
Vínculo institucional

2008 - 2010
Vínculo: livre, Enquadramento Funcional: Biotecnologia Vegetal, Carga horária: 30, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

02/2008 - 02/2010
Pesquisa e desenvolvimento , Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Embrapa Soja, .



Linhas de pesquisa


1.
Sequenciamento de genes análogos de resistência em soja

Objetivo: Sequenciamento de dois genes análogos de resistência em soja..
2.
Mapeamento de dois genes de resistência à ferrugem asiática da soja

Objetivo: Identificação de marcadores moleculares microssatélites (SSR) ligados a genes de resistência à ferrugem asiática.
3.
Estudo com marcadores microssatélites em soja

Objetivo: Identificação de marcadores microssatélites no estudo com resistência a doenças em soja.
4.
Predição computacional de alvos de microRNAs
5.
Using systems biology approach to develop a model for whole plant functioning

Objetivo: Desenvolvimento de uma ferramenta de bioinformática para integração das escalas de transcrição gênica, proteômica e fisiologia utilizando sorgo e cana-de-açúcar como sistemas modelos.


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Bioinformática.
2.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Biologia Molecular.


Idiomas


Espanhol
Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.
Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.


Prêmios e títulos


2009
O melhor Pôster do Evento - Identificação de SNPs/InDels em Análogos de Genes de Resistência em Soja, Universidade Estadual do Norte do Paraná - Campus Luiz Meneghel.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
BASTOS, ELEN PEREIRA2014BASTOS, ELEN PEREIRA ; BRENTANI, HELENA ; PASINI, FATIMA SOLANGE ; SILVA, ADERBAL RUY T. ; TORRES, CESAR HENRIQUE ; PUGA, RENATO DAVID ; OLIVIERI, ELOISA HELENA RIBEIRO ; PIOVEZANI, AMANDA RUSISKA ; PEREIRA, CARLOS ALBERTO DE BRAGANÇA ; MACHADO-LIMA, ARIANE ; CARRARO, DIRCE MARIA ; BRENTANI, MARIA MITZI . MicroRNAs Discriminate Familial from Sporadic Non-BRCA1/2 Breast Carcinoma Arising in Patients ≤35 Years. Plos One, v. 9, p. e101656, 2014.

Resumos expandidos publicados em anais de congressos
1.
PIOVEZANI, A. R.; PEREIRA, R. M. ; ABDELNOOR, R. V. . Caracterização de Genes Análogos de Resistência a Doenças em Soja. In: IV Jornada Acadêmica da Embrapa Soja, 2009, Londrina - PR. IV Jornada Acadêmica da Embrapa Soja, 2009.

2.
PIOVEZANI, A. R.; PEREIRA, R. M. ; ABDELNOOR, R. V. . Identificação de SNPs/InDels em Análogos de Genes de Resistência em Soja. In: I Simpósio de Ciências Ambientais do Norte do Paraná, 2009, Bandeirantes. Anais do I SICAMP, 2009.

3.
PIOVEZANI, A. R.; SILVA, D. C. G. ; STOLF, R. ; MORTEL, M. V. ; LEMOS, N. G. ; SANTOS, J. V. M. ; PEREIRA, R. M. ; BINNECK, E. ; ALMEIDA, A. M. R. ; YAMANAKA, N. ; MARCELINO, F. C. ; BAUM, T. J. ; WHITHAM, S. A. ; LEMOS, E. G. M. ; ABDELNOOR, R. V. . Análise de Microarranjo de cDNA da Soja Induzidos durante Interação com a Ferrugem Asiática. In: I Simpósio de Ciências Ambientais do Norte do Paraná, 2009, Bandeirantes. Anais do I SICAMP, 2009.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
PIOVEZANI, A. R.; BRENTANI, H. P. ; MACHADO-LIMA, A. . MicroRNAs Target Prediction in Breast Cancer. In: MicroRNA 2012 International Symposium, 2012, São Paulo. Program & Abstracts, 2012.

2.
PIOVEZANI, A. R.; BASTOS, E ; BRENTANI, MITZI ; BRENTANI, H. P. ; MACHADO-LIMA, A. . Target Prediction of miRNA in Breast Cancer. In: 7 International Conference of Bioinformatics and Computational Biology - X-meeting, 2011, Florianópolis. Abstracts Book, 2011.

3.
PIOVEZANI, A. R.; BRENTANI, H. P. ; MACHADO-LIMA, A. . Predicting Targets of MiRNAs in Schizophrenia. In: 6 International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology - X-meeting, 2010, Ouro Preto. Abstracts Book, 2010.

4.
CAMARGO, P. C. ; CATELLI, L. L. ; RINCAO, M. P. ; PIOVEZANI, A. R. ; ARIAS, C. A. A. ; ABDELNOOR, R. V. . Mapeamento do Locus de Resistência à Ferrugem Asiática no Genótipo PI 561356. In: V Congresso Brasileiro de Soja e Mercosoja 2009, 2009, Goiânia - GO. Anais Mercosoja 2009, 2009.

5.
PIOVEZANI, A. R.; PEREIRA, R. M. ; ABDELNOOR, R. V. . Caracterização de Polimorfismo em Genes Análogos de Resistência a Doneças em Soja. In: 55º Congresso Brasileiro de Genética, 2009, Águas de Lindóia. Anais Eletrônicos-Resumos, 2009.

6.
PIOVEZANI, A. R.; SANTOS, . L. S. ; GOISSIS, M. V. ; BARREIRO., I. M. J. ; BELLETTINI., N. M. T. . Testes de Vigor em Sementes de Amendoim. In: XI Semana da biologia, 2007, Botucatu - SP. XI Semana da Biologia, 2007.

7.
SANTOS, . L. S. ; PIOVEZANI, A. R. ; BARREIRO., I. M. J. ; GOISSIS, M. V. ; BELLETTINI., N. M. T. . Teste de Envelhecimento Acelerado com Soluçao Salina em Sementes de Amendoim. In: XI Semana da biologia, 2007, Botucatu - SP. Anais de XI semana da biologia, 2007.

8.
Roma-Neto, I. V. ; CARVALHO, N. C. ; PIOVEZANI, A. R. ; MATSUMOTO, L. S. . Avaliação de Atividade Antimicrobiana de Desinfetantes de Uso Doméstico com Envelhecimento Acelerado. In: VIII Encontro Maringaense de Biologia, 2006, Maringá - PR. Anais da XXI Semana da Biologia, 2006.

Apresentações de Trabalho
1.
PIOVEZANI, A. R.. Desenvolvimento de uma abordagem integrativa utilizando a cana-de-açúcar como objeto de estudo. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

2.
PIOVEZANI, A. R.. Systems biology on sugarcane roots. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

3.
PIOVEZANI, A. R.; LOPES, F. M. ; BUCKERIDGE, M. S. . Integrating transcriptomics, proteomics and physiology scales in sugarcane roots. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

4.
PIOVEZANI, AMANDA RUSISKA. Bioinformática: transformando dados em ciência. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

5.
PIOVEZANI, A. R.; BRENTANI, H. ; MACHADO-LIMA, A. . SIMTar: A tool for prediction of SNPs Interfering on MicroRNA Target sites. 2013. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

6.
PIOVEZANI, A. R.; BRENTANI, H. P. ; MACHADO-LIMA, A. . Predicting targets of mirnas in schizophrenia. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

7.
PIOVEZANI, A. R.. Predição de alvos de miRNAs em esquizofrenia. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

8.
PIOVEZANI, A. R.; PEREIRA, R. M. ; ABDELNOOR, R. V. . Caracterização de Genes Análogos de Resistência a Doenças em Soja. 2009. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).


Produção técnica
Programas de computador sem registro
1.
PIOVEZANI, A. R.; BRENTANI, H. ; MACHADO-LIMA, A. . SIMTar: Uma ferramenta para predição de SNPs interferindo em sítios alvos de microRNAs. 2013.


Demais tipos de produção técnica
1.
PIOVEZANI, A. R.. Bioinformática Aplicada à Análise de Sequências Biológicas. 2016. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).


Produção artística/cultural
Artes Visuais
1.
PIOVEZANI, A. R.. Onde Está o Coração. 2007. Fotografia.



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
60º Congresso Brasileiro de Genética. Development of a Bioinformatic tool for integration of transcriptomics, proteomics and physiology using sorghum and sugarcane as model systems. 2014. (Congresso).

2.
III Workshop de bioinformática.Development of a Bioinformatic tool for integration of transcriptomics, proteomics and physiology using sorghum and sugarcane as model systems. 2014. (Outra).

3.
III Workshop de Bioinformática.Development of a bioinformatic tool for integration of transcriptomics, proteomics and physiology using sorghum and sugarcane as model systems. 2013. (Encontro).

4.
Latin American eScience workshop "Turning Data into Insight". 2013. (Outra).

5.
USP Conference on Synthetic Biology for Biomass and Biofuels Production. 2013. (Outra).

6.
X-meeting/BSB 2013 Conference. SIMTar: A tool for prediction of SNPs Interfering on MicroRNA Target sites. 2013. (Congresso).

7.
II Workshop de Bioinformática.MicroRNAs Target Site Prediction in SNP Regions Associated to Interest Phenotype. 2012. (Outra).

8.
microRNA2012 International Symposium.MicroRNAs Target Prediction in Complex Diseases. 2012. (Simpósio).

9.
Curso de Verão em Bioinformática 2011.Predicting targets of mirnas in schizophrenia. 2011. (Seminário).

10.
I Simpósio de Bioquímica e Biotecnologia da Universidade Estadual de Londrina - I SIMBBTEC2011. 2011. (Simpósio).

11.
X-meeting, 7 International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology - X-meeting. Target Prediction of miRNA in Breast Cancer. 2011. (Congresso).

12.
Iberoamerican Congress on Pattern Recognition. 2010. (Congresso).

13.
I Workshop de Bioinformática.Predição de alvos de miRNAs em esquizofrenia. 2010. (Encontro).

14.
X-meeting, 6 International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology -.Predicting targets of mirnas in schizophrenia. 2010. (Outra).

15.
55º Congresso Brasileiro de Genética. Caracterização de Polimorfismo em Genes Análogos de Resistência a Doenças em Soja. 2009. (Congresso).

16.
Curso de Inverno: V Genética nas Férias. 2009. (Seminário).

17.
Curso de Verão em Bioinformática. 2009. (Outra).

18.
I Simpósio de Ciências Ambientais do Norte do Paraná.Análise de Microarranjo de cDNA da Soja Induzidos durante Interação com a Ferrugem Asiática. 2009. (Simpósio).

19.
IV Jornada Acadêmica da Embrapa Soja.Caracterização de Genes Análogos de Resistência a Doenças em Soja. 2009. (Seminário).

20.
PCR Quantitativo em Tempo Real: Metodologias e Aplicações. 2008. (Outra).

21.
Seminário de Agronegócio. 2008. (Seminário).

22.
53º Congresso Brasileiro de Genética. 2007. (Congresso).

23.
II CIPAGEM - Ciclo de Palestras sobre Genética. 2007. (Seminário).

24.
11º Coneb da UNE - Conselho Nacional de Entidades de Base. 2006. (Encontro).

25.
I Ciclo de Palestras sobre Genética. 2006. (Seminário).

26.
II Curso de Genética nas Férias. 2006. (Simpósio).

27.
IV Seminário de Apresentação de Monografias do curso de Ciências Biológicas. 2006. (Seminário).

28.
VIII Enconto Maringaense de Biologia e XXI Semana de Biologia.Avaliação de Atividade Antimicrobiana de Desinfetantes de Uso Doméstico com Envelhecimento Acelerado. 2006. (Encontro).

29.
XI Semana da Bio. 2006. (Outra).

30.
XXVI Congresso Brasileiro de Zoologia. 2006. (Congresso).

31.
III Seminário de Apresentação de Monografias do curso de Ciências Biológicas. 2005. (Seminário).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
PIOVEZANI, A. R.; BARROS-CARVALHO, G. A. ; MACHADO, D. J. ; ORPINELLI, F. ; VILLAR, C. ; MOURA, L. ; MARCOS, G. . Curso de Verão em Bioinformática 2014. 2014. (Outro).

2.
PIOVEZANI, AMANDA RUSISKA; BARROS-CARVALHO, G. A. . III Workshop de bioinformática. 2014. (Outro).

3.
PIOVEZANI, A. R.; BARROS-CARVALHO, G. A. ; LIMA, L. A. . Curso de Verão em Bioinformática 2013. 2013. (Outro).

4.
PIOVEZANI, A. R.. III Workshop de Bioinformática. 2013. (Outro).

5.
PIOVEZANI, A. R.. Curso de Verão em Bioinformática 2012. 2012. (Outro).

6.
PIOVEZANI, A. R.. Curso de Verão em Bioinformática 2011. 2011. (Outro).



Educação e Popularização de C & T



Apresentações de Trabalho
1.
PIOVEZANI, AMANDA RUSISKA. Bioinformática: transformando dados em ciência. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).




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