Dinler Amaral Antunes

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  • Última atualização do currículo em 22/01/2018


Possui graduação em Biomedicina pela Universidade Federal do Rio Grande do Sul (2008), com ênfase em Imunologia e Virologia, e mestrado em Genética e Biologia Molecular (2011) pela mesma Universidade (PPGBM/UFRGS). Possui doutorado em Ciências (2014) pelo Programa de Genética e Biologia Molecular (PPGBM/UFRGS), tendo desenvolvido seu projeto no Núcleo de Bioinformática do Laboratório de Imunogenética (NBLI). Tem experiência na área de imunoinformática, com ênfase em resposta imunológica celular, reatividade cruzada e análise estrutural de complexos peptídeo:MHC. Foi um dos responsáveis pelo desenvolvimento do CrossTope Data Bank, um banco contendo estruturas de complexos peptídeo:MHC, com foco no estudo da imunogenicidade e na predição de reatividade cruzada (http://www.crosstope.com.br/). Atualmente desenvolve seu projeto de Pós-Doutorado no Departamento de Ciências da Computação da Rice University, em Houston (TX). Seu trabalho foca no desenvolvimento de um novo algoritmo para ancoramento molecular de complexos peptídeo:MHC, visando aplicações em imunoterapia contra câncer. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Dinler Amaral Antunes
Nome em citações bibliográficas
Antunes, D.A.;Antunes, Dinler A.;ANTUNES, D. A.;ANTUNES, DINLER A

Endereço


Endereço Profissional
Rice University, Department of Computer Science.
6100 Main Street, Duncan Hall, office 3061.
Rice Village
77005 - Houston, - Estados Unidos
Telefone: (111) 1111111
URL da Homepage: http://www.kavrakilab.org/people/DinlerAntunes.html


Formação acadêmica/titulação


2011 - 2014
Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular.
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.
Título: Similaridade estrutural de complexos peptídeo:MHC como um indicador para a ocorrência de reatividade cruzada, Ano de obtenção: 2014.
Orientador: Gustavo Fioravanti Vieira.
Coorientador: Marialva Sinigaglia.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Palavras-chave: Reatividade Cruzada; Hepatitis C Virus; Docking Molecular.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Imunologia / Subárea: Imunogenética / Especialidade: Bioinformática.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Imunologia / Subárea: IMUNOINFORMÁTICA.
Setores de atividade: Pesquisa e desenvolvimento científico.
2009 - 2011
Mestrado em Genética e Biologia Molecular.
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.
Título: Estudo in silico das bases moleculares responsáveis pela reatividade cruzada entre epitopos virais restritos ao alelo HLA-A*02:01.,Ano de Obtenção: 2011.
Orientador: Gustavo Fioravanti Vieira.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Imunologia / Subárea: Imunogenética / Especialidade: Bioinformática.
2005 - 2008
Graduação em Biomedicina.
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.
Título: Utilização de Ferramentas de Bioinformática para a Análise do Potencial de Reatividade Cruzada entre Epitopos Virais.
Orientador: José Artur Bogo Chies.


Pós-doutorado


2015
Pós-Doutorado.
Rice University, RICE, Estados Unidos.
Grande área: Ciências Biológicas
2014
Pós-Doutorado.
Rice University, RICE, Estados Unidos.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra


Formação Complementar


2016 - 2016
Proposal Writing Workshop. (Carga horária: 12h).
Rice University, RICE, Estados Unidos.
2015 - 2015
Entering Mentoring Workshop. (Carga horária: 8h).
Rice University, RICE, Estados Unidos.
2014 - 2014
Extensão universitária em Nuclear Magnetict Ressonance Applied to Proteins. (Carga horária: 30h).
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.
2013 - 2013
Extensão universitária em Método lógico para redação científica. (Carga horária: 16h).
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.
2012 - 2012
Immunoinformatics (ISCB Tutorial). (Carga horária: 7h).
Pontificia Universidad Católica de Chile, PUCC, Chile.
2011 - 2011
Macromolecular Structure, Protein Function. (Carga horária: 3h).
Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, AB3C, Brasil.
2009 - 2011
Curso de Inglês (Básico, Intermediário e Avançado). (Carga horária: 180h).
Minds English School, MINDS, Brasil.
2010 - 2010
Métodos de Docking Receptor-Ligante. (Carga horária: 6h).
Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.
2010 - 2010
Dinâmica Molecular Básica. (Carga horária: 6h).
Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.
2009 - 2009
Introdução a Docagem Molecular. (Carga horária: 9h).
Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, PUCRS, Brasil.
2009 - 2009
Modelagem e Dinâmica Molecular. (Carga horária: 9h).
Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, PUCRS, Brasil.
2008 - 2008
Extensão universitária em Curso de Biotecnologia Molecular e Bioinformática. (Carga horária: 15h).
Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, PUCRS, Brasil.
2007 - 2007
Extensão universitária em Atualização em Imunologia. (Carga horária: 20h).
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.
2007 - 2007
Extensão universitária em I Simpósio de Bio.Mol. aplic. às Ciências da Saúde. (Carga horária: 6h).
Fundação Universidade Federal de Ciências da Saúde de Porto Alegre, UFCSPA, Brasil.
2007 - 2007
Immuno.Bioinf.,Epitope Discovery and Vacine Design. (Carga horária: 4h).
Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, AB3C, Brasil.
2007 - 2007
Introdução a Biologia Molecular Computacional. (Carga horária: 30h).
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.
2006 - 2006
Extensão universitária em Curso de Extensão em Genética. (Carga horária: 30h).
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.
2005 - 2005
Extensão universitária em I Curso de Manipulação Genética. (Carga horária: 8h).
Hospital de Clínicas de Porto Alegre, HCPA, Brasil.
2005 - 2005
Extensão universitária em Curso de Extensão em Genética Forense. (Carga horária: 40h).
Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, PUCRS, Brasil.


Atuação Profissional



Instituto de Pesquisas Veterinárias Desidério Finamor, IPVDF, Brasil.
Vínculo institucional

2008 - 2009
Vínculo: Estágio Curricular, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 40


Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.
Vínculo institucional

2011 - 2014
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Aluno de Doutorado (CNPq), Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

2009 - 2011
Vínculo: Bolsista de Mestrado CNPq, Enquadramento Funcional: Aluno de Mestrado, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

2008 - 2008
Vínculo: Estágio Obrigatório, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 29
Outras informações
Estágio Obrigatório em Pesquisa, duranto o qual foi realizado o Trabalho de Conclusão de Curso (TCC).

Vínculo institucional

2008 - 2008
Vínculo: Treinamento em Citometria, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 10
Outras informações
Treinamento em Citometria de Fluxo, no serviço oferecido pelo Laboratório de Imunogenética, para quantificação das populações de linfócitos T CD4/CD8 no soro de pacientes HIV+.

Vínculo institucional

2006 - 2008
Vínculo: Livre, Enquadramento Funcional: Bolsista de Iniciação Científica, Carga horária: 20
Outras informações
Bolsista PIBIC CNPq/UFRGS

Vínculo institucional

2006 - 2008
Vínculo: Representante, Enquadramento Funcional: Representante Discente
Outras informações
Membro da Comissão de Pesquisa (COMPESQ) do Instituto de Ciências Básicas da Saúde (ICBS).

Vínculo institucional

2006 - 2006
Vínculo: Monitoria, Enquadramento Funcional: Monitor, Carga horária: 20
Outras informações
Colaborador voluntário nas aulas práticas do III Curso de Técnicas de Estudo dos Primeiros Estágios Embrionários, no Departamento de Ciências Morfológicas do Instituto de Ciências Básicas da Saúde.


Rice University, RICE, Estados Unidos.
Vínculo institucional

2015 - Atual
Vínculo: Postdoctoral Researcher, Enquadramento Funcional: Postdoctoral Research Associate, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

2014 - 2015
Vínculo: Postdoctoral Researcher, Enquadramento Funcional: Complimentary Postdoctoral Research Associate, Regime: Dedicação exclusiva.



Projetos de pesquisa


2017 - Atual
Structural modeling of peptide-HLA complexes presenting a melanoma-associated antigen for cross-reactivity assessment
Descrição: Este projeto visa utilizar ferramentas de bioinformática estrutural para análisar dois alvos tumorais com potencial uso para o desenvolvimento de imunoterapias contra melanoma.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) .
Integrantes: Dinler Amaral Antunes - Integrante / Lydia E. Kavraki - Coordenador / Mark Moll - Integrante / Gregory A. Lizée - Integrante / Didier Devaurs - Integrante.Financiador(es): Cancer Prevention and Research Institute of Texas - Auxílio financeiro.
Número de produções C, T & A: 1
2016 - Atual
Structure-based Selection of Tumor-antigens for T-cell Based Immunotherapy
Descrição: Este projeto visa desenvolver e aplicar ferramentas de bioinformática estrutural, sobretudo ancoramento moleuclar, para ajudar na identificação e seleção de peptídeos tumorais com potencial uso como alvos para o desenvolvimento de imunoterapias contra o câncer.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) .
Integrantes: Dinler Amaral Antunes - Integrante / Lydia E. Kavraki - Coordenador / Mark Moll - Integrante / Gregory A. Lizée - Integrante / Didier Devaurs - Integrante.Financiador(es): National Institutes of Health - Auxílio financeiro.
Número de produções C, T & A: 1
2009 - 2014
Large-Scale MHC Epitope Analysis for Vaccine Development
Descrição: Create 3-D computer models of viral epitopes anchored to different alleles of MHC molecules to search for ?generalist? epitopes that can be used to develop viral vaccines that are effective against a broad spectrum of pathogens.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) .
Integrantes: Dinler Amaral Antunes - Integrante / Gustavo Fioranvanti Vieira - Coordenador / José Artur Bogo Chies - Integrante / Maurício Menegatti Rigo - Integrante / Samuel Paulo Cibulski - Integrante / Cassiana Chassot Fülber - Integrante / Marialva Sinigaglia - Integrante.Financiador(es): Bill & Melinda Gates Foundation - Auxílio financeiro.
2006 - 2014
Peptídeos Virais Imunodominantes como Determinantes de Reatividade Cruzada no Sistema Imune
Descrição: Analisar, através de metodologias de bioinformática a estrutura de epitopos virais imunodominantes em busca de seqüências padrão e estruturas conservadas com o objetivo final de desenvolvimento de vacinas anti-virais de amplo espectro.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) .
Integrantes: Dinler Amaral Antunes - Integrante / Gustavo Fioranvanti Vieira - Coordenador / José Artur Bogo Chies - Integrante / Maurício Menegatti Rigo - Integrante / Samuel Paulo Cibulski - Integrante / Cassiana Chassot Fülber - Integrante / Marialva Sinigaglia - Integrante.Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.


Revisor de periódico


2012 - Atual
Periódico: African Journal of Microbiology Research
2014 - Atual
Periódico: Computers in Biology and Medicine
2017 - Atual
Periódico: Journal of Molecular Graphics and Modelling
2015 - Atual
Periódico: IEEE-ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics
2016 - Atual
Periódico: Current Computer-Aided Drug Design


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Imunogenética/Especialidade: Bioinformática.
2.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Imunologia.
3.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Biologia e Fisiologia dos Microorganismos/Especialidade: Virologia.
4.
Grande área: Ciências da Saúde / Área: Medicina / Subárea: Oncologia.


Idiomas


Espanhol
Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.
Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.


Prêmios e títulos


2012
Best poster presentation in the session Biomedicine and Immunoinformatics, entitled Hierarchical Clustering of pMHC Complexes Based on the Electrostatic Potential of the TCR-Interacting Surface., International Society for Computational Biology (ISCB).
2009
Destaque na sessão Genética Molecular no XIX Salão de Iniciação Científica da UFRGS com o trabalho apresentado por CASSIANA CHASSOT FÜLBER, Universidade Federal do Rio Grande do Sul.
2009
Grant of Grand Challenges Explorations - Round 2, pelo projeto Large-Scale MHC Epitope Analysis for Vaccine Development, Bill and Melinda Gates Foundation.
2007
Destaque na sessão Genética Molecular no XIX Salão de Iniciação Científica, Universidade Federal do Rio Grande do Sul.


Produções



Produção bibliográfica
Citações

Web of Science
Total de trabalhos:7
Total de citações:10
Fator H:2
Antunes DA  Data: 07/03/2012

Artigos completos publicados em periódicos

1.
DEVAURS, DIDIER2017DEVAURS, DIDIER ; Antunes, Dinler A. ; PAPANASTASIOU, MALVINA ; MOLL, MARK ; RICKLIN, DANIEL ; LAMBRIS, JOHN D. ; KAVRAKI, LYDIA E. . Coarse-Grained Conformational Sampling of Protein Structure Improves the Fit to Experimental Hydrogen-Exchange Data. FRONTIERS IN MOLECULAR BIOSCIENCES, v. 4, p. eCollection2017, 2017.

2.
Antunes, Dinler A.2017Antunes, Dinler A.; MOLL, MARK ; DEVAURS, DIDIER ; JACKSON, KYLE R. ; LIZÉE, GREGORY ; KAVRAKI, LYDIA E. . DINC 2.0: A New Protein-Peptide Docking Webserver Using an Incremental Approach. CANCER RESEARCH, v. 77, p. e55-e57, 2017.

3.
Antunes, Dinler A.2017 Antunes, Dinler A.; RIGO, MAURÍCIO M. ; FREITAS, MARTIELA V. ; MENDES, MARCUS F. A. ; SINIGAGLIA, MARIALVA ; LIZÉE, GREGORY ; KAVRAKI, LYDIA E. ; SELIN, LIISA K. ; CORNBERG, MARKUS ; VIEIRA, GUSTAVO F. . Interpreting T-Cell Cross-reactivity through Structure: Implications for TCR-Based Cancer Immunotherapy. Frontiers in Immunology, v. 8, p. eCollection2017, 2017.

4.
ZHANG, SHIHONG2015ZHANG, SHIHONG ; BAKSHI, RAKESH K. ; SUNEETHA, POTHAKAMURI VENKATA ; FYTILI, PARASKEVI ; Antunes, D.A. ; VIEIRA, GF ; JACOBS, ROLAND ; KLADE, CHRISTOPH S. ; MANNS, MICHAEL P. ; KRAFT, ANKE R. M. ; WEDEMEYER, HEINER ; SCHLAPHOFF, VERENA ; CORNBERG, MARKUS . Frequency, private specificity and cross-reactivity of pre-existing HCV-specific CD8+ T cells in HCV seronegative individuals: implication for vaccine responses. Journal of Virology (Print), v. 90, p. JVI.00539-15, 2015.

5.
MENDES, MARCUS F.A.2015MENDES, MARCUS F.A. ; Antunes, D.A. ; Rigo, Maurício M. ; Sinigaglia, Marialva ; VIEIRA, GF . Improved structural method for T-cell cross-reactivity prediction. Molecular Immunology, v. xx, p. 01-08, 2015.

6.
ANTUNES, DINLER A2015ANTUNES, DINLER A; DEVAURS, DIDIER ; KAVRAKI, LYDIA E . Understanding the challenges of protein flexibility in drug design. Expert Opinion on Drug Discovery (Print), v. 1, p. 1-13, 2015.

7.
FIGUEIREDO, DANIELI FORGIARINI2014FIGUEIREDO, DANIELI FORGIARINI ; Antunes, D.A. ; Rigo, Maurício M. ; MENDES, MARCUS F.A. ; Silva, Jader P. ; MAYER, FABIANA Q. ; MATTE, URSULA ; GIUGLIANI, ROBERTO ; VIEIRA, GF ; Sinigaglia, Marialva . Lessons from molecular modeling human α-L-Iduronidase. Journal of Molecular Graphics & Modelling, v. 54, p. 107-113, 2014.

8.
Antunes, Dinler A.2014Antunes, Dinler A.; RIGO, MAURÍCIO M. ; SINIGAGLIA, MARIALVA ; DE MEDEIROS, RÚBIA M. ; JUNQUEIRA, DENNIS M. ; ALMEIDA, SABRINA E. M. ; VIEIRA, GUSTAVO F. . New Insights into the In Silico Prediction of HIV Protease Resistance to Nelfinavir. PLoS One, v. 9, p. e87520, 2014.

9.
Sinigaglia, M.2013 Sinigaglia, M. ; ANTUNES, D. A. ; Rigo, M. M. ; Chies, J. A. B. ; Vieira, G. F. . CrossTope: a curate repository of 3D structures of immunogenic peptide: MHC complexes. DATABASE-OXFORD, v. 2013, p. bat002-bat002, 2013.

10.
Rigo, M.M.2012Rigo, M.M. ; Antunes, D.A. ; Sinigaglia, M. ; SINIGAGLIA, M ; Cibulski, SP ; Chies J.A.B. ; Vieira G.F. . Immunogenic epitopes of Hantaviruses' N protein are restricted to conserved regions. Frontiers in Bioscience (Print), v. 17, p. 1582, 2012.

11.
Campos, F. S.2011Campos, F. S. ; Dezen, D. ; Antunes, D.A. ; Santos, H. F. ; Arantes, T.S. ; Cenci, A. ; Gomes, F. ; Lima, F.E.S. ; Brito, W. M. E. D. ; Filho, H.C.K. ; Batista, H.B.C.R. ; Spilki, F. R. ; Franco, A. C. ; Rijsewijk, F.A.M. ; Roehe, P. M. . Efficacy of an inactivated, recombinant bovine herpesvirus type 5 (BoHV-5) vaccine. Veterinary Microbiology (Amsterdam. Print), v. 148, p. 18-26, 2011.

12.
Antunes, D.A.2011 Antunes, D.A.; Rigo, M. M. ; Silva, J. P. ; Cibulski, S. P. ; Sinigaglia, M. ; Chies, J. A. B. ; Vieira, G. F. . Structural in silico analysis of cross-genotype-reactivity among naturally occurring HCV NS3-1073-variants in the context of HLA-A*02:01 allele.. Molecular Immunology, v. 48, p. 1461-1467, 2011.

13.
Antunes, Dinler A.2010 Antunes, Dinler A.; Vieira, G. F. ; Rigo, M. M. ; Cibulski, S. P. ; Sinigaglia, M. ; Chies, J. A. B. . Structural Allele-Specific Patterns Adopted by Epitopes in the MHC-I Cleft and Reconstruction of MHC:peptide Complexes to Cross-Reactivity Assessment. Plos One, v. 5, p. e10353, 2010.

14.
Varela, A.P.M.2010Varela, A.P.M. ; Holz, C. L. ; Cibulski, S. P. ; Teixeira, T. F. ; Antunes, D.A. ; Franco, A. C. ; Roehe, L.R. ; Oliveira, M.T. ; Campos, F. S. ; Dezen, D. ; Cenci, A. ; Brito, W. M. E. D. ; Roehe, P. M. . Neutralizing antibodies to bovine herpesvirus types 1 (BoHV-1) and 5 (BoHV-5) and its subtypes. Veterinary Microbiology (Amsterdam. Print), v. 142, p. 254-260, 2010.

15.
Rigo, M. M.2009Rigo, M. M. ; ANTUNES, D. A. ; Vieira, G. F. ; Chies, J. A. B. . MHC:Peptide Analysis: Implications on the Immunogenicity of Hantaviruses N protein. Lecture Notes in Computer Science, v. 5676, p. 160-163, 2009.

Capítulos de livros publicados
1.
Rigo, M. M. ; Antunes, D.A. ; Sinigaglia, M. ; Chies, J. A. B. ; Vieira, G. F. . MHC, Viral Infection and Immunoinformatics. In: Natalya V. Semiletova. (Org.). Major Histocompatibility Complex: Biology, Functions and Roles in Disease. Hauppauge: Nova Science Publishers, 2012, v. , p. -.

2.
Antunes, D.A.; Rigo, M. M. ; Sinigaglia, M. ; Vieira, G. F. . Structural Immunoinformatics and Vaccine Development. In: Chiheb Battik; Khalil Belhassine. (Org.). Bioinformatics Research: New Developments. 1ed.Hauppauge: Nova Science Publishers, 2012, v. , p. 1-33.

3.
Rigo, M. M. ; ANTUNES, D. A. ; Sinigaglia, M. ; Fülber, C.C. ; Chies, J. A. B. ; Vieira, G. F. . Molecular aspects involved in the immunogenicity against viral epitopes: an immunoinformatic perspective. In: Christian J. Villanueva. (Org.). Immunogenicity. Hauppauge: Nova Science Publishers, 2010, v. , p. -.

Textos em jornais de notícias/revistas
1.
Vieira, G. F. ; Rigo, M. M. ; Antunes, D.A. ; Sinigaglia, M. ; Chies, J. A. B. . Uso de Ferramentas de Bioinformática para Estudo "In Silico" de Reatividade Cruzada. Revista CESUP 2011, Porto Alegre, p. 24 - 25.

Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1.
Fülber, C.C. ; ANTUNES, D. A. ; Rigo, M. M. ; Chies, J. A. B. ; Sinigaglia, M. ; Vieira, G. F. . Reconstruction of MHC Alleles by Cross Modeling and Structural Assessment. In: International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2010, Las Vegas. BIOCOMP'10, USA, 2010.

Resumos expandidos publicados em anais de congressos
1.
Antunes, D.A.; Figueiredo, D. F. ; Rigo, M. M. ; Silva, J. P. ; Chies, J. A. B. ; Sinigaglia, M. ; Vieira, G. F. . Hierarchical Clustering of pMHC Complexes Based on the Electrostatic Potential of the TCR-Interacting Surface. In: Second International Society for Computational Biology Latin American regional meeting (ISCB-Latin America), 2012, Santiago. ISCB-Latin America, 2012.

2.
Rigo, M. M. ; Antunes, D.A. ; Minozzo, R. ; Silva, J. P. ; Figueiredo, D. F. ; Chies, J. A. B. ; Sinigaglia, M. ; Vieira, G. F. . Analysis of Interaction Residues Between HLA-A*02:01 Cleft and Epitopes. In: Second International Society for Computational Biology Latin American regional meeting (ISCB-Latin America), 2012, Santiago. ISCB-Latin America, 2012.

3.
Rigo, M. M. ; Antunes, D.A. ; Vieira, G. F. ; Chies, J. A. B. . Immunogenic regions on the N protein from hantavirus genus: implications in vaccine development.. In: X meeting, 2008, Salvador. Anals of the 4º International Conference of the AB3C, 2008.

4.
Antunes, D.A.; Vieira, G. F. ; Chies, J. A. B. . Structural analyses of viral epitopes and proteolytic simulation of its proteins. In: 3rd International Conference of Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2007, São Paulo. X meeting 2007, 2007.

5.
Vieira, G. F. ; Antunes, D.A. ; Chies, J. A. B. . Viral epitopes: which is(are) the target(s)?. In: International Conference of Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology - X meeting 2007, 2007, São Paulo. X meeting 2007, 2007.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
Antunes, D.A.; Silva, J. P. ; Mendes, M. F. A. ; Rigo, M. M. ; Chies, J. A. B. ; Sinigaglia, M. ; Vieira, G. F. . Cross reactivity prediction based on hierarchical clustering of pMHC complexes. In: 3rd European Congress of Immunology - ECI 2012, 2012, Glasgow, Scotland. Special Issue: Abstracts of the European Congress of Immunology, 2012. v. 137. p. 345-345.

2.
Vieira, G. F. ; Antunes, D.A. ; Rigo, M. M. ; Chies, J. A. B. ; Sinigaglia, M. . CrossTope: a curate repository of three-dimensional structures of MHC:epitope complexes. In: 3rd European Congress of Immunology - ECI 2012, 2012, Glasgow, Scotland. Immunology Special Issue: Abstracts of the European Congress of Immunology, 2012. v. 137. p. 758-758.

3.
Antunes, D.A.; Medeiros, R. M. ; Junqueira, D. M. ; Silva, J. P. ; Rigo, M. M. ; Sinigaglia, M. ; Chies, J. A. B. ; Almeida, S. E. M. ; Vieira, G. F. . Molecular Characterization of a New HIV-1 Protease Mutation in a Position Already Involved With Resistance to Nelfinavir. In: XLI Reunião Anual da SBBq, 2012, Foz do Iguaçu, PR/BR. Anais da XLI Reunião Anual da SBBq, 2012.

4.
Rigo, M. M. ; Antunes, D.A. ; Minozzo, R. ; Silva, J. P. ; Figueiredo, D. F. ; Chies, J. A. B. ; Sinigaglia, M. ; Vieira, G. F. . Analysis of Interaction Residues between HLA-A*02:01 Cleft and Epitopes. In: XLI Reunião Anual da SBBq, 2012, Foz do Iguaçu, PR/BR. Anais da XLI Reunião Anual da SBBq, 2012.

5.
Silva, J. P. ; Antunes, D.A. ; Rigo, M. M. ; Chies, J. A. B. ; Sinigaglia, M. ; Vieira, G. F. . Molecular Modeling of 9 human MHC alleles and a structural analysis of the complexes presenting an EBV-derived epitope. In: XLI Reunião Anual da SBBq, 2012, Foz do Iguaçu, PR/BR. Anais da XLI Reunião Anual da SBBq, 2012.

6.
Silva, J. P. ; Antunes, D.A. ; Medeiros, R. M. ; Junqueira, D. M. ; Rigo, M. M. ; Sinigaglia, M. ; Chies, J. A. B. ; Almeida, S. E. M. ; Vieira, G. F. . Caracterização Molecular de Duas Novas Mutações de Protease de HIV-1 em Posição Envolvida com Resistência ao Nelfinavir. In: XXIV Salão de Iniciação Científica da UFRGS, 2012, Porto Alegre, RS/BR. Anais do XXIV Salão de Iniciação Científica da UFRGS, 2012.

7.
Antunes, D.A.; Rigo, M.M. ; Cibulski, S. P. ; Sinigaglia, M. ; Chies J.A.B. ; Vieira G.F. . Use of multivariate statistical methods for structural virtual screening of cross-reactive targets. In: 7th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology (AB3C) - X-meeting 2011, 2011, Florianópolis. X-meeting 2011, 2011.

8.
Minozzo, R. ; Rigo, M.M. ; Antunes, D.A. ; Sinigaglia, M. ; Vieira, G. F. . Mapping pivotal interaction residues between hla-a*02:01 cleft and epitopes.. In: 7th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology (AB3C) - X-meeting 2011, 2011, Florianópolis. X-meeting 2011, 2011.

9.
Rigo, M. M. ; Figueiredo, D. F. ; Cagliari A. ; ANTUNES, D. A. ; Margis, M. ; Sinigaglia, M. ; Vieira, G. F. . In silico interaction study of nf-yb/nf-yc transcription factor complex.. In: 7th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology (AB3C) - X-meeting 2011, 2011, Florianópolis. X-meeting 2011, 2011.

10.
Figueiredo, D. F. ; Silva, J. P. ; Antunes, D.A. ; Rigo, M. M. ; Mayer, F. Q. ; Giugliani, R. ; Matte, U. ; Vieira, G. F. ; Sinigaglia, M. . Molecular homology modeling of the α-l-iduronidase enzyme (IDUA). In: 7th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology (AB3C) - X-meeting 2011, 2011, Florianópolis. X-meeting 2011, 2011.

11.
Silva, J. P. ; Antunes, D.A. ; Rigo, M. M. ; Chies, J. A. B. ; Sinigaglia, M. ; Vieira, G. F. . Modelagem Molecular de 9 alelos de MHC humanos: conseqüências na apresentação diferencial de um epitopo de Epstein-Barr virus. In: XXIII Salão de Iniciação Científica da UFRGS, 2011, Porto Alegre, RS/BR. Anais do XXIII Salão de Iniciação Científica da UFRGS, 2011.

12.
Fülber, C.C. ; Cibulski, S. P. ; ANTUNES, D. A. ; Rigo, M. M. ; Chies, J. A. B. ; Sinigaglia, M. ; Vieira, G. F. . Reconstruction of MHC alleles by cross modeling and structural assessment. In: International Society for Computational Biology Regional Latin American meeting (ISCB-LA), 2010, Montevidéo. ISCB Latin America, 2010.

13.
Rigo, M. M. ; ANTUNES, D. A. ; Cibulski, S. P. ; Fülber, C.C. ; Sinigaglia, M. ; Chies, J. A. B. ; Vieira, G. F. . Peptide:MHC complexes reconstrution to infer binding affinity for the HLA-A*0201 allele. In: International Society for Computational Biology Regional Latin American meeting (ISCB-LA), 2010, Montevidéo. ISCB Latin America, 2010.

14.
Fülber, C.C. ; ANTUNES, D. A. ; Rigo, M. M. ; Sinigaglia, M. ; Vieira, G. F. ; Chies, J. A. B. . Desenvolvimento de métodos computacionais para automatização do processo de modelagem por homologia e padronização da técnica de modelagem de alelos de MHC humanos.. In: XXII Salão de Iniciação Científica da UFRGS, 2010, Porto Alegre. Anais do XXII Salão de Iniciação Científica da UFRGS, 2010.

15.
Rigo, M. M. ; ANTUNES, D. A. ; Fülber, C.C. ; Chies, J. A. B. ; Sinigaglia, M. ; Vieira, G. F. . Use of Molecular Dynamics and Immunoinformatic Tools to Infer Good and Bad HLA Ligands.. In: XXXV Congresso da Sociedade Brasileira de Imunologia, 2010, Porto Alegre. Anais do XXXV Congresso da Sociedade Brasileira de Imunologia, 2010.

16.
ANTUNES, D. A.; Rigo, M. M. ; Cibulski, S. P. ; Sinigaglia, M. ; Chies, J. A. B. ; Vieira, G. F. . Structural in silico analysis of cross-genotype-reactivity among naturally occurring HCV NS3-1073-variants in the context of HLA-A*02:01 allele.. In: XXXV Congresso da Sociedade Brasileira de Imunologia, 2010, Porto Alegre. Anais do XXXV Congresso da Sociedade Brasileira de Imunologia, 2010.

17.
ANTUNES, D. A.; Rigo, M. M. ; Cibulski, S. P. ; Sinigaglia, M. ; Chies, J. A. B. ; Vieira, G. F. . In Silico Assessment of Structural Basis for Cross-Reactivity Among HCV Genotype Variants.. In: 4th Vaccine and ISV Annual Global Congress, 2010, Viena. 4th Vaccine and ISV Annual Global Congress, 2010.

18.
Rigo, M. M. ; ANTUNES, D. A. ; Fülber, C.C. ; Chies, J. A. B. ; Sinigaglia, M. ; Vieira, G. F. . In Silico Analysis of Good and Bad HLA Ligands: a Molecular Dynamics Approach.. In: 4th Vaccine and ISV Annual Global Congress, 2010, Viena. 4th Vaccine and ISV Annual Global Congress, 2010.

19.
Sinigaglia, M. ; Cibulski, S. P. ; ANTUNES, D. A. ; Rigo, M. M. ; Fülber, C.C. ; Chies, J. A. B. ; Vieira, G. F. . Structure modeling of rabies virus glycoprotein.. In: V Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos (LNCC), 2010, Petrópolis. Resumos da V Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos., 2010.

20.
Rigo, M. M. ; Antunes, D.A. ; Fülber, C.C. ; Chies, J. A. B. ; Sinigaglia, M. ; Vieira, G. F. . Inference of Good and Bad HLA Ligands Through Molecular Dynamics Approach. In: V Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos (LNCC), 2010, Petrópolis. Resumos da V Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos, 2010.

21.
Antunes, D.A.; Rigo, M. M. ; Cibulski, S. P. ; Fülber, C.C. ; Sinigaglia, M. ; Chies, J. A. B. ; Vieira, G. F. . Use of Molecular Dynamics for In Silico Assessment of Cross-Reactivity. In: V Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos (LNCC), 2010, Petrópolis. Resumos da V Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos, 2010.

22.
Vieira, G. F. ; Fülber, C.C. ; Cibulski, S. P. ; Antunes, D.A. ; Rigo, M. M. ; Sinigaglia, M. ; Chies, J. A. B. . Reconstruction of MHC Alleles by Cross Modeling and Structural Assessment. In: V Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos (LNCC), 2010, Petrópolis. Resumos da V Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos, 2010.

23.
Antunes, D.A.; Vieira, G. F. ; Rigo, M. M. ; Cibulski, S. P. ; Fülber, C.C. ; Sinigaglia, M. ; Chies, J. A. B. . Structural allele-specific patterns presented by epitopes in the MHC-I cleft and reconstruction of MHC:PEP complexes to cross-reactivity assessment. In: XXXIV Congress of the Brazilian Society for Immunology and X International Symposium on Allergy and Clinical Immunology, 2009, Salvador. Anais do XXXIV Congresso da Sociedade Brasileira de Imunologia, 2009.

24.
Fülber, C.C. ; ANTUNES, D. A. ; Vieira, G. F. ; Sinigaglia, M. ; Rigo, M. M. ; Cibulski, S. P. ; Chies, J. A. B. . Reprodução de Moléculas cristalografadas de MHC murino buscando desenvolver uma técnica de modelagem de alelos MHC a partir de estruturas desconhecidas. In: XXI Salão de Iniciação Científica da UFRGS, 2009, Porto Alegre. Anais XXI Salão de Iniciação Científica, 2009.

25.
Cibulski, S. P. ; ANTUNES, D. A. ; Rigo, M. M. ; Fülber, C.C. ; Sinigaglia, M. ; Vieira, G. F. ; Chies, J. A. B. . Análise Molecular in silico da Resposta de LInfócitos T CD8+ Induzida por Reatividade Cruzada Entre Epitopos Virais de Hepatite C e Influenza A. In: 29ª Semana Científica do Hospital de Clínicas de Porto Alegre, 2009, Porto Alegre. Resumos da 29ª Semana Científica do Hospital de Clínicas de Porto Alegre, 2009.

26.
Cibulski, S. P. ; Sinigaglia, M. ; Rigo, M. M. ; ANTUNES, D. A. ; Vieira, G. F. ; Fülber, C.C. ; Chies, J. A. B. ; Franco, A. C. ; Roehe, P. M. . Structure Modelling of Rabies Virus Glycoprotein. In: X-meeting 2009, 2009, Angra dos Reis. Proceedings of the X-meeting 2009, 2009.

27.
Cibulski, S. P. ; Sinigaglia, M. ; Rigo, M. M. ; ANTUNES, D. A. ; Vieira, G. F. ; Fülber, C.C. ; Chies, J. A. B. ; Franco, A. C. ; Roehe, P. M. . Structure Modelling of the UL41-Encoded Protein of Human Herpesvirus Type 1. In: XX National Congress of Virology, 2009, Brasília. VIRUS Reviews and Research. Rio de Janeiro: Imprinta Express LTDA, 2009. v. 14. p. 65-66.

28.
Cibulski, S. P. ; Fülber, C.C. ; ANTUNES, D. A. ; Vieira, G. F. ; Sinigaglia, M. ; Rigo, M. M. ; Chies, J. A. B. . Análise in silico dos elementos indutores de reatividade cruzada entre epitopos virais de hepatite C e influenza mediada por linfócitos T CD8+. In: XXI Salão de Iniciação Científica da UFRGS, 2009, Porto Alegre. Livro de Resumos do XXI Salão de Iniciação Científica da UFRGS, 2009.

29.
Campos, F. S. ; Dezen, D. ; Antunes, D.A. ; Santos, H. F. ; Arantes, T.S. ; Cenci, A. ; Gomes, F. ; Lima, F. E. S. ; Brito, W. M. E. D. ; Kunert Filho, H. C. ; Batista, H.B.C.R. ; Spilki, F. R. ; Franco, A. C. ; Roehe, P. M. . Efficacy of an Inactivated, Recombinant Bovine Herpesvirus 5 (BoHV-5) Vaccine. In: XX National Meeting of Virology, 2009, Brasília. Virus: Reviews and Research, 2009. v. 14. p. 149-149.

30.
Arantes, T.S. ; Campos, F. S. ; Dezen, D. ; Antunes, D.A. ; Santos, H. F. ; Cenci, A. ; Gomes, F. ; Lima, F. E. S. ; Brito, W. M. E. D. ; Kunert Filho, H. C. ; Franco, A. C. ; Roehe, P. M. . Eficácia de uma vacina inativada preparada com uma amostra de Herpesvírus da encefalite bovina (BOHV-5) recombinante (GI/GE/US9). In: II Congresso Internacional de Bioanálises, 2009, Novo Hamburgo. Anais do II Congresso Internacional de Bioanálises, 2009.

31.
Antunes, D.A.; Vieira, G. F. ; Chies, J. A. B. . Utilização de Docking Molecular para Abordagens Imunológicas. In: XII Encontro Gaúcho de Imunologia, 2008, Porto Alegre. Anais do XII Encontro Gaúcho de Imunologia, 2008.

32.
Rigo, M. M. ; Antunes, D.A. ; Vieira, G. F. ; Chies, J. A. B. . Inferência de Motivos Virais Conservados na Proteína de Nucleocapsídeo do Gênero Hantavirus Utilizando Ferramentas de Imunoinformática. In: XII Encontro Gaúcho de Imunologia, 2008, Porto Alegre. Anais do XII Encontro Gaúcho de Imunologia, 2008.

33.
Rigo, M. M. ; Antunes, D.A. ; Vieira, G. F. ; Chies, J. A. B. . Análise de regiões imunogênicas da proteína de nucleocapsídeo do gênero hantavirus utilizando ferramentas de imunoinformatica. In: 54º Congresso Brasileiro de Genética, 2008, Salvador. Anais do 54º Congresso Brasileiro de Genética, 2008.

34.
Antunes, D.A.; Vieira, G. F. ; Rigo, M. M. ; Chies, J. A. B. . Utilização de Ferramentas de Bioinformática para a Análise do Potencial de Reatividade Cruzada entre Epitopos Virais. In: XX Salão de Iniciação Científica da Universidade Federal do Rio Grande do Sul, 2008, Porto Alegre. Livro de Resumos do XX Salão de Iniciação Científica, 2008.

35.
Rigo, M. M. ; Vieira, G. F. ; Antunes, D.A. ; Chies, J. A. B. . Inferência de Motivos Virais Conservados na Proteína de Nucleocapsídeo do Gênero Hantavirus Utilizando Ferramentas de Imunoinformática. In: XX Salão de Iniciação Científica da Universidade Federal do Rio Grande do Sul, 2008, Porto Alegre. Livro de Resumos do XX Salão de Iniciação Científica, 2008.

36.
Dezen, D. ; Rijsewijk, F.A.M. ; Teixeira, T. F. ; Holz, C. L. ; Cibulski, S. P. ; Kunert Filho, H. C. ; Antunes, D.A. ; Rigo, M. M. ; Roehe, P. M. . The 16 Carboxy-Terminal Aminoacids of ORF4 are not Essential for PCV2 Replication.. In: XIX Encontro Nacional de Virologia, 2008, Caxambú. Anais do XIX Encontro Nacional de Virologia, 2008.

37.
Antunes, D.A.; Vieira, G. F. ; Chies, J. A. B. . Inferência in-silico de motivos em epitopos de proteínas virais, visando aplicação no desenvolvimento de vacinas de amplo espectro. In: 27ª Semana Científica do Hospital de Clínicas de Porto Alegre, 2007, Porto Alegre. Anais da 27ª Semana Científica, 2007. v. 27.

38.
Antunes, D.A.; Vieira, G. F. ; Chies, J. A. B. . Uso de bioinformática para simulação proteolítica de proteínas virais e análise estrutural de epitopos imunodominantes. In: XIX Salão de Iniciação Científica da Universidade Federal do Rio Grande do Sul, 2007, Porto Alegre. Livro de Resumos: XIX Salão de Iniciação Científica e XVI Feira de Iniciação Científica da UFRGS, 2007.

Apresentações de Trabalho
1.
ANTUNES, D. A.; JACKSON, K. R. ; DEVAURS, D. ; MOLL, M. ; LIZEE, G. A. ; KAVRAKI, L. E. . Ab Initio Modeling of Peptide-HLA Complexes for Rational Vaccine Design. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

2.
ANTUNES, D. A.; DEVAURS, D. ; MOLL, M. ; LIZEE, G. A. ; KAVRAKI, L. E. . Towards a general method for geometry prediction of peptide-HLA complexes: implications for immunotherapy. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

3.
ANTUNES, D. A.; DEVAURS, D. ; MOLL, M. ; JACKSON, K. R. ; LIZEE, G. A. ; KAVRAKI, L. E. . Towards personalized structural analysis of peptide-HLA complexes for T-cell-based immunotherapy. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

4.
ANTUNES, DINLER A; DEVAURS, D. ; MOLL, M. ; JACKSON, K. R. ; LIZEE, G. A. ; KAVRAKI, L. E. . Towards personalized structural analysis of peptide-HLA complexes for T-cell-based immunotherapy. 2017. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

5.
ANTUNES, DINLER A; JACKSON, K. R. ; Vieira, G. F. ; LIZEE, G. A. ; KAVRAKI, L. E. . Structural modeling and hierarchical clustering of peptide-HLA complexes for cross-reactivity assessment. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

6.
ANTUNES, D. A.; MOLL, M. ; JACKSON, K. R. ; LIZEE, G. A. ; KAVRAKI, L. E. . Computational modeling of cancer-derived peptides for the improvement of cellular immunotherapy. 2016. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

7.
ANTUNES, D. A.; MOLL, M. ; JACKSON, K. R. ; LIZEE, G. A. ; KAVRAKI, L. E. . Incremental Docking of Overlapping Fragments for Structural Prediction of Peptide-MHC complexes. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

8.
ANTUNES, D. A.; JACKSON, K. R. ; DEVAURS, D. ; MOLL, M. ; LIZEE, G. A. ; KAVRAKI, L. E. . Ab Initio Modeling of Peptide-HLA Complexes for Rational Vaccine Design. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

9.
ANTUNES, D. A.; JACKSON, K. R. ; DEVAURS, D. ; MOLL, M. ; LIZEE, G. A. ; KAVRAKI, L. E. . Computational structural analysis of peptide-HLA complexes for immunotherapy. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

10.
ANTUNES, D. A.; TADWALKER, S. ; MOLL, M. ; JACKSON, K. R. ; LIZEE, G. A. ; KAVRAKI, L. E. . Developing Tools for Binding Mode Prediction of Cancer-Derived Peptides to HLA Receptors. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

11.
ANTUNES, D. A.. Atuação do Biomédico na Pós-Graduação (2a edição). 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

12.
ANTUNES, D. A.. Avanços da Bioinformática. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

13.
Antunes, D.A.; KAVRAKI, L. E. . Predicting binding modes of large peptides to HLA-A receptors with biomedical interest. 2014. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

14.
Antunes, D.A.. Atuação do Biomédico na Pós-Graduação. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

15.
Antunes, D.A.; Rigo, M.M. ; Mendes, M. F. A. ; Sinigaglia, M. ; Selin, L. K. ; Cornberg, M. ; Vieira G.F. . In silico structural analysis of a cross-reactivity network based on immunogenic viral peptides. 2013. (Apresentação de Trabalho/Outra).

16.
Antunes, D.A.; Figueiredo, D. F. ; Rigo, M. M. ; Silva, J. P. ; Chies, J. A. B. ; Sinigaglia, M. ; Vieira, G. F. . Hierarchical Clustering of pMHC Complexes Based on the Electrostatic Potential of the TCR-Interacting Surface. 2012. (Apresentação de Trabalho/Outra).

17.
Antunes, D.A.. Bioinformática: Origem e Aplicações. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

18.
Antunes, D.A.. Biomedicina e Biotecnologia: Caminhos para se estudar diferentes aspectos da Biologia. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

19.
Antunes, D.A.. Aplicação da bioinformática à vacinologia. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

20.
Antunes, D.A.; Rigo, M. M. ; Cibulski, S. P. ; Sinigaglia, M. ; Chies, J. A. B. ; Vieira, G. F. . In Silico Assessment of Structural Basis for Cross-Reactivity Among HCV Genotype Variants. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

21.
Antunes, D.A.; Rigo, M. M. ; Cibulski, S. P. ; Sinigaglia, M. ; Chies, J. A. B. ; Vieira, G. F. . Structural in silico analysis of cross-genotype-reactivity among naturally occurring HCV NS3-1073-variants in the context of HLA-A*02:01 allele. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

22.
Antunes, D.A.; Rigo, M. M. ; Cibulski, S. P. ; Fülber, C.C. ; Sinigaglia, M. ; Chies, J. A. B. ; Vieira, G. F. . Use of Molecular Dynamics for In Silico Assessment of Cross-Reactivity. 2010. (Apresentação de Trabalho/Outra).

23.
Antunes, D.A.; Vieira, G. F. ; Rigo, M. M. ; Cibulski, S. P. ; Fülber, C.C. ; Sinigaglia, M. ; Chies, J. A. B. . Structural allele-specific patterns presented by epitopes in the MHC-I cleft and reconstruction of MHC:PEP complexes to cross-reactivity assessment. 2009. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

24.
Antunes, D.A.; Vieira, G. F. ; Rigo, M. M. ; Chies, J. A. B. . Utilização de Ferramentas de Bioinformática para a Análise do Potencial de Reatividade Cruzada entre Epitopos Virais. 2008. (Apresentação de Trabalho/Outra).

25.
Antunes, D.A.; Vieira, G. F. ; Chies, J. A. B. . Utilização de Docking Molecular para Abordagens imunológicas. 2008. (Apresentação de Trabalho/Outra).

26.
Antunes, D.A.. Bioinformática: Origem e Aplicações. 2008. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

27.
Antunes, D.A.. Bioinformática no desenvolvimento de vacinas. 2008. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

28.
Antunes, D.A.; Vieira, G. F. ; Chies, J. A. B. . Inferência in-silico de motivos em epitopos de proteínas virais, visando aplicação no desenvolvimento de vacinas de amplo espectro.. 2007. (Apresentação de Trabalho/Outra).

29.
Antunes, D.A.; Vieira, G. F. ; Chies, J. A. B. . Structural analyses of viral epitopes and proteolytic simulation of its proteins. 2007. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

30.
Antunes, D.A.; Vieira, G. F. ; Chies, J. A. B. . Uso de bioinformática para simulação proteolítica de proteínas virais e análise estrutural de epitopos imunodominantes. 2007. (Apresentação de Trabalho/Outra).

Outras produções bibliográficas
1.
Antunes, D.A.. Genética Molecular Humana, 4ª Edição (Tom Strachan / Andrew Read) - Capítulo 10. Organismos-Modelo, Genômica Comparativa e Evolução.. Porto Alegre - RS/BR: ARTMED EDITORA LTDA., 2013. (Tradução/Livro).

2.
Antunes, D.A.. Genética Molecular Humana, 4ª Edição (Tom Strachan / Andrew Read) - Capítulo 13. Variabilidade Genética Humana e suas Consequências.. Porto Alegre - RS/BR: ARTMED EDITORA LTDA., 2013. (Tradução/Livro).

3.
Antunes, D.A.. Genética Molecular Humana, 4ª Edição (Tom Strachan / Andrew Read) - Glossário e Índice.. Porto Alegre - RS/BR: ARTMED EDITORA LTDA., 2013. (Tradução/Livro).

4.
Antunes, D.A.. Genética Molecular Humana, 4ª Edição (Tom Strachan / Andrew Read) - Capítulo 1. Estrutura dos Ácidos Nucléicos e Expressão Gênica.. Porto Alegre - RS/BR: ARTMED EDITORA LTDA., 2013. (Tradução/Livro).


Produção técnica
Redes sociais, websites e blogs
1.
ANTUNES, DINLER A. SBlogI - Blog da Sociedade Brasileira de Imunologia. 2018; Tema: Imunologia, Divulgação científica. (Blog).

2.
ANTUNES, DINLER A. Da varíola ao anti-vaxx: Por que precisamos de vacinas?. 2017; Tema: Vacinas. (Site).

3.
ANTUNES, DINLER A. SBlogI - Blog da Sociedade Brasileira de Imunologia. 2017; Tema: Imunologia, Divulgação científica. (Blog).

4.
ANTUNES, DINLER A. SBlogI - Blog da Sociedade Brasileira de Imunologia. 2016; Tema: Imunologia, Divulgação Científica. (Blog).

5.
ANTUNES, DINLER A. SBlogI - Blog da Sociedade Brasileira de Imunologia. 2015; Tema: Imunologia, Divulgação Científica. (Blog).

6.
ANTUNES, DINLER A. SBlogI - Blog da Sociedade Brasileira de Imunologia. 2014; Tema: Imunologia, Divulgação Científica. (Blog).


Demais tipos de produção técnica
1.
Rigo, M. M. ; Antunes, D.A. . Bioinformática. 2011. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

2.
RIGO, MAURÍCIO M. ; ANTUNES, D. A. . Bioinformática. 2010. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

3.
Vieira, G. F. ; ANTUNES, D. A. ; Rigo, M. M. ; Sinigaglia, M. ; Chies, J. A. B. . Ferramentas de Bioinformática Aplicadas ao Desenvolvimento de Vacinas (Segunda Edição). 2009. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

4.
Antunes, D.A.; Rigo, M. M. ; Vieira, G. F. ; Chies, J. A. B. . Ferramentas de Bioinformática no Desenvolvimento de Vacinas. 2008. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

5.
Vieira, G. F. ; Antunes, D.A. ; Rigo, M. M. ; Chies, J. A. B. . O Papel da Bioinformática no Desenvolvimento de Novas Estratégias Vacinais. 2008. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

6.
Vieira, G. F. ; Antunes, D.A. ; Chies, J. A. B. . Ferramentas de Bioinformática Aplicadas a Imunologia. 2007. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
ANTUNES, DINLER A; SCHULER-FACCINI, L.; Junqueira, D. M.. Participação em banca de Marcelo Alves de Souza Bragatte. Avaliação de Parentesco: Varredura de Alvos Virais através da Comparação das Estruturas dos Epitopes das Células T de Flavivirus - Modelo do Vírus da Zika. 2017. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação de Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Trabalhos de conclusão de curso de graduação
1.
Antunes, D.A.; GOTTFRIED, C.. Participação em banca de Julia Medeiros Sorrentino.Inibição da aromatase por ácido valpróico no autismo. 2013. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Farmácia) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

2.
Antunes, D.A.; Fernandes, C. L.; Verli, H.. Participação em banca de Pedro Magno Mentges.Docking de inibidores planejados da trombina derivados do ácido glicirrético. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Farmácia) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.




Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
XLII Annual Meeting of The Brazilian Biochemistry and Molecular Biology Society. In silico structural analysis of a cross-reactivity network based on immunogenic viral peptides. 2013. (Congresso).

2.
3rd European Congress of Immunology - ECI 2012. Cross reactivity prediction based on hierarchical clustering of pMHC complexes. 2012. (Congresso).

3.
Culturas da Inovação - Os desafios na construção de novas ideias. 2012. (Encontro).

4.
Second International Society for Computational Biology Latin American regional meeting (ISCB-Latin America). Hierarchical Clustering of pMHC Complexes Based on the Electrostatic Potential of the TCR-Interacting Surface. 2012. (Congresso).

5.
XLI Reunião Anual da SBBq. Molecular Characterization of a New HIV-1 Protease Mutation in a Position Already Involved With Resistance to Nelfinavir. 2012. (Congresso).

6.
7th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology (AB3C) - X-meeting 2011. Use of multivariate statistical methods for structural virtual screening of cross-reactive targets. 2011. (Congresso).

7.
Curso de Informática Aplicada a Biologia e ao Planejamento de Fármacos.Aplicação da Bioinformática à Vacinologia. 2011. (Simpósio).

8.
Curso de Virologia Molecular: o HIV como modelo de estudo. 2011. (Oficina).

9.
V Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos (LNCC).Use of Molecular Dynamics for In Silico Assessment of Cross-Reactivity. 2010. (Encontro).

10.
XVII Encontro de Geneticistas do Rio Grande do Sul. 2010. (Encontro).

11.
XXXV Congresso da Sociedade Brasileira de Imunologia. Structural in silico analysis of cross-genotype-reactivity among naturally occurring HCV NS3-1073-variants in the context of HLA-A*02:01 allele. 2010. (Congresso).

12.
Brazilian Symposium on Bioinformatics (BSB). 2009. (Simpósio).

13.
II Ciclo de Palestras em Imunologia: Um olhar sobre a Imunoterapia. 2009. (Outra).

14.
II Escola Brasileira de Bioinformática (EBB 2009). 2009. (Outra).

15.
Second Biological Evolution Workshop. 2009. (Oficina).

16.
XXXIV Congress of the Brazilian Society for Immunology and X International Symposium on Allergy and Clinical Immunology. Structural allele-specific patterns presented by epitopes in the MHC-I cleft and reconstruction of MHC:PEP complexes to cross-reactivity assessment. 2009. (Congresso).

17.
VI Semana Acadêmica da Biomedicina da ULBRA.Bioinformática no Desenvolvimento de Vacinas. 2008. (Outra).

18.
XII Encontro Gaúcho de Imunologia.Utilização de Docking Molecular para Abordagens Imunológicas. 2008. (Encontro).

19.
XVI Encontro de Geneticistas do RS. 2008. (Encontro).

20.
XX Salão de Iniciação Científica da Universidade Federal do Rio Grande do Sul.Utilização de Ferramentas de Bioinformática para a Análise do Potencial de Reatividade Cruzada entre Epitopos Virais. 2008. (Outra).

21.
27ª Semana Científica do Hospital de Clínicas de Porto Alegre.Inferência in-silico de motivos em epitopos de proteínas virais, visando aplicação no desenvolvimento de vacinas de amplo espectro. 2007. (Outra).

22.
3rd International Conference of Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology. Structural analyses of viral epitopes and proteolytic simulation of its proteins. 2007. (Congresso).

23.
American Society of Clinical Oncology (ASCO). 2007. (Congresso).

24.
III Jornada Acadêmica da Biomedicina da FFFCMPA. 2007. (Simpósio).

25.
XI Encontro Gaúcho de Imunologia. 2007. (Encontro).

26.
XIX Salão de Iniciação Científica da Universidade Federal do Rio Grande do Sul.Uso de bioinformática para simulação proteolítica de proteínas virais e analise estrutural de epitopos imunodominantes. 2007. (Outra).

27.
Simpósio Nacional: Pesquisa Básica, Pré-clínica e Clínica em Terapia Gênica e Celular. 2006. (Simpósio).

28.
XVIII Salão de Iniciação Científica da UFRGS. 2006. (Outra).

29.
I Jornada Acadêmica de Biomedicina da FFFCMPA. 2005. (Outra).

30.
Pré-Cálculo. 2005. (Outra).

31.
XVII Salão de Iniciação Científica da UFRGS. 2005. (Outra).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
Vieira, G. F. ; Antunes, D.A. ; Rigo, M. M. ; Chies, J. A. B. . Curso de Extensão Ferramentas de Bioinformática no Desenvolvimento de Vacinas.. 2008. (Outro).

2.
Antunes, D.A.. I Semana Acadêmica de Biomedicina da UFRGS. 2007. (Outro).

3.
Vieira, G. F. ; Antunes, D.A. ; Chies, J. A. B. . Curso de Extensão Ferramentas de Bioinformática Aplicadas a Imunologia.. 2007. (Outro).



Educação e Popularização de C & T



Apresentações de Trabalho
1.
Antunes, D.A.. Bioinformática: Origem e Aplicações. 2008. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

2.
Antunes, D.A.. Bioinformática no desenvolvimento de vacinas. 2008. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

3.
Antunes, D.A.. Bioinformática: Origem e Aplicações. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

4.
Antunes, D.A.. Biomedicina e Biotecnologia: Caminhos para se estudar diferentes aspectos da Biologia. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

5.
Antunes, D.A.. Aplicação da bioinformática à vacinologia. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

6.
Antunes, D.A.. Atuação do Biomédico na Pós-Graduação. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

7.
ANTUNES, D. A.. Atuação do Biomédico na Pós-Graduação (2a edição). 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

8.
ANTUNES, D. A.. Avanços da Bioinformática. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).


Cursos de curta duração ministrados
1.
Vieira, G. F. ; Antunes, D.A. ; Chies, J. A. B. . Ferramentas de Bioinformática Aplicadas a Imunologia. 2007. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

2.
Rigo, M. M. ; Antunes, D.A. . Bioinformática. 2011. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

3.
RIGO, MAURÍCIO M. ; ANTUNES, D. A. . Bioinformática. 2010. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

4.
Antunes, D.A.; Rigo, M. M. ; Vieira, G. F. ; Chies, J. A. B. . Ferramentas de Bioinformática no Desenvolvimento de Vacinas. 2008. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

5.
Vieira, G. F. ; ANTUNES, D. A. ; Rigo, M. M. ; Sinigaglia, M. ; Chies, J. A. B. . Ferramentas de Bioinformática Aplicadas ao Desenvolvimento de Vacinas (Segunda Edição). 2009. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

6.
Vieira, G. F. ; Antunes, D.A. ; Rigo, M. M. ; Chies, J. A. B. . O Papel da Bioinformática no Desenvolvimento de Novas Estratégias Vacinais. 2008. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).


Redes sociais, websites e blogs
1.
ANTUNES, DINLER A. SBlogI - Blog da Sociedade Brasileira de Imunologia. 2014; Tema: Imunologia, Divulgação Científica. (Blog).

2.
ANTUNES, DINLER A. SBlogI - Blog da Sociedade Brasileira de Imunologia. 2015; Tema: Imunologia, Divulgação Científica. (Blog).

3.
ANTUNES, DINLER A. SBlogI - Blog da Sociedade Brasileira de Imunologia. 2016; Tema: Imunologia, Divulgação Científica. (Blog).

4.
ANTUNES, DINLER A. SBlogI - Blog da Sociedade Brasileira de Imunologia. 2018; Tema: Imunologia, Divulgação científica. (Blog).

5.
ANTUNES, DINLER A. Da varíola ao anti-vaxx: Por que precisamos de vacinas?. 2017; Tema: Vacinas. (Site).

6.
ANTUNES, DINLER A. SBlogI - Blog da Sociedade Brasileira de Imunologia. 2017; Tema: Imunologia, Divulgação científica. (Blog).



Outras informações relevantes


Segundo lugar no Concurso de Planos de Negócios realizado em comemoração aos 10 anos do Centro de Empreendimentos em Informática - CEI (Informática UFRGS), com a empresa de bioinformática InfoGen.



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