Lucas Palma Perez Braga

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  • Última atualização do currículo em 07/11/2018


Possui graduação em Biotecnologia (Bacharelado) pela UNESP (2008), mestrado em Recursos Florestais pela ESALQ/USP (2011) e doutorado em Ciências (Biologia na Agricultura e no Ambiente) pelo Centro de Energia Nuclear na Agricultura (CENA/USP) (2017). Realizou pós-doutorado no Institut National de la Recherche Agronomique (Agroécologie) (2017-2018). Atualmente é pós-doutorando da Universidade de São Paulo. Tem experiência nas áreas de microbiologia, biologia molecular e bioinformática. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Lucas Palma Perez Braga
Nome em citações bibliográficas
BRAGA, L. P. P.;BRAGA, LUCAS PALMA PEREZ;Braga, Lucas Peres Palma;BRAGA, LUCAS P. P.


Formação acadêmica/titulação


2013 - 2017
Doutorado em Ciências (Biologia na Agricultura e no Ambiente).
Centro de Energia Nuclear na Agricultura / Universidade de São Paulo, CENA/USP, Brasil.
com período sanduíche em Universität Bayreuth (Orientador: Prof. Harold Drake).
Título: Disentangling the influence of earthworms on microbial communities in sugarcane rhizosphere, Ano de obtenção: 2017.
Orientador: Profa. Dra. Siu Mui Tsai.
Coorientador: Prof. Harold Leslie Drake.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
2009 - 2011
Mestrado em Recursos Florestais.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: O papel da reposição florestal para a cadeia de bioenergia: um estudo de caso para estimativa de carbono em Piracicaba -SP,Ano de Obtenção: 2011.
Orientador: Weber Antonio Neves do Amaral.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
2004 - 2008
Graduação em Biotecnologia (Bacharelado).
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.


Pós-doutorado


2017
Pós-Doutorado.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
2017 - 2018
Pós-Doutorado.
Institut National de la Recherche Agronomique, INRA, França.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.


Formação Complementar


2016 - 2016
Antibiograma - Uma Abordagem Prática. (Carga horária: 24h).
Sociedade Brasileira de Microbiologia, SBM, Brasil.
2013 - 2013
Bioinformática no Estudo de Comunidades Microbi.... (Carga horária: 18h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2013 - 2013
Introdução à programação em Python. (Carga horária: 4h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2013 - 2013
Redes Complexas. (Carga horária: 8h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2007 - 2007
Terra: Biodiversidade Científica e Tecnológica. (Carga horária: 40h).
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
2007 - 2007
Biologia Aquática. (Carga horária: 8h).
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
2006 - 2006
Técnicas modernas de citogenética e biologia molec. (Carga horária: 4h).
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
2006 - 2006
Proteínas recombinantes e suas aplicações. (Carga horária: 4h).
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
2005 - 2006
Extensão universitária em Aspectos Práticos da histologia. (Carga horária: 32h).
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
2005 - 2005
Efeito de fatores inibidores no metabolismo de .... (Carga horária: 8h).
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
2005 - 2005
Células Tronco: Obtenção e cultivo. (Carga horária: 16h).
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
2004 - 2004
Biossegurança no Laboratório. (Carga horária: 16h).
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.


Atuação Profissional



Universidade Bandeirante de São Paulo, UNIBAN, Brasil.
Vínculo institucional

2012 - 2013
Vínculo: Professor Adjunto, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto
Outras informações
Disciplinas ministradas: Educação Ambiental - para o 6º semestre do curso de Ciências Biológicas; Educação Ambiental - para o 1º semestre do curso de Ciências Biológicas; Educação Ambiental - para o 1º Semestre do curso de Tecnologia de Gestão Ambiental; Energia e meio ambiente ? para o 2º semestre do curso de Tecnologia de Gestão Ambiental; Microbiologia e Imunologia - para o 3º semestre do curso de Ciências Biológicas; Estudos sociais, económicos e ambientais - para o 1º semestre do curso de Arquitetura e Urbanismo. Fenômenos da Natureza - EAD.


Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Vínculo institucional

2017 - Atual
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-doutorando
Outras informações
Estágio de pós-doutorado no Laboratório de Bioinformática do Instituto de Química da Universidade de São Paulo. Supervisor: João Carlos Setubal. Tema de pesquisa: Eco-genômica e interação fago-procarioto em ambiente de compostagem.

Vínculo institucional

2012 - 2013
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Treinamento técnico
Outras informações
Colaboração no desenvolvimento do Projeto FAPESP 2011/51749-6 "Functional Bio-Indicators for Soil Quality Monitoring for Sustainable Management of Sugarcane Biomass production"

Vínculo institucional

2009 - 2011
Vínculo: Outro (pós-graduando), Enquadramento Funcional: pós-graduando, Regime: Dedicação exclusiva.


Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
Vínculo institucional

2007 - 2008
Vínculo: estagiário bolsista, Enquadramento Funcional: estagiário
Outras informações
Auxílio FAPESP no período de 01/09/2007 a 31/07/2008


Centro de Energia Nuclear na Agricultura / Universidade de São Paulo, CENA/USP, Brasil.
Vínculo institucional

2013 - 2017
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estudante de doutorado, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

2015 - 2015
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Programa de Aperfeiçoamento de Ensino - PAE, Carga horária: 6
Outras informações
Disciplina Microbiologia de Alimentos (ESALQ/USP)


Institut National de la Recherche Agronomique, INRA, França.
Vínculo institucional

2017 - 2018
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-doutorado



Revisor de periódico


2018 - Atual
Periódico: Scientific Reports
2018 - Atual
Periódico: GEODERMA
2018 - Atual
Periódico: The ISME Journal


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia.
2.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
3.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: BIOINFORMÁTICA.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
AMGARTEN, D. E.2018AMGARTEN, D. E. ; BRAGA, L. P. P. ; da SILVA, A.M. ; SETUBAL, J.C. . MARVEL, a Tool for Prediction of Bacteriophage Sequences in Metagenomic Bins. Frontiers in Genetics, v. 9, p. 304, 2018.

2.
BRAGA, LUCAS P. P.2018BRAGA, LUCAS P. P.; SOUCY, SHANNON M. ; AMGARTEN, DEYVID E. ; DA SILVA, ALINE M. ; SETUBAL, JOÃO C. . Bacterial Diversification in the Light of the Interactions with Phages: The Genetic Symbionts and Their Role in Ecological Speciation. FRONTIERS IN ECOLOGY AND EVOLUTION, v. 6, p. 6, 2018.

3.
BRAGA, L. P. P.2017BRAGA, L. P. P.; Alves, RF ; Dellias, M ; NAVARRETE, A. A. ; Basso, TO ; TSAI, SIU MUI . Vinasse fertirrigation alters soil resistome dynamics: an analysis based on metagenomic profiles. BioData Mining, v. 10, p. 10-17, 2017.

4.
Mendes, Lucas William2017Mendes, Lucas William ; Braga, Lucas Peres Palma ; NAVARRETE, ACACIO APARECIDO ; Souza, Dennis Goss de ; SILVA, GENIVALDO GUEIROS ZACARIAS ; TSAI, SIU MUI . Using Metagenomics to Connect Microbial Community Biodiversity and Functions. CURRENT ISSUES IN MOLECULAR BIOLOGY, v. 24, p. 103-118, 2017.

5.
BRAGA, LUCAS PALMA PEREZ2016BRAGA, LUCAS PALMA PEREZ; YOSHIURA, C. A. ; BORGES, C. D. ; HORN, M. A. ; BROWN, G. G. ; DRAKE, H. L. ; TSAI, S. M. . Disentangling the influence of earthworms in sugarcane rhizosphere. Scientific Reports, v. 6, p. 38923, 2016.

6.
NAVARRETE, ACACIO APARECIDO2015NAVARRETE, ACACIO APARECIDO ; DINIZ, TATIANA ROSA ; BRAGA, LUCAS PALMA PEREZ ; SILVA, GENIVALDO GUEIROS ZACARIAS ; FRANCHINI, JULIO CEZAR ; ROSSETTO, RAFFAELLA ; EDWARDS, ROBERT ALAN ; TSAI, SIU MUI . Multi-Analytical Approach Reveals Potential Microbial Indicators in Soil for Sugarcane Model Systems. Plos One, v. 10, p. e0129765, 2015.

7.
ALVES, S.O.2013ALVES, S.O. ; AMARAL, W.A.N. ; HORBACH, M.A ; BRAGA, L. P. P. ; DIAS, I.F . Caracterização dos recursos genéticos dos plantios de dendê no estado do Pará. Bioenergia em Revista: Diálogos, v. 3, p. 20, 2013.

Capítulos de livros publicados
1.
Mendes, Lucas William ; Braga, Lucas Peres Palma ; NAVARRETE, ACACIO APARECIDO ; Souza, Dennis Goss de ; SILVA, GENIVALDO GUEIROS ZACARIAS ; TSAI, SIU MUI . Using Metagenomics to Connect Microbial Community Biodiversity and Functions. Metagenomics: Current Advances and Emerging Concepts. 1ed.: Caister Academic Press, 2017, v. , p. 103-.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
BRAGA, LUCAS PALMA PEREZ; SCRIVEN, F. ; THOMAS, A. ; QUAGLIO, R. B. ; da SILVA, A.M. ; SETUBAL, J.C. . Community-wide transcriptional patterns reveal microbial endurance in a thermophilic composting process from Sao Paulo Zoo. In: 11th Georgia Tech Bioinformatic Conference, 2017, Atlanta. 11th Georgia Tech Bioinformatic Conference, 2017.

2.
NAVARRETE, ACACIO APARECIDO ; DINIZ, TATIANA ROSA ; BRAGA, LUCAS PALMA PEREZ ; SILVA, GENIVALDO GUEIROS ZACARIAS ; FRANCHINI, JULIO CEZAR ; ROSSETTO, RAFFAELLA ; EDWARDS, ROBERT ALAN ; TSAI, SIU MUI . Multi-analytical approach reveals potential microbial indicators in soil for sugarcane model systems. In: 13th Symposium on Bacterial Genetics and Ecology (BAGECO), 2015, Milão. 13th Symposium on Bacterial Genetics and Ecology, 2015.

3.
BRAGA, LUCAS PALMA PEREZ; BORGES, C. D. ; YOSHIURA, C. A. ; BROWN, G. G. ; TSAI, SIU MUI . A Metagenomic Approach Towards the Understanding of Earthworm-Microbe Interaction in Sugarcane Rhizosphere. In: 5th edition of Latin American Oligochaete Ecology and Taxonomy Meeting, 2015, Curitiba. 5th edition of Latin American Oligochaete Ecology and Taxonomy Meeting, 2015.

4.
BRAGA, LUCAS PALMA PEREZ; YOSHIURA, C. A. ; BORGES, C. D. ; HORN, M. A. ; BROWN, G. G. ; DRAKE, H. L. ; TSAI, SIU MUI . Earthworm-microbe interaction can be associated to less harsh conditions in green sugarcane systems. In: Ecology of Soil Microorganisms, 2015, Prague. Ecology of Soil Microorganisms, 2015.

5.
NAVARRETE, ACACIO APARECIDO ; BRAGA, LUCAS PALMA PEREZ ; DINIZ, TATIANA ROSA ; FRANCHINI, JULIO CEZAR ; ROSSETTO, RAFFAELLA ; TSAI, S. M. . Potential microbial bioindicators of agricultural amendments on sugarcane soils. In: 2nd Brazilian BioEnergy Science and Technology Conference (BBEST), 2014, Campos do Jordão. 2nd Bioenergy Science and Technology (BBEST), 2014.

6.
BRAGA, LUCAS PALMA PEREZ; BROWN, G. G. ; TSAI, SIU MUI . Tracking earthworm-microbe interactions and GHG emissions in green sugarcane production. In: First Global Soil Biodiversity Conference, 2014, Dijon. First Global Soil Biodiversity Conference, 2014.

7.
BRAGA, LUCAS PALMA PEREZ; BROWN, G. G. ; TSAI, SIU MUI . Interactions between earthworms and soil microbiota under green sugarcane production. In: ISME 15, 2014, Seul. ISME 15, 2014.

8.
NAVARRETE, ACACIO APARECIDO ; BRAGA, LUCAS PALMA PEREZ ; DINIZ, TATIANA ROSA ; ROSSETTO, RAFFAELLA ; TSAI, SIU MUI . Modelo conexionista aplicado à definição de indicadores microbiológicos para avaliação da qualidade do solo em sistemas de produção de cana-de-açúcar. In: XXXIV Congresso Brasileiro de Ciência do Solo, 2013. XXXIV Congresso Brasileiro de Ciência do Solo, 2013.

9.
NAVARRETE, ACACIO APARECIDO ; BRAGA, LUCAS PALMA PEREZ ; DINIZ, TATIANA ROSA ; ROSSETTO, RAFFAELLA ; KURAMAE, E. E. ; TSAI, SIU MUI . Perspectives on combinatorial biological, chemical and physical parameters in soil quality: an approach for sugarcane production systems. In: 12th Symposium on Bacterial Genetics and Ecology (BAGECO 12), 2013, Liubliana. BAGECO 12 - Networking and Plasticity of Microbial Communities: The Secret to Success, 2013.

Apresentações de Trabalho
1.
BRAGA, L. P. P.. Métodos de Biologia Molecular. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

2.
BRAGA, L. P. P.; BORGES, C. D. ; YOSHIURA, C. A. ; BROWN, G. G. ; TSAI, S. M. . A Metagenomic Approach Towards the Understanding of Earthworm-Microbe Interaction in Sugarcane Rhizosphere. 2015. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

3.
BRAGA, L. P. P.; BROWN, G. G. ; TSAI, S. M. . Tracking earthworm-microbe interactions and GHG emissions in green sugarcane production. 2014. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

4.
BRAGA, L. P. P.. Tracking the earthworm-microbe interactions and GHG emissions in green sugarcane systems. 2014. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

5.
BRAGA, L. P. P.; BROWN, G. G. ; TSAI, S. M. . Interactions between earthworms and soil microbiota under green sugarcane production. 2014. (Apresentação de Trabalho/Congresso).


Demais tipos de produção técnica
1.
SETUBAL, J.C. ; BRAGA, L. P. P. ; Guima, S . curso prático de bioinformática de metagenomas (Biofilms: ecología microbiana de los sistemas de distribución de agua potable, aspectos experimentales y bioinformáticos). 2017. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Trabalhos de conclusão de curso de graduação
1.
PRIMON, C.; MELLO, L. H.; BRAGA, L. P. P.. Participação em banca de Ferreira, LAC; Fulanetto, MZ; Toledo, VSR; Silva, WL.A importância da educação ambiental no ensino fundamental I. 2012. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Bandeirante Anhanguera.

2.
PRIMON, C.; MELLO, L. H.; BRAGA, L. P. P.. Participação em banca de Gomes, A.; Dutra, AR; Guerra, F; Lima, LS.O papel da historia da ciência na formação de professores de biologia para a educação básica. 2012. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Bandeirante Anhanguera.

3.
PRIMON, C.; MELLO, L. H.; BRAGA, L. P. P.. Participação em banca de Santos, CS; Carmo, DS; Valentin, J; Moraes, RD; Canhete, RM.A inclusão de aluno com necessidades educacionais especiais no ensino regular. 2012. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Bandeirante Anhanguera.

4.
PRIMON, C.; MELLO, L. H.; BRAGA, L. P. P.. Participação em banca de Pereira, C; Coleppicolo, FG; Lopes, G.Visão da educação ambiental entre instituições públicas e privadas de ensino no município de Osasco. 2012. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Bandeirante Anhanguera.




Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
11th Georgia Tech Bioinformatic Conference. Community-wide transcriptional patterns reveal microbial endurance in a thermophilic composting process from Sao Paulo Zoo. 2017. (Congresso).

2.
5th edition of Latin American Oligochaete Ecology and Taxonomy Meeting.A Metagenomic Approach Towards the Understanding of Earthworm-Microbe Interaction in Sugarcane Rhizosphere. 2015. (Simpósio).

3.
Ecology of Soil Microorganisms. Earthworm-microbe interaction can be associated to less harsh conditions in green sugarcane systems. 2015. (Congresso).

4.
First Global Soil Biodiversity Conference. Tracking earthworm-microbe interactions and GHG emissions in green sugarcane production. 2014. (Congresso).

5.
ISME 15. Interactions between earthworms and soil microbiota under green sugarcane production. 2014. (Congresso).

6.
VI Simpósio Científico dos Pós-Graduandos no CENA/USP. 2013. (Simpósio).

7.
3er ENCUENTRO LATINO AMERICANO DE ECONOMÍA DE LA ENERGÍA.Climate changing and forest restoration: a firewood policy favorable scenery. 2011. (Encontro).

8.
I ENCONTRO PAULISTA SOBRE CLONAGEM ANIMAL. 2006. (Encontro).

9.
I FÓRUM DE BIOTECNOLOGIA DO VALE DO PARANAPANEMA - NOVOS RUMOS PARA O DESENVOLVIMENTO. 2006. (Outra).

10.
VI WORK SHOP DE GENÉTICA. 2006. (Outra).

11.
VIII Encontro de Biociências e Biotecnologia de Assis. 2005. (Encontro).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
RIBEIRO-PAES, D. J. T. ; NOGUEIRA, D. M. F. G. ; BRAGA, L. P. P. . I ENCONTRO PAULISTA SOBRE CLONAGEM ANIMAL. 2006. (Outro).

2.
BRAGA, L. P. P.. VIII Encontro de Biociências e Biotecnologia de Assis. 2005. (Outro).



Educação e Popularização de C & T



Cursos de curta duração ministrados
1.
SETUBAL, J.C. ; BRAGA, L. P. P. ; Guima, S . curso prático de bioinformática de metagenomas (Biofilms: ecología microbiana de los sistemas de distribución de agua potable, aspectos experimentales y bioinformáticos). 2017. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).




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