Denis Jacob Machado

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  • Última atualização do currículo em 27/07/2018


Doutorando, Programa Interunidades de Pós-Graduação em Bioinformática, Universidade de São Paulo (USP). (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Denis Jacob Machado
Nome em citações bibliográficas
MACHADO, D. J.;MACHADO, DENIS JACOB;JACOB MACHADO, DENIS

Endereço


Endereço Profissional
Universidade de São Paulo, Instituto de Biociências, Departamento de Zoologia.
Rua do Matão, travess 14, no. 101, sala 137
Cidade Universitária
05508900 - São Paulo, SP - Brasil
Telefone: (11) 30917615
URL da Homepage: http://about.me/machadodj


Formação acadêmica/titulação


2013 - 2018
Doutorado em Bioinformática.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Comparative genomics and the evolution of amphibian chemical defense, Ano de obtenção: 2018.
Orientador: Taran Grant.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Palavras-chave: Comparative Genomics; Next-Generation DNA Sequencing; Chemical Defense; Poison Frogs; Phylogenetic Systematics.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Zoologia.
Setores de atividade: Pesquisa e desenvolvimento científico.
2010 - 2012
Mestrado em Ciências Biológicas (Zoologia).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Acanthobothrium Blanchard, 1848: diversidade filogenética das linhagens parasitas de arraias de água doce,Ano de Obtenção: 2012.
Orientador: Fernando Portella de Luna Marques.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Palavras-chave: Filogenética; Homologia Dinâmica.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Zoologia / Subárea: Taxonomia dos Grupos Recentes.
Setores de atividade: Pesquisa e desenvolvimento científico.
2006 - 2009
Graduação em Ciências Biológicas.
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
Título: Posição filogenética de linhagens de Phyllobothriidae (Eucestoda: Tetraphyllidea) parasitas de raias de água doce (Chondrichthyes: Myliobatoidei: Potamotrygonidae) baseada em otimização direta de dados moleculares.
Orientador: Prof. Dr. Fernando Portella de Luna Marques.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
2000 interrompida
Curso técnico/profissionalizante interrompido em 2002 em Informática.
Escola Técnica Estadual Dr. Adail Nunes de Silva, ETE DANS, Brasil.
Bolsista do(a): Centro Paula Souza, CPS, Brasil.
Ano de interrupção: 2002




Formação Complementar


2009 - 2009
Teoria e prática em reconstruções filogenéticas. (Carga horária: 80h).
Instituto de Biociências, IBUSP, Brasil.
2007 - 2007
Extensão universitária em Introdução à Modelagem Numérica/ DELF-3D. (Carga horária: 40h).
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
2007 - 2007
Ecologia de Eslasmobrânquios. (Carga horária: 10h).
Núcleo de Pesquisa e Estudo em Chondrichthyes, NUPEC, Brasil.
2006 - 2006
Sistemática Filogenética. (Carga horária: 16h).
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
2006 - 2006
Ecologia de Recifes de Coral. (Carga horária: 16h).
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
2004 - 2004
Biologia Marinha. (Carga horária: 40h).
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
2004 - 2004
Comportamento e biologia dos tubarões. (Carga horária: 9h).
Instituto de Pesca, IP, Brasil.
2004 - 2004
Curso de Taxidermia. (Carga horária: 20h).
Instituto de Pesca, IP, Brasil.


Atuação Profissional



University of North Carolina at Charlotte, UNCC, Estados Unidos.
Vínculo institucional

2016 - 2016
Vínculo: , Enquadramento Funcional:


Instituto de Biociências, IBUSP, Brasil.
Vínculo institucional

2018 - Atual
Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Docente, Carga horária: 16
Outras informações
Professor responsável pela disciplina BIZ5785 do Programa de Pós-graduação em Zoologia do Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo, intitulada "Introdução à bioinformática: curso teórico-prático com exemplos da filogenômica de flavivírus".

Vínculo institucional

2012 - 2013
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisador Assistente, Carga horária: 40
Outras informações
Supervisor: Prof. Fernando Portella de Luna Marques, PhD Principais atividades: Sequênciamento e análise de DNA, desenvolvimento de ferramentas em bioinformática, gestão de servidores e outros serviços computacionais, consultor na área de sistemática de parasitas.

Vínculo institucional

2011 - 2011
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Monitor, Carga horária: 6
Outras informações
Bolsita do Programa de Aperfeiçoamento do Ensino (PAE). Disciplina: Princípios de Sistemática e Biogeografia. Professor responsável: Dr. Fernando Portella de Luna Marques.

Vínculo institucional

2011 - 2011
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Monitor, Carga horária: 4
Outras informações
Disciplina: Diversificação e Biogeografia da Biota Neotropical. Professor responsável: Dr. Ricardo Pinto da Rocha.


Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Vínculo institucional

2009 - 2009
Vínculo: Outro (estágiário), Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 20, Regime: Dedicação exclusiva.



Projetos de pesquisa


2016 - 2016
Sequênciamento genômico do sapo pé-de-pá-oriental, Scaphiopus holbrookii (Amphibia: Anura: Scaphiopodidade) e do sapo flamenguinho, Melanophryniscus moreirae (Amphibia: Anura: Bufonidae)
Descrição: Projeto de Bolsa em Extensão e Pesquisa no Exterior (BEPE), FAPESP, Proc. No. 2015/18654-2. Apesar da disponibilidade de tecnologias de sequenciamento de alta performance que permitem a aquisição de dados moleculares a preços factíveis, dificuldades computacionais em analisar grandes bancos de dados de sequências e o pequeno número de genomas nucleares de sapos que possam ser usados como referência têm dificultado avanços em estudos genômicos de anuros. Apenas dois genomas nucleares e 81 genomas mitocondriais completes foram publicados para Anura até a data de submissão desta proposta, uma amostragem muito pequena das atuais 6.483 espécies de sapos. Aqui eu proponho montar e analisar o genoma nuclear parcial e o genoma mitocondrial completo do sapo-pé-de-pá-oriental, Scaphiopus holbrookii, e do sapo-flamenguinho, Melanophyniscus moreirae, usando tecnologias de sequenciamento de alta eficiência (Illumina HiSeq). Estas espécies foram selecionadas devido à características genéticas que facilitam a análise de seu genoma e qualidades únicas que as tornam interessantes para o estudo da evolução de Anfíbios e da defesa química neste grupo. O sapo-pé-de-pá-oriental tem posição filogenética estratégica que possibilita a investigação de aspectos genômicos associados com a transição para o ambiente terrestre em sapos, do papel dos elementos transponíveis no tamanho do genoma de anfíbios, da distribuição e variabilidade de elementos ultra-conservados específicos à linhagem ou aos anuros, da evolução de genes organelares e dos rearranjos genômicos mitocondriais em anuros, entre outros. Já o sapo-flamenguinho é um bufonídeo que apresenta defesa química baseada tanto em alcaloides sequestrados da dieta quanto bufoteninas biosintetizadas, sendo então uma espécie chave para o entendimento da defesa química em anuros. A viabilidade deste projeto é garantida pela disponibilidade de sequências brutas já obtidas para ambas as espécies e recursos computacionais massivos dedicados à este projeto, aliados à experiência dos nossos colaboradores internacionais na área da genômica de organismos não-modelo. Eu acredito que a presente proposta irá nos levar um passo adiante na superação da nossa atual falta de conhecimento em genômica comparada de anuros e na distância entre a facilidade atual na obtenção de dados genômicos e a dificuldade de analisá-los..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado: (1) .
Integrantes: Denis Jacob Machado - Integrante / Taran Grant - Integrante / DANIEL JANIES - Coordenador.
2013 - Atual
Genômica Comparada e a Evolução da Defesa Química de Anfíbios
Descrição: Projeto de doutorado FAPESP, proc. no. 2013/05958-8. Esta proposta visa integrar técnicas de sequenciamento de próxima-geração ("next-generation sequencing", NGS) ao estudo da evolução da defesa química em anfíbios. Do ponto de vista da sistemática filogenética, o NGS possui o potencial para obtenção de filogenias mais bem suportadas, aumentando nossa capacidade de lidar com dificuldades causadas por poliploidia e hibridização e provendo novas opções para o estudo filogenético em diversos níveis taxonômicos. De uma perspectiva genômica, a análise comparada de rãs de veneno e outros anuros tem o potencial de identificar mudanças genéticas relacionadas à base molecular da defesa química em anfíbios (i.e., sequestro de alcaloides lipofílicos e resistência fisiológica), direcionando futuras pesquisas. Neste contexto, nós usaremos NGS (Illumina® HiSeqTM 2000) para gerar seis genomas nucleares completos de anuros com foco em rãs de veneno. Os dados assim obtidos serão empregados para: (1) identificar variações genéticas que possam estar associadas nos mecanismos de sequestro e resistência a alcaloides lipofílicos em rãs de veneno e (2) desenhar sondas que nos permitam empregar NGS na obtenção de loci específicos para o estudo da sistemática de anfíbios em diferentes níveis de divergência..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado: (1) .
Integrantes: Denis Jacob Machado - Integrante / Taran Grant - Coordenador.
2009 - 2012
iversidade filogenética das linhagens de Acanthobothrium van Beneden, 1850 (Eucestoda: Tetraphyllidea: Onchobothriidae) parasitas de Potamotrygonidae (Chondrichthyes: Myliobatoidei)
Descrição: Um importante impedimento para apresentação de uma hipótese robusta acerca da origem e diversificação dos potamotrigonídeos com base em dados parasitológicos reside nas lacunas do conhecimento sobre a diversidade e relação de parentesco de suas linhagens de parasitas. Membros da família Potamotrygonidae são elasmobrânquios estenohalinos endêmicos dos sistemas fluviais da região Neotropical, cujo o ancestral das ~20 espécies reconhecidas para a família provavelmente derivou de uma raia marinha durante as ingressões marinhas do Mioceno ao norte da América do Sul. A história biogeográfica destes hospedeiros impingiu padrões de diversificação em sua fauna parasitária composta de elementos endêmicos dos sistemas fluviais da América do Sul, bem como de linhagens compartinhadas com elasmobrânquios marinhos. Diante das discrepâncias entre as hipóteses sustentadas por dados provenientes do hospedeiro, para a origem e diversificação dos potamotrigonídeos, em relação àquelas sugeridas por dados parasitológicos, evidencia-se a necessidade de se examinar mais detalhadamente este sistema. Acredita-se que o uso de dados parasitológicos depende do esforço em documentar e postular hipóteses filogenéticas para diversas linhagens de parasitas. Com o auxílio de dados moleculares, este projeto visa abordar duas questões referentes à diversidade de uma linhagem particular de tetrafilídeos: o gênero Acantobotrium. Primeiro, objetiva-se identificar a posição relativa de linhagens monofiléticas deste gênero em relação a linhagens marinhas. Segundo, objetiva-se correlacionar estes grupos monofiléticos com o conceito atual das espécies nominais disponíveis para o gênero, ou seja, buscar suporte filogenético para espécies nominais que até o momento são definidas por caracteres morfológicos..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Denis Jacob Machado - Integrante / Fernando Portella de Luna Marques - Coordenador.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
2009 - 2009
Posição filogenética de linhagens da Phyllobothriidae (Eucestoda: Tetraphyllidea) pasitas das raias de água doce da família Potamotrygonidae (Chondrichthyes: Myliobatoidei) baseada em otimização direta de dados moleculares
Descrição: Este projeto visa identificar a posição filogenética de quatro gêneros de filobotriídeos (Rhinebothrium, Rhinebothroides, Anindobothrium e Nandocestus) parasitas de potamotrigonídeos utilizando dados moleculares (18S e 28S rDNA)..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Denis Jacob Machado - Integrante / Fernando Portella de Luna Marques - Coordenador.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.


Revisor de periódico


2017 - Atual
Periódico: BMC EVOLUTIONARY BIOLOGY


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Zoologia / Subárea: Filogenia.
2.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
3.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Animal.
4.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Parasitologia / Subárea: Helmintologia de Parasitos.
5.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Bioinformática.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.
Português
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.


Prêmios e títulos


2016
Most Implementable Solution at the Zika Innovation Hack-a-thon, CAMTech and Global Disaster Response (Massachusetts General Hospital).
2013
The Willi Hennig Award, Yhe Willi Hennig Society.
2013
Kurt Milton Pickett Intercontinental Travel Award, The Willi Hennig Society.
2012
Master in Zoology, Institute of Biosciences of the University of São Paulo.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
JACOB MACHADO, DENIS2018 JACOB MACHADO, DENIS; JANIES, DANIEL ; BROUWER, CORY ; GRANT, TARAN . A new strategy to infer circularity applied to four new complete frog mitogenomes. Ecology and Evolution, v. 1, p. 1-8, 2018.

2.
GRANT, TARAN2017 GRANT, TARAN ; RADA, MARCO ; ANGANOY-CRIOLLO, MARVIN ; BATISTA, ABEL ; DIAS, PEDRO HENRIQUE ; JECKEL, ADRIANA MORIGUCHI ; MACHADO, DENIS JACOB ; RUEDA-ALMONACID, JOSÉ VICENTE . Phylogenetic Systematics of Dart-Poison Frogs and Their Relatives Revisited (Anura: Dendrobatoidea). South American Journal of Herpetology, v. 12, p. S1-S90, 2017.

3.
MACHADO, D. J.2016 MACHADO, D. J.; LYRA, M. L. ; Grant, T. . Mitogenome assembly from genomic multiplex libraries: comparison of strategies and novel mitogenomes for five species of frogs. Molecular Ecology Resources, v. 16, p. 686-693, 2016.

4.
MACHADO, DENIS JACOB2015 MACHADO, DENIS JACOB. YBYRÁ facilitates comparison of large phylogenetic trees. BMC BIOINFORMATICS, v. 16, p. 204, 2015.

5.
MACHADO, DENIS JACOB2012MACHADO, DENIS JACOB; Marques, F. P. L. . The forgotten origin of Acanthobothrium Blanchard, 1848 (Tetraphyllidea: Onchobothriidae). ZOOTAXA, v. 88, p. 86-88, 2012.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
SCHNEIDER, A. de B. ; MACHADO, DENIS JACOB ; DAMODARAN, L. ; JANIES, D. . Flavivirus Phylogeny Revisited: In search of the Orthologs. In: 5th International Quest for Orthologs Meeting, 2017, Los Angeles. 5th International Quest for Orthologs Meeting, 2017.

2.
MACHADO, DENIS JACOB; Marques, F. P. L. ; Grant, T. . Direct Measures of Support for Maximum Likelihood. In: Annual Meeting of the Willi Hennig Society and XII Reunión Argentina de Cladística y Biogeografia, 2016, Buenos Aires. 35th Annual Meeting of the Willi Hennig Society and XII Reunión Argentina de Cladística y Biogeografia,, 2016.

3.
MACHADO, DENIS JACOB; CASTROVIEJO-FISHER, S. ; Grant, T. . Evidence of absence treated as absence of evidence: the effects of gaps in standart maximum likelihood analysis. In: 35th Annual Meeting of the Willi Hennig Society and XII Reunión Argentina de Cladística y Biogeografia, 2016, Buenos Aires. 35th Annual Meeting of the Willi Hennig Society and XII Reunión Argentina de Cladística y Biogeografia,, 2016.

4.
MACHADO, D. J.; LYRA, M. L. ; Grant, T. . Reconstructing mitochondrial genomes for five species of amphibians directly from genomic next-generation sequencing reads. In: X Congreso Latinoamericano de Zoologia, 2014, Cartajena. La biodiversidad sensible: un patrimonio natural irreemplazable. Bogota: Asociacion Colombiana de Zoologia, 2014. v. 1. p. 551-552.

5.
DIAS, P. H. S. ; MACHADO, D. J. . Phylogenetic analysis of transformation series composed of ordered sequences. In: X Congreso Latinoamericano de Zoologia, 2014, Cartajena. La biodiversidad sensible: un patrimonio natural irreemplazable. Bogota: Asociación Colombiana de Zoología, 2014. v. 1. p. 625-625.

6.
MACHADO, D. J.; Marques, F. P. L. ; Reyda, F.B. . The phylogenetic position of unarmed cestodes parasites of neotropical freshwater stingrays. In: The 88th Annual Meeting of the American Society of Parasitologists and the 13th Annual Québec Molecular Parasitology Meeting, 2013, Québec. The 88th Annual Meeting of the American Society of Parasitologists and the 13th Annual Québec Molecular Parasitology Meeting, 2013. p. 30-162.

7.
MACHADO, D. J.; Marques, F. P. L. . On the use of iterative pass as a refinement strategy. In: XXXII Meeting of the Willi Hennig Society, 2013, Rostock. XXXII Meeting of the Willi Hennig Society, 2013. p. 20-161.

8.
MACHADO, D. J.; Marques, F. P. L. . Posicionamento filogenético de filobotriídios (Eucestoda: Tetraphyllidea: Phyllobothriidae) parasitas de arraias de água doce Neotropicais (Chondrichthyes: Myliobatoidei: Potamotrygonidae) baseada na otimização direta de dados moleculares. In: Hennig XXX - 2011 Meeting of the Willi Hennig Society, 2011, São José do Rio Preto. Hennig XXX: Abstracts. São José do Rio Preto: UNESP/ IBILCE, 2011. p. 1-192.

9.
Marques, F. P. L. ; Reyda, F.B. ; PRADO, P. I. ; Bueno, V.M. ; MACHADO, D. J. ; Luchetti, N.M. . Delimitando espécies aplicando taxonomia integrativa para tetrafilídeos dulcícolas: como reconhecer e lidar com grande variabilidade morfológica?. In: 7th Internation Workshop on Cestode Systematics, 2011, Lawrence. 7th International Workshop on Cestode Systematics. Lawrence: University of Kansas, 2011.

Apresentações de Trabalho
1.
SCHNEIDER, A. B. ; MACHADO, D. J. ; LAMBODHAR, D. ; JANIES, D. . Flavivirus Phylogeny Revisited: In search of the Orthologs.. 2017. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

2.
MACHADO, D. J.; Grant, T. ; CASTROVIEJO-FISHER, S. . Evidence of absence treated as absence of evidence: the effects of gaps in standart maximum likelihood analysis. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

3.
MACHADO, D. J.; Marques, F. P. L. ; Grant, T. . Direct Measures of Support for Maximum Likelihood. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

4.
HORA, B. R. da ; MACHADO, D. J. ; Caruso, I. A. ; RODRIGUES, S. D. ; DOMINGOS, M. F. ; VEIGAS-BARREIROS, R. M. O. . Potencial larvicida do pinhão-manso no controle da dengue. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

Outras produções bibliográficas
1.
MACHADO, D. J.; Marques, F. P. L. . The forgotten origin of Acanthobothrium Blanchard, 1848 (Tetraphyllidea: Onchobothriidae). Magnolia Press, 2012 (Correspondence).


Produção técnica
Programas de computador sem registro
1.
MACHADO, D. J.. YBYRÁ. 2013.

Redes sociais, websites e blogs
1.
MACHADO, D. J.. Um Sapo Me Contou. 2017; Tema: Divulgação científica. (Blog).

2.
MACHADO, D. J.. Anfíbio do Mês. 2013; Tema: Divulgação científica. (Blog).


Demais tipos de produção técnica
1.
MACHADO, D. J.. Análises filogenéticas. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

2.
MACHADO, D. J.. Posição filogenética de linhagens de Phyllobothriidae (Eucestoda: Tetraphyllidea) parasitas das raias de água doce da família Potamotrygonidae (Chondrichthyes: Myliobatoidei) baseada em otimização direta de dados moleculares. 2010. (Relatório de pesquisa).



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
?Curso de Verão em Bioinformática.Genômica comparada e defesa química em anfíbios. 2014. (Seminário).

2.
Curso de Verão em Bioinformática.Introdução à computação. 2014. (Seminário).

3.
I Curso de Verão em Zoologia.Análises filogenéticas. 2013. (Outra).

4.
XXXII Meeting of the Willi Hennig Society. YBYRÁ - a fast and resourceful tool for examining clade prevalences in large sets of trees. 2013. (Congresso).

5.
XXXII Meeting of the Willi Hennig Society. On the use of iterative pass as a refinement strategy. 2013. (Congresso).

6.
7th International Workshop on Cestode Systematics. Defining species boundaries using integrated taxonomy for freshwater tetraphyllideans: How to recognize and deal with great morphological variation?. 2011. (Congresso).

7.
The Willi Hennig Society 12th International workshop in Phylogenetic Methods. 2011. (Oficina).

8.
XXX Willi Hennig Meeting. Phylogenetic position of phyllobothriids (Eucestoda: Tetraphyllidea: Phyllobothriidea) parasites of Neotropical freshwater stingrays (Chondrichthyies: Myliobatoidei: Potamotrygonidae) based on direct optimization of nucleotide sequences.. 2011. (Congresso).

9.
International Symposium on Phylogeography. 2010. (Simpósio).

10.
Workshop on Marine Biodiversity: Current Advances on Bioprospecting, Biogeography and Phylogeography. 2010. (Simpósio).

11.
IV Workshp de Chondrichthyes do NUPEC. 2007. (Outra).

12.
V Semana da Biologia Marinha e Gerenciamento Costeiro. 2007. (Outra).

13.
IV Semana da Biologia Marinha e do Gerenciamento Costeiro. 2006. (Outra).

14.
XXIX Semana de Ciência e Tecnológia Agropecuária. 2004. (Outra).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
Fujita, A. ; Machado-Lima, A. ; Gruber, A. ; Reis, E. ; Lopes, F. M. ; Setubal, J. C. ; Araújo, L. V. ; Gubitoso, M. D. ; Vêncio, R. Z. N. ; Oliveira, P. S. L. ; Matioali, S. R. ; MACHADO, D. J. ; Rangel, L. T. . Curso de Verão em Bioinformática. 2014. (Outro).



Educação e Popularização de C & T



Programa de Computador sem registro de patente
1.
MACHADO, D. J.. YBYRÁ. 2013.


Cursos de curta duração ministrados
1.
MACHADO, D. J.. Análises filogenéticas. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Outra).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
Fujita, A. ; Machado-Lima, A. ; Gruber, A. ; Reis, E. ; Lopes, F. M. ; Setubal, J. C. ; Araújo, L. V. ; Gubitoso, M. D. ; Vêncio, R. Z. N. ; Oliveira, P. S. L. ; Matioali, S. R. ; MACHADO, D. J. ; Rangel, L. T. . Curso de Verão em Bioinformática. 2014. (Outro).



Outras informações relevantes


Current: PhD Student, Universidade de São Paulo (USP), São Paulo?SP. Programa Interunidades de Pós-Graduação em Bioinformática. Thesis project: "Comparative Genomics and the Evolution of Amphibian Chemical Defense".

2010?2012: Master in Zoology, Universidade de São Paulo (USP), São Paulo?SP, GPA 4.00. Financial support: Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

2006?2009: Bachelor in Biological Sciences/ Marine Biology, Universidade Estadual Paulista ?Júlio de Mesquita Filho?(UNESP), São Vicente?SP, GPA 3.26. Financial support: Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP).

2000?2002: Vocational and technical education in Informatics, Escola Técnica Estadual ?Dr. Adail Nunes da Silva? (ETE ?Dans?), Taquaritinga?SP. Financial support: Centro Estadual de Educação Tecnológica Paula Souza (CEET Paula Souza).



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