André Ramos Fernandes da Silva

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  • Última atualização do currículo em 20/08/2018


Doutorando em Biociências e Biotecnologia (Fiocruz), mestre em Engenharia de Sistemas e Computação (UFRJ, 2016) e bacharel em Ciência da Computação (UFRJ, 2014). Desde de 2014 trabalha com bioinformática e proteômica. Atualmente pesquisa e desenvolve novas metodologias de diagnóstico por espectrometria de massas e inteligência artificial. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
André Ramos Fernandes da Silva
Nome em citações bibliográficas
SILVA, ANDRÉ RAMOS FERNANDES DA;Silva, André R F;SILVA, A. R. F.;SILVA, ANDRÉ R. F.;SILVA, ANDRÉ R F


Formação acadêmica/titulação


2017
Doutorado em andamento em BIOCIÊNCIAS E BIOTECNOLOGIA.
Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Brasil.
Título: Classificação de perfis proteômicos de interesse para a saúde pública,
Orientador: Paulo Costa Carvalho.
Coorientador: Valmir Carneiro Barbosa.
Bolsista do(a): Instituto Carlos Chagas - Fiocruz - Paraná, ICC/FIOCRUZ-PR, Brasil.
2015 - 2016
Mestrado em Engenharia de Sistemas e Computação.
Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.
Título: Computational environment for discovery of new molecules with diagnostic potential,Ano de Obtenção: 2016.
Orientador: Paulo Costa Carvalho.
Coorientador: Valmir Carneiro Barbosa.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
2005 - 2014
Graduação em Ciência da Computação.
Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.
Título: Metodologia computacional para identificação de peptídeos a partir de espectros de massas.
Orientador: João Carlos Pereira da Silva.




Formação Complementar


2016 - 2016
Proteome Analysis by Mass Spectrometry. (Carga horária: 40h).
Institut Pasteur de Montevideo, IP MONTEVIDEO, Uruguai.
2016 - 2016
MS in forensic chemistry, forensic toxicology and clinical toxicology. (Carga horária: 8h).
1st IBERO-American, 6th BrMASS Conference on Mass Spectrometry, BRMASS, Brasil.
2016 - 2016
International course on theoretical and applied aspects of systems biology. (Carga horária: 30h).
Instituto Oswaldo Cruz, IOC, Brasil.
2014 - 2014
Introduction to Chemistry. (Carga horária: 40h).
Duke University, DUKE, Estados Unidos.
2014 - 2014
Curso SQL Completo. (Carga horária: 20h).
Softblue, SOFTBLUE, Brasil.
2014 - 2014
Análise de dados proteômicos. (Carga horária: 40h).
Instituto de Química - UFRJ, IQ/UFRJ, Brasil.
2003 - 2003
Curso de Formação de Professores DOSVOX. (Carga horária: 20h).
Núcleo de Computação Eletrônica - UFRJ, NCE/UFRJ, Brasil.
2002 - 2002
Programa Miniempresa. (Carga horária: 30h).
Associação Junior Achievement, AJA-RJ, Brasil.


Atuação Profissional



Flexibrás Tubos Flexíveis Ltda, FLEXIBRÁS, Brasil.
Vínculo institucional

2014 - 2014
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 20
Outras informações
Modelagem, aplicação e avaliação de desempenho de bancos de dados NoSQL para séries temporais e processamento de sinais.


Amtera Systems, Amtera, Brasil.
Vínculo institucional

2008 - 2010
Vínculo: Bolsista Desenvolvimento CNPq, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 30
Outras informações
Desenvolvimento de aplicações de web semântica, extração de informação, processamento de linguagem natural e informações geoespaciais.



Revisor de periódico


2016 - Atual
Periódico: Journal of Proteomics (Print)


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Português
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Grego
Compreende Pouco, Fala Pouco, Lê Pouco, Escreve Pouco.
Espanhol
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
SILVA, ANDRÉ R. F.2017 SILVA, ANDRÉ R. F.; LIMA, DIOGO B. ; LEYVA, ALEJANDRO ; DURAN, ROSARIO ; BATTHYANY, CARLOS ; AQUINO, PRISCILA F. ; LEAL, JULIANA C. ; RODRIGUEZ, JIMMY E. ; DOMONT, GILBERTO B. ; SANTOS, MARLON D. M. ; CHAMOT-ROOKE, JULIA ; BARBOSA, VALMIR C. ; CARVALHO, PAULO C. . DiagnoProt: a tool for discovery of new molecules by mass spectrometry. BIOINFORMATICS, v. 33, p. 1883-1885, 2017.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
LIMA, D. B. ; DUPRE, M. ; SILVA, A. R. F. ; CARVALHO, P. C. ; CHAMOT-ROOKE, J. . Automatic selection of discriminative top-down mass spectra with Diagno-Top: application to the differentiation of bacterial pathogens. In: 65th American Society for Mass Spectrometry, 2017, Indianapolis. 65th American Society for Mass Spectrometry, 2017.

2.
BARROS, M. A. S. ; SILVA, A. R. F. ; TEIXEIRA, F. A. ; LIMA, D. B. ; SILVA, J. C. P. . Método de Ranqueamento de Espectros de Massas para Identificação de Peptídeos. In: XXXVI Jornada Giulio Massarani de Iniciação Científica, Tecnológica, Artística e Cultural, 2014, Rio de Janeiro. Livro de Resumos da XXXVI Jornada Giulio Massarani de Iniciação Científica, Tecnológica, Artística e Cultural. Rio de Janeiro: Universidade Federal do Rio de Janeiro, 2014. p. 263-263.

Apresentações de Trabalho
1.
SILVA, ANDRÉ R F. Bioinformática para diagnóstico de doenças e identificação de micro-organismos. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

2.
BARROS, M. A. S. ; SILVA, A. R. F. ; TEIXEIRA, F. A. ; LIMA, D. B. ; SILVA, J. C. P. . Método de Ranqueamento de Espectros de Massas para Identificação de Peptídeos. 2014. (Apresentação de Trabalho/Congresso).



Patentes e registros



Patente

A Confirmação do status de um pedido de patentes poderá ser solicitada à Diretoria de Patentes (DIRPA) por meio de uma Certidão de atos relativos aos processos
1.
 CARVALHO, P. C. ; BATTHYANY, C. ; SILVA, A. R. F. ; LIMA, D. B. ; BARBOSA, V. C. ; DURAN, R. ; PENA, A. L. . SYSTEM, METHOD AND DEVICE FOR IDENTIFYING DISCRIMINANT BIOLOGICAL FACTORS AND FOR CLASSIFYING PROTEOMIC PROFILES. 2016, Estados Unidos.
Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: 62422964, título: "SYSTEM, METHOD AND DEVICE FOR IDENTIFYING DISCRIMINANT BIOLOGICAL FACTORS AND FOR CLASSIFYING PROTEOMIC PROFILES" , Instituição de registro: United States Patent and Trademark Office. Depósito: 16/11/2016



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
1st IBERO-American, 6th BrMASS Conference on Mass Spectrometry and the 13th UppCon. 2016. (Congresso).

2.
Oswaldo Cruz Institute Symposium in Proteomics. 2014. (Simpósio).



Inovação



Patente
1.
 CARVALHO, P. C. ; BATTHYANY, C. ; SILVA, A. R. F. ; LIMA, D. B. ; BARBOSA, V. C. ; DURAN, R. ; PENA, A. L. . SYSTEM, METHOD AND DEVICE FOR IDENTIFYING DISCRIMINANT BIOLOGICAL FACTORS AND FOR CLASSIFYING PROTEOMIC PROFILES. 2016, Estados Unidos.
Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: 62422964, título: "SYSTEM, METHOD AND DEVICE FOR IDENTIFYING DISCRIMINANT BIOLOGICAL FACTORS AND FOR CLASSIFYING PROTEOMIC PROFILES" , Instituição de registro: United States Patent and Trademark Office. Depósito: 16/11/2016



Educação e Popularização de C & T



Apresentações de Trabalho
1.
SILVA, ANDRÉ R F. Bioinformática para diagnóstico de doenças e identificação de micro-organismos. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).




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