Jadson Castro Gertrudes

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  • Última atualização do currículo em 30/08/2018


Aluno de Doutorado do Programa de Pós-graduação em Ciências de Computação e Matemática Computacional (PPg-CCMC) no Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação da Universidade de São Paulo (ICMC-USP); Mestre em Ciências pelo Programa de Pós-graduação em Sistemas de Informação da Escola de Artes, Ciências e Humanidades da Universidade de São Paulo (EACH-USP, 2013) e bacharel em Ciência da Computação pela Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia (UESB, 2011) . Realiza pesquisas nas áreas de Inteligência Computacional e Reconhecimento de Padrões. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Jadson Castro Gertrudes
Nome em citações bibliográficas
GERTRUDES, J. C.;GERTRUDES, J.C.;GERTRUDES, JADSON CASTRO


Formação acadêmica/titulação


2014
Doutorado em andamento em Ciências da Computação e Matemática Computacional.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
com período sanduíche em University of Alberta (Orientador: Joerg Sander).
Título: Abordagens de Agrupamento Semissupervisionado com Aplicação em Estudos de Química Medicinal,
Orientador: Ricardo Jose Gabrielli Barreto Campello.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Palavras-chave: Semi-supervised clustering; Density-based clustering; medicinal chemistry.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
2011 - 2013
Mestrado em SISTEMAS DE INFORMAÇÃO.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Emprego de técnicas de análise exploratória de dados utilizados em Química Medicinal,Ano de Obtenção: 2013.
Orientador: Káthia Maria Honório.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Palavras-chave: Reconhecimento de padrões; Análise de Componentes Principais; Análise de Componentes Principais Esparsas; Aprendizado não supervisionado.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Reconhecimento de padrões.
2006 - 2011
Graduação em Ciência da Computação.
Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia, UESB, Brasil.
Título: Utilização de classificador na detecção de veículos em imagens para auxílio na condução de veículos.
Orientador: Roque Mendes Prado Trindade.




Formação Complementar


2010 - 2010
Reconhecimento de Padrões em Imagens Médicas. (Carga horária: 6h).
Sociedade Brasileira de Computação - Porto Alegre, SBC, Brasil.
2010 - 2010
3Com LAN, Wireless, Security, IAP/IMC. (Carga horária: 80h).
Hewlett-Packard Brasil - Matriz, HP BRASIL, Brasil.
2009 - 2009
Desenvolvimento de Aplicações Web com PHP. (Carga horária: 12h).
Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia, UESB, Brasil.
2009 - 2009
Redes Wi-Fi. (Carga horária: 12h).
Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia, UESB, Brasil.


Atuação Profissional



Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Vínculo institucional

2014 - Atual
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Aluno de doutorado

Vínculo institucional

2015 - 2015
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estágio Supervisionado em docência, Carga horária: 6
Outras informações
Programa de Aperfeiçoamento de Ensino (PAE). Disciplina: Introducao à programação. Supervisor: Ricardo J. G. B. Campello.

Vínculo institucional

2014 - 2014
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estágio Supervisionado em Docência, Carga horária: 6
Outras informações
Programa de Aperfeiçoamento de Ensino (PAE). Disciplina: Mineração de dados biológicos. Supervisor: Ricardo J. G. B. Campello.

Vínculo institucional

2013 - 2013
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estágio Supervisionado em Docência, Carga horária: 6
Outras informações
Programa de tutoria em resolução de problemas. Disciplina: Resolução de Problemas I. Supervisor: Fábio Nakano.

Vínculo institucional

2012 - 2012
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estágio Supervisionado em Docência, Carga horária: 6
Outras informações
Programa de Aperfeiçoamento de Ensino (PAE). Disciplina: Introdução a Estatística. Supervisor: Esteban Tuesta.

Vínculo institucional

2012 - 2012
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estágio Supervisionado em Docência, Carga horária: 6
Outras informações
Programa de tutoria em resolução de problemas. Disciplina: Resolução de problemas II. Supervisor: Roberto Ortiz.

Vínculo institucional

2011 - 2011
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estágio Supervisionado em Docência, Carga horária: 6
Outras informações
Programa de Aperfeiçoamento de Ensino (PAE). Disciplina: Engenharia de software. Supervisor: Marcelo Morandini.

Atividades

02/2014 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação, .

03/2017 - 06/2017
Extensão universitária , Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação, .

Atividade de extensão realizada
Práticas com tablets e celulares.
02/2011 - 09/2013
Pesquisa e desenvolvimento , USP Leste, .


University of Alberta, UALBERTA, Canadá.
Vínculo institucional

2015 - 2016
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pesquisador visitante especial, Carga horária: 40
Outras informações
Doutorado Sandwich no Exterior (SWE). Processo CNPq 20883/2015-9


Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia, UESB, Brasil.
Vínculo institucional

2010 - 2011
Vínculo: , Enquadramento Funcional: TECNICO DE SUPORTE EM REDES, Carga horária: 40


Ministério do Trabalho e Emprego, MTE, Brasil.
Vínculo institucional

2008 - 2010
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: ESTAGIÁRIO, Carga horária: 20



Linhas de pesquisa


1.
Abordagens de Agrupamento Semissupervisionado com Aplicação em Estudos de Química Medicinal
2.
Desenvolvimento e Validação de um Esquema de Análise Exploratória para Dados de Química Medicinal


Projetos de pesquisa


2015 - 2016
Abordagens de agrupamento semissupervisionado com aplicação em estudos de Química Medicinal
Descrição: Os conjuntos de dados avaliados na área de Química Medicinal são caracterizados pelo baixo número de exemplos rotulados, pela alta dimensionalidade e, em alguns casos, por não possuir uma clara relação entre estrutura química e atividade biológica, o que torna complexa a aplicação de técnicas de classificação / regressão e a análise dos fenômenos químicos. Por conta disso, torna-se promissor o desenvolvimento e a aplicação de métodos que auxiliem na descoberta de grupos de moléculas dentro dos conjuntos de dados a serem estudados, com base em um subconjunto reduzido de informações rotuladas disponíveis. Uma abordagem de agrupamento de dados aplicável nesse contexto é denominada como agrupamento semissupervisionado, que é objeto de estudo no presente projeto de pesquisa. Recentemente, diversos trabalhos foram desenvolvidos na busca por algoritmos que realizem de forma eficaz o agrupamento semi-supervisionado, sendo que ainda há discussões quanto à forma de utilização das informações rotuladas durante o processo de aprendizado. Uma dessas discussões refere-se a inserção de regras de aprendizado ativo no contexto do agrupamento semi-supervisionado. Com base nas informações apresentadas, os principais objetivos deste projeto de estágio sanduíche consistem em: (i) investigar, implementar e validar abordagens de agrupamento semissupervisionado que sejam apropriadas para a análise de dados em Química Medicinal; (ii) investigar, implementar e validar a possibilidade de inserir regras de aprendizado ativo em algoritmos semissupervisionados que sejam apropriadas para o contexto de Química Medicinal..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2011 - 2013
Desenvolvimento e Validação de um Esquema de Análise Exploratória para Dados de Química Medicinal
Descrição: Pesquisas relevantes na área de Química Medicinal têm direcionado-se para a descoberta de novas substâncias químicas bioativas, potenciais candidatas a novos medicamentos para doenças consideradas crônicas, como é o caso do diabetes mellitus tipo 2 (DM) e a síndrome metabólica (SM). Entretanto, os dados manipulados pelos pesquisadores que atuam nessa área são inerentemente caracterizados pela alta dimensionalidade e pelo número cada vez maior de amostras a serem analisadas, o que torna complexa a modelagem de fenômenos moleculares que constituem os processos bioquímicos subjacentes. Dessa forma, para que a modelagem e a simulação desses sistemas complexos sejam bem sucedidas, é fundamental combinar-se a memória do computador, para cálculo e armazenamento de dados, e a habilidade humana em reconhecer padrões, resolvendo-se assim, problemas multivariados. A proposta de pesquisa apresentada neste documento compreende uma investigação multidisciplinar cujas principais contribuições incluem o aprimoramento e a integração de técnicas de análise exploratória, gerando uma ferramenta computacional capaz de reduzir o tempo de análise dos dados obtidos a partir de modelos da química medicinal, caracterizados por sua alta dimensionalidade e que possa auxiliar na futura construção de um banco de dados que seja referência na área de propriedades biológicas de drogas e candidatos a fármacos.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) .
Integrantes: Jadson Castro Gertrudes - Integrante / Patrícia Rufino Oliveira - Coordenador / HONORIO, KATHIA MARIA - Integrante.
Número de produções C, T & A: 2


Projetos de extensão


2007 - 2009
Nucleo de Gestão Colaborativa
Descrição: Alfabetizar digitalmente crianças, jovens, adultos e idosos na cidade de Vitória da Conquista - BA..
Situação: Concluído; Natureza: Extensão.
Alunos envolvidos: Graduação: (8) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) .
Integrantes: Jadson Castro Gertrudes - Integrante / Roque Mendes Prado Trindade - Coordenador.


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Aprendizado de máquina.
2.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Reconhecimento de padrões.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.
Português
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.


Produções



Produção bibliográfica
Citações

SCOPUS
Total de trabalhos:5
Total de citações:65
Gertrudes, Jadson Castro  Data: 27/06/2017

Outras
Total de trabalhos:5
Total de citações:80
Jadson Castro Gertrudes  Data: 27/06/2017

Artigos completos publicados em periódicos

1.
MALTAROLLO, VINÍCIUS GONÇALVES2015MALTAROLLO, VINÍCIUS GONÇALVES ; GERTRUDES, JADSON CASTRO ; OLIVEIRA, PATRÍCIA RUFINO ; HONORIO, KATHIA MARIA . Applying machine learning techniques for ADME-Tox prediction: a review. Expert Opinion on Drug Metabolism & Toxicology, v. 11, p. 259-271, 2015.

2.
ARAUJO, S. C.2015ARAUJO, S. C. ; MALTAROLLO, V.G. ; SILVA, D. C. ; GERTRUDES, J.C. ; HONORIO, K. M. . ALK-5 Inhibition: A Molecular Interpretation of the Main Physicochemical Properties Related to Bioactive Ligands. JOURNAL OF THE BRAZILIAN CHEMICAL SOCIETY, v. 26, p. 1936-1946, 2015.

3.
PANTALEÃO, SIMONE QUEIROZ2015PANTALEÃO, SIMONE QUEIROZ ; MALTAROLLO, VINICIUS GONÇALVES ; ARAUJO, SHEILA CRUZ ; GERTRUDES, JADSON CASTRO ; HONORIO, KATHIA MARIA . Molecular docking studies and 2D analyses of DPP-4 inhibitors as candidates in the treatment of diabetes. Molecular BioSystems, v. 11, p. 3188-3193, 2015.

4.
HONORIO, K. M.2013HONORIO, K. M. ; GARCIA, T. S. ; SILVA, D. C. ; GERTRUDES, J. C. ; MATAROLLO, V. G. . Molecular features related to the binding mode of PPAR δ agonists from QSAR and docking analyses. SAR and QSAR in Environmental Research (Print), v. 24, p. 157-173, 2013.

5.
GERTRUDES, J. C.;GERTRUDES, J.C.;GERTRUDES, JADSON CASTRO2012 GERTRUDES, J. C.; MALTAROLLO, V. G. ; SILVA, R. A. ; OLIVEIRA, P. R. ; HONORIO, K. M. ; da SILVA, A. B. . Machine Learning Techniques and Drug Design. Current Medicinal Chemistry, v. 19, p. 4289-4297, 2012.

Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1.
GERTRUDES, JADSON CASTRO; ZIMEK, ARTHUR ; SANDER, JÖRG ; CAMPELLO, RICARDO J. G. B. . A unified framework of density-based clustering for semi-supervised classification. In: the 30th International Conference, 2018, Bozen-Bolzano. Proceedings of the 30th International Conference on Scientific and Statistical Database Management - SSDBM '18. New York: ACM Press, 2018. p. 1-12.

Outras produções bibliográficas
1.
GERTRUDES, J.C.. SBSI 2017 - WICSI 2017 2017 (Revisor de Conferência).



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Trabalhos de conclusão de curso de graduação
1.
BRAGA, R. T. V.; GERTRUDES, J.C.. Participação em banca de Marcello de Paula Ferreira Costa.Mineração de dados - Um estudo de diagnósticos. 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação (ICMC-USP).

2.
Toledo, C. F. M; GERTRUDES, J.C.. Participação em banca de Henrique Cintra Miranda de Souza.Análise de dados de telecomunicação utilizando aprendizado de máquina. 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação (ICMC-USP).

3.
Toledo, C. F. M; GERTRUDES, J.C.. Participação em banca de Yago Minto Lourenço.Sistemas de Informação como apoio para marketing digital. 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação (ICMC-USP).

4.
GERTRUDES, JADSON CASTRO; FORTES, R.. Participação em banca de Leonardo Alves Miguel.Criação de uma estrutura de BI para documentos fiscais. 2016. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Sistemas de Informação) - Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação (ICMC-USP).

5.
BATISTA NETO, J. E. S.; GERTRUDES, JADSON CASTRO. Participação em banca de Jaqueline Melissa Arai.Modelos Preditivos e Visualização Computacional para Análise de Risco. 2016. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Sistemas de Informação) - Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação (ICMC-USP).

6.
BRAGA, R. T. V.; GERTRUDES, JADSON CASTRO. Participação em banca de Lilian Faria e Silva.Desenvolvimento de transações para equipamentos de autoatendimento bancário. 2016. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Sistemas de Informação) - Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação (ICMC-USP).




Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
Simpósio Internacional de Iniciação Científica da USP (1a etapa).Avaliador. 2016. (Simpósio).

2.
Scientific Writing in English. 2015. (Oficina).

3.
3rd School on Machine Learning and Knowledge Discovery in Databases. 2014. (Encontro).

4.
3o Workshop de Capacitação para Pesquisadores da USP em Publicação Científica. 2011. (Oficina).

5.
11º FORUM INTERNACIONAL DE SOFTWARE LIVRE. 2010. (Congresso).

6.
Maratona de Programação.Maratona de Programação. 2010. (Outra).

7.
X ERBASE. 2010. (Congresso).

8.
10º FORUM INTERNACIONAL DE SOFTWARE LIVRE. 2009. (Congresso).

9.
III SECOMP. 2009. (Outra).

10.
FORUM DO POLO DIGITAL DO SERTAO. 2008. (Encontro).

11.
I WORKSHOP DE SOFTWARE LIVRE. 2007. (Outra).

12.
X CONPEX. 2007. (Congresso).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
TRINDADE, R. M. P. ; GERTRUDES, J.C. . IV SECOMP. 2010. (Congresso).

2.
GERTRUDES, J. C.. III SECOMP. 2009. (Congresso).

3.
GERTRUDES, J. C.. VIII ERBASE. 2007. (Congresso).




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