Lucas Souza Lopes

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  • Última atualização do currículo em 12/11/2018


Bacharel em Ciências Biológicas pela Universidade Federal de Viçosa - UFV (2012). Mestre em agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas) pela Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz"/Universidade de São Paulo- ESALQ/USP (2014). Atualmente cursa Doutorado em Bioenergias pelo programa integrado da Universidade de São Paulo (USP) em parceria com a Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) e Universidade Estadual Paulista (UNESP) (2018). Atua em projetos de pesquisa relacionados a fermentação etanólica a partir de caldo de cana-de-açúcar e biologia computacional aplicados a estudos bioquímicos e moleculares em bactérias e leveduras. Desenvolve seu projeto de doutorado no Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol/Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CTBE/CNPEM) em parceria com o Laboratório Max Feffer de Genética de Plantas (ESALQ/USP). Desenvolveu projeto de pesquisa relacionados a diversidade genética de Medronheiro (Arbutus unedo) no Instituto Politécnico de Bragança (IPB), Bragança, Portugal. Suas pesquisas englobam estudos de genética, biologia molecular, biologia vegetal, bioquímica, fisiologia vegetal, fisiologia de microrganismos, fermentação alcoólica, bioprocessos industriais aplicados no setor sucroenergético e bioinformática. Tem interesse profissionais nos seguintes temas: 1) Ensino universitário em áreas de biologia celular, biologia molecular, genética e fisiologia de plantas, genética e fisiologia de microrganismos, bioinformática, bioquímica, estatística, biologia de sistemas e áreas afins; 2) Desenvolvimento de projetos de pesquisa e inovação nas áreas de bioinformática, biologia de sistemas, estudos genéticos e fisiológicos de plantas e microrganismos de interesse agronômico e industrial. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Lucas Souza Lopes
Nome em citações bibliográficas
LOPES, L. S.;LOPES, LUCAS


Formação acadêmica/titulação


2015
Doutorado em andamento em BIOENERGIA USP, UNICAMP E UNESP.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Orientador: Carlos Alberto Labate.
Coorientador: Diego Maurício Riaño-Pachón.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Palavras-chave: Bioinformática; Saccharomyces cerevisiae; Fisiologia de microrganismos; Biologia Vegetal.
2012 - 2014
Mestrado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Caracterização Molecular da linhagem PE-2 de Saccharomyces cerevisiae sob condições de alto etanol em fermentadores industriais,Ano de Obtenção: 2014.
Orientador: Márcio de Castro Silva Filho.
Coorientador: Marcelo Mendes Brandão.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Palavras-chave: WGCNA; Big data; Saccharomyces cerevisiae; ethanol stress; industrial fermentation.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Bioinformática.
Setores de atividade: Pesquisa e desenvolvimento científico.
2006 - 2011
Graduação em Ciências Biológicas.
Universidade Federal de Viçosa, UFV, Brasil.
Título: Caracterização in silico e análise da expressão gênica da família de Lipoxigenases em Soja.
Orientador: Everaldo Gonçalves de Barros.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.




Formação Complementar


2016 - 2016
Introdução aos modelos gráficos e aplicações à genética. (Carga horária: 3h).
Sociedade Brasileira de Genética, SBG, Brasil.
2010 - 2010
Genética Forense. (Carga horária: 3h).
Sociedade Brasileira de Genética, SBG, Brasil.
2008 - 2008
Proteômica e Peptidômica na Genômica Funcional. (Carga horária: 8h).
Universidade Federal de Viçosa, UFV, Brasil.
2008 - 2008
Uso de Ferramentas estatísticas do Excel. (Carga horária: 8h).
Universidade Federal de Viçosa, UFV, Brasil.
2007 - 2007
Bioinformática para análises genômicas. (Carga horária: 16h).
Universidade Federal de Viçosa, UFV, Brasil.
2007 - 2007
Organização e evolução dos genomas. (Carga horária: 3h).
Sociedade Brasileira de Genética, SBG, Brasil.
2007 - 2007
Curso de Web básica:HTML. (Carga horária: 14h).
Universidade Federal de Viçosa, UFV, Brasil.
2007 - 2007
Treinamento do uso do software de estatitística R. (Carga horária: 8h).
Universidade Federal de Viçosa, UFV, Brasil.


Atuação Profissional



Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Vínculo institucional

2015 - Atual
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Doutorado, Carga horária: 40

Vínculo institucional

2012 - 2014
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Mestrado, Carga horária: 40
Outras informações
Desenvolvimento do projeto: Seleção e caracterização molecular de leveduras adaptadas a condições de alto etanol em fermentadores industriais.


Universidade Federal de Viçosa, UFV, Brasil.
Vínculo institucional

2011 - 2011
Vínculo: Monitoria, Enquadramento Funcional: Voluntária, Carga horária: 4
Outras informações
Disciplina: Biologia Molecular Básica. Assuntos Abordados: Introdução à biologia molecular. Estrutura e propriedades dos ácidos nucléicos. Biossíntese de ácidos nucléicos. Código genético. Biossíntese de proteínas. Mutação, reparo e recombinação no material genético. Regulação da biossíntese de proteínas. Noções básicas de engenharia genética

Vínculo institucional

2011 - 2011
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Monitor, Carga horária: 12, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Disciplina: Biologia Celular. Assuntos abordados: Organização geral das células e vírus. Métodos de estudo da célula. Composição química da célula. Membranas biológicas e digestão intracelular. Mitocôndria. Célula vegetal. Citoesqueleto e movimentos celulares. Núcleo. Ciclo celular. Retículo endoplasmático e complexo de Golgi. Diferenciação celular

Vínculo institucional

2011 - 2011
Vínculo: Estágio, Enquadramento Funcional: Supervisionado, Carga horária: 20
Outras informações
Estágio desenvolvido para execução do projeto de Monografia: Caracterização in silico e análise de expressão gênica da família de lipoxigenases em soja

Vínculo institucional

2009 - 2009
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Iniciação Científica, Carga horária: 20, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Foi bolsista do Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) - processo 504534/2007. Projeto de Pesquisa: Obtenção de plantas geneticamente modificadas de soja com sementes com baixos teores ou ausência dos inibidores de protease do tipo Bowman-Birk e da proteína Gly Bd 30K (P34)

Vínculo institucional

2009 - 2009
Vínculo: Monitoria, Enquadramento Funcional: Voluntária, Carga horária: 8
Outras informações
Disciplina: Práticas em Biologia Molecular. Assuntos abordados: Organização do genoma de vírus. Organização do genoma de procariontes. Organização do genoma de cloroplastos e mitocôndrias. Organização do genoma de eucariontes. Controle da expressão gênica. Técnicas básicas de biologia molecular: extração de DNA, PCR, Clonagem.

Vínculo institucional

2007 - 2009
Vínculo: Estágio, Enquadramento Funcional: Voluntário, Carga horária: 10
Outras informações
Atividades desenvolvidas: Extração de DNA de soja, amplificação de fragmentos de DNA via Reação da Polimerase em Cadeia (PCR), Análise eletroforética de fragmentos de DNA em géis de agarose, técnicas de clonagem de fragmentos de DNA, extração e análise de RNA total de soja e obtenção de células competentes para transformação.

Vínculo institucional

2006 - 2009
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Programa de Educação Tutorial - PET, Carga horária: 20, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Membro do Programa de Educação Tutorial (PET) Ciências Biológicas da UFV. Desenvolvimento de atividades em Ensino, Pesquisa e Extensão sob tutoria do professor doutor José Lino Neto

Vínculo institucional

2008 - 2008
Vínculo: Monitoria, Enquadramento Funcional: Voluntária, Carga horária: 4
Outras informações
Disciplina: Biologia Molecular Básica. Assuntos abordados: Introdução à biologia molecular. Estrutura e propriedades dos ácidos nucléicos. Biossíntese de ácidos nucléicos. Código genético. Biossíntese de proteínas. Mutação, reparo e recombinação no material genético. Regulação da biossíntese de proteínas. Noções básicas de engenharia genética


Instituto Politécnico de Bragança, IPB, Portugal.
Vínculo institucional

2009 - 2010
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estágio laboratorial, Carga horária: 20, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Projeto de Pesquisa: Estudo da diversidade genética de populações naturais de medronheiro - Arbutus unedo por análise morfológica e molecular (ISSR e RAPD). O trabalho desenvolvido incluiu a colheita de amostras no interior norte e centro de Portugal, análises morfológicas das folhas e molecular através de marcadores RAPD e ISSR.



Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Metabolismo e Bioenergética.
2.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Bioinformática.
3.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.
4.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Bioquímica dos Microorganismos.
5.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biotecnologia / Subárea: Biotecnologia Industrial/Especialidade: Biocombustíveis.
6.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Fisiologia / Subárea: Biologia Vegetal.


Idiomas


Português
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.


Prêmios e títulos


2008
Prêmio Arthur Bernardes de Ensino, Universidade Federal de Viçosa.
2008
Menção Honrosa, Universidade Federal de Viçosa.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
LOPES, LUCAS2012 LOPES, LUCAS; SÁ, OLGA ; PEREIRA, JOSÉ ALBERTO ; BAPTISTA, PAULA . Genetic diversity of Portuguese Arbutus unedo L. populations using leaf traits and molecular markers: An approach for conservation purposes. Scientia Horticulturae, v. 142, p. 57-67, 2012.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
LOPES, L. S.; PERSINOTI, G. F. ; RIANO-PACHON, D.M. ; LABATE, C. A. . Genetic characterization of three bacterial strains isolated from ethanol producing mills in Brazil. In: X-meeting 2018, 14th International Conference of the AB3C, 2018, São Pedro. Anais do X-meeting 2018, 14th International Conference of the AB3C, 2018.

2.
LOPES, L. S.; BONATELLI, M. L. ; LABATE, C. A. ; RIANO-PACHON, D.M. . Genome sequencing of three bacterial isolates contaminating industrial ethanolic fermentations. In: Brazilian-International Congress of Genetics, 2016, Caxambú. Annals of Brazilian-International Congress of Genetics, 2016.

3.
BRANDAO, M. M. ; LOPES, L. S. ; SILVA-FILHO, M. C. . Gene co-expression and big data approach to evaluate the molecular characterization of PE-2 Yeast adapted to high ethanol conditions in industrial fermenters. In: International Conference of the AB3C and Brazilian Symposium on Bioinformatics, 2013, Recife. Abstract Book - X-meeting BSB 2013-11-10, 2013.

4.
LOPES, L. S.; Sá, O. ; PEREIRA, J. A. ; BAPTISTA, P. . Estudo da diversidade genética de Arbutus unedo L. utilizando marcadores ISSR e RAPD. In: 56 Congresso Brasileiro de Genética, 2010, Guarujá - SP. 56 Congresso Brasileiro de Genética, 2010.

5.
LOPES, L. S.; Sá, O. ; BALTAZAR, J. L. ; PEREIRA, J. A. ; BAPTISTA, P. . Analysis of molecular and morphological diversity of Arbutus unedo in the interior North and Center of Portugal. In: XXXV Jornadas Portuguesas de Genética, 2010, Braga. XXXV Jornadas Portuguesas de Genética, 2010.

6.
LOPES, L. S.; FIALHO, L. S. ; BARROS, B. A. ; REZENDE, S. T. ; BARROS, E. G. . Construção de um cassete de expressão para silenciamento do gene da Estaquiose Sintase em soja (Glycine max), via RNA de Interferência. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 2008, SALVADOR - BA. 54 CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 2008.

7.
LOPES, L. S.; FIALHO, L. S. ; CARDOSO, M. S. ; REZENDE, S. T. ; BARROS, E. G. . Isolamento, clonagem e análise in silico da região promotora do gene da Estaquiose Sintase de soja (Glycine max). In: XVIII SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, VIII SIMPÓS - MOSTRA CIENTÍFICA DA PÓS-GRADUAÇÃO, VI SIMPÓSIO DE EXTENSÃO UNIVERSITÁRIA E II SEn - SIMPÓSIO DE ENSINO, 2008, Viçosa/MG. Anais XVIII SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, VIII SIMPÓS - MOSTRA CIENTÍFICA DA PÓS-GRADUAÇÃO, VI SIMPÓSIO DE EXTENSÃO UNIVERSITÁRIA E II SEn - SIMPÓSIO DE ENSINO, 2008.

8.
LOPES, L. S.; Lilian da Silva Fialho ; REZENDE, S. T. ; BARROS, E. G. . Montagem de cassete de silenciamento, via RNA de interferência, do gene da Estaquiose Sintase em Soja (Glycine max). In: XVIII SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, VIII SIMPÓS - MOSTRA CIENTÍFICA DA PÓS-GRADUAÇÃO, VI SIMPÓSIO DE EXTENSÃO UNIVERSITÁRIA E II SEn - SIMPÓSIO DE ENSINO, 2008. Anais XVIII SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, VIII SIMPÓS - MOSTRA CIENTÍFICA DA PÓS-GRADUAÇÃO, VI SIMPÓSIO DE EXTENSÃO UNIVERSITÁRIA E II SEn - SIMPÓSIO DE ENSINO, 2008.

9.
OLIVEIRA, C. G. B. ; PRADO, F. V. ; SILVA, M. C. ; MARTINELLI, F. S. ; MOREIRA, E. A. ; BENEVENUTO, J. ; LOPES, L. S. ; LINO NETO, J. . Relação de fatores socioculturais com o ingresso dos estudantes na UFV de 2000 a 2007. In: XVIII SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, VIII SIMPÓS - MOSTRA CIENTÍFICA DA PÓS-GRADUAÇÃO, VI SIMPÓSIO DE EXTENSÃO UNIVERSITÁRIA E II SEn - SIMPÓSIO DE ENSINO, 2008. Anais XVIII SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, VIII SIMPÓS - MOSTRA CIENTÍFICA DA PÓS-GRADUAÇÃO, VI SIMPÓSIO DE EXTENSÃO UNIVERSITÁRIA E II SEn - SIMPÓSIO DE ENSINO, 2008.



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
X-meeting 2018, 14th International Conference of the AB3C. Genetic characterization of three bacterial strains isolated from ethanol producing mills in Brazil. 2018. (Congresso).

2.
Brazilian-International Congress of Genetics. Genome sequencing of three bacterial isolates contaminating industrial ethanolic fermentations. 2016. (Congresso).

3.
56 Congresso Brasileiro de Genética. Estudo da diversidade genética de Arbutus unedo L. utilizando marcadores ISSR e RAPD. 2010. (Congresso).

4.
XXXV Jornadas Portuguesas de Genética. Analysis of molecular and morphological diversity of Arbutus unedo in the interior North and Center of Portugal. 2010. (Congresso).

5.
55 Congresso Brasileiro de Genética. 2009. (Congresso).

6.
54º CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA. Construção de um cassete de expressão para silenciamento do gene da Estaquiose Sintase em Soja (Glycine max), via RNA de Interferência. 2008. (Congresso).

7.
Ciclo de Palestras sobre evolução. 2008. (Outra).

8.
XI Encontro dos grupos PET/BIOLOGIA de Minas Gerais. 2008. (Encontro).

9.
XVIII SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, VIII SIMPÓS - MOSTRA CIENTÍFICA DA PÓS-GRADUAÇÃO, VI SIMPÓSIO DE EXTENSÃO UNIVERSITÁRIA E II SEn - SIMPÓSIO DE ENSINO.ISOLAMENTO, CLONAGEM E ANÁLISE IN SILICO DA REGIÃO PROMOTORA DO GENE DA ESTAQUIOSE SINTASE DE SOJA (Glycine max). 2008. (Simpósio).

10.
53º Congresso Brasileiro de Genética. 2007. (Congresso).

11.
Ciclo de Palestras Charles Darwin - vida e obra. 2007. (Outra).

12.
X Encontro de Grupos PET/BIOLOGIA de Minas Gerais. 2007. (Encontro).

13.
XXIV Semana Acadêmica de Biologia. 2007. (Simpósio).

14.
II Interpet UFJF. 2006. (Encontro).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
LOPES, L. S.. VII Encontro dos Grupos PET da Região Sudeste. 2007. (Congresso).




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