José Henrique Pereira

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  • Última atualização do currículo em 28/02/2008


Possui graduação em Ciências Biológicas e doutorado em Biofísica Molecular pela UNESP/São José do Rio Preto . Atualmente realiza pos-doutorado na Universidade da California - Berkeley desde Fevereiro de 2006. Tem experiência nas areas de biologia molecular (clonagem, expressao e purificacao de proteinas) assim como nas areas de cristalografia de proteinas e modelagem molecular. Os principais projetos sao: estudo estrutural de proteinas presentes em celulas-tronco embrionarias, proteinas de membrana (quimiorreceptores) e complexos proteina-DNA. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
José Henrique Pereira
Nome em citações bibliográficas
PEREIRA, J. H.

Endereço


Endereço Profissional
Universidade da California - Berkeley.
University of California - Berkeley / Donner Laboratory / Room 301
94720 - Berkeley, - Estados Unidos
Telefone: (510) 4864332


Formação acadêmica/titulação


2002 - 2005
Doutorado em Biofísica Molecular.
Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas - UNESP/São José do Rio.
Título: Estudo Estrutural das Enzimas da Via Metabólica do Ácido Chiquímico, Ano de obtenção: 2005.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Júnior.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo.
Palavras-chave: shikimate pathway; structure; molecular model; Mycobacterium tuberculosis.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular / Especialidade: Biologia Estrutural.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular / Especialidade: Bioinformática.
1998 - 2001
Graduação em Ciências Biológicas.
Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas - UNESP/São José do Rio.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo.


Pós-doutorado


2006
Pós-Doutorado.
Universidade da California - Berkeley.


Atuação Profissional



Universidade da California - Berkeley, UC-BERKELEY, Estados Unidos.
Vínculo institucional

2006 - Atual
Vínculo: pos-doutorado, Enquadramento Funcional: bolsista, Regime: Dedicação exclusiva.


Lawrence Berkeley National Laboratory, LBL, Estados Unidos.
Vínculo institucional

2006 - Atual
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: guest



Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular.
2.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular/Especialidade: Biologia Estrutural.
3.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular/Especialidade: Bioinformática.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
PEREIRA, J. H.2008PEREIRA, J. H.; HA, C. S. ; KIM, S-H. . Crystallization and preliminary X-ray analysis of human Brn-5 transcription factor in complex with DNA. Acta Crystallographica. Series F, v. 64, p. 175-178, 2008.

2.
ARCURI, H. A.2008ARCURI, H. A. ; BORGES, J. C. ; Fonseca, I. O. ; PEREIRA, J. H. ; RUGGIERO NETO, J. ; BASSO, L. A. ; SANTOS, D. S. ; DE AZEVEDO, W. F. . Structural studies of shikimate 5-dehydrogenase from Mycobacterium tuberculosis.. Proteins, v. xx, p. xxx, 2008.

3.
MARQUES, M. R.2007MARQUES, M. R. ; PEREIRA, J. H. ; OLIVEIRA, J. S. ; BASSO, L. A. ; DE AZEVEDO, W. F. ; SANTOS, D. S. ; PALMA, M. S. . The Inhibition of 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase as a model for development of novel antimicrobials.. Current Drug Targets, v. 8, p. 445-457, 2007.

4.
PEREIRA, J. H.2007 PEREIRA, J. H.; VASCONCELOS, I. B. ; OLIVEIRA, J. S. ; CACERES, R.A. ; DE AZEVEDO, W. F. ; BASSO, L. A. ; SANTOS, D. S. . Shikimate kinase: a potential target for development of novel antitubercular agents.. Current Drug Targets, v. 8, p. 459-468, 2007.

5.
BORGES, J. C.2006BORGES, J. C. ; PEREIRA, J. H. ; VASCONCELOS, I. B. ; dos SANTOS, G. C. ; OLIVIERI, J. R. ; RAMOS, C. ; PALMA, M. S. ; BASSO, L. A. ; SANTOS, D. S. ; DE AZEVEDO, W. F. . Phosphate closes the solution structure of the 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase (EPSPS) from Mycobacterium tuberculosis.. Archives of Biochemistry and Biophysics, v. 452, p. 156-164, 2006.

6.
SILVEIRA, N. J. F.2006SILVEIRA, N. J. F. ; BONALUMI, C. E. ; UCHOA, H. B. ; PEREIRA, J. H. ; CANDURI, F. ; DE AZEVEDO, W. F. . DBMODELING: a database applied to the study of protein targets from genome projects.. Cell Biochemistry and Biophysics, v. 44, p. 366-374, 2006.

7.
OLIVEIRA, J. S.2006 OLIVEIRA, J. S. ; PEREIRA, J. H. ; Canduri, F. ; RODRIGUES, N. C. ; SOUZA, O. N. ; DE AZEVEDO, W. F. ; BASSO, L. A. ; SANTOS, D. S. . Crystallographic and pre-steady-state kinetics studies on binding of NADH to wild-type and isoniazid-resistant enoyl-ACP(CoA) reductase enzymes from Mycobacterium tuberculosis.. Journal of Molecular Biology, v. 359, p. 646-666, 2006.

8.
DIAS, M. V. B.2006DIAS, M. V. B. ; BORGES, J. C. ; ELY, F. ; PEREIRA, J. H. ; Canduri, F. ; RAMOS, C. ; FRAZZON, J. ; PALMA, M. S. ; BASSO, L. A. ; SANTOS, D. S. ; DE AZEVEDO, W. F. . Structure of chorismate synthase from Mycobacterium tuberculosis.. Journal of Structural Biology, v. 154, p. 130-143, 2006.

9.
SILVEIRA, N. J. F.2005SILVEIRA, N. J. F. ; UCHOA, H. B. ; PEREIRA, J. H. ; CANDURI, F. ; BASSO, L. A. ; PALMA, M. S. ; SANTOS, D. S. ; DE AZEVEDO, W. F. . Molecular models of protein targets from Mycobacterium tuberculosis. Journal of Molecular Modeling (Online), v. 11, p. 160-166, 2005.

10.
SILVA, R. G.2005SILVA, R. G. ; PEREIRA, J. H. ; CANDURI, F. ; DE AZEVEDO, W. F. ; BASSO, L. A. ; SANTOS, D. S. . Kinetics and crystal structure of human purine nucleoside phosphorylase in complex with 7-methyl-6-thio-guanosine. Archives of Biochemistry and Biophysics, v. 442, p. 49-58, 2005.

11.
ARCURI, H. A.2004ARCURI, H. A. ; CANDURI, F. ; PEREIRA, J. H. ; SILVEIRA, N. J. F. ; OLIVEIRA, J. S. ; BASSO, L. A. ; PALMA, M. S. ; SANTOS, D. S. ; DE AZEVEDO, W. F. . Molecular models for shikimate pathway enzymes of Xylella fastidiosa. Biochemical and Biophysical Research Communications, v. 320, p. 979-991, 2004.

12.
PEREIRA, J. H.2004 PEREIRA, J. H.; OLIVEIRA, J. S. ; CANDURI, F. ; DIAS, M. V. B. ; PALMA, M. S. ; BASSO, L. A. ; SANTOS, D. S. ; DE AZEVEDO, W. F. . Structure of shikimate kinase from Mycobacterium tuberculosis reveals the binding of shikimic acid. Acta Crystallographica. Section D, Biological Crystallography, v. 60, p. 2310-2319, 2004.

13.
NOLASCO, D. O.2004NOLASCO, D. O. ; CANDURI, F. ; PEREIRA, J. H. ; CORTINOZ, J. R. ; PALMA, M. S. ; OLIVEIRA, J. S. ; BASSO, L. A. ; DE AZEVEDO, W. F. ; SANTOS, D. S. . Crystallographic structure of PNP from Mycobacterium tuberculosis at 1.9 resolution. Biochemical and Biophysical Research Communications, v. 324, p. 789-794, 2004.

14.
SILVEIRA, N. J. F.2004SILVEIRA, N. J. F. ; UCHOA, H. B. ; CANDURI, F. ; PEREIRA, J. H. ; CAMARA JR, J. C. ; BASSO, L. A. ; PALMA, M. S. ; SANTOS, D. S. ; DE AZEVEDO, W. F. . Structural bioinformatics study of PNP from Schistosoma mansoni. Biochemical and Biophysical Research Communications, v. 322, p. 100-104, 2004.

15.
DIAS, M. V. B.2004DIAS, M. V. B. ; ELY, F. ; CANDURI, F. ; PEREIRA, J. H. ; FRAZZON, J. ; BASSO, L. A. ; PALMA, M. S. ; DE AZEVEDO, W. F. ; SANTOS, D. S. . Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of chorismate synthase from Mycobacterium tuberculosis. Acta Crystallographica. Section D, Biological Crystallography, v. 60, p. 2003-2005, 2004.

16.
PEREIRA, J. H.2003 PEREIRA, J. H.; Canduri, F. ; OLIVEIRA, J. S. ; SILVEIRA, N. J. F. ; BASSO, L. A. ; PALMA, M. S. ; DE AZEVEDO, W. F. ; SANTOS, D. S. . Structural bioinformatics study of EPSP synthase from Mycobacterium tuberculosis. Biochemical and Biophysical Research Communications, v. 312, p. 608-614, 2003.

17.
SANTOS, D. M.2003SANTOS, D. M. ; CANDURI, F. ; PEREIRA, J. H. ; DIAS, M. V. B. ; SILVA, R. G. ; MENDES, M. A. ; PALMA, M. S. ; BASSO, L. A. ; DE AZEVEDO, W. F. ; SANTOS, D. S. . Crystal structure of human purine nucleoside phosphorylase complexed with acyclovir. Biochemical and Biophysical Research Communications, v. 308, p. 553-559, 2003.

18.
DE AZEVEDO, W. F.2003DE AZEVEDO, W. F. ; CANDURI, F. ; SANTOS, D. M. ; PEREIRA, J. H. ; DIAS, M. V. B. ; SILVA, R. G. ; MENDES, M. A. ; BASSO, L. A. ; PALMA, M. S. ; SANTOS, D. S. . Structural basis for inhibition of human PNP by immucillin-H. Biochemical and Biophysical Research Communications, v. 309, p. 922-927, 2003.

19.
DE AZEVEDO, W. F.2003DE AZEVEDO, W. F. ; CANDURI, F. ; SANTOS, D. M. ; PEREIRA, J. H. ; DIAS, M. V. B. ; SILVA, R. G. ; MENDES, M. A. ; BASSO, L. A. ; PALMA, M. S. ; SANTOS, D. S. . Crystal structure of human PNP complexed with guanine. Biochemical and Biophysical Research Communications, v. 312, p. 767-772, 2003.

20.
DE AZEVEDO, W. F.2002 DE AZEVEDO, W. F. ; CANDURI, F. ; OLIVEIRA, J. S. ; PALMA, M. S. ; PEREIRA, J. H. ; SANTOS, D. S. . Molecular model of shikimate kinase from Mycobacterium tuberculosis. Biochemical and Biophysical Research Communications, v. 295, p. 142-148, 2002.

21.
CANDURI, F.2000CANDURI, F. ; DELATORRE, P. ; FADEL, V. ; PEREIRA, J. H. ; OLIVIERI, J. R. ; RUGGIERO NETO, J. ; KONNO, K. ; PALMA, M. S. ; YAMANE, T. ; DE AZEVEDO, W. F. . Crystallization and prelimirary X-Ray diffraction analysis of a eumenine mastoparan toxin. A new class of mast cell degranulating peptide in the wasp venom. Acta Crystallographica. Section D, Biological Crystallography, v. 56, p. 1434-1436, 2000.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
PEREIRA, J. H.. Structural Bioinformatics Study Of Tryptophan Synthase From Mycobacterium tuberculosis. In: XXXIII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2004, Caxambu. Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2004. v. XXXIII.

2.
RODRIGUES, N. C. ; PEREIRA, J. H. ; OLIVEIRA, J. S. ; BASSO, L. A. ; DE AZEVEDO, W. F. ; SANTOS, D. S. . Crystallization and Preliminary X-Ray Diffraction Analysis of I21V Mutant Form of nhA from Mycobacterium tuberculosis. In: XXXIII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2004, Caxambu. Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2004. v. XXXIII.

3.
PEREIRA, J. H.; OLIVEIRA, J. S. ; DIAS, M. V. B. ; BASSO, L. A. ; DE AZEVEDO, W. F. ; SANTOS, D. S. . Crystal structure of Shikimate Kinase complexed with MgADP and shikimic acid from Mycobacterium tuberculosis. In: XXXIII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2004, Caxambu. Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2004. v. XXXIII.

4.
OLIVEIRA, J. S. ; PEREIRA, J. H. ; CANDURI, F. ; BASSO, L. A. ; DE AZEVEDO, W. F. ; SANTOS, D. S. . Crystal Strcuture of an Ioniazid-Resistant Mutant of Enoyl Reductase from Mycobacterium Tuberculosis. In: 14a. Reunião Anual de Usuários LNLS, 2004, Campinas. Reunião Anual de Usuários LNLS, 2004. v. 14. p. 45-45.

5.
DIAS, M. V. B. ; SANTOS, D. M. ; CANDURI, F. ; PEREIRA, J. H. ; DE AZEVEDO, W. F. ; SILVA, R. G. ; BASSO, L. A. ; PALMA, M. S. ; SANTOS, D. S. . Structural Basis doe Inhibition of Human PNP by Immucillin H. In: 14a. Reunião Anual de Usuários LNLS, 2004, Campinas. Reunião Anual de Usuários LNLS, 2004. v. 14. p. 42-42.

6.
PEREIRA, J. H.; OLIVEIRA, J. S. ; DIAS, M. V. B. ; BASSO, L. A. ; DE AZEVEDO, W. F. ; SANTOS, D. S. . Structure of shikimate kinase from Mycobacterium tuberculosis reveals the binding of shikimic acid. In: 1st Latin American Protein Society Meeting, 2004, Angra dos Reis-RJ. Latin American Protein Society Meeting, 2004. v. 1.

7.
PEREIRA, J. H.; ARCURI, H. A. ; CANDURI, F. ; CAMARA JR, J. C. ; SILVEIRA, N. J. F. ; DE AZEVEDO, W. F. . Molecular Model of Shikimate Kinase Isolated from Xylella Fastidiosa. In: XXXII Reunião Annual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2003, Caxambu. Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2003. v. XXXII. p. 261-261.

8.
PEREIRA, J. H.; CANDURI, F. ; PALMA, M. S. ; DE AZEVEDO, W. F. . Molecular Model of Shikimate Kinase from Mycobacterium tuberculosis. In: Workshop on Molecular Modeling in Biophysics - Methods and Applications - Satellite meeting of the 2002 IUPAB International Biophysics Congress, 2002, Rio de Janeiro. Workshop on Molecular Modeling in Biophysics - Methods and Applications - Satellite meeting of the 2002 IUPAB International Biophysics Congress, 2002. p. 25-25.

9.
PEREIRA, J. H.; OLIVEIRA, J. S. ; CANDURI, F. ; BASSO, L. A. ; DE AZEVEDO, W. F. ; SANTOS, D. S. . Molecular model of Dehydroquinate synthase from Mycobacterium tuberculosis. In: I Workshop da Rede Brasileira de Pesquisa em Tuberculose, 2002, Rio de Janeirp. I Workshop da Rede Brasileira de Pesquisa em Tuberculose, 2002.

10.
LORENZI, C. C. B. ; PEREIRA, J. H. ; KONNO, K. ; PALMA, M. S. ; RUGGIERO NETO, J. ; DE AZEVEDO, W. F. . CD Analysis and Molecular Modeling of Anoplin a New Class of Amphiphilic alfa-Helical Peptide from Solitary Wasp Venom. In: XXX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2001, Caxambu. Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2001. v. XXX. p. 204-204.

11.
SANTOS, W. L. C. ; PEREIRA, J. H. ; CANDURI, F. ; DELATORRE, P. ; FADEL, V. ; LORENZI, C. C. B. ; RUGGIERO NETO, J. ; DE AZEVEDO, W. F. . Crystallization of a mastoparan toxin isolated from solitary wasp Anterhynchium flavomarginatum micado. In: XXIX Reunião da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2000, Caxambu. Reunião da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2000. v. XXIX.

12.
PEREIRA, J. H.; CANDURI, F. ; DELATORRE, P. ; FADEL, V. ; LORENZI, C. C. B. ; OLIVIERI, J. R. ; RUGGIERO NETO, J. ; KONNO, K. ; YAMANE, T. ; DE AZEVEDO, W. F. . Crystallization of HR-1 a Synthetic Mastopan Peptide. In: XV Reunião da Sociedade Brasileira de Cristalografia, 2000, Campinas. Sociedade Brasileira de Cristalografia, 2000. v. XV. p. 25-25.

13.
LORENZI, C. C. B. ; CANDURI, F. ; FADEL, V. ; PEREIRA, J. H. ; OLIVIERI, J. R. ; RUGGIERO NETO, J. ; KONNO, K. ; PALMA, M. S. ; YAMANE, T. ; DE AZEVEDO, W. F. . Preliminary Crystallographic Studies of an Eumenine Mastoparan Toxin. In: XV Reunião da Sociedade Brasileira de Cristalografia, 2000, Campinas. Sociedade Brasileira de Cristalografia, 2000. v. XV. p. 24-24.




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