Igor Cesarino

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  • Última atualização do currículo em 23/11/2018


Bacharel e licenciado em Ciências Biológicas pela Universidade Estadual de Campinas (2007). Mestre em Biologia Vegetal pela Universidade Estadual de Campinas (2009) e Doutor em Biologia Vegetal pela Universidade Estadual de Campinas com período sanduíche no Department of Plant Systems Biology - VIB/Universiteit Gent (2012). Entre 2012 e 2014, fez pos-doutorado no Department of Plant Systems Biology - VIB/Universiteit Gent, atuando em projetos de caracterização do metabolismo de lignina em Arabidopsis thaliana e Populus spp. Atualmente é Professor Doutor no Departamento de Botânica da Universidade de São Paulo, com interesse nas bases moleculares do metabolismo de lignina e da deposição de parede celular secundária. Atua nas áreas de Biologia Molecular e Biotecnologia de plantas com foco em Bioenergia e Recalcitrância da Biomassa. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Igor Cesarino
Nome em citações bibliográficas
CESARINO, I.;Cesarino, Igor

Endereço


Endereço Profissional
Universidade de São Paulo, Instituto de Biociências, Departamento de Botânica.
Rua do Matão, 277
Butantã
05508090 - São Paulo, SP - Brasil
Telefone: (11) 30917550
URL da Homepage: http://www.ib.usp.br/departamento/botanica.html


Formação acadêmica/titulação


2009 - 2012
Doutorado em Biologia Vegetal.
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
com período sanduíche em Universiteit Gent (Orientador: Wout Boerjan).
Título: Estudos iniciais de caracterização funcional de peroxidases e laccases envolvidas no processo de lignificação em cana-de-açúcar, Ano de obtenção: 2012.
Orientador: Paulo Mazzafera.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Palavras-chave: Peroxidase; Laccase; Lignina; Cana-de-açúcar.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Metabolismo e Bioenergética.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
2007 - 2009
Mestrado em Biologia Vegetal.
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Título: Clonagem, expressão e caracterização de uma flavina monooxigenase de Coffea arabica,Ano de Obtenção: 2009.
Orientador: Paulo Mazzafera.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Palavras-chave: Flavin-containing monooxygenase; expressão heteróloga; Coffea arabica.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Metabolismo e Bioenergética.
2003 - 2006
Graduação em Ciências Biológicas.
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.


Pós-doutorado


2012 - 2014
Pós-Doutorado.
VIB Department of Plant Systems Biology, PSB/VIB, Bélgica.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Vegetal.


Formação Complementar


2008 - 2008
Treinamento em Eletroforese 2D. (Carga horária: 28h).
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
2007 - 2007
Curso da Rede de Proteoma do Estado de São Paulo. (Carga horária: 24h).
Laboratório Nacional de Luz Síncrotron, LNLS, Brasil.
2007 - 2007
Molecular Mechanisms Controlling Flower Developmen. (Carga horária: 24h).
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.


Atuação Profissional



Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Vínculo institucional

2014 - Atual
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Doutor, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

02/2018 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências, Departamento de Botânica.

Cargo ou função
Membro suplente da Comissão Coordenadora do Programa de Pós-Graduação em Bioenergia (USP, UNESP, UNICAMP).
12/2017 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências, Departamento de Botânica.

Cargo ou função
Membro Titular da Congregação (Categoria Professor Doutor).
04/2017 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências, Departamento de Botânica.

Cargo ou função
Membro Suplente do Conselho Departamental.
04/2017 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências, Departamento de Botânica.

Cargo ou função
Membro Suplente da Comissão Coordenadora do Programa de Pós-Graduação em Botânica.
02/2017 - Atual
Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
BIB0145 - Forma e Função do Metabolismo Vegetal
12/2016 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências, Departamento de Botânica.

Cargo ou função
Membro Titular da Comissão de Relações Internacionais (CRInt) do Instituto de Biociências.
08/2016 - Atual
Ensino, Programa de Pós-Graduação em Botânica, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
BIB5750 - Biotechnology for Biofuels
08/2015 - Atual
Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
BIB0442 - Tópicos em Biotecnologia Vegetal
02/2015 - Atual
Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
BIB0306 - Metabolismo Vegetal e Biotecnologia
10/2014 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Biociências, Departamento de Botânica.

10/2014 - 12/2016
Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
BIB140 - Forma e Função

VIB Department of Plant Systems Biology, PSB/VIB, Bélgica.
Vínculo institucional

2012 - 2014
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Postdoctoral fellow, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.


Universiteit Gent, UGENT, Bélgica.
Vínculo institucional

2011 - 2012
Vínculo: Exchange Student, Enquadramento Funcional: PhD Exchange Student, Regime: Dedicação exclusiva.


Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Vínculo institucional

2009 - 2012
Vínculo: Estudante, Enquadramento Funcional: Estudante de Doutorado, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

2007 - 2012
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Auxiliar Didático, Carga horária: 6

Vínculo institucional

2007 - 2009
Vínculo: Mestrado, Enquadramento Funcional: Estudante, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

2003 - 2006
Vínculo: Graduando, Enquadramento Funcional: Graduando, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

08/2008 - 09/2010
Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
BV680 Fisiologia Vegetal II
08/2008 - 09/2010
Ensino, Engenharia Agrícola (Diurno), Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
BT330 Botânica Básica
03/2007 - 09/2010
Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
BV381 Fisiologia Vegetal Básica (Diurno)
BV780 Fisiologia Vegetal Geral (Noturno)
08/2007 - 11/2007
Ensino, Farmácia (Integral), Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
NV915 Metabolismo Vegetal e Produção de Fitofármacos
03/2006 - 07/2006
Ensino,

Disciplinas ministradas
Ciências para Ensino Fundamental (5ª e 6ª série)
03/2006 - 07/2006
Outras atividades técnico-científicas , Instituto de Biologia, Instituto de Biologia.

Atividade realizada
PAD voluntário da disciplina BV780 - Fisiologia Vegetal Geral (carga horária: 12 horas semanais).

Sociedade Botânica de São Paulo, SBSP, Brasil.
Vínculo institucional

2017 - Atual
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Presidente da Sociedade Botânica de São Paulo, Carga horária: 4



Linhas de pesquisa


1.
Metabolismo de Lignina
2.
Deposição e Engenharia de Parede Celular Secundária
3.
Bioenergia


Projetos de pesquisa


2015 - Atual
Development of model systems in sorghum and a systems biology approach to unravel the molecular mechanisms controlling lignin metabolism in grasses
Descrição: Recently, interest on lignin research has increased significantly since several studies have identified this biopolymer as the main factor responsible for the recalcitrance of cell walls to cellulose-to-glucose conversion for downstream applications, such as the production of biofuels and bio-based materials. Despite recent advances, most of our current knowledge of cell wall formation and lignin metabolism is primarily derived from dicotyledoneous species. However, the molecular mechanisms controlling different aspects of lignin metabolism in grasses, such as transcriptional regulation, biosynthesis and polymerization, remains largely unknown, despite of the economic importance of this group of plants. Therefore, comprehensive and systematic studies are needed to unravel specific characteristics of secondary cell wall formation and lignin metabolism in grasses. The present project aims to develop model systems of sorghum and use them in a systems biology approach based on transcriptomics and metabolomics to correlate changes in cell wall composition with changes in gene expression, with a major focus on lignin and phenolic metabolism. The proposed model systems are: i) the elongating internode system, and ii) inducible cell suspension culture for tracheary element differentiation. Both systems will be characterized for lignin deposition and phenolic profiling and subsequently used in high-throughput transcriptomic analysis using RNAseq. Finally, the transcriptomic data will be used to generate a co-expression network and a database of co-expressed genes, in order to select candidate genes that potentially play a role in secondary cell wall formation and lignin biosynthesis in grasses. The obtained knowledge might be very helpful for future biotechnological strategies to reduce biomass recalcitrance in bioenergy crops, such as sugarcane..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) .
Integrantes: Igor Cesarino - Coordenador / Renato Vicentini - Integrante.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2012 - Atual
Engineering cell wall quality for biofuels
Descrição: It is commonly known that fossil fuels contribute to climate change and that we need to look for more environmentally friendly substitutes. Plant biomass can serve as a renewable and carbon-neutral raw material for the production of bioenergy. Indeed, lignocellulosic plant biomass can be processed into liquid biofuels via the conversion of cell wall polysaccharides, comprising mainly cellulose and hemicelluloses, into fermentable sugars, in a process called saccharification. However, the presence of lignin hampers the saccharification process and, hence, plant biomass needs to be pre-treated to make the polysaccharides accessibly by the enzymes. The pretreatment of biomass is the most costly process in the valorization of biomass to liquid biofuels, and is also an environmentally hazardous process. Lignin is a complex aromatic polymer that provides both structure and rigidity to the cell and waterproofs the cell wall, enabling water transport through the vascular system. From an industrial perspective, engineering plants that either deposit less lignin or produce lignins more amenable to chemical degradation could reduce the amount of energy and chemicals needed in the pretreatment step. Indeed, many studies have reported an improved biomass processing by altering cell wall composition through genetic engineering. However, lignin biosynthesis is a complex process where there is as yet a lot to be discovered. In addition, the outcome of genetic alterations is not always in agreement with the existing knowledge and those modifications often result in perturbations on biochemical processes and pathways other than the target. The first goal of this project is to characterize a pre-selected gene that is highly likely involved in lignin biosynthesis in the model plant Arabidopsis thaliana. The target gene was derived from a systems biology project, carried out within the Bioenergy Group, which covered the metabolome and transcriptome analysis of a set of Arabidopsis mutants, defective in consecutive steps of the lignin biosynthetic pathway. After these analyses, knockout mutants of candidate genes were screened for their saccharification potential and their total amount of lignin, and the target genes were selected for further characterization. The second goal is to use the knowledge gained with Arabidopsis to engineer poplar plants with better saccharification potential. The ultimate goal of the project is, therefore, to perform field trials using the transgenic poplar lines with enhanced cell wall extractability to evaluate their performance in field conditions and determine their potential as improved bioenergy crops. http://multibiopro.eu/.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2011 - 2012
Breeding with rare defective alleles: A natural Populus nigra HCT mutant with modified lignin as a case study
Descrição: · Next generation sequencing in a natural population of Populus nigra revealed a mutant with a premature stop codon in the gene encoding hydroxycinnamoyl-CoA:shikimate hydroxycinnamoyl transferase1 (HCT1), an essential enzyme in lignin biosynthesis. · The lignin composition of P. nigra trees homozygous for the defective allele was compared with that of heterozygous trees and trees without the defective allele. The lignin wascharacterized by phenolic profiling, lignin oligomer sequencing, thioacidolysis and NMR. In addition, HCT1 was heterologously expressed for activity assays and crosses were made to introduce the mutation in different genetic backgrounds. · HCT1 converts p-coumaroyl-CoA into p-coumaroyl shikimate. The mutant allele, PnHCT1-Δ73, encodes a truncated protein and trees homozygous for this recessive allele have a modified lignin composition characterized by a 17-fold increase in p-hydroxyphenyl units. · Using the lignin pathway as proof of concept, we illustrated that next generation EcoTILLING to identify rare defective alleles is a straightforward approach to initiate reverse genetics and accelerate tree breeding. The proposed breeding strategy, called ?Breeding with Rare Defective Alleles? (BRDA), should be widely applicable independent of the target gene or the species..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado: (2) .
Integrantes: Igor Cesarino - Coordenador / Bartel Vanholme - Integrante / Wout Boerjan - Integrante.
2010 - 2012
Estudos iniciais de caracterização funcional de peroxidases e laccases envolvidas no processo de lignificação em cana-de-açúcar
Descrição: A lignina é um heteropolímero complexo depositado principalmente na parede celular secundária de tipos celulares especializados, conferindo força mecânica e rigidez para as plantas se manterem eretas e também proporcionando hidrofobicidade para que células condutoras transportem água e nutrientes por longas distâncias. Embora a lignina seja essencial para o desenvolvimento da planta, este polímero é o principal componente da parede celular responsável pela recalcitrância da biomassa vegetal, sendo que sua presença afeta negativamente o uso do material lignocelulósico para a produção de biocombustíveis e biomateriais. Diversas evidências suportam um papel para peroxidases e laccases no processo de polimerização da lignina. No entanto, identificar genes/isoformas relacionados com o processo de polimerização de lignina e caracterizar seu mecanismo de ação estão entre as tarefas mais desafiadoras acerca do metabolismo deste polímero fenólico. Neste trabalho, uma abordagem técnica abrangente foi aplicada com o objetivo de se identificar potenciais candidatos envolvidos na radicalização oxidativa dos monômeros de lignina. A estratégia envolveu análise de atividade enzimática e o perfil proteômico de peroxidases de classe III durante o desenvolvimento do colmo de cana-de-açúcar; o uso de células em suspensão como ferramenta para isolar e caracterizar peroxidases de classe III potencialmente envolvidas na polimerização de lignina; e a combinação de análises de co-expressão, expressão tecido/tipo celular específica e complementação de um mutante de Arabidopsis thaliana para a caracterização de uma laccase..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado: (2) .
Integrantes: Igor Cesarino - Coordenador / Paulo Mazzafera - Integrante / Pedro - Integrante / Adriana Franco Paes Leme - Integrante / Renato Vicentini - Integrante / Juliana Lischka Sampaio Mayer - Integrante.
2008 - 2010
Proteoma de sementes de café com diferentes qualidades de bebida
Descrição: O café é uma importante fonte de divisas para o país, e no cenário internacional, depois do petróleo, é o commodity que mais movimenta as trocas comerciais. A espécie Coffea arabica responde por cerca de 70% de toda a produção mundial, além de produzir bebida de melhor qualidade. Devido à sua importância e ao fato de se conhecer pouco sobre a influência das proteínas e peptídeos na qualidade da bebida, este projeto inicialmente buscava analisar as diferenças no perfil protéico de amostras de C. arabica convencional e orgânico (ambos variedade Mundo Novo), e ?ruim? (variedade Catuaí Vermelho), utilizando-se como ferramenta a poderosa análise proteômica. Obtendo-se um mapa proteômico destas diferentes variedades, provenientes de localidades distintas, seria possível correlacionar o perfil protéico da semente e os mecanismos que influenciam a qualidade da bebida..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) .
Integrantes: Igor Cesarino - Integrante / Paulo Mazzafera - Coordenador / Marcelo Jun Murai - Integrante.
2007 - 2009
Clonagem, expressão e caracterização de uma flavina monooxigenase de Coffea arabica
Descrição: Em plantas, poucas funções biológicas estão relacionadas com flavina monooxigenases (Flavin-containing monooxygenases - FMOs), embora uma grande quantidade de genes codificantes para este tipo de enzimas seja encontrada nestes organismos. A análise dos genes FMO-like dos três genomas vegetais completamente seqüenciados, somada às recentes caracterizações funcionais de FMOs vegetais, revela que as FMOs de Arabidopsis thaliana, Oryza sativa e Populus trichocharpa se distribuem em três clados, de acordo com suas funções básicas: (i) Clado I, relacionadas com defesa contra patógenos; (ii) Clado II, relacionadas com síntese de auxina; e (iii) Clado III, relacionadas com S-oxigenação de substratos endógenos. A maior parte do conhecimento das características bioquímicas destas enzimas foi gerado por pesquisas com FMOs animais, sendo que a primeira caracterização de uma FMO de origem vegetal foi realizada em 2001. Assim, com o intuito de identificar substratos naturais potenciais, o presente trabalho visa a realização da expressão heteróloga e caracterização funcional in vitro de uma FMO de Coffea arabica, a principal espécie comercial de café..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) .
Integrantes: Igor Cesarino - Integrante / Paulo Mazzafera - Coordenador.
2006 - 2007
Estudo da Expressão de Genes MADS-box durante o Desenvolvimento Floral em Café
Descrição: O estudo visa identificar genes MADS-like no Banco de Dados do Projeto Genoma Café e estudar o padrão de expressão dos genes identificados em diferentes órgãos da planta de café, por meio de PCR semi-quantitativa. Os genes de maior interesse, notadamente os genes homeóticos do padrão ABC que determinam a formação dos órgãos florais, serão estudados por meio da técnica de hibridização in situ..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) .
Integrantes: Igor Cesarino - Integrante / Paulo Mazzafera - Integrante / Dornelas, M.C. - Integrante / Raphael Ricon de Oliveira - Coordenador.
2004 - 2006
Desvendando o metabolismo degradativo de cafeína em plantas de café
Descrição: Todos os compostos envolvidos nas vias de síntese e degradação de cafeína em café já foram elucidados, além da maioria das enzimas participantes. Entretanto, as atividades das enzimas que realizam as demetilações da cafeína até a formação de xantina ainda não foram detectadas. Em animais a demetilação de cafeína é realizada por enzimas do grande grupo dos citocromos P450. A partir desta informação, neste trabalho procuramos levantar evidências de que em café essas reações também são catalisadas por esta classe de enzimas. Para isso, acompanhamos o catabolismo de cafeína em folhas de Coffea dewevrei na presença de inibidores específicos de citocromos P450. Utilizou-se esta espécie de café, pois ela apresenta altas taxas de degradação de cafeína nas folhas, o que conseqüentemente resulta em uma baixa concentração do composto neste órgão. Alguns discos de folha foram infiltrados apenas com cafeína, servindo de controle, enquanto outros foram infiltrados com cafeína juntamente com algum inibidor específico de P450. A partir destes discos, foram feitos extratos metanólicos 24, 48 e 144 horas após a infiltração, que foram submetidos à análise em HPLC. A comparação com o controle mostrou que certos inibidores atrasaram a degradação de cafeína, o que constitui uma forte evidência de que o catabolismo de cafeína em plantas de café também é realizado por um citocromo P450..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) .
Integrantes: Igor Cesarino - Coordenador / Paulo Mazzafera - Integrante.


Membro de corpo editorial


2018 - Atual
Periódico: PLoS One


Revisor de periódico


2012 - Atual
Periódico: Annals of Applied Biology
2013 - Atual
Periódico: Journal of Biotechnology
2013 - Atual
Periódico: Tropical Plant Biology (Online)
2013 - Atual
Periódico: Electronic Journal of Biotechnology
2013 - Atual
Periódico: Bioresources (Raleigh, N.C)
2013 - Atual
Periódico: African Journal of Biotechnology
2013 - Atual
Periódico: African Journal of Agricultural Research
2013 - Atual
Periódico: Cloning and Transgenesis
2013 - Atual
Periódico: BioEnergy Research
2014 - Atual
Periódico: Molecular Plant
2014 - Atual
Periódico: International Journal of Molecular Sciences (Online)
2014 - Atual
Periódico: Bio-protocol
2014 - Atual
Periódico: Plant and Cell Physiology
2015 - Atual
Periódico: Trees (Berlin. Print)
2015 - Atual
Periódico: Brazilian Journal of Botany
2015 - Atual
Periódico: Tree Genetics & Genomes
2016 - Atual
Periódico: Molecular Biology Reports
2016 - Atual
Periódico: Advances in Biology
2016 - Atual
Periódico: Achievements in the Life Sciences
2016 - Atual
Periódico: Acta Physiologiae Plantarum
2016 - Atual
Periódico: Molecular Genetics and Genomics
2016 - Atual
Periódico: Plant Cell Reports
2016 - Atual
Periódico: Planta
2017 - Atual
Periódico: Frontiers in Plant Science
2018 - Atual
Periódico: NEW PHYTOLOGIST (ONLINE)
2018 - Atual
Periódico: CURRENT OPINION IN BIOTECHNOLOGY
2018 - Atual
Periódico: GENE


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Botânica / Subárea: Fisiologia Vegetal.
2.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Metabolismo e Bioenergética.
3.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Vegetal.
4.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.
Italiano
Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.


Prêmios e títulos


2005
Prêmio de Terceiro Colocado na Categoria Molecular no VII Congresso Aberto aos Estudantes de Biologia (CAEB)., UNICAMP.
2003
1º lugar em Ciências Biológicas - Ribeirão Preto do vestibular 2003 da FUVEST - USP., FUVEST - USP.


Produções



Produção bibliográfica
Citações

Web of Science
Total de trabalhos:25
Total de citações:428
Fator H:10
Cesarino, Igor  Data: 06/11/2018

SCOPUS
Total de trabalhos:26
Total de citações:442
Cesarino, I  Data: 31/08/2018

Outras
Total de trabalhos:31
Total de citações:632
Cesarino, I  Data: 23/11/2018

Artigos completos publicados em periódicos

1.
ELOY, NUBIA2017ELOY, NUBIA ; VOOREND, WANNES ; LAN, WU ; SALEME, MARINA DE LYRA SORIANO ; Cesarino, Igor ; VANHOLME, RUBEN ; SMITH, REBECCA A. ; GOEMINNE, GEERT ; PALLIDIS, ANDREAS ; MORREEL, KRIS ; NICOMEDES, JOSÉ ; RALPH, JOHN ; BOERJAN, WOUT A . Silencing CHALCONE SYNTHASE in Maize Impedes the Incorporation of Tricin Into Lignin and Increases Lignin Content. Plant Physiology (Bethesda), v. 173, p. 998-1016, 2017.

2.
STEENACKERS, WARD2017STEENACKERS, WARD ; KLÍMA, PETR ; QUARESHY, MUSSA ; Cesarino, Igor ; KUMPF, ROBERT P. ; CORNEILLIE, SANDER ; Araújo, Pedro ; VIAENE, TOM ; GOEMINNE, GEERT ; NOWACK, MORITZ K. ; LJUNG, KARIN ; FRIML, JI'Í ; BLAKESLEE, JOSHUA J. ; NOVÁK, OND'EJ ; ZA'ÍMALOVÁ, EVA ; NAPIER, RICHARD ; BOERJAN, WOUT ; VANHOLME, BARTEL . cis-Cinnamic Acid Is a Novel, Natural Auxin Efflux Inhibitor That Promotes Lateral Root Formation. PLANT PHYSIOLOGY, v. 173, p. 552-565, 2017.

3.
ÖZPARPUCU, M.2017ÖZPARPUCU, M. ; RÜGGEBERG, M. ; GIERLINGER, N. ; CESARINO, I. ; VANHOLME, R. ; BOERJAN, W. ; BURGERT, I. . Unravelling the impact of lignin on cell wall mechanics - a comprehensive study on young poplar trees downregulated for CINNAMYL ALCOHOL DEHYROGENASE (CAD). PLANT JOURNAL, v. 91, p. 480-490, 2017.

4.
SALEME, MARINA DE LYRA SORIANO2017SALEME, MARINA DE LYRA SORIANO ; Cesarino, Igor ; VARGAS, LÍVIA ; KIM, HOON ; VANHOLME, RUBEN ; GOEMINNE, GEERT ; VAN ACKER, REBECCA ; FONSECA, FERNANDO CAMPOS DE ASSIS ; PALLIDIS, ANDREAS ; VOOREND, WANNES ; NICOMEDES, JOSÉ ; PADMAKSHAN, DHARSHANA ; VAN DOORSSELEARE, JAN ; RALPH, JOHN ; BOERJAN, WOUT A . Silencing CAFFEOYL SHIKIMATE ESTERASE affects lignification and improves saccharification. PLANT PHYSIOLOGY, v. 175, p. pp.00920.2017, 2017.

5.
FIGUEIREDO, R.2016FIGUEIREDO, R. ; Cesarino, Igor ; Mazzafera, Paulo . Suberin as an Extra Barrier to Grass Digestibility: a Closer Look to Sugarcane Forage. Tropical Plant Biology (Print), p. 96-108, 2016.

6.
VARGAS, LÍVIA2016VARGAS, LÍVIA ; Cesarino, Igor ; VANHOLME, RUBEN ; VOOREND, WANNES ; DE LYRA SORIANO SALEME, MARINA ; MORREEL, KRIS ; BOERJAN, WOUT . Improving total saccharification yield of Arabidopsis plants by vessel-specific complementation of caffeoyl shikimate esterase (cse) mutants. Biotechnology for Biofuels, v. 9, p. 139, 2016.

7.
STEENACKERS, WARD JAN2016STEENACKERS, WARD JAN ; Cesarino, Igor ; KLÍMA, PETR ; QUARESHY, MUSSA ; VANHOLME, RUBEN ; CORNEILLIE, SANDER ; KUMPF, ROBERT P. ; VAN DE WOUWER, DORIEN ; LJUNG, KARIN ; GOEMINNE, GEERT ; NOVAK, ONDREJ ; ZA'ÍMALOVÁ, EVA ; NAPIER, RICHARD M. ; BOERJAN, WOUT A ; VANHOLME, BARTEL . The allelochemical MDCA inhibits lignification and affects auxin homeostasis. Plant Physiology (Bethesda), p. pp.01972.2015-874-888, 2016.

8.
Cesarino, Igor2016Cesarino, Igor; SIMÕES, MARCELLA SIQUEIRA ; DOS SANTOS BRITO, MICHAEL ; FANELLI, AMANDA ; DA FRANCA SILVA, TATIANE ; ROMANEL, ELISSON . Building the wall: recent advances in understanding lignin metabolism in grasses. Acta Physiologiae Plantarum, v. 38, p. 269, 2016.

9.
Vicentini, R2015Vicentini, R ; BOTTCHER, A. ; BRITO, M. S. ; BROMBINI, A. ; Creste, S ; LANDELL, M. G. D. A. ; CESARINO, I. ; MAZZAFERA, P. . Large-Scale Transcriptome Analysis of Two Sugarcane Genotypes Contrasting for Lignin Content. Plos One, v. 10, p. e0134909, 2015.

10.
RUPRECHT, C.2014RUPRECHT, C. ; TOHGE, T. ; FERNIE, A. ; MORTIMER, C. L. ; KOZLO, A. ; FRASER, P. D. ; FUNKE, N. ; CESARINO, I. ; VANHOLME, R. ; BOERJAN, W. ; MORREEL, K. ; BURGERT, I. ; GIERLINGER, N. ; BULONE, V. ; SCHNEIDER, V. ; STOCKERO, A. ; NAVARRO, J. P. ; PUDEL, F. ; TAMBUYSER, B. ; HYGATE, J. ; BUMSTEAD, J. ; NOTLEY, L. ; PERSSON, S. . Transcript and Metabolite Profiling for the Evaluation of Tobacco Tree and Poplar as Feedstock for the Bio-based Industry. Journal of Visualized Experiments, p. na-na, 2014.

11.
VANHOLME, B.2014VANHOLME, B. ; VANHOLME, R. ; TURUMTAY, H. ; GOEMINNE, G. ; Cesarino, Igor ; GOUBET, F. ; MORREEL, K. ; RENCORET, J. ; BULONE, V. ; HOOIJMAIJERS, C. ; RYCKE, R. ; GHEYSEN, G. ; RALPH, J. ; BLOCK, M. ; MEULEWAETER, F. ; BOERJAN, W. . Accumulation of GlcNAc oligomers in the plant cell wall affects plant architecture in a dose-dependent and conditional manner. Plant Physiology (Bethesda), p. 290-308, 2014.

12.
OLIVEIRA, R. R.2014OLIVEIRA, R. R. ; CESARINO, I. ; MAZZAFERA, P. ; Dornelas, M.C. . Flower development in Coffea arabica L.: new insights into MADS-box genes. Plant Reproduction, p. n/a-n/a, 2014.

13.
Araújo, Pedro2014Araújo, Pedro ; Cesarino, Igor ; MAYER, JULIANA LISCHKA SAMPAIO ; FERRARI, ILSE FERNANDA ; KIYOTA, EDUARDO ; SAWAYA, ALEXANDRA CHRISTINE HELENA FRANKLAN ; LEME, ADRIANA FRANCO PAES ; Mazzafera, Paulo . A model system to study the lignification process in Eucalyptus globulus. Physiologia Plantarum (Kobenhavn. 1948), v. 152, p. n/a-n/a, 2014.

14.
Cesarino, Igor2013Cesarino, Igor; Araújo, Pedro ; Paes Leme, Adriana Franco ; CRESTE, SILVANA ; Mazzafera, Paulo . Suspension cell culture as a tool for the characterization of class III peroxidases in sugarcane. Plant Physiology and Biochemistry (Paris), v. 62, p. 1-10, 2013.

15.
VANHOLME, B.2013VANHOLME, B. ; Cesarino, Igor ; GOEMINNE, G. ; KIM, H. ; MARRONI, F. ; VAN ACKER, R. ; VANHOLME, R. ; MORREEL, K. ; IVENS, B. ; PINOSIO, S. ; MORGANTE, M. ; RALPH, J. ; BASTIEN, C. ; BOERJAN, W. . Breeding with rare defective alleles (BRDA): a natural HCT mutant with modified lignin as a case study. New Phytologist (Print), v. 198, p. 765-776, 2013.

16.
CESARINO, I.2013 CESARINO, I.; ARAUJO, P. ; SAMPAIO MAYER, J. L. ; VICENTINI, R. ; BERTHET, S. ; DEMEDTS, B. ; VANHOLME, B. ; BOERJAN, W. ; Mazzafera, P. . Expression of SofLAC, a new laccase in sugarcane, restores lignin content but not S:G ratio of Arabidopsis lac17 mutant. Journal of Experimental Botany (Online), v. 64, p. 1769-1781, 2013.

17.
CESARINO, I.2013 CESARINO, I.; VANHOLME, R. ; RATAJ, K. ; XIAO, Y. ; SUNDIN, L. ; GOEMINNE, G. ; KIM, H. ; CROSS, J. ; MORREEL, K. ; ARAUJO, P. ; WELSH, L. ; HAUSTRAETE, J. ; MCCLELLAN, C. ; VANHOLME, B. ; RALPH, J. ; SIMPSON, G. G. ; HALPIN, C. ; BOERJAN, W. . Caffeoyl Shikimate Esterase (CSE) Is an Enzyme in the Lignin Biosynthetic Pathway. Science (New York, N.Y.), v. 341, p. 1103, 2013.

18.
BOTTCHER, A.2013 BOTTCHER, A. ; CESARINO, I. ; BROMBINI DOS SANTOS, A. ; VICENTINI, R. ; MAYER, J. L. S. ; VANHOLME, R. ; MORREEL, K. ; GOEMINNE, G. ; MOURA, J. C. M. S. ; NOBILE, P. M. ; CARMELLO-GUERREIRO, S. M. ; ANTONIO DOS ANJOS, I. ; CRESTE, S. ; BOERJAN, W. ; LANDELL, M. G. D. A. ; MAZZAFERA, P. . Lignification in Sugarcane: Biochemical Characterization, Gene Discovery, and Expression Analysis in Two Genotypes Contrasting for Lignin Content. Plant Physiology (Bethesda), v. 163, p. 1539-1557, 2013.

19.
Araújo, Pedro2013Araújo, Pedro ; Cesarino, Igor ; CARMELLO-GUERREIRO, SANDRA MARIA ; DORNELAS, MARCELO CARNIER . Citrus sinensis L. Osbeck orthologs of FRUITFULL and SHATTERPROOF are differentially expressed during fruit development. Plant Growth Regulation, v. 70, p. 1-13, 2013.

20.
Cesarino, Igor2012Cesarino, Igor; Araújo, Pedro ; Sampaio Mayer, Juliana Lischka ; Paes Leme, Adriana Franco ; Mazzafera, Paulo . Enzymatic activity and proteomic profile of class III peroxidases during sugarcane stem development. Plant Physiology and Biochemistry (Paris), v. 55, p. 66-76, 2012.

21.
CESARINO, I.;Cesarino, Igor2012CESARINO, I.; ARAÚJO, PEDRO ; Domingues Jr, A.P. ; Mazzafera, P. . An overview of lignin metabolism and its effect on biomass recalcitrance. Brazilian Journal of Botany, v. 35, p. 303-311, 2012.

22.
Shimizu, Milton Massao2011Shimizu, Milton Massao ; Melo, Geraldo Aclésio ; Brombini dos Santos, Adriana ; Bottcher, Alexandra ; CESARINO, I. ; Araújo, Pedro ; Moura, Jullyana Cristina Magalhães Silva ; Mazzafera, Paulo . Enzyme characterisation, isolation and cDNA cloning of polyphenol oxidase in the hearts of palm of three commercially important species. Plant Physiology and Biochemistry (Paris), v. 49, p. 970-977, 2011.

23.
Coelho, M. B.2010Coelho, M. B. ; Macedo, M. ; Marangoni, S. ; Silva, D.S. ; CESARINO, I. ; MAZZAFERA, P. . Purification of Legumin-Like Proteins from Coffea arabica and Coffea racemosa Seeds and Their Insecticidal Properties toward Cowpea Weevil (Callosobruchus maculatus) (Coleoptera: Bruchidae). Journal of Agricultural and Food Chemistry, v. 58, p. 3050-3055, 2010.

Capítulos de livros publicados
1.
Cesarino, Igor; Mazzafera, Paulo . Botanical Aspects of the Antioxidant System in Coffee. In: Victor R. Preedy. (Org.). Coffee in Health and Disease Prevention. 1ed.San Diego: Elsevier, 2015, v. , p. 53-60.

2.
CESARINO, I.; MAZZAFERA, P. . Producing a Recombinant Flavin-Containing Monooxygenase from Coffea arabica in Escherichia coli for Screening of Potential Natural Substrates. In: Arthur Germano Fett-Neto. (Org.). Plant Secondary Metabolism Engineering: Methods and Applications. : , 2010, v. 643, p. -.

Resumos expandidos publicados em anais de congressos
1.
CESARINO, I.; MAZZAFERA, P. ; ABREU, I. N. . Catabolismo de Cafeína em Plantas de Café: Evidências da Participação de Citocromo P450.. In: X Congresso Brasileiro de Fisiologia Vegetal/ XII Congresso Latino Americano de Fisiologia Vegetal, 2005, Recife - PE. X Congresso Brasileiro de Fisiologia Vegetal/ XII Congresso Latino Americano de Fisiologia Vegetal, 2005.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
OZPARPUCU, M. ; RUGGEBERG, M. ; GIERLINGER, N. ; CESARINO, I. ; VANHOLME, R. ; BOERJAN, W. ; BURGERT, I. . Micro mechanical and nano structural characterisation of lignin-modified poplar. In: XIV Cell Wall Meeting, 2016, Chania. XIV Cell Wall Meeting, 2016.

2.
VANHOLME, R. ; CESARINO, I. ; MEESTER, B. ; VARGAS, L. ; VRIES, L. ; BOERJAN, W. . Recovery of the cse and crr1 mutant phenotype via vessel-specific complementation. In: XIV Cell Wall Meeting, 2016, Chania. XIV Cell Wall Meeting, 2016.

3.
STEENACKERS, W. ; CESARINO, I. ; KUMPF, R. ; VANHOLME, R. ; CORNELLIE, S. ; QUARESHY, M. ; VAN DE WOUWER, D. ; GRUNEWALD, W. ; ARAUJO, P. ; GOEMINNE, G. ; KLIMA, P. ; NOVAK, O. ; LJUNG, K. ; NAPIER, R. ; ZAZIMALOVA, E. ; VANHOLME, B. ; BOERJAN, W. . The allelochemical 3,4-(methylenedioxy)cinnamic acid (MDCA) inhibits lignification and affects auxin homeostasis in Arabidopsis. In: The International Conference on Arabidopsis Research, 2016, Gyeongju. The International Conference on Arabidopsis Research, 2016.

4.
VARGAS, L. ; CESARINO, I. ; VANHOLME, R. ; VOOREND, W. ; SALEME, M. L. S. ; MORREEL, K. ; BOERJAN, W. . Improving total saccharification yield of Arabidopsis plants by vessel-specific complementation of caffeoyl shikimate esterase (cse) mutants. In: The International Conference on Arabidopsis Research, 2016, Gyeongju. The International Conference on Arabidopsis Research, 2016.

5.
OZPARPUCU, M. ; RUGGEBERG, M. ; GIERLINGER, N. ; CESARINO, I. ; VANHOLME, R. ; BOERJAN, W. ; BURGERT, I. . Micromechanical and structural characterization of genetically modified poplar.. In: 8th Plant Biomechanics International Conference, 2015, Nagoya. 8th Plant Biomechanics International Conference, 2015.

6.
STEENACKERS, W. ; CESARINO, I. ; KUMPF, R. ; VANHOLME, R. ; CORNELLIE, S. ; QUARESHY, M. ; VAN DE WOUWER, D. ; GRUNEWALD, W. ; ARAUJO, P. ; GOEMINNE, G. ; KLIMA, P. ; NOVAK, O. ; LJUNG, K. ; NAPIER, R. ; ZAZIMALOVA, E. ; VANHOLME, B. ; BOERJAN, W. . The allelochemical 3,4-(methylenedioxy)cinnamic acid (MDCA) inhibits lignification and affects auxin homeostasis in Arabidopsis. In: 11th International Congress of Plant Molecular Biology, 2015, Foz do Iguaçu. 11th International Congress of Plant Molecular Biology, 2015.

7.
BOTTCHER, A. ; BROMBINI DOS SANTOS, A. ; CESARINO, I. ; VICENTINI, R. ; MOURA, J. C. M. S. ; Mayer, JLS ; NOBILE, P. M. ; BRITO, M. S. ; Anjos, IA ; Vincentz MGA ; CRESTE, S. ; LANDELL, M. G. D. A. ; MAZZAFERA, P. . A profile of lignin and related gene expression in the stem of two 
sugarcane varieties. In: Plant Biology 2012 American Society of Plant Biology, 2012, Austin. Anais do Plant Biology 2012 American Society of Plant Biology, 2012.

8.
CESARINO, I.; Araújo, Pedro ; Vicentini, R ; Paes Leme, AF ; Anjos, IA ; Creste, S ; Landell, M ; MAZZAFERA, P. . Analysis of enzymatic activity and proteomic profile of class III peroxidases during sugarcane stem development. In: 1st Brazilian Bioenergy Science and Technology Conference, 2011, Campos do Jordão. Proceedings do 1st Brazilian Bioenergy Science and Technology Conference, 2011.

9.
Kiyota, E ; Sawaya, ACHF ; CESARINO, I. ; MAZZAFERA, P. . Comparison of lignins formed in vitro by Peroxidases type I and II. In: 1st Brazilian Bioenergy Science and Technology Conference, 2011, Campos do Jordão. Proceedings do 1st Brazilian Bioenergy Science and Technology Conference, 2011.

10.
Araújo, Pedro ; Cesarino, Igor ; MAZZAFERA, P. . Identification and characterization of class III peroxidases in Eucalyptus globulus. In: 26th New Phytologist Symposium - Bioenergy Trees, 2011, Nancy - France. Annals of the 26th New Phytologist Symposium - Bioenergy Trees, 2011.

11.
Cesarino, Igor; MAZZAFERA, P. ; SOUZA, A. P. ; SARAIVA, A. M. . A divergent YUCCA-like member in coffee. In: Plant Biology 2010, 2010, Montreal - Canada. Plant Biology 2010, 2010.

12.
MAZZAFERA, P. ; CESARINO, I. ; Vicentini, R . Peroxidases in the lignin biosynthesis in sugarcane. In: Plant Biology 2010, 2010, Montreal - Canada. Plant Biology 2010, 2010.

13.
Cesarino, Igor; SARAIVA, A. M. ; SOUZA, A. P. ; Mantovani, S. M. ; Marsaioli, A. J. ; MAZZAFERA, P. . Clonagem, expressão e caracterização de uma flavina monooxigenase (FMO) de Coffea arabica. In: XII Congresso Brasileiro de Fisiologia Vegetal, 2009, Fortaleza. Anais do XII Congresso Brasileiro de Fisiologia Vegetal, 2009.

14.
SHIMIZU, M. M. ; TOMAZ, R. M. A. G. ; Cesarino, Igor ; Brombini dos Santos, Adriana ; MAZZAFERA, P. . Carboidratos e nitrogênio no florescimento de laranjeira. In: 59o Congresso Nacional de Botânica, 2008, Natal. Anais do 59o Congresso Nacional de Botânica, 2008.

15.
SHIMIZU, M. M. ; TOMAZ, R. M. A. G. ; Cesarino, Igor ; Brombini dos Santos, Adriana ; MAZZAFERA, P. . Enzimas do metabolismo de carboidratos e nitrogênio ao longo do dia em laranjeira. In: 59o Congresso Nacional de Botânica, 2008, Natal. Anais do 59o Congresso Nacional de Botânica, 2008.

16.
Cesarino, Igor; SARAIVA, A. M. ; SOUZA, A. P. ; MAZZAFERA, P. . Clonagem e Expressão de uma FMO em Coffea arabica L.. In: 59o Congresso Nacional de Botânica, 2008, Natal. Anais do 59o Congresso Nacional de Botânica, 2008.

17.
CESARINO, I.; MAZZAFERA, P. . Caracterização Inicial do Metabolismo de Cafeína e Outras Metilxantinas em Coffea richardii. In: XI Congresso Brasileiro de Fisiologia Vegetal, 2007, Gramado - RS. Brazilian Journal of Plant Physiology, 2007. v. 19.

18.
Cazoto, J.L. ; Fonseca, T.C. ; CESARINO, I. ; Dornelas, M.C. . Estudo da Expressão Gênica Durante a Reprodução Vegetativa em Bryophyllum (Crassulaceae). In: XI Congresso Brasileiro de Fisiologia Vegetal, 2007, Gramado - RS. Brazilian Journal of Plant Physiology, 2007. v. 19.

19.
CESARINO, I.; MAZZAFERA, P. . Catabolismo de Cafeína em Plantas de Café: Evidências da Participação de Citocromo P450. In: XV Congresso Interno de Iniciação Científica, 2007, Campinas. XV Congresso Interno de Iniciação Científica, 2007.

20.
CESARINO, I.; MAZZAFERA, P. . Desvendando o metabolismo degradativo de cafeína em plantas de café. In: XVI Congresso da Soc. Botânica de São Paulo, 2006, Piracicaba. Resumos do XVI Congresso da Soc. Botânica de São Paulo. São Paulo: Soc. Botânica de São Paulo. v. CD rom.

21.
CESARINO, I.; MAZZAFERA, P. . Catabolismo de cafeína em café. In: XIV Congresso de Iniciação Científica - UNICAMP, 2006, Campinas. Resumos do XIV Congresso de Iniciação Científica - UNICAMP. Campinas: Editora da Unicamp. v. CD rom.

22.
CESARINO, I.; MAZZAFERA, P. ; ABREU, I. N. . Catabolismo de Cafeína em Plantas de Café: Evidências da Participação de Citocromo P450. In: Congresso Aberto aos Estudantes de Biologia, 2005, Campinas. Guia CAEB, 2005.

Apresentações de Trabalho
1.
CESARINO, I.; SARAIVA, A. M. ; SOUZA, A. P. ; Murai, MJ ; Mantovani, S. M. ; Marsaioli, A. J. ; MAZZAFERA, P. . Clonagem, expressão e caracterização de uma flavina monooxigenase (FMO) de Coffea arabica L.. 2009. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

2.
SHIMIZU, M. M. ; TOMAZ, R. M. A. G. ; CESARINO, I. ; BROMBINI, A. ; MAZZAFERA, P. . Carboidratos e Nitrogênio no Florescimento de Laranjeira. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

3.
SHIMIZU, M. M. ; TOMAZ, R. M. A. G. ; BROMBINI, A. ; CESARINO, I. ; MAZZAFERA, P. . Enzimas do Metabolismo de Carboidratos e Nitrogênio ao Longo do Dia em Laranjeira. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

4.
CESARINO, I.; SARAIVA, A. M. ; SOUZA, A. P. ; MAZZAFERA, P. . Clonagem e Expressão de uma FMO em Coffea arabica L.. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

5.
CESARINO, I.; MAZZAFERA, P. . Caracterização Inicial do Metabolismo de Cafeína e Outras Metilxantinas em Coffea richardii. 2007. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

6.
CESARINO, I.; MAZZAFERA, P. . Catabolismo de Cafeína em Plantas de Café: Evidências da Participação de Citocromo P450. 2007. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

7.
CESARINO, I.; MAZZAFERA, P. . Desvendando o Metabolismo Degradativo de Cafeína em Plantas de Café. 2006. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

8.
CESARINO, I.; MAZZAFERA, P. . Catabolismo de Cafeína em Plantas de Café: Evidências da Participação de Citocromo P450. 2006. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

9.
CESARINO, I.; ABREU, I. N. ; MAZZAFERA, P. . Catabolismo de Cafeína em Plantas de Café. 2005. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

Outras produções bibliográficas
1.
CESARINO, I.; VANHOLME, R. ; GOEMINNE, G. ; VANHOLME, B. ; BOERJAN, W. . Shikimate Hydroxycinnamoyl Transferase (HCT) Activity Assays in Populus nigra. Bio-protocol.org, 2013 (Protocolo).



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
AIDAR, M. P. M.; MORAES, R. M.; CESARINO, I.. Participação em banca de Heloisa Bortolin Bruno. Aspectos funcionais do conteúdo de lignina foliar em árvores da Mata Atlântica-SP. 2018. Dissertação (Mestrado em Biodiversidade Vegetal e Meio Ambiente) - Instituto de Botânica.

2.
BUCKERIDGE, M. S.; CESARINO, I.; BRAGA, M. R.; CORETE, A. A. C.. Participação em banca de Débora Pagliuso. Padrões de alocação de carbono estrutural e não estrutural em cinco espécies de lentilhas d'água (:emnaceae). 2018. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

3.
VAN SLUYS, MA; HOTTA, C. T.; COSTA, N. S.; CESARINO, I.. Participação em banca de Vania Gabriela Sedano Partida. Caracterização genômica dos genes S6PP de Saccharum spp. associados no metabolismo da sacarose. 2018. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

Teses de doutorado
1.
VICENTINI, R.; Vincentz MGA; FERREIRA, M. A.; CESARINO, I.; VIANA, A. J. C.. Participação em banca de Leonardo Cardoso Alves. Ritmos diel em cana-de-açúcar: como a expressão de genes relacionados ao metabolismo de carboidratos e os principais metabólitos componentes da parede celular são controlados por fotoperíodos distintos?. 2018. Tese (Doutorado em Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

2.
FURLAN, C. M.; SANTOS, D. Y. A. C.; CESARINO, I.; SARTORELLI, P.; FABI, J. P.. Participação em banca de Fernanda Mendes de Rezende. Chemical analysis of color change and transcriptional profile in flavonoids biosynthesis during flower development of Tibouchina pulcra (Cham.) Cogn.. 2018. Tese (Doutorado em Doutorado em Botânica) - Universidade de São Paulo.

3.
PINNA, G. F. A. M.; MENEZES, N. L.; MASUDA, H. P.; CESARINO, I.; SYLVESTRE, L. S.. Participação em banca de Rafael da Silva Cruz. Desenvolvimento de folhas em samambaias sob a visão contínua de Agnes Arber em morfologia vegetal. 2018. Tese (Doutorado em Doutorado em Botânica) - Universidade de São Paulo.

4.
FLOH, E. I. S.; LABATE, C. A.; VAN SLUYS, MA; SANTA CATARINA, C.; CESARINO, I.. Participação em banca de Bruno Viana Navarro. Marcadores bioquímicos associados ao metabolismo de carboidratos durante a embriogênese zigótica e somática de Araucaria angustifolia (Bertol.) Kuntze. 2018. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

5.
TEIXEIRA, M. M.; CESARINO, I.; SOUZA, A. A.; HOTTA, C. T.; CARNEIRO, M. S.. Participação em banca de Max Seiji Tsunada. Promotores induzidos por seca em raízes de cana-de-açúcar (Saccharum spp.). 2018. Tese (Doutorado em Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

6.
TEIXEIRA, M. M.; SILVEIRA, F. T.; Creste, S; CESARINO, I.; PINO, L. E.. Participação em banca de Danilo Alves Ferreira. O papel do metabolismo no controle e desenvolvimento das gemas axilares de cana-de-açúcar. 2018. Tese (Doutorado em Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

7.
TEIXEIRA, M. M.; CESARINO, I.; MONDEGO, J. M. C.; LABATE, C. A.; SOUZA, H. M. B.. Participação em banca de Camila Pinto da Cunha. Análise Transcriptômica e Fisiológica da Resposta de Cana-de-Açúcar ao Hormônio Etileno Durante a Maturação. 2017. Tese (Doutorado em Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

8.
TEIXEIRA, M. M.; Cesarino, Igor; STEVANI, C. V.; REIS, E. M. R.; HOTTA, C. T.. Participação em banca de Luíza Lane de Barros Dantas. Caracterização do relógio biológico e seu impacto no metabolismo da cana-de-açúcar. 2017. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Universidade de São Paulo.

9.
FLOH, E. I. S.; MARTINELLI, A.; CARRER, H.; CESARINO, I.; FORTES, A. M.. Participação em banca de Leandro Francisco de Oliveira. Metabolismo de poliaminas na embriogênese zigótica e somática de Araucaria angustifolia (Bertol.) Kuntze. 2017. Tese (Doutorado em Doutorado em Botânica) - Universidade de São Paulo.

10.
PINNA, G. F. A. M.; DEMARCO, D.; Cesarino, Igor; ELBL, P. M.; MASUDA, H. P.. Participação em banca de Aline Siqueira Ogura. Desenvolvimento foliar e expressão do ortólogo de ASYMMETRICLEAVES1/ROUGHSHEATH2/PHANTASTICA em Aizoaceae. 2017. Tese (Doutorado em Doutorado em Botânica) - Universidade de São Paulo.

11.
SALATINO, A.; CESARINO, I.; PESTANA, C. M. D.; VILEGAS, W.; SANTOS, W. D.. Participação em banca de Carmen Eusebia Palacios Jara. Efeito do déficit hídrico e CO2 elevado sobre substâncias fenólicas e ligninas do sorgo var. BRS330. 2017. Tese (Doutorado em Doutorado em Botânica) - Universidade de São Paulo.

12.
FRESCHI, L.; CESARINO, I.; FABI, J. P.; SILVEIRA, F. T.; CARRARI, F. O.. Participação em banca de Ricardo Ernesto Bianchetti. Interações entre fitocromos e fitormônios em tomateiro: impactos na fisiologia e qualidade nutricional dos frutos. 2017. Tese (Doutorado em Doutorado em Botânica) - Universidade de São Paulo.

13.
BUCKERIDGE, M. S.; HASHIMOTO, R. F.; NISHIYAMA JUNIOR, M. Y.; MARGARIDO, G. R. A.; CESARINO, I.. Participação em banca de Amanda Rusiska Piovezani. Systems Integration Tool: uma ferramenta para integração e visualização de dados em larga escala e sua aplicação em cana-de-açúcar. 2017. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

14.
Mazzafera, Paulo; HABERMANN, G.; SODEK, L.; RIBEIRO, R. V.; CESARINO, I.. Participação em banca de Adilson Pereira Domingues Junior. Respostas fisiológicas e moleculares de Eucalyptus glóbulos e E. grandes ao estresse por baixas temperaturas. 2016. Tese (Doutorado em Biologia Vegetal) - Universidade Estadual de Campinas.

15.
VEYLDER, L.; BEECKMAN, T.; ZAZIMALOVA, E.; NOVAK, M.; GEELEN, D.; CESARINO, I.. Participação em banca de Ward Steenackers. Phenylpropanoids as plant growth regulators. 2016. Tese (Doutorado em Biochemistry and Biotechnology) - VIB Department of Plant Systems Biology.

16.
ARRUDA, P.; MAIA, I. G.; CESARINO, I.; MONDEGO, J. M. C.; SOUSA, S. M.. Participação em banca de Eduardo Kiyota. Identificação e Caracterização da Enzima Aminoadípico Semialdeído Desidrogenase em Plantas. 2015. Tese (Doutorado em Programa de Pós Graduação em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

17.
BUCKERIDGE, M. S.; CESARINO, I.; BRAGA, M. R.; PURGATTO, E.; VAN SLUYS, MA. Participação em banca de Adriana Grandis. Papel das enzimas de degradação da parede celular na formação do aerênquima em raízes de cana-de-açúcar. 2015. Tese (Doutorado em Doutorado em Botânica) - Universidade de São Paulo.

Qualificações de Doutorado
1.
CARRER, H.; LINHARES, F. S.; CESARINO, I.. Participação em banca de Bruno Rubens Flausino Teixeira. Roots of Sorghum bicolor as a model for understanding the mechanisms related to mixed-linkage glucan hydrolysis during the aerenchyma development. 2018. Exame de qualificação (Doutorando em INTERNACIONAL BIOLOGIA) - Universidade de São Paulo.

2.
Cesarino, Igor; FABI, J. P.; CARVALHO, R. F.. Participação em banca de Frederico Rocha Rodrigues Alves. Manipulação de fitocromos como estratégias de biofortificação de frutos de tomateiro. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Doutorado em Botânica) - Universidade de São Paulo.

3.
CESARINO, I.; CENTENO, D. C.; GASPAR, M.. Participação em banca de Renata Callegari Ferrari. Investigando a compatibilidade entre as fotossínteses C4 e CAM em Portulaca oleracea. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Doutorado em Botânica) - Universidade de São Paulo.

4.
KERBAUY, G. B.; CESARINO, I.; BAENA, M. S. S.. Participação em banca de André Carvalho Lima. Aspectos hormonais e gênicos no desenvolvimento da anatomia lianescente no modelo Bignonia magnifica (Bignoniaceae). 2016. Exame de qualificação (Doutorando em Doutorado em Botânica) - Universidade de São Paulo.

5.
CESARINO, I.; TAVARES, E. Q. P.; ZSOGON, A.. Participação em banca de Daniele Silva Pereira Rosado. Caracterização funcional das proteínas PIF (phytochrome interacting factor) de tomateiro e seu papel na regulação da biossíntese de vitamina E. 2016. Exame de qualificação (Doutorando em Doutorado em Botânica) - Universidade de São Paulo.

6.
FERREIRA, M. J. P.; GASPAR, M.; CESARINO, I.. Participação em banca de Fernanda Mendes de Rezende. Caracterização química da mudança de cor e perfil transcricional de genes da biossíntese de fenilpropanóides e flavonóides durante o desenvolvimento de flores de Tibouchina pulchra (Cham.) Cogn.. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Doutorado em Botânica) - Universidade de São Paulo.

7.
CALDANA, C.; VICENTINI, R.; CESARINO, I.. Participação em banca de Natalia Gomes Vieira. Expressão Diferencial de genes homeólogos em Coffea arabica e identificação de possíveis elementos de regulação transcricional. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

8.
Vincentz MGA; BENEDETTI, C. E.; CESARINO, I.. Participação em banca de Carolina Cassano Monte Bello. Interação entre a via "target of Rapamycin" (TOR) e o metabolismo energético em plantas. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

9.
Vincentz MGA; Novello JC; Cesarino, Igor. Participação em banca de Ilse Fernanda Ferrari. Caracterização Fisiológica e Molecular de Plantas Silenciadas para Possíveis Genes Reguladores da Biossíntese de Cafeína. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Qualificações de Mestrado
1.
CENTENO, D. C.; CESARINO, I.; TEODOROV, E.. Participação em banca de Larissa Batista Seixas. Diversidade da família gênica LEA nas espécies irmãs Setaria italica e Setaria viridis e sua associação à resposta ao estresse hídrico. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Biotecnociência) - Universidade Federal do ABC.

2.
ARAUJO, W. L.; GRANDIS, A.; CESARINO, I.. Participação em banca de Grayce Hellen Romin Silva. O papel da hidrolase de calose (GH17) na formação do aerênquima da cana-de- açúcar. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

3.
ROSSI, M. M.; TINE, M. A. S.; CESARINO, I.. Participação em banca de Arthur Bottacin Cambler. Adaptação do método de fracionamento de parede celular de cana-de-açúcar para análise de um grande número de amostras. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Mestrado em Botânica) - Universidade de São Paulo.

4.
ELBL, P. M.; BUCKERIDGE, M. S.; CESARINO, I.. Participação em banca de Giovanni Victório Cerruti. ELUCIDAÇÃO DOS EFEITOS DA SUPLEMENTAÇÃO DA L-ARGININA NA EMISSÃO DO ÓXIDO NÍTRICO, E PERFIS DE POLIAMINAS E AMINOÁCIDOS DURANTE A PROLIFERAÇÃO E MATURAÇÃO DE EMBRIÕES SOMÁTICOS DO PINHEIRO BRASILEIRO (ARAUCARIA ANGUSTIFOLIA (BERTOL.) KUNTZE). 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

5.
ARAUJO, W. L.; VAN SLUYS, MA; CESARINO, I.. Participação em banca de Débora Pagliuso. Caracterização Comparativa da Parede Celular de Lentilhas D'Água (Lemnaceae). 2017. Exame de qualificação (Mestrando em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

6.
SANTOS JUNIOR, A. R.; SILVA, J. P. N.; CESARINO, I.. Participação em banca de Márcia Gonçalves Dias. Determinação do conteúdo de lignina em colmos de diferentes variedades de cana-de-açúcar. 2017. Exame de qualificação (Mestrando em Biotecnociência) - Universidade Federal do ABC.

7.
CESARINO, I.; ROSSI, M. M.; ELBL, P. M.. Participação em banca de Flaviane Lopes Ferreira. O papel do fator de transcrição ScRAV1 na expressão de genes da parede celular em cana-de-açúcar. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Mestrado em Botânica) - Universidade de São Paulo.

8.
ALCALDE, F. S. C.; FARAH, S. C.; CESARINO, I.. Participação em banca de Vania Gabriela Sedano Partida. Caracterização genômica dos genes s6pp de Saccharum spp, vinculados na produção de sacarose. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Pós-Graduação Interunidades em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

9.
ROMANEL, E. A. C.; CESARINO, I.; FERRAZ, A. L.. Participação em banca de Guilherme Rodriguez Ferraz. Identificação e evolução dos genes da via de biossíntese de lignina em cana-de-açúcar (Saccharum app.) e análise de expressão gênica em genótipos contrastantes de lignina. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Biotecnologia Industrial) - Escola de Engenharia de Lorena (Universidade de São Paulo).

Trabalhos de conclusão de curso de graduação
1.
CORETE, A. A. C.; CESARINO, I.; GONCALVEZ, N.. Participação em banca de Marcella Siqueira Simões.Alterações no conteúdo e localização histológica de lignina de parede celular de Apoclada simplex (Poaceae:Bambusoideae). 2014. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de São Paulo.




Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
III Ciclo de Palestras em Biotecnologia Vegetal.Biotechnological strategies for the optimisation of plant biomass for the biorefinery. 2018. (Outra).

2.
Brazilian Bioenergy Science and Technology Conference 2017. A systems biology approach to study lignification in C4 grasses. 2017. (Congresso).

3.
19a Semana Temática da Biologia.Seleção artificial de plantas: das origens da agricultura à biotecnologia moderna. 2016. (Simpósio).

4.
18a Semana Temática da Biologia.Biotecnologia de Plantas: Conceitos, Aplicações e Impactos. 2015. (Simpósio).

5.
62a Jornada Farmacêutica da Unesp. Plantas Geneticamente Modificadas - Conceitos e Conflitos. 2015. (Congresso).

6.
Brazil Biobased Economy - Autumn School - Special Edition.Model systems in green biotechnology: possibilities and limitations. 2015. (Encontro).

7.
EcoEncontros.An Overview of Lignin Metabolism and its Effect on Biomass Recalcitrance. 2015. (Encontro).

8.
Environmental and metabolic control of plant growth and development.​systems biology approach to unravel the molecular mechanisms controlling lignin metabolism in grasses. 2015. (Encontro).

9.
Strategic Workshops PRP/USP - Bioeconomy. 2015. (Encontro).

10.
Using systems and synthetic biology to tailor plant cell walls for a better future.Lignin Metabolism and Engineering of Plant Cell Walls. 2015. (Encontro).

11.
Workshop Novos Pesquisadores e Expansão das Pesquisas em Bioenergia.Development of Model Systems in Sorghum and a Systems Biology Approach to Unravel the Molecular Mechanisms Controlling Lignin Metabolism in Grasses. 2015. (Encontro).

12.
Plant Biology 2010 - Annual Meeting of the American Society of Plant Biologists. A divergent YUCCA-like member in coffee. 2010. (Congresso).

13.
Plant Biology 2010 - Annual Meeting of the American Society of Plant Biologists. Peroxidases in the lignin biosynthesis in sugarcane. 2010. (Congresso).

14.
XII Congresso Brasileiro de Fisiologia Vegetal. Clonagem, expressão e caracterização de uma flavina monooxigenase (FMO) de Coffea arabica L.. 2009. (Congresso).

15.
59º Congresso Nacional de Botânica. Clonagem e Expressão de uma FMO em Coffea arabica L.. 2008. (Congresso).

16.
XI Congresso Brasileiro de Fisiologia Vegetal. Caracterização Inicial do Metabolismo de Cafeína e Outras Metilxantinas em Coffea richardii. 2007. (Congresso).

17.
XVI Congresso da Soc. Botânica de São Paulo. Desvendando o Metabolismo Degradativo de Cafeína em Café. 2006. (Congresso).

18.
Congresso Aberto aos Estudantes de Biologia. Catabolismo de Cafeína em Plantas de Café: Evidências da Participação de Citocromo P450. 2005. (Congresso).

19.
X Congresso Brasileiro de Fisiologia Vegetal/ XII Congresso Latino Americano de Fisiologia Vegetal. Catabolismo de Cafeína em Plantas de Café: Evidências da Participação de Citocromo P450.. 2005. (Congresso).



Orientações



Orientações e supervisões em andamento
Dissertação de mestrado
1.
Raphael Mendes de Almeida Svartman. Expressão tecido-específica e regulação dos genes envolvidos na biossíntese de tricina em Setaria viridis [(L.) P.Beauv.]. Início: 2018. Dissertação (Mestrado profissional em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo. (Orientador).

Tese de doutorado
1.
Marcella Siqueira Simões. Caracterização funcional de genes que codificam lacases potencialmente envolvidas no processo de lignificação em Setaria viridis (L.) P.Beauv. Início: 2018. Tese (Doutorado em Doutorado em Botânica) - Universidade de São Paulo. (Orientador).

2.
Nathália Volpi e Silva. Ácido clorogênico e sua relação com a biossíntese de lignina. Início: 2014. Tese (Doutorado em Biologia Vegetal) - Universidade Estadual de Campinas. (Coorientador).

Supervisão de pós-doutorado
1.
Sávio de Siqueira Ferreira. Análise do transcriptoma e construção de redes de co-expressão em sistemas modelo para identificação de genes envolvidos na deposição de parede celular secundária e no metabolismo de lignina em gramíneas. Início: 2017. Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo.

Iniciação científica
1.
Gabriel Garon Carvalho. Identificação de peroxidases de classe III potencialmente envolvidas no processo de lignificação em Setaria viridis (L.) P.Beauv.. Início: 2018 - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. (Orientador).

2.
Leydson Gabriel Alves de Lima. Identificação de novos fatores de transcrição que regulam a deposição de parede secundária em gramíneas. Início: 2018 - Universidade de São Paulo. (Orientador).


Orientações e supervisões concluídas
Dissertação de mestrado
1.
Heloísa Bortolin Bruno. Aspectos funcionais do conteúdo de lignina foliar em árvores da Mata Atlântica-SP. 2018. Dissertação (Mestrado em Biodiversidade Vegetal e Meio Ambiente) - Instituto de Botânica, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Coorientador: Igor Cesarino.

2.
Marcella Siqueira Simões. Cultura de células em suspensão como ferramenta para estudos em parede celular secundária em gramíneas C4. 2017. Dissertação (Mestrado em Mestrado em Botânica) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Igor Cesarino.

Tese de doutorado
1.
Jocimar Oliani. Croton urucurana e C. floribundus: Fontes de Flavonoides e Enzimas para a Biocatálise de Acilação. 2015. Tese (Doutorado em Doutorado em Botânica) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Coorientador: Igor Cesarino.

Iniciação científica
1.
Gabriel Garon Carvalho. Identificação de laccases potencialmente envolvidas no processo de lignificação em Setaria viridis. 2017. Iniciação Científica. (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade de São Paulo. Orientador: Igor Cesarino.

2.
André Vicioli de Almeida Pina. Estabelecimento de um sistema de um único entrenó em processo de alongamento como modelo para estudos de deposição de parede celular secundária em sorgo [Sorghum bicolor (L.) Moench]. 2016. Iniciação Científica. (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Igor Cesarino.

3.
Raphael Svartman. Estudos iniciais de caracterização do metabolismo de tricina em sorgo [Sorghum bicolor (L.) Moench]. 2016. Iniciação Científica. (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Igor Cesarino.

Orientações de outra natureza
1.
Lennart Hoengenaert, Kelly van Looveren e Sven Bulterijs. Activation or repression by transcription factors on promoters of the phenylpropanoid pathway. 2013. Orientação de outra natureza - Universiteit Gent. Orientador: Igor Cesarino.



Inovação



Projetos de pesquisa



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