Antonio Sergio Kimus Braz

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  • Última atualização do currículo em 29/10/2018


Possui graduação em Agronomia pela Universidade Federal de Viçosa (1995), mestrado em Fitopatologia pela Universidade Federal de Viçosa (1998) e doutorado em Ciências Biológicas (Genética) pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (2004). Foi Bolsista de Pós Doutorado (CNPq) e posteriormente de ProDoc (CAPES) no Departamento de Genética da UNESP de Botucatu (2005-2008). Atualmente é Professor de Genética Molecular e Genômica na Universidade Federal do ABC . Tem experiência na áreas de Genética molecular vegetal, virologia vegetal, bioinformática, evolução molecular, modelagem molecular e dinâmica molecular. Atuando principalmente nos seguintes temas: Evolução molecular, Modelagem molecular e Biologia Molecular estrutural. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Antonio Sergio Kimus Braz
Nome em citações bibliográficas
BRAZ, A. S. K.;BRAZ, A;Braz, Antônio S. K.;BRAZ, ANTONIO S.K.;BRAZ, ANTÔNIO S.K.;BRAZ, ANTONIO S. K.;BRAZ, ANTÔNIO SÉRGIO KIMUS;KIMUS BRAZ, Antonio Sergio;Kimus BRAZ, Antonio

Endereço


Endereço Profissional
Universidade Federal do ABC, Centro de Ciências Naturais e Humanas.
Rua Santa Adélia, 166
Bangu
09210-170 - Santo Andre, SP - Brasil
Telefone: (14) 49963166
URL da Homepage: http://www.ufabc.edu.br


Formação acadêmica/titulação


1999 - 2004
Doutorado em Ciências Biológicas (Genética).
Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.
Título: Identificação e análise de genes diferencialmente expressos em plantas com silenciamento por RNA, Ano de obtenção: 2004.
Orientador: Rogério Margis.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Palavras-chave: RNA silencing; RNAi; cDNA-AFLP; proteínas supressoras de silenciamento; virus; RNase L inhibitor.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Biologia e Fisiologia dos Microorganismos / Especialidade: Virologia.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular / Especialidade: Expressão de Proteínas Recombinantes.
Setores de atividade: Produção Vegetal.
1996 - 1998
Mestrado em Agronomia (Fitopatologia).
Universidade Federal de Viçosa, UFV, Brasil.
Título: Clonagem e sequenciamento dos genes da capa protéica e da replicase do SAPV, e transformação de maracujazeiro com diferentes construções derivadas desses genes,Ano de Obtenção: 1999.
Orientador: Francisco Murilo Zerbini Júnior.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Palavras-chave: maracujá; virus; transformação genetica; controle; biologia molecular.
Grande área: Ciências Agrárias
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Vegetal / Especialidade: Biologia Molecular Vegetal.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Biologia e Fisiologia dos Microorganismos / Especialidade: Virologia.
Setores de atividade: Produção Vegetal.
1990 - 1995
Graduação em Agronomia.
Universidade Federal de Viçosa, UFV, Brasil.
Título: Seleção de isolados fracos do vírus do endurecimento dos frutos do maracujazeiro (PWV), para premunização do hospedeiro.
Orientador: Prof Murilo Geraldo de Carvalho.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
1987 - 1989
Ensino Médio (2º grau).
Centro Interescolar de Agropecuária José Francisco Lippi, CIAP, Brasil.


Pós-doutorado


2005 - 2005
Pós-Doutorado.
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular / Especialidade: Expressão de Proteínas Recombinantes.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular / Especialidade: Biologia Molecular Estrutural.


Formação Complementar


2006 - 2006
III Escola de Modelagem Molecular Em Sistemas Biol. (Carga horária: 44h).
Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.
2003 - 2003
Bioinformatica Y Modelization Molecular. (Carga horária: 80h).
Iflysib Universidade Nac de La Plata, IFLYSIB_UNLP, Argentina.
2000 - 2000
Metodos Computacionais em Biologia. (Carga horária: 60h).
Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.


Atuação Profissional



Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Vínculo institucional

2010 - 2015
Vínculo: Outro (especifique), Enquadramento Funcional: o professor Adj I, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.


Universidade Federal do ABC, UFABC, Brasil.
Vínculo institucional

2009 - Atual
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto I, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.


Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
Vínculo institucional

2005 - 2008
Vínculo: PRO-DOC, Enquadramento Funcional: Outro, Carga horária: 0
Outras informações
Projeto de Pro-Doc do depto de Genética do IB da UNESP de Botucatu pesquisa e aula para pos-graduação

Atividades

7/2005 - Atual
Ensino, Ciências Biológicas (Genética), Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
topicos especias em genética : Bioinformatica

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais, FAPEMIG, Brasil.
Vínculo institucional

1997 - 1999
Vínculo: Outro, Enquadramento Funcional: , Carga horária: 0



Projetos de pesquisa


2014 - Atual
Estudo da Flexibilidade das Proteínas NS3 e NS5 do Dengue Virus (DENV) através de Análise de Modos Normais e Dinâmica Molecular
Descrição: O presente trabalho tem por objetivo principal identificar, por meio de simulações, movimentos de grande amplitude realizados pelas proteínas NS3 e NS5 codificadas pelo DENV. Esses movimentos normalmente estão relacionados à mobilidade alostérica e desempenham um importante papel nas atividades exercidas por essas proteínas, sejam elas atividades catalíticas (protease, helicase, MTase e RdRp) ou interação de proteínas do hospedeiro (STAT2, TYK 2, KPNB1 e XPO1). Objetivos Específicos: Investigar mudanças conformacionais das proteínas NS3 e NS5 do DENV e seus respectivos domínios, através da análise dos modos normais e da geração de estruturas por meio de DM ao longo dos modos. i) Gerar e selecionar estruturas por meio de DM ao longo da combinação de modos que possam ser usadas para estudos posteriores envolvendo interação proteína-proteína. ii) Verificar se os movimentos e alterações estruturais observadas podem contribuir de alguma forma para o papel catalítico desempenhado pelos domínios protease, helicase, Mtase e RdRp. iii) Verificar se as variações estruturais obtidas por NMA e MD auxiliariam de alguma forma a capacidade de ligação da Proteína NS5 com outras proteínas como a NS3 viral e as proteínas do hospedeiro STAT2, TYK 2, KPNB1 e XPO1 (cujas estruturas estão resolvidas experimentalmente). Para isso, devemos realizar testes de Docking molecular das proteínas alvo com as variações estruturais da NS5 e NS3. iv) Comparar os resultados obtidos com dados de literatura, e procurar/criar hipóteses para explicar os resultados obtidos..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado: (1) .
Integrantes: Antonio Sergio Kimus Braz - Coordenador.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2010 - 2012
Desenvolvimento de metodologia para docking flexível com alterações especificas na estrutura primária. E suas aplicações para estudar interação Proteína-Proteína , Proteína-Ligante e resistência de patógenos a drogas
Descrição: Projeto Bolsa PNPD..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (2) .
Integrantes: Antonio Sergio Kimus Braz - Integrante / SCOTT, L. P. B. - Coordenador.
2008 - Atual
AS PROTEÍNAS DESACOPLADORAS MITOCONDRIAIS E SEUS ASPECTOS FUNCIONAIS EM PLANTAS
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2007 - Atual
ESTUDOS BIOQUÏMICOS E MOLECULARES DA INTERAÇÃO POTYVIRUS/PLANTA
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado: (2) .
Integrantes: Antonio Sergio Kimus Braz - Integrante / Ivan de Godoi Maia - Integrante / Renate Krause Sakate - Coordenador.Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro / COFECUB - Auxílio financeiro.
2005 - Atual
Expressão e análise das propriedades biológicas de proteínas virais supressoras de silenciamento por RNA
Descrição: O silenciamento por RNA é um sistema conservado de resposta a moléculas de RNA dupla fita (dsRNA) presente em todos eucariontes, que desempenha papéis fundamentais como a regulação da expressão gênica e a resistência a vírus e transposons. Nesse sistema, a presença de dsRNAs leva a uma série de eventos que culmina, entre outros efeitos, na degradação seqüência específica de mRNAs homólogos ao dsRNA. Nas plantas, tal mecanismo também desempenha um importante papel na defesa contra vírus. Entretanto, a resposta evolutiva dos vírus foi a de codificar proteínas capazes de suprimir tal sistema de defesa. Alguns exemplos destas proteínas são: HC-Pro (potyvirus) e a AC2 (geminivirus). Estas proteínas atuam desligando o silenciamento de forma distinta e tem como alvo diferentes proteínas vegetais, mas o mecanismo de ação das mesmas continua pouco conhecido. Este projeto tem por objetivo expressar em sistemas heterólogos, purificar e analisar proteínas de origem viral envolvidas na supressão do silenciamento por RNA. Como alvo serão utilizadas as proteínas supressoras HC-Pro e AC2. As proteínas purificadas serão analisadas quanto à qualidade de suas estruturas e propriedades biológicas. Pretende-se desta maneira disponibilizar grandes quantidades dessas proteínas puras e ativas visando estudos futuros de estrutura função..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Antonio Sergio Kimus Braz - Integrante / Ivan de Godoi Maia - Coordenador.Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.
1997 - 1999
Clonagem e sequenciamento dos genes da capa protéica e da replicase do SAPV, e transformação de maracujazeiro com diferentes construções derivadas desses genes.
Descrição: Obtenção e plantas trangenicas de maracujazeiro resistentes aos virus causadores do endurecimento dos frutos, através de insernação de porções de genes virais no genoma da planta.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Antonio Sergio Kimus Braz - Coordenador.


Revisor de periódico


2006 - Atual
Periódico: Fitopatologia Brasileira
2006 - Atual
Periódico: Genetics and Molecular Biology


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Bioinformatica/Especialidade: Modelagem Molecular.
2.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular/Especialidade: Evolução Molecular.
3.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Biologia e Fisiologia dos Microorganismos/Especialidade: Virologia.
4.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: genômica comparativa.
5.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Biologia Molecular Estrutural.


Idiomas


Inglês
Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.
Espanhol
Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Bem, Escreve Pouco.


Produções



Produção bibliográfica
Citações

SCOPUS

Artigos completos publicados em periódicos

1.
BIZOTTO, FERNANDA M.2018BIZOTTO, FERNANDA M. ; CERATTI, RENAN S. ; BRAZ, ANTONIO S.K. ; MASUDA, HANA PAULA . Evolutionary history of Mo25 gene in plants, a component of RAM/MOR signaling network. MECHANISMS OF DEVELOPMENT, v. 153, p. 64-73, 2018.

2.
LIMA, ANGELICA NAKAGAWA2018LIMA, ANGELICA NAKAGAWA ; DE OLIVEIRA, RONALDO JUNIO ; BRAZ, ANTÔNIO SÉRGIO KIMUS ; DE SOUZA COSTA, MAURÍCIO GARCIA ; PERAHIA, DAVID ; SCOTT, LUIS PAULO BARBOUR . Effects of pH and aggregation in the human prion conversion into scrapie form: a study using molecular dynamics with excited normal modes. EUROPEAN BIOPHYSICS JOURNAL WITH BIOPHYSICS LETTERS, v. 47, p. 583-590, 2018.

3.
STANGHERLIN, LUCAS M.2017STANGHERLIN, LUCAS M. ; DE PAULA, FELIPE N. ; ICIMOTO, MARCELO Y. ; RUIZ, LEONARDO G. P. ; NOGUEIRA, MAURÍCIO L. ; Braz, Antônio S. K. ; JULIANO, LUIZ ; DA SILVA, MARIA C. C. . Positively Selected Sites at HCMV gB Furin Processing Region and Their Effects in Cleavage Efficiency. Frontiers in Microbiology, v. 8, p. 1-10, 2017.

4.
MEISSNER, GABRIEL OTTO2016MEISSNER, GABRIEL OTTO ; DE RESENDE LARA, PEDRO TÚLIO ; SCOTT, LUIS PAULO BARBOUR ; BRAZ, ANTÔNIO SÉRGIO KIMUS ; CHAVES-MOREIRA, DANIELE ; MATSUBARA, FERNANDO HITOMI ; SOARES, EDUARDO MENDONÇA ; TREVISAN-SILVA, DILZA ; GREMSKI, LUIZA HELENA ; VEIGA, SILVIO. SANCHES ; CHAIM, OLGA MEIRI . Molecular cloning and in silico characterization of knottin peptide, U2-SCRTX-Lit2, from brown spider (Loxosceles intermedia) venom glands. Journal of Molecular Modeling (Print), v. 22, p. 196, 2016.

5.
GERALDO, MARCOS TADEU2016GERALDO, MARCOS TADEU ; TAKEDA, Agnes Alessandra Sekijima ; BRAZ, ANTÔNIO SÉRGIO KIMUS ; LEMKE, NEY . Bending-Twisting Motions and Main Interactions in Nucleoplasmin Nuclear Import. Plos One, v. 11, p. e0157162, 2016.

6.
PHILOT, ERIC ALLISON2016PHILOT, ERIC ALLISON ; DA MATA LOPES, DAVID ; DE SOUZA, ARYANE TOFANELLO ; BRAZ, ANTÔNIO SÉRGIO KIMUS ; NANTES, ISELI LOURENÇO ; RODRIGUES, TIAGO ; PERAHIA, DAVID ; MITEVA, MARIA A. ; SCOTT, LUIS PAULO BARBOUR . Binding of phenothiazines into allosteric hydrophobic pocket of human thioredoxin 1. European Biophysics Journal, v. 45, p. 279-286, 2016.

7.
SOARES, RENAN C.2016SOARES, RENAN C. ; CAMARGO-PENNA, PEDRO H. ; DE MORAES, VANESSA C. S. ; DE VECCHI, RODRIGO ; CLAVAUD, CÉCILE ; BRETON, LIONEL ; BRAZ, ANTONIO S. K. ; PAULINO, LUCIANA C. . Dysbiotic Bacterial and Fungal Communities Not Restricted to Clinically Affected Skin Sites in Dandruff. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, v. 6, p. 157, 2016.

8.
DE CONTO, VALDERES2015DE CONTO, VALDERES ; BRAZ, ANTÔNIO S.K. ; PERAHIA, DAVID ; SCOTT, LUIS P.B. . Recovery of the wild type atomic flexibility in the HIV-1 protease double mutants. Journal of Molecular Graphics & Modelling, v. 59, p. 107-116, 2015.

9.
YU, NA2015YU, NA ; ZOTTI, MOISES JOÃO ; SCHEYS, FREJA ; Braz, Antônio S. K. ; PENNA, PEDRO H. C. ; NACHMAN, RONALD J. ; SMAGGHE, GUY . Flexibility and extracellular opening determine the interaction between ligands and insect sulfakinin receptors. Scientific Reports, v. 5, p. 12627, 2015.

10.
MONTEIRO NASCIMENTO, MONICA2015MONTEIRO NASCIMENTO, MONICA ; SANTOS AKKARI, ALESSANDRA ; FREITAS MARIANO, KELLY ; Kimus BRAZ, Antonio ; LOMBELLO, CHRISTIANE ; DE ARAUJO, DANIELE . Cyclodextrin-Based Delivery Systems for Arthritic Diseases: From Development to Experimental Therapeutics. Current Pharmaceutical Design (Print), v. 21, p. 4907-4916, 2015.

11.
DA SILVA, VIVIAM M.2014DA SILVA, VIVIAM M. ; COLUSSI, FRANCIELI ; DE OLIVEIRA NETO, MARIO ; BRAZ, ANTONIO S. K. ; SQUINA, FABIO M. ; OLIVEIRA, CRISTIANO L. P. ; GARCIA, WANIUS . Modular Hyperthermostable Bacterial Endo-β-1,4-Mannanase: Molecular Shape, Flexibility and Temperature-Dependent Conformational Changes. Plos One, v. 9, p. e92996, 2014.

12.
GERALDO, M. T.2013GERALDO, M. T. ; VALENTE, G. T. ; BRAZ, A. S. K. ; MARTINS, C. . The discovery of Foxl2 paralogs in chondrichthyan, coelacanth and tetrapod genomes reveals an ancient duplication in vertebrates.. Heredity (Edinburgh. Print), v. 111, p. 57-65, 2013.

13.
PHILOT, E. A.2013PHILOT, E. A. ; PERAHIA, D. ; BRAZ, A. S. K. ; COSTA, M. S. ; SCOTT, L. P. B. . Binding sites and hydrophobic pockets in Human Thioredoxin 1 determined by normal mode analysis. Journal of Structural Biology (Print), v. 184, p. 293-300, 2013.

14.
ZOTTI, MOISÉS J.2013ZOTTI, MOISÉS J. ; GEYTER, ELLEN DE ; SWEVERS, LUC ; BRAZ, ANTÔNIO S.K. ; SCOTT, LUIS P.B. ; ROUGÉ, PIERRE ; COLL, JOSEP ; GRUTZMACHER, ANDERSON D. ; LENARDÃO, EDER J. ; SMAGGHE, GUY . A cell-based reporter assay for screening for EcR agonist/antagonist activity of natural ecdysteroids in Lepidoptera (Bm5) and Diptera (S2) cell cultures, followed by modeling of ecdysteroid-EcR interactions and normal mode analysis. Pesticide Biochemistry and Physiology, v. 107, p. 309-320, 2013.

15.
BRAZ, A. S. K.2012 BRAZ, A. S. K.; TUFANETTO, P. ; PERAHIA, D. ; SCOTT, L. P. B. . Relation between flexibility and positively selected HIV-1 protease mutants against inhibitors. Proteins (Print), v. 80, p. 2680-2691, 2012.

16.
LIMA, A. N.2012LIMA, A. N. ; PHILOT, E. A. ; PERAHIA, D. ; BRAZ, A. S. K. ; SCOTT, L. P. B. . GANM: A protein ligand docking approach based on genetic algorithm and normal modes. Applied Mathematics and Computation, v. 219, p. 511-520, 2012.

17.
ANTONANGELO, ANA TERESA B.F.2012ANTONANGELO, ANA TERESA B.F. ; COLOMBI, DÉBORA ; CURI, ROGÉRIO A. ; BRAZ, ANTONIO S.K. ; OLIVEIRA, TRÍCIA M. ; MOTA, LÍGIA S.L.S. DA . Detection and quantification of Duffy antigen on bovine red blood cell membranes using a polyclonal antibody. Pesquisa Veterinária Brasileira (Impresso), v. 32, p. 936-940, 2012.

18.
dos Santos, Juliana I.2010dos Santos, Juliana I. ; Cintra-Francischinelli, Mariana ; Borges, Rafael J. ; Fernandes, Carlos A. H. ; Pizzo, Paola ; Cintra, Adélia C. O. ; Braz, Antonio S. K. ; BRAZ, A. S. K. ; Soares, Andreimar M. ; Fontes, Marcos R. M. . Structural, functional, and bioinformatics studies reveal a new snake venom homologue phospholipase A2 class. Proteins (Print), v. 79, p. 61-78, 2010.

19.
Coscrato, Virginia E.2009Coscrato, Virginia E. ; Braz, Antônio S. K. ; Perondini, André L. ; SELIVON, Denise ; Marino, Celso L. . Wolbachia in Anastrepha Fruit Flies (Diptera: Tephritidae). Current Microbiology (Print), v. 59, p. 295-301, 2009.

20.
) Sant'Ana CD2008) Sant'Ana CD ; Bernardes CP ; Izidoro LF ; MAZZI, Maurício ; SOARES, Andreimar M ; FULY, André L ; Zingali RB ; MAGRO, Angelo José ; BRAZ, A. S. K. ; Fontes M R M ; STÁBELI, Rodrigo ; SAMPAIO, Suely . Molecular characterization of BjussuSP-I, a new thrombin-like enzyme with procoagulant and kallikrein-like activity isolated from Bothrops jararacussu snake venom. Biochimie (Paris), v. 90, p. 500-507, 2008.

21.
RODRIGUES, R2008RODRIGUES, R ; DASILVA, J ; BOLDRINIFRANCA, J ; FONSECA, F ; OTAVIANO, A ; HENRIQUESILVA, F ; HAMAGUCHI, A ; MAGRO, A ; BRAZ, A. S. K. ; DOSSANTOS, J . Structural and functional properties of Bp-LAAO, a new l-amino acid oxidase isolated from Bothrops pauloensis snake venom. Biochimie (Paris), p. 1, 2008.

22.
MAZZI, Maurício2007MAZZI, Maurício ; MAGRO, Angelo José ; OLIVEIRA, Clayton Z ; AMUI, Saulo F ; TICHI, Fábio K ; STÁBELI, Rodrigo ; FULY, André L ; BRAZ, A. S. K. ; FONTES, M. R. M ; SAMPAIO, Suely ; SOARES, Andreimar M . Molecular Characterization and Phylogenetic Analysis of BjussuMP-I: a RGD-P-III class hemorrhagic metalloprotease from Bothrops jararacussu snake venom. Journal of Molecular Graphics & Modelling, v. 26, p. 69-85, 2007.

23.
Marcussi S2007Marcussi S ; Bernardes CP ; Santos-Filho NA ; MAZZI, Maurício ; OLIVEIRA, Clayton Z ; Izidoro LF ; FULY, André L ; MAGRO, Angelo José ; BRAZ, A. S. K. ; Giglio JR ; Soares A M . Molecular and functional characterization of a new non-hemorrhagic metalloprotease from Bothrops jararacussu snake venom with antiplatelet activity. Peptides (New York), v. 28, p. 2328-2339, 2007.

24.
NASCIMENTO, A.V.S2006NASCIMENTO, A.V.S ; SANTANA, e N ; BRAZ, A. S. K. ; ALFENAS, P.A. ; PIO-RIBEIRO, G. ; Andrade G P ; CARVALHO, M.G. ; ZERBINI, F.M . Cowpea aphid-borne mosaic virus (CABMV) is widespread in passionfruit in Brazil and causes passionfruit woodiness disease. Archives of Virology, v. 9, p. 1797-1809, 2006.

25.
ALFENAS, P F2005 ALFENAS, P F ; BRAZ, A. S. K. ; TORRES, L.B. ; SANTANA, e N ; NASCIMENTO, Avs ; OTONI, W C ; ZERBINI . Transgenic passionfruit (Passiflora edulis f. flavicarpa) expressing an RNA derived from Cowpea aphid-borne mosaic virus (CABMV) are resistant to passionfruit woodiness. Fitopatologia Brasileira, v. 30, p. 33-38, 2005.

26.
BRAZ, A. S. K.;BRAZ, A;Braz, Antônio S. K.;BRAZ, ANTONIO S.K.;BRAZ, ANTÔNIO S.K.;BRAZ, ANTONIO S. K.;BRAZ, ANTÔNIO SÉRGIO KIMUS;KIMUS BRAZ, Antonio Sergio;Kimus BRAZ, Antonio2004 BRAZ, A. S. K.; FINNEGAN, Jean ; WATERHOUSE, Peter ; MARGIS, Rogério . A plant orthologue of RNase L Inhibitor (RLI) is induced in plants showing RNA interference.. Journal of Molecular Evolution, Verlag New York, v. 59, n.1, p. 20-30, 2004.

Capítulos de livros publicados
1.
ZERBINI, F.M ; NASCIMENTO, A.V.S ; ALFENAS, P.A. ; TORRES, L.B ; BRAZ, A. S. K. ; SANTANA, E.N ; OTONI, W.C . Transformação genética do maracujazeiro para resistência a doenças. In: F G Faleiro; N T V Junqueira; M F Braga. (Org.). Maracujá - Germoplasma e Melhoramento Genético. Planaltina: EMBRAPA, 2005, v. , p. 589-600.

Resumos expandidos publicados em anais de congressos
1.
Fernandes CAH ; BRAZ, A. S. K. ; Soares A M ; Fontes M R M . Structural and evolutionary inferences of snake venom serine proteases. In: X MEETING, 2007, São Paulo. X MEETING, 2007.

2.
MAGRO, Angelo José ; BRAZ, A. S. K. ; Soares A M ; FONTES, M. R. M . Structural and phylogenetic studies with a theoretical model of the BjussuMP-I, a metalloprotease isolated from the Bothrops jararacussu venom. In: 14th ANNUAL MEETING OF THE INTERNATIONAL SOCIETY FOR COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2006, Fortaleza, CE. CONFERENCE PROCEEDINGS OF 14th ANNUAL MEETING OF THE INTERNATIONAL SOCIETY FOR COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2007, Fortaleza. 14th ANNUAL MEETING OF THE INTERNATIONAL SOCIETY FOR COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2006, Fortaleza, CE. CONFERENCE PROCEEDINGS OF 14th ANNUAL MEETING OF THE INTERNATIONAL SOCIETY FOR COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2006.

3.
BRAZ, A. S. K.; MAIA, Ivan . Molecular dynamic and structural analysis from the ab initio model of HC-Pro, a plant virus multifunctional protein. In: 14th ANNUAL MEETING OF THE INTERNATIONAL SOCIETY FOR COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2006, FORTALEZA, CE. CONFERENCE PROCEEDINGS OF 14th ANNUAL MEETING OF THE INTERNATIONAL SOCIETY FOR COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2006, Fortaleza. 14th ANNUAL MEETING OF THE INTERNATIONAL SOCIETY FOR COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2006, FORTALEZA, CE. CONFERENCE PROCEEDINGS OF 14th ANNUAL MEETING OF THE INTERNATIONAL SOCIETY FOR COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2006.

4.
BRAZ, A. S. K.; MAIA, Ivan . Evolutionary inferences from the amino acid sequence of HC-Pro, a plant virus multifunctional protein. In: In: 14th ANNUAL MEETING OF THE INTERNATIONAL SOCIETY FOR COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2006, Fortaleza, CE. CONFERENCE PROCEEDINGS OF 14th ANNUAL MEETING OF THE INTERNATIONAL SOCIETY FOR COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2006, Fortaleza. In: 14th ANNUAL MEETING OF THE INTERNATIONAL SOCIETY FOR COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2006, Fortaleza, CE. CONFERENCE PROCEEDINGS OF 14th ANNUAL MEETING OF THE INTERNATIONAL SOCIETY FOR COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2006.

5.
TAKEDA, Agnes Alessandra Sekijima ; BRAZ, A. S. K. ; KOBE, Bostjan ; Fontes M R M . Structural and Evolutionary analysis of Importin-alpha and its interaction with the nuclear localization sequence peptides. In: In: 14th ANNUAL MEETING OF THE INTERNATIONAL SOCIETY FOR COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2006, Fortaleza, CE. CONFERENCE PROCEEDINGS OF 14th ANNUAL MEETING OF THE INTERNATIONAL SOCIETY FOR COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2006, Fortaleza. In: 14th ANNUAL MEETING OF THE INTERNATIONAL SOCIETY FOR COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2006, Fortaleza, CE. CONFERENCE PROCEEDINGS OF 14th ANNUAL MEETING OF THE INTERNATIONAL SOCIETY FOR COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2006.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
COSCRATO, V. E. ; BRAZ, A. S. K. ; MARCON, Helena Sanchez ; MARINO, Celso Luís ; PERONDINI, Andre . Evidence Of Single Nucleotide Polymorphisms (SNP) In Clones Of Wolbachia Wsp Gene From Anastrepha Sororcula (Diptera: Tephritidae).?. In: PLANT & ANIMAL GENOMES XV CONFERENCE, 2007, San Diego-CA. PLANT & ANIMAL GENOMES XV, 2007, San Diego. PLANT & ANIMAL GENOMES XV CONFERENCE, 2007, San Diego-CA. PLANT & ANIMAL GENOMES XV, 2007.

2.
ALFENAS, P.A. ; BRAZ, A. S. K. ; MAIA, Ivan ; ZERBINI, F.M . The Role of Translationally controlled tumor protein (TCTP) induction during the initial steps of tomato infection by a Potyvirus. In: XVIII NATIONAL MEETING OF VIROLOGY,, 2007, Armação dos Búzios. XVIII NATIONAL MEETING OF VIROLOGY, 2007.

3.
HOSHINO, Andrea A ; BRAZ, A. S. K. ; MAIA, Ivan de Godoi ; Marcos A. G . Preliminary characterization of lipid transfer genes in sugarcane. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 2007, Natal. SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 2007.

4.
BRAZ, A. S. K.; FINNEGAN, Jean ; WATERHOUSE, Peter ; MARGIS, Rogério . A plant orthologue of RNAseL inhibitor (RLI) is induced in plants showing RNA interference. In: XXXIII Reunião da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2004, Caxambu, 2004.

5.
VASLIN, M F S ; BRAZ, A. S. K. ; MARGIS, Rogério . Host Genes involved in post-transacriptional gene silencing. In: XIII Encontro Nacional de Virologia, 2002, Águas de Lindóia, 2002.

6.
BRAZ, A. S. K.; VASLIN, M F S ; ROJAS, C. ; CORREA, R.L ; MARGIS, Rogério . Post-transcriptional gne silencing (PTGS): identification of putative gene involved by. In: XIII Encontro Nacional de Virologia, 2002, Águas de Lindóia, 2002.

7.
NASCIMENTO, A.V.S ; SOUZA, A.R.R ; SANTANA, E.N. ; BRAZ, A. S. K. ; PIO-RIBEIRO, G. ; ZERBINI, F.M . Cowpea aphid-borne mosaic virus (CABMV) is widespread in passionfruit in Brazil and causes passionfruit woodiness. In: XIII Encontro Nacional de Virologia, 2002, Águas de Lindóia, 2002.

8.
ALFENAS, P.A. ; TORRES, L.B ; BRAZ, A. S. K. ; OTONI, W.C ; ZERBINI, F.M . Resistance of trangenic passionfruit (Pasiflora edulis f. flavicarpa) transformed with a construct derived from genome of PWV ( passion fruit woodiness virus) to two isolades of pathogen. In: Resistance of trangenic passionfruit (Pasiflora edulis f. flavicarpa) transformed with a construct derived from genome of PWV ( passion fruit woodiness virus) to two isolades of pathogen, 2002, Águas de Lindóia, 2002.

9.
GOMES, L.L ; BRAZ, A. S. K. ; ZERBINI, F.M ; M.F.S., Vaslin ; MARGIS, R. . Virus resistance in transgenic plants through homology-dependent gene silencing is abolished by previous infection with an unrelated virus. In: XIII Encontro Nacional de Virologia, 2002, Águas de Lindóia, 2002.

10.
BRAZ, A. S. K.; ROJAS, C ; CORRÊA, R.L ; VASLIN, M.F.S ; MARGIS, R. . Isolation of gene fragments differentially expressed in transgenic tobacco with post-transcriptional gene silencing (PTGS) by cDNA-AFLP. In: XXX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular SBBq, 2001, Caxambu, 2001.

11.
LASSANCE, L ; BRAZ, A. S. K. ; VASLIN, M.F.S ; MARGIS, R. . Supression of PTGS and Andean potato mottle virus (APMoV) resistance in transgenic tobacco mediated by potato virus Y (PVY). In: XXX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular SBBq, 19 a 22 de maio de 2001 em Caxambu-MG, 2001.

12.
BRAZ, A. S. K.; ROJAS, C ; CORRÊA, R.L ; VASLIN, M.F.S ; MARGIS, R . Cloning of differentially expressed genes in post-transcriptional gene silencing by cDNA-AFLP. In: 3° Encontro de Virologia do Mercosul, 2000, São Lourenço-MG, 2000.

13.
BRAZ, A. S. K.; ROJAS, C ; CORRÊA, R.L ; VASLIN, M.F.S ; MARGIS, R . Isolation of genes involved on plant post-transcriptional gene silencing (PTGS) by cDNA-AFLP. In: 46º Congresso Nacional de Genética, 2000, Águas de Lindóia, 2000.

14.
BRAZ, A. S. K.; VASLIN, M F S ; CORRÊA, L R ; ROJAS, C ; MARGIS, R . Isolation of genes involved on plant Post-transcriptional gene silencing (PTGS) by cDNA-AFLP. In: XXIX REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE BIOQUÍMICA E BIOLOGIA MOLECULAR SBBQ, 2000, Caxambu, 2000.

15.
SANTANA, E.N ; BRAZ, A. S. K. ; TORRES, L.B ; MACIEL-ZAMBOLIM, E. ; ZERBINI, F.M . Molecular characterization of Potyvirus isolates causing passionfruit woodiness in Brazil. In: X Encontro Nacional de Virologia da Sociedade Brasileira de Virologia-SBV, 1999, Curitiba, 1999.

16.
BRAZ, A. S. K.; SANTANA, E.N ; COSTA, A..F ; MACIEL-ZAMBOLIM, E ; ZERBINI, F.M . Molecular characterization of to isolates of south african passiflora virus infecting passionfruit in Brazil.. In: IX Encontro Nacional de Virologia da Sociedade Brasileira de Virologia-SBV, 1998, São Lourenço, 1998.

17.
BRAZ, A. S. K.; OTONI, W.C. ; SANTANA, E.N ; MACIEL-ZAMBOLIM, E ; ZERBINI, F.M . Transformation of passionfruit (Passiflora edulis fv. Flavicarpa) with sequences derived from the NIb and CP genes of South African Passiflora Virus(SAPV).. In: IX Encontro Nacional de Virologia da Sociedade Brasileira de Virologia-SBV, 1998, São Lourenço, 1998.

18.
BRAZ, A. S. K.. Partial host range of TGV-Ub, a new tomato-infecting Geminivirus from Uberlândia, MG. In: XXX Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 1997, Poços de Caldas, 1997.

19.
KRAUSE, R ; FERNANDES, J.J. ; BRAZ, A. S. K. ; FONTES, E.P.B ; ZERBINI, F.M . Two tomato-infecting Geminiviruses from Minas Gerias state are sap-transmissible to Nicotiana benthamiana. In: XXX Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 1997, Poços de Caldas, 1997.

20.
BRAZ, A. S. K.; BOARI, A.C ; CARVALHO, M.G . Potyvirus em Kalanchoe sp. In: XXIX Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 1996, Campo grande, 1996.

21.
COSTA, A.F ; BRAZ, A. S. K. ; CARVALHO, M.G. . Transmissão do vírus do endurecimento dos frutos do maracujazeiro (VEFM) por afídeos (Hemiptera Aphididae). In: XXVIII Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 1995, Ilhéus Bahia, 1995.

22.
BRAZ, A. S. K.; COSTA, A.F ; CARVALHO, M.G . Seleção de isolados fracos do vírus do endurecimento dos frutos do Maracujázeiro(VEFM), para uso na premunização. In: IV Simpósio de Iniciação Científica na UFV, 1994, Viçosa, 1994.

Apresentações de Trabalho
1.
BRAZ, A. S. K.. Silenciamento por RNA: mecanismos e aplicações. 2007. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

2.
BRAZ, A. S. K.. Bioinformática estrutural de proteínas : organização, evolução, classificação e modelagem molecular de proteínas. 2006. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

3.
BRAZ, A. S. K.. Bioinformática estrutural de proteínas : organização, classificação e modelagem molecular de proteínas. 2006. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

4.
BRAZ, A. S. K.. Mesa redonda Transgênicos. 2006. (Apresentação de Trabalho/Outra).

5.
BRAZ, A. S. K.; Sassaki F T . Aplicações da Bioinformática. 2006. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

6.
BRAZ, A. S. K.. Identificação e análise de genes diferencialmente expresos em plantas com RNA silencing. 2005. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

7.
BRAZ, A. S. K.. RNA silencing como estratégia de combate a vírus de plantas: uma nova solução com novos problemas e novas perpectivas. 2005. (Apresentação de Trabalho/Seminário).


Produção técnica
Assessoria e consultoria
1.
Braz, Antônio S. K.. Teste de ligação de compostos contaminantes em DNA por Molecular Docking. 2014.

Trabalhos técnicos


Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
LARA, P. T. R.; BRAZ, A. S. K.. Participação em banca de Pedro Túlio de Resende Lara. Análise Estrutural do fator de crescimento Neural e as implicações moleculares de suas mutações na interação com receptores TRKA e P75NTR. 2015. Dissertação (Mestrado em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC.

2.
MAGALHAES, J. G.; YAGUI, C. O. R.; BRAZ, A. S. K.. Participação em banca de Juliana Gallottini de Magalhães. Busca Virtual de agonistas enviesados não peptidicos do receptor de angiotensina II do tipo 1. 2015. Dissertação (Mestrado em Fármacos e Medicamentos) - Universidade de São Paulo.

3.
Fontes M R M; Fernandez R M; BRAZ, A. S. K.. Participação em banca de Guilherme Henrique Marchi Salvador. estudos estruturais com fosfolipase A2 e fosfolipase A2 homologas isoladas do veneno de bothrops moojeni. 2012. Dissertação (Mestrado em Biologia Geral e Aplicada) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

4.
BRAZ, A. S. K.; Forti F L. Participação em banca de Karine Panico. Proteína Tirosina Fosfatase de Dupla Especificidade 3 e suas Interações Moleculares.. 2012. Dissertação (Mestrado em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC.

5.
PANICO, K.; Forti F L; BRAZ, A. S. K.. Participação em banca de Karine Panico. Interações Moleculares da proteína Tirosina fosfatase de dupla especificidade 3 em linhagnes de celulas tumorais humanas submetidas a estresse genotoxico. 2012. Dissertação (Mestrado em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC.

6.
Cano, M I N; x; xx; xxx; BRAZ, A. S. K.. Participação em banca de Arina Marina Perez. Caracterização da proteína LaRbp38 : mapeamento do dominio de interação com ácidos nucléicos e identificação de possíveis proteínas parceiras. 2009. Dissertação (Mestrado em Ciencias Biologicas (Genetica)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

7.
Fontes M R M; Soares A M; BRAZ, A. S. K.. Participação em banca de Luiz Claudio Corrêa. Estudos estruturais com a BthTX-II, uma Asp49-Fosfolipase A2 miotóxica e com baixa atividade catalítica do veneno de Bothrops jararacussu. 2007. Dissertação (Mestrado em Biologia Geral e Aplicada) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

8.
Gimenes M P; BRAZ, A. S. K.; Zucchi M I. Participação em banca de Waldemir Pinto Oliveira. CONSTRUÇÃO DE UM MAPA DE LIGAÇÃO PARA O GENOMA B DE ARACHIS UTILIZANDO MARCADOR RAPD. 2006. Dissertação (Mestrado em Ciencias Biologicas (Genetica)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Teses de doutorado
1.
VALENTE, G. T.; LEMKE, N.; BRAZ, A. S. K.. Participação em banca de Guilherme Targino Valente. Analisando a determinação sexual de vertebrados com base em redes de interação entre proteinas. 2013. Tese (Doutorado em Ciencias Biologicas (Genetica)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

2.
MATAROLLO, V. G.; BRAZ, A. S. K.. Participação em banca de Vinicius Gonçalves Matarollo. aplicação de estrategias in silico para desenvolvimento de ligantes com afinidade pelo receptor PPAR gama. 2013. Tese (Doutorado em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC.

3.
FONTES, M. R. M; Colombi , D; PUPO A S; BRAZ, A. S. K.; MAIA, Ivan de Godoi. Participação em banca de Agnes Alessandra Sekijima Takeda. Estudos estruturais com a Importina. 2009. Tese (Doutorado em Ciencias Biologicas (Genetica)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Qualificações de Doutorado
1.
LIMA, A. N.; BRAZ, A. S. K.. Participação em banca de Angelica Nakagawa Lima. Caracterização das interações molecualres envolvidas na transição PrPc PrPsc. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC.

Qualificações de Mestrado
1.
KLIOUSOFF JUNIOR, A.; BRAZ, A. S. K.. Participação em banca de Andre Kliousoff Junior. Investigando padrões em proteinas com região de desordem por meio demineração de dados. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em Ciência da Computação) - Universidade Federal do ABC.

2.
CRISTOFARO, R. A. L.; BRAZ, A. S. K.. Participação em banca de Raphael Agostin Leite Cristofaro. Desenvolvimento de um modulo web e aprimoramento da ferrameta GANM para simular docking completamente flexivel de proteina-ligante. 2013. Exame de qualificação (Mestrando em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC.

3.
BRAZ, A. S. K.. Participação em banca de Karine Panico. Proteína Tirosina Fosfatase de Dupla Especificidade 3 e suas Interações Moleculares.. 2012. Exame de qualificação (Mestrando em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC.

4.
BRAZ, A. S. K.; SCOTT, L. P. B.. Participação em banca de Rosanne da Silva Vieira. Predição de Hot Spots em complexos Proteína-Proteína. 2012. Exame de qualificação (Mestrando em Ciência da Computação) - Universidade Federal do ABC.

Trabalhos de conclusão de curso de graduação
1.
OLIVERIA, T. C.; BRAZ, A. S. K.. Participação em banca de Thais Crippa de Oliveria.Estudos Evolutivos de liapses de gungos do genero Malassezia. 2013. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do ABC.



Participação em bancas de comissões julgadoras
Concurso público
1.
GOLDMAN, M. H. S.; França, M.G.C.; BRAZ, A. S. K.. Concurso Público para Professor Adjunto - Nível I, Subárea Fisiologia Vegetal, Edital no. 24/2010. 2010. Universidade Federal do ABC. 2010. Universidade Federal do ABC.



Eventos



Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
BRAZ, A. S. K.. I ESCOLA BRASILEIRA DE MODELAGEM MOLECULAR. 2011. (Congresso).

2.
BRAZ, A. S. K.. VI Workshop de genética. 2006. (Outro).



Orientações



Orientações e supervisões em andamento
Tese de doutorado
1.
Fernanda Marisca Bizotto. Estudo evolutivo e estrutural das proteínas da via de biossíntese de THC em Cannabis sativa. Início: 2015. Tese (Doutorado em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Orientador).

2.
Pedro Túlio de Resende Lara. Transferência de informação na sinalização dos receptores TrkA mediados por neurotrofinas e suas implicações no desenho de fármacos. Início: 2015. Tese (Doutorado em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Orientador).


Orientações e supervisões concluídas
Dissertação de mestrado
1.
Pedro Túlio de Resende Lara. Estudo estrutural de neurotrofinas e seus receptores a partir de análise de modos normais. 2013. Dissertação (Mestrado em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC, . Orientador: Antonio Sergio Kimus Braz.

2.
Matheus Fazian Ige Gondo. Simulações de Dinâmica Molecular no Estudo Estrutural da Miotoxina MjTX-II do Veneno da Serpente Bothrops moojeni. 2008. Dissertação (Mestrado em Ciencias Biologicas (Genetica)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Coorientador: Antonio Sergio Kimus Braz.

3.
Edmarcia Elisa de Souza. Expressão, purificação e teste de cristalização da proteína AtRLI2 (RNAse L inhibitor) de Arabidopsis thaliana, uma supressora de silenciamento por RNA. 2007. Dissertação (Mestrado em Biologia Geral e Aplicada) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Coorientador: Antonio Sergio Kimus Braz.

4.
Rodrigo Kazuo Makiyama. Clonagem, expressão e purificação da rgs-CaM, uma calmodulina supressora de silenciamento por RNA. 2007. Dissertação (Mestrado em Ciencias Biologicas (Genetica)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Antonio Sergio Kimus Braz.

Tese de doutorado
1.
Patrícia Cassiolato Tufanetto. Estudo estrutural de replicases virais a partir de análise de modos normais. 2014. Tese (Doutorado em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Antonio Sergio Kimus Braz.

2.
Eric Allison Philot. Caracterizando as Interações Moleculares envolvidas no sistema Trx e no processo de docking entre a Tioredoxina e Tioredoxina Redutase com inbidores, moduladores alostéricos e proteínas. 2010. Tese (Doutorado em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC, . Coorientador: Antonio Sergio Kimus Braz.

Iniciação científica
1.
Guilherme Henrique de Paula Carpentieri. Avaliação de alterações conformacionais e de perda de afinidade a inibidores antivirais da Transcriptase reversa do HIV-1 (Human Immunodeficiency Virus -1) em resposta a mutações em sítios sobre seleção positiva. 2010. Iniciação Científica. (Graduando em BC&T) - Universidade Federal do ABC, Universidade Federal do ABC. Orientador: Antonio Sergio Kimus Braz.

2.
Tiago de França Queiroz. Estudo de evolução molecular de proteínas carreadoras de ADP/ATP (AAC) e desenvolvimento de um software para integração de dados biológicos.. 2010. Iniciação Científica. (Graduando em BC&T) - Universidade Federal do ABC, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Antonio Sergio Kimus Braz.

3.
Anderson de França Queiroz. Estudo de evolução molecular de proteínas carreadoras de ATP-Mg/Pi (SCaMC) e desenvolvimento de um software de criação e visualização de árvores 3D com base em dados de duplicações genéticas. 2010. Iniciação Científica. (Graduando em BC&T) - Universidade Federal do ABC, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Antonio Sergio Kimus Braz.

4.
Patricia Tuffaneto. Avaliação de alterações conformacionais e de perda de afinidade a inibidores antivirais da protease do HIV-1 (Human Immunodeficiency Virus -1) em resposta a mutações em sítios sobre seleção positiva. 2010. Iniciação Científica. (Graduando em BC&T) - Universidade Federal do ABC. Orientador: Antonio Sergio Kimus Braz.

5.
Frayli Maltoni Fratoni. Análise de pressão de seleção em glicoproteínas do Citomegalovírus. 2010. Iniciação Científica. (Graduando em BC&T) - Universidade Federal do ABC, Universidade Federal do ABC. Orientador: Antonio Sergio Kimus Braz.

6.
Régis Lopes Corrêa. Clonagem de Genes Diferencialmente Expressos em Plantas Apresentando Silenciamento Gênico Pós-transcricional. 1999. Iniciação Científica. (Graduando em Ciencias biologicas bacharelado em genetica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro. Orientador: Antonio Sergio Kimus Braz.




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