Ana Ligia Scott

  • Endereço para acessar este CV: http://lattes.cnpq.br/9435885004578060
  • Última atualização do currículo em 05/11/2018


Orientadora de Doutorado de Mestrado. Professora Associada na Universidade Federal do ABC. Pós-doutorado junto a Escola de Medicina da Universidade de Pittsburgh ? Bahar Lab. (2018). Pós-doutorado Laboratoire de Biologie et Pharmacologie Appliquée (LBPA)- Ecole Normale Supérieure de Cachan- Perahia Lab. (2013). Doutorado junto ao Departamento de Física do IBILCE/UNESP (2013).Lider do Laboratório de Biologia Computacional e de Bioinformática da UFABC. Atua na area de Biofísica Molecular e Biologia Estrutural. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Ana Ligia Scott
Nome em citações bibliográficas
SCOTT, L. P. B.;Luis P B Scott;SCOTT, LUIS P.B.;Luis P.B. Scott;P.B., SCOTT Luis;ANA LíGIA SCOTT;A L SCOTT;L SCOTT;SCOTT, ANA;SCOTT, LUIS PAULO BARBOUR;SCOTT, AL;ANA LIGIA SCOTT

Endereço


Endereço Profissional
Universidade Federal do ABC, Centro de Matemática, Computação e Cognição.
Rua Catequese, N. 242
jardim
09090400 - Santo André, SP - Brasil
Telefone: (11) 44361700
Ramal: 400
Fax: (11) 44361700
URL da Homepage: http://www.UFABC.EDU.BR


Formação acadêmica/titulação


2000 - 2003
Doutorado em Biofísica Molecular.
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
Título: PREDICAO DE ESTRUTURAS PROTEICAS VIA REDES NEURAIS E ALGORITMOS GENÉTICOS, Ano de obtenção: 2003.
Orientador: JORGE CHAHINE.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Palavras-chave: Predição; Estrutura de Proteínas; Redes Neurais; Algoritmos Genéticos; Modelagem Molecular.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação / Especialidade: Redes Neurais.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular.
Setores de atividade: Produtos e Processos Biotecnológicos; Desenvolvimento de Programas (Software) e Prestação de Serviços em Informática.
1991 - 1993
Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: protótipo evolutivo de um sistema de modelagem de sólidos,Ano de Obtenção: 1993.
Orientador: MARIA CRISTINA FERREIRA DE OLIVEIRA.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Palavras-chave: Orientação a Objetos; Modelagem; Computação Gráfica; MODELAGEM DE SÓLIDOS.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação / Especialidade: Arquitetura de Sistemas de Computação.
Setores de atividade: Construção Civil; Desenvolvimento de Novos Materiais; Fabricação e Montagem de Veículos Automotores Para Transporte de Carga e Passageiros.
1987 - 1990
Graduação em Bacharelado Em Ciências da Computação.
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
Título: SIMULAÇÃO DE POLÍMEROS UTILIZANDO MONTE CARLO.
Orientador: JORGE CHAHINE.


Pós-doutorado


2018
Pós-Doutorado.
Univesity of Pittysburgh, PITT, Estados Unidos.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas
2013 - 2014
Pós-Doutorado.
École Normale Supérieure de Cachan, ENS/Cachan, França.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas


Formação Complementar


2009 - 2009
Estágio/Visita técnica.
UNIVERSIDADE DE PARIS XI, UN. PARIS-SUD, França.
2009 - 2009
Capacitação de Avaliadores Insit. Externa. (Carga horária: 8h).
Instituto Nacional de Estudos e Pesquisas Educacionais Anísio Teixeira, INEP/MEC, Brasil.
2007 - 2007
CAPACITAÇÃOP DO BANCO DE AVALIADORES DO SINAES. (Carga horária: 32h).
Ministério da Educação, MEC, Brasil.
2001 - 2001
Modelagem de Biomoléculas. (Carga horária: 16h).
Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.
2001 - 2001
Bioinformática Análise de Banco de Dados Genéticos. (Carga horária: 20h).
Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.
2001 - 2001
Filogenia Molecular. (Carga horária: 20h).
Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.
1999 - 1999
Treinamento no Banco de Dados Progress e na Lingua. (Carga horária: 40h).
Dual Software, DUAL, Brasil.
1999 - 1999
Computer Science. (Carga horária: 120h).
Instituto de Tecnologia da Geoórgia, GEATECH, Estados Unidos.
1997 - 1997
SQL Server Administration. (Carga horária: 40h).
CENTRO DE TREINAMENTO DA SYBASE, SYBASE, Brasil.
1996 - 1996
Introduction to Powebuilder. (Carga horária: 40h).
CENTRO DE TREINAMENTO DA SYBASE, SYBASE, Brasil.
1995 - 1995
Introduction to Sybase. (Carga horária: 40h).
CENTRO DE TREINAMENTO DA SYBASE, SYBASE, Brasil.
1992 - 1992
Métodos Topológicos em Modelagem Geométrica. (Carga horária: 20h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
1992 - 1992
Conceitos Básicos de Computação Gráfica. (Carga horária: 20h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
1992 - 1992
Curso de Computação Algébrica e Simbólica. (Carga horária: 40h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
1991 - 1991
Extensão universitária em Sistema Operacional UNIX. (Carga horária: 60h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
1980 - 1985
Inglês. (Carga horária: 1020h).
Escolas Fisk, FISK, Brasil.


Atuação Profissional



Universidade Federal do ABC, UFABC, Brasil.
Vínculo institucional

2007 - Atual
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Associado II, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

06/2014 - Atual
Direção e administração, Programa de Pos Graduaçao em Engenharia da Informaçao -UFABC, .

Cargo ou função
Coordenador.
02/2007 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , Centro de Matemática, Computação e Cognição, .

02/2007 - Atual
Ensino, Bacharelado em Ciência e Tecnologia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
lógica Computacional
Metodologia e Algoritmos Computacionais
Sistemas de Gerencimaento de Banco de dados
05/2012 - 01/2013
Direção e administração, Centro de Matemática, Computação e Cognição, .

Cargo ou função
Coordeanador do Mestrado em Engenharia da Informação da UFABC.
08/2008 - 12/2009
Direção e administração, Centro de Matemática, Computação e Cognição, .

Cargo ou função
Diretor Adjunto.
09/2008 - 12/2008
Ensino, Engenharia da Informação, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Modelagm e Simulação de Sistemas
02/2007 - 08/2008
Conselhos, Comissões e Consultoria, Comissão de Biblioteca da UFABC, .

Cargo ou função
Representante do CMCC.
07/2007 - 11/2007
Conselhos, Comissões e Consultoria, Comissão do BC&T, .

Cargo ou função
Representante do CMCC.
03/2007 - 07/2007
Conselhos, Comissões e Consultoria, Comissão do Bacharelado em Ciências da Computação, .

Cargo ou função
Representante dos docentes.

Instituto Nacional de Estudos e Pesquisas Educacionais Anísio Teixeira, INEP/MEC, Brasil.
Vínculo institucional

2007 - Atual
Vínculo: Avaliador, Enquadramento Funcional: Avaliador Insitucional e de Curso

Atividades

06/2007 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, inep, .

Cargo ou função
Avaliado Insitucional e de Curso.

CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA, UNIFEV, Brasil.
Vínculo institucional

2002 - 2007
Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 40

Atividades

10/2005 - 01/2007
Direção e administração, Coordenação de Pós Graduação, Campus Centro.

Cargo ou função
Coordeandor de Pós-Graduação.
1/2005 - 01/2007
Conselhos, Comissões e Consultoria, Comitê Executivo da Revista Científica Mosaico da Unifev, Campus Centro.

Cargo ou função
Membro do Comitê Executivo.
10/2004 - 01/2007
Direção e administração, Coordenadoria de Pesquisa, .

Cargo ou função
Coordenador de Pesquisa.
10/2004 - 01/2007
Conselhos, Comissões e Consultoria, Comitê Científico, .

Cargo ou função
Membro Presidente do Comitê Científico.
5/2004 - 01/2007
Ensino, Redes de Computadores, Nível: Especialização

Disciplinas ministradas
Engenharia da Informação
Métodos e Técnicas de Pesquisa
08/2002 - 01/2007
Ensino, Bacharel em Sistemas de Informação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Banco de Dados I
Banco de Dados II
Estrutura de Dados I
Estrutura de Dados II
Tópicos Avançados em Computação I
Tópicos Avançados em Computação II
08/2004 - 12/2006
Ensino, Psicopedagogia, Nível: Especialização

Disciplinas ministradas
Métodos e Técnicas de Pesquisa
08/2002 - 12/2006
Pesquisa e desenvolvimento , Curso de Engenharia de Computação, Campus Centro.

10/2006 - 10/2006
Extensão universitária , Campus Centro, .

Atividade de extensão realizada
Organização do II Congresso de Iniciação Científica.
1/2006 - 6/2006
Ensino, Mba Em Gestão da Produção, Nível: Especialização

Disciplinas ministradas
Métodos e Técnicas de Pesquisa
11/2005 - 11/2005
Extensão universitária , Coordenadoria de Pesquisa, Campus Centro.

Atividade de extensão realizada
Palestra: A importância da Iniciação Científica na Formação Acadêmica - I Congresso de Iniciação Científica.
11/2005 - 11/2005
Extensão universitária , Coordenadoria de Pesquisa, Campus Centro.

Atividade de extensão realizada
Organização do I Congresso de Iniciação Científica da UNIFEV.
5/2005 - 5/2005
Extensão universitária , Depto de Ciências Exatas, Campus Centro.

Atividade de extensão realizada
Palestra "Bioinformática: Uma nova área da Bioinformática ", V Congresso de Computação.
02/2003 - 11/2003
Extensão universitária , Depto de Ciências Exatas, Campus Centro.

Atividade de extensão realizada
INTRODUÇÃO À BIOINFORMÁTICA - MINICURSO.

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
Vínculo institucional

2002 - 2004
Vínculo: Professor Substituto, Enquadramento Funcional: Professor MS-II, Carga horária: 24

Atividades

08/2002 - 7/2004
Ensino, Bacharelado Em Ciências da Computação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
ASPECTOS TEÓRICOS DA COMPUTAÇÃO E FUND. DE LINGUAGEM DE PROGRAMAÇÃO
COMPLEXIDADE DE ALGORITMOS
COMPUTABILIDADE
LINGUAGENS FORMAIS E AUTÔMATOS
02/2002 - 5/2004
Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Departamento de Ciência da Computação e Estatística.


École Normale Supérieure de Cachan, ENS/Cachan, França.
Vínculo institucional

2017 - 2017
Vínculo: CONVIDADO, Enquadramento Funcional: Professor Visitante
Outras informações
Sem Vinculo Empregaticio


University of Pittsburgh, PITT, Estados Unidos.
Vínculo institucional

2018 - Atual
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Visiting Professor



Linhas de pesquisa


1.
ALGORITMOS GENÉTICOS
2.
BIOFÍSICA MOLECULAR
3.
Aplicações de Algortimos Genéticos

Objetivo: Estudar a aplicação de algortimos genéticos no problema de predição de estrutura de peptídeos utilizando biblioteca de rotâmeros dependentes e não dependentes do backbone. Explorar também a parlelização dos algoritmos genéticos em problemas de bioinformática.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação / Especialidade: Algoritmos Genéticos.
Setores de atividade: Fabricação de Produtos Químicos; Informática; Produtos e Processos Biotecnológicos.
Palavras-chave: Algoritmos Genéticos; Proteínas; Predição; Estrutura de Proteínas; Otimização.
4.
Bioinformática

Objetivo: Estudo de Ferramentas e Desenvolvimento de software para predição e design de núcleos hidrofóbicos e estruturas protéicas..
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
Setores de atividade: Produtos e Processos Biotecnológicos; Informática; Fabricação de Produtos Químicos.
Palavras-chave: Estrutura de Proteínas; Algoritmos Genéticos; Otimização; Predição; Redes Neurais.
5.
Modelagem Molecular
6.
Biologia Computacional


Projetos de pesquisa


2016 - Atual
Estudo das interações moleculares envolvidas na formação de agregados da Superóxido Dismutase 1 (SOD1) e de seus aspectos termodinâmicos por meio de Molecular Dynamics with excited Normal Modes e técnicas de mineração de dados
Descrição: A enzima humana Cu,Zn-SOD é um homodímero de 35-kDa (Rumfeldt, 2009), no qual cada monômero se liga a um átomo de zinco e um átomo de cobre. O Cobre está diretamente envolvido nas reações de catálise, enquanto o Zinco tem função estrutural na região do sítio ativo. Expressada em praticamente, todos os tecidos e em altas concentrações, esta enzima converte o ânion superóxido, um danoso produto do metabolismo protéico, em peróxido de hidrogênio e oxigênio molecular. Este projeto de pesquisa possui como principais objetivos: i) compreender as interações moleculares envolvidas na formação dos agregados da SOD1; ii) identificar padrões (flexibilidade e área acessível ao solvente) em mutantes da SOD1 que estejam correlacionados com a formação de agregados e com diferentes doenças, iii) estudar e compreender melhor o papel do cobre (Cu) e do zinco (Zn) para a estabilidade da estrutura da SOD1 e na propensão de formação de agregados, iv) contribuir para compreensão, de forma mais geral, do mecanismo de agregação de proteínas. O projeto de pesquisa será desenvolvido no Laboratório de Biologia Computacional e Bioinformática da UFABC com a colaboração do Dr. David Perahia que é especialista nas técnicas de Análise de Modos Normais e Dinâmica Molecular. Estudos sobre os mecanismos e agregados envolvidos com patologias podem auxiliar na compreensão das mesmas e no desenvolvimento de novos medicamentos e tratamentos. Mais especificamente, a compreensão das interações moleculares envolvidas na formação dos agregados da SOD e seus mutantes são importantes e contribuem para a compreensão dos mecanismos moleculares envolvidos em doenças neurodegenerativas como a Esclerose Lateral Amiotrófica..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) .
Integrantes: Ana Ligia Scott - Integrante / Luis Paulo Barbour Scott - Coordenador.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2014 - 2016
Estudo de estrutural e funcional de proteínas envolvidas em doenças neurodegenerativa utilizando analise de modos normais e dinâmica molecular
Descrição: Este projeto de pesquisa propõem investigar diferentes doenças neurodegernerativas do ponto de vista molecular, estudando as proteínas envolvidas com essas patologias a partir de vários aspectos: estrutura, dinâmica, formação de agregados, função e interação. Pretende-se investigar os mecanismos moleculares a partir de diferentes visões: evolução, busca de padrões (bioinformática), enovelmamento, formaçao de agregado, interação proteína-ligante e drug design. Essa visão/estudo hierarquico permitirá um melhor entendimento do processo molecular envolvido nessas doenças neurodegenerativas. Este projeto de pesquisa possui como principais objetivos: i) compreender as interações moleculares envolvidas na formação dos agregados de proteínas e doenças neurodegenerativas; ii) identificar padrões (flexibilidade, área acessível ao solvente e outros) nas proteínas e em seus respectivos mutantes que estejam relacionados com as diferentes doenças, iii) identificar possíveis sítios de ligação alostéricos por meio de mudanças conformacionais globais, iv) investigar o docking dessas proteínas com compostos candidatos a inibidores..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) .
Integrantes: Ana Ligia Scott - Integrante / Luis Paulo Barbour Scott - Coordenador.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2011 - 2013
Study of moleuclar interactions among Thioredoxin/Thioredoxin Reductase and inhibitors and alosteric modulators the characterization of moecular interactions presents in the system Trx.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) .
Integrantes: Ana Ligia Scott - Coordenador / Luis Paulo Barbour Scott - Integrante / Eric Allison Philot - Integrante / Ricardo Hildebrand Theodoro da Silv - Integrante.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2011 - 2013
Estudo de padrões em proteínas virais humanas e a sua correlação com a rede de interação dessas proteínas
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) .
Integrantes: Ana Ligia Scott - Integrante / Luis Paulo Barbour Scott - Coordenador / Denis Lucas Silva - Integrante.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
2010 - 2015
DESENVOLVIMENTO DE UM SOFTWARE PARA DESIGN DE FÁRMACOS BASEADO EM ESTRUTURA E ESTUDO DE INTERAÇÃO PROTEÍNA-PROTEÍNA PROTEÍNA-LIGANTE
Descrição: Projeto Bolsa PNPD.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) .
Integrantes: Ana Ligia Scott - Coordenador / Luis Paulo Barbour Scott - Integrante / Antonio Sergio Kimus Braz - Integrante.Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.
2010 - 2012
Desenvolvimento de metodologia para docking flexível com alterações especificas na estrutura primária. E suas aplicações para estudar interação Proteína-Proteína , Proteína-Ligante e resistência de patógenos a drogas
Descrição: Projeto de Auxílio regular à Pesuqisa - Fapesp.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) .
Integrantes: Ana Ligia Scott - Coordenador / Luis Paulo Barbour Scott - Integrante / Perahia, D - Integrante / Antonio Sergio Kimus Braz - Integrante.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2010 - Atual
Laboratório de Modelagem e Simulação de Sistemas não Lineares (LMSSNL)
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2009 - 2010
Methodological developments based on genetic algorithm and normal mode technique to simulate molecular docking
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (3) .
Integrantes: Ana Ligia Scott - Coordenador / Luis Paulo Barbour Scott - Integrante / David Parahia - Integrante.Financiador(es): Chamada Fapesp/CNRS - Auxílio financeiro.
2007 - 2009
Aplicação de Monte Carlo e Wang-Landau Estudo de Enovelamento, Dinâmica e Estabilidade de Estruturas Protéicas em uma Rede Cúbica
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (2) .
Integrantes: Ana Ligia Scott - Coordenador / Luis Paulo Barbour Scott - Integrante / Hudson Roger - Integrante.
2007 - 2008
Investigação do uso de algoritmos genéticos e redes neurais na modelagem e predição de estruturas de macromoléculas e na simulação de docking entre proteína e ligante
Descrição: Investigação e desenvolvimento de ferramentas para áre de modelagem de proteínas, utilizando algoritmos genéticos e redes neurais.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) .
Integrantes: Ana Ligia Scott - Integrante / Luis Paulo Barbour Scott - Coordenador.
2004 - 2004
Desenvolvimento de um CD multimídia para ensino e treinamento de UML
Descrição: O porjeto consisitu na elbaoração de um CD muiltimídia que possa ser utilizado para o ensino e treinamento de UML.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Ana Ligia Scott - Coordenador / Luis Paulo Barbour Scott - Integrante / Cleber Pressunto Fogo - Integrante.Financiador(es): CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA - Remuneração.
2003 - 2004
Desenvolvimento e Investigação de Ferramentas para Predição de Estruturas Protéicas
Descrição: Estudar ferramentas prontas e desenevolver softwrae utilizando redes neurais e algoritmos genéticos para predição de estrutura secundária e terciária de proteínas..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Ana Ligia Scott - Coordenador / Luis Paulo Barbour Scott - Integrante / Luiz Henrique Boiago - Integrante / Sinval Jardineti - Integrante / Ellen Quirino de Fátima Silva - Integrante.Financiador(es): CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA - Remuneração.
2003 - 2003
Estudo e Avaliação de Ferramentas para Bioinformática
Descrição: Esse projeto visou estudar as ferramentas disponíveis para estudo de estruturas moleculares (principalmente proteínas) e realizar uma coparação e avaliação dessas ferramentas e desenvolver um CD educativo..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Ana Ligia Scott - Coordenador / Luis Paulo Barbour Scott - Integrante / PATRÍCIA FERREIRA QUEIROZ - Integrante / LEONARDO BOTTARO - Integrante.Financiador(es): CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA - Remuneração.
2002 - 2003
Desenvolvimento de um Preditor de Estrutura Secundária de Proteínas
Descrição: Este projeto consiste no desenvolvimento de uma ferramenta, baseada em redes neurais artificiais, para realizar a predição de estrutura secundária de proteínas a partir da sequência primária das mesmas..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Ana Ligia Scott - Integrante / Luis Paulo Barbour Scott - Coordenador.Financiador(es): CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA - Remuneração.
Número de produções C, T & A: 3


Projetos de desenvolvimento


2008 - 2010
Combining Genetic Algorithms and Molecular Dynamics to Investigate Protein-Ligand and Protein-Protein Docking
Descrição: In this project we will be interested in developing methods that combine specifically Genetic Algorithms (GA) and Molecular Dynamics (MD) in order to apply them to the elucidation of docking problem by taking into account the global conformational changes. The combined use of GA and MD can bee a good method in these fields since these two methods own different properties, GA allowing to design families of structures and making evolve them to lower energy ones in an efficient way, and MD to refine them and gain in precision. The project was written and it will be developed with the collaboration of the Prof. Dr. David Perahia, University Paris-Sud, CNRS, France. The research will be developed in 24 months..
Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento.
Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) .
Integrantes: Ana Ligia Scott - Integrante / Luis Paulo Barbour Scott - Coordenador.Financiador(es): Não informado / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.


Membro de corpo editorial


2006 - Atual
Periódico: Mosaico: Área de Ciências Humanas de Sociais - UNIFEV
2005 - 2006
Periódico: Mosaico: Área de Ciências Humanas de Sociais - UNIFEV
2006 - 2007
Periódico: Mosaico: Trabalho de Conclusão de Curso - UNIFEV
2006 - Atual
Periódico: Mosaico: Área de Ci6encias Exatas de Tecnológicas - UNIFEV
2005 - 2006
Periódico: Mosaico: Área de Ci6encias Exatas de Tecnológicas - UNIFEV
2005 - 2006
Periódico: Mosaico : Revista de Pesquisa da Área de Ciências Biológicas -UNIFEV
2005 - 2006
Periódico: Mosaico Multidisciplinar -UNIFEV


Revisor de periódico


2009 - Atual
Periódico: Applied Mathematics and Computation
2010 - Atual
Periódico: Information Sciences
2010 - Atual
Periódico: Journal of Theoretical Biology
2010 - Atual
Periódico: Chemical Physics
2011 - Atual
Periódico: Computers in Biology and Medicine


Revisor de projeto de fomento


2013 - Atual
Agência de fomento: Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
2013 - Atual
Agência de fomento: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular.
2.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação.
3.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica.
4.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física Atômica e Molecular.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.


Produções



Produção bibliográfica
Citações

SciELO
Total de trabalhos:5
Total de citações:3
Scott, L. P. B.  Data: 31/01/2012

SCOPUS
Total de trabalhos:5
Total de citações:4
Scott, L.P.B.  Data: 31/01/2012

Artigos completos publicados em periódicos

1.
PANTALEAO, S. Q.2018PANTALEAO, S. Q. ; Philot, E. A. ; RESENDE-LARA, P. ; Lima, A N. ; MITEVA, M. A. ; Perahia, D. ; ANA LíGIA SCOTT ; HONÓRIO, K. . Structural Dynamics of DPP-4 and Its Influence on the Projection of Bioactive Ligands. MOLECULES, v. 23, p. 490, 2018.

2.
MANO, E.2018MANO, E. ; SCOTT, L. P. B. ; HONORIO, K. M. . UDP-glucuronosyltransferases: Structure, Function and Drug Design Studies. CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY, v. 25, p. 10-15, 2018.

3.
LIMA, ANGELICA NAKAGAWA2018LIMA, ANGELICA NAKAGAWA ; DE OLIVEIRA, RONALDO JUNIO ; BRAZ, ANTÔNIO SÉRGIO KIMUS ; DE SOUZA COSTA, MAURÍCIO GARCIA ; PERAHIA, DAVID ; SCOTT, LUIS PAULO BARBOUR . Effects of pH and aggregation in the human prion conversion into scrapie form: a study using molecular dynamics with excited normal modes. EUROPEAN BIOPHYSICS JOURNAL WITH BIOPHYSICS LETTERS, v. 47, p. 583-590, 2018.

4.
BERTOZO, L. C.2018BERTOZO, L. C. ; Philot, E. A. ; Lima, A N. ; RESENDE-LARA, P. ; SCOTT, AL ; XIMENES, V. F. . Interaction between 1-pyrenesulfonic acid and albumin: Moving inside the protein. SPECTROCHIMICA ACTA PART A-MOLECULAR AND BIOMOLECULAR SPECTROSCOPY, v. 208, p. 243-254, 2018.

5.
PANTALEAO, S. Q.2017PANTALEAO, S. Q. ; FUJJI1B, D. G. V. ; MALTAROLLO, V. ; SILVA, D. C. ; TROSSINI, G. H. G. ; WEBER, K. C. ; SCOTT, L. P. B. ; HONORIO, K. M. . The role of QSAR and virtual screening studies in type 2 diabetes drug discovery. Medicinal Chemistry, v. 13, p. 1, 2017.

6.
Philot, E. A.2016Philot, E. A. ; LOPES, D. M. ; SOUZA, A. T. ; BRAZ, A. S. K. ; NANTES, I. L. ; RODRIGUES, T. ; Perahia, D. ; MITEVA, M. A. ; SCOTT, L. P. B. . Binding of phenothiazines into allosteric hydrophobic pocket of human thioredoxin 1. European Biophysics Journal, v. 43, p. 2798-286, 2016.

7.
Lima, A N.2016Lima, A N. ; Philot, E. A. ; TROSSINI, G. ; SCOTT, L. P. B. ; MALTAROLLO, V. ; HONORIO, K. M. . Use of machine learning approaches for novel drug discovery. Expert Opinion on Drug Discovery (Print), v. 11, p. 225-239, 2016.

8.
MEISSNER, G.2016MEISSNER, G. ; RESENDE-LARA, P. ; MATSUBARA, F. ; Luis P B Scott ; BRAZ, ANTÔNIO S.K. ; CHAVES-MOREIRA, D. ; SOARES, E. ; TREVISAN-SILVA, D. ; GREMSKI, L. ; VEIGA ; CHAIM, O. . Molecular cloning and in silico characterization of knottin peptide, U2-SCRTX-Lit2, from brown spider (Loxosceles intermedia) venom glands. Journal of Molecular Modeling (Online), v. 22, p. 196, 2016.

9.
ARAUJO, G.2016ARAUJO, G. ; Silva, R H T ; SCOTT, L. P. B. ; ARAUJO, A. S. ; SOUZA, F. P. ; OLIVEIRA, R. J. . Structure and functional dynamics characterization of the ion channel of the human respiratory syncytial virus (hRSV) small hydrophobic protein (SH) transmembrane domain by combining molecular dynamics with excited normal modes. Journal of Molecular Modeling (Print), v. 22, p. 3-8, 2016.

10.
Philot, E. A.2016Philot, E. A. ; Lima, A N. ; RESENDE-LARA, P. ; Tufanetto, P ; SCOTT, L. P. B. . Considering Global and Local Conformational Changes in Molecular Docking. JSM Chemistry, v. 4, p. 01, 2016.

11.
CONTO, V.2015CONTO, V. ; BRAZ, A. S. K. ; Perahia, D. ; SCOTT, L. P. B. . Recovery of the wild type atomic flexibility in the HIV-1 protease double mutants. Journal of Molecular Graphics & Modelling, v. 59c, p. 107-116, 2015.

12.
HOMEM-­‐DE-­‐MELLO, P.2015HOMEM-­‐ ; Lima, A N. ; AONO1, C. M. ; COSTA, E. ; Philot, E. A. ; BETANNIN, F. ; SALVADOR, E. L. ; HONORIO, K. M. ; Luis P B Scott ; MIOTTO, R. . Simulações moleculares: uma área naturalmente interdisciplinar. Revista Interciente, v. 2, p. 72-90, 2015.

13.
LIBERATO, M.2013 LIBERATO, M. ; KOGISKOK, S. ; SILVA, E. ; SILVA, R. ; OLIVEIRA, V. ; Luis P B Scott ; ANDO, R. ; ALVES, W. ; COUTINHO-NETO, M. . Self-Assembly of Arg-Phe Nanostructures via the Solid-Vapor Phase Method. Journal of Physical Chemistry. B, v. 117, p. 733-740, 2013.

14.
Philot, E. A.2013 Philot, E. A. ; Perahia, D. ; BRAZ, A. S. K. ; COSTA, M. ; SCOTT, L. P. B. . Binding sites and hydrophobic pockets in Human Thioredoxin 1 determined by normal mode analysis. Journal of Structural Biology (Print), v. 182, p. 293-300, 2013.

15.
ZOTTI, MOISÉS J.2013ZOTTI, MOISÉS J. ; DE GEYTER, ELLEN ; SWEVERS, LUC ; BRAZ, ANTÔNIO S.K. ; SCOTT, LUIS P.B. ; ROUGÉ, PIERRE ; COLL, JOSEP ; GRUTZMACHER, ANDERSON D. ; LENARDÃO, EDER J. ; SMAGGHE, GUY . A cell-based reporter assay for screening for EcR agonist/antagonist activity of natural ecdysteroids in Lepidoptera (Bm5) and Diptera (S2) cell cultures, followed by modeling of ecdysteroid-EcR interactions and normal mode analysis. Pesticide Biochemistry and Physiology, v. 107, p. 309-320, 2013.

16.
BRAZ, A. S. K.2012 BRAZ, A. S. K. ; Patrícia Tuferatto ; Perahia, D. ; SCOTT, L. P. B. . Relation between flexibility and positively selected HIV-1 protease mutants against inhibitors. Proteins (Print), v. 80, p. 2680-2691, 2012.

17.
Lima, A N.2012 Lima, A N. ; Philot, E. A. ; BRAZ, A. S. K. ; Perahia, D. ; SCOTT, L. P. B. . GANM: A protein ligand docking approach based on genetic algorithm and normal modes. Applied Mathematics and Computation, v. 219, p. 511-520, 2012.

18.
Stelle, D.2011Stelle, D. ; Barioni, C. M. ; SCOTT, L. P. B. . Using data mining to identify structural rules in proteins. Applied Mathematics and Computation, v. 218, p. 1997-2004, 2011.

19.
SCOTT, L. P. B.2008SCOTT, L. P. B. ; CHAHINE, Jorge ; RUGGIERO, José Roberto . Use of genetic algorithms and solvation potential to study peptides structure. Applied Mathematics and Computation, v. 195, p. 515-522, 2008.

20.
SCOTT, L. P. B.2008SCOTT, L. P. B. ; CHAHINE, Jorge ; RUGGIERO, José Roberto . Predicting Peptides Structure with Solvation Potential and Rotamer Library Dependent of the Backbone. Applied Mathematics and Computation, v. 199, p. 155-161, 2008.

21.
SCOTT, L. P. B.2008 SCOTT, L. P. B. ; CHAHINE, Jorge ; RUGGIERO, José Roberto . Using genetic algorithm to design protein sequence. Applied Mathematics and Computation, v. 200, p. 1-9, 2008.

22.
SCOTT, L. P. B.2007SCOTT, L. P. B. . Aplicação de Redes MLP na Predição de Estrutura Secundária de Proteínas-PREDCASA. Biomatemática (UNICAMP), v. 17, p. 87-100, 2007.

23.
SCOTT, L. P. B.2005SCOTT, L. P. B. ; ALMEIDA, Marcelo de Brito ; VICENTIM, Marcos Alexandre . Estudo sobre computação móvel. Mosaico Revista Multidisciplinar de Pesquisa da Unifev, Votuporanga, v. 3, p. 35-40, 2005.

Capítulos de livros publicados
1.
SCOTT, L. P. B. ; ARAUJO, M. . Modelling of Biosystem Structure: A study of Hydrophobic Effect on the Protein Folding. In: Rubem P Mondaine. (Org.). Biomat 2008: International Symposium on Mathematical and Computational Biology [Hardcover]. 1ed.Singapore: World Scientific Publishing Co. Pte. Ltda., 2009, v. I, p. 114-155.

Textos em jornais de notícias/revistas
1.
SCOTT, L. P. B. . Pesquisa Básica. Diário da Região, 19 jun. 2001.

2.
SCOTT, L. P. B. . Orientação a Objetos: O mais novo Paradigma para Desenvolvimento de Sistemas. Caderno de Informática do Diário de Região, 18 maio 1997.

Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1.
SCOTT, L. P. B. . A new protocol to investigate conformational population patterns in the enzymatic activity cycle of proteins using molecular dynamics and normal modes. In: 9 International Conference on Structural Biology, 2017, Zurich. Proceedings of Structural Biology, 2017. v. I. p. 49-49.

2.
SCOTT, L. P. B. ; CHAHINE, Jorge . Design of Protein Sequence with Genetic Algorithms. In: Conference on Computational Physics, 2008, Ouro Preto. Anais of CPP 2008, 2008.

3.
PEREIRA, D. C. ; SCOTT, L. P. B. ; NASCIMENTO, M., Z. . Avaliação de filtros para pré-processamento aplicados à mamogramas. In: Congresso Brasileiro de Engenharia Biomédica, 2008, SALVADOR. XXI Congresso Brasileiro de Engenharia Biomédica, 2008.

4.
PEREIRA, D. C. ; NASCIMENTO, M., Z. ; SCOTT, L. P. B. ; C. S. Kurashima . Avaliação de Filtros Wavelets Aplicados no Pré-Processamento de Imagens Mamográficas. In: XI Congresso Brasileiro de Informática na Saúde, 2008, Campos do Jordão. XI Congresso Brasileiro de Informática na Saúde, 2008.

5.
SCOTT, L. P. B. ; Silva, H R. ; ARAUJO, M. . A study of hydrophobic effect on the protein folding using Monte Carlo. In: Biomat 2008, 2008, Cmapos de Jordão. Biomat 2008. Hackensack, NJ: World Sci. Publ, 2008. v. I. p. 146-156.

6.
Joselisa Paiva ; SCOTT, L. P. B. . Estudo de Aplicação de Diferentes Arquiteturas de Redes Neurais Artificiais no Diagnóstico de Propensão à Doenças Cárdiacas. In: VI Congresso de Lógica Aplicada à Tecnologia, 2007, Santos. VI Congresso de Lógica Aplicada à Tecnologia, 2007. v. 1.

7.
SCOTT, L. P. B. ; PIEMENTEL, Maria da Graça Campos . An Object-Oriented Model for HyTime using UML. In: ICCIMIA'99, 1999, NEW DEHLI- ÍNDIA. Proceedings of ICCIMA'99, 1999. v. I. p. 393-398.

8.
SCOTT, L. P. B. ; PIEMENTEL, Maria da Graça Campos . OOHyTime from the time-based point of view: the case of synchronization specification in multimedia documents. In: ICCIMA'99, 1999, NEW DEHLI-ÍNDIA. Proceedings of ICCIMA'99, 1999. v. I. p. 319-325.

9.
SCOTT, L. P. B. ; PIEMENTEL, Maria da Graça Campos ; TEIXEIRA, Cesar . HyTime from the Object-Oriented Point of View. In: ICCIMA'98, 1998, CHURCHILL -AUSTRÁLIA. PROCEEDINGS OF ICCIMA'98, 1998. v. I. p. 655-660.

10.
SCOTT, L. P. B. ; OLIVEIRA, Maria Cristina Ferreira de ; GERMANO, Fernando . Evolutive Prototype of an Object-Oriented Solid Modeling System. In: Edugraphics?93 (First International Conference on Graphics Education) and Compugrahics?93, 1993, Portugal. Proceedings of Edugraphics?93 (First International Conference on Graphics Education) and Compugrahics?93, 1993. v. I. p. 341-350.

Resumos expandidos publicados em anais de congressos
1.
ANA LIGIA SCOTT ; Lima, A N. ; OLIVEIRA, R. J. ; Perahia, D. ; COSTA, M. ; BRAZ, A. S. K. . Effects of pH and aggregation in the human prion conversion into scrapie form: a study using molecular dynamics with excited normal modes,. In: X-Meeting 2018, 2018, Aguas de Sao Paedro. X-Meeting 2018, 2018. v. 1.

2.
SCOTT, L. P. B. ; Lima, A N. ; Philot, E. A. ; Perahia, D. ; Cassiano, J. . Applying Genetic Algorithms and Rotamer Library to study the Molecular Docking of HIV-1 Protease and CDK-2 with ligands. In: Conference on Computational Physics 2010, 2010, Trondheim. proceedings of Conference on Computational Physics 2010, 2010.

3.
Ferreira, F. ; SCOTT, L. P. B. ; CHAHINE, Jorge ; RUGIERO, José Roberto . Improved Prediction of Protein Secondary Structure Using Neural Networks with Jury Decision. In: V Congresso Ibero-Americano de Biofísica, 2003, Rio de Janeiro. Proceedings of V Congresso Ibero-Americano de Biofísica, 2003. v. I.

4.
SCOTT, L. P. B. ; RUGIERO, José Roberto ; CHAHINE, Jorge . Use of Neural Networks Multi Layer Perceptron with Backpropgation algorithm in the Prediction of Secondary Structure of Protein. In: Congresso Ibero-Americano de Biofísica, 2003, Rio de Janeiro. Proceedings of V Congresso Ibero-Americano de Biofísica, 2003. v. I.

5.
SCOTT, L. P. B. ; CHAHINE, Jorge ; RUGIERO, José Roberto . Predicting Protein Structure Using Genetic Algorithms. In: School on Computational Physics, ICCMP, 2001, Brasília. Proceedings of School on Computational Physics, ICCMP, 2001. v. I.

6.
SCOTT, L. P. B. ; CHAHINE, Jorge ; RUGIERO, José Roberto . Prediction of Protein Structures Using a Hopfield Network. In: VI Simpósio Brasileiro de Redes Neurais, 2000, Rio de Janeiro. Proceedings of VI Simpósio Brasileiro de Redes Neurais - SBRN´2000, 2000. v. I.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
PANTALEAO, S. Q. ; Lima, A N. ; Philot, E. A. ; HONORIO, K. M. ; ANA LIGIA SCOTT . Analysis of the biological activity of antidiabetic compounds using CoMFA models. In: 41 Reuniao da Sociedade Brasileira de Quimica, 2018, Foz do Iguacu. Congresso. v. 1.

2.
SANTOS, A. L. ; Braz, A. S. K ; Lima, A N. ; ANA LIGIA SCOTT . MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS AND NORMAL MODES ANALYSIS OF ZIKA VIRUS NS1. In: X-meeting 2018, 2018, Aguas de Sao Pedro. X-meeting 2018, 2018. v. 1.

3.
MOREIRA, C. ; ANA LIGIA SCOTT . Predicting Regions Prone to Protein Aggregation based on SVM Algorithm. In: X-meeting 2018, 2018. X-meeting 2018, 2018. v. 1.

4.
Lima, A N. ; Perahia, D. ; SCOTT, L. P. B. ; COSTA, M. . pH and aggregation effects in the convesrsion of human prion into scrapie form: a study suing Molecular Dynamics with excited Normal Modes. In: 46th SBBq meeting, 2017, Aguás de Lindóia. 46th SBBq meeting, 2017. v. 1.

5.
PANTALEAO, S. Q. ; Lima, A N. ; Philot, E. A. ; SCOTT, L. P. B. ; HONÓRIO, K. . STRUCTURAL ANALYSIS OF THE BIOLOGICAL TARGET DIPEPTIDYL PEPTIDASE-4 (DPP-4) RELATED TO TYPE II DIABETES MELLITUS TREATMENT. In: 46th SBBq meeting, 2017, Águas de Lindóia. 46th SBBq meeting, 2017. v. 1.

6.
Philot, E. A. ; MORO, P. ; OLIVEIRA, R. J. ; SCOTT, L. P. B. . USING STRUCTURE-BASED MODEL AND NORMAL MODE ANALYSIS TO INVESTIGATE SOD 1 AGGREGATION. In: 46th SBBq Meeting, 2017, Águas de Lindóia. 46th SBBq Meeting, 2017. v. 1.

7.
Tufanetto, P ; Braz, A. S. K ; SCOTT, L. P. B. . STRUCTURAL ANALYSIS OF THE DENGUE PROTEASE (NS2B/NS3) AND ALLOSTERIC INHIBITION MECHANISMS. In: 46 th SBBq meeting, 2017, Águas de Lindóia. 46 th SBBq meeting, 2017. v. 1.

8.
QUEIROZ, S. ; Lima, A N. ; Philot, E. A. ; SCOTT, L. P. B. ; HONÓRIO, K. . Estudo sobre os movimentos funcionais da dipeptidil peptidase-4 (DPP-4) e as interações moleculares com ligantes para tratamento do diabetes tipo II. In: Reunião da SBQ 2016, 2016, Goiãnia. Reunião da SBQ 2016. v. 1.

9.
SCOTT, L. P. B. ; Lima, A N. ; OLIVEIRA, R. J. ; Perahia, D. ; COSTA, M. . PH AND AGGREGATION EFFECTS IN THE CONVERSION OF HUMAN PRION INTO SCRAPIE FORM: A STUDY USING MOLECULAR DYNAMICS WITH EXCITED NORMAL MODES. In: reunião da SBBq 2016, 2016, Natal. Anais da 45 Reunião da SBBq 2016, 2016. v. 1.

10.
PANTALEAO, S. Q. ; Lima, A N. ; Philot, E. A. ; RESENDE-LARA, P. ; BRAZ, A. S. K. ; SCOTT, L. P. B. ; HONORIO, K. M. . Docking Molecular de Candidatos a Inibidores da Enzima DPP-4. In: VIII ESCOLA DE MODELAGEM MOLECULAR EM SISTEMAS BIOLÓGICOS, 2016, PETRÓPOLIS. VIII ESCOLA DE MODELAGEM MOLECULAR EM SISTEMAS BIOLÓGICOS, 2016.

11.
SCOTT, L. P. B. ; PANTALEAO, S. Q. ; Philot, E. A. ; Lima, A N. ; HONORIO, K. M. . Functional Movements and Conformational Changes of dipeptidil peptidase-4 (DPP-4) related with biding sites and ligands. In: ongress of Theoretical Chemists of Latin Expression - Quitel 2016, 2016, Montevideo. QUITEL 2016, 42nd International Congress of Theoretical Chemists of Latin Expression, 6102. v. i.

12.
MOREIRA, C. ; SCOTT, L. P. B. . Development a Predictor of Aggregation-protein using Supporting Vector Machine. In: X-Meeting 2016 - 12th International Conference of the Brazilian Association of Bioinformatics and Computational Biology (AB3C), 2016, Belo Horizonte. X-Meeting 2016 - 12th International Conference of the Brazilian Association of Bioinformatics and Computational Biology (AB3C), 2016. v. 1.

13.
CONTO, V. ; BRAZ, A. S. K. ; SCOTT, L. P. B. ; MELLO, P. H. ; COUTINHO-NETO, M. . IMPACT OF PROTEIN FLEXIBILITY IN THE SUBSTRATE CLEAVAGE OF HIV-PR EVALUATED USING NORMAL MODES AND DENSITY FUNCTIONAL THEORY. In: 23rd Congress of the International Union for Biochemistry and Molecular Biology (IUBMB) and 44th Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology (SBBq), 2015, Foz do Iguaçu. 23rd Congress of the International Union for Biochemistry and Molecular Biology (IUBMB) and 44th Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology (SBBq), 2015. v. I. p. 147-147.

14.
Lima, A N. ; BRAZ, A. S. K. ; Perahia, D. ; OLIVEIRA, R. J. ; SCOTT, L. P. B. . STUDY OF AGGREGATION MODELS OF PrPSc USING MOLECULAR DYNAMICS WITH EXCITED NORMAL MODES AND COARSEGRAINED. In: SBBa and IUBMB 2015 abstrct book, 2015, Foz do Iguaçu. SBBq and IUBMB 2015, 2015. v. I.

15.
CONTO, V. ; BRAZ, A. S. K. ; SCOTT, L. P. B. ; COUTINHO-NETO, M. ; MELLO, P. H. . STRUCTURE ENSAMBLE GENERATED FROM NMA REVEALED DISTINCT MOTION PATTERNS FOR HIV-1 PROTEASE ENZYME ACTIVE CYCLE. In: SBBq and IUBMB 2015, 2015, Foz do Iguaçu. SBBq and IUBMB 2015 abstract book, 2015. v. 1.

16.
ARAUJO, G. C. ; Silva, R H T ; SCOTT, L. P. B. ; OLIVEIRA, R. J. ; SOUZA, F. P. . Analysis of RSV SH Protein Viroporin Function by Molecular Dynamics and Normal Modes. In: SBBq and IUBMB 2015, 2015, Foz do Iguaçu. SBBq and IUBMB 2015 abstract book, 2015. v. 1.

17.
TEIXEIRA, T. ; ARAUJO, G. ; SCOTT, L. P. B. ; SOUZA, F. P. . STRUCTURAL AND FUNCTIONAL ANALYSES OF M2-1 PROTEIN FOR PHARMACOPHORE MODEL DESIGN BY BIOINFORMATICS TOOLS.. In: SBBq and IUBMB 2015, 2015, Foz do Iguaçu. SBBQ and IUBMB 2015, 2015. v. 1.

18.
RESENDE-LARA, P. ; SCOTT, L. P. B. ; BRAZ, A. S. K. . CONFORMATIONAL ENTROPY CHANGES IN NERVE GROWTH FACTOR INTERACTION WITH TRKA RECEPTOR. In: SBBQ and IUBMB 2015, 2015, Fos do Iguaçu. SBBQ and IUBMB 2015 - Abstract book, 2015. v. 1.

19.
RESENDE-LARA, P. ; Perahia, D. ; SCOTT, L. P. B. ; BRAZ, A. S. K. . Normal Modes Analysis of Human Nerve Growth Factor and its Receptors. In: Reunião Anual da SBBq 2014, 2014, Foz do Iguaçu. Reunião Anual da SBBq 2014, 2014.

20.
CONTO, V. ; BRAZ, A. S. K. ; SCOTT, L. P. B. ; Perahia, D. ; COUTINHO-NETO, M. ; MELLO, P. H. . Effects of the Presence of Substrates, Products and Catalytic Water in HIV1 Protease Flexibility by NMA. In: Reunião SBBq 2014, 2014, Foz do Iguaçu. Reunião SBBq 2014, 2014.

21.
BRAZ, A. S. K. ; Tufanetto, P ; Perahia, D. ; SCOTT, L. P. B. . Flexibility study of HIV1 Tat, Normal Modes Analysis. In: Reunião SBBq 2014, 2014, Foz do Iguaçu. Reunião SBBq 2014, 2014.

22.
Lima, A N. ; BRAZ, A. S. K. ; Perahia, D. ; SCOTT, L. P. B. . Transition between PrPC and PrPSc in monomers and trimers studied by Normal Modes Analysis and Activated Molecular Dynamics simulations. In: X-Meeting 2014, 2014, Belo Horizonte. Proc. of The third International Society for Computational Biology Latin America X-Meeting on Bioinformatics with BSB and SoiBio (ISCB-Latin America 2014), 2014.

23.
BRAZ, A. S. K. ; CONTO, V. ; Perahia, D. ; SCOTT, L. P. B. . HiV-1 protease double mutants analysis by NMA indicates convergence to flexibility of the wild type. In: 9th European Biophysics Congress, 2013, Lisboa. European Biophysical Journal, 2013. v. 42. p. S174-S174.

24.
Lima, A N. ; BRAZ, A. S. K. ; Perahia, D. ; COSTA, M. ; SCOTT, L. P. B. . Transition between PrPC and PrPSc studied using normal modes analysis and excited molecular dynamics. In: 9th European Biophysics Congress, 2013, Lisboa. European Biophysical Journal, 2013. v. 42. p. S178-S178.

25.
Silva, R H T ; COUTINHO-NETO, M. ; ALVES, W. ; LIBERATO, M. ; Luis P B Scott . tudy of Self-Assembly of Arg−Phe Nanostructures. In: Encontro da SBBq 2013, 2013, Foz do Iguaçu. Anais do Encontro da SBBq 2013, 2013.

26.
Angélica Lima ; Eric Phillot ; Silva, R H T ; Braz, A. S. ; SCOTT, L. P. B. . A NEW APPROACH FOR DOCKING MOLECULAR: THE SECOND AND THIRD VERSION OF GANM. In: XLI Anual Meeting of SBBq, 2012, Foz do Iguaçu. XLI Anual Meeting of SBBq, 2012.

27.
Eric Phillot ; David Perahia ; BRAZ, A. S. K. ; SCOTT, L. P. B. . INVESTIGATING THE FLEXIBILITY OF HUMAN THIOREDOXIN 1 USING NORMAL MODES ANALYSIS. In: XLI Anual Meeting of SBBq, 2012, Foz do Iguaçu. XLI Anual Meeting of SBBq, 2012.

28.
Tufanetto, P ; BRAZ, A. S. K. ; SCOTT, L. P. B. ; David Perahia . FLEXIBILITY STUDY OF HIV-1 PROTEASE MUTANTS OF POSITIVELY SELECTED MUTANTS, NORMAL MODES ANALYSIS. In: XLI Anual Meeting of SBBq, 2012, Foz do Iguaçu. XLI Anual Meeting of SBBq, 2012.

29.
GOMES, D. H. ; Perahia, D. ; Bisch, P .M. ; PASCUTTI, P. G. ; SCOTT, L. P. B. . DEVELOPMENT OF A FULLY FLEXIBLE PROTEIN-PROTEIN DOCKING METHOD COMBINING NORMAL MODES AND GENETIC ALGORITHM. In: XLI Anual Meeting of SBBq, 2012, Foz do Iguaçu. XLI Anual Meeting of SBBq, 2012.

30.
SCOTT, L. P. B. ; Stelle, D. ; Barioni, C. M. . Identifying folding rules for proteins: relating the secondary structures of proteins and hydrophobicity patterns. In: XI European Symposium of the Protein Society, 2011, Estocolmo. WXI European Wonders and Disatres of The Protein World, 2011. v. I. p. 33-33.

31.
SCOTT, L. P. B. ; Godoy, W. . Using Normal Modes Analysis and Molecular Dynamics to investigate amyloid peptides and senile plaques. In: IX European Symposium of the Protein Society, 2011, Estocolmo. Wonders and Disatres of The Protein World, 2011. v. 1. p. 68-68.

32.
SCOTT, L. P. B. ; Philot, E. A. ; Lima, A N. ; David Perahia ; Braz, A. S. . GANM: A new protein-ligand docking approach based on genetic algorithm and normal modes. In: IX European Symposium of the Protein Society, 2011, Estocolmo. Wonders and Disatres of The Protein World, 2011. v. 1. p. 33-33.

33.
Godoy, W. ; SCOTT, L. P. B. . Analyzying Alzheimer´s amyloids with molecular dynamics and normal modes. In: XVI Simpósio Brasileiro de Química Teórica, 2011, Ouro Preto. Livro de Resumos: XVI Simpósio Brasileiro de Química Teórica, 2011. v. 1. p. 75-75.

34.
GOMES, D. H. ; PASCUTTI, P. G. ; David Perahia ; Bisch, P .M. ; SCOTT, L. P. B. . Protein-protein Docking using normal modes and genetic algorithm. In: XVI Simpósio Brasileiro de Química Teórica, 2011, Ouro Preto. Livro de Resumos - XVI Simpósio Brasileiro de Química Teórica, 2011. p. 186-186.

35.
Angélica Lima ; Eric Phillot ; Silva, R H T ; BRAZ, A. S. K. ; SCOTT, L. P. B. . GANM-methodology to introduce the flexibility of protein using genetic algorithm in protein docking. In: XVI Simpósio Brasileiro de Química Teórica, 2011, Ouro Preto. Livro de Resumos -XVI Simpósio Brasileiro de Química Teórica, 2011. p. 240-240.

36.
Patrícia Tuferatto ; BRAZ, A. S. K. ; SCOTT, L. P. B. . Analyses of the Inhibitor-active site binding of the HIV-1 Protease (Human Immunodeficiency Virus -1-M) in cases od strutcure and/or functional mutations. In: Simpósio Interdisciplinar Física+Bioinformática 2011, 2011, São José do Rio Preto. Programa e Livro de Resumos: Simpósio Interdisciplinar Física+Bioinformática 2011, 2011.

37.
Stelle, D. ; Barioni, C. M. ; SCOTT, L. P. B. . Identifing relationship between the secondary structures of proteins and hidrophobicity patterns present in the primary structure. In: Reunião da SBBq, 2011, Foz do Iguaçu. LIvro de REsumos da Reunião Aniual da SBBq, 2011.

38.
Silva, R H T ; Yamagushi, M. E. B ; Vitor Barbanti Pereira Leite ; CHAHINE, Jorge ; SCOTT, L. P. B. . Hydrophobicity effect on protein evolution. In: Reunião Anual da SBBq, 2011, Foz do Iguaçu. LIvro de Resumos da Reunião Aniual da SBBq, 2011.

39.
Eric Phillot ; Lima, A N. ; ARAUJO, A. P. ; BRAZ, A. S. K. ; SCOTT, L. P. B. . Developing a methodology for protein-ligand docking based on genetic algorithm and rotamer library. In: Reunião Anual da SBBq, 2011, Foz do Iguaçu. LIvro de Resumos da Reunião Aniual da SBBq, 2011.

40.
SCOTT, L. P. B. ; Perahia, D. ; Angélica Lima ; Eric Phillot . Methodological developments based on genetic algorithm and normal mode analysis for performing protein-ligand and protein-protein simulations. In: ISCB Latin America 2010, 2010, Montevideo. ISCB Latin America 2010.

41.
SCOTT, L. P. B. ; TISSUER, P. ; Faria, A. . A Study of Hydrophobic Effect on the protein Folding Using Monte Carlo in 2D and Cubic Lattice. In: ISCB Latin America 2010, 2010, Montevideo. ISCB Latin America 2010, 2010.

42.
SCOTT, L. P. B. ; Eric Phillot ; Angélica Lima . Using genetic algorithms and rotamer library to investigate protein-ligand docking. In: ISCB Latin America, 2010, Montevideo. ISCB Latin America 2010, 2010.

43.
SCOTT, L. P. B. ; Barioni, C. M. ; Stelle, D. . Applying data mining to investigate the protein folding and etrxact rule of rometion of secondary structure. In: ISCB - Latin America 2010, 2010, Montevideo. ISCB Latin America. Montevideo: ISCB, 2010.

44.
razante, H. ; BRAZ, A. S. K. ; SCOTT, L. P. B. . Protein Data Integration for Phylogenetic data Mining. In: ISCB Latin America 2010, 2010, Montevideo. ISCB Latin America 2010, 2010.

45.
SCOTT, L. P. B. ; Philot, E. A. ; Lima, A N. ; Perahia, D. . Developing a methodology for protein-ligand docking based on genetic algorithm and normal modes. In: 9a European Conference on Computational Biology -2010, 2010, Ghent - Bélgica. European Conference on Computational Biology 2010, 2010.

46.
Stelle, D. ; SCOTT, L. P. B. ; Barioni, C. M. . Using data mining to identify structural rules in proteins. In: 9 European Conference on Computational Biology, 2010, gHENT. eccb 2010, 2010.

47.
Angélica Lima ; Eric Phillot ; SCOTT, L. P. B. . COMBINING GENTEIC ALGORITHMS AND ROTAMER LIBRARY TO INVESTIGATE PROTEIN-LIGAND DOCKING. In: VII CONGRESSO IBERO AMERICANO DE BIOFÍSICA 2009, 2009, BÚZIOS. VII CONGRESSO IBERO AMERICANO DE BIOFÍSICA 2009, 2009.

48.
SCOTT, L. P. B. ; CHAHINE, Jorge ; RUGGIERO, José Roberto . Predicting Protein Using Genetic Algorithms and Rotamer Library. In: XXXVII Latin American School of Physics, 2006, São José do Rio Preto. Anais da XXXVII Latin American School of Physics, 2006. v. I. p. 19-19.

49.
SCOTT, L. P. B. ; CHAHINE, Jorge ; RUGGIERO, José Roberto . Using Neural Networks MLP to predict the Secondary Structure of Proteins. In: In-silico analysis of proteins: Celbreting the 20th anniversary of Swiss-Prot, 2006, Fortaleza. Proceedings of In-silico analysis of proteins: Celbreting the 20th anniversary of Swiss-Prot, 2006. v. 1.

50.
CHAHINE, Jorge ; SCOTT, L. P. B. ; RUGIERO, José Roberto . . Secondary Structure Predition of Peptides Using Genetic Algorithm with a Solvation Potential.. In: Workshop on Molecular Modeling in Biophysics - Methods and Applications - Satellite meeting of the 2002 IUPAB International Biophysics Congress, 2002, Rio deJaneiro. Workshop on Molecular Modeling in Biophysics - Methods and Applications - Satellite meeting of the 2002 IUPAB International Biophysics Congress, 2002. p. 22-22.

51.
SCOTT, L. P. B. ; PONTES, Michael . Controle de Acesso e Reconhecimento de voz utilizando redes neurais. In: CIP- 2000, 2000, São José do Rio Preto - SP. Anais do CIP 2000, 2000. v. I.

52.
CHAHINE, Jorge ; SCOTT, L. P. B. ; RUGGIERO, José Roberto . Desenvolvimento de Software para Simulação e Animação em Física. In: 17o. Colóquio de Incentivo à Pesquisa, 1990, São José do Rio Preto. 17o. Colóquio de Incentivo à Pesquisa, 1990. p. 87-87.

53.
CHAHINE, Jorge ; RUGGIERO, José Roberto ; SCOTT, L. P. B. . Simulação e Visualização de um Polímero. In: : II Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 1990, Botucatu. Congresso de Iniciação Científica - UNESP, 1990. p. 26-26.

Apresentações de Trabalho
1.
ANA LíGIA SCOTT . Studies about Conformational Changes and Functional Movements using Full-Atom model combined with Coarse-Grained and QM/MM. 2018. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

2.
ANA LIGIA SCOTT . Integrating Models all-toms and cooarse grained to study movements in proteins. 2018. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

3.
ANA LíGIA SCOTT ; PANTALEAO, S. Q. ; HONÓRIO, K. . Structural Dynamics of DPP-4 and its influence on the projection of inhibitors. 2018. (Apresentação de Trabalho/Outra).

4.
SCOTT, L. P. B. ; Perahia, D. ; Lima, A N. ; COSTA, M. . pH and aggregation effects in the convesrsion of human prion into scrapie form: a study suing Molecular Dynamics with excited Normal Modes. 2017. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

5.
PANTALEAO, S. Q. ; Lima, A N. ; Philot, E. A. ; SCOTT, L. P. B. ; HONORIO, K. M. . STRUCTURAL ANALYSIS OF THE BIOLOGICAL TARGET DIPEPTIDYL PEPTIDASE-4 (DPP-4) RELATED TO TYPE II DIABETES MELLITUS TREATMENT. 2017. (Apresentação de Trabalho/Outra).

6.
PANTALEAO, S. Q. ; Lima, A N. ; Philot, E. A. ; SCOTT, L. P. B. ; HONÓRIO, K. . Análise de Propriedade Farmacocinéticas do Inibidor N7F para a enzima DDP-4. 2017. (Apresentação de Trabalho/Outra).

7.
Philot, E. A. ; MORO, P. ; OLIVEIRA, R. J. ; SCOTT, L. P. B. . USING STRUCTURE-BASED MODEL AND NORMAL MODE ANALYSIS TO INVESTIGATE SOD 1 AGGREGATION. 2017. (Apresentação de Trabalho/Outra).

8.
SCOTT, L. P. B. ; Lima, A N. ; OLIVEIRA, R. J. ; Perahia, D. ; COSTA, M. . PH AND AGGREGATION EFFECTS IN THE CONVERSION OF HUMAN PRION INTO SCRAPIE FORM: A STUDY USING MOLECULAR DYNAMICS WITH EXCITED NORMAL MODES. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

9.
SCOTT, L. P. B. ; PANTALEAO, S. Q. ; Philot, E. A. ; Lima, A N. ; HONÓRIO, K. . Functional Movements and Conformational Changes of dipeptidil peptidase-4 (DPP-4) related with biding sites and ligands. 2016. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

10.
SCOTT, L. P. B. . Studying functionally relevant structural changes and global motions in proteins. 2015. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

11.
SCOTT, L. P. B. . Modelagem e simulação de mecanismos moleculares e da interação de fármacos com proteínas. 2015. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

12.
SCOTT, L. P. B. . Studying functionally relevant structural changes and global motions in proteins. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

13.
SCOTT, L. P. B. ; GOMES, D. H. ; PASCUTTI, P. G. ; Bisch, P .M. . Protein-protein docking interaction taking account global conformational changes. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

14.
Philot, E. A. ; Perahia, D. ; SCOTT, L. P. B. ; BRAZ, A. S. K. . Flexibility of Thioredoxin 1 and new binding sites using Normal Modes Analyses. 2013. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

15.
GOMES, D. H. ; SCOTT, L. P. B. ; PASCUTTI, P. G. ; Bisch, P .M. ; David Perahia . Deveopment of a fully Flexible Protein-Protein Docking method combining Normal Modes and Genetic Algorithm. 2012. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

16.
GOMES, D. H. ; SCOTT, L. P. B. ; PASCUTTI, P. G. ; Bisch, P .M. ; Perahia, D. . Protein-Protein docking using normal modes and genetic algorithm. 2011. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

17.
Angélica Lima ; Eric Phillot ; SCOTT, L. P. B. ; BRAZ, A. S. K. ; Perahia, D. . THE SECOND AND THIRD VERSION OF GANM: AN APPROACH FOR MOLECULAR DOCKING. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

18.
SCOTT, L. P. B. ; TISSUER, P. ; Faria, A. . A study of hydrophobic Effect in Real sequences using Monte Carlo and HP Model. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

19.
Stelle, D. ; SCOTT, L. P. B. ; Barioni, C. M. . Develping a software to extract rule for the formation of secondary strutucture. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

20.
Stelle, D. ; SCOTT, L. P. B. ; Barioni, C. M. . Using Data mining to identify Hydrophobicity Patterns and sequences motifs in proteins classes. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

21.
SCOTT, L. P. B. ; CHAHINE, Jorge . Design of protein Sequence with Genetic Algorithms. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

22.
SCOTT, L. P. B. ; CHAHINE, Jorge . A Surdy of Hydrophobic effect on The Protein Folding using Monte Carlo. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

23.
SCOTT, L. P. B. . Técnicas de Predição de Estruturas de Proteínas. 2008. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

24.
SCOTT, L. P. B. . Predicting Peptides Structure with Solvation Potential and Rotamer. 2007. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

25.
SCOTT, L. P. B. ; CHAHINE, Jorge . Application of Genetic Algorithms to modeling and design of proteins. 2007. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

26.
SCOTT, L. P. B. ; Joselisa Paiva . . Estudo de Aplicação de Diferentes Arquiteturas de Redes Neurais Artificiais no Diagnóstico de Propensão à Doenças Cárdiacas. 2007. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

27.
SCOTT, L. P. B. ; CHAHINE, Jorge . Prediction of Pepetides Structure Using Genetic Algorithms and Rotamer Library Dindependent fo Backbone. 2007. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

28.
CHAHINE, Jorge ; SCOTT, L. P. B. ; RUGGIERO, José Roberto . Predicting Protein using Genetic Algorithms and Rotamer Library. 2006. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

29.
CHAHINE, Jorge ; RUGGIERO, José Roberto ; SCOTT, L. P. B. . Using Neural Networks MLP to predict the Secondary Structure of Proteins. 2006. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

30.
SCOTT, L. P. B. ; CHAHINE, Jorge ; RUGGIERO, José Roberto . Prediction of Peptides Structure using Genetic Algorithms. 2004. (Apresentação de Trabalho/Outra).

31.
SCOTT, L. P. B. . Técnicas de Predição de Estruturas Protéicas. 2003. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

32.
SCOTT, L. P. B. . Ferramentas de Bioinformática aplicadas à Química. 2002. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

33.
SCOTT, L. P. B. . Introdução à Bioinformática. 2002. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

34.
SCOTT, L. P. B. . Bioinformática e o Genoma Estrutural. 2001. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

35.
SCOTT, L. P. B. . Aplicações de Redes Neurais e Algoritmos Genéticos na Predição de Estruturas Terciárias de Proteínas. 2001. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

36.
SCOTT, L. P. B. . Bioinformática: análise de banco de dados genéticos e estudo de estruturas de macromoléculas. 2001. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

37.
SCOTT, L. P. B. . Bioinformáitca. 2001. (Apresentação de Trabalho/Outra).

38.
SCOTT, L. P. B. . Aplicação de Geometria Analítica em Computação Gráfica. 2000. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

39.
SCOTT, L. P. B. . Projeto e Desenvolvimento de Sistemas para Web. 1999. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

40.
SCOTT, L. P. B. . Introdução à Computação Gráfica. 1994. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

Outras produções bibliográficas
1.
SCOTT, L. P. B. . Mini- Curso: Modelos e técnicas para predição de estruturas de proteínas. 2008 (Material Didático).

2.
SCOTT, L. P. B. . A Importância da Bioinformáitca 2004 (Artigo Eletrônico).

3.
SCOTT, L. P. B. ; BOTTARO, Leonardo ; QUEIROZ, Patrícia Ferreira . Curso Introdutório à Bioinformática 2003 (Material Didático).


Produção técnica
Assessoria e consultoria
1.
SCOTT, L. P. B. . Desenvolvolvimento e Implantação de um Sistema Cliente Servidor. 1995.

Programas de computador sem registro
1.
SCOTT, L. P. B. ; FOGO, Cleber Pressunto . CD PARA ENSINO E TREINAMENTO EM UML. 2004.

2.
SCOTT, L. P. B. ; BOTTARO, Leonardo ; QUEIROZ, Patrícia Ferreira . CD-ROM PARA ENSINO E TREINAMENTO EM BIOINFORMÁTICA. 2003.

3.
SCOTT, L. P. B. . YODA. 2003.

4.
SCOTT, L. P. B. . Formatador. 2002.

5.
SCOTT, L. P. B. . Composer. 2002.

6.
SCOTT, L. P. B. . Modelador de Sólidos. 1993.

Processos ou técnicas
1.
SCOTT, L. P. B. . Nina: Um método para modelagem e desenvolvimento orientado a objetos de websites. 2000.

Trabalhos técnicos

Demais tipos de produção técnica
1.
SCOTT, L. P. B. . Introdução à Bioinformática. 2002. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

2.
SCOTT, L. P. B. . Introdução à Bioinformática e Banco de Dados GenétiCOS. 2002. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

3.
SCOTT, L. P. B. . Introdução aos Conceitos e Técnicas de Computação Gráfica. 1997. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

4.
SCOTT, L. P. B. . Redes Neurais Artificiais. 1997. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

5.
SCOTT, L. P. B. . Redes Neurais Artificiais. 1997. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

6.
SCOTT, L. P. B. . Introdução aos Conceitos e Técnicas de Computação Gráfica. 1997. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

7.
SCOTT, L. P. B. . Programação Orientada a Objetos. 1996. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

8.
SCOTT, L. P. B. . Projeto de Sistemas de Tempo Real. 1995. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

Demais trabalhos
1.
SCOTT, L. P. B. ; BOTARO, Leonardo ; QUEIROZ, Patrícia Ferreira . Estudo de Ferramentas e Softwares de Boinformática. 2002 (PESQUISA) .

2.
SCOTT, L. P. B. . Simulação e animação de redes e padrões de drenagem. 1995 (Demais trabalhos relevantes) .



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
SCOTT, L. P. B.; HONORIO, K. M.; IMOTO, H. T.. Participação em banca de João Paulo Machado Martins. Triagem vistual de inibidoes da enzima di-hidrofolato redutase de Schistosoma Mansoni (SmDHFR). 2017. Dissertação (Mestrado em Fármacos e Medicamentos) - Universidade de São Paulo.

2.
FONTES, M. R. M.; TAKEDA, A. A. S.; SCOTT, L. P. B.. Participação em banca de Fábio Filippi Matioloi. Um nova metodologia in silico para predição de complexos flexíveis entre proteínas: estudo de caso para inibidores plasmáticos de fosfolipase A2 de serpentes. 2016. Dissertação (Mestrado em Biologia Geral e Aplicada) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

3.
OLIVEIRA, R. J.; BRITO, B. G. A.; SCOTT, L. P. B.. Participação em banca de Pâmela Aparecida Cândido. Modelos Teóricos Simplificados Aplicados no Desenvolvimento de Proteínas para Diagnósticos e Imunoterapia de Alergia Respirtaório. 2016. Dissertação (Mestrado em Progrma Multicêntrico em Química de Minas Gerais) - Universidade Federal do Triângulo Mineiro.

4.
CORDEIRO, R. M.; BRAZ, ANTÔNIO S.K.; SCOTT, L. P. B.; ITRI, R.. Participação em banca de Antenor José Paulista. Simulação dos produtos de Oxidação do Colesterol em Bicamadas Lipídicas. 2015. Dissertação (Mestrado em Pós-Graduação em Ciência e Tecnologia/Química) - Universidade Federal do ABC.

5.
SCOTT, L. P. B.; SUYAMA, R.; OLIVEIRA, R. J.. Participação em banca de Raphael Agostin Cristofaro. Implementação da terceira versão da ferramenta GANM: considerando o ligante flexivel. 2014. Dissertação (Mestrado em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC.

6.
HONÓRIO, K.; TROSSINI, G. H. G.; SCOTT, L. P. B.. Participação em banca de Simone Queiroz Pantaleão. Análise das Relações entre a Estrutura e Atividade de Compostos Empregados no Tratamento de Diabete mllitus Tipo II. 2014. Dissertação (Mestrado em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC.

7.
SOUZA, F. P.; ARAUJO, A. S.; SCOTT, L. P. B.. Participação em banca de GABRIELA CAMPOS DE ARAUJO. ESTUDO DA ESTRUTURA DA PROTEÍNA SH DO VÍRUS SINCICIAL RESPIRATÓRIO HUMANO: ANÁLISE FUNCIONAL DA ESTRUTURA PENTAMÉRICA POR FERRAMENTAS DE BIOINFORMÁTICA. 2013. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

8.
KIHARA, A.; BUZATO, C. B. C.; SCOTT, L. P. B.. Participação em banca de Guilherme Vilar Higa. Possível Relação entre Acoplamento Celular na Neurodegeneração da Retina. 2012. Dissertação (Mestrado em Fisiologia) - Universidade de São Paulo.

9.
TINOS, R.; VENCIO, R. Z. N.; SCOTT, L. P. B.. Participação em banca de Luis Henrique Uchida Ishivatari. Função de avaliação dinâmica em algoritmos genéticos aplicados na predição de estruturas tridimensionais de proteínas. 2012. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

10.
CORNELIO, M. L.; RUGGIERO, José Roberto; SCOTT, L. P. B.. Participação em banca de DANIEL INOUE KOGA. ANÁLISE VIBRACIONAL DO X-TOCOFEROL. 2010. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

11.
CHAHINE, Jorge; Araujo; RUGGIERO, José Roberto; SCOTT, L. P. B.. Participação em banca de Denise Cavalcante de Melo. Estruturação do Eumenine mastparano por Dinâmica Molecular em misturas de TFE -água. 2007. Dissertação (Mestrado em Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista.

12.
OKI, N.; VILLARREAL, D. M. O.; SCOTT, L. P. B.. Participação em banca de Raynner Antonio Toschi Silva. Éris- Sistema de Acompanhamento e Monitoramento Climático e Meterorológico. 2006. Dissertação (Mestrado em Engenharia Elétrica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Teses de doutorado
1.
ALENCAR, A. M.; COUTINHO, K. R.; HENRIQUES, V. B.; GALVAO, D. S.; SCOTT, L. P. B.. Participação em banca de Alexandre Barros de Almeida. Gotas e pontes capilares na escala nanométrica. 2017. Tese (Doutorado em Doutoramento em Física) - Universidade de São Paulo.

2.
LAMKE, N.; SCOTT, L. P. B.; MAGRO, A. J.; BERTOLINI, M. C.; CARVALHO, R. F.. Participação em banca de Marcos Tadeu Geraldo. Caracterização in silico dos mecanismos de interação entre sequências de localização nuclear e Importina-alfa. 2016. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

3.
RUGIERO, José Roberto; PAIVA, P. B.; FALCAO, P. R. K.; SCOTT, L. P. B.; SOUZA, F. P.. Participação em banca de Flavio Almeida Curvelo dos Anjos. Predição de sítios de ligação para cisplatina e transplatina baseada em ligações de hidrogênio. 2015. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

4.
THIEMANN, O. H.; ABREGO, J. R. B.; NASCIMENTO, A. S.; MASCARENHAS, Y. P.; SCOTT, L. P. B.. Participação em banca de Daiana Evelin Martil. Estudos Estruturais da Seril-tRNA Sintetase nativa e em interação com tRNAs cognatos de Trypanosoma brucei. 2014. Tese (Doutorado em Fisica Biomolecular) - Universidade de São Paulo.

5.
RUGIERO, José Roberto; Calir,i A.; OLIVEIRA, L. C.; SCOTT, L. P. B.. Participação em banca de Gisele Baldissera. Estudo das Interações de Peptídeos Antimicrobianos e Sistemas MIméticos de Membrana por Dinâmica Molecular. 2014. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

6.
Vitor Barbanti Pereira Leite; ARAUJO, A. P.; ALVES, N. A.; SCOTT, L. P. B.; RUGGIERO, José Roberto. Participação em banca de Ronaldo Junior de Oliveira. Estudo do Coeficiente de Difusão no Enovelamento de Proteína. 2011. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

7.
Vitor Barbanti Pereira Leite; Calir,i A.; Michel Eduardo Beleza Yamagish; Sidney Jurado de Cravalho; SCOTT, L. P. B.. Participação em banca de RICARDO HIDELBRAND THEODORO DA SILVA. Efeitos de Hidrofobicidade em evolução da proteína. 2009. Tese (Doutorado em Fisica (Sjrp)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Qualificações de Mestrado
1.
SATO, J.; SCOTT, L. P. B.; ZAMPIROLLI, F.. Participação em banca de Wagner Lopes Moreira Junior. Uma Nova Abordagem de Descritor de Textura Baseada em Transformada Ripplet para Classificação de Lesões Mamográficas. 2017. Exame de qualificação (Mestrando em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC.

2.
KLEINSCHMIDT, J. H.; SCOTT, L. P. B.; KAMIENSKI, C. A.. Participação em banca de Andrea Garcia Trindade. Análise, Modelagem e Predição de Eeventos em Praças Digitais. 2017. Exame de qualificação (Mestrando em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC.

3.
FAVERO, P. B.; CHANG JUNIOR, J.; SCOTT, L. P. B.. Participação em banca de Edcleisson Martinez Zanardi,. Assitência ao Atendimento Pré-Hospitalar com Sistemas Especialistas. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC.

4.
FRAGA, F.; SCOTT, L. P. B.; SATO, J.. Participação em banca de Claudemiro Vigo Noya. Proposta de uma Metodologia para Obtenção de Potenciais Evocados e Análise de Filtro Sensório-Motor em Pacientes com Esquizofrenia. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC.

5.
NASCIMENTO, M. Z.; SCOTT, L. P. B.. Participação em banca de Ricardo Agostinho de Rezende Junior. Quatificação de tecidos histológicos da próstata com dimensao fractal colorida. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC.

6.
YAGUI, C. O. R.; SCOTT, L. P. B.; MALTAROLLO, V.. Participação em banca de Juliana Gallottini de Magalhães. Busca Virtual de agonistas enviesados não peptídicos do receptor angiotensina II do Tipo 1. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em Fármacos e Medicamentos) - Universidade de São Paulo.

7.
SCOTT, L. P. B.; BRAZ, A. S. K.; KLEINSCHIMIDT, J. H.. Participação em banca de André Kliousoff Junior. Investigando Padrões em Proteínas com Regiões de Desordem por mei ode Mineração de Dados. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC.

8.
HONÓRIO, K.; TROSSINI, G. H. G.; GALVAO, A. C. S. S.; SCOTT, L. P. B.. Participação em banca de Sheila Cruz Araujo. Estratégias de Modelagem Molecular para Estudo de Compostos com Afinidade pelo REceptor TGFbRI/ALK-5. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC.

Trabalhos de conclusão de curso de graduação
1.
SCOTT, L. P. B.; SILVA JUNIOR, E. C.; Silva, D.D.. Participação em banca de Gracieli Begia Mateus.Desenvolvimento de Aplicações para Telefones Celulares. 2006. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA.

2.
SCOTT, L. P. B.; Silva, D.D.; SILVA JUNIOR, E. C.. Participação em banca de Danilo César Pereira.Processamento de Imagens Mamográficas Através de Filtros de Suavização no Espaço de Frequência. 2006. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA.

3.
SCOTT, L. P. B.; Silva, D.D.; SILVA JUNIOR, E. C.. Participação em banca de Élcio Capóia Júnior.Processamento de Imagens Digitais: Uma Abordagem Direcionada a Rotinas de Segmentação. 2006. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA.

4.
SCOTT, L. P. B.; Silva, D.D.; MENECHELLI, Fenrando Bermejo. Participação em banca de Elis Cristina Monotoro Hernandes.PSP & XP: Proposta de melhoria na Qualidade de Desenvolvimento de Softwares. 2006. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA.

5.
SCOTT, L. P. B.; Silva, D.D.; MENECHELLI, Fenrando Bermejo. Participação em banca de Danilo Monco.Aplicações de Padrões de Projeto em C#. 2006. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA.

6.
SCOTT, L. P. B.; Silva, D.D.; MENECHELLI, Fenrando Bermejo. Participação em banca de Valquiria Trivelato.Banco de Dados Multimídia e suas Aplicações em processamento de Imagens. 2006. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA.

7.
SCOTT, L. P. B.; SILVA JUNIOR, E. C.; Silva, D.D.. Participação em banca de Ever Augusto de Catsro Borges Chemin.Inteligência Artificial e Integração com um Sistema de Controle Utilizando Recursos de Java. 2006. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA.

8.
SCOTT, L. P. B.. Participação em banca de Armando Raposo Neto.Controlador de Fluxo de Veículos. 2004. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA.

9.
SCOTT, L. P. B.. Participação em banca de André de Souza Tarallo.Controle Remoto para Exibir PowerPoint. 2004. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA.

10.
SCOTT, L. P. B.. Participação em banca de Marcos Fernando Gonçalves Nunes.Linguagens de Programação para Internet. 2004. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA.

11.
SCOTT, L. P. B.. Participação em banca de Marcio Fernando da Silva.O Aspecto Jurídico no Meio Eletrônico Brasileiro.. 2004. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA.

12.
SCOTT, L. P. B.. Participação em banca de Rafael Biazetto Ayusso Fernandes.Qualidade de Software e a Importância para o Sucesso. 2004. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências da Computação) - Centro Universitário de Rio Preto.

13.
Crepaldi H.; SCOTT, L. P. B.. Participação em banca de Helton Crepaldi.Firewalls como Alternativa para Segirança em Redes. 2004. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências da Computação) - Centro Universitário de Rio Preto.

14.
SCOTT, L. P. B.. Participação em banca de Evandro Luis Pinotti.Redes Wireless:Tecnologis e Segurança- Estudo sobre a Rede Wireless Municipal. 2004. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências da Computação) - Centro Universitário de Rio Preto.

15.
SCOTT, L. P. B.. Participação em banca de Alexandre Shinji Muramatsu.UNIRP VIrtual - Um Sistema de Infomação geográfica para a Unidade III da Unirp. 2004. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências da Computação) - Centro Universitário de Rio Preto.

16.
KANESAKI, A. H.; SCOTT, L. P. B.. Participação em banca de Adriano Hideiki kanesaki.Passeio Virtual Envolvendo Sistem de Informação Geográfica. 2004. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências da Computação) - Centro Universitário de Rio Preto.

17.
SCOTT, L. P. B.; SERAPHIM, Enzo; PEREIRA, Aledir Silveira. Participação em banca de Sayuri Watanabe.Consulta por Similaridade em Imagens de Tumores Malignos de Mama. 2003. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Ciências da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

18.
SCOTT, L. P. B.; AZEVEDO JR, Wlater Figueira de; CARLSON FILHO, Carlos Magnus. Participação em banca de Guilherme Eberhart Jorge.Prot GIG- Ferramenta WEB apliacda à construção de gáficos macromleculares para publicação e ensino. 2003. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Ciências da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

19.
SCOTT, L. P. B.; PEREIRA, Aledir Silveira; SERAPHIM, Enzo. Participação em banca de Sayuri Watanabe.Suporte ao Diagnóstico de Cãncer de Mama através de Consulta por Similaridade. 2003. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Ciências da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

20.
SCOTT, L. P. B.. Participação em banca de Anna Júlia Herandes Chamas.Banco de Dados Distribuídos: Conceitos. 2003. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA.

21.
SCOTT, L. P. B.. Participação em banca de Ricardo Alexandre Simões Singhi.Bulk Loading para Estruturas Métricas de Indexação.. 2003. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Ciências da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

22.
SCOTT, L. P. B.. Participação em banca de Flávio Henrique Gatto.Computação Gráfica com Ênfase em Animação. 2003. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA.

23.
SCOTT, L. P. B.. Participação em banca de Adriana Regina Rosante.Projeto Sonda.. 2003. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA.

24.
SCOTT, L. P. B.; MARIN, Denise Rodrigues; MENECHELLI, Fenrando Bermejo. Participação em banca de Patrícia Ferreira de Queiroz e Leonardo Botaro.Estudo de Ferramentas e Softwares para Bioinformática. 2003. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA.

25.
SCOTT, L. P. B.; PEREIRA, Aledir Silveira. Participação em banca de Alfredo Fernandes Tavres Junior.Aplicações de TRansformadas Matemáticas em Imagens Matriciais. 2002. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Ciências da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.



Participação em bancas de comissões julgadoras
Concurso público
1.
Katti Faceli; SCOTT, L. P. B.; Cristina Dutra de Aguiar Ciferri. Concurso para professor Adjunto I na Área de Banco de Dados. 2008. Universidade Federal de São Carlos.

2.
SCOTT, L. P. B.; PENTEADO, R. A. D.; LIFSCHITZ, S.. Concurso Público para professor Adjunto - I na área de Projeto e Desenvolvimento de Sistemas. 2008. Universidade Federal do ABC.

3.
Vicari R; Bitencourt G.; SCOTT, L. P. B.. Teoria da Computação/Inteligência Artificial. 2007. Universidade Federal do ABC.

Avaliação de cursos
1.
SCOTT, L. P. B.. Comissão Avaliadora de Reconhecimento do Curso de Tecnolgia em desenvolvimento de Sistemas o Centro Universitário de Belo Horizonte. 2008. Instituto Nacional de Estudos e Pesquisas Educacionais Anísio Teixeira.

2.
SCOTT, L. P. B.. COMISSÃO PARA AVALIAÇÃO DE AUTORIZAÇÃO DE CURSOS/CREDENCIAMENTO DE IES NOVAROMA. 2008.

Outras participações
1.
NASCIMENTO, M. Z.; Zampirolli, F A; SCOTT, L. P. B.. Método Automático para Criação de Mapas Polares Baseados em Alinhamento de Imagens. 2010. Universidade Federal do ABC.

2.
NASCIMENTO, M. Z.; C. S. Kurashima; LORENA, A. C.; SCOTT, L. P. B.. Detecção Automática de Nódulo mamário através de wavelet e algoritmo genético. 2009.

3.
SCOTT, L. P. B.; Renato Kraide Soffner; SGARBI, N. M. F. Q.. Comissão de Avaliação para Credenciamento de IES para Educação a Distância - INEP. 2008. Instituto Nacional de Estudos e Pesquisas Educacionais Anísio Teixeira.

4.
SCOTT, L. P. B.. II Jornada Nacional da Produção Científica em Educação Profissional e Tecnológica. 2007. Ministério da Educação.

5.
SCOTT, L. P. B.; SILVA, Raynner Toschi; SANTOS, F. S.. FRONTEND SQUID, Uma maneira simples e rápida de administrar serviços no LInux. 2006. CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA.

6.
SILVA, Raynner Toschi; SANTOS, F. S.; SCOTT, L. P. B.. SMARTDOC. 2006. CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA.

7.
SCOTT, L. P. B.; MENECHELLI, Fenrando Bermejo; Silva, D.D.. Sistema de Controle de vendas e Estoque de DVDs e Fitas VHS. 2006. CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA.

8.
SCOTT, L. P. B.; Silva, D.D.; MENECHELLI, Fenrando Bermejo. Sistema de Controle de Locodora. 2006. CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA.

9.
SILVA, Raynner Toschi; SANTOS, F. S.; SCOTT, L. P. B.. Enciclopédia Digital. 2006. CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA.



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
Hands-on Workshop on Computational Biophysics 2018. 2018. (Oficina).

2.
Hands-On Workshop on Enhanced Sampling and Free-Energy Calculation. 2018. (Oficina).

3.
SBBq. STRUCTURAL ANALYSIS OF THE BIOLOGICAL TARGET DIPEPTIDYL PEPTIDASE-4 (DPP-4) RELATED TO TYPE II DIABETES MELLITUS TREATMENT. 2017. (Congresso).

4.
SBBq. PH AND AGGREGATION EFFECTS IN THE CONVERSION OF HUMAN PRION INTO SCRAPIE FORM: A STUDY USING MOLECULAR DYNAMICS WITH EXCITED NORMAL MODES. 2017. (Congresso).

5.
IUBMB 2015. STUDY OF AGGREGATION MODELS OF PRPSC USING MOLECULAR DYNAMICS WITH EXCITED NORMAL MODES AND COARSE-GRAINED. 2015. (Congresso).

6.
reunião da SBBq 2015. STUDY OF AGGREGATION MODELS OF PRPSC USING MOLECULAR DYNAMICS WITH EXCITED NORMAL MODES AND COARSE-GRAINED. 2015. (Congresso).

7.
Workshop em Biofísica Molecular.Studying functionally relevant structural changes and global motions in proteins. 2015. (Simpósio).

8.
III Simpósio Interdisciplinar Fisica+ Bioinformática.Atudying functionally relevant changes and global motions in proteins. 2014. (Simpósio).

9.
Reuniao Anual da SBBq 2014. Effects of the Presence of Substrates, Products and Catalytic Water in HIV1 Protease Flexibility by NMA. 2014. (Congresso).

10.
Workshop at the interface between physics and biology. 2014. (Seminário).

11.
9th European Biophysics Congress. HIV-1 protease double mutants analysis by NMA indicates convergence to flexibility of the wild type. 2013. (Congresso).

12.
Frontiers in dynamics simulations of biological molecules.Flexibility of Thioredoxin1 and new binding sites using Normal Modes Analyses. 2013. (Simpósio).

13.
WORKSHOP DEFIS - Biophysics of large macromolecular assemblies: experiments and simulations.Protein-protein docking interaction taking account global conformational changes. 2013. (Simpósio).

14.
REUNIÃ DA SBBq. DEVELOPMENT OF A FULLY FLEXIBLE PROTEIN-PROTEIN DOCKING METHOD COMBINING NORMAL MODES AND GENETIC ALGORITHM. 2012. (Congresso).

15.
Protein Socity Europen Meeting 2011. Using Normal Modes Analysis and Molecular Dynamics to investigate amyloid peptides and senile plaques. 2011. (Congresso).

16.
Reunião da SBQT 2011. Protein-protein Docking using normal modes and genetic algorithm. 2011. (Congresso).

17.
Simpósio Interdisciplinar: Física + Bioinformática. Analyses of the Inhibitor-active site binding of the HIV-1 Protease (Human Immunodeficiency Virus -1-M) in cases od strutcure and/or functional mutations. 2011. (Congresso).

18.
9 European Conference on Computational Biology. Developing a methodology for protein-ligand docking based on genetic algorithm and normal modes. 2010. (Congresso).

19.
II Semana Científica e Cultural da Unifesp Diadema (SCCUD). Bioinfromática: modelagem molecular. 2010. (Congresso).

20.
ISCB Latin America 2010. A Methodological developments based on genetic algorithm and normal mode analysis for performing protein-ligand and protein-protein docking simulations. 2010. (Congresso).

21.
XXXIII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. developing a software to extract rules for the formation of secondary structure. 2010. (Congresso).

22.
Conference on Computational Physics. Design of Protein Sequence with Genetic Algorithms. 2008. (Congresso).

23.
Curso de Verão em Biofísica Molecular 2008.Modelos e Técnicas para predição de Estrutura de Proteínas. 2008. (Outra).

24.
Aula Magna para os Cursos de Física e Computação- UNIFEV.Biotecnologia: Uma área promissora para profissionais da área de extas. 2007. (Outra).

25.
I Workshop em Sistemas Complexos e Cognição. Predicting Peptides Structure with Solvation Potential and Rotamer. 2007. (Congresso).

26.
Semana da Computação - UNIRP.Biotecnologia: Uma área promissora para profissionais da área de computação. 2007. (Seminário).

27.
XIV Congresso Latino-Americano de Biomatemática. Application of genetic algorithms to modeling and design proteins. 2007. (Congresso).

28.
I Encontro da área de Saúde.Bioinformática como Ferramenta de auxílio à Pesquisa na Área de Saúda. 2006. (Simpósio).

29.
I Fórum de Auto-Avaliação UNIFEV.Auto-Avaliação da Pesquisa de Pós-Graduação. 2006. (Encontro).

30.
Ii CONGRESSO INICIAÇÃO CIENTÍFICA. 2006. (Congresso).

31.
In-Silico analysis of proteins: Celebreting the 20th aniversary of Swiss-Prot. In-Silico analysis of proteins: Celebreting the 20th aniversary of Swiss-Prot. 2006. (Congresso).

32.
XXXVII Latin American School of Physics. XXXVII latin American School of Physics. 2006. (Congresso).

33.
I Simpósio de Biotecnologia do Noroeste Paulista. I Simpósio de Biotecnologia do Noroeste Paulista. 2005. (Congresso).

34.
VI Encontro nacional sobre Pós-Graduação e pesquisa nas IES Particulares. 2005. (Encontro).

35.
II Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos. II Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos. 2004. (Congresso).

36.
IV Jornada de Informática.Bioinformática. 2004. (Simpósio).

37.
V Congresso de Computação da UNIFEV. V Congresso de Computação da UNIFEV. 2004. (Congresso).

38.
XIII Congresso da Sociedade Brasileira de Computação. 2003. (Congresso).

39.
Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos. I Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos. 2002. (Congresso).

40.
Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos, LNCC- Petrópolis - Rio de Janeiro. Predição de Estruturas Secundárias Utilizando Redes Neurais. 2002. (Congresso).

41.
Semana da Biologia da UNIFEV,.Minicurso: Conceitos Básicos de Bioinformática. 2002. (Encontro).

42.
Semana da Química - UNIFEV. Bioinformática - Uma ferramenta para área de Química. 2002. (Congresso).

43.
XII Congresso da Sociedade Brasileira de Computação. 2002. (Congresso).

44.
II Escola de verão em métodos computacionais em biologia. Aplicação de Redes Neurais na Predição de Núcleos Hidrofóbicos. 2001. (Congresso).

45.
School on Computational Physics. Predicting Protein Structure Using Genetic Algorithms. 2001. (Congresso).

46.
IV Simpósio Brasileiro de Redes Neurais.Predição de Estruturas de Proteínas Utilizando Rede de Hopfield. 2000. (Simpósio).

47.
ICCIMA'98, International Conference on Computacional Intelligence and Multimedia Applications. HyTime from the Object-Oriented Point of View. 1998. (Congresso).

48.
IX Semana da Computação.Uma comparação dos métodos de modelagem e projeto de aplicações hipermídia. 1998. (Encontro).

49.
Seminário de Tendências do Ensino Superior para o Terceiro Milênio. 1998. (Seminário).

50.
2a Semana de Incentivo Científico e Cultural da UNIRP. Orientação a Objetos. 1997. (Congresso).

51.
I Workshop de Iniciação Científica em Computação das FIRP. Um Estudo de Conceitos e Técnicas de Análise e Projeto orientado a Objetos. 1997. (Congresso).

52.
1a Semana de Informática da UNIRP.Mini-curso sobre Redes Neurais Artificiais. 1996. (Encontro).

53.
I Wokshop de Visão Cibernética. 1996. (Outra).

54.
III Seminário de Informática e telecomunicações de Rio Preto.Conceitos Básicos de Computação Gráfica. 1995. (Seminário).

55.
I Semana de Incentivo Científico e Cultural - SICC, FIRP. Mini-curso: Projeto de Sistemas de Tempo Real. 1995. (Congresso).

56.
Workshop em Programação Concorrente, Sistemas Distribuídos e Engenharia de Softwar. 1991. (Encontro).

57.
XV Congresso Nacional de Matemática Aplicada e Computacional. 1991. (Congresso).

58.
XV Congresso Nacional de Matemática Aplicada e Computacional. 1991. (Congresso).

59.
I Congresso de Iniciação Científica da UNESP. Simulação a Análise da Dinâmica Newtoniana. 1990. (Congresso).

60.
VII Escola de Computação. Simulação e Visualização de um Polímero em Rede. 1990. (Congresso).

61.
XII Congresso de Estudantil de Física. Simulação e Visualização de um Polímero em Rede. 1990. (Congresso).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
SCOTT, L. P. B.; COUTINHO-NETO, M. ; HONORIO, K. M. ; MELLO, P. H. . IV Escola Brasileira de Modelagem Molecular. 2017. (Congresso).

2.
SCOTT, L. P. B.. Symposium: Dynamic of Biomolecular Systems - 46th SBBq. 2017. (Outro).

3.
Braz, A. S. ; COUTINHO, M ; HONÓRIO, K. ; SCOTT, L. P. B. ; MELLO, P. H. . III Escola Brasileira de Modelagem Molecular. 2015. (Congresso).

4.
HONÓRIO, K. ; SCOTT, L. P. B. ; MELLO, P. H. ; COUTINHO-NETO, M. ; BRAZ, A. S. K. . II ESCOLA DE BRASILEIRA DE MODELAGEM MOLECULAR - EBMM 2013. 2013. (Congresso).

5.
SCOTT, L. P. B.; COUTINHO, M ; MELLO, P. H. ; Braz, A. S. K ; NASCIMENTO, A. S. ; HONÓRIO, K. . ESCOLA BARSILEIRA DE MODELAGEM MOLECULAR - EBMM 2011. 2011. (Congresso).

6.
SCOTT, L. P. B.; KLEINSCHMIDT, J. H. ; MInami, M ; Born ; FRAGA, F. . I Workshop da Pós Graduação em Engeharia da Informação da UFABC. 2011. (Outro).

7.
SCOTT, L. P. B.. IADIS Multi Conference on Computer Science and Information Systems 2010. 2010. (Congresso).

8.
SCOTT, L. P. B.. IADIS Informatics 2009 (I 2009) Conference. 2009. (Congresso).

9.
SCOTT, L. P. B.; Lorena, Ana . I Escola Brasileira de Bioifnromática, EBB 2008. 2008. (Congresso).

10.
SCOTT, L. P. B.; Lorena, Ana . Simpósio Brasileiro de Bioinformática. 2008. (Congresso).

11.
SCOTT, L. P. B.. I Congresso de Iniciação Científica da UNIFEV. 2005. (Congresso).

12.
SCOTT, L. P. B.. I Simpósio de Biotecnologia do Noroeste Paulista. 2005. (Congresso).

13.
SCOTT, L. P. B.. I Congresso de Iniciação Científica da UNIRP. 2004. (Congresso).



Orientações



Orientações e supervisões em andamento
Tese de doutorado
1.
Carlos Alvez Moreira. Predicao de Regiaoes Proepensa a Agregacao x Estabilidade de Proteinas. Início: 2018. Tese (Doutorado em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Orientador).

2.
André Luiz dos Santos. Movimentos Funcionais e Mudanças Conformacionais de proteínas e peptídeos relacionados com agregação. Início: 2015. Tese (Doutorado em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Orientador).

3.
André Kliousoff Junior. Determinação de padrões de movimentos funcionais em classes proteínas usando modos normais e técnicas de aprendizado de máquina. Início: 2015. Tese (Doutorado em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC. (Orientador).

4.
Pedro Túlio de Resende Lara. Transferência de informação na sinalização dos receptores TrkA mediados por neurotrofinas e outros ligantes. Início: 2015. Tese (Doutorado em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Coorientador).

5.
Simone Queiroz Pantaleão. Estudos de Modelagem Molecular e Triagem Virtual de Ligantes da Enzima Dipeptidil Peptidase-4 Candidatos ao Tratamento do Diabetes Tipo II. Início: 2015. Tese (Doutorado em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC. (Coorientador).

Supervisão de pós-doutorado
1.
Angelica Nakagawa Lima. Início: 2018. Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior.

2.
Eric Allison Phillot. Início: 2018. Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior.


Orientações e supervisões concluídas
Dissertação de mestrado
1.
Carlos Moreira. Desenvolvimento de um Preditor de Agregação de proteínas e peptídeos. 2016. Dissertação (Mestrado em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC, . Orientador: Ana Ligia Scott.

2.
André Kliousoff. Estudo de padrões de propriedades de resíduos em Proteínas Desordenadas. 2015. Dissertação (Mestrado em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC, . Orientador: Ana Ligia Scott.

3.
Pedro Túlio de Resende Lara. Estudo estrutural de neurotrofinas e seus receptores a partir de análise de modos normais. 2015. Dissertação (Mestrado em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC, . Coorientador: Ana Ligia Scott.

4.
Raphael Leite. Iplementação da terceira versão da ferramenta GANM: considerando o ligante flexivel. 2014. Dissertação (Mestrado em Engenharia da Informação) - Universidade Federral do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Ana Ligia Scott.

5.
Denis Lucas Silva. Estudo de padrões em proteínas virais humanas e a sua correlação com a rede de interação dessas proteínas. 2013. Dissertação (Mestrado em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Ana Ligia Scott.

6.
Rosanne Viera. Predição de Hot Spots em complexos Proteína-Proteína. 2013. Dissertação (Mestrado em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Ana Ligia Scott.

7.
Paulo Henrique Pisani. Algoritmos Imunológicos aplicados na Detecção de Intrusões com Dinâmica da Digitação. 2012. Dissertação (Mestrado em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Coorientador: Ana Ligia Scott.

8.
Diogo Stelle. Uso de Data Mining na descoberta ou identificação de regras de enovelamento baseado em perfis de hidrofobicidade. 2011. Dissertação (Mestrado em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC, Universidade Federral do ABC. Orientador: Ana Ligia Scott.

9.
Eric Allison Philo. Investigação do Docking da HIV-1 Protease e Ligantes utilizando Algoritmos Genéticos e Biblioteca de Rotâmeros. 2010. Dissertação (Mestrado em Mestrado em Engenharia de Informação) - Universidade Federal do ABC, Universidade Federal do ABC. Orientador: Ana Ligia Scott.

10.
Angelica Nakagawa Lima. Investigação do Docking da HIV-1 Protease e Ligantes utilizando Algoritmos Genéticos e Dinâmica Molecular com Modos Normais. 2008. Dissertação (Mestrado em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Ana Ligia Scott.

11.
Danilo César Pereira. Quantificação do Pré-Processamento em Sistemas De Diagnóstico Auxiliado por Computador. 2007. Dissertação (Mestrado em Mestrado em Engenharia de Informação) - Universidade Federal do ABC, Universidade Federral do ABC. Coorientador: Ana Ligia Scott.

12.
Fausto Roberto Ferreira. O uso de Redes Neurais Artificiais MLP na Predição de Estruturas Secundárias de Proteínas. 2004. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Coorientador: Ana Ligia Scott.

Tese de doutorado
1.
Angelica Nakagwa Lima. Caracterização teórica das interações moleculares entre os peptídeos β-Amilóides (Aβ42, Aβ40), Prion Protein (PrPc e PrPSc), APLP1, B30 por meio de dinâmica molecular, análise de modos normais de baixa frequência, docking proteína-proteína e QM/MM?. 2015. Tese (Doutorado em Biossitemas) - Universidade Federal do ABC, Universidade Federral do ABC. Orientador: Ana Ligia Scott.

2.
Patrícia Cassiolato Tufanetto. Estudo estrutural de replicases virais a partir de análise de modos normais. 2014. Tese (Doutorado em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Coorientador: Ana Ligia Scott.

3.
Eric Allison Philot. Caracterizando as Interações moleculares entre a Tioredoxina e inibidores/moduladores alostéricos. 2010. Tese (Doutorado em Biossitemas) - Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Ana Ligia Scott.

Supervisão de pós-doutorado
1.
Eric Allison Phillot. 2017. Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Ana Ligia Scott.

2.
Angelica Lima. 2017. Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Ana Ligia Scott.

3.
Eric Allison Philot. 2016. Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Ana Ligia Scott.

4.
Valderes de Conto. 2012. Universidade Federal do ABC, Universidade Federral do ABC. Ana Ligia Scott.

5.
Ricardo Hildebrand Theodoro da Silva. Desenvolvimento de um software para design de fármacos baseado em estrutura e estudo de interação proteína-proteína proteína-ligante. 2011. Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Ana Ligia Scott.

6.
Humberto Luiz Razante. Integração de Bancos de dados Biológicos e Implementação de um Workflow para Mineração de Dados filogenéticos. 2009. Universidade Federral do ABC, Universidade Federral do ABC. Ana Ligia Scott.

Trabalho de conclusão de curso de graduação
1.
Valquiria Trivelato. Banco de Dados Multimídia e suas Aplicações em Processamento de Imagens. 2006. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA. Orientador: Ana Ligia Scott.

2.
Ana Paula Fernandes. Banco de Dados genéticos e de Proteínas. 2004. 0 f. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA. Orientador: Ana Ligia Scott.

3.
Daiane Maldonado de Lima. Banco de Dados Genéticos e de Proteínas. 2004. 0 f. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA. Orientador: Ana Ligia Scott.

4.
Waldecir Pereira Junior. Banco de Dados Móveis e Computação Móvel: Uma discussão de seus recursos e aplicações.. 2004. 0 f. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA. Orientador: Ana Ligia Scott.

5.
Ravel João da Silva Gimenez. Banco de Dados móveis e Computação móvel:Uma discussão de seus Recursos e Aplicações. 2004. 0 f. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA. Orientador: Ana Ligia Scott.

6.
Elton dos Santos. Banco de Dados Multimídia na Medicina. 2004. 0 f. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA. Orientador: Ana Ligia Scott.

7.
William Demarchi. Banco de Dados Multimídia na Medicina. 2004. 0 f. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA. Orientador: Ana Ligia Scott.

8.
Denilson Manzano de Oliveira. Datamining: Aplicacões, conceitos, casos de uso e sua importância no mercado na tomada de decisão.. 2004. 0 f. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA. Orientador: Ana Ligia Scott.

9.
Ronny Eduardo Rodrigues dos Santos Neto. Datamining: Aplicações, Conceitos, Casos de Uso e sua Importância no Mercado na Tomada de Decisão.. 2004. 0 f. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA. Orientador: Ana Ligia Scott.

10.
André Belloti Lacerda. Ferramentas Computacionais Utilizadas para o Desenvolvimento do Projeto Genoma. 2004. 0 f. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA. Orientador: Ana Ligia Scott.

11.
Catieli Regina de Oliveira. Ferramentas Computacionais Utilizadas para o Desenvolvimento do Projeto Genoma. 2004. 0 f. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA. Orientador: Ana Ligia Scott.

12.
Juliana Basso. Ferramentas para WEB e um Levantamento Regional.. 2004. 0 f. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA. Orientador: Ana Ligia Scott.

13.
Luiz Henrique Perez. Redes Neurais Artificiaise Reconhecimento de Padrões. 2004. 0 f. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA. Orientador: Ana Ligia Scott.

14.
Carlos Silva Malone. Redes Neurais Artificiais e Reconhecimento de Padrões.. 2004. 0 f. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA. Orientador: Ana Ligia Scott.

15.
Thony Dhark Regende Pimentel. Um estudo sobre Sistemas Gerenciadores de Banco de Dados na Região de Votuporanga.. 2004. 0 f. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA. Orientador: Ana Ligia Scott.

16.
Aledir Silveira Pereira. Um estudo sobre Sistema Gerenciadores de Banco de Dados, na Região de Votuporanga .. 2004. 0 f. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA. Orientador: Ana Ligia Scott.

Iniciação científica
1.
Eduardo Petecof Mattoso. Análise estrutural e funcional de alguns mutantes da Prions (PrPC, PrPSc) por meio de dinâmica molecular e análise de modos normais. 2015. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Ana Ligia Scott.

2.
Fernando Georgetto Nogueira. Estudo estrutural e funcional da Alfa-sinucleína por meio de análise de modos normais e dinâmica molecular. 2015. Iniciação Científica. (Graduando em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Ana Ligia Scott.

3.
Henrique Santos Franco. Aplicação de Redes Neurais Artificiais para Predizer Estruturas Secundárias de Proteínas. 2013. Iniciação Científica - Universidade Federal do ABC, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Ana Ligia Scott.

4.
Vitor Hugo Lage Cabral. Análise Estrutural e de Flexibilidade dos Mutantes da Prion via Dinâmica Molecular e Modos Normais. 2012. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Ana Ligia Scott.

5.
SERGIO RICARDO ZERBETTO MASSON. Análise dos Modos Normais de nano estruturas de peptídeos. 2011. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, MINISTÉRIO DA EDUCAÇÃO. Orientador: Ana Ligia Scott.

6.
Patricia Cassiolato Tufanetto. Análise in silico da afinidade de inibidores ao sítio ativo da protease do HIV-1MNO (Human Immunodeficiency Virus ? 1MNO) em casos de mutações não sinônimas sob pressão de seleção positiva.. 2011. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, Universidade Federral do ABC. Orientador: Ana Ligia Scott.

7.
André Macedo. Análise in silico da flexibilidade da SOD em casos de mutações não sinônimas sob pressão de seleção positiva. 2011. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, MEC. Orientador: Ana Ligia Scott.

8.
Danielle Custório. Investigando a Flexibilidade da Tioredoxinas e Tioredoxinas Redutase por meio de análise de modos normais de baixa frequência e dinâmica molecular. 2010. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, Universidade Federral do ABC. Orientador: Ana Ligia Scott.

9.
Wesley Henrique Godoy.. Investigando a estrutura e flexibilidade de peptídeos β-Amilóides (Aβ42, Aβ40) e a formação de agregados por meio de dinâmica molecular e análise de modos normais de baixa frequência. 2010. Iniciação Científica - Universidade Federal do ABC, Universidade Federral do ABC. Orientador: Ana Ligia Scott.

10.
Arthur Muramoto Hayashi. Estudo dos softwares: VMD, ArgusLab na Simulação de Docking de Sistemas Proteína-Ligante relacionados à doenças auto-imunes. 2009. Iniciação Científica - Universidade Federal do ABC, Universidade Federral do ABC. Orientador: Ana Ligia Scott.

11.
Cassio Pereira Christianini. Estudo dos softwares: VMD, ArgusLab e Gromac na Simulação de Docking de Sistemas Proteína-Ligante. 2009. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, Universidade Federral do ABC. Orientador: Ana Ligia Scott.

12.
Michelle Honoratto Araújo. Modelagem por hmologia de proteínas envolvidas em doenças auto imunes. 2009. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, Universidade Federral do ABC. Orientador: Ana Ligia Scott.

13.
Joselisa Paiva. Aplicação de Redes Neurais do Tipo MLP na Predição de Doenças Cardíacas. 2008. Iniciação Científica. (Graduando em BC&T) - Universidade Federral do ABC, Universidade Federral do ABC. Orientador: Ana Ligia Scott.

14.
Hudson Roger da Silva. Aplicação de Monte Carlo no Estudo de Enovelamento, Dinâmica e Estabilidade de EstruturasProtéicas em uma Rede Cúbica. 2008. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Ana Ligia Scott.

15.
Bruno Novaes. Predição de pepetídeos usando Algoritmo genético e Bilbioteca de Rotâmeros. 2008. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Ana Ligia Scott.

16.
Michelle Honorato. Predição de Estruturas de proteínas Usando Algoritmos Genéticos e Biblioteca de Rotãmeros dependente do backbone. 2008. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Ana Ligia Scott.

17.
Cleber Pressunto Fogo. Desenvolvimento de um CD para ensino e treinamento em UML.. 2004. 0 f. Iniciação Científica. (Graduando em Engenharia de Computação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA. Orientador: Ana Ligia Scott.

18.
LEONARDO BOTTARO. Estudos de Ferramentas e Softwares de Bioinformática.. 2003. 0 f. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharel em Sistemas de Informação) - CENTRO UNIVERSITÁRIO DE VOTUPORANGA. Orientador: Ana Ligia Scott.

Orientações de outra natureza
1.
Valderes De Conto. Estudo das interações moleculares entre Tioredoxinas/Tioredoxinas Redutase e inibidores/moduladores alostéricos e caracterização das interações moleculares presentes no sistema Trx. 2012. Orientação de outra natureza - Universidade Federal do ABC, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Ana Ligia Scott.

2.
Diego Enry Gomes. Desenvolvimento de metodologia para docking flexível com alterações especificas na estrutura primária. E as aplicações para estudar interação Proteína-Proteína, Proteína-Ligante e resistência de patógenos a drogas. 2011. Orientação de outra natureza - Universidade Federal do ABC, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Ana Ligia Scott.

3.
Angélica Nakagawa Lima. Desenvolvimento de metodologia para docking flexível com alterações especificas na estrutura primária. E suas aplicações para estudar interação Proteína-Proteína , Proteína-Ligante e resistência de patógenos a drogas. 2010. Orientação de outra natureza - Universidade Federal do ABC, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Ana Ligia Scott.



Educação e Popularização de C & T



Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
SCOTT, L. P. B.; COUTINHO-NETO, M. ; HONORIO, K. M. ; MELLO, P. H. . IV Escola Brasileira de Modelagem Molecular. 2017. (Congresso).

2.
SCOTT, L. P. B.. Symposium: Dynamic of Biomolecular Systems - 46th SBBq. 2017. (Outro).



Outras informações relevantes


Coordenador Científico do Convênio Bi-Lateral UFABC/ ENS Cachan (Colégio Franco-Brasileiro Santos Dumont)



Página gerada pelo Sistema Currículo Lattes em 20/11/2018 às 9:23:42