Joao Meidanis

  • Endereço para acessar este CV: http://lattes.cnpq.br/1313385414995585
  • Última atualização do currículo em 20/12/2018


João Meidanis possui graduação em Bacharelado em Matemática pela Universidade de São Paulo (1980), mestrado em Ciência da Computação - University of Wisconsin - Madison (1989), mestrado em Matemática pela Universidade de São Paulo (1985) e doutorado em Ciência da Computação - University of Wisconsin - Madison (1992). Atualmente é diretor da Scylla Informática e professor titular da Universidade Estadual de Campinas. Suas áreas de atuação incluem análise de algoritmos, teoria dos grafos, biologia computacional e otimização. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Joao Meidanis
Nome em citações bibliográficas
MEIDANIS, J.;Meidanis, Joao;MEIDANIS, JOÃO

Endereço


Endereço Profissional
Scylla Informática S/A.
Avenida Francisco Glicério, 305 sala 33
Vila Lídia
13026501 - Campinas, SP - Brasil
Telefone: (19) 35796193
URL da Homepage: http://www.scylla.com.br


Formação acadêmica/titulação


1987 - 1992
Doutorado em Ciência da Computação.
University of Wisconsin - Madison, WISC, Estados Unidos.
Título: Algorithms for Problems in Computational Genetics, Ano de obtenção: 1992.
Orientador: Eric Bach Deborah Joseph.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
1987 - 1989
Mestrado em Master of Sciences.
University of Wisconsin - Madison, WISC, Estados Unidos.
Título: Não houve dissertação,Ano de Obtenção: 1989.
Orientador: Não houve orientador.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
1981 - 1985
Mestrado em Matemática.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Não houve dissertação,Ano de Obtenção: 1985.
Orientador: Não houve orientador.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Palavras-chave: Complexidade Computacional.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Setores de atividade: Desenvolvimento de Programas (Software).
1978 - 1980
Graduação em Bacharelado em Matemática.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.


Pós-doutorado e Livre-docência


1996
Livre-docência.
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Título: , Ano de obtenção: 1996.
2016 - 2017
Pós-Doutorado.
University of Ottawa, U.OTTAWA, Canadá.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Matemática da Computação / Especialidade: Modelos Analíticos e de Simulação.
1995 - 1995
Pós-Doutorado.
University of Münster, WWU MÜNSTER, Alemanha.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação / Especialidade: Sistemas de Informação.


Atuação Profissional



Scylla Informática S/A, SCYLLA, Brasil.
Vínculo institucional

2002 - Atual
Vínculo: Diretor, Enquadramento Funcional: Presidente, Carga horária: 30

Atividades

05/2002 - Atual
Direção e administração, .

Cargo ou função
Presidente.
05/2002 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , Pesquisa e Desenvolvimento, .

Linhas de pesquisa
Biponformática
Otimização

Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Vínculo institucional

2006 - Atual
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor titular, Carga horária: 24

Vínculo institucional

2002 - 2006
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Associado, Carga horária: 24

Vínculo institucional

1996 - 2002
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Livre Docente, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

1992 - 1996
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Assistente Doutor, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

1986 - 1992
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Assistente, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

09/1992 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Computacao, .

05/1993 - 04/1995
Direção e administração, Instituto de Computacao, .

Cargo ou função
Coordenador de Curso.

Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Vínculo institucional

1982 - 1985
Vínculo: Servidor público ou celetista, Enquadramento Funcional: PROFESSOR ASSISTENTE, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

11/1981 - 02/1986
Pesquisa e desenvolvimento , Universidade de São Paulo, .

Linhas de pesquisa
GEOMETRIA DIFERENCIAL


Linhas de pesquisa


1.
GEOMETRIA DIFERENCIAL
2.
Bioinformática
3.
Biologia Computacional
4.
Teoria dos Grafos
5.
Biponformática
6.
Otimização


Projetos de pesquisa


2014 - 2016
Desenvolvimento de uma plataforma computacional para quantificação econômica em ativos empregados em atividades do setor de geração de energia elétrica baseados em modelos não-convencionais
Descrição: 1) Desenvolver modelos com base em programação dinâmica e teoria do investimento para se estimar a vida econômica dos ativos, bem como comparar os resultados e apontar as situações em que cada método se torna mais adequado. 2) Desenvolver modelos matemáticos a escolha entre aquisição de ativos e a realização de grandes reformas (overhauls) em função de custos excessivos de manutenção. 3) Desenvolver modelos matemáticos-estatísticos para escolha do momento de substituição de ativos decorrente da perda de eficiência, custo de falhas e demanda não atendida. 3) Desenvolver modelos para substituição de equipamentos em que ocorrem ganhos tecnológicos, aumentos de produtividades, etc. 4) Incluir na modelagem da plataforma computacional a variável risco de falha de equipamentos como mais um indicador juntamente com o momento econômico ótimo de substituição. 5) Desenvolver modelos para a escolha entre realizar a substituição de equipamentos individualmente e em grupos, bem como as diferenças em termos de risco e custo..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Joao Meidanis - Integrante / Gabriel Alves da Costa Lima - Coordenador / Paulo Roberto Viadanna Jr. - Integrante.
2014 - 2016
Desenvolvimento de metodologias e ferramenta computacional para a seleção de portfólios de projetos de melhorias operacionais e avaliação do seu desempenho no segmento de geração de energia elétrica
Descrição: 1) Desenvolver modelos para a quantificação de riscos alinhados com o PAS-55 em nível de projetos de modo a ampliar a metodologia existente atualmente com base em escalas qualitativas. Este modelo deve quantificar os riscos nas suas diversas dimensões: (1) segurança, (2) meio ambiente, (3) custos, (4) Imagem, (5) geração de energia (disponibilidade, MRA). 2) Nos modelos de seleção de projetos considerar as restrições de ordem hidrológica sobretudo no caso de usinas localizadas numa mesma cascata, caso comum na AES-Tietê. 3) Desenvolvimento de metodologia para estimativa de indicadores econômicos em nível de projeto e também de portfólio dos projetos selecionados. 4) Aumentar o número de variáveis de restrições no modelo de seleção de portfólios tais como restrições de recursos (mão-de-obra, ferramentas, licenças ambientais, licenças de trabalho, etc). 5) Desenvolvimento de novos algoritmos para reduzir o tempo de simulação de resultados depois de análise de bilhões de combinações possíveis. 6) Ampliação e implementação de modelos para estimar o nível de risco associado aos indicadores indisponibilidade forçada (IF), indisponibilidade programada (IP), MRE, disponibilidade, dentre outros bem como a estimativa do custo da indisponibilidade das usinas para cada uma das alternativas de decisão bem como apresentar soluções ao problema. 7) Construção de uma ferramenta que possa ser utilizada para dar suporte à inteligência de negócio de modo a auxiliar a tomada de decisão tática e estratégica em nível gerencial. 8) Capacitar mão-de-obra na AES para conhecer a ferramenta de otimização de portfólios de projetos de melhorias operacionais..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Joao Meidanis - Integrante / Cleber Valgas Gomes Mira - Integrante / Arnaldo Vieira Moura - Integrante / Gabriel Alves da Costa Lima - Coordenador.
2010 - 2013
MODELAGEM MULTI-OBJETIVO E PLATAFORMA COMPUTACIONAL PARA OTIMIZAÇÃO DE GRUPOS DE PROJETOS DE MELHORIAS OPERACIONAIS DO SEGMENTO DE GERAÇÃO DE ENERGIA ELÉTRICA

Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Gabriel Alves da Costa Lima em 03/08/2015.
Descrição: 1) Modelos para otimização de portfólios 2) Medidas de risco de portfólios 3) Desenvolvimento de software de otimização de portfólios de projetos 4) Testes e aplicabilidade do software em situações reais das empresas..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Joao Meidanis - Integrante / Arnaldo Vieira Moura - Integrante / Gabriel Alves da Costa Lima - Coordenador.
2004 - 2007
Ferramentas de Software para Melhoramento Genético Bovino
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Joao Meidanis - Coordenador.
Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2004 - 2006
SIP - Sistema de Identificação de Polimorfismos
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Joao Meidanis - Coordenador.
Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2000 - 2002
Bioinformática do projeto Fapesp/LICR Human Cancer Genome Project
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Joao Meidanis - Integrante / sandro jose de souza - Coordenador / Aline Maria da Silva - Integrante / Arthur Gruber - Integrante / Wilson Araújo da Silva Junior - Integrante / Paulo Bandiera Paiva - Integrante / Paulo Sergio Lopes de Oliveira - Integrante / Eduardo Massad - Integrante / João Paulo Fumio Whitaker Kitajima - Integrante / Milton Faria Junior - Integrante / Gonçalo Amarante Guimarães Pereira - Integrante.
Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2000 - 2002
Bioinformática do Projeto Genoma - Xanthomonas axonopodis pv. citri
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Joao Meidanis - Coordenador / J. C. SETUBAL - Integrante.
Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Número de produções C, T & A: 1
1999 - 2001
Bioinformática do Projeto SUCEST - Sugarcane EST
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Joao Meidanis - Coordenador.
Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
1998 - 2000
Bioinformática do Projeto Genoma - Xylella fastidiosa
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Joao Meidanis - Coordenador.
Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.


Projetos de desenvolvimento


2010 - 2012
DESENVOLVIMENTO DE PLATAFORMA COMPUTACIONAL PARA MODELAGEM DA VIDA ECONÔMICA DE ATIVOS EMPREGADOS EM ATIVIDADES OPERACIONAIS DE EMPRESAS GERADORAS DE ENERGIA
Descrição: Este projeto desenvolveu metodologias e ferramenta computacional para determinar (a) previsão de custos de manutenção, (b) vida econômica, (c) momento de substituição e (d) custo mínimo de CAPEX e manutenção de milhares de equipamentos usados na geração de energia elétrica..
Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.

Integrantes: Joao Meidanis - Coordenador / Gabriel Alves da Costa Lima - Integrante.


Membro de corpo editorial


2018 - Atual
Periódico: Genes
2015 - 2015
Periódico: BMC Bioinformatics
2015 - 2015
Periódico: BMC Genomics


Revisor de periódico


2000 - Atual
Periódico: BMC Bioinformatics (1471-2105)
2006 - Atual
Periódico: IEEE/ACM Transactions on Compuational Biology and Bioinformatics
2000 - Atual
Periódico: Discrete Applied Mathematics
2001 - Atual
Periódico: Journal of Computational Biology
2001 - Atual
Periódico: Information Processing Letters
2003 - Atual
Periódico: Theoretical Computer Science
2003 - Atual
Periódico: Bioinformatics (Oxford)
2005 - Atual
Periódico: Journal of the Brazilian Computer Society
2013 - 2014
Periódico: ALGORITHMICA


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Teoria da Computação/Especialidade: Análise de Algoritmos e Complexidade de Computação.
2.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Teoria da Computação/Especialidade: Computabilidade e Modelos de Computação.
3.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Matemática da Computação.


Idiomas


Grego
Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Pouco.
Inglês
Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Fala Bem, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.
Português
Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.


Prêmios e títulos


2009
Distinguished Innovators Award, Business Software Alliance.
2000
Medalha do Merito Cientifico e Tecnologico, Governo do Estado de Sao Paulo.
2000
Prêmio de Reconhecimento Acadêmico Zeferino Vaz, Unicamp.
1998
Prêmio de Reconhecimento Acadêmico Zeferino Vaz, Unicamp.


Produções



Produção bibliográfica
Citações

SciELO
Total de trabalhos:3
Total de citações:3
meidanis  Data: 21/12/2015

SCOPUS
Total de trabalhos:36
Total de citações:1529
meidanis j  Data: 21/12/2015

Artigos completos publicados em periódicos

1.
Chindelevitch, Leonid2018Chindelevitch, Leonid ; PEREIRA ZANETTI, JOÃO PAULO ; MEIDANIS, JOÃO . On the rank-distance median of 3 permutations. BMC BIOINFORMATICS, v. 19, p. 142, 2018.

2.
DA SILVA, CELMAR G.2017DA SILVA, CELMAR G. ; MEIDANIS, JOÃO ; MOURA, ARNALDO V. ; Souza, Maria Angélica ; Viadanna, Paulo ; DE OLIVEIRA, MARCELLO R. ; DE OLIVEIRA, MAURÍCIO R. ; JARDIM, LIDIANNE H. ; Costa Lima, Gabriel A. ; DE BARROS, RAFAEL S.V. . An improved visualization-based approach for project portfolio selection. COMPUTERS IN HUMAN BEHAVIOR, v. 73, p. 685-696, 2017.

3.
ZANETTI, JOAO PAULO PEREIRA2016ZANETTI, JOAO PAULO PEREIRA ; BILLER, PRISCILA ; Meidanis, Joao . Median Approximations for Genomes Modeled as Matrices. Bulletin of Mathematical Biology (Print), v. 78, p. 786-814, 2016.

4.
MIRA, Cleber Valgas Gomes2015MIRA, Cleber Valgas Gomes ; VIADANNA JR., P. R. ; SOUZA, M. A. ; MOURA, A. V. ; MEIDANIS, J. ; LIMA, G. A. C. ; BOSSOLAN, R. . PROJECT SCHEDULING OPTIMIZATION IN ELECTRICAL POWER UTILITIES. Pesquisa Operacional (Online), v. 35, p. 285-310, 2015.

5.
DA SILVA, CELMAR2014DA SILVA, CELMAR ; DE MELO, MARIVALDO ; DE PAULA E SILVA, FELIPI ; MEIDANIS, JOÃO . PQR sort: using PQR trees for binary matrix reorganization. Journal of The Brazilian Computer Society (Online), v. 20, p. 3-15, 2014.

6.
BILLER, P.2013BILLER, P. ; FEIJAO, P. ; MEIDANIS, J. . Rearrangement-Based Phylogeny Using the Single-Cut-or-Join Operation. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (Print), v. 10, p. 122-134, 2013.

7.
FEIJAO, PEDRO2013FEIJAO, PEDRO ; Meidanis, Joao . Extending the Algebraic Formalism for Genome Rearrangements to Include Linear Chromosomes. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (Print), v. 10, p. 819-831, 2013.

8.
CANAVEZ, F.2012CANAVEZ, F. ; LUCHE, D. ; STOTHARD, P. ; LEITE, K. ; SOUZA-CANAVEZ, J. ; PLASTOW, G. ; MEIDANIS, J. ; SOUZA, M. A. ; FEIJAO, P. ; MOORE, S. ; CAMARA-LOPES, L. H. . Genome Sequence and Assembly of Bos indicusGenome Sequence and Assembly of Bos indicus. Journal of Heredity, v. 103X, p. 342X-348, 2012.

9.
FEIJAO, P.2011FEIJAO, P. ; MEIDANIS, J. . SCJ: A Breakpoint-Like Distance that Simplifies Several Rearrangement Problems. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (Print), v. 8, p. 1318-1329, 2011.

10.
ALCON, L.2007ALCON, L. ; CERIOLI, M. R. ; FIGUEIREDO, C. M. H. ; GUTIERREZ, M. ; MEIDANIS, J. . Tree loop graphs. Discrete Applied Mathematics, v. 155, p. 686-694, 2007.

11.
QUITZAU, J. A. A.2006QUITZAU, J. A. A. ; MEIDANIS, J. . A fully resolved consensus between fully resolved phylogenetic trees. Genetics and Molecular Research, Brasil, v. 5, n.1, p. 269-283, 2006.

12.
GUTIERREZ, M.2003GUTIERREZ, M. ; MEIDANIS, J. . Recognizing Clique Graphs of Directed Edge Path Graphs. Discrete Applied Mathematics, Holanda, v. 126, n.2-3, p. 297-304, 2003.

13.
FIGUEIREDO, C. M. H.2003FIGUEIREDO, C. M. H. ; MEIDANIS, J. ; MELLO, C. P. ; ORTIZ, C. . Decompositions for the edge colouring of reduced indifference graphs. Theoretical Computer Science, Holanda, v. 297, n.1-3, p. 145-155, 2003.

14.
MEIDANIS, J.;Meidanis, Joao;MEIDANIS, JOÃO2003 MEIDANIS, J.; ANALYSIS, Organization For Nucleotide Sequencing A . Analysis and Functional Annotation of an Expressed Sequence Tag Collection for Tropical Crop Sugarcane. Genome Research, Estados Unidos, v. 13, p. 2725-2735, 2003.

15.
MEIDANIS, J.;Meidanis, Joao;MEIDANIS, JOÃO2002MEIDANIS, J.; BRAGA, M. D. V. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, S. . Whole-genome analysis of transporters in the plant pathogen Xylella fastidiosa. Microbiology and Molecular Biology Reviews, Estados Unidos, v. 66, n.2, p. 272-299, 2002.

16.
GUTIERREZ, M.2002GUTIERREZ, M. ; MEIDANIS, J. . On Clique Graph Recognition. Ars Combinatoria, Canadá, v. 63, p. 207-210, 2002.

17.
MEIDANIS, J.;Meidanis, Joao;MEIDANIS, JOÃO2002MEIDANIS, J.; WALTER, M. E. M. T. ; DIAS, Z. . A Lower Bound on the Reversal and Transposition Diameter. Journal of Computational Biology, Estados Unidos, v. 9, n.5, p. 743-745, 2002.

18.
MEIDANIS, J.;Meidanis, Joao;MEIDANIS, JOÃO2002 MEIDANIS, J.; ANALYSIS, Organization For Nucleotide Sequencing A . Comparison of the genomes of two Xanthomonas pathogens with differing host specificities. Nature (London), Inglaterra, v. 417, p. 459-463, 2002.

19.
BRAGA, M. D. V.2001BRAGA, M. D. V. ; DIAS, Z. ; LIN, T. L. ; MEIDANIS, J. ; QUITZAU, J. A. A. ; SILVA, F. R. ; TELLES, G. P. . Bioinformatics of the Sugarcane EST Project. Genetics and Molecular Biology (Impresso), Brasil, v. 24, p. 9-15, 2001.

20.
GUTIERREZ, M.2001GUTIERREZ, M. ; MEIDANIS, J. . Algebraic Theory for the Clique Operator. Journal of the Brazilian Computer Society, Brasil, v. 7, n.3, 2001.

21.
MEIDANIS, J.;Meidanis, Joao;MEIDANIS, JOÃO2000 MEIDANIS, J.; ANALYSIS, Organization For Nucleotide Sequencing A . The genome sequence of the plant pathogen Xylella fastidiosa. Nature (London), Inglaterra, v. 406, n.6792, p. 151-157, 2000.

22.
FIGUEIREDO, C. M. H.2000FIGUEIREDO, C. M. H. ; MEIDANIS, J. ; MELLO, C. P. . Local conditions for edge-colouring. JCMCC. Journal of Combinatorial Mathematics and Combinatorial Computing, Inglaterra, v. 32, p. 79-91, 2000.

23.
FIGUEIREDO, C. M. H.1999FIGUEIREDO, C. M. H. ; MEIDANIS, J. ; MELLO, C. P. . Total-chromatic number and chromatic index of dually chordal graphs. Information Processing Letters, Holanda, v. 70, n.3, p. 147-152, 1999.

24.
FIGUEIREDO, C. M.1999FIGUEIREDO, C. M. ; MEIDANIS, J. ; Célia P. Mello ; C. P. de Mello . Total-chromatic number and chromatic index of dually chordal graphs. Information Processing Letters (Print), v. 70, p. 147-152, 1999.

25.
MEIDANIS, J.;Meidanis, Joao;MEIDANIS, JOÃO1998 MEIDANIS, J.; PORTO, O. ; TELLES, G. P. . On The Consecutive Ones Property. Discrete Applied Mathematics, Holanda, v. 88, p. 325-354, 1998.

26.
BARBOSA, M. B.1998BARBOSA, M. B. ; MELLO, C. P. ; MEIDANIS, J. . Local Conditions For Edge-Colouring Of Cographs. Congressus Numerantium, EUA, v. 133, p. 45-55, 1998.

27.
FIGUEIREDO, C. M. H.1997FIGUEIREDO, C. M. H. ; MEIDANIS, J. ; MELLO, C. P. . On Edge-Colouring Indifference Graphs. Theoretical Computer Science, AMSTERDAM, HOLANDA, v. 181, p. 91-106, 1997.

28.
FIGUEIREDO, C. M. H.1995FIGUEIREDO, C. M. H. ; MEIDANIS, J. ; MELLO, C. P. . A Linear-Time Algorithm For Proper Interval Graph Recognition. Information Processing Letters (Print), AMSTERDAM, HOLANDA, v. 56, p. 179-184, 1995.

29.
FIGUEIREDO, C. M. H.1995FIGUEIREDO, C. M. H. ; MEIDANIS, J. ; MELLO, C. P. . A Greedy Method For Edge-Coloring Odd Maximum Degree Doubly Chordal Graphs. Congressus Numerantium, WINNIPEG, CANADA, v. 111, p. 170-176, 1995.

30.
MEIDANIS, J.;Meidanis, Joao;MEIDANIS, JOÃO1991MEIDANIS, J.. Lower Bounds For Arithmetic Problems. Information Processing Letters (Print), v. 38, p. 83-87, 1991.

Livros publicados/organizados ou edições
1.
SETUBAL, J. C. ; MEIDANIS, J. . Introduction To Computational Molecular Biology. BOSTON, EUA: PWS PUBLISHING COMPANY, INC, 1997. 296p .

2.
MEIDANIS, J.; SETUBAL, J. C. . Uma Introducao A Biologia Computacional. RECIFE, PE, BRASIL: UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO, 1994. 131p .

Capítulos de livros publicados
1.
Chindelevitch, Leonid ; MEIDANIS, JOÃO . On the Rank-Distance Median of 3 Permutations. In: L. Nahkleh; J. Meidanis. (Org.). Lecture Notes in Computer Science. 1ed.Heidelberg: Springer International Publishing, 2017, v. 10562, p. 256-276.

2.
da Silva, Celmar Guimarães ; MEIDANIS, JOÃO ; Moura, Arnaldo Vieira ; Souza, Maria Angélica ; Viadanna, Paulo ; Costa Lima, Gabriel A. ; de Barros, Rafael S. V. . A Visualization-Based Approach for Project Portfolio Selection. In: Álvaro Rocha; Ana Maria Correia; Hojjat Adeli; Luis Paulo Reis; Marcelo Mendonça Teixeira. (Org.). Advances in Intelligent Systems and Computing. 1ed.Cham: Springer International Publishing, 2016, v. 444, p. 835-844.

3.
MEIDANIS, J.. Sequence assembly. In: D. Cooper. (Org.). Encyclopedia of the Human Genome. 1ed.Nova Iorque: Wiley, 2003, v. 1, p. -.

4.
MEIDANIS, J.. Global alignment. In: D. Cooper. (Org.). Encyclopedia of the Human Genome. 1ed.Nova Iorque: Wiley, 2003, v. 1, p. -.

5.
MEIDANIS, J.; DIAS, Z. . An alternative algebraic formalism for genome rearrangements. In: David Sankoff; Joseph Nadeau. (Org.). Comparative Genomics. 1ed.Dordrecht: Kluwer Academic Publishers, 2000, v. 1, p. 213-223.

6.
MEIDANIS, J.. A Simple Toolkit For Dna Fragment Assembly. In: Martin Farach-Colton; Fred S. Roberts; Martin Vingron; Michael Waterman. (Org.). DIMACS Series in Discrete Mathematics and Theoretical Computer Science, vol. 47. 1ed.EUA: American Mathematical Society, 1999, v. 47, p. 271-288.

Textos em jornais de notícias/revistas
1.
MEIDANIS, J.. Craig Venter, um bem necessário. Pesquisa FAPESP (Impresso), Brasil, p. 48 - 49, 01 jun. 2010.

Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1.
Chindelevitch, Leonid ; MEIDANIS, J. . A cubic algorithm for the generalized rank median of three genomes. In: RECOMB Comparative Genomics 2018, 2018, Sherbrooke, Canada. Proceedings of the RECOMB Comparative Genomics Workshop 2018, 2018.

2.
SILVA, C. G. ; Meidanis, Joao ; MOURA, A. V. ; OLIVEIRA, M. R. ; MEDINA, B. F. ; LIMA, G. A. C. . A focus+context compact scalable Gantt chart with drag-and-drop capabilities. In: III Encontro de Inovação em Sistemas de Informação, 2016, Florianópolis. Anais [do] III Encontro de Inovação em SI (EISI 2016). Florianópolis: UFSC/ Departamento de Informática e Estatística, 2016. v. 1. p. 4-7.

3.
Meidanis, Joao; SOUZA, M. A. ; VIADANNA, P. ; MOURA, A. V. ; SILVA, C. G. ; MIRA, Cleber Valgas Gomes ; LIMA, G. A. C. ; BARROS, R. S. . Otimização de Portfólios de Projetos em Empresas Geradoras de Energia. In: ABRISCO 2015, 2015, Rio de Janeiro, RJ. Anais do ABRISCO 2015, 2015. p. 1-12.

4.
ZANETTI, J. P. P. ; BILLER, P. N. ; MEIDANIS, J. . On the Matrix Median Problem. In: 13th International Workshop, WABI 2013, 2013, Sophia Antipolis, France. Algorithms in Bioinformatics. Heidelberg: Springer, 2013. v. 8126. p. 230-243.

5.
FEIJAO, P. ; MEIDANIS, J. . Extending the Algebraic Formalism for Genome Rearrangements to Include Linear Chromosomes. In: Brazilian Symposium on Bioinformatics, 2012, Campo Grande. Proceeding of the VII Brazilian Symposium on Bioinformatics, 2012. p. 1-8.

6.
FEIJAO, P. ; MEIDANIS, J. . SCJ: A Variant of Breakpoint Distance for Which Sorting, Genome Median and Genome Halving Problems Are Easy. In: WABI 2009 - 9th International Workshop on Algorithms in Bioinformatics, 2009, Philadelphia, PA, USA. Lecture Notes in Computer Science - Algorithms in Bioinformatics. Berlin / Heidelberg: Springer, 2009. v. 5724. p. 85-96.

7.
QUITZAU, J. A. A. ; MEIDANIS, J. . A Fully Resolved Consensus Between Fully Resolved Phylogenetic Trees. In: X-meeting, 2005, Caxambu. X-meeting Proceedings, 2005.

8.
MEIDANIS, J.. Current Challenges in Bioinformatics. In: SPIRE'2003 - String Processing and Information Retrieval, 2003, Manaus, AM, Brasil. Lecture Notes in Computer Science. Heidelberg: Springer, 2003. v. 2857. p. 16-27.

9.
BRAGA, M. D. V. ; MEIDANIS, J. . An algorithm that builds a set of strings given their overlap graph. In: Latin American Theoretical Informatics (LATIN02), 2002, Cancun. Proceedings of the Symposium Latin American Theoretical Informatics, 2002.

10.
DIAS, Z. ; MEIDANIS, J. . Sorting by Prefix Transpositions. In: SPIRE'2002 - String Processing and Information Retrieval, 2002, Lisboa. Proceedings of SPIRE'2000 - String Processing and Information Retrieval, 2002.

11.
GUTIERREZ, M. ; MEIDANIS, J. . The Clique Operator, Set Families, and Their Properties. In: Brazilian Symposium on Graphs and Combinatorics (GRACO), 2001, Fortaleza. Electronic Notes on Discrete Mathematics. Amsterdam: Elsevier, 2001. v. 7.

12.
CERQUEIRA, F. R. ; MEIDANIS, J. . Algorithms for Large-scale DNA Sequencing. In: XXVIII Seminário Integrado de Software e Hardware, 2001, Fortaleza. Anais do XXVIII Seminário Integrado de Software e Hardware, 2001.

13.
DIAS, Z. ; MEIDANIS, J. . Genome Rearrangements Distance by Fusion, Fission, and Transposition is Easy. In: SPIRE'2001 - String Processing and Information Retrieval, 2001. Proceedings of SPIRE'2001 - String Processing and Information Retrieval.

14.
WALTER, M. E. M. T. ; DIAS, Z. ; MEIDANIS, J. . A New Approach for Approximating The Transposition Distance. In: SPIRE'2000 - String Processing and Information Retrieval, 2000, La Coruna. Proceedings of SPIRE'2000 - String Processing and Information Retrieval, 2000.

15.
WALTER, M. E. M. T. ; DIAS, Z. ; MEIDANIS, J. . Reversal And Transposition Distance Of Linear Chromosomes. In: String Processing and Information Retrieval - A South American Symposium - SPIRE'98, 1998, Santa Cruz de la Sierra, Boliv. String Processing and Information Retrieval - A South American Symposium, 1998. v. 1. p. 96.

16.
GUTIERREZ, M. ; MEIDANIS, J. . On The Clique Operator. In: LATIN'98 - Theoretical Informatics, 1998, CAMPINAS, SP, BRASIL. Lecture Notes in Computer Science, 1998. v. 1380. p. 261-272.

17.
MEIDANIS, J.; WALTER, M. E. M. T. ; DIAS, Z. . Distancia de Reversao de Cromossomos Circulares. In: SEMINARIO INTEGRADO DE SOFTWARE E HARDWARE - SEMISH97, 1997, BRASILIA, DF, BRASIL. ANAIS DO XXIV SEMINARIO INTEGRADO DE SOFTWARE E HARDWARE, 1997. p. 119-131.

18.
MEIDANIS, J.; MUNUERA, E. G. . A Theory For The Consecutive Ones Property. In: THIRD SOUTH AMERICAN WORKSHOP ON STRING PROCESSING, 1996, RECIFE, PE, BRASIL. INTERBATIONAL INFORMATICS SERIES, 1996. v. 4. p. 194-202.

19.
FIGUEIREDO, C. M. H. ; MEIDANIS, J. ; MELLO, C. P. . On The Edge-Coloring Of Split Graphs. In: SEMINARIO INTEGRADO DE SOFTWARE E HARDWARE, 1996, RECIFE, PE, BRASIL. ANAIS DO XXIII SEMINARIO INTEGRADO DE SOFTWARE E HARDWARE, 1996. p. 415-420.

20.
MEIDANIS, J.; VOSSEN, G. ; WESKE, M. . Using Workflow Management In Dna Sequencing. In: FIRST INTERNATIONAL CONFERENCE ON COOPERATIVE INFORMATION SYSTEMS, 1996, LOS ALAMITOS, CALIFORNIA, EUA. PROCEEDINGS OF THE FIRST INTERNATIONAL CONFERENCE ON COOPERATIVE INFORMATION SYSTEMS. p. 114-123.

21.
FIGUEIREDO, C. M. H. ; MEIDANIS, J. ; MELLO, C. P. . Local Conditions For Edge Coloring. In: II OFICINA NACIONAL EM PROBLEMAS COMBINATORIOS, 1995, CAMPINAS, SP, BRASIL. ANAIS DA II OFICINA NACIONAL EM PROBLEMAS COMBINATORIOS, 1995. p. 26-38.

22.
MEIDANIS, J.; MUNUERA, E. G. . A Simple Linear Time Algorithm For Binary Phylogeny. In: XV INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE CHILEAN COMPUTING SOCIETY, 1995, ARICA, CHILE. PROCEEDINGS OF THE XV INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE CHILEAN COMPUTING SOCIETY. p. 275-283.

23.
FIGUEIREDO, C. M. H. ; MEIDANIS, J. ; MELLO, C. P. . On Edge-Colouring Indifference Graphs. In: II LATIN AMERICAN THEORETICAL INFORMATICS - LATIN95, 1995, VALAPRAISO, CHILE. LECTURE NOTES IN COMPUTER SCIENCE, 1995. v. 911. p. 286-299.

24.
MEIDANIS, J.; SETUBAL, J. C. . Multiple Alignment Of Biological Sequences With Gap Flexibility. In: II LATIN AMERICAN THEORETICAL INFORMATICS, 1995, VALPARAISO, CHILE. LECTURE NOTES IN COMPUTER SCIENCE, 1995. v. 911. p. 411-426.

25.
MEIDANIS, J.. Distance And Similarity In The Presence Of Nonincreasing Gap-Weighting Functions. In: II SOUTH AMERICAN WORKSHOP ON STRING PROCESSING, 1995, VALAPRAISO, CHILE. PROC. OF THE II SOUTH AMERICAN WORKSHOP ON STRING PROCESSING, 1995. p. 27-37.

26.
FIGUEIREDO, C. M. H. ; MEIDANIS, J. ; MELLO, C. P. . Edge-Colouring, Indifference Graphs, And Odd Maximum Degree Graphs. In: I OFICINA NACIONAL EM PROBLEMAS COMBINATORIOS, 1995, SAO PAULO, SP, BRASIL. ANAIS DA I OFICINA NACIONAL EM PROBLEMAS COMBINATORIOS, 1995. p. 11-14.

27.
ALMEIDA, A. A. M. ; MEIDANIS, J. ; MORIYA, A. . Um Sistema Para Auxilio Na Montagem de Fragmentos de Dna. In: XXI SEMINARIO INTEGRADO DE SOFTWARE E HARDWARE, 1994, CAXAMBU, MG, BRASIL. ANAIS DO XXI SEMINARIO INTEGRADO DE SOFTWARE E HARDWARE, 1994. p. 533-545.

28.
MEIDANIS, J.. Rethinking The Dna Fragment Assembly Problem. In: FIRST SOUTH AMERICAN WORKSHOP ON STRING PROCESSING, 1993. BELO HORIZONTE, BRASIL. p. 0-0.

29.
KRYDER, A. ; LEWANDOWSKI, G. ; MEIDANIS, J. ; RANG, A. ; WYMAN, S. ; JOSEPH, D. . Dynamic Methods For Fragment Assembly In Large Scale Genome Sequencing Projects. In: TWENTY-SIXTH ANNUAL HAWAII INTERNATIONAL CONFERENCE ON SYSTEM SCIENCES, 1993, HONOLULU, HAWAII, EUA. Proceeding of the Twenty-Sixth Hawaii International Conference on System Sciences, 1993. p. 0-0.

30.
JOSEPH, D. ; MEIDANIS, J. ; TIWARI, P. . Determining Dna Sequence Similarity Using Maximum Independent Set Algorithms For Interval Graphs. In: THIRD SCANDINAVIAN WORKSHOP ON ALGORITHM THEORY, 1992, HELSINKI, FINLANDIA. Algorithm Theory ? SWAT '92. Heidelberg, Germany: SPRINGER, 1992. v. 621. p. 326-337.

Resumos expandidos publicados em anais de congressos
1.
MIRA, Cleber Valgas Gomes ; FEIJAO, P. ; SOUZA, M. A. ; MOURA, A. V. ; MEIDANIS, J. ; LIMA, G. A. C. ; BOSSOLAN, R. ; FREITAS, I. . A GRASP-based heuristic for the Project Portfolio Selection Problem. In: The 15th IEEE International Conference On Computational Science and Engineering, 2012, Paphos, Cyprus. Proceedings of The 15th IEEE International Conference On Computational Science and Engineering, 2012.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
FEIJAO, P. ; MIRA, Cleber Valgas Gomes ; MACARIO, C. G. N. ; MEIDANIS, J. ; JOLY, C. A. . Taxonomic Data Migration in a Legacy Biodiversity Information System. In: 8th International Conference on Ecological Informatics, 2012, BRASILIA, DF, BRASIL. Proceedings of the 8th International Conference on Ecological Informatics, 2012.

2.
FEIJAO, P. ; MIRA, Cleber Valgas Gomes ; SAMOGIN, C. D. ; MEIDANIS, J. ; JOLY, C. A. . Data Migration to SinBiota 2.0 Biodiversity Information System. In: 8th International Conference on Ecological Informatics, 2012, BRASILIA, DF, BRASIL. Proceedings of the 8th International Conference on Ecological Informatics, 2012.

3.
COGO, P. P. ; MEIDANIS, J. . Comparison Between Complete Genome Sequences of Vibrionaceae species. In: X-meeting, 2005, Caxambu. X-meeting Poster Abstracts, 2005.

4.
MEIDANIS, J.; MIRA, Cleber Valgas Gomes . Analysis of Sorting by Transpositions based on Algebraic Formalism. In: Research on Computational Biology - RECOMB - poster session, 2004, San Diego, CA, EUA, 2004.

Artigos aceitos para publicação
1.
SANKOFF, DAVID ; ZHENG, CHUNFANG ; ZHANG, YUE ; Meidanis, Joao ; LYONS, ERIC ; TANG, HAIBAO . Models for Similarity Distributions of Syntenic Homologs and Applications to Phylogenomics. IEEE-ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2018.

Apresentações de Trabalho
1.
MEIDANIS, J.. Genome Matrices and the Median Problem. 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

2.
Meidanis, Joao; ZANETTI, JOAO PAULO PEREIRA ; BILLER, PRISCILA . Genome Matrices and the Median Problem. 2017. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

3.
Meidanis, Joao; ZANETTI, JOAO PAULO PEREIRA ; BILLER, PRISCILA . Genome Matrices and the Median Problem. 2017. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

4.
MEIDANIS, J.; ZANETTI, JOAO PAULO PEREIRA ; BILLER, PRISCILA . Genome Matrices and the Median Problem. 2017. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

5.
MEIDANIS, J.; ZANETTI, J. P. P. ; BILLER, PRISCILA . Genome Matrices and the Median Problem. 2017. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

6.
MEIDANIS, J.; ZANETTI, JOAO PAULO PEREIRA ; BILLER, PRISCILA . Genome Matrices and the Median Problem. 2017. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

7.
MEIDANIS, J.; ZANETTI, JOAO PAULO PEREIRA ; BILLER, PRISCILA . Genome Matrices and the Median Problem. 2017. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

8.
MEIDANIS, J.; ZANETTI, JOAO PAULO PEREIRA ; BILLER, PRISCILA . Genome Matrices and the Median Problem. 2017. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

9.
MEIDANIS, J.; ZANETTI, J. P. P. ; BILLER, P. . Genome Matrices and the Median Problem. 2016. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

10.
MEIDANIS, J.; LIMA, G. A. C. ; MOURA, A. V. ; SILVA, C. G. ; SOUZA, M. A. L. ; BARROS, R. S. . Otimização de Portfólios de Projetos em Empresas Geradoras de Energia. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

11.
MEIDANIS, J.; YANCOPOULOS, S. . Models and Algorithms for Genome Evolution. 2013. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

12.
MEIDANIS, J.; FEIJAO, P. . Inversion of Algorithms: applications to Bioinformatics. 2008. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).


Produção técnica
Programas de computador sem registro
1.
MEIDANIS, J.; ALMEIDA, A. A. M. ; MORIYA, A. ; JEROZOLIMSKI, D. ; CRUVINEL, A. . Montador de Fragmentos de Dna. 1996.

Produtos tecnológicos
1.
Simpson, A ; Reinach, F ; SETUBAL, J. C. ; MEIDANIS, J. ; Arruda, P . Sequencia de DNA completa de patógeno de planta. 2002.

Trabalhos técnicos
1.
MIRA, Cleber Valgas Gomes ; MEIDANIS, J. . Algebraic formalism for genome rearrangements (part 1). 2005.

2.
MEIDANIS, J.; LIN, T. L. . Visão geral do sistema de anotação de proteínas de transporte. 2002.

3.
DIAS, Z. ; MEIDANIS, J. . The genome rearrangement distance problem using fusion, fission, and transpositions with arbitrary weights. 2002.

4.
MEIDANIS, J.; TAKAKI, P. . Interval graphs with repeats and the DNA fragment assembly problem. 2002.

Entrevistas, mesas redondas, programas e comentários na mídia
1.
KOWALTOWSKI, T. ; SOMA, N. ; RUIVO, R. ; BITTENCOURT, R. ; Meidanis, Joao . Desmistificando 'The Art of Computer Programming'. 2018. (Programa de rádio ou TV/Mesa redonda).


Demais tipos de produção técnica
1.
MEIDANIS, J.. Inserção de dados no sistema do projeto BIOprospecTA. 2008. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

2.
MEIDANIS, J.. Sistema de Informação do BIOprospecTA - manual de usuário. 2008. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Manual).



Patentes e registros



Patente

A Confirmação do status de um pedido de patentes poderá ser solicitada à Diretoria de Patentes (DIRPA) por meio de uma Certidão de atos relativos aos processos
1.
 Simpson, A ; Reinach, F ; SETUBAL, J. C. ; MEIDANIS, J. ; Arruda, P . Sequencia de DNA completa de patógeno de planta. 2002, Brasil.
Patente: Patente no Exterior. Número do registro: WO200282432-A, título: "Sequencia de DNA completa de patógeno de planta" . Depósito: 17/10/2002Instituição(ões) financiadora(s): FAPESP.



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
FIGUEIREDO, C. M. H.; KOWADA, L. A. B.; BARBOSA, V. C.; MEIDANIS, J.. Participação em banca de Luís Felipe Ignácio Cunha. Limites para distância e diâmetro em rearranjo de genomas por transposições. 2013. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Sistemas e Computação) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

2.
MOURA, A. V.; MEIDANIS, J.. Participação em banca de Rafael Augusto Scaraficci. Estratégias Híbridas para um Problema de Planejamento e Escalonamento de Atividades Florestais de Curto Prazo. 2008. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

3.
WAKABAYASHI, Y.; MEIDANIS, J.; LAGO, A. P.. Participação em banca de Andréa Tieme Nakasato. Ordenação por Reversão. 2008. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Teses de doutorado
1.
BROOM, M.; CHALUB, F. A. C. C.; MEIDANIS, J.; WALTER, M. E. M. T.; NEVES, A. G. M.; TEIXEIRA, R. C.; SANKOFF, D.; SOUZA, M. O.. Participação em banca de Poly Hannah da Silva. Two Studies on the Mathematical Analysis of Evolution: fixation in star-like graphs and phylogenetic reconstruction through breakpoint medians. 2017. Tese (Doutorado em Matemática) - Universidade Federal Fluminense.

2.
S. A. Queiroz; MEIDANIS, J.; R. Carvalheiro; R. Fonseca; A. Sanches. Participação em banca de Eduardo da Cruz Gouveia Pimentel. Uso das rotações de Givens modificadas como um método direto para obtenção e atualização das soluções em sistemas com acumulação seqüencial de dados. 2007. Tese (Doutorado em Genética e Melhoramento Animal) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.




Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
Brazilian Symposium on Bioinformatics.Genome Matrices and The Median Problem. 2018. (Simpósio).

2.
RECOMB Comparative Genomics Satellite Workshop. 2016. (Oficina).

3.
RECOMB Comparative Genomics Satellite Workshop. 2012. (Oficina).

4.
WABI International Workshop on Algorithms in Bioinformatics. 2009. (Oficina).

5.
Inovação e Desenvolvimento Tecnológico - impacto na relação academia-indústria.Da Academia para a Empresa: Uma Experiência Pessoal. 2007. (Oficina).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
Anido, R. O. ; SETUBAL, J. C. ; MEIDANIS, J. . Décima Escola de Computação. 1996. (Congresso).



Orientações



Orientações e supervisões concluídas
Dissertação de mestrado
1.
João Paulo Pereira Zanetti. Complexidade de Construção de Árvores PQR. 2012. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Joao Meidanis.

2.
Priscila do Nascimento Biller. Experimentos em construção de árvores filogenéticas com a operação de rearranjo de genomas Single-Cut-Or-Join. 2012. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Joao Meidanis.

3.
Karina Zupo de Oliveira. Construção de Filogenias Baseadas em Genomas Completos. 2010. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas, . Orientador: Joao Meidanis.

4.
Patrícia Pilisson Côgo. Comparação de genomas completos de vibriões. 2008. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Joao Meidanis.

5.
André Atanasio Maranhão Almeida. Comparação algébrica de genomas: o caso da distância de reversão. 2007. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Joao Meidanis.

6.
José Augusto Amgarten Quitzau. Um consenso completamente resolvido entre árvores filogenéticas completamente resolvidas. 2005. 0 f. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas, . Orientador: Joao Meidanis.

7.
Vinicius José Fortuna. Distâncias de Transposição entre Genomas. 2005. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Joao Meidanis.

8.
Flavio Stecca. Coloração de Arestas de Grafos Indiferença. 2003. 90 f. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas, . Orientador: Joao Meidanis.

9.
Marcelo Cezar Pinto. Métodos e Ferramentas para comparação de Genomas. 2002. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Joao Meidanis.

10.
Lin Tzy Li. Montagem de Fragmentos de DNA pelo Método. 2001. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Joao Meidanis.

11.
Fabio Ribeiro Cerqueira. Montagem de Fragmentos de DNA. 2000. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas, . Orientador: Joao Meidanis.

12.
Marília Dias Vieira Braga. Grafos de Seqüências de DNA. 2000. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Joao Meidanis.

13.
Guilherme Pimentel Telles. Propriedade de Uns Consecutivos e Arvores Pqr. 1997. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas, . Orientador: Joao Meidanis.

14.
Erasmo Gongora Munuera. A Propriedade dos Uns Consecutivos e Reconhecimento de Grafos Intervalo. 1996. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas, . Orientador: Joao Meidanis.

Tese de doutorado
1.
João Paulo Pereira Zanetti. Teoria Algébrica de Rearranjo de Genomas. 2016. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Joao Meidanis.

2.
Priscila do Nascimento Biller. Teoria Algébrica de Rearranjo de Genomas. 2016. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Joao Meidanis.

3.
Pedro Feijão. On genome rearrangement models. 2012. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Joao Meidanis.

4.
Cleber Valgas Gomes Mira. Abordagem algébrica para rearranjo de genomas. 2007. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Joao Meidanis.

5.
Guilherme Pimentel Telles. Um algoritmo quase-linear para árvores PQR e um esquema para clustering de seqüências expressas de cana-de-açúcar. 2002. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Joao Meidanis.

6.
Zanoni Dias. Rearranjo de Genomas: Uma Coletânea de Artigos. 2002. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Joao Meidanis.

7.
Maria Emília Machado Telles Walter. Algoritmos para Problemas em Rearranjo de Genomas. 1999. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Joao Meidanis.

Supervisão de pós-doutorado
1.
João Paulo Pereira Zanetti. 2017. Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Joao Meidanis.



Educação e Popularização de C & T



Entrevistas, mesas redondas, programas e comentários na mídia
1.
KOWALTOWSKI, T. ; SOMA, N. ; RUIVO, R. ; BITTENCOURT, R. ; Meidanis, Joao . Desmistificando 'The Art of Computer Programming'. 2018. (Programa de rádio ou TV/Mesa redonda).




Página gerada pelo Sistema Currículo Lattes em 17/02/2019 às 5:15:13