Paulo Arruda

Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 1B

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  • Última atualização do currículo em 13/02/2018


Formado em Biologia pela Universidade Católica de Campinas, ingressou como professor na Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) em 1976, no Departamento de Genética e Evolução, Instituto de Biologia. Na UNICAMP, iniciou trabalhos de pesquisa em genética fisiológica de plantas e fez mestrado e doutorado em genética. Entre 1982e 1983, realizou pós-doutorado no Biochemistry Department, Rothamsted Experimental Station, Inglaterra. De volta ao Brasil em março de 1983, iniciou um grupo de pesquisa em biologia molecular de plantas, área até então incipiente no Brasil. A partir de 1987, coordenou a implantação do Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG) da UNICAMP para o desenvolvimento de grupos de pesquisa em biologia molecular principalmente na área vegetal. A partir de então realizou uma série de projetos em colaboração com universidades e instituições de pesquisa, envolvendo vários países da América Latina e da Europa. O seu principal tema de pesquisa é a regulação da expressão gênica. Possui 99 trabalhos em revistas científicas internacionais de alto impacto. Colaborou na organização do Programa Genoma FAPESP, estruturando o projeto de seqüenciamento do genoma da bactéria Xyllela fastidiosa. Nesse projeto coordenou um dos laboratórios centrais responsáveis pelo treinamento dos grupos da rede ONSA. Posteriormente, coordenou o Projeto Genoma da Cana de Açúcar (SUCEST), formado por uma rede de 60 grupos de pesquisa de diversas Universidades e Institutos de Pesquisa brasileiros. O laboratório de biologia molecular de plantas do CBMEG, sob sua liderança, já treinou mais de uma centena de estudantes de iniciação científica, mestres, doutores e pós-doutores, muitos dos quais ocupam posições de destaque em instituições de ensino e pesquisa nacionais e internacionais. Alem das atividades de pesquisa e ensino em nível de graduação e pós-graduação, coordena também um grupo de Educação em Ciências com apoio da Fundação VITAE, FAPESP, CAPES e FINEP. Esse trabalho já treinou centenas de estudantes e professores do ensino médio. Por suas atividades acadêmicas foi agraciado com diversos prêmios e honrarias dentre as quais se destacam: Prêmio Mérito Científico e Tecnológico outorgado pelo Governo do Estado de São Paulo, Prêmio ?Zeferino Vaz? de Reconhecimento Acadêmico concedido pela Universidade Estadual de Campinas, Prêmio Medalha REDBIO 2001 concedido pela Rede Latino-Americana de Biotecnologia/FAO. É membro titular da Academia Brasileira de Ciências e Membro da Ordem Nacional do Mérito Científico na classe de Comendador. Na área de editoria científica, é revisor de revistas científicas internacionais, membro do corpo editorial da revista Tropical Plant Biology publicada pela Springer, New York e editor associado da revista The Plant Genome, uma publicação da Crop Science Society of America. Como atividades de política científica, atuou como membro e coordenador do GT do PADCT, membro e coordenador do Comitê Assessor de Genética do CNPq, membro da coordenação do programa Genoma da FAPESP, membro do Comitê Assessor do Fundo Setorial de Biotecnologia do MCT e membro de comitês assessores de vários organismos internacionais como FAO, PNUD e UNU. No âmbito do desenvolvimento tecnológico, foi sócio fundador da empresa Alellyx Applied Genomics, a primeira empresa brasileira de genômica vegetal aplicada. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Paulo Arruda
Nome em citações bibliográficas
Arruda, P;Arruda p;Paulo Arruda;Arruda, Paulo

Endereço


Endereço Profissional
Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia.
UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS
CIDADE UNIVERSITARIA
13083875 - Campinas, SP - Brasil - Caixa-postal: 6010
Telefone: (19) 35211137
URL da Homepage: www.pgl.unicamp.br


Formação acadêmica/titulação


1979 - 1982
Doutorado em Genética e Biologia Molecular.
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Título: O POTENCIAL OSMOTICO EM MUTANTES DE ENDOSPERMA DE MILHO E SUA INTERA- CAO COM CARACTERISTICAS FISICAS E COM A ATIVIDADE DA RNASE DA SEMENTE, Ano de obtenção: 1982.
Orientador: WILLIAM JOSE DA SILVA.
Palavras-chave: Milho, Potencial Osmotico; Osmoregulacao; Rnase.
Grande área: Ciências Biológicas
1976 - 1979
Mestrado em Genética e Biologia Molecular.
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Título: SINTESE DE AMINO ACIDOS E PROTEINAS E CARACTERISTICAS FISICAS E QUIMI-CAS EM ENDOSPERMAS NORMAL E OPAQUE2 DURANTE O DESENVOLVIMENTO DA SE- MENTE D MILHO,Ano de Obtenção: 1979.
Orientador: WILLIAM JOSE DA SILVA.
Palavras-chave: Amino Acidos, Proteinas de Reserva; Lisina; Milho.
Grande área: Ciências Biológicas
1973 - 1976
Graduação em Ciencias Biologicas.
Pontifícia Universidade Católica de Campinas, PUC Campinas, Brasil.


Pós-doutorado e Livre-docência


1995
Livre-docência.
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Título: Regulação da Biossíntese e Degradação de Lisina em Milho, Ano de obtenção: 1995.
1982 - 1983
Pós-Doutorado.
Rothamsted Experimental Station, Biochemistry Department, RES, Inglaterra.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.


Atuação Profissional



Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Vínculo institucional

2002 - Atual
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Titular MS-6, Carga horária: 24

Vínculo institucional

1999 - 2002
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto MS-5, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

1995 - 1999
Vínculo: Servidor público ou celetista, Enquadramento Funcional: Professor Livre Docente MS-4, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

1983 - 1995
Vínculo: Servidor público ou celetista, Enquadramento Funcional: Professor Assistente Doutor MS-3, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

1979 - 1982
Vínculo: Servidor público ou celetista, Enquadramento Funcional: Professor Assistente MS-2, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

1976 - 1979
Vínculo: Servidor público ou celetista, Enquadramento Funcional: Professor MS-1, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

05/1976 - Atual
Ensino, Ciências Biólogicas, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Genética Molecular
Genética Vegetal II
Genética Vegetal I
Genética fisiológica e molecula
12/1986 - 04/2002
Direção e administração, Centro de Biologia Molecular e Enegenharia Genética, .

Cargo ou função
Diretor de Unidade.
03/1996 - 03/2000
Direção e administração, Instituto de Biologia, .

Cargo ou função
Coordenador de Programa.
03/1983 - 12/1993
Ensino, Genética e Biologia Molecular, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Genética fisiológica e molecular em plantas superiores

Alellyx Applied Genomics, ALELLYX, Brasil.
Vínculo institucional

2002 - 2008
Vínculo: Diretor, Enquadramento Funcional: Diretor Científico, Carga horária: 24

Atividades

07/2002 - 12/2008
Direção e administração, Diretoria, .

Cargo ou função
Diretor.


Projetos de pesquisa


1999 - 2002
Projeto genoma da cana-de-açúcar
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
1997 - 2003
Caracterização da proteína desacopladora de mitocôndrias de plantas, PUMP, e a sua possível relevância fisiológica no controle da produção de calor em plantas
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
1997 - 1999
Sequenciamento completo do genoma da bactéria fitopatogênica Xyllela fastidiosa.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
1996 - 1999
Genetic analysis and engineering of aluminum tolerance in maize and model plant
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
1995 - 1998
Mecanismos de transporte e metabolismo energético em sistemas biológicos
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
1991 - 1995
Expressão de genes que codificam coixinas em plantas transgênicas
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
1991 - 1995
Mapeamento por RFLPs da região 11-49 do cromossomo 2 de milhos tropicais: Introdução de resistência ambiental em linhagens elites
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
1991 - 1994
Caracterização bioquímica e molecular da H+/ATPASE de milho
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
1990 - 1992
Regulação da biossíntese de amino ácidos e proteínas em endospermas de milho e Coix lacryma-jobi
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
1988 - 1990
Biologia celular e molecular para o melhoramento do milho
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
1988 - 1990
Regulação da biossíntese de amino ácidos e proteínas em endospermas de milho e Coix lacryma-jobi
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
1988 - 1990
Transformacion de cana de azucar y maiz para obtener variedades resistentes al ataque de insectos
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
1988 - 1990
Biologia celular e molecular para o melhoramento do milho
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.


Projetos de desenvolvimento


1985 - 1987
Utilização de técnicas de biologia celular e molecular para o melhoramento do milho
Descrição: Estudo da regulação da biossíntese de aminoácisdos e proteinas de reserva em milho.
Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.


Outros Projetos


2001 - 2007
Ciência para todos
Situação: Concluído; Natureza: Outra.
1997 - 1999
A interface entre a universidade e o segundo grau: Os cursos de férias
Situação: Concluído; Natureza: Outra.


Membro de corpo editorial


2016 - Atual
Periódico: Frontiers in Plant Science
2008 - Atual
Periódico: Tropical Plant Biology
2008 - Atual
Periódico: The Plant Genome


Membro de comitê de assessoramento


2010 - Atual
Agência de fomento: Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
2010 - Atual
Agência de fomento: Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico


Revisor de periódico


1999 - Atual
Periódico: Plant Molecular Biology
1995 - Atual
Periódico: Molecular and General Genetics
1998 - Atual
Periódico: Journal of Agricultural and Food Chemistry
1993 - Atual
Periódico: Plant Physiology (Bethesda)
2002 - Atual
Periódico: Plant Physiology and Biochemistry (Paris)
2000 - Atual
Periódico: Journal of Plant Physiology
2002 - Atual
Periódico: Molecular Breeding
2002 - Atual
Periódico: Theoretical and Applied Genetics
1999 - Atual
Periódico: Physiologia Plantarum (Copenhagen)
2006 - Atual
Periódico: BMC Plant Biology (Online)
2006 - Atual
Periódico: BMC Genomics
2006 - Atual
Periódico: Journal of Biological Chemistry (Online)
2002 - Atual
Periódico: Biotechnology Progress
2004 - Atual
Periódico: Brazilian Journal of Plant Physiology
1995 - Atual
Periódico: Brazilian Journal o Medical andBiologicl Research
2002 - Atual
Periódico: Ciência Agrícola
1998 - Atual
Periódico: Ciencia e Cultura
2007 - Atual
Periódico: FEBS Letters
2001 - Atual
Periódico: FEMS Microbiology Letters
2006 - Atual
Periódico: Journal of Experimental Botany
1996 - Atual
Periódico: Pant Science
2006 - Atual
Periódico: Plant Molecular Biology Report
2007 - Atual
Periódico: Tropical Pant Biology
2009 - Atual
Periódico: Journal of Cereal Science


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Vegetal.
2.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.
3.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.


Idiomas


Inglês
Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Fala Bem, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.


Prêmios e títulos


2011
Ordem Nacional do Mérito Científico - Classe Grã Cruz, Presidencia da Republica.
2011
Membro titular da THE WORLD ACADEMY OF SCIENCES, TWAS.
2001
Prêmio Medalia RedBio 2001 concedido pela Rede Latino-americana de Biotecnologia pela contribuição para o desenvolvimento da Biotecnologia na America Latina, Rede Latino-americana de Biotecnologia.
2000
Prêmio Merito Cientifico e Tecnológico outorgado pelo Governo do Estado de São Paulo, pela contribuição ao sequenciamento do genoma da bactéria Xylella fastidiosa, Governo do Estado de São Paulo.
2000
Ordem Nacional do Mérito Científico - Classe Comendador, Presidencia da República.
1999
Menção honrosa concedida pelo XXV Concurso Prêmio Governador do Estado - Invento Brasileiro, Governo do Estado de São Paulo.
1999
Membro titular da Academia Brasileira de Ciências, Academia Brasileira de Ciencias.
1999
Prêmio Zeferino Vaz de Reconhecimento Acadêmico, Universidade Estadual de Campinas.
1997
Prêmio Zeferino Vaz de Reconhecimento Acadêmico, Universidade Estadual de Campinas.


Produções



Produção bibliográfica
Citações

Web of Science
Total de trabalhos:128
Total de citações:3951
Fator H:36
Arruda, Paulo  Data: 28/03/2017

SCOPUS
Total de trabalhos:111
Total de citações:4366
arruda p  Data: 25/11/2016

Outras
Total de trabalhos:128
Total de citações:6933
Arruda p  Data: 28/03/2017

Artigos completos publicados em periódicos

1.
ARMANHI, JADERSON SILVEIRA LEITE2018ARMANHI, JADERSON SILVEIRA LEITE ; DE SOUZA, RAFAEL SOARES CORREA ; DAMASCENO, NATÁLIA DE BRITO ; DE ARAÚJO, LAURA M. ; IMPERIAL, JUAN ; Arruda, Paulo . A Community-Based Culture Collection for Targeting Novel Plant Growth-Promoting Bacteria from the Sugarcane Microbiome. Frontiers in Plant Science, v. 8, p. 2191, 2018.

2.
BARRETO, PEDRO2017BARRETO, PEDRO ; YASSITEPE, JULIANA E. C. T. ; WILSON, ZOE A. ; Arruda, Paulo . Mitochondrial Uncoupling Protein 1 Overexpression Increases Yield in Nicotiana tabacum under Drought Stress by Improving Source and Sink Metabolism. Frontiers in Plant Science, v. 8, p. 1836, 2017.

3.
AQUINO, BRUNO2017AQUINO, BRUNO ; COUÑAGO, RAFAEL M. ; VERZA, NATALIA ; FERREIRA, LUCAS M. ; MASSIRER, KATLIN B. ; GILEADI, OPHER ; Arruda, Paulo . Structural Characterization of Maize SIRK1 Kinase Domain Reveals an Unusual Architecture of the Activation Segment. Frontiers in Plant Science, v. 8, p. 852, 2017.

4.
PENA, IZABELLA A.2016PENA, IZABELLA A. ; MARQUES, LYGIA A. ; LARANJEIRA, ANGELO B. A. ; YUNES, JOSÉ A. ; EBERLIN, MARCOS N. ; Arruda, Paulo . Simultaneous detection of lysine metabolites by a single LC-MS/MS method: monitoring lysine degradation in mouse plasma. SpringerPlus, v. 5, p. 172, 2016.

5.
ARMANHI, JADERSON SILVEIRA LEITE2016ARMANHI, JADERSON SILVEIRA LEITE ; DE SOUZA, RAFAEL SOARES CORREA ; DE ARAÚJO, LAURA MIGLIORINI ; Okura, Vagner Katsumi ; MIECZKOWSKI, PIOTR ; IMPERIAL, JUAN ; Arruda, Paulo . Multiplex amplicon sequencing for microbe identification in community-based culture collections. Scientific Reports, v. 6, p. 29543, 2016.

6.
DE SOUZA, RAFAEL SOARES CORREA2016DE SOUZA, RAFAEL SOARES CORREA ; Okura, Vagner Katsumi ; ARMANHI, JADERSON SILVEIRA LEITE ; JORRÍN, BEATRIZ ; LOZANO, NÚRIA ; DA SILVA, MÁRCIO JOSÉ ; GONZÁLEZ-GUERRERO, MANUEL ; DE ARAÚJO, LAURA MIGLIORINI ; VERZA, NATÁLIA CRISTINA ; BAGHERI, HOMAYOUN CHAICHIAN ; IMPERIAL, JUAN ; Arruda, Paulo . Unlocking the bacterial and fungal communities assemblages of sugarcane microbiome. Scientific Reports, v. 6, p. 28774, 2016.

7.
Okura, Vagner Katsumi2016Okura, Vagner Katsumi ; SOUZA, RAFAEL S. C. DE ; DE SIQUEIRA TADA, SUSELY F. ; Arruda, Paulo . BAC-Pool Sequencing and Assembly of 19 Mb of the Complex Sugarcane Genome. Frontiers in Plant Science, v. 7, p. 001, 2016.

8.
PENA, IZABELLA AGOSTINHO2016PENA, IZABELLA AGOSTINHO ; MARQUES, LYGIA AZEVEDO ; LARANJEIRA, ÂNGELO B.A. ; YUNES, JOSÉ A. ; EBERLIN, MARCOS N. ; MACKENZIE, ALEX ; Arruda, Paulo . Mouse lysine catabolism to aminoadipate occurs primarily through the saccharopine pathway; implications for pyridoxine dependent epilepsy (PDE). BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-MOLECULAR BASIS OF DISEASE, v. 1863, p. 121-128, 2016.

9.
Souza RSC2015Souza RSC ; Balbuena TS ; Arruda, P . Structure, Organization, and Expression of the Alpha Prolamin Multigenic Family Bring New Insights into the Evolutionary Relationships among Grasses. PLANT GENOME-US, v. 0, p. 1, 2015.

10.
Kiyota, Eduardo2015Kiyota, Eduardo ; PENA, IZABELLA AGOSTINHO ; Arruda, Paulo . The saccharopine pathway in seed development and stress response of maize. Plant, Cell and Environment (Print), v. 38, p. n/a-n/a, 2015.

11.
BARRETO, P. P.2015BARRETO, P. P. ; OKURA, VAGNER ; PENA, IZABELLA A. ; MAIA, RENATO ; MAIA, IVAN G. ; Arruda, P . Overexpression of mitochondrial uncoupling protein 1 (UCP1) induces a hypoxic response in Nicotiana tabacum leaves. Journal of Experimental Botany (Online), v. 67, p. erv460, 2015.

12.
BARRETO, PEDRO2014BARRETO, PEDRO ; Okura, Vagner Katsumi ; NESHICH, IZABELLA AGOSTINHO ; MAIA, IVAN DE ; Arruda, Paulo . Overexpression of UCP1 in tobacco induces mitochondrial biogenesis and amplifies a broad stress response. BMC Plant Biology (Online), v. 14, p. 144, 2014.

13.
NESHICH, IZABELLA AP2013NESHICH, IZABELLA AP ; Kiyota, Eduardo ; Arruda, Paulo . Genome-wide analysis of lysine catabolism in bacteria reveals new connections with osmotic stress resistance. The ISME Journal (Print), v. 7, p. 2400-2410, 2013.

14.
de Mello Serrano, Guilherme Coutinho2012de Mello Serrano, Guilherme Coutinho ; e Silva Figueira, Thaís Rezende ; Kiyota, Eduardo ; Zanata, Natalia ; Arruda, P . Lysine degradation through the saccharopine pathway in bacteria: LKR and SDH in bacteria and its relationship to the plant and animal enzymes. FEBS Letters (Print), v. 586, p. 905-911, 2012.

15.
Arruda, P;Arruda p;Paulo Arruda;Arruda, Paulo2012Arruda, P; Neshich IP . Nutritional-rich and stress-tolerant crops by saccharopine pathway manipulation. Food and Energy Security, v. 2, p. 1, 2012.

16.
Arruda, Paulo2012Arruda, Paulo. Genetically modified sugarcane for bioenergy generation. Current Opinion in Biotechnology, v. 23, p. 315-322, 2012.

17.
Silva Figueira, Thais Rezende e2012Silva Figueira, Thais Rezende e ; Arruda, Paulo ; Taag, Jayson ; Okura, Vagner ; da Silva, Marcio Jose ; Ammiraju, Jetty SS ; da Silva, Felipe Rodrigues ; Wing, Rod ; Kudrna, Dave . A BAC library of the SP80-3280 sugarcane variety (saccharum sp.) and its inferred microsynteny with the sorghum genome. BMC RESEARCH NOTES, v. 5, p. 185, 2012.

18.
KNAPP, STEFAN2012KNAPP, STEFAN ; Arruda, Paulo ; BLAGG, JULIAN ; BURLEY, STEPHEN ; DREWRY, DAVID H ; EDWARDS, ALED ; FABBRO, DORIANO ; GILLESPIE, PAUL ; GRAY, NATHANAEL S ; KUSTER, BERNHARD ; LACKEY, KAREN E ; MAZZAFERA, PAULO ; TOMKINSON, NICHOLAS C O ; WILLSON, TIMOTHY M ; WORKMAN, PAUL ; ZUERCHER, WILLIAM J . A public-private partnership to unlock the untargeted kinome. Nature Chemical Biology, v. 9, p. 3-6, 2012.

19.
VERZA, N.C.2011VERZA, N.C. ; Figueira, T.R.S. ; Sousa, S.M. ; Arruda, P . Transcription factor profiling identifies an aleurone-preferred NAC family member involved in maize seed development. Annals of Applied Biology, v. 158, p. 115-129, 2011.

20.
Figueira, Thais Resende Silva2011Figueira, Thais Resende Silva ; Arruda, P . Differential expression of uncoupling mitochondrial protein and alternative oxidase in the plant response to stress. Journal of Bioenergetics and Biomembranes, v. 43, p. 67-70, 2011.

21.
Arruda, P;Arruda p;Paulo Arruda;Arruda, Paulo2011Arruda, P. Perspective of the Sugarcane Industry in Brazil. Tropical Plant Biology, p. 3-8, 2011.

22.
Cheavegatti-Gianotto, Adriana2011Cheavegatti-Gianotto, Adriana ; Abreu, Hellen Marília Couto ; Arruda, P ; Bespalhok Filho, João Carlos ; Burnquist, William Lee ; Creste, Silvana ; Ciero, Luciana ; Ferro, Jesus Aparecido ; Oliveira Figueira, Antônio Vargas ; Sousa Filgueiras, Tarciso ; Grossi-de-Sá, Mária de Fátima ; Guzzo, Elio Cesar ; Hoffmann, Hermann Paulo ; Andrade Landell, Marcos Guimarães ; Macedo, Newton ; Matsuoka, Sizuo ; Castro Reinach, Fernando ; Romano, Eduardo ; Silva, William José ; Castro Silva Filho, Márcio ; César Ulian, Eugenio . Sugarcane (Saccharum X officinarum): A Reference Study for the Regulation of Genetically Modified Cultivars in Brazil. Tropical Plant Biology, v. 4, p. 62-89, 2011.

23.
Azevedo, R. A.2010Azevedo, R. A. ; Arruda, P . High-lysine maize: the key discoveries that have made it possible. Amino Acids (Wien. Print), v. 39, p. 979-989, 2010.

24.
Matsuoka, Sizuo2009Matsuoka, Sizuo ; Ferro, Jesus ; Arruda, P . The Brazilian experience of sugarcane ethanol industry. In Vitro Cellular & Developmental Biology. Plant, v. 45, p. 372-381, 2009.

25.
DESOUSA, S2009DESOUSA, S ; ROSSELLI, L ; KIYOTA, E ; DASILVA, J ; SOUZA, G ; PERONI, L ; STACHMACHADO, D ; EBERLIN, M ; SOUZA, A ; KOCH, K ; Arruda, P . Structural and kinetic characterization of a maize aldose reductase. Plant Physiology and Biochemistry (Paris), v. 47, p. 98-104, 2009.

26.
Figueira, Thaís Rezende e Silva2008Figueira, Thaís Rezende e Silva ; Mello Serrano, Guilherme Coutinho ; Arruda, P . Evolution of the Genes Encoding Seed Storage Proteins in Sugarcane and Maize. Tropical Plant Biology, v. 1, p. 108-119, 2008.

27.
Sousa, Sylvia Morais2008Sousa, Sylvia Morais ; Paniago, Mário del Giúdice ; Arruda, P ; Yunes, José Andrés . Sugar levels modulate sorbitol dehydrogenase expression in maize. Plant Molecular Biology, v. 68, p. 203-213, 2008.

28.
Jannoo, Nazeema2007Jannoo, Nazeema ; Grivet, Laurent ; Chantret, Nathalie ; Garsmeur, Olivier ; Glaszmann, Jean Christophe ; Arruda, Paulo ; D Hont, Angélique ; Arruda, P . Orthologous comparison in a gene-rich region among grasses reveals stability in the sugarcane polyploid genome. Plant Journal, v. 50, p. 574-585, 2007.

29.
Borecky, J.2006Borecky, J. ; NOGUEIRA, F. T. S. ; Oliveira kap ; Maia, Ivan de Godoy ; Vercesi, Anibal Eugenio ; Arruda, Paulo ; Arruda, P . The plant energy-dissipating mitochondrial systems: depicting the genomic structure and the expression profiles of the gene families of uncoupling protein and alternative oxidase in monocots and dicots. Journal of Experimental Botany, v. 57, p. 849-864, 2006.

30.
Vercesi, Anibal Eugenio2006Vercesi, Anibal Eugenio ; Borecky, Jiri ; Maia, Ivan de Godoy ; Arruda, P ; Cuccovia, Iolanda Midea ; Chaimovich, Hernan . PLANT UNCOUPLING MITOCHONDRIAL PROTEINS. Annual Review of Plant Biology, v. 57, p. 383-404, 2006.

31.
LORENZINI, D2006LORENZINI, D ; SILVAJR, P ; SOARES, M ; Arruda, P ; SETUBAL, J ; DAFFRE, S . Discovery of immune-related genes expressed in hemocytes of the tarantula spider Acanthoscurria gomesiana. Developmental and Comparative Immunology, v. 30, p. 545-556, 2006.

32.
Pascon, Renata C.2006Pascon, Renata C. Kitajima, João Paulo Breton, Michèle C. Assumpção, Laura Greggio, Christian Zanca, Almir S. Okura, Vagner Katsumi Alegria, Marcos C. Camargo, Maria E. Silva, Giovana G.C. Cardozo, Jussara C. Vallim, Marcelo A. Franco, Sulamita F. Silva, Vitor H. Junior, Hamilton Jordão Oliveira, Fernanda Giachetto, Poliana F. Ferrari, Fernanda Aguilar-Vildoso, Carlos I. Franchiscini, Fabrício J.B. Silva, José M.F. Arruda, Paulo Arruda, P Ferro, Jesus A. Reinach, Fernando , et al.Silva, Ana Cláudia Rasera ; The Complete Nucleotide Sequence and Genomic Organization of Citrus Leprosis Associated Virus, Cytoplasmatic type (CiLV-C). Virus Genes, v. 32, p. 289-298, 2006.

33.
Maccheroni, W.2005Maccheroni, W. Alegria, M. C. Greggio, C. C. Piazza, J. P. Kamla, R. F. Zacharias, P. R. A. Bar-Joseph, M. Kitajima, E. W. Assumpcao, L. C. Camarotte, G. Cardozo, J. Casagrande, E. C. Ferrari, F. Franco, S. F. Giachetto, P. F. Girasol, A. Jordao, H. Silva, V. H. A. Souza, L. C. A. Aguilar-Vildoso, C. I. Zanca, A. S. Arruda, P Kitajima, J. P. Reinach, F. C. Ferro, J. A. , et al.da Silva, A. C. R. ; Identification and Genomic Characterization of a New Virus (Tymoviridae Family) Associated with Citrus Sudden Death Disease. Journal of Virology, v. 79, p. 3028-3037, 2005.

34.
De Rosa Jr., Vicente E.2005De Rosa Jr., Vicente E. ; Nogueira, Fábio T. S. ; Menossi, Marcelo ; Ulian, Eugênio C. ; Arruda, Paulo ; Arruda, P . Identification of methyl jasmonate-responsive genes in sugarcane using cDNA arrays. Brazilian Journal of Plant Physiology, v. 17, p. 131-136, 2005.

35.
NOGUEIRA, F2005NOGUEIRA, F ; SCHLOGL, P ; CAMARGO, S ; FERNANDEZ, J ; DEROSAJR, V ; POMPERMAYER, P ; Arruda, P ; Arruda, P . SsNAC23, a member of the NAC domain protein family, is associated with cold, herbivory and water stress in sugarcane. Plant Science (Limerick), v. 169, p. 93-106, 2005.

36.
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112.
Crozier, Alan1988Crozier, Alan ; Arruda, P ; Jasmim JM ; Monteiro AM ; Sandberg G . Analysis Of Indole-3-Acetic Acid Related Indoles In Culture Medium From Azospirillum Lipoferum And Azospirillum Brasilense. APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, v. 54, p. 2833-2837, 1988.

113.
Arruda, P;Arruda p;Paulo Arruda;Arruda, Paulo1984Arruda, P; Bright, S. W. J. ; Kueh, J. S. H. ; Lea, P. J. ; Rognes, S. E. . Regulation of Aspartate Kinase Isoenzymes in Barley Mutants Resistant to Lysine plus Threonine : Construction and Analysis of Combinations of the Lt1a, Lt1b, and Lt2 Mutant Genes. Plant Physiology (Bethesda), v. 76, p. 442-446, 1984.

114.
Arruda, P1983Arruda, P; da Silva WJ . Lysine-ketoglutarate reductase activity in maize: Its possible role in lysine metabolism of developing endosperm. Phytochemistry, v. 22, p. 2687-2689, 1983.

115.
Arruda, P;Arruda p;Paulo Arruda;Arruda, Paulo1982Arruda, P; Sodek, L. ; da Silva, W. J. . Lysine-Ketoglutarate Reductase Activity in Developing Maize Endosperm. Plant Physiology (Bethesda), v. 69, p. 988-989, 1982.

116.
Arruda, P;Arruda p;Paulo Arruda;Arruda, Paulo1982Arruda, P; da Silva WJ . Protein And Aminoacid Metabolism In Normal And High/Lysine Sugary Opaque-2 Maize Endosperm During Kernel Development. REVISTA BRASILEIRA DE GENETICA, v. 2, p. 313-319, 1982.

117.
Arruda, Paulo1979Arruda, Paulo; Da Silva, William J. . Relationship among maize endosperm characteristics of normal and sugary opaque-2 kernels during development. Journal of Agricultural and Food Chemistry, v. 27, p. 802-805, 1979.

118.
Arruda, P1979Arruda, P; da Silva WJ . Amino acid composition of vascular sap of maize ear peduncle. Phytochemistry, v. 18, p. 409-410, 1979.

119.
Arruda, P1979Arruda, P; da Silva WJ . Evidence for the genetic control of lysine catabolism in maize endosperm. Phytochemistry, v. 18, p. 1803-1805, 1979.

120.
WJ, S.1978WJ, S. ; JPF, T. ; MB, L. ; Arruda, P . Nutrimaiz A Tropical Sweet Corn Cultivar Of High Nutritional Value. MAYDICA, v. 23, p. 129-137, 1978.

121.
Arruda, P1978Arruda, P; da Silva WJ ; JPF, T. . Protein and free amino acids in a high lysine maize double mutant. Phytochemistry, v. 17, p. 1217-1218, 1978.

122.
JPF, T.1976JPF, T. ; OC, B. ; Arruda, P . Determinacao Automatizada de Enxofre Em Plantas Pelo Sistema Autoana- Lizador Ii Technicon. BRAGANTIA, v. 35, p. 77-81, 1976.

Capítulos de livros publicados
1.
Ferro JA ; MATSUOKA S ; Arruda, P . The Brazilian Experience of Sugarcane Ethanol Industry. In: Tomes D; Lakshmanan P; Songstad D. (Org.). BIOFUELS: GLOBAL IMPACT ON RENEWABLE ENERGY, PRODUCTION AGRICULTURE, AND TECHNOLOGICAL ADVANCEMENTS. : Springer, 2011, v. , p. 157-172.

2.
SILVA, T. R. ; Arruda, P . Transcriptome analysis of sugarcane genome for crop improvement. In: Rajeev K. Varshney and Roberto Tuberosa. (Org.). Genomics-Assisted Crop Improvement. : Springer Netherlands, 2007, v. 2, p. 483-494.

3.
Arruda, P; A, L. ; G, C. N. ; Vettore AL ; JA, Y. . The prolamins of sorghum, Coix and millets. In: PR Shewry and R. Casey. (Org.). Seed Proteins. Dordrecht: Kluwer Academic Publishers, 1999, v. , p. 141-157.

4.
Arruda, P; Vercesi AE ; Jezek P ; Costa ADT ; Maia IG ; Kowaltowski AJ . A plant uncoupling mitochondrial protein. In: IM Moller, P. Gardestron, K Glimelius and E. Glaser. (Org.). Plant Mitochondria: From gene to function. Leiden: Backhuys Publisher, 1998, v. , p. 435-440.

5.
Arruda, P; Maia IG ; Benedetti CE ; A, L. ; SR, T. ; Vercesi AE . Structure and cold induction pattern of AtPUMP, an Arabidopsis gene encoding an uncoupling mitochondrial protein. In: IM Moller, P. Gardestron, K Glimelius and E. Glaser. (Org.). Plant Mitochondria: From gene to function. Leiden: Backhuys Publisher, 1998, v. , p. 493-497.

6.
Arruda, P; Polikarpov I ; Craievich A ; G, O. ; Castellano EE ; R, G. ; A, L. . Protein crystallography station at LNLS. In: Gazzenelli R, Moreira L.R and Rodrigues W.U.N. (Org.). Physics and Industrial Development: Bridging the gap. Singapore: World Scientific, 1997, v. , p. 391-394.

7.
Arruda, P; G, C. N. ; M, G. . Lysine catabolism and the regulation of lysine accumulation in maize endosperm. In: Mertz, E.T. and Larkins, B.A. (Org.). Thirty years of quality protein maize. Purdue: Purdue University Press, 1997, v. , p. 175-184.

8.
P, A. ; Arruda, P ; MR, B. ; M, G. ; TORIGOI ; RA, A. ; A, L. . The Role Of Lysine-Ketoglutarate Reductase In Lysine Accumulation In Maize Endosperm. In: arruda P. (Org.). AMINOACIDS AND THEIR DERIVATIVES IN HIGHR PLANTS. SEB PLANT METABOLISMGROUP CONFERENCE. OXFOR, UK: OXFORD PRESS, 1994, v. , p. -.

9.
A, C. ; Arruda, P ; G, S. ; CT, W. ; R, A. ; AM, M. ; JM, J. ; P, A. . Phytohormone Production By Nitrogn Fixing Bcteria. In: arruda p. (Org.). PHYSIOLOGY AND BUOCHEMISTRY OF AUXINS IN PLANTS. : ACAEMIC PUBLISHING. THE HAGNE, 1987, v. , p. 67-75.

10.
LM, P. ; Arruda, P ; WJ, S. ; P, A. ; MR, S. . Regeneration Capacity Of Corn And Teosinte Genotypes. In: arruda p. (Org.). TISSUE CULTURE IN FORSTRY AND AGRICULURE. : PLENUM PUBLISHING CORP, 1984, v. , p. -.

11.
SWJ, B. ; Arruda, P ; PJ, L. ; P, A. ; NP, H. ; AC, K. ; AJ, K. ; JSH, K. ; ML, P. ; SE, R. ; RM, T. J. W. ; BJ, M. . Manipulation Of Key Pathways In Photorespiration And Aminoacid Metabolism By Mutation And Selection. In: arruda p. (Org.). THE GENETIC MANIPULATION OF PLANTS AND ITS APPLICATION TO AGRICULTURE. OXFORD, UK: OXFORD UNIVERSITY PRESS, 1984, v. , p. 141-169.

12.
WJ, S. ; Arruda, P ; P, A. ; AP, R. . Plant Characteistics And Nitrogenase Activity In Five Inbred Lines Of Maize. In: arruda p. (Org.). ASSOCIATIVE N2-FIXATION. BOCA RATON, FLORIDA, USA: CRC PRESS INC, 1981, v. , p. 179-187.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
da SILVA, F. R. ; TELLES, G. P. ; Arruda, P . CLUSTERING 300,000 SUGARCANE ESTS. THE CHALANGE OF DEALING WITH ORHTOLOGS, PAROLOGS, HOMOLOGS AND SOME RUBBISH. In: 7th International congress of Plant Molecular Biology, 2003, Barcelona. 7th International congress of Plant Molecular Biology- Book of Abstracts. Athens, GA - USA: The International Society For Plant Molecular Biology, 2003. v. 1. p. 58-58.

2.
VERZA, N.C. ; SILVA, T. R. ; da SILVA, F. R. ; Vettore AL ; Arruda, P ; et al . GENOMIC ANALYSIS OF THE OF TRANSCRIPTION FACTORS EXPRESSED IN DEVELOPING MAIZE ENDOSPERM. In: 7th International congress of Plant Molecular Biology, 2003, Barcelona. 7th International congress of Plant Molecular Biology- Book of Abstracts. Athens, GA , USA: The International Society For Plant Molecular Biology, 2003. v. 1. p. 59-59.

3.
SILVA, T. R. ; VERZA, N.C. ; FISCH, P. H. ; REBELLO, M. M. ; Arruda, P . Large Scale EST Sequencing Shows Specific Genes Expressed In Developing Maize Endosperm.. In: 7th International congress of Plant Molecular Biology, 2003, Barcelona. 7th International congress of Plant Molecular Biology- Book of Abstracts, 2003. v. 1. p. 59-59.

4.
VERZA, N.C. ; SILVA, T. R. ; FISCH, P. H. ; REBELLO, M. M. ; da SILVA, F. R. ; Vettore AL ; Arruda, P . Genomic Analysis Of The Transcription Factors Expressed In Developing Maize Endosperm.. In: 7th International congress of Plant Molecular Biology, 2003, Barcelona. 7th International congress of Plant Molecular Biology- Book of Abstracts, 2003. v. 1. p. 59-59.

5.
de ROSA JUNIOR, V. E. ; NOGUEIRA, F. T. S. ; ULIAN, E. C. ; Menossi M ; Arruda, P . Expression Profile Of Methyl Jasmonate Responsive Genes In Sugarcane. In: 7th International Congress of Plant Molecular Biology, 2003. 7th International Congress of Plant Molecular Biology - Book of Abstracts. v. 1. p. 59-59.

6.
VERZA, N.C. ; SILVA, T. R. ; FISCH, P. H. ; REBELLO, M. M. ; da SILVA, F. R. ; Vettore AL ; Arruda, P . ?Discovering The Transcription Factors Expression Profile In The Developing Maize Endosperm Transcriptome?. In: XXXII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2003, Caxambu. XXXII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBQ 2003, 2003. v. 1. p. 65-65.

7.
SILVA, T. R. ; VERZA, N.C. ; da SILVA, F. R. ; FISCH, P. H. ; REBELLO, M. M. ; Vettore AL ; Arruda, P . ?Large scale EST analysis of the maize developing endosperm?.. In: XXXII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2003, Caxambu. XXXII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular ? SBBQ 2003, 2003. v. 1. p. 65-65.

8.
BORECKÝ, J. ; NOGUEIRA, F. T. S. ; Maia IG ; Vercesi AE ; Arruda, P . ?Identification Of Members Of Uncoupling Protein And Alternative Oxidase Gene Families And Their Differential Expression In Sugarcane Tissues?. In: XXXII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2003, Caxambu. XXXII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular ? SBBQ 2003, 2003. v. 1. p. 17-17.

9.
NOGUEIRA, F. T. S. ; de ROSA JUNIOR, V. E. ; SCHLOGL, P. ; POMPERMAYER, P. ; COSTA-NETTO, A. P. ; Arruda, P . A Cold- And ABA-Inducible Sugarcane Gene Functionally Related To The ATAF Subfamily Of NAC Domain Proteins. In: 7th International Congress of Plant Molecular Biology, 2003, Barcelona. 7th International congress of Plant Molecular Biology - Book of Abstracts, 2003. v. 1. p. 59-59.


Produção técnica
Processos ou técnicas
1.
SIMPSON, Aj ; REINACH, Fc ; SETUBAL, Jc ; MEIDANIS, Jc ; Arruda, P . Isolated genome of xyllela fastidiosa and uses thereof.. 2002.

2.
NASCIMENTO, Lto ; KO, Ai ; Arruda, P ; TSAI, M . New isolated nucleic acid molecule that encodes a leptospiral surface protein, useful for diagnosing and treating a leptospiral infection, particularly leptospirosis. 2001.

3.
LEITE, A ; ZAWAZOE, U ; Arruda, P ; DASILVAJR, A . Antimicrobial peptides and methods for identifying and using such peptides. 2000.

4.
Arruda, P; SILVA, Fr da ; KEMPER, El ; VETTORE, Al ; LEITE, A ; DASILVA, Mj . Isolated Gum operon from Xylella fastidiosa, isolated nucleic acid molecules therefrom, and uses thereof. 1999.

5.
LEITE, A ; Arruda, P ; ELDORRY, H ; KEMPER, e ; DASILVA, Mj . Desenvolvimento de um cassete de expressão de proteínas heterólogas especificamente em sementes de plantas transgênicas. 1998.

Demais trabalhos
1.
Arruda, P; Silva FR ; Kemper EL ; Vettore AL ; A, L. ; MJ, S. . Isolated Gum operon from Xylella fastidiosa, isolated nucleic acid molecules therefrom, and uses thereof. 2000 (Patente) .

2.
Arruda, P; A, L. ; El-Dorry H ; Kemper EL ; MJ, S. . Desenvolvimento de um cassete para expressão de proteínas heterólogas especificamente em sementes de plantas transgênicas. 1998 (Patente) .



Patentes e registros



Patente

A Confirmação do status de um pedido de patentes poderá ser solicitada à Diretoria de Patentes (DIRPA) por meio de uma Certidão de atos relativos aos processos
1.
 PAPES, Fabio ; Paulo Arruda . POLYNUCLEOTIDES, DNA CONSTRUCTS AND METHODS FOR THE ALTERATION OF PLANT LIGNIN CONTENT AND/OR COMPOSITION. 2006, Brasil.
Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: WO2006017920 (A2, título: "POLYNUCLEOTIDES, DNA CONSTRUCTS AND METHODS FOR THE ALTERATION OF PLANT LIGNIN CONTENT AND/OR COMPOSITION" , Instituição de registro: PATENT COOPERATION TREATY APPLICATION. Depósito: 23/02/2006; Depósito PCT: 23/02/2006; Concessão: 20/08/2013.

2.
 PAPES, F. ; Paulo Arruda . CONSTITUTIVE PROMOTERS FROM POPLAR AND USES THEREOF. 2008, Brasil.
Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: EP1904622 (A2), título: "CONSTITUTIVE PROMOTERS FROM POPLAR AND USES THEREOF" , Instituição de registro: EUROPEAN PATENT APPLICATION. Depósito: 02/04/2008; Depósito PCT: 10/04/2008; Concessão: 12/08/2014.

3.
 PAPES, Fabio ; Paulo Arruda . POLYNUCLEOTIDES, DNA CONSTRUCTS AND METHODS FOR THE ALTERATION OF PLANT CELLULOSE CONTENT. 2008, Bélgica.
Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: EP1945022 (A2), título: "POLYNUCLEOTIDES, DNA CONSTRUCTS AND METHODS FOR THE ALTERATION OF PLANT CELLULOSE CONTENT" , Instituição de registro: EUROPEAN PATENT. Depósito: 23/07/2008; Depósito PCT: 23/07/2008; Concessão: 12/08/2013.

4.
 Paulo Arruda; GERHARDT, I. R. . NUCLEIC ACID CONSTRUCTS AND METHODS FOR ALTERING PLANT FIBER LENGTH AND/OR PLANT HEIGHT. 2009, Brasil.
Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: EP2094852 (A1), título: "NUCLEIC ACID CONSTRUCTS AND METHODS FOR ALTERING PLANT FIBER LENGTH AND/OR PLANT HEIGHT" , Instituição de registro: EUROPEAN PATENT. Depósito: 02/09/2009; Depósito PCT: 02/09/2009; Concessão: 12/08/2013.

5.
 GERHARDT, I. R. ; Paulo Arruda . NUCLEIC ACID MOLECULES ENCODING PLANT PROTEINS IN THE C3HC4 FAMILY AND METHODS FOR THE ALTERATION OF PLANT CELLULOSE AND LIGNIN CONTENT. 2009, Bélgica.
Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: EP2097532 (A1), título: "NUCLEIC ACID MOLECULES ENCODING PLANT PROTEINS IN THE C3HC4 FAMILY AND METHODS FOR THE ALTERATION OF PLANT CELLULOSE AND LIGNIN CONTENT" , Instituição de registro: EUROPEAN PATENT. Depósito: 09/09/2009; Depósito PCT: 09/09/2009; Concessão: 14/08/2014.

6.
 Arruda, P; GERHARDT, I.R. . INCREASING CELL WALL DEPOSITION AND BIOMASS IN PLANTS. 2010, Estados Unidos.
Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: WO2010020868 A2, título: "INCREASING CELL WALL DEPOSITION AND BIOMASS IN PLANTS" , Instituição de registro: PATENT COOPERATION TREATY APPLICATION. Depósito: 25/02/2010; Depósito PCT: 25/02/2010; Concessão: 18/08/2013.

7.
 PAPES, F. ; GERHARDT, I. R. ; Arruda p . Cambium/Xylem-preferred promoters and uses thereof. 2013, Bélgica.
Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: EP2557166 (A2), título: "Cambium/Xylem-preferred promoters and uses thereof" , Instituição de registro: EUROPEAN PATENT APPLICATION. Depósito: 13/02/2013; Depósito PCT: 13/02/2013; Concessão: 13/08/2014.



Orientações



Orientações e supervisões em andamento
Dissertação de mestrado
1.
Laura Migliorini. Microbioma da cana de açúcar. Início: 2014. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Projeto Saccharome, Repsol Fumcamp. (Orientador).

Tese de doutorado
1.
Jaderson Armanhi. Microbioma da cana de a'cucar. Início: 2014. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Projeto Saccharome, Repsol Fumcamp. (Orientador).

2.
Rafael Soares Correa. O MICROBIOMA DA CANA-DE-AÇÚCAR. Início: 2013. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Projeto Saccharome, Repsol Fumcamp. (Orientador).

3.
Izabella Agostinho Pena-Neshich. Mecanismos de indução da via da Sacaropina em resposta a estresses em células humanas. Início: 2013. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. (Orientador).

4.
Vagner Okura. Desenvolvimento de um modelo para sequenciamento e montagem de pools de BACs de genomas complexos. Início: 2012. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas. (Orientador).

5.
Eduardo Kyiota. Identificação e caracterização da enzima aminoadípico semialdeído desidrogenase em plantas. Início: 2011. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas. (Orientador).


Orientações e supervisões concluídas
Dissertação de mestrado
1.
Guilherme Serrano. Síntese e degradação de lisina em organismos superirores: uma possível origem bacteriana.. 2010. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Paulo Arruda.

2.
Nathaly Nunes Uchôa. Indução do gene codificador da enzima LKR/SDH em diferentes condições de estresse em milho e Arabidopsis. 2002. 0 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Paulo Arruda.

3.
Tiago Campos Pereira. Regulação do silenciamento gênico pós-transcricional. 2002. 0 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Paulo Arruda.

4.
Marcos Brandalise. Estudo de stress oxidativo em plantas transgênicas superexpressando AtPUMP.. 2001. Dissertação (Mestrado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Coorientador: Paulo Arruda.

5.
Karen Cristiane Martinez de Morais. Controle do catabolismo de lisina na semente de milho: Isolamento, sequenciamento e caracterização do clone genômico da LKR (Lisina-cetoglutarato redutase). 1999. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Paulo Arruda.

6.
Ricardo Augusto Dante. Clonagem, caracterização e estudo da expressão do gene DapA que codifica a enzima dihidrodipicolinato sintase de Coix lacryma-jobi L. 1997. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Paulo Arruda.

7.
Edson Luis Kemper. Transformação de milho através de bombardeamento com micropartículas. Otimização de parâmetros físicos e biológicos. 1996. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Paulo Arruda.

8.
Meyrimar Gonçalves-Butruille. Lisina cetoglutarato redutase e sacaropina dehydrogenase são atividades de um polipeptídeo bifuncional em endosperma de milho (Zea mays L) em desenvolvimento. 1994. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Paulo Arruda.

9.
MARIA LUISA NATIVIDADE PENTEADO TARGON. Sintese e Deposicao de Coixinas Em Sementes de Coix Lacryma-Jobi Var. Adlay. 1991. Dissertação - Universidade Estadual de Campinas, . Orientador: Paulo Arruda.

10.
MARCIO JOSE DA SILVA. Caracterizacao de Mutantes Adh-0 Em Milho Obtidos Atraves de Variacao Somaclonal. 1990. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual de Campinas, . Orientador: Paulo Arruda.

11.
ROSELY TIEMI SAKATA. Efeeito do Herbicida Glifosato Em Cultura de Tecidos de Milho (Zea Mays L). 1989. Dissertação - Universidade Estadual de Campinas, . Orientador: Paulo Arruda.

12.
RICARDO ANTUNES DE AZEVEDO. Mutantes da Via Metabolica do Acido Aspartico Em Milho Obtidos Atravesde Cultura de Tecidos. 1988. Dissertação - Universidade Estadual de Campinas, . Orientador: Paulo Arruda.

13.
JANIE MENDES JASMIN. Caracterizacao de Azospirillum Brasiliensis e Azospirillum Lipoferum Aisolados de Teosinte e Milho e Sua Interacao Com Raizes de Milho. 1988. Dissertação - Universidade Estadual de Campinas, . Orientador: Paulo Arruda.

Tese de doutorado
1.
Pedro Paulo Augusto Fabiano Arantes Pereira Barreto. Alterações no metabolismo energético provocadas pela superexpressão da proteína desacopladora mitocondrial 1 (UCP1) em tabaco induzem biogênese mitocondrial e resposta global a estresses. 2014. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Paulo Arruda.

2.
Thais Rezende e Silva Figueira. A origem do milho: a identificação de saccharum como um de seus prováveis parentais. 2007. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Paulo Arruda.

3.
Vicente Eugenio de Rosa Junior. Análise funcional e caracterização de genes induzidos por ácido jasmônico. sob diferentes estresses em tecidos de cana-de-açúcar. 2005. 0 f. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Paulo Arruda.

4.
Natalia Cristina Verza Ferreira. Análise, classificação, anotação e perfil de expressão de fatores de transcrição no endosperma de milho (Zea mays L). 2005. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Paulo Arruda.

5.
Fábio Tebaldi Silveira Nogueira. Análise funcional e caracterização de genes expressos sob diferentes estresses em cana-de-açúcar. 2004. 0 f. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Paulo Arruda.

6.
Fabio Papes. Caracterização molecular e funcional da degradação de lisina pela via da sacaropina em eucariotos superiores. 2001. 0 f. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Paulo Arruda.

7.
Adriana Natalicio Cappela. Caracterização de genes diferencialmente expressos em Arabidopsis thaliana em resposta ao ácido jasmônico. 2001. 0 f. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Paulo Arruda.

8.
Edson Luis Kemper. O papel fisiológico da enzima LKR-SDH em plantas. 1999. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Paulo Arruda.

9.
Germano Cord Neto. O envolvimento do ativador transcricional Opaco2 no metabolismo de lisina e na síntese de proteínas de reserva durante o desenvolvimento da semente de milho. 1998. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Paulo Arruda.

10.
José Andres Yunes. Interação da proteína Opaco2 com o promotor de um gene de a-coixina: especificidade e aspectos termodinâmicos da interação proteína-DNA. 1997. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Paulo Arruda.

11.
Marcio Jose da Silva. Desenvolvimento de. 1996. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, . Orientador: Paulo Arruda.

12.
LAURA MARIA MARISCAL OTTOBONI. As Proteinas do Endosperma de Coix Lacryma-Jobi L Var. Adlay.I Caracterizacao e Comparacao Com Proteinas do Endosperma de Milho e Teosinte. 1989. Tese - Universidade Estadual de Campinas, . Orientador: Paulo Arruda.

13.
MARCIA REGINA BROCHETO-BRAGA. Purificacao e Caracterizacao Molecular da Lisina-Cetoglutarato Redutase de Endospermas de Milho (Zea Mays L). 1989. Tese - Universidade Estadual de Campinas, . Orientador: Paulo Arruda.

14.
OSWALDO GARCIA JUNIOR. Estudos da Biolixiviacao de Minerios de Uranio Por Thiobacillus Ferroxidans. 1989. Tese - Universidade Estadual de Campinas, . Orientador: Paulo Arruda.



Inovação



Patente
1.
 Arruda, P; GERHARDT, I.R. . INCREASING CELL WALL DEPOSITION AND BIOMASS IN PLANTS. 2010, Estados Unidos.
Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: WO2010020868 A2, título: "INCREASING CELL WALL DEPOSITION AND BIOMASS IN PLANTS" , Instituição de registro: PATENT COOPERATION TREATY APPLICATION. Depósito: 25/02/2010; Depósito PCT: 25/02/2010; Concessão: 18/08/2013.

2.
 PAPES, F. ; GERHARDT, I. R. ; Arruda p . Cambium/Xylem-preferred promoters and uses thereof. 2013, Bélgica.
Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: EP2557166 (A2), título: "Cambium/Xylem-preferred promoters and uses thereof" , Instituição de registro: EUROPEAN PATENT APPLICATION. Depósito: 13/02/2013; Depósito PCT: 13/02/2013; Concessão: 13/08/2014.

3.
 PAPES, F. ; Paulo Arruda . CONSTITUTIVE PROMOTERS FROM POPLAR AND USES THEREOF. 2008, Brasil.
Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: EP1904622 (A2), título: "CONSTITUTIVE PROMOTERS FROM POPLAR AND USES THEREOF" , Instituição de registro: EUROPEAN PATENT APPLICATION. Depósito: 02/04/2008; Depósito PCT: 10/04/2008; Concessão: 12/08/2014.

4.
 PAPES, Fabio ; Paulo Arruda . POLYNUCLEOTIDES, DNA CONSTRUCTS AND METHODS FOR THE ALTERATION OF PLANT LIGNIN CONTENT AND/OR COMPOSITION. 2006, Brasil.
Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: WO2006017920 (A2, título: "POLYNUCLEOTIDES, DNA CONSTRUCTS AND METHODS FOR THE ALTERATION OF PLANT LIGNIN CONTENT AND/OR COMPOSITION" , Instituição de registro: PATENT COOPERATION TREATY APPLICATION. Depósito: 23/02/2006; Depósito PCT: 23/02/2006; Concessão: 20/08/2013.

5.
 Paulo Arruda; GERHARDT, I. R. . NUCLEIC ACID CONSTRUCTS AND METHODS FOR ALTERING PLANT FIBER LENGTH AND/OR PLANT HEIGHT. 2009, Brasil.
Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: EP2094852 (A1), título: "NUCLEIC ACID CONSTRUCTS AND METHODS FOR ALTERING PLANT FIBER LENGTH AND/OR PLANT HEIGHT" , Instituição de registro: EUROPEAN PATENT. Depósito: 02/09/2009; Depósito PCT: 02/09/2009; Concessão: 12/08/2013.

6.
 PAPES, Fabio ; Paulo Arruda . POLYNUCLEOTIDES, DNA CONSTRUCTS AND METHODS FOR THE ALTERATION OF PLANT CELLULOSE CONTENT. 2008, Bélgica.
Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: EP1945022 (A2), título: "POLYNUCLEOTIDES, DNA CONSTRUCTS AND METHODS FOR THE ALTERATION OF PLANT CELLULOSE CONTENT" , Instituição de registro: EUROPEAN PATENT. Depósito: 23/07/2008; Depósito PCT: 23/07/2008; Concessão: 12/08/2013.

7.
 GERHARDT, I. R. ; Paulo Arruda . NUCLEIC ACID MOLECULES ENCODING PLANT PROTEINS IN THE C3HC4 FAMILY AND METHODS FOR THE ALTERATION OF PLANT CELLULOSE AND LIGNIN CONTENT. 2009, Bélgica.
Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: EP2097532 (A1), título: "NUCLEIC ACID MOLECULES ENCODING PLANT PROTEINS IN THE C3HC4 FAMILY AND METHODS FOR THE ALTERATION OF PLANT CELLULOSE AND LIGNIN CONTENT" , Instituição de registro: EUROPEAN PATENT. Depósito: 09/09/2009; Depósito PCT: 09/09/2009; Concessão: 14/08/2014.




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