Eugênio Simão

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  • Última atualização do currículo em 21/11/2015


Possui graduação em Engenharia da Computação pela Pontifícia Universidade Católica do Paraná (1995). Mestrado em Ciências da Computação pela Universidade Federal de Santa Catarina (2002), com defesa de dissertação em Serviços Diferenciados em Redes de Computadores. Doutorado em Engenharia Quimica pela Universidade Federal de Santa Catarina (2006), defesa de tese em Biologia Molecular Computacional, Métodos Formais para Modelagem Redes de Regulação Genômicas. Doutorado Sanduíche no laboratório IBDM/CNRs de Marselha, França, em Bioinformatica. Atualmente professor adjunto da Universidade Federal de Santa Catarina, UFSC Campus de Araranguá, também foi coordenador do Curso de Engenharia de Computação e atualmente Diretor do Campus UFSC/Araranguá. Disciplinas/Áreas: Teoria da Computação, Compiladores, Programação Orientada por Objetos, Sistemas de Informações Genômicas, Bioinformatica, Biologia Molecular Computacional. Membro do grupo de pesquisa BIOPSYS (Biologia Sistêmica e Pesquisa Translacional Genômica para Medicina). do grupo de pesquisa em Engenharia Genômica e Engenharia Tecidual e do grupo de Computação Científica UFSC/Campus Araranguá. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Eugênio Simão
Nome em citações bibliográficas
SIMÃO, E.;SIMAO, E

Endereço


Endereço Profissional
Universidade Federal de Santa Catarina, Universidade Federal de Santa Catarina.
Rodovia SC-449, nº 3201
Jardim das Avenidas
88900000 - Araranguá, SC - Brasil
Telefone: (48) 37212198
Fax: (48) 37216448
URL da Homepage: http://ararangua.ufsc.br/


Formação acadêmica/titulação


2002 - 2006
Doutorado em Engenharia Química.
Universidade Federal de Santa Catarina, UFSC, Brasil.
com período sanduíche em Université de La Méditerranée Aix Marseille II (Orientador: Denis Thieffry).
Título: Redes de Regulação Gênica: Um Modelo Integrado da Regulação do Metabolismo do Triptofano em Escherichia Coli sob o Formalismo de Redes de Petri., Ano de obtenção: 2006.
Orientador: Luis Marques Porto..
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Palavras-chave: Bioinformatica; Biologia Molecular Computacional; Bioengenharia.
Grande área: Engenharias
Grande Área: Engenharias / Área: Engenharia Biomédica / Subárea: Bioengenharia / Especialidade: Modelagem de Fenômenos Biológicos.
Grande Área: Engenharias / Área: Engenharia Biomédica / Subárea: Bioengenharia / Especialidade: Modelagem de Sistemas Biológicos.
Setores de atividade: Pesquisa e desenvolvimento científico.
2000 - 2002
Mestrado em Ciências da Computação.
Universidade Federal de Santa Catarina, UFSC, Brasil.
Título: SERVIÇOS DIFERENCIADOS EM REDES IP: diferenciação de serviços de rede utilizando um roteador CBQ.,Ano de Obtenção: 2002.
Orientador: Roberto Willrich.
Palavras-chave: Quality of Service QoS; Class-Based Queueing CBQ; Qualidade de Serviço em Redes de Computadores.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação / Especialidade: Serviços Diferenciados Em Redes de Computadores.
Setores de atividade: Desenvolvimento de Programas (Software).
1990 - 1995
Graduação em Engenharia da Computação.
Pontifícia Universidade Católica do Paraná, PUC/PR, Brasil.
Título: CATALOGO ELETRONICO: Base de Dados para Imagens Orientada por Objetos..
Orientador: Flavio Bortolozzi.
1984 - 1987
Graduação em Licenciatura Magistério Técnologico de Nivel Médio.
Universidade Tecnológica Federal do Paraná, UTFPR, Brasil.




Formação Complementar


2009 - 2009
Extensão universitária em Mecanismos de Financiamento a C&T&I. (Carga horária: 16h).
Instituto Euvaldo Lodi, IEL, Brasil.
2009 - 2009
Extensão universitária em Lei de Incentivo à Inovação Federal e Estadual. (Carga horária: 16h).
Instituto Euvaldo Lodi, IEL, Brasil.
2009 - 2009
Extensão universitária em Dissertações e Teses, Normas da ABNT.. (Carga horária: 20h).
Universidade do Oeste de Santa Catarina, UNOESC, Brasil.
2009 - 2009
Extensão universitária em Oratória na Prática Docente. (Carga horária: 4h).
Universidade do Oeste de Santa Catarina, UNOESC, Brasil.
1991 - 1991
Lingua Francesa. (Carga horária: 20h).
Université Jean Monnet Saint-Etienne, UNIV-St ETIENNE, França.


Atuação Profissional



Universidade Federal de Santa Catarina, UFSC, Brasil.
Vínculo institucional

2010 - Atual
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

2013 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , Universidade Federal de Santa Catarina, .

2010 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , Universidade Federal de Santa Catarina, .

2010 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , Universidade Federal de Santa Catarina, .

Linhas de pesquisa
Bioinformática Integrativa

Universidade do Oeste de Santa Catarina, UNOESC, Brasil.
Vínculo institucional

1998 - 2010
Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor titular, Carga horária: 40

Atividades

09/2008 - Atual
Direção e administração, Universidade Federal de Santa Catarina, .

Cargo ou função
Coordenador do Núcleo de Inovação Tecnológica, NIT..
09/2008 - Atual
Direção e administração, Campus de Videira, .

Cargo ou função
Coordenador de Relações Interinstitucionais..
02/2007 - Atual
Direção e administração, Campus de Videira, .

Cargo ou função
Coordenador da Pré-Incubadora NECTAR, Núcleo de Empreendimentos Tecnológicos e Científicos..
01/2007 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, Campus de Videira, .

Cargo ou função
Membro do Conselho de Gestão..
4/1998 - Atual
Ensino, Ciência da Computação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Cálculo Numérico
Modelagem Computacional
Teoria dos Grafos
Laboratório de Programação II
Laboratório de Programação I
Programação II
Programação I
01/2006 - 12/2008
Conselhos, Comissões e Consultoria, Universidade do Oeste de Santa Catarina, .

Cargo ou função
Membro do Comitê de Ética da na Pesquisa..

Universidade Tecnológica Federal do Paraná, UTFPR, Brasil.
Vínculo institucional

1982 - 1997
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor titular, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

09/1982 - 12/1996
Ensino,

Disciplinas ministradas
Ciências dos Materiais I & II


Linhas de pesquisa


1.
Pesquisa Translacional Genômica para Saúde
2.
Bioinformática Pós-Genômica
3.
Bioinformática Integrativa


Projetos de pesquisa


2008 - Atual
Pesquisa Translacional Genômica para Saúde (Informática na Saúde).
Descrição: A pesquisa translacional se ocupa em gerenciar a pesquisa de base até ser alcançado a fase final de produto ou processo. A Informática Translacional procura lançar mão de métodos e processos formais da Ciência da Computação para auxiliar na redução do tempo de desenvolvimento entre ideia e produto. A Pesquisa Translacional Genômica para Medicina visa incluir descobertas recentes da genômica para a pratica clinica na medicina. Mais precisamente, a inclusão de dados genômicos em prontuários eletrônicos contribuindo para o diagnóstico gene/doença..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (4) .
Integrantes: Eugênio Simão - Coordenador.
2003 - 2004
Engenharias II: Engenharia Metabólica para Produção de Agentes Anti-tumoriais.
Descrição: Desenvolvimento de ferramentas de engenharia genômica aplicadas a modelagem, simulação e análise de vias metabólicas de biosíntese de agentes tumorais..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (3) .
Integrantes: Eugênio Simão - Integrante / Luismar Marques Porto - Coordenador.


Membro de corpo editorial


2009 - Atual
Periódico: Unoesc & Ciência
2006 - Atual
Periódico: Evidência (UNOESC)


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Biologia Molecular Computacional.
2.
Grande área: Engenharias / Área: Engenharia Química / Subárea: Biologia Sistêmica.
3.
Grande área: Engenharias / Área: Ciência da Computação / Subárea: Bioinformática.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Bem.
Francês
Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
SIMÃO, E.;SIMAO, E2005 SIMÃO, E.; THIEFFRY, D. ; CHAOUIYA, C. ; REMY, E. . Qualitative modelling of regulated metabolic pathways: application to the tryptophan biosynthesis in E. coli.. Bioinformatics (Oxford), ECCB 2005, Madri, Espanha., v. 21, p. 190-196, 2005.

Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1.
SIMAO, E; REMY, E. ; PORTO, L. M. ; THIEFFRY, D. ; CHAOUIYA, C. . Dynamics of Genetic Regulatory Graphs in the Biosynthesis of Tryptophan in Escherichia coli. In: X Meeting 2007, 2007, São Paulo. X Meeting 2007, 2007.

2.
SIMAO, E; REMY, E. ; PORTO, L. M. ; THIEFFRY, D. ; CHAOUIYA, C. . Qualitative Analysis of Genetic Regulatory Networks. In: XVI Simposio Nacional de Bioprocessos, 2007, Curitiba. XVI Simposio Nacional de Bioprocessos, 2007.

3.
SIMÃO, E.; RISO, A. V. ; PORTO, L. M. . Modelagem de Vias Metabolicas com Redes de Petri Hibridas. In: XIV Simpósio Ncaional de Bioprocessos, 2003, Florianopolis. XIV Simpósio Ncaional de Bioprocessos, 2003.



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Teses de doutorado
1.
PORTO, L. M.; SIMÃO, E.; SOARES, C.; MOMBACH, J. C. M.; BEAN, S. P. C.. Participação em banca de Itamar Leite de Oliveira. Análise Computacional de Redes Metabólicas com Regulação. 2008. Tese (Doutorado em Engenharia Química) - Universidade Federal de Santa Catarina.

Trabalhos de conclusão de curso de graduação
1.
SIMÃO, E.. Participação em banca de SCHNEIDER, André..Workflow Aplicado a Um Ambiente Hospitalar. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade do Oeste de Santa Catarina.

2.
SIMÃO, E.. Participação em banca de MARINI, Gilberto..Geometria Fractal no Processamento de Imagens.. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade do Oeste de Santa Catarina.

3.
SIMÃO, E.. Participação em banca de VANZ, Giorge..Método para Administração de Banco de Dados Oracle Baseado em SOA.. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade do Oeste de Santa Catarina.

4.
SIMÃO, E.. Participação em banca de APPI, Marcio José..Desenvolvimento de um Sistema de Gerenciamento de Conteudo para Internet.. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade do Oeste de Santa Catarina.

5.
SIMÃO, E.. Participação em banca de SILVA, Felix Guzi Rafael..Implementação de Uma Ferramenta para Gerência de Servidores Através de Dispositivos Móveis Utilizando o Protocolo LDAP.. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade do Oeste de Santa Catarina.

6.
SIMÃO, E.. Participação em banca de SAVARIS, Rafael..Protótipo para Atualização de Schemas de Banco de Dados Relacionais CLiente-Servidor.. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade do Oeste de Santa Catarina.

7.
SIMÃO, E.. Participação em banca de DORNELLES, Helena Scheila.Utilização de Certificados Digitais em Autenticação de Redes Wireless. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade do Oeste de Santa Catarina.

8.
SIMÃO, E.. Participação em banca de GONZALEZ, Rodrigo..Análise da Utilização do Moodle como Ambiente Virtual de Apoio ao Ensino a Distância na UNOESC.. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade do Oeste de Santa Catarina.

9.
SIMÃO, E.. Participação em banca de KRUG, Anderson..Sistema de Gerenciamento de Vistorias sanitárias em Ambientes Produtores de Alimentos. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade do Oeste de Santa Catarina.

10.
SIMÃO, E.. Participação em banca de LOBUS, Gean Carlo Vila.Aplicação e Simulação da Arquitetura MPLS Sobre Redes TCP/IP. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade do Oeste de Santa Catarina.

11.
REYNAUD., F.; SIMÃO, E.; NUNES, Estela de Oliveira. Participação em banca de BRANDELERO, Evandro..Sistema de Captura de Agentes Tóxicos: Uma Aplicação par aCaptura de Antibioticos Residuais Presentes no Meio Ambiente.. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Farmácia) - Universidade do Oeste de Santa Catarina.

12.
REYNAUD., F.; SIMÃO, E.. Participação em banca de BOTTEGA, Daniela..Perspectivas de Inovação dos Sistemas de Liberação Controlada de Farmacos.. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Farmácia) - Universidade do Oeste de Santa Catarina.

13.
PAZ, Marcelo Fossa da; REYNAUD., F.; SIMÃO, E.. Participação em banca de SILVA, Francio Bruna..Nano Ciência e Nanotecnologia: um enfoque de nanoparticulas para aplicação cutânea.. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Farmacia) - Universidade do Oeste de Santa Catarina.

14.
SIMÃO, E.. Participação em banca de RIGO, Antonio Jose.Objetos Componentes Distribuidos, abordando DCOM.. 2005. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade do Oeste de Santa Catarina.

15.
SIMÃO, E.. Participação em banca de LEGNANI, Karenn.Transformada de Fourier Aplicada ao Processamento Digital de Imagens. 2002. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade do Oeste de Santa Catarina.

16.
SIMÃO, E.. Participação em banca de ASSUNCAO, Marcos Dias.Redes Privativas Virtuais. 2001. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade do Oeste de Santa Catarina.

17.
SIMÃO, E.. Participação em banca de BATAGELO, Harlen Costa.Geração de Sombras em Tempo Real Usando Arvores BSP e Buffers Estenceis. 1999. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade do Oeste de Santa Catarina.



Participação em bancas de comissões julgadoras
Concurso público
1.
SIMÃO, E.; PAZ, Marcelo Fossa da; BENTO, Alessandra Pelissaro. Cultivo de Células e Tecidos I. 2007. Universidade do Oeste de Santa Catarina.

2.
SIMÃO, E.; SILVA, Severo Jr.; GELINSKI, Jane M. L. N.. Biotecnologia de Alimentos. 2007. Universidade do Oeste de Santa Catarina.

Outras participações
1.
SIMÃO, E.. I Seminário Integrado de Ensino, Pesquisa e Extensão.. 2008. Universidade do Oeste de Santa Catarina.



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
Desafios e Perspectivas da Pós-Graduação Em Seu Processo de Interiorização - Reduzindo Assimetrias.. 2009. (Oficina).

2.
III Cônferência Estadual de Ciência Tecnologia e Inovação.. 2009. (Outra).

3.
I Seminário Integrado de Ensino, Pesquisa e Extensão.. 2008. (Seminário).

4.
Seminário Regional de Inovação Tecnológica: Oportunidade para o Desenvolvimento do Oeste de Santa Catarina.. 2008. (Seminário).

5.
Workshop de Articulação Rede de Nucleos de Inovação Tecnologica de Santa Catarina.. 2007. (Oficina).

6.
XVI Simpósio Nacional de Bioprocessos - SINAFERM 2007.Qualitative Analysis of Genetic Regulatory Networks: Application to the Biosynthesis of Triptophan REgulatory System in E. Coli.. 2007. (Simpósio).

7.
V Seminario de Iniciação Cientifica. 2006. (Seminário).

8.
First International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics.. 2005. (Congresso).

9.
Dynamics of Regulatory Networks.. 2003. (Encontro).

10.
First International Conference on Bioinformatics and Computational Biology.. 2003. (Outra).



Orientações



Orientações e supervisões em andamento
Iniciação científica
1.
LOPES, Ramiro.. Informática Translacional Genômica para Medicina: uma aplicação de linguagens formais baseadas em xml para favorecer a interoperabilidade entre sistemas de bases de dados genômicos e da saùde.. Início: 2009. Iniciação científica (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade do Oeste de Santa Catarina, Fundação de Amparo à Pesquisa e Inovação do Estado de Santa Catarina. (Orientador).

2.
PAGLIARI, Adroaldo.. Informática Translacional Genômica para Medicina: Recuperação e Integração de informações Distribuidas, Gene versus Doença, Orientado por em Formalismos da Websemântica.. Início: 2009. Iniciação científica (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade do Oeste de Santa Catarina, Fundação de Amparo à Pesquisa e Inovação do Estado de Santa Catarina. (Orientador).


Orientações e supervisões concluídas
Trabalho de conclusão de curso de graduação
1.
MENEGAZZO, Rene Rodrigo.. Seen Spot JAVA, Gerenciamento de Sensores.. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade do Oeste de Santa Catarina. Orientador: Eugênio Simão.

2.
BALLEN, Luiz André.. Prototipo Aplicativo Para Representação Comercial em Dispositivos Computacionais Moveis.. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade do Oeste de Santa Catarina. Orientador: Eugênio Simão.

3.
FELDHAUS, Corbari Thiago. Sistema de Gestão da Qualidade.. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade do Oeste de Santa Catarina. Orientador: Eugênio Simão.

4.
BALESTRIN, Douglas. Farmacogenômica no Design de Drogas. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Farmácia) - Universidade do Oeste de Santa Catarina. Orientador: Eugênio Simão.

5.
KOWALCZKI, S. Anderson.. Robô Movel Autônomo.. 2005. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade do Oeste de Santa Catarina. Orientador: Eugênio Simão.

6.
RAMOS, B. Alexandre.. Qualidade de Seviços SObre Redes IP.. 2005. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade do Oeste de Santa Catarina. Orientador: Eugênio Simão.

7.
LOSS, Leandro. Reconhecimento Otico de Caracteres, Por Processamento de Imagens.. 2005. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade do Oeste de Santa Catarina. Orientador: Eugênio Simão.

8.
CENDRON, Antônio.. Autenticação Autorização e Contabilidade de Usuarios.. 2003. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade do Oeste de Santa Catarina. Orientador: Eugênio Simão.

9.
LEGNANI, Karenn. Processamento digital de sinais : a transformada de Fourier no processamento digital de sinais de voz. 2002. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade do Oeste de Santa Catarina. Orientador: Eugênio Simão.

10.
SARETTA, Luciano. Processamento Digital de Imagens: localização de placas de veícilos em imagens de graus de cinza, utilizando a transformada de Hough. 2002. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade do Oeste de Santa Catarina. Orientador: Eugênio Simão.

11.
RAMOS, Alexandre Bacher. Qualidade de serviço sobre rede IP. 2002. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade do Oeste de Santa Catarina. Orientador: Eugênio Simão.

12.
TAFFAREL, Biago. Calibração de Câmeras Usando Geometria Epipolar. 2001. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade do Oeste de Santa Catarina. Orientador: Eugênio Simão.

13.
ASSUNÇÃO, Marcos Dias de. Redes Privadas Virtuais: protocolos e arquiteturas. 2001. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade do Oeste de Santa Catarina. Orientador: Eugênio Simão.

14.
RIGO, Antonio José. Objetos Componentes Distribuídos Abordando DCOM. 2000. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade do Oeste de Santa Catarina. Orientador: Eugênio Simão.




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