Guilherme Pimentel Telles

Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 2

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  • Última atualização do currículo em 13/09/2018


Guilherme P. Telles é bacharel, mestre e doutor em Ciência da Computação. Tem interesse em algoritmos, em especial em estruturas de dados e indexação, em biologia molecular computacional, em especial em filogenias e comparação de genomas, e em visualização de informção. Atualmente é professor na UNICAMP. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Guilherme Pimentel Telles
Nome em citações bibliográficas
Guilherme P. Telles;TELLES, GUILHERME P.;TELLES, G. P.;TELLES, GUILHERME P;TELLES, G.P.;TELLES, G.

Endereço


Endereço Profissional
Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Computação.
Rua Albert Einstein, 1251
Cidade Universitária
13083852 - Campinas, SP - Brasil
Telefone: (19) 35215868


Formação acadêmica/titulação


1998 - 2002
Doutorado em Ciência da Computação.
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Título: Um algoritmo quase-linear para árvores PQR e um esquema para clustering de seqüências expressas de cana-de-açúcar, Ano de obtenção: 2002.
Orientador: João Meidanis.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Palavras-chave: Estrutura de dados; Algoritmos; Projetos Genoma; Cana-de-açúcar.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Setores de atividade: Desenvolvimento de Programas (Software).
1996 - 1997
Mestrado em Ciência da Computação.
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Título: Problema dos uns consecutivos e árvores PQR,Ano de Obtenção: 1997.
Orientador: João Meidanis.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
1992 - 1995
Graduação em Bacharelado Em Ciência da Computação.
Pontifícia Universidade Católica de Minas Gerais, PUC Minas, Brasil.
1988 - 1990
Curso técnico/profissionalizante.
Centro Federal de Educação Tecnológica de Minas Gerais, CEFET/MG, Brasil.




Atuação Profissional



Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Vínculo institucional

2010 - Atual
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor-Doutor, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

08/2017 - Atual
Direção e administração, Instituto de Computação, .

Cargo ou função
Coordenador de Pós-Graduação.
08/2015 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Computação, .

Cargo ou função
Membro da Comissão de Pós-Graduação do IC.
09/2014 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Computação, .

Cargo ou função
Membro da Comissão de Extensão do IC.
05/2010 - Atual
Ensino, Ciência da Computação, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Complexidade de Algoritmos
Biologia Computacional
05/2010 - Atual
Ensino, Ciência da Computação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Projeto e Análise de Algoritmos I
Estruturas de Dados
Paradigmas de Programação
Bioinformática
08/2015 - 07/2017
Direção e administração, Instituto de Computação, .

Cargo ou função
Coordenador Substituto de Pós-Graduação.
08/2013 - 07/2017
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Computação, .

Cargo ou função
Membro da Congregação do IC.
01/2011 - 12/2014
Conselhos, Comissões e Consultoria, Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética, .

Cargo ou função
Membro do Conselho Científico Superior do CBMEG.
08/2010 - 12/2013
Direção e administração, Instituto de Computação, .

Cargo ou função
Vice-chefe do Departamento de Teoria da Computação.
06/2011 - 08/2011
Direção e administração, Instituto de Computação, .

Cargo ou função
Chefe pro-tempore do Departamento de Teoria da Computação.

Escola de Engenharia de Piracicaba, EEP-FUMEP, Brasil.
Vínculo institucional

2007 - 2010
Vínculo: Celetista formal, Enquadramento Funcional: professor, Carga horária: 8

Atividades

08/2007 - Atual
Ensino, Bacharelado em Ciência da Computação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Compiladores
Sistemas digitais II
Sistemas disgitais I

Fundação Centro de Pesquisa e Desenvolvimento em Telecomunicações, CPqD, Brasil.
Vínculo institucional

2007 - 2010
Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Analista de Sistemas, Carga horária: 40


Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Vínculo institucional

2003 - 2007
Vínculo: , Enquadramento Funcional: Professor Doutor, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Admitido por processo seletivo para contrato pelo prazo de 4 anos.

Atividades

9/2003 - 8/2007
Ensino, Ciência da Computação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Algoritmos avançados
Algoritmos e estruturas de dados I
Algoritmos e estruturas de dados II
Introdução à ciência de computação I
Introdução à ciência de computação II
Teoria da computação
09/2003 - 8/2007
Ensino, Ciências da Computação e Matemática Computacional, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Teoria da computação
02/2005 - 02/2007
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação, .

Cargo ou função
Membro da Congregação do ICMC.

Scylla Informática S A, SCYLLA, Brasil.
Vínculo institucional

2002 - 2003
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Analista/Pesquisador



Projetos de pesquisa


2017 - Atual
Algoritmos e Estruturas Combinatórias
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2016 - Atual
Genômica e transcritômica de espécies forrageiras tropicais

Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Nalvo Franco de Almeida Junior em 21/10/2016.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2015 - Atual
Técnicas computacionais para rastreamento de focos de Tuberculose Bovina
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2014 - 2016
Análise Visual Multi-escala de dados multidimensionais em redes: dados biológicos e textuais

Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Rosane Minghim em 26/10/2016.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2013 - 2016
Algoritmos, grafos e otimização combinatória
Descrição: Neste projeto tratamos do desenvolvimento de pesquisas em estruturas discretas, com ênfase em Algoritmos, Combinatória e Otimização. Os tópicos considerados se inserem nas áreas de otimização combinatória, teoria dos grafos, biologia e geometria computacional. A equipe proponente é composta pelos membros do Laboratório de Otimização e Combinatória (LOCo) do Instituto de Computação da UNICAMP..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2013 - Atual
Filogenia Viva: complexidade computacional e algoritmos
Descrição: Este projeto propõe uma nova caracterização para o problema de filogenia, que chamamos de Problema da filogenia viva, onde a entrada é uma coleção de objetos vivos, mas diferentemente do problema de filogenia convencional, admitindo que nós internos da árvore possam representar não somente ancestrais hipotéticos, mas também ancestrais vivos. Ou seja, um objeto não precisa ser necessariamente representado na árvore como folha, mas também como nó interno. Algumas aplicações reais para este problema incluem a análise de populações de vírus ou outros organismos que evoluem muito rapidamente, ao ponto de conviverem com seus ancestrais; e a análise de objetos não-biológicos, tais como documentos ou entradas em bancos de dados relacionais..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado: (2) .
Integrantes: Guilherme Pimentel Telles - Integrante / Nalvo F. Almeida - Coordenador / Maria Emília M. T. Walter - Integrante.Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2012 - 2016
Desafios em Visualização Exploratória de Dados Multidimensionais: Novos Paradigmas, Escalabilidade e Aplicações

Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Luis Gustavo Nonato em 11/09/2013.
Descrição: Este projeto visa desenvolver novas técnicas e paradigmas que contribuam para o avanço da área de visualização de dados científicos e abstratos, com ênfase no tratamento e manipulação de dados de alta dimensão, multimodais e variantes no tempo. Os novos paradigmas a serem desenvolvidos deverão fornecer metáforas visuais criadas a partir de técnicas de projeção multidimensional e árvores filogenéticas, buscando facilitar a compreensão, exploração e mineração visual de, entre outros, dados textuais, coleções de imagens ou músicas e dados de sensoriamento em nanoescala. Além de primitivas geométricas como unidade de representação visual, propomos usar estruturas de árvores e combinações de entidades geométricas com entidades abstratas a fim de criar um arcabouço unificado de manipulação e representação visual de dados de alta dimensão. Este projeto também inova na proposta de trazer métodos de visualização e exploração visual para o contexto de dispositivos portáteis. Os desenvolvimentos aqui propostos permitirão manter os grupos de pesquisa envolvidos na vanguarda da pesquisa na área, em nível mundial, fomentando a criação de propriedade intelectual nacional e a transferência tecnológica..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2012 - 2015
Novas técnicas de aprendizagem supervisionada aplicadas à Agropecuária e à Biotecnologia
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2012 - 2013
Tratamento de problemas críticos e aplicações inovadoras de visualização em larga escala
Descrição: Este projeto se insere no campo de Visualização de Dados e Analítica Visual, ambos os campos preocupados em propor alternativas para análise de dados complexos, multivalorados, e volumosos. Do ponto de vista da Visualização Computacional, nosso grupo de pesquisa vem desenvolvendo, ao longo de muitos anos, técnicas cujo objetivo é apoio à análise de dados multidimensionais, isto é, aqueles definidos por muitas variáveis ou atributos. O progresso da área levou a novas técnicas que são capazes de tratar dados cada vez mais numerosos com precisão. Muitos dos problemas relacionados a esta área, entretanto, ainda representam desafios em aberto. Este projeto também envolve problemas em vários outros campos, tais como análise de imagens, bioinformática, nanotecnologia e análise de redes sociais. Um objetivo objetivo do projeto é avançar o estágio de desenvolvimento de técnicas previamente desenvolvidas para o problema de forma a apoiar a solução de três problemas críticos: a escalabilidade do número de elementos tratados, o paradigma de visualização e a adaptabilidade para dados não numéricos. O segundo objetivo do projeto é adaptar tais técnicas para aplicões estratégicas para as quais nenhuma solução até o momento é satisfatória para o usuário final, isto é, o analista que precisa extrair conhecimento relevante dos dados. Este projeto pretende apresentar soluções computacionais para avançar no tratamento desses problemas, e testar as abordagens para dados de imagens, bio-sensores, sequências genéticas, redes sociais, comércio eletrônico e patentes, vários deles fornecidos através de parcerias em início ou mais avançadas. Este projeto também envolve problemas em vários outros campos, tais como análise de imagens, bioinformática, nanotecnologia e análise de redes sociais. O objetivo principal do projeto é avançar o estágio de desenvolvimento de técnicas previamente desenvolvidas para o o tratamento de dados multidimensionais complexos e de natureza variada..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (4) / Doutorado: (4) .
Integrantes: Guilherme Pimentel Telles - Integrante / Fernando Vieira Paulovich - Integrante / Alejandro C. F. Orgambide - Integrante / Alneu de Andrade Lopes - Integrante / Helio Pedrini - Integrante / Maria Cristina F. Oliveira - Integrante / Anton Heijs - Integrante / Lars Linsen - Integrante / Alexandru C. Telea - Integrante / Rosane Minghim - Coordenador.Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2011 - 2013
Comparação de genomas pela identificação de cliques maximais em grafos de seqüências
Situação: Desativado; Natureza: Pesquisa.
2010 - 2012
Algoritmos, grafos e otimização combinatória
Descrição: Neste projeto tratamos do desenvolvimento de pesquisas em estruturas discretas, com ênfase em Algoritmos Combinatórios, Combinatória e Métodos Formais. Os tópicos considerados se inserem nas áreas de otimização combinatória, teoria dos grafos, biologia e geometria computacional, verificação formal de programas e autômatos híbridos..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Mestrado acadêmico: (22) / Doutorado: (12) .
Integrantes: Guilherme Pimentel Telles - Integrante / Célia P. de Mello - Coordenador / Cid C. Souza - Integrante / Christiane N. Campos - Integrante / Eduardo C. Xavier - Integrante / Flávio K. Miyazawa - Integrante / Orlando Lee - Integrante / Pedro J. Rezende - Integrante / Zanoni Dias - Integrante.Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2006 - 2007
Identificação de regiões funcionais por comparação de genomas
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2003 - 2005
Análise de expressão gênica utilizando técnicas de aprendizado de máquina
Descrição: Os projetos Genoma estão gerando uma grande massa de dados biológicos. Diversas pesquisas correntes em Bioinformática têm sido dedicada à análise destes dados para a descoberta de padrões e aquisição de novos conhecimentos. Ou seja, o foco mudou do acúmulo dessas informações para uma análise das mesmas. Porém, a realização desta tarefa de forma manual, em laboratórios, mostra-se impraticável e muito custosa. Técnicas computacionais capazes de extrair conhecimento dos dados clínicos e biológicos de forma automática tornam-se especialmente adequadas neste caso. É crescente a utilização de Algoritmos de Aprendizado de Máquina em diferentes domínios de aplicação onde o principal objetivo é a implementação de sistemas capazes de adquirir conhecimento de forma automatizada. Este projeto tem como objetivo a investigação e uso de técnicas de Aprendizado de Máquina para o auxílio na resolução de problemas computacionais envolvendo a análise de expressão gênica e previsão da estrutura de proteínas..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2000 - 2001
Sugarcane EST Project - SUCEST
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
1999 - 2000
Projeto Genoma da Xylella fastidiosa
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.


Projetos de desenvolvimento


2007 - 2010
Sistemas de Gestão de Negócios e Suporte a Operação Rede Convergente e Serviços Triple Play
Descrição: Projeto de pesquisa e desenvolvimento. Implementação de protótipos que abrangem a gestão de negócios, gerência de ativos, cadastro das facilidades e o aprovisionamento fim-a-fim de serviços Triple Play em uma rede de telecomunicações utilizando-se de uma definição de arquitetura de software para Sistemas de Suporte a Operações baseada em especificações NGOSS (New Generation Operations Support System), OSS/J (OSS through Java initiative) e SOA (Service Oriented Architecture)..
Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.
2007 - 2009
Priorização e roteirização baseadas em informações georrefenciadas para suporte ao despacho de serviços na AES Eletropaulo
Descrição: Projeto de pesquisa e desenvolvimento. Palavras chave: pesquisa operacional, roteamento de veículos, grafos..
Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.
2002 - 2003
Arquiteturas de software e desenvolvimento baseado em componentes
Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.


Outros Projetos


2013 - Atual
CEPID - Center for Computational Engineering and Sciences
Situação: Em andamento; Natureza: Outra.


Revisor de periódico


2016 - 2016
Periódico: JOURNAL OF THEORETICAL BIOLOGY
2018 - 2018
Periódico: INFORMATION SCIENCES
2018 - 2018
Periódico: BMC BIOINFORMATICS
2018 - 2018
Periódico: BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS


Revisor de projeto de fomento


2013 - Atual
Agência de fomento: Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
2013 - Atual
Agência de fomento: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
2003 - Atual
Agência de fomento: Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Teoria da Computação/Especialidade: Análise de Algoritmos e Complexidade de Computação.
2.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Teoria da Computação/Especialidade: Bioinformática.


Idiomas


Português
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.


Prêmios e títulos


2000
Honra ao Mérito Científico e Tecnológico, Governo do Estado de São Paulo.
1998
Primeiro Lugar no Concurso de Teses e Dissertações - Mestrado, Sociedade Brasileira de Computação.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
TELLES, GUILHERME P.2018TELLES, GUILHERME P.; ARAÚJO, GRAZIELA S. ; WALTER, MARIA E. M. T. ; BRIGIDO, MARCELO M. ; ALMEIDA, NALVO F. . Live neighbor-joining. BMC BIOINFORMATICS, v. 19, p. 172, 2018.

2.
LOUZA, F. A.2017LOUZA, F. A. ; GAGIE, TRAVIS ; Guilherme P. Telles . Burrows-Wheeler transform and LCP array construction in constant space. Journal of Discrete Algorithms (Print), v. 42, p. 14-22, 2017.

3.
LOUZA, F. A.2017LOUZA, F. A. ; GOG, SIMON ; Guilherme P. Telles . Optimal suffix sorting and LCP array construction for constant alphabets. Information Processing Letters (Print), v. 118, p. 30-34, 2017.

4.
LOUZA, FELIPE A.2017LOUZA, FELIPE A. ; GOG, SIMON ; TELLES, GUILHERME P. . Inducing enhanced suffix arrays for string collections. THEORETICAL COMPUTER SCIENCE, v. 678, p. 22-39, 2017.

5.
LOUZA, FELIPE A.2017LOUZA, FELIPE A. ; TELLES, GUILHERME P. ; HOFFMANN, STEVE ; CIFERRI, CRISTINA D. A. . Generalized enhanced suffix array construction in external memory. Algorithms for Molecular Biology, v. 12, p. 1, 2017.

6.
HEBERLE, HENRY2017HEBERLE, HENRY ; CARAZZOLLE, MARCELO FALSARELLA ; TELLES, GUILHERME P. ; MEIRELLES, GABRIELA VAZ ; MINGHIM, ROSANE . CellNetVis: a web tool for visualization of biological networks using force-directed layout constrained by cellular components. BMC BIOINFORMATICS, v. 18, p. 1, 2017.

7.
TUSTUMI, WILLIAM H.A.2016TUSTUMI, WILLIAM H.A. ; GOG, SIMON ; TELLES, GUILHERME P. ; LOUZA, FELIPE A. . An improved algorithm for the all-pairs suffix-prefix problem. Journal of Discrete Algorithms (Print), v. 37, p. 34-43, 2016.

8.
HEBERLE, HENRY2015HEBERLE, HENRY ; MEIRELLES, GABRIELA VAZ ; DA SILVA, FELIPE R ; TELLES, GUILHERME P ; MINGHIM, ROSANE . InteractiVenn: a web-based tool for the analysis of sets through Venn diagrams. BMC Bioinformatics, v. 16, p. 1, 2015.

9.
KAWAHARA, REBECA2015KAWAHARA, REBECA ; MEIRELLES, GABRIELA V. ; HEBERLE, HENRY ; DOMINGUES, ROMÊNIA R. ; GRANATO, DANIELA C. ; YOKOO, SAMI ; CANEVAROLO, RAFAEL R. ; WINCK, FLAVIA V. ; RIBEIRO, ANA CAROLINA P. ; BRANDÃO, THAÍS BIANCA ; FILGUEIRAS, PAULO R. ; CRUZ, KAREN S. P. ; BARBUTO, JOSÉ ALEXANDRE ; POPPI, RONEI J. ; MINGHIM, ROSANE ; TELLES, GUILHERME P. ; FONSECA, FELIPE PAIVA ; FOX, JAY W. ; SANTOS-SILVA, ALAN R. ; COLETTA, RICARDO D. ; SHERMAN, NICHOLAS E. ; PAES LEME, ADRIANA F. . Integrative analysis to select cancer candidate biomarkers to targeted validation. Oncotarget, v. 6, p. 43635-43652, 2015.

10.
RAIOL, T.2014RAIOL, T. ; DE-SOUZA, M. T. ; OLIVEIRA, J. V. A. ; SILVA, H. S. D. I. L. ; OREM, J. C. ; CAVALCANTE, D. A. ; ALMEIDA, N. F. ; TELLES, G. P. ; SETUBAL, J. C. ; BRIGIDO, M. M. ; TORRES, F. A. G. ; STADLER, P. S. ; WALTER, M. E. M. T. ; MORAES, L. M. P. . Draft Genome Sequence of FT9, a Novel Bacillus cereus Strain Isolated from a Brazilian Thermal Spring. Genome Announcements, v. 2, p. e01027-14-e01027-14, 2014.

11.
MARTINS, LAYLA FARAGE2013MARTINS, LAYLA FARAGE ; ANTUNES, LUCIANA PRINCIPAL ; PASCON, RENATA C. ; DE OLIVEIRA, JULIO CEZAR FRANCO ; DIGIAMPIETRI, LUCIANO A. ; BARBOSA, DEIBS ; PEIXOTO, BRUNO MALVEIRA ; VALLIM, MARCELO A. ; VIANA-NIERO, CRISTINA ; OSTROSKI, ERIC H. ; TELLES, GUILHERME P. ; DIAS, ZANONI ; DA CRUZ, JOÃO BATISTA ; JULIANO, LUIZ ; VERJOVSKI-ALMEIDA, SERGIO ; DA SILVA, ALINE MARIA ; SETUBAL, JOÃO CARLOS . Metagenomic Analysis of a Tropical Composting Operation at the São Paulo Zoo Park Reveals Diversity of Biomass Degradation Functions and Organisms. Plos One, v. 8, p. e61928, 2013.

12.
TELLES, GUILHERME P.2013TELLES, GUILHERME P.; ALMEIDA, NALVO F. ; MINGHIM, ROSANE ; WALTER, MARIA EMILIA M.T. . Live Phylogeny. Journal of Computational Biology, v. 20, p. 30-37, 2013.

13.
DELBEM, ALEXANDRE C. B.2012DELBEM, ALEXANDRE C. B. ; DE LIMA, TELMA W. ; TELLES, GUILHERME P. . Efficient Forest Data Structure for Evolutionary Algorithms Applied to Network Design. IEEE Transactions on Evolutionary Computation, v. 16, p. 829-846, 2012.

14.
PAULOVICH, FERNANDO V.2012PAULOVICH, FERNANDO V. ; TOLEDO, FRANKLINA M. B. ; TELLES, GUILHERME P. ; MINGHIM, ROSANE ; NONATO, LUIS GUSTAVO . Semantic Wordification of Document Collections. Computer Graphics Forum (Print), v. 31, p. 1145-1153, 2012.

15.
PAIVA, J. G.2011PAIVA, J. G. ; FLORIAN, L. ; PEDRINI, H. ; TELLES, G. ; MINGHIM, R. . Improved Similarity Trees and their Application to Visual Data Classification. IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics, v. 17, p. 2459-2468, 2011.

16.
TELLES, G.P.2007TELLES, G.P.; MINGHIM, R. ; PAULOVICH, F.V. . Normalized compression distance for visual analysis of document collections. Computers & Graphics, v. 31, p. 327-337, 2007.

17.
VETTORE, A. L.2003VETTORE, A. L. DA SILVA, F. R. KEMPER, E. L. SOUZA, G. M. DA SILVA, A. M. FERRO, M. I. T. HENRIQUE-SILVA, F. GIGLIOTI, E. A. LEMOS, M. V. F. COUTINHO, L. L. NOBREGA, M. P. CARRER, H. FRANCA, S. C. BACCI, M. GOLDMAN, M. H. S. GOMES, S. L. NUNES, L. R. CAMARGO, L. E. A. SIQUEIRA, W. J. VAN SLUYS, M. A. THIEMANN, O. H. KURAMAE, E. E. SANTELLI, R. V. MARINO, C. L. TARGON, M. L. P. N. , et al.FERRO, J. A. SILVEIRA, H. C. S. MARINI, D. C. LEMOS, E. G. M. MONTEIRO-VITORELLO, C. B. TAMBOR, J. H. M. CARRARO, D. M. ROBERTO, P. G. MARTINS, V. G. GOLDMAN, G. H. DE OLIVEIRA, R. C. TRUFFI, D. COLOMBO, C. A. ROSSI, M. DE ARAUJO, P. G. SCULACCIO, S. A. ANGELLA, A. LIMA, M. M. A. DE ROSA, V. E. SIVIERO, F. COSCRATO, V. E. MACHADO, M. A. GRIVET, L. DI MAURO, S. M. Z. NOBREGA, F. G. MENCK, C. F. M. BRAGA, M. D. V. TELLES, G. P. CARA, F. A. A. PEDROSA, G. MEIDANIS, J. ARRUDA, P. ; Analysis and Functional Annotation of an Expressed Sequence Tag Collection for Tropical Crop Sugarcane. Genome Research, v. 13, p. 2725-2735, 2003.

18.
Guilherme P. Telles;TELLES, GUILHERME P.;TELLES, G. P.;TELLES, GUILHERME P;TELLES, G.P.;TELLES, G.2001Guilherme P. Telles; Felipe R. da Silva . Trimming and clustering sugarcane ESTs. Genetics and Molecular Biology (Impresso), v. 24, n.1-4, p. 17-23, 2001.

19.
Guilherme P. Telles;TELLES, GUILHERME P.;TELLES, G. P.;TELLES, GUILHERME P;TELLES, G.P.;TELLES, G.2001Guilherme P. Telles; Marília D. V. Braga ; Zanoni Dias ; Lin Tzy Li ; José A. A. Quitzau ; Felipe R. da Silva ; João Meidanis . Bioinformatics of the sugarcane EST project. Genetics and Molecular Biology (Impresso), v. 24, n.1-4, p. 9-15, 2001.

20.
MEIDANIS, JOÃO1998MEIDANIS, JOÃO ; PORTO, OSCAR ; TELLES, GUILHERME P. . On the consecutive ones property. Discrete Applied Mathematics, v. 88, p. 325-354, 1998.

Livros publicados/organizados ou edições
1.
Osmar N. de Souza (Org.) ; Guilherme P. Telles (Org.) ; Mathew J. Palakal (Org.) . Proceedings of the Brazilian Symposium on Bioinformatics. 1. ed. Heidelberg, Alemanha: Springer, 2011. v. 2. 84p .

2.
Natália Martins (Org.) ; Maria E. M. T. Walter (Org.) ; Guilherme P. Telles (Org.) ; Marcelo M. Brigido (Org.) ; Vasco Azevedo (Org.) . Genetics and Molecular Research. 4-3. ed. , 2005. v. 1. 109p .

3.
Natália Martins (Org.) ; Maria E. M. T. Walter (Org.) ; Marcelo M. Brigido (Org.) ; Guilherme P. Telles (Org.) . Anais do III Workshop Brasileiro de Bioinformática. 1. ed. , 2004. v. 1. 199p .

Capítulos de livros publicados
1.
Pedro Henrique Siqueira ; Guilherme P. Telles ; Rosane Minghim . Revisiting landscape views in information visualization. In: Bruno Lopes; Talita Perciano. (Org.). Learning and Inferring: Festscrift for Alejandro C. Frery. 1ed.Londres: College Publications, 2015, v. 27, p. 131-152.

Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1.
Lavinia Egidi ; Felipe A. Louza ; Giovanni Manzini ; Guilherme P. Telles . External memory BWT and LCP computation for sequence collections with applications. In: 18th International Workshop on Algorithms in Bioinformatics - WABI, 2018, Helsinki. Proc. of WABI 2018. Dagstuhl, Germany: DROPS, 2018. v. 113. p. 10:1-10:12.

2.
Rogério Güths ; Guilherme P. Telles ; Maria E. M. T. Walter ; Nalvo F. Almeida . A Branch and Bound for the Large Live Parsimony Problem. In: BIOSTEC 2017 - 10th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies, 2017, Porto, Portugal. Proceedings of the 10th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies, 2017. v. 1. p. 185-189.

3.
Graziela Santos de Araújo ; Guilherme P. Telles ; Maria E. M. T. Walter ; Nalvo F. Almeida . Distance-based Live Phylogeny. In: BIOSTEC 2017 - 10th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies, 2017, Porto, Portugal. Proceedings of the 10th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies, 2017. p. 196-201.

4.
Felipe A. Louza ; Simon Gog ; Guilherme P. Telles . Induced Suffix Sorting for String Collections. In: Data Compression Conference (DCC), 2016, Snowbird, Utah, USA. Proc. of DCC 2016, 2016. p. 43-52.

5.
Felipe A. Louza ; Simon Gog ; Leandro Zanotto ; Guido Costa Souza de Araújo ; Guilherme P. Telles . Parallel Computation for the All-Pairs Suffix-Prefix Problem. In: International Symposium on String Processing and Information Retrieval (SPIRE), 2016, Beppu, Japan. Proc. of SPIRE 2016, 2016. p. 1-11.

6.
Felipe A. Louza ; Guilherme P. Telles . Computing the BWT and the LCP Array in Constant Space. In: International Workshop on Combinatorial Algorithms (IWOCA), 2015, Verona, Italy. Proc. of IWOCA 2015, 2015. v. 9538. p. 312-320.

7.
Felipe A. Louza ; Guilherme P. Telles ; Cristina D. A. Ciferri . External Memory Generalized Suffix and LCP Arrays Construction. In: Combinatorial Pattern Matching, 2013, Bad Herrenalb. Proc. of 24th Annual Symposium on Combinatorial Pattern Matching, 2013. v. 7922. p. 201-210.

8.
João V. A. Oliveira ; Tainá Raiol ; Nariélly C. Farias ; Nalvo F. Almeida ; João C. Setubal ; Guilherme P. Telles ; Mikael L. Araújo ; Filipe P. Lima ; Clara B.-Pilven ; Marcelo M. Brigido ; Marlene T. De-Souza ; Lídia M. P. Moraes ; Maria E. M. T. Walter . Genome sequence of a Brazilian Bacillus cereus isolate. In: Brazilian Symposium on Bioinformatics, 2012, Campo Grande-MS. Digital Proceedings of the VII Brazilian Symposium on Bioinformatics, 2012. p. 9-14.

9.
Heidi Muniz ; Nariélly C. Farias ; Tainá Raiol ; Andréa L. C.-Laura ; Guilherme P. Telles ; Nalvo F. Almeida . A comparison of two approaches for species identification. In: Brazilian Symposium on Bioinformatics, 2012, Campo Grande-MS. Digital Proceedings of the VII Brazilian Symposium on Bioinformatics, 2012. p. 50-55.

10.
Daniel A. S. Anjos ; Gustavo G. Zerlotini ; Guilherme A. Pinto ; Maria E. M. T. Walter ; Marcelo M. Brigido ; Guilherme P. Telles ; Carlos J. M. Viana ; Nalvo F. Almeida . A Method for Inferring Biological Functions Using Homologous Genes Among Three Genomes. In: Brazilian Symposion on Bioinformatics, 2007, Angra dos Reis. Lecture Notes in Bioinformatics, 2007. v. 4643. p. 69-80.

11.
Ana M. Cuadros ; Fernando V. Paulovich ; Rosane Minghim ; Guilherme P. Telles . Point placement by phylogenetic trees and its application for visual analysis of document collections. In: IEEE Symposium on Visual Analytics Science and Technology, 2007, Sacramento-CA. Proc. IEEE Symposium on Visual Analytics Science and Technology, 2007. p. 99-106.

12.
João Paulo Duarte Casarotti ; Franklina M. B. Toledo ; Guilherme P. Telles . Heurísticas para o problemade dimensionamento de lotes capacitado com atraso. In: XXXVIII Simpósio Brasileiro de Pesquisa Operacional, 2006, Goiânia. Anais do XXXVIII Simpósio Brasileiro de Pesquisa Operacional, 2006. p. 2424-2431.

13.
Guilherme P. Telles; João Meidanis . Building PQR trees in almost-linear time. In: Second Brazilian Symposium on Graphs, Algorithms and Combinatorics, 2005, Angra dos Reis-RJ. Electronic Notes in Discrete Mathematics, 2005. v. 19. p. 33-39.

14.
Guilherme P. Telles; Marcelo M. Brigido ; Nalvo F. Almeida ; Carlos J. M. Viana ; Daniel A. S. Anjos ; Maria E. M. T. Walter . A method for comparing three genomes. In: IV Brazilian Simposium on Bioinformatics, 2005, Sao Leopoldo. Lecture Notes in Bioinformatics. Berlin: Springer-Verlag, 2005. v. 3594. p. 160-169.

15.
João Paulo Duarte Casarotti ; Franklina M. B. Toledo ; Guilherme P. Telles . Heuristicas para o problema de dimensionamento de lotes não-capacitado com atraso. In: XXXVII Simpósio Brasileiro de Pesquisa Operacional, 2005, Gramado-RS. Anais do XXXVII Simpósio Brasileiro de Pesquisa Operacional, 2005. p. 1644-1653.

Resumos expandidos publicados em anais de congressos
1.
Anderson Parreira ; Rivael S. Penze ; Sandro D. Gatti ; Guilherme P. Telles . Automatic Planning of Hybrid Access Triple Play Networks. In: International Workshop on Telecommunications-IWT, 2011, Rio de Janeiro. Proceedings of IWT 2011, 2011. p. 319-321.

2.
Guilherme P. Telles; Nalvo F. Almeida ; Marcelo M. Brigido ; Paulo A. Alvarez ; Maria E. M. T. Walter . kGC: Finding Groups Of Homologous Genes Across Multiple Genomes. In: Brazilian Symposium on Bioinformatics, 2011, Brasilia. Advances in Bioinformatics and in Computational Biology. Heidelberg: Springer, 2011. v. 6832. p. 79-82.

3.
Delane P. O. Dias ; Rosane Minghim ; Fernando V. Paulovich ; Guilherme P. Telles . A tool for visualizing and analyzing EST collections. In: Brazilian Symposion on Bioinformatics, 2007, Angra dos Reis. BSB 2007 Poster Proceedings, 2007. p. 187-190.

4.
Tiago J. S. Lopes ; Guilherme P. Telles . Finding Clusters in Tridimensional Gene Expression Datasets. In: Brazilian Symposion on Bioinformatics, 2007, Angra dos Reis. Poster Proceedings of BSB 2007}, 2007. p. 99-102.

5.
Guilherme P. Telles; João Meidanis . Ferramentas computacionais para projetos genoma. In: Congresso da Sociedade Brasileira de Computação, 2003, Campinas. Anais do Congresso da Sociedade Brasileira de Computação - CTD, 2003.

6.
Guilherme P. Telles; João Meidanis . Propriedade dos uns consecutivos e árvores PQR. In: Congresso da Sociedade Brasileira de Computação, 1998, Belo Horizonte-MG. Anais do XVIII Congresso da SBC, 1998.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
Anderson Parreira ; Rivael S. Penze ; Sandro D. Gatti ; Guilherme P. Telles . Optimization Algorithms for the Automatic Planning of Hybrid Access Telecommunication Networks. In: IFORS 2011, 2011, Melbourne, Austrália. IFORS 2011 Book of Abstracts, 2011. p. FB-20-FB-20.

2.
Felipe R. da Silva ; Guilherme P. Telles ; Paulo Arruda . Clustering 300,000 sugarcane ESTs: the challenge of dealing with orthologs, paralogs, homologs and some rubbish. In: 7th International Congress on Plant Molecular Biology, 2003, Barcelona. Book of Abstracts, 2003. p. 58-58.

3.
Felipe R. da Silva ; Guilherme P. Telles ; Paulo Arruda . Clustering SUCEST: defining and validating ESTs clustering pipelines. In: Plant, Animal & Microbe Genomes X Conference, 2002, San Diego. Painel, 2002.

4.
Felipe R. da Silva ; Guilherme P. Telles ; Paulo Arruda . Defining and validating ESTs clustering pipelines. In: XXXI Reunião da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2002, Caxambu. Anais da XXXI Reunião da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2002.

5.
Guilherme P. Telles; Felipe R. da Silva . Defining and validating EST clustering pipelines. In: Brazilian International Genome Conference, 2001, Angra dos Reis. Proc. of Brazilian International Genome Conference, 2001.

6.
Oscar Porto ; João Meidanis ; Guilherme P. Telles . Recognizing interval matrices through PQR-trees. In: 16th International Symposium on Mathematical Programming, 1997, Lousanne. Proceedings of the 16th International Symposium on Mathematical Programming, 1997. p. 220-220.

Outras produções bibliográficas
1.
Guilherme P. Telles; Nalvo F. Almeida ; Paulo A. Alvarez ; Marcelo M. Brigido ; Maria E. M. T. Walter . A method to find groups of orthogous genes across multiple genomes. Revista de Sistemas de Informaçãao da FSMA, 2013 (Artigo de divulgação científica).

2.
Guilherme P. Telles; Rosane Minghim ; Fernando V. Paulovich . Visual mappping of text collections using an approximation of KolmogorovComplexity. ICMC-USP, Relatório Técnico 262, 2005 (Relatório Técnico).

3.
Guilherme P. Telles; João Meidanis . Building PQR trees in almost-linear time. Instituto de Computação da Unicamp, TR-03-26, 2003 (Relatório Técnico).


Produção técnica

Demais tipos de produção técnica
1.
Guilherme P. Telles. Bases de dados biológicos. 2012. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

2.
Guilherme P. Telles; Nalvo F. Almeida ; Fábio H. V. Martinez . Algoritmos e heurísticas para comparações exata e aproximada de seqüências. 2005. (Nota didática).

3.
André C. P. L. F. Carvalho ; Alexandre C. B. Delbem ; Roseli A. F. Romero ; Eduardo V. Simões ; Guilherme P. Telles . Computação Bioinspirada. 2004. (Nota didática).

4.
Guilherme P. Telles. Algoritmos em bioinformática. 2003. (Curso de curta duração ministrado/Outra).



Patentes e registros



Programa de computador
1.
Guilherme P. Telles; Paulo V. Gurtler ; Sandro D. Gatti . CPQD2266 - ROTEIRIZADOR - V.2.0. 2008.
Patente: Programa de Computador. Número do registro: 09231-1, título: "CPQD2266 - ROTEIRIZADOR - V.2.0" , Instituição de registro: INPI - Instituto Nacional da Propriedade Industrial.



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
Milton Cezar Ribeiro; Joao do Espítio Santo Batista; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Fábio Felix Dias. Uma estratégia para análise visual de paisagens acústicas com base em seleção de características discriminantes. 2018. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

2.
Maria E. M. T. Walter; Li Weigang; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Rafael Lins Fernandes. Algorirmos genéticos para filogenia viva com matriz de características. 2018. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade de Brasília.

3.
Adriana F. Paes Leme; Marcia Miguel Castro Ferreira; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Romênia Ramos Domingues. Proteômica baseada em descoberta para busca de alvos terapêuticos e biomarcadores potenciais utilizando-se análises univariadas e multivariadas. 2017. Dissertação (Mestrado em BIOCIÊNCIAS E TECNOLOGIA DE PRODUTOS BIOATIVOS) - Universidade Estadual de Campinas.

4.
George Luiz M. Teodoro; Guilherme P. Telles; Maurício A. Rincon. Participação em banca de Lucas Ângelo da Silveira. Ordenação por translocação entre genomas sem sinal utilizando um algoritmo genético. 2016. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade de Brasília.

5.
Franklina M. B. Toledo; Marina Andretta; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Marcos Okamura Rodrigues. Modelos matemáticos para o problema de empacotamento em faixa de peças irregulares. 2015. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

6.
Zanoni Dias; Nalvo F. Almeida; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Sergio Jeferson Rafael Ordine. Alinhamento múltiplo de proteínas utilizando algoritmos genéticos. 2015. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

7.
Zanoni Dias; Guilherme P. Telles; Maria E. M. T. Walter. Participação em banca de André Rodrigues Oliveira. O problema da ordenação de permutações por reversões e transposições. 2015. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

8.
Maurício A. Rincon; Maria E. M. T. Walter; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Daniel Saad Nogueira. Um índice baseado em árvores de sufixos comprimidas com baixo consumo de memória. 2013. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade de Brasília.

9.
Said S. Adi; Guilherme P. Telles; Nalvo F. Almeida. Participação em banca de Leandro Ishi Soares de Lima. O problema do alinhamento de segmentos. 2013. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Mato Grosso do Sul.

10.
Zanoni Dias; Maria E. M. T. Walter; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Victor de Abreu Iizuka. Progaramação por restrições aplicada a problemas de rearranjo de genomas. 2012. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

11.
Zanoni Dias; Maria E. M. T. Walter; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Victor de Abreu Izuka. Programação por restrições aplicada a problemas de rearranjo de genomas. 2012. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

12.
Maria Cristina F. Oliveira; Rosane Minghim; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Frizzi Alejandra San Roman Salazar. Um estudo sobre o papel de medidas de similaridade em vizualização de coleções de documentos. 2012. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

13.
João Meidanis; Carlos E. Ferreira; Guilherme P. Telles. Participação em banca de João Paulo Perreira Zanetti. Complexidade de construção de árvores PQR. 2012. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

14.
Alair P. do Lago; José C. de Pina; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Gustavo Akio Tominaga Sacomoto. Árvores de Ukkonen: caracterização combinatória e aplicações. 2011. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

15.
Nalvo F. Almeida; Zanoni Dias; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Maria Angélica Lopes de Souza. Alinhamento progressivo de seqüências de proteínas. 2010. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

16.
Luís A. A. Meira; Eduardo C. Xavier; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Thiago de Paulo Faleiros. Algoritmos para o problema de particionamento. 2010. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

17.
Arnaldo V. Moura; Maria T. M. Rodrigues; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Tony Minoru Tamura Lopes. O problema de planejamento e agendamento de operações em uma rede de oleodutos. 2010. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

18.
Felipe R. da Silva; Alexandre C. B. Delbem; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Cristina Teixeira de Oliveira. Método para melhoria da eficiência na identificação computacional de RNAs não-codificantes. 2009. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

19.
Rosane Minghim; Alejandro C. F. Orgambide; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Ana Maria Cuadros Valdivia. Mapeamento de dados multidimensionais usando árvores filogenéticas. 2007. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

20.
Tomasz Kowaltowski; Célio C. Guimarães; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Alan Bustus Kleiman. Análise e comparação qualitativa de sistemas de detecção de plágio em tarefas de programação. 2007. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

21.
Maria E. M. T. Walter; Alexandre C. B. Delbem; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Tiago José da Silva Lopes. Um novo algoritmo de clustering para a organização tridimensional de dados de expressão gênica. 2007. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

22.
Rosane Minghim; Nalvo F. Almeida; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Delane Pereira de Oliveira Dias. Uma ferramenta para a exploração de ESTs. 2007. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

23.
Zanoni Dias; João Meidanis; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Christian Baudet. Uma abordagem para a detecção e remoção de artefatos em seqüências ESTs. 2006. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

24.
Zanoni Dias; João Meidanis; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Miguel Galves. Uma abordagem computacional para a determinação de polimorfismos de base única. 2006. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

25.
Mauro Biajiz; Nalvo F. Almeida; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Vinicius Garibaldi Martelli. Definição de banco de dados DOG para a obtenção de ortologia em múltiplos proteomas através do padrão PVOM. 2006. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal de São Carlos.

26.
Alexandre C. B. Delbem; Richard C. Garratt; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Telma Woerle de Lima. Algoritmos evolutivos para a predição de estruturas de proteínas. 2006. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

Teses de doutorado
1.
Maurício A. Rincon; André C. Drummond; Marcelo M. Brigido; TELLES, G.; DE LIMA, TELMA W.; George Luiz M. Teodoro. Participação em banca de José Luis Soncco Alvarez. Cálculo da distância de reversão e construção de árvores filogenéticas usando a ordem dos genes. 2017. Tese (Doutorado em Informática) - Universidade de Brasília.

2.
George D. C. Cavalcanti; Guilherme P. Telles; José Fernando Garcia; Sérgio Lifschitz; Tsang Ing Ren. Participação em banca de Francisco do Nascimento Jr.. ScreenVar - a clustering-based methodology for evaluating structural variants. 2017. Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Pernambuco.

3.
Claudia M. Bauzer Medeiros; SALGADO, A. C. B.; Ricardo R. Ciferri; André Santanchè; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Jaudete Daltio. Views over Graph Databases: A Multifocus Approach for Heterogeneous Data. 2017. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

4.
Paulo Arruda; Claudia Teixeira Guimarães; João P. Kitajima; Michel Eduardo B. Yamagishi; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Vagner Katsumi Okura. Sintenia genômica entre sorgo e cana-de-açúcar inferida a partir do sequenciamento de um pool de BACs. 2015. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

5.
Zanoni Dias; Eduardo C. Xavier; Guilherme P. Telles; Maria E. M. T. Walter; Yoshiko Wakabayashi. Participação em banca de Gustavo Rodrigues Galvão. Algorithms for sorting by reversals or transpositions, with applications to genome rearrangement. 2015. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

6.
Zanoni Dias; Felipe R. da Silva; Maria E. M. T. Walter; Orlando Lee; Guilherme P. Telles. Participação em banca de André Atanásio Maranhão Almeida. Novas abordagens para o problema do alinhamento múltiplo de seqüências. 2013. Tese (Doutorado em Doutorado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

7.
Rodrigo F. de Mello; Diogo C. Soriano; Guilherme P. Telles; Ivan N. da Silva; Moacir Ponti Jr.. Participação em banca de Ricardo Araújo Rios. Modelagem de séries temporais por meio da decomposição e análise de influências estocásticas e determinísticas. 2013. Tese (Doutorado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

8.
Eliane Martins; Marco P. A. Vieira; Márcio E. Delamaro; Arnaldo V. Moura; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Gizelle Sandrini Lemos. Alinhamento de seqüências na avaliação de resultados de testes de robustez. 2012. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

9.
Siome K. Goldenstein; Aurélio R. L. Oliveira; Nelson Maculan Filho; Luiz S. Ochi; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Ivan da Silva Sendin. Tratamento de incertezas no cálculo de estruturas de proteínas. 2012. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

10.
Zanoni Dias; Guilherme P. Telles; João C. Setubal; João Meidanis; Nalvo F. Almeida. Participação em banca de Ulisses Martins Dias. Problemas de comparação de genomas. 2012. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

11.
Zanoni Dias; João C. Setubal; Nalvo F. Almeida; João Meidanis; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Christian Baudet. Enumeração de traces e identificação de breakpoints. 2010. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

12.
Alair P. do Lago; Nalvo F. Almeida; Eduardo S. Laber; Carlos E. Ferreira; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Augusto Fernandes Vellozo. Alinhamento de seqüências com rearranjos. 2007. Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

Qualificações de Doutorado
1.
Nalvo F. Almeida; Marcelo Henriques de Carvalho; Maria E. M. T. Walter; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Rogério Güths. Parcimônia para filogenia viva. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em CIÊNCIA DA COMPUTAÇÃO) - Universidade Federal de Mato Grosso do Sul.

2.
Nalvo F. Almeida; Henrique Mongelli; Maria E. M. T. Walter; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Graziela Santos de Araújo. Filogenia viva baseada em distâncias. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Mato Grosso do Sul.

3.
Guilherme P. Telles; Diego de Freitas Aranha; Marcos Antônio Simplício Jr.. Participação em banca de Armando Faz Hernández. Técnicas para a implementação eficiente da criptografia baseada em curvas elípticas. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

4.
Maurício A. Rincon; George Luiz M. Teodoro; Guilherme P. Telles; Maria E. M. T. Walter. Participação em banca de Daniel Saad Nogueira Nunes. Dinamizando estruturas de dados sucintas. 2016. Exame de qualificação (Doutorando em Informática) - Universidade de Brasília.

5.
Francisco A. Rodrigues; Guilherme P. Telles; Eduardo Raul Hruschka. Participação em banca de Felipe Simões Lage Gomes Duarte. Decomposição de séries temporais preservando o viés determinístico. 2016. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

6.
Telma Woerle de Lima Soares; Joao Bosco Augusto London Junior; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Marco Aurélio Lopes Barbosa. Estruturas de dados persistentes em algoritmos evolutivos. 2016. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

7.
Guilherme P. Telles; Heiko H. Hornung; Vinícius L. Dantas. Participação em banca de Greice Cristina Mariano. Uso de técnicas de visualização de informação para detecção de padrões temporais cíclicos associados a estudos de fenologia. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

8.
Maurício A. Rincon; André C. Drummond; Marcelo M. Brigido; Guilherme P. Telles. Participação em banca de José Luis Soncco Álvarez. Construção de árvores filogenéticas e o problema da mediana de três genomas. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências da Informação) - Universidade de Brasília.

9.
Maria E. M. T. Walter; Alba C.M.A. Melo; Guilherme P. Telles; Nalvo F. Almeida. Participação em banca de Ricardo Régis Cavalcante Chaves. O problema da edição de cografos aplicado à evolução. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências da Informação) - Universidade de Brasília.

10.
Renato Vicentini; João P. Kitajima; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Vagner Katsumi Okura. Desenvolvimento de um modelo para sequenciamento e montagem de pools de BACS. 2011. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

11.
Antônio C. Moretti; Anderson R. Rocha; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Ivan da Silva Sendin. Tratamento de incertezas no cálculo de estruturas de proteínas. 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Doutorado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

12.
Luís G. Nonato; Alneu A. Lopes; Guilherme P. Telles. Participação em banca de José Gustavo de Souza Paiva. Técnicas computacionais de apoio para a classificação visual de imagens. 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

13.
Francisco A. Rodrigues; Reynaldo D. Pinto; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Ricardo Araújo Rios. Uma abordagem híbrida para identificação e modelagem de componentes estocásticos e determinísticos de séries temporais. 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

14.
João Meidanis; Maria E. M. T. Walter; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Ulisses Martins Dias. Heurísticas para problemas de rearranjo de genomas. 2009. Exame de qualificação (Doutorando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

15.
João Meidanis; Maria E. M. T. Walter; Guilherme P. Telles. Participação em banca de André Atanásio Maranhão Almeida. Novas abordagens para o problema do alinhamento múltiplo de seqüências. 2009. Exame de qualificação (Doutorando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

16.
Alair P. do Lago; Ronaldo F. Hashimoto; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Augusto Fernandes Vellozo. Alinhamentos de seqüências com inversões não-sobrepostas. 2006. Exame de qualificação (Doutorando em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo.

17.
Fernando J. V. Zuben; Roseli A. F. Romero; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Waldo Gonzalo Cancino Ticona. Aplicação de algoritmos evolutivos multi-objetivo para a reconstrução de árvores filogenéticas. 2004. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

18.
André C. P. L. F. Carvalho; Antônio C. Moretti; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Kelly Cristina Poldi. O problema de corte de estoque e extensões. 2004. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

19.
Maria C. Monard; Junior Barrera; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Katti Faceli. Combinação de algoritmos de agrupamento para análise de expressão gênica. 2004. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

20.
Dorival L. Pinto Jr; Antônio P. Braga; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Ana Carolina Lorena. Utilização de classificadores de margens largas na solução de problemas multicalsses em bioinformática. 2003. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

Qualificações de Mestrado
1.
Maria E. M. T. Walter; Ricardo Pezzuol Jacobi; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Rafael Lins Fernandes. Algoritmos genéticos para filogenia viva. 2017. Exame de qualificação (Mestrando em Informática) - Universidade de Brasília.

2.
Rosane Minghim; Maria Cristina F. Oliveira; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Nicolas Roque dos Santos. Análise visual de rumores em redes sociais. 2017. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

3.
Helio Pedrini; André Santanchè; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Gabriel Massaki Wakano Bezerra. Super-resolução em vídeos baseada em técnicas de aprendizado. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

4.
Helio Pedrini; André Santanchè; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Gabriel Massaki Wakano Bezerra. Super-resolução em vídeos baseada em técnicas de aprendizado. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

5.
Helio Pedrini; André Santanchè; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Luciana Barbieri. Reconhecimento de micro-expressões faciais baseado em aprendizagem de máquina. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

6.
Helio Pedrini; André Santanchè; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Luciana Barbieri. Reconhecimento de Microexpressões Faciais Baseado em Aprendizagem de Máquina. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

7.
Nalvo F. Almeida; Marcelo M. Brigido; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Rodolpho Gheleri de Oliveira Lima. Identificação de Expressão de Genes Hox. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Mato Grosso do Sul.

8.
Rosane Minghim; Marcela X. Ribeiro; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Henry Heberle. Técnicas de análise visual de relações entre conjuntos aplicadas à biologia molecular. 2013. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

9.
Zanoni Dias; Orlando Lee; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Carla Negri Lintzmayer. O problema da ordenação de panquecas com duas espátulas. 2012. Exame de qualificação (Mestrando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

10.
Zanoni Dias; Orlando Lee; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Thiago da Silva Arruda. Problema de distância de reversão quase-simétrica. 2012. Exame de qualificação (Mestrando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

11.
Cristina D. A. Ciferri; André C. P. L. F. Carvalho; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Felipe Alves da Louza. Proposta de um índice biológico persistente baseado em vetores de sufixo generalizados. 2012. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

12.
Eduardo C. Xavier; Orlando Lee; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Eduardo Theodoro Bogue. O problema da Máxima Interseção de k-Subconjuntos. 2012. Exame de qualificação (Mestrando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

13.
Maria Cristina F. Oliveira; Rosane Minghim; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Frizzi Alejandra San Roman Salazar. Visualização de coleções de documentos dinâmicas: abordando o problema da atualização do cálculo de similaridade. 2011. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

14.
Zanoni Dias; João Meidanis; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Gustavo Rodrigues Galvão. Uma ferramenta para avaliacao de algoritmos de rearranjo de genomas e sua aplicacao ao problema da ordenacao por transposicoes de prefixo. 2011. Exame de qualificação (Mestrando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

15.
João Meidanis; Célia P. Mello; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Priscila do Nascimento Biller. Rearranjo de genomas single-cut-or-join. 2010. Exame de qualificação (Mestrando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

16.
João Meidanis; Célia P. Mello; Guilherme P. Telles. Participação em banca de João Paulo Pereira Zanetti. Complexidade de Construção de Árvores PQR. 2010. Exame de qualificação (Mestrando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

17.
Mauro Biajiz; Ricardo R. Ciferri; Marilde T.P. Santos; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Marcus Vinícius Carneiro Teixeira. Gerenciamento de anotações de seqüências de DNA utilizando associação entre ontologias e esquemas XML. 2007. Exame de qualificação (Mestrando em Ciência da Computação) - Universidade Federal de São Carlos.

18.
Nalvo F. Almeida; Said S. Adi; Guilherme P. Telles. Participação em banca de André Chastel Lima. Ancoragem de genomas incompletos em genomas completos. 2006. Exame de qualificação (Mestrando em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Mato Grosso do Sul.

19.
Mauro Biajiz; Marilde T.P. Santos; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Vinícius Garibaldi Martelli. Utilização de bancos de dados na obtenção de regiões ortólogas em múltiplos proteomas. 2005. Exame de qualificação (Mestrando em Ciência da Computação) - Universidade Federal de São Carlos.

20.
Rosane Minghim; Hugo Alexandre D. Nascimento; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Delane Pereira de Oliveira Dias. Uma Abordagem Exploratória em Mineração Visual de Dados Baseada em Grafos. 2005. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

21.
Alexandre C. B. Delbem; Richard C. Garratt; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Telma Woerle de Lima. Algoritmos evolutivos e raciocínio baseado em casos para determinação de estruturas de proteínas. 2005. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

22.
Alexandre C. B. Delbem; Roseli A. F. Romero; Guilherme P. Telles. Participação em banca de Karen Honda. Algoritmos Evolutivos para Problemas de Projeto de Redes Aplicados à Filogenia. 2004. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.



Participação em bancas de comissões julgadoras
Concurso público
1.
Débora A. Scerni; Carlos E. Ferreira; Gordana Manic; MEIRA, L. A. A.; Marcos G. Quiles; Guilherme P. Telles. Concurso público na área de teoria da computação. 2013. Universidade Federal de São Paulo.

2.
Maria E. M. T. Walter; Maurício A. Rincon; Guilherme P. Telles. Concurso público na área de teoria da computação. 2012. Universidade de Brasília.

3.
Wesley Attrot; Carlos Henrique C. Ribeiro; Guilherme P. Telles. Concurso público para a carreira do magistério público do ensino superior. 2011. Universidade Estadual de Maringá.

4.
José Luís Zem; Luiz Camolesi Jr.; Guilherme P. Telles. Contratação de professor de ensino superior. 2008. Escola de Engenharia de Piracicaba.

5.
Siang W. Song; Paulo C. Masiero; João José Neto; Carlos E. Ferreira; Guilherme P. Telles. Contratação de 3 docentes em dedicação integral. 2004. Universidade de São Paulo.



Orientações



Orientações e supervisões em andamento
Dissertação de mestrado
1.
Mônica Domingues de Arruda Cachoni. Um problema interessante. Início: 2016. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas. (Orientador).

Tese de doutorado
1.
Jorge Augusto Hongo. Um problema interessante. Início: 2016. Tese (Doutorado em Doutorado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas. (Orientador).

2.
Lise Rommel Romero Navarrete. Um problema interessante. Início: 2016. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Orientador).

Iniciação científica
1.
Nicolas dos Santos França. Um problema interessante. Início: 2018. Iniciação científica (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas. (Orientador).

2.
Bruno Arnoni Falkenburg. Um problema interessante. Início: 2018. Iniciação científica (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas. (Orientador).


Orientações e supervisões concluídas
Dissertação de mestrado
1.
Acauan Cardoso Ribeiro. Visualização em tempo-real de coleções de documentos. 2017. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Guilherme Pimentel Telles.

2.
Lise Rommel Romero Navarrete. Alinhamentos de seqüências restritos por expressão regular usando padrões PROSITE. 2016. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Guilherme Pimentel Telles.

3.
Pedro Henrique Siqueira. Visualização de informação através de metáforas geográficas. 2015. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Guilherme Pimentel Telles.

4.
Jorge Augusto Hongo. Komodo 2 - Lage-Scale Genomic Inference. 2015. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas, . Orientador: Guilherme Pimentel Telles.

5.
Bruno Malveira Peixoto. Bioinformática aplicada a um projeto de metagenômica. 2012. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas, . Coorientador: Guilherme Pimentel Telles.

6.
Cristina Teixeira de Oliveira. Método para melhoria da eficiência na identificação computacional de RNAs não-codificantes. 2009. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo, . Orientador: Guilherme Pimentel Telles.

7.
Tiago José da Silva Lopes. Um novo algoritmo de clustering para dados tridimensionais de expressão gênica. 2007. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo, . Orientador: Guilherme Pimentel Telles.

8.
Delane Pereira de Oliveira Dias. Uma ferramenta para exploração de ESTs. 2007. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo, . Coorientador: Guilherme Pimentel Telles.

9.
Ana Maria Cuadros Valdivia. Visualização de mapas de documento através de árvores filogenéticas. 2007. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo, . Coorientador: Guilherme Pimentel Telles.

Tese de doutorado
1.
Felipe Alves da Louza. Engeneering augmented suffix sorting algorithms. 2017. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Guilherme Pimentel Telles.

Trabalho de conclusão de curso de graduação
1.
Leonardo Scoriza Foschine. Método de apuração da qualidade do serviço de telefonia IP em ambiente de rede particular. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciência da Computação) - Escola de Engenharia de Piracicaba. Orientador: Guilherme Pimentel Telles.

2.
Regis Correa Pavinato. Um algoritmo para comparar três genomas utilizando informações de vias metabólicas. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciência da Computação) - Escola de Engenharia de Piracicaba. Orientador: Guilherme Pimentel Telles.

3.
Heitor Hákime Cunha. Incorporação de algoritmos para detecção de plágio a uma ferramenta de exploração visual de documentos. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciência da Computação) - Escola de Engenharia de Piracicaba. Orientador: Guilherme Pimentel Telles.

Iniciação científica
1.
Tamara Martinelli de Campos. Integração de ferramentas de proteômica ao Galaxy. 2016. Iniciação Científica. (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Guilherme Pimentel Telles.

2.
William H. A. Tustumi. O problema do casamento sufixo-prefixo. 2015. Iniciação Científica. (Graduando em Engenharia de Computação) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Guilherme Pimentel Telles.

3.
Tamara Martinelli de Campos. Genômica comparativa no genoma da Copaíba. 2015. Iniciação Científica. (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas. Orientador: Guilherme Pimentel Telles.

4.
Isaura Maria Cronenberger. Algoritmos de detecção de plágio e visualização. 2007. Iniciação Científica. (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo. Orientador: Guilherme Pimentel Telles.

5.
João Paulo Durate Casarotti. Aplicação de árvores PQR ao problema da planaridade em grafos. 2007. Iniciação Científica. (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo. Orientador: Guilherme Pimentel Telles.

6.
Marcelo Henrique Cerri. Algoritmos paralelos para problemas envolvendo seqüências moleculares. 2005. Iniciação Científica. (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo. Orientador: Guilherme Pimentel Telles.



Outras informações relevantes


ResearcherId E-6620-2011



Página gerada pelo Sistema Currículo Lattes em 15/10/2018 às 23:09:30