Fabiano Sviatopolk-Mirsky Pais

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  • Última atualização do currículo em 30/11/2018


Fabiano é graduado em Ciências Biológicas pela Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG). Desenvolveu o seu mestrado e seu doutorado no Depto de Bioquímica e Imunologia do Instituto de Ciências Biológicas da UFMG, sob orientação da Dra. Santuza Teixeira, onde desenvolveu pesquisas para caracterização molecular e imunológica de antígenos de T. cruzi. Fez dois pós-doutorados no Instituto René Rachou (IRR) - FIOCRUZ/Minas: O primeiro sob orientação do Dr. Álvaro Romanha, onde trabalhou com proteínas associadas à mecanismos de resistência à drogas em T. cruzi; e o segundo sob orientação do Dr. Guilherme Oliveira, onde passou a trabalhar com a biologia computacional em áreas como a genômica, transcritômica e aprendizado de máquina em diversos projetos. Foi bioanalista da Rede Genoma de Minas Gerais (RGMG), sob coordenação dos Drs. Guilherme Oliveira e Vasco Azevedo (Depto de Biologia Geral, UFMG). Atualmente é bioanalista da plataforma de bioinformática do IRR - Fiocruz/Minas sob coordenação do Dr. Gabriel Fernandes (IRR - FIOCRUZ/Minas). Atua também como docente do programa de mestrado profissional de Tecnologia da Informação Aplicada à Biolgia Computacional e no ensino superior no Centro Universitário Promove e na Faculdade Kennedy de Belo Horizonte. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Fabiano Sviatopolk-Mirsky Pais
Nome em citações bibliográficas
PAIS, F. S.;PAIS, FABIANO SVIATOPOLK-MIRSKY;PAIS, FABIANO S.;PAIS, FABIANO SVIATOPOLK MIRSKY;FABIANO SVIATOPOLK MIRSKY PAIS;FABIANO SVIATOPOLK-MIRSKY PAIS;PAIS, FABIANO S. M.;PAIS, FABIANO

Endereço


Endereço Profissional
Centro de Pesquisas René Rachou / Fundação Oswaldo Cruz.
Avenida Augusto de Lima 1715
Barro Preto
30190002 - Belo Horizonte, MG - Brasil
Telefone: (31) 33497875
URL da Homepage: http://www.cpqrr.fiocruz.br/pg/


Formação acadêmica/titulação


2004 - 2008
Doutorado em Bioquímica e Imunologia.
Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.
Título: Caracterização de antígenos componentes de complexos ribonucleoprotéicos de Trypanosoma cruzi contendo sequências com repetições de aminoácidos, Ano de obtenção: 2008.
Orientador: Santuza Maria Ribeiro Teixeira.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
2003 - 2004
Mestrado em Bioquímica e Imunologia.
Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.
Título: Caracterização de antígenos componentes de complexos ribonucleoproteicos expressos em formas amastigotas de Trypanosoma cruzi,Ano de Obtenção: 2004.
Orientador: Santuza Maria Ribeiro Teixeira.
1998 - 2002
Graduação em Ciências Biológicas Diurno.
Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.
Título: Expressão heteróloga e caracterização da antigenicidade de proteínas ribossômicas de Trypanosoma cruzi.
Orientador: Santuza Maria Ribeiro Teixeira.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.


Pós-doutorado


2009 - 2014
Pós-Doutorado.
Centro de Pesquisas René Rachou / Fundação Oswaldo Cruz, CPQRR FIOCRUZ MG, Brasil.


Formação Complementar


2015 - 2015
Metagenomics Course. (Carga horária: 30h).
Centro de Pesquisas René Rachou / Fundação Oswaldo Cruz, CPQRR FIOCRUZ MG, Brasil.
2014 - 2014
Ensembl Genome Annotation. (Carga horária: 16h).
University of Cambridge, CAM, Inglaterra.
2014 - 2014
Animal Genome Informatics. (Carga horária: 40h).
European Bioinformatics Institute, EMBL, Inglaterra.
2014 - 2014
BioPerl for Pipeline building in Bioinformatics. (Carga horária: 8h).
Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, AB3C, Brasil.
2014 - 2014
Train the Trainer. (Carga horária: 40h).
European Bioinformatics Institute, EMBL, Inglaterra.
2013 - 2013
Curso de Software Estatístico R. (Carga horária: 16h).
Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.
2013 - 2013
Curso de Estatística em R. (Carga horária: 57h).
Centro de Excelência em Bioinformática, CEBIO, Brasil.
2013 - 2013
RNA-Seq analysis using Bioconductor. (Carga horária: 40h).
Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, AB3C, Brasil.
2012 - 2012
I Curso RNAseq - ICB/UFMG. (Carga horária: 45h).
Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.
2010 - 2010
I Curso de Nivelamento em Bioinformática do Cebio. (Carga horária: 80h).
Centro de Excelência em Bioinformática, CEBIO, Brasil.
2010 - 2010
Agilent Microarrays: marcação e extração de dados. (Carga horária: 16h).
GE Healthcare, GE, Brasil.
2009 - 2009
Como otimizar a expressão de proteínas em bactéria. (Carga horária: 2h).
Centro de Pesquisas René Rachou / Fundação Oswaldo Cruz, CPQRR FIOCRUZ MG, Brasil.
2009 - 2009
Uso de ferramentas na predição de epitopos T e B. (Carga horária: 30h).
Centro de Pesquisas René Rachou / Fundação Oswaldo Cruz, CPQRR FIOCRUZ MG, Brasil.
2007 - 2007
Top Esp em Microbiologia e Bionanotecnologia. (Carga horária: 30h).
Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.
2006 - 2006
Exp. e Purif. de Proteínas Recomb. e Proteoma. (Carga horária: 8h).
GE Healthcare, GE, Brasil.


Atuação Profissional



Centro de Pesquisas René Rachou / Fundação Oswaldo Cruz, CPQRR FIOCRUZ MG, Brasil.
Vínculo institucional

2017 - Atual
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Apoio Técnico da Plataforma de Bioinformática, Carga horária: 40

Vínculo institucional

2015 - 2017
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bioanalista da Rede Genoma de Minas Gerais, Carga horária: 40

Vínculo institucional

2010 - 2014
Vínculo: Pós-doutorado, Enquadramento Funcional: Pós-doutorado, Carga horária: 40
Outras informações
Pós-doutorado no Grupo de Genômica e Biologia Computacional (GGBC) no projeto Centro de Excelência em Bioinformática (CEBio) sobre supervisão do Dr. Guilherme Correa Oliveira.

Vínculo institucional

2009 - 2009
Vínculo: Pós-doutorado, Enquadramento Funcional: Pós-doutorado, Carga horária: 40
Outras informações
Pós-doutorado no Laboratório de Parasitologia Celular e Molecular (LPCM) sobre supervisão do Dr. Álvaro José Romanha. Bolsista de Pós-doutorado Júnior do CNPq.


Associação Educativa do Brasil - Faculdade Infórium, SOEBRAS, Brasil.
Vínculo institucional

2014 - Atual
Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Docente permanente da Pós-Graduação, Carga horária: 3
Outras informações
Coordenador e Professor da disciplina Introdução à Bioinformática

Vínculo institucional

2012 - Atual
Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Docente permanente da Pós-Graduação, Carga horária: 4
Outras informações
Docente permanente do Mestrado Profissional de Tecnologia da Informação Aplicada à Biologia Computacional pela Faculdade Infórium de Tecnologia.

Vínculo institucional

2013 - 2014
Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Docente permanente da Pós-Graduação, Carga horária: 4
Outras informações
Coordenador e Professor da disciplina Fundamentos de Biologia Molecular.


Faculdades Kennedy, KENNEDY, Brasil.
Vínculo institucional

2017 - Atual
Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 9


Centro Mineiro de Ensino Superior Promove, PROMOVE, Brasil.
Vínculo institucional

2017 - 2018
Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 3


Centro Universitário UNA, UNA, Brasil.
Vínculo institucional

2015 - 2015
Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 4
Outras informações
Professor da disciplina de Bioinformática para estudantes do curso de Ciências Biológicas


Fundação Educacional Lucas Machado, FELUMA, Brasil.
Vínculo institucional

2009 - 2010
Vínculo: Prestação de serviço, Enquadramento Funcional: Sub-coordenador de curso de Pós-Graduação, Carga horária: 8
Outras informações
Sub-coordenador e Docente do Curso de Especialização em Biotecnologia e Terapia Celular Baseada em Células-Tronco.


Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.
Vínculo institucional

2004 - 2008
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estudante de Pós-graduação, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Estudante de Doutorado do Depto. de Bioquímica e Imunologia sobre orientação da Dra. Santuza Maria Ribeiro Teixeira

Vínculo institucional

2003 - 2004
Vínculo: Estudante, Enquadramento Funcional: Estudante de Pós-graduação, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Estudante de Mestrado do Depto. de Bioquímica e Imunologia sobre orientação da Dra. Santuza Maria Ribeiro Teixeira



Projetos de pesquisa


2015 - 2017
FlatGenomes: construction of a flatworm knowledge base to empower the genomics based development of new control tools

Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Guilherme Corrêa de Oliveira em 04/03/2015.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2013 - 2016
Caracterização funcional e identificação dos genes alvos de regulação das vias de sinalização das MAPK do Schistosoma mansoni
Descrição: As três principais espécies causadoras da esquistossomose são Schistosoma mansoni, S. japonicum e S. haematobium. Juntos esses parasitos infectam cronicamente mais de 200 milhões de pessoas e matam 200 mil todos os anos no mundo. Vários esforços têm sido dedicados para o controle da doença, entre medidas sanitárias, supressão do hospedeiro intermediário e tratamentos quimioterápicos. Um único medicamento é massivamente utilizado há mais de 40 anos para o tratamento, o praziquantel, e este corre o risco de se tornar pouco ativo devido a possibilidade de desenvolvimento de resistência dos parasitos. Até o momento não existe uma alternativa eficaz para reinfecções e a prevalência da doença não mostrou redução significativa, o que indica a necessidade de desenvolvimento de uma nova droga anti-schistosoma. Dessa forma, optamos por utilizar as poderosas ferramentas genômicas, alavancadas pelos genomas recentemente sequenciados desses parasitos, para estudar potenciais alvos para o desenvolvimento de um medicamento alternativo e aumentar a compreensão das vias de sinalização do parasito. Já que proteínas quinase eucarióticas (ePKs) são consideradas alvos para o desenvolvimento de drogas do ponto de vista médico e químico e um número crescente de inibidores de ePKs foram desenvolvidos e aprovados para o tratamento de diferentes doenças humanas, estas se tornaram o foco de estudo desse trabalho. As ePKs de S. mansoni, S. japonicum e S. haematobium foram previamente identificadas pelo nosso grupo nos proteomas preditos e, a partir das informações dos ortólogos identificados, foi possível selecionar um grupo de ePKs com função predita essencial. Durante o processo de anotação funcional, observamos que grande parte das ePKs selecionadas são ativadoras/efetoras da via de sinalização MAPK. Proteínas chave da via MAPK (GTPase-SmRAS, SmERK1, SmERK2, SmJNK, p38 e SmCaMK2) foram escolhidas para caracterização experimental. Utilizaremos o silenciamento gênico por RNA de interferência para esclarecer o papel funcional dessas proteínas em S. mansoni in vitro e na relação parasito-hospedeiro, bem como elucidar os genes alvos de regulação da via de sinalização de MAPK aprimorando o conhecimento sobre esta importante via e o pontecial destas proteínas como alvos de drogas.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2013 - 2015
Genômica e bioinformática: fronteira da inovação em biotecnologia em Minas Gerais
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2013 - 2015
Diversidade e Características Funcionais de Comunidades Endofiticas de Milho Avaliadas por Análise Metagenômica
Descrição: O objetivo deste projeto é acessar a diversidade microbiana endofítica em plantas de milho cultivadas sob diferentes condições de adubação, visando à compreensão dos mecanismos de interação de micro-organismos endofíticos com a planta hospedeira, em especial os mecanismos de promoção de crescimento vegetal. O microbioma da planta será estudado por meio de metagenômica, estudos de expressão gênica e monitoramento da colonização da planta..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) .
Integrantes: Fabiano Sviatopolk-Mirsky Pais - Integrante / Guilherme Oliveira - Integrante / Flávio M G Araújo - Integrante / Ana Cristina Salim - Integrante / Laura Rabelo Leite - Integrante / Vera Lucia dos Santos - Coordenador / Sara Cuadros Orellana - Integrante / Aline Bruna Martins Vaz - Integrante / Aristóteles Góes-Neto - Integrante / Christiane Abreu de Oliveira Paiva - Integrante / Ivanildo Evódio Marriel - Integrante / Eliane A Gomes - Integrante / Swiany Silveira Lima - Integrante / Patrícia Gomes Silva - Integrante / João Antônio Vieira - Integrante / Raphael Lima - Integrante / Heyder Teixeira de Almeida - Integrante / Ubiana de Cássia Silva - Integrante.
2012 - 2017
Obtenção e integração de dados ?ômicos? de helmintos em um novo banco de dados relacional, FlatDB, para identificação de candidatos a alvos terapêuticos
Descrição: Os helmintos são agentes infecciosos que acarretam graves problemas de saúde pública em todo o mundo, especialmente nos países em desenvolvimento. Apesar das doenças causadas por esses parasitos oferecerem grandes prejuízos, elas são em grande parte, negligenciadas por acometerem exatamente os países mais pobres.A finalidade deste projeto será integrar as informações existentes pertinentes a genômica, transcriptômica e proteômica dos platelmintos e, ao mesmo tempo, oferecer ferramentas de análise capazes de gerar resultados de interesse biotecnológico. Os grupos participantes também tem o objetivo de gerar novos dados, por meio de proteômica e sequenciamento de nova geração, que também serão integrados a um novo banco de dados, o FlatDB..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2011 - 2013
Novo método para sorotipagem molecular de Streptococcus pneumoniae
Descrição: Esta proposta tem como objetivo desenvolver uma metodologia de sorotipagem molecular para S. pneumoniae. O processo é baseado nos perfis restrição gerados pela amplificação e digestão de uma sequência específica do DNA. Uma vez obtidos os perfis de restrição de todos os sorotipos de S. pneumoniae, estes serão depositados em um banco de dados que será acessado através do programa MST (www.cebio.org/mst). O MST é um software ?web-based? de acesso livre que permite identificar, neste momento, os sorotipos de Shigella - E. coli..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2008 - 2011
Análise funcional de proteínas do Trypanosoma cruzi selecionadas por proteoma e busca de novas drogas para quimioterapia da doença de Chagas
Descrição: Um dos maiores obstáculos para o tratamento, prevenção e erradicação de doenças parasitárias humanas é a resistência a drogas. Em T. cruzi, é bem conhecido a presença de cepas com resistência natural e o fenômeno de resistência cruzada entre o BZ e o NFx. Porém, as alterações bioquímicas e os mecanismos moleculares pelos quais os parasitos tornam-se resistentes ou suscetíveis a drogas, são ainda desconhecidos. Este projeto visa identificar novos alvos para terapia contra T. cruzi.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.


Projetos de extensão


2015 - 2017
Principles and Trends in Genomics and Computational Biology
Descrição: Web-based course to enable students to get a working knowledge of various facets of molecular and computational biology, including genome structure and organization, introduction to Linux, besides other most advanced topics, such as transcriptomics and proteomics.
Situação: Concluído; Natureza: Extensão.


Revisor de periódico


2015 - Atual
Periódico: Genetics and Molecular Biology (online version)
2015 - Atual
Periódico: Acta Tropica


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Bioinformática.
2.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
3.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Imunologia.
4.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica.


Idiomas


Espanhol
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.


Prêmios e títulos


2008
Menção Honrosa para o trabalho apresentado na XVII Semana de Iniciação Científica, UFMG.
2008
Premiação por relevância acadêmica para o trabalho apresentado na XVII Semana de Iniciação Científica, UFMG.
2005
Melhor pôster apresentado no III Encontro Anual de Pesq. em Bioq. e Imuno. ENAPEBI, ICB-UFMG.
2002
Melhor trabalho na área de Cien. Biol. e Agra. na X Semana de Inic. Cientif., ICB-UFMG.


Produções



Produção bibliográfica
Citações

Outras
Total de trabalhos:14
Total de citações:204
Fabiano Sviatopolk Mirsky Pais  Data: 07/06/2018

Artigos completos publicados em periódicos

1.
RADIO, SANTIAGO2018RADIO, SANTIAGO ; FONTENLA, SANTIAGO ; SOLANA, VICTORIA ; MATOS SALIM, ANNA C. ; ARAÚJO, FLÁVIO MARCOS GOMES ; ORTIZ, PEDRO ; HOBAN, CRISTIAN ; MIRANDA, ESTEFAN ; GAYO, VALERIA ; PAIS, FABIANO SVIATOPOLK-MIRSKY ; SOLANA, HUGO ; OLIVEIRA, GUILHERME ; SMIRCICH, PABLO ; TORT, JOSÉ F. . Pleiotropic alterations in gene expression in Latin American Fasciola hepatica isolates with different susceptibility to drugs. Parasites & Vectors, v. 11, p. 56, 2018.

2.
MOREIRA, DOUGLAS DE SOUZA2018MOREIRA, DOUGLAS DE SOUZA ; DUARTE, ANA PAULA ; PAIS, FABIANO SVIATOPOLK MIRSKY ; SILVA-PEREIRA, ROSIANE APARECIDA DA ; ROMANHA, ALVARO JOSÉ ; SCHENKMAN, SERGIO ; MURTA, SILVANE MARIA FONSECA . Overexpression of eukaryotic initiation factor 5A (eIF5A) affects susceptibility to benznidazole in Trypanosoma cruzi populations. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz, v. 113, p. 1-5, 2018.

3.
CARAGATA, E. P.2017 CARAGATA, E. P. ; PAIS, F. S. ; BATON, L. A. ; SILVA, J. B. L. ; SORGINE, M. H. F. ; MOREIRA, L. A. . The transcriptome of the mosquito Aedes fluviatilis (Diptera: Culicidae), and transcriptional changes associated with its native Wolbachia infection. BMC Genomics, v. 18, p. 1-19, 2017.

4.
SCHOLTE, L. L. S.2017SCHOLTE, L. L. S. ; MOURAO, M. M. ; PAIS, FABIANO SVIATOPOLK MIRSKY ; MELESINA, J. ; ROBAA, D. ; VOLPINI, A. C. ; SIPPL, W. ; PIERCE, R. J. ; OLIVEIRA, G. ; NAHUM, L. A. . Evolutionary relationships among protein lysine deacetylases of parasites causing neglected diseases. INFECTION GENETICS AND EVOLUTION, v. Epub, p. Epub, 2017.

5.
JEREMIAS, WANDER DE JESUS2017JEREMIAS, WANDER DE JESUS ; ARA?JO, FL?VIO MARCOS GOMES ; QUEIROZ, F?BIO RIBEIRO ; PAIS, FABIANO SVIATOPOLK MIRSKY ; MATTOS, ANA CAROLINA ALVES DE ; SALIM, ANNA CHRISTINA DE MATOS ; COELHO, PAULO MARCOS ZECH ; OLIVEIRA, GUILHERME CORREA ; KUSEL, JOHN ROBERT ; GUERRA-S?, RENATA ; COIMBRA, RONEY SANTOS ; BAB?, ?LIO HIDEO . Comparative sequence analysis reveals regulation of genes in developing schistosomula of Schistosoma mansoni exposed to host portal serum. PLoS One, v. 12, p. e0178829, 2017.

6.
FIGUEIRÓ, HENRIQUE V.2017FIGUEIRÓ, HENRIQUE V. LI, GANG TRINDADE, FERNANDA J. ASSIS, JULIANA PAIS, FABIANO FERNANDES, GABRIEL SANTOS, SARAH H. D. HUGHES, GRAHAM M. KOMISSAROV, ALEKSEY ANTUNES, AGOSTINHO TRINCA, CRISTINE S. RODRIGUES, MAÍRA R. LINDEROTH, TYLER BI, KE SILVEIRA, LEANDRO AZEVEDO, FERNANDO C. C. KANTEK, DANIEL RAMALHO, EMILIANO BRASSALOTI, RICARDO A. VILLELA, PRISCILLA M. S. NUNES, ADAUTO L. V. TEIXEIRA, RODRIGO H. F. MORATO, RONALDO G. LOSKA, DAMIAN SARAGÜETA, PATRICIA , et al.GABALDÓN, TONI TEELING, EMMA C. O?BRIEN, STEPHEN J. NIELSEN, RASMUS COUTINHO, LUIZ L. OLIVEIRA, GUILHERME MURPHY, WILLIAM J. EIZIRIK, EDUARDO ; Genome-wide signatures of complex introgression and adaptive evolution in the big cats. SCIENCE ADVANCES, v. 3, p. e1700299, 2017.

7.
ADEMA, COEN M.2017 ADEMA, COEN M. HILLIER, LADEANA W. JONES, CATHERINE S. LOKER, ERIC S. KNIGHT, MATTY MINX, PATRICK OLIVEIRA, GUILHERME RAGHAVAN, NITHYA SHEDLOCK, ANDREW DO AMARAL, LAURENCE RODRIGUES ARICAN-GOKTAS, HALIME D. ASSIS, JULIANA G. BABA, ELIO HIDEO BARON, OLGA L. BAYNE, CHRISTOPHER J. BICKHAM-WRIGHT, UTIBE BIGGAR, KYLE K. BLOUIN, MICHAEL BONNING, BRYONY C. BOTKA, CHRIS BRIDGER, JOANNA M. BUCKLEY, KATHERINE M. BUDDENBORG, SARAH K. LIMA CALDEIRA, ROBERTA CARLETON, JULIA , et al.CARVALHO, OMAR S. CASTILLO, MARIA G. CHALMERS, IAIN W. CHRISTENSENS, MIKKEL CLIFTON, SANDRA COSSEAU, CELINE COUSTAU, CHRISTINE CRIPPS, RICHARD M. CUESTA-ASTROZ, YESID CUMMINS, SCOTT F. DI STEPHANO, LEON DINGUIRARD, NATHALIE DUVAL, DAVID EMRICH, SCOTT FESCHOTTE, CÉDRIC FEYEREISEN, RENE FITZGERALD, PETER FRONICK, CATRINA FULTON, LUCINDA GALINIER, RICHARD GAVA, SANDRA G. GEUSZ, MICHAEL GEYER, KATHRIN K. GIRALDO-CALDERÓN, GLORIA I. DE SOUZA GOMES, MATHEUS GORDY, MICHELLE A. GOURBAL, BENJAMIN GRUNAU, CHRISTOPH HANINGTON, PATRICK C. HOFFMANN, KARL F. HUGHES, DANIEL HUMPHRIES, JUDITH JACKSON, DANIEL J. JANNOTTI-PASSOS, LIANA K. DE JESUS JEREMIAS, WANDER JOBLING, SUSAN KAMEL, BISHOY KAPUSTA, AURÉLIE KAUR, SATWANT KOENE, JORIS M. KOHN, ANDREA B. LAWSON, DAN LAWTON, SCOTT P LIANG, DI LIMPANONT, YANIN LIU, SIJUN LOCKYER, ANNE E. LOVATO, TYANNA L. LUDOLF, FERNANDA MAGRINI, VINCE MCMANUS, DONALD P. MEDINA, MONICA MISRA, MILIND MITTA, GUILLAUME MKOJI, GERALD M. MONTAGUE, MICHAEL J. MONTELONGO, CESAR MOROZ, LEONID L. MUNOZ-TORRES, MONICA C. NIAZI, UMAR NOBLE, LESLIE R. OLIVEIRA, FRANCISLON S. PAIS, FABIANO S. PAPENFUSS, ANTHONY T. PEACE, ROB PENA, JANETH J. PILA, EMMANUEL A. QUELAIS, TITOUAN RANEY, BRIAN J. RAST, JONATHAN P. ROLLINSON, DAVID ROSSE, IZINARA C. ROTGANS, BRONWYN ROUTLEDGE, EDWIN J. RYAN, KATHRYN M. SCHOLTE, LARISSA L. S. STOREY, KENNETH B. SWAIN, MARTIN TENNESSEN, JACOB A. TOMLINSON, CHAD TRUJILLO, DAMIAN L. VOLPI, EMANUELA V. WALKER, ANTHONY J. WANG, TIANFANG WANNAPORN, ITTIPRASERT WARREN, WESLEY C. WU, XIAO-JUN YOSHINO, TIMOTHY P. YUSUF, MOHAMMED ZHANG, SI-MING ZHAO, MIN WILSON, RICHARD K. ; Whole genome analysis of a schistosomiasis-transmitting freshwater snail. Nature Communications, v. 8, p. 15451, 2017.

8.
PYLRO, VICTOR SATLER2016PYLRO, VICTOR SATLER ; OLIVEIRA, FRANCISLON SILVA ; MORAIS, DANIEL KUMAZAWA ; CUADROS-ORELLANA, SARA ; PAIS, FABIANO SVIATOPOLK-MIRSKY ; MEDEIROS, JULLIANE DUTRA ; GERALDO, JULIANA ASSIS ; GILBERT, JACK ; VOLPINI, ANGELA CRISTINA ; FERNANDES, GABRIEL ROCHA . ZIKV - CDB: A Collaborative Database to Guide Research Linking SncRNAs and ZIKA Virus Disease Symptoms. PLoS Neglected Tropical Diseases (Online), v. 10, p. e0004817, 2016.

9.
DA SILVA, THAIS ALMEIDA MARQUES2015DA SILVA, THAIS ALMEIDA MARQUES ; GOMES, LUCIANA INÁCIA ; OLIVEIRA, EDWARD ; COURA-VITAL, WENDEL ; SILVA, LETÍCIA AZEVEDO ; PAIS, FABIANO SVIATOPOLK-MIRSKY ; KER, HENRIQUE GAMA ; REIS, ALEXANDRE BARBOSA ; RABELLO, ANA ; CARNEIRO, MARIANGELA . Genetic homogeneity among Leishmania (Leishmania) infantum isolates from dog and human samples in Belo Horizonte Metropolitan Area (BHMA), Minas Gerais, Brazil. Parasites & Vectors, v. 8, p. 226-234, 2015.

10.
CAMARGO, D. R. A.2015CAMARGO, D. R. A. ; PAIS, FABIANO S. ; VOLPINI, A. C. ; OLIVEIRA, M. A. ; COIMBRA, R. S. . Revisitingmolecular serotyping of Streptococcus pneumoniae. BMC GENOMICS, v. 16, p. S1, 2015.

11.
DE SOUZA MELO, CAROLINA P.2015 DE SOUZA MELO, CAROLINA P. ; CAMPOS, CATHARINA B. ; DE OLIVEIRA RODRIGUES, JULIANA ; AGUIRRE-NETO, JOAQUIM C. ; ATALLA, ÂNGELO ; PIANOVSKI, MARA A. D. ; CARBONE, EDNA K. ; LARES, LUCIANA B. Q. ; MORAES-SOUZA, HÉLIO ; OCTACÍLIO-SILVA, SHIRLEI ; PAIS, FABIANO S. M. ; DE SOUZA FERREIRA, ALESSANDRO C. ; ASSUMPÇÃO, JULIANA G. . Long non-coding RNAs: biomarkers for acute leukaemia subtypes. British Journal of Haematology (Print), v. n/a, p. n/a-n/a, 2015.

12.
PAIS, FABIANO SVIATOPOLK-MIRSKY2014PAIS, FABIANO SVIATOPOLK-MIRSKY; RUY, PATRÍCIA DE ; OLIVEIRA, GUILHERME ; COIMBRA, RONEY SANTOS . Assessing the efficiency of multiple sequence alignment programs. Algorithms for Molecular Biology, v. 9, p. 4, 2014.

13.
CUESTA-ASTROZ, YESID2014CUESTA-ASTROZ, YESID ; SCHOLTE, LARISSA L. S. ; PAIS, FABIANO SVIATOPOLK-MIRSKY ; OLIVEIRA, GUILHERME ; NAHUM, LAILA A. . Evolutionary analysis of the cystatin family in three Schistosoma species. Frontiers in Genetics, v. 5, p. 1-13, 2014.

14.
BARTHOLOMEU, D. C.2009BARTHOLOMEU, D. C. ; CERQUEIRA, G. C. ; LEAO, A. C. A. ; DAROCHA, W. D. ; PAIS, F. S. ; MACEDO, C. ; DJIKENG, A. ; TEIXEIRA, S. M. R. ; EL-SAYED, N. M. . Genomic organization and expression profile of the mucin-associated surface protein (masp) family of the human pathogen Trypanosoma cruzi. Nucleic Acids Research, v. 37, p. 3407-3417, 2009.

15.
PAIS, FABIANO S.2008 PAIS, FABIANO S.; DAROCHA, WANDERSON D. ; ALMEIDA, RAMON M. ; LECLERCQ, SOPHIE Y. ; PENIDO, MARCUS L. ; FRAGOSO, STENIO P. ; BARTHOLOMEU, DANIELLA C. ; GAZZINELLI, RICARDO T. ; TEIXEIRA, SANTUZA M.R. . Molecular characterization of ribonucleoproteic antigens containing repeated amino acid sequences from Trypanosoma cruzi. Microbes and Infection, v. 10, p. 716-725, 2008.

Capítulos de livros publicados
1.
COIMBRA, R. S. ; VOLPINI, A. C. ; PAIS, F. S. ; OLIVEIRA, F. S. ; OLIVEIRA, G. ; OLIVEIRA, M. A. A. . Biologia Molecular para Identificar Bactérias. In: Fundação Oswaldo Cruz. (Org.). PII: Programa de Incentivo à Inovação no Centro de Pesquisas René Rachou / Fundação Oswaldo Cruz. 22ed.Belo Horizonte: , 2011, v. , p. 20-23.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
GOES, W. M. ; VALENTE, B. M. ; OLIVEIRA, A. E. R. ; TAVARES, T. S. ; PAIS, FABIANO SVIATOPOLK-MIRSKY ; CAMPOS, C. L. V. ; Teixeira, SMR . Analysis of the role of an RNA binding protein in the control of gene expression in Trypanosoma cruzi epimastigotes. In: X Meeting 2017, 2017, São Pedro. 13th International Conference of the AB3C, 2017.

2.
PEREIRA, D. V. C. ; GUIMARAES, A. L. S. ; PAIS, F. S. . Gene network analysis of melanoma cancer development. In: 12th International Conference of the AB3C, 2016, Belo Horizonte. 12th International Conference of the AB3C, 2016.

3.
CARAGATA, E. ; PAIS, F. S. ; BATON, L. ; SILVA, J. ; SORGINE, M. ; MOREIRA, L. . Transcriptional changes due to Wolbachia infection in the mosquito Aedes fluviatilis reveal evidence of residual host maniputaion. In: X-Meeting 2015 - 11th International Conference of the AB3C + SolBio, 2015, São Paulo. X-Meeting 2015 - 11th International Conference of the AB3C + SolBio, 2015.

4.
CAMARGO, D. R. A. ; PAIS, F. S. ; VOLPINI, A. C. ; OLIVEIRA, M. A. ; COIMBRA, R. S. . Revisiting molecular serotyping of Streptococcus pneumoniae. In: ISCB-Latin America / X-meeting in Bioinformatics / BSB / SoiBio, 2014, Belo Horizonte. ISCB-Latin America / X-meeting in Bioinformatics / BSB / SoiBio, 2014.

5.
CAMARGO, D. R. A. ; PAIS, FABIANO SVIATOPOLK-MIRSKY ; VOLPINI, A. C. ; OLIVEIRA, G. ; OLIVEIRA, M. A. A. ; COIMBRA, R. S. . Method, software and databse for molecular serotyping of Streptococcus pneumoniae: a tool set to asses the effectiveness of vaccination program in Brazil. In: 9th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2013, Recife. 9th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2013.

6.
JEREMIAS, W. J. ; PAIS, F. S. ; Araújo, F M G ; KAMITAMI, F. L. ; SALIM, A. C. ; GUERRA-SA, R. ; COIMBRA, R. S. ; COELHO, P. M. Z. ; OLIVEIRA, G. ; BABA, E. H. . Gene expression in S. mansoni schistosomula in the presence of hamster's perpheral or portal serum. In: International Society for Computational Biology ISCB Latin America, Santiago, Chile, 2012, Santiago, Chile. International Society for Computational Biology ISCB Latin America, Santiago, Chile, 2012.

7.
PAIS, F. S.; PAIXAO, D. M. ; Araújo, F M G ; KAMITAMI, F. L. ; NASCIMENTO, M. ; SILVA, F. F. ; GUIMARAES, S. E. F. ; OLIVEIRA, G. . High-throughput Transcriptome Sequencing Of Pig Breeds Differing In Muscle Growth Rate And Fatness. In: 8th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2012, Campinas, SP. 8th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2012.

8.
CAMARGO, D. R. A. ; PAIS, F. S. ; SAMUEL, M. L. ; VOLPINI, A. C. ; OLIVEIRA, G. ; OLIVEIRA, M. A. A. ; COIMBRA, R. S. . A New Molecular Serotyping Tool For Streptococcus pneumoniae. In: XXI Congresso Latinoamericano de Microbiologia (XXI ALAM), 2012, Campos, SP. XXI Congresso Latinoamericano de Microbiologia (XXI ALAM), 2012.

9.
PAIS, F. S.; RUY, P. C. ; OLIVEIRA, G. ; COIMBRA, R. S. . Assessing the efficiency of multiple sequence alignment programs. In: 7th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology - X Meeting, 2011, Florianópolis. 7th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology - X Meeting, 2011.

10.
DUARTE, A. P. M. ; PAIS, F. S. ; CESAR, D. F. ; SCHENKMAN, S. ; Silva-Pereira R A ; Murta S M F ; Romanha A J . Characterization of eukaryotic initiation factor 5a (EIF-5Α) in Trypanosoma cruzi populations susceptible and resistant to Benznidazole. In: XXVII Annual meeting of the Brazilian Society of Protozoology / XXXVIII Annual meeting on basic research in Chagas´Disease, 2011, Foz do Iguaçu. XXVII Annual meeting of the Brazilian Society of Protozoology / XXXVIII Annual meeting on basic research in Chagas´Disease, 2011. p. 15-15.

11.
Araújo, F M G ; JEREMIAS, W. J. ; COELHO, P. M. Z. ; OLIVEIRA, G. ; SALIM, A. C. ; KAMITAMI, F. L. ; GUERRA-SA, R. ; PAIS, F. S. ; COIMBRA, R. S. ; BABA, E. H. . Gene Eexpression in Schistosoma mansoni schistosomula in the presence of hamster´s peripheral or portal serum. In: 7th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology - X Meeting, 2011, Florianópolis. 7th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology - X Meeting, 2011.

12.
PAIS, F. S.; OLIVEIRA, F. S. ; OLIVEIRA, M. A. A. ; VOLPINI, A. C. ; OLIVEIRA, G. C. ; COIMBRA, R. S. . Molecular Serotyping Tool For Streptococcus Pneumoniae. In: 6th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Compatational Biology - X Meeting, 2010, Ouro Preto. 6th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Compatational Biology, 2010.

13.
ZERLOTINI, A. ; PAIS, F. S. ; SIMOES, M. ; OLIVEIRA, G. . SchistoDB 2.5 - An updated Schistosoma mansoni bioinformatics resource. In: 6th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology - X Meeting, 2010, Ouro Preto. 6th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2010.

14.
PAIS, F. S.; Silva-Pereira R A ; Lopes dos Santos S ; Murta S M F ; Romanha A J . Characterization of Trypanosoma cruzi Proteins Differentially Expressed in Trypomastigote Forms of Benznidazole Resistant and Susceptible Populations. In: XIII International Congress of Protistology / XXV Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology / XXXVI Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease, 2009, Búzios. XIII International Congress of Protistology / XXV Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology / XXXVI Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease, 2009.

15.
PAIS, F. S.; DAROCHA, W. ; ALMEIDA, R. M. ; LECLERCQ, S. ; PENIDO, M. ; FRAGOSO, S. ; Bartholomeu, D.C. ; GAZZINELLI, R. T. ; Teixeira, SMR . Molecular characterization of ribonucleoproteic antigens containing repeated amino acid sequences from Trypanossoma cruzi. In: BSP Spring, Trypanossomiasis/Leishmaniasis & Malaria Meetings, 2008, Newcastle. BSP Spring, Trypanossomiasis/Leishmaniasis & Malaria Meetings, 2008. p. 117-117.

16.
PAIS, F. S.; ALMEIDA, R. M. ; DAROCHA, W. ; LECLERCQ, S. ; PENIDO, M. ; FRAGOSO, S. ; Bartholomeu, D.C. ; GAZZINELLI, R. T. ; Teixeira, SMR . Molecular Characterization of TcRpL7a, an Imunogenic RIbosomal Protein from Trypanosoma cruzi Containnig Repetitive Aminoacid Sequences. In: XXXV Reunião Anual sobre Pesquisa Básica em Doença de Chagas, 2008, Águas de Lindóia. XXXV Reunião Anual de Pesquisa Básica em Doença de Chagas, 2008.

17.
ALMEIDA, R. M. ; PAIS, F. S. ; DAROCHA, W. ; LECLERCQ, S. ; Teixeira, SMR . Expressão e purificação da proteína TcRpL7a, um antígeno de Trypanosoma cruzi que contém sequências repetitivas de aminoácidos. In: XVII Semana de Iniciação Científica, 2008, Belo Horizonte. XVII Semana de Inciação Científica, 2008.

18.
PAIS, F. S.; ALMEIDA, R. M. ; DAROCHA, W. ; LECLERCQ, S. ; PENIDO, M. ; FRAGOSO, S. ; Bartholomeu, D.C. ; GAZZINELLI, R. T. ; Teixeira, SMR . Molecular Characterization of Tcrpl7a, an Imunogenic Ribosomal Protein from Trypanosoma cruzi Containing Repetitive Amino Acid Sequences. In: VIII Encontro de Pesquisa do ICB/ IV Encontro Anual de Pesquisa em Bioquímica e Imunologia.Molecular, 2008, Belo Horizonte. VIII Encontro de Pesquisa do ICB/ IV Encontro Anual de Pesquisa em Bioquímica e Imunologia.Molecular, 2008.

19.
PAIS, F. S.; DAROCHA, W. ; ALMEIDA, R. M. ; LECLERCQ, S. ; PENIDO, M. ; FRAGOSO, S. ; GAZZINELLI, R. T. ; Teixeira, SMR . Molecular characterization of ribonucleoproteic antigens from Trypanosoma cruzi. In: XXXIV Annual Meeting on basic research in Chagas Disease, 2007, Caxambu. XXXIV Annual Meeting on basic research in Chagas Disease, 2007.

20.
Leao, A.C. ; DAROCHA, W. ; DJIKENG, A. ; Cerqueira, G ; PAIS, F. S. ; El-Sayed, N.M.A. ; Teixeira, SMR ; Bartholomeu, D.C. . Characterization, expression analysis and subcellular localization of the MASP family of Trypanosoma cruzi. In: XXXIVAnnual Meeting on Basic Research in Chagas Disease, 2007, Caxambu. XXXIVAnnual Meeting on Basic Research in Chagas Disease, 2007.

21.
ALMEIDA, R. M. ; MENDES, T. ; CALDAS, G. A. B. ; PAIS, F. S. ; DAROCHA, W. ; Bartholomeu, D.C. ; Teixeira, SMR . Analysis of variability of repetitive amino acid motifs in Trypanosoma cruzi. In: XXXIVAnnual Meeting on Basic Research in Chagas Disease, 2007, Caxambu. XXXIVAnnual Meeting on Basic Research in Chagas Disease, 2007.

22.
PAIS, F. S.; DAROCHA, W. ; LECLERCQ, S. ; PENIDO, M. ; FRAGOSO, S. ; GAZZINELLI, R. T. ; Teixeira, SMR . Molecular characterization of ribonucleoproteic antigens from Trypanosoma cruzi. In: XXXIII Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease, 2006, Caxambu. XXXIII Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease, 2006.

23.
Leao, A.C. ; PAIS, F. S. ; Teixeira, SMR ; El-Sayed, N.M.A. ; Bartholomeu, D.C. . Generation of antisera against the mucin-associated surface protein (MASP) family of Trypanosoma cruzi and expression studies. In: XXXIII Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease, 2006, Caxambu. XXXIII Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease, 2006.

24.
PAIS, F. S.; DAROCHA, W. ; GAZZINELLI, R. T. ; Teixeira, SMR . Chacterization of two novel ribonucleoproteic antigens of Trypanosoma cruzi. In: III Encontro Anual de Pesquisa em Bioquímica e Imunologia, 2005. III Encontro Anual de Pesquisa em Bioquímica e Imunologia, 2005.

25.
PAIS, F. S.; DAROCHA, W. ; GAZZINELLI, R. T. ; Teixeira, SMR . Chacterization of two novel ribonucleoproteic antigens of Trypanosoma cruzi. In: XXXII Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease, 2005, Caxambu. XXXII Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease, 2005.

26.
PAIS, F. S.; DAROCHA, W. ; CAMPOS, P. C. ; SOUZA, F. M. ; GAZZINELLI, R. T. ; Teixeira, SMR . CARACTERIZAÇÃO DA TCRPL7A, UMA NOVA PROTEÍNA RIBOSSÔMICA ANTIGÊNICA DO TRYPANOSOMA CRUZI. In: II Encontro Anual de Pesquisa em Bioquímica e Imunologia, 2004, Belo Horizonte. II Encontro Anual de Pesquisa em Bioquímica e Imunologia, 2004.

27.
PAIS, F. S.; DAROCHA, W. ; CAMPOS, P. C. ; SOUZA, F. M. ; GAZZINELLI, R. T. ; Teixeira, SMR . ANTIGEN COMPONENTS OF RIBONUCLEOPROTEIN COMPLEXES OF TRYPANOSOMA CRUZI: CELLULAR LOCALIZATION AND REACTIVITY WITH CHAGASIC SERA. In: XXXI Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease, 2004, Caxambu. XXXI Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease, 2004.

28.
PAIS, F. S.; DAROCHA, W. ; BILATE, A. M. B. ; CAMPOS, P. C. ; CUNHA-NETO, E. ; Teixeira, SMR . Human cagasic response against Trypanosoma cruzi recombinant antigens derived from ribonucleproteic complexes. In: XXIX Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease, 2002, Caxambu. XXIX Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease. São Paulo, 2002.

29.
PAIS, F. S.; DAROCHA, W. ; Teixeira, SMR . CDNAS DE TRYPANOSOMA CRUZI QUE CODIFICAM PROTEÍNAS RIBOSSÔMICAS RECONHECIDAS POR PACIENTES COM DOENÇA DE CHAGAS. In: X Semana de Iniciação Científica, 2002, Belo Horizonte. X Semana de Iniciação Científica, 2002.

30.
PAIS, F. S.; DAROCHA, W. ; CAMPOS, P. C. ; Teixeira, SMR . RESPOSTA DE PACIENTES CHAGÁSICOS CONTRA ANTÍGENOS RECOMBINANTES DE TRYPANOSOMA CRUZI DERIVADOS DE COMPLEXOS RIBONUCLEOPROTÉICOS. In: XI Semana de Iniciação Científica da Universidade Federal de Minas Gerais, 2002, Belo Horizonte. XI Semana de Iniciação Científica, 2002.

31.
PAIS, F. S.; DAROCHA, W. ; Bartholomeu, D.C. ; CUNHA-NETO, E. ; DONELSON, J. E. ; Teixeira, SMR . CHARACTERIZATION OF TRYPANOSOMA CRUZI ANTIGENS ENCODING NUCLEIC ACID BINDING PROTEINS AND RECOGNIZED BY SERA FROM CHAGASIC PATIENTS. In: XXVIII Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease, 2001, Caxambu. XXVIII Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease, 2001.

32.
PAIS, F. S.; DAROCHA, W. ; Teixeira, SMR . Caracterização de cDNAs que codificam antígenos repetitivos presentes em formas amastigotas de Trypanosoma cruzi. In: IX Semana de Iniciação Científica da Universidade Federal de Minas Gerais, 2000, Belo Horizonte. IX Semana de Iniciação Científica, 2000.

Apresentações de Trabalho
1.
PAIS, F. S.. Investigating host-pathogen interactions through a dual rna-seq approach. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

2.
PAIS, F. S.. Method, software and database for molecular serotyping of Streptococcus pneumoniae: a tool set to assess the effectiveness of vaccination program in Brazil (AB3C Meeting, Recife, PE). 2014. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

3.
PAIS, F. S.. Assessing the Efficiency of Multiple Sequence Alingment Programs (UEFS, Feira de Santana, BA). 2012. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

4.
PAIS, F. S.. Estudo de proteínas do Trypanosoma cruzi diferencialmente expressas nas formas tripomastigotas de cepas resistentes e susceptíveis ao Benzonidazol (Fiocruz/Minas, Belo Horizonte, MG). 2009. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

5.
PAIS, F. S.. Biotecnologia no estudo da doença de Chagas e outras parasitoses (Unimontes, Montes Claros, MG). 2009. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).


Produção técnica
Programas de computador sem registro
1.
PYLRO, V. S. ; FERNANDES, G. ; OLIVEIRA, F. S. ; MORAIS, D. K. ; PAIS, F. S. ; ORELLANA, S. C. ; VOLPINI, A. C. ; MEDEIROS, J. D. ; GERALDO, J. A. . ZIKV - CDB: A Collaborative Database to Guide Research Linking SncRNAs and ZIKA Virus Disease Symptoms. 2016.


Demais tipos de produção técnica
1.
PAIS, F. S.; OLIVEIRA, G. ; ORELLANA, S. C. ; PETERSEN, B. ; FERNANDES, G. ; LYRLO, V. ; AZIZ, R. ; VIVES, M. ; MORAIS, D. K. ; ROCHA, U. N. . Metagenomics Course (docente). 2015. .

2.
PAIS, F. S.; FERNANDES, G. ; EMERY, L. ; BARZINE, M. ; ARCHIBALD, A. ; MCLAREN, W. ; STREETER, I. ; ZERBINO, D. ; DOLEZAL, M. ; EORY, L. ; CARVALHO-SILVA, D. ; HOURLIER, T. ; BILLIS, K. . Animal Genome Informatics (docente). 2014. .

3.
PAIS, F. S.; ZERLOTINI, A. ; Araújo, F M G ; SALIM, A. C. ; SILVA, F. F. . I Curso de RNAseq da Rede Genoma de Minas Gerais (docente). 2013. .

4.
PAIS, F. S.; PROBST, C. ; NILSSON, D. ; MARQUES, J. T. ; CERQUEIRA, G. C. ; FRANCO, G. R. ; BARBOSA, A. ; SOUZA, J. E. S. . Curso RNAseq - Instituto de Ciências Biológicas / UFMG (docente). 2012. .

5.
PAIS, F. S.. III Curso de Nivelamento do CEBio - Fiocruz/Minas (docente). 2011. .

6.
PAIS, F. S.. I Curso de Nivelamento do CEBio - Fiocruz/Minas (docente). 2010. .

7.
PAIS, F. S.. II Curso de Nivelamento do CEBio - Fiocruz/Minas (docente). 2010. .



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
BLEICHER, L.; PAIS, FABIANO SVIATOPOLK-MIRSKY. Participação em banca de Thais Couto Laureano. Identificação e estudo do interatoma entre parasitos do gênero Leishmania e humanos. 2018. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

2.
MENDES, B. B. R. O.; PAIS, FABIANO SVIATOPOLK-MIRSKY. Participação em banca de Camila Marani Abreu Lopes de Oliveira. Estratégias de anotação do transcriptoma do télson de Tityus serrulatus. 2018. Dissertação (Mestrado em Pós-graduação em Genética) - Universidade Federal de Minas Gerais.

3.
PAIS, FABIANO SVIATOPOLK-MIRSKY; TOLEDO, J. S.. Participação em banca de Leilane Oliveira Gonçalves. Análise de dados de sequenciamento de RNA voltados a comparação da expressão gênica visando um melhor entendimento dos mecanismos de resistência aos antimoniais. 2017. Dissertação (Mestrado em Pós-graduação em Ciências da Saúde) - Centro de Pesquisas René Rachou / Fundação Oswaldo Cruz.

4.
PAIS, FABIANO SVIATOPOLK MIRSKY; INACIO, M. J.. Participação em banca de Rafael Moreno Ribeiro do Nascimento. Avaliação da interface do Sistema InterProScan sob a ótica de um profissional de Sistemas de informação. 2015. Dissertação (Mestrado em Tec. da Info. Aplicada a Biologia Computacional) - Associação Educativa do Brasil - Faculdade Infórium.

5.
PAIS, F. S.; NEGRAO-CORREA, D. A.; COELHO, P. M. Z.. Participação em banca de Fabio Ribeiro Queiroz. Caracterização da maquinaria de processamento de miRNAs e piRNAs em Biomphalaria glabrata (Say 1818) e o efeito da infecção por Schistosoma mansoni no processo. 2015. Dissertação (Mestrado em Pós-graduação em Ciências da Saúde) - Centro de Pesquisas René Rachou / Fundação Oswaldo Cruz.

Teses de doutorado
1.
SCLIAR, M. O.; SCHIMIDT, L. C.; CERAVOLO, I. P.; PAIS, FABIANO SVIATOPOLK MIRSKY. Participação em banca de Aracele Maria de Souza. Estudo da ancestralidade genômica e sua influência na distribuição das variantes de DARC e ABO em uma população de área endêmica para malária. 2018. Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde) - Centro de Pesquisas René Rachou / Fundação Oswaldo Cruz.

2.
PAIS, FABIANO SVIATOPOLK-MIRSKY; BLEICHER, L.; FONSECA, F. G.; Oliveira J G. Participação em banca de Tarcisio José Domingos Coutinho. Genômica Comparativa Homologia-Independente entre Vírus da ordem Picornavirales e seus hospedeiros. 2018. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

3.
LOBO, F. P.; VIEIRA, G. F.; RUIZ, J. C.; PAIS, F. S.. Participação em banca de Armando Menezes Neto. Aprimoramento da anotação N-terminal de proteínas através da predição de peptídeo sinal em proteínas ortólogas e desenvolvimento de uma ferramenta automática para a identificação de grupos ortólogos contendo erros de anotação. 2012. Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde) - Centro de Pesquisas René Rachou / Fundação Oswaldo Cruz.

4.
Oliveira J G; Bahia MT; Soeiro M N; PAIS, F. S.. Participação em banca de Marcela Lencini Ferraz. Caracterização de potenciais alvos moleculares e teste de fármacos candidatos ao tratamento da Doença de Chagas experimental. 2009. Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde) - Centro de Pesquisas René Rachou / Fundação Oswaldo Cruz.

Qualificações de Doutorado
1.
BARTHOLOMEU, DANIELLA C.; FERNANDES, G.; PAIS, F. S.. Participação em banca de Michele Araújo Pereira. Análise por RNA-Seq dos efeitos da radiação ionizante na alteração do transcriptoma codificante de Trypanosoma cruzi. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Trabalhos de conclusão de curso de graduação
1.
PAIS, F. S.; VAZ, A. B. M.. Participação em banca de Assmaa El Khal.Análise metagenômica da água da barragem de rejeitos da mina de Sossego (Canaã dos Carajás, PA). 2013. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Pontifícia Universidade Católica de Minas Gerais.

2.
PAIS, F. S.; MOURAO, M. M.. Participação em banca de Paola Rezende Patrocínio.Aplicação de Ferramentas Proteômicas na Busca de Novos Antígenos Imunoprotetores Contra Esquistossomose Mansônica. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Pontifícia Universidade Católica de Minas Gerais.




Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
X-Meeting 2015 - 11th International Conference of the AB3C. Transcriptional changes due to Wolbachia infection in the mosquito Aedes fluviatilis reveal evidence of residual host maniputaion. 2015. (Congresso).

2.
ISCB-Latin America / Xmeeting in Bioinformatics / BSB / SoiBio. Revisiting molecular serotyping of Streptococcus pneumoniae. 2014. (Congresso).

3.
X-meeting BSB 2013. METHOD, SOFTWARE AND DATABASE FOR MOLECULAR SEROTYPING OF Streptococcus pneumoniae: A TOOL SET TO ASSESS THE EFFECTIVENESS OF VACCINATION PROGRAM IN BRAZIL. 2013. (Congresso).

4.
8th International Conference of the Brazilian Association of Bioinformatics and Computational Biology. High-throughput Transcriptome Sequencing Of Pig Breeds Differing In Muscle Growth Rate And Fatness. 2012. (Congresso).

5.
International Society for Computational Biology ISCB Latin America, Santiago, Chile. Gene expression in S. mansoni schistosomula in the presence of hamster's perpheral or portal serum. 2012. (Congresso).

6.
7th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology - X Meeting. Assessing the efficiency of multiple sequence alignment programs. 2011. (Congresso).

7.
6th International Conference of the Brazilian Association of Bioinformatics and Computational Biology. Molecular Serotyping Tool For Streptococcus Pneumoniae. 2010. (Congresso).

8.
Brazil-Deutschland Systems Biology Meeting.Characterization of Trypanosoma cruzi proteins differentially expressed in trypomastigote forms of benznidazole resistant and susceptible populations. 2010. (Encontro).

9.
XIII International Congress of Protistology / XXV Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology / XXXVI Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease. CHARACTERIZATION OF TRYPANOSOMA CRUZI PROTEINS DIFFERENTIALLY EXPRESSED IN TRYPOMASTIGOTE FORMS OF BENZONIDAZOLE RESISTANT AND SUSCEPTIBLE POPULATIONS. 2009. (Congresso).

10.
BSP Spring, Trypanossomiasis/Leishmaniasis & Malaria Meetings. Molecular characterization of ribonucleoproteic antigens containing repeated amino acid sequences from Trypanossoma cruzi. 2008. (Congresso).

11.
VIII Encontro de Pesquisa do ICB/ IV Encontro Anual de Pesquisa em Bioquímica e Imunologia.Comissão Avaliadora de Pôsters. 2008. (Encontro).

12.
XXXV Reunião Anual sobre Pesquisa Básica em Doença de Chagas. Molecular Characterization of TcRpL7a, an imunogenic ribosomal protein from Trypanosoma cruzi containnig repetitive aminoacid sequences. 2008. (Congresso).

13.
XXXIVAnnual Meeting on Basic Research in Chagas Disease. Molecular characterization of ribonucleoproteic antigens from Trypanosoma cruzi. 2007. (Congresso).

14.
XXXIII Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease. Molecular characterization of two ribonuleoproteic antigens from Trypanosoma cruzi. 2006. (Congresso).

15.
III Encontro Anual de Pesquisa em Bioquímica e Imunologia. Characterization of two novel ribonucleoproteic antigens of Trypanosoma cruzi. 2005. (Congresso).

16.
XXXII Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease. Characterization of two novel ribonucleoproteic antigens of Trypanosoma cruzi. 2005. (Congresso).

17.
II Encontro Anual de Pesquisa em Bioquímica e Imunologia. Caracterização de TcRpLa, uma nova proteína ribossômica antigênica do Trypanosoma cruzi. 2004. (Congresso).

18.
XXXI Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease. Antigen Comonents of Ribonucleoprotein complexes of Trypanosoma cruzi: cellular localization and reactivity with chagasic sera. 2004. (Congresso).

19.
XXX Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease. 2003. (Congresso).

20.
XI Semana de Iniciação Científica da Universidade Federal de Minas Gerais.Resposta de pacientes chagásicos contra antígenos recombinantes de Trypanosoma cruzi derivados de complexos ribonucleoprotéicos. 2002. (Oficina).

21.
X Semana de Iniciação CIentífica da Universidade Federal de Minas Gerais.cDNAs de Trypanosoma cruzi que codificam proteínas ribossômicas reconhecidas por pacientes com Doença de Chagas. 2002. (Oficina).

22.
XXIX Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease. Human chagasic response against Trypanosomca cruzi recombinant antigens derived from ribonucleoproteic complexes. 2002. (Congresso).

23.
XXVIII Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease. Characterization of Trypanosoma cruzi antigens encoding nucleic acid binding proteins and recpgnized by sera from chagasic patients. 2001. (Congresso).

24.
IX Semana de Iniciação Científica da Universidade Federal de Minas Gerais.Caracterização de cDNAs que codificam antígenos repetitivos presentes em formas amastigotas de Trypanosoma cruzi. 2000. (Oficina).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
PAIS, F. S.. Comissão Organizadora do I Curso de RNAseq da Rede Genoma de Minas Gerais. 2013. (Outro).



Orientações



Orientações e supervisões concluídas
Dissertação de mestrado
1.
Wallison Fabiano de Araújo. LBXR - Load Blast XML Results: Desenvolvimento de um sistema que facilita a análise de sequências anotadas por Blast. 2017. Dissertação (Mestrado em Tec. da Info. Aplicada a Biologia Computacional) - Associação Educativa do Brasil - Faculdade Infórium, . Orientador: Fabiano Sviatopolk-Mirsky Pais.

2.
Wanessa Moreira Goes. EFEITO DA DELEÇÃO DO GENE QUE CODIFICA UMA PROTEÍNA DE LIGAÇÃO À RNA SOBRE O TRANSCRIPTOMA DE EPIMASTIGOTAS DE TRYPANOSOMA CRUZI. 2016. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais. Coorientador: Fabiano Sviatopolk-Mirsky Pais.

3.
Diego Vinícius de Castro Pereira. Identificação e análise de redes de genes envolvidos no câncer de pele melanoma através de mineração de texto. 2016. Dissertação (Mestrado em Tec. da Info. Aplicada a Biologia Computacional) - Associação Educativa do Brasil - Faculdade Infórium, . Orientador: Fabiano Sviatopolk-Mirsky Pais.

4.
Jéssica Silqueira Hickson Rios. Utilização de dados de RNA-seq de Schistosoma mansoni para pesquisa de variantes em receptores farmacológicos do praziquantel e potenciais alvos para novas drogas esquistossomicidas. 2015. Dissertação (Mestrado em Tec. da Info. Aplicada a Biologia Computacional) - Associação Educativa do Brasil - Faculdade Infórium, . Orientador: Fabiano Sviatopolk-Mirsky Pais.

Iniciação científica
1.
Larissa Lilian de Oliveira. Investigando a disponibilidade para o diagnóstico de doenças genéticas por laboratórios particulares. 2018. Iniciação Científica. (Graduando em Enfermagem) - Faculdades Kennedy. Orientador: Fabiano Sviatopolk-Mirsky Pais.

2.
Jessica Rodrigues Plaça. Análise de mapeamento e cálculo de expressão diferencial de genes provenientes de dados de RNAseq. 2013. Iniciação Científica. (Graduando em Biotecnologia) - Universidade Federal de Pelotas. Orientador: Fabiano Sviatopolk-Mirsky Pais.

3.
Debora de Figueiredo Cesar. Estudo de uma proteína do Trypanosoma cruzi diferencialmente expressa nas formas tripomastigotas de populações resistentes e susceptíveis ao Benzonidazol. 2009. Iniciação Científica - Centro de Pesquisas René Rachou / Fundação Oswaldo Cruz, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Fabiano Sviatopolk-Mirsky Pais.

4.
Ana Carolina Leão. Characterization, expression analysis and subcellular localization of the MASP family of Trypanosoma cruzi. 2006. Iniciação Científica. (Graduando em Ciências Biológicas Diurno) - Universidade Federal de Minas Gerais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Fabiano Sviatopolk-Mirsky Pais.



Inovação



Projetos de pesquisa


Outras informações relevantes


Aprovado em terceiro lugar no concurso FIOCRUZ-2014 para o perfil HP1488 - Bioinformática / Belo Horizonte-MG registrado no DOU Nº 122 de segunda-feira, 30 de junho de 2014.



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