José Salvatore Leister Patané

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  • Última atualização do currículo em 22/04/2013

É graduado em Ciências Biológicas pela Universidade de São Paulo (USP), com Mestrado no Departamento de Genética e Biologia Evolutiva da USP (genética de populações de moscas-das-frutas da espécie Anastrepha fraterculus), e Doutorado no mesmo departamento (evolução e biogeografia das espécies de tucanos, gênero Ramphastos). Atualmente é pesquisador colaborador do Laboratório de Ecologia e Evolução do Instituto Butantan (filogeografia das populações de Bothrops jararaca, usando marcadores nucleares e mitocondriais), e cursa MBA em Gestão Empresarial pela Fundação Getúlio Vargas. Tem experiência nas áreas de Genética e Evolução (ênfase em Filogeografia, Filogenética, Evolução Molecular, Sistemática e Evolução de Répteis e Aves), Bioinformática (utilização, criação e testes de modelos evolutivos; testes de simulação em dados simulados/não-simulados), Linguagens de Programação (Basic, C, C++, Groovy, Java, Pascal, Perl, Python, Ruby, Scala, R e MatLab) e Biogeografia. (Texto informado pelo autor)


Identificação
Nome
José Salvatore Leister Patané
Nome em citações bibliográficas
PATANÉ, J.S.L.;Patané, José S.L.;Patane, J. S. L., Patane, JSL

Endereço
Endereço Profissional
Instituto Butantan, Laboratório de Ecologia e Evolução.
Av. Dr. Vital Brazil, 1500
Butantã
05503-900 - Sao Paulo, SP - Brasil
Telefone: (11) 37267222
Ramal: 2073


Formação acadêmica/titulação
2009 - 2010
Pós-Doutorado.
Instituto Butantan, IBU, Brasil.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Filogeografia.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: GENÉTICA DE POPULAÇÕES.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Animal.
2002 - 2007
Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
com período sanduíche em Field Museum of Natural History (Orientador: John M. Bates).
Título: Filogenia molecular e biogeografia das espécies e subespécies do gênero Ramphastos (Piciformes: Ramphastidae), Ano de obtenção: 2007.
Orientador: Anita Wajntal.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo.
Palavras-chave: Ramphastos; Filogenia; Evolução molecular.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Animal / Especialidade: Sistemática Filogenética.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Animal / Especialidade: Evolução Molecular.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Zoologia / Subárea: Taxonomia dos Grupos Recentes.
1997 - 2001
Mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Genética).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Avaliação do emprego da técnica ISSR (Inter-Simple Sequence Repeat) em Anastrepa fraterculus (Diptera: Tephritidae).,Ano de Obtenção: 2001.
Orientador: Sergio Russo Matioli.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo.
Palavras-chave: ISSR; Anastrepha; Índice de similaridade.
1992 - 1996
Graduação em Ciências Biológicas.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Aplicação da técnica DS-PCR (Double-Stringency Polymerase Chain Reaction) em Anastrepha spp..
Orientador: Sergio Russo Matioli.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo.


Formação Complementar
2011 - 2011
Workshop on molecular evolution - Europe. (Carga horária: 80h).
Workshop on Molecular Evolution.
2011 - 2011
Synth. datab. fossil calib.:div. dating and beyond. (Carga horária: 24h).
National Evolutionary Synthesis Center.
2010 - 2010
Desc. recentes e perspect. em Bioinf. e Genômica. (Carga horária: 8h).
Laboratório Nacional de Computação Científica.
2010 - 2010
DNAs satélites: muito mais que mais do mesmo. (Carga horária: 4h).
56o Congresso Brasileiro de Genética.
2010 - 2010
Aplicações e impacto do sequenc. de nova geração. (Carga horária: 6h).
56o Congresso Brasileiro de Genética.
2010 - 2010
São Paulo Open Science Grid school. (Carga horária: 40h).
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
2010 - 2010
International Symposium on Phylogeography. (Carga horária: 16h).
Faculdade de Economia, Administração e Contabilidade - USP.
2008 - 2008
Computational Phyloinformatics. (Carga horária: 54h).
National Evolutionary Synthesis Center.
2008 - 2008
Origens da Vida. (Carga horária: 18h).
Faculdade de Arquitetura e Urbanismo.
2004 - 2004
Evolution, Phylogeography and Conservation. (Carga horária: 10h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2004 - 2004
Biometr. Marcadores Genét. Aplicados à Gen. Pop.. (Carga horária: 3h).
50o Congresso Brasileiro de Genética.
2004 - 2004
Evol. Genet., Comparative Biol. and Morphol. Evol.. (Carga horária: 10h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2004 - 2004
Introdução à Sistemática Filogenética de Aves. (Carga horária: 8h).
XII Congresso Brasileiro de Ornitologia.
2003 - 2003
Filog. Moleculares e Conservação da Biodiversidade. (Carga horária: 3h).
49o Congresso Nacional de Genética.
2003 - 2003
Métodos de Análise Filogenética. (Carga horária: 3h).
49o Congresso Nacional de Genética.
1998 - 1998
Evolução e Filogenias Moleculares. (Carga horária: 4h).
Instituto de Biociências - USP.
1998 - 1998
Tecnologia do DNA Recombinante. (Carga horária: 4h).
Instituto de Biociências - USP.
1997 - 1997
Inter-taxonomic comparisons in biology. (Carga horária: 8h).
Instituto de Biociências - USP.


Atuação Profissional

Instituto Butantan, IBU, Brasil.
Vínculo institucional

2010 - Atual
Vínculo: Pesquisador colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisador colaborador, Carga horária: 40

Vínculo institucional

2009 - 2010
Vínculo: Bolsista recém-doutor, Enquadramento Funcional: Pós-Doutorando, Carga horária: 40
Outras informações
Pos-Doutorado voltado à análise filogeográfica de populações de Bothrops jararaca (Serpentes:Viperidae), a partir de marcadores moleculares de regiões repetitivas de DNA (microssatélites).



Projetos de pesquisa
2011 - Atual
Filogeografia de populações de Bothrops jararaca (Serpentes: Viperidae) continentais e formas insulares, baseada em marcadores nucleares e mitocondriais
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: José Salvatore Leister Patané - Integrante / Maria José de J. Silva - Coordenador.
2009 - 2010
Filogeografia de populações de Bothrops jararaca (Serpentes: Viperidae) continentais e formas insulares associadas, baseada em marcadores de microssatélites
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: José Salvatore Leister Patané - Integrante / Maria José de J. Silva - Coordenador.
Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.


Revisor de periódico
2011 - 2011
Periódico: Genetics and Molecular Biology (Impresso)


Áreas de atuação
1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Animal/Especialidade: Evolução Molecular.
2.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Animal/Especialidade: Sistemática Filogenética.
3.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Filogeografia.
4.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Bioinformática.
5.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação/Especialidade: Linguagens de Programação.


Idiomas
Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Italiano
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.
Espanhol
Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Pouco.


Produções

Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
Patel, Swati2011Patel, Swati ; Weckstein, Jason D. ; Patané, José S.L. ; Bates, John M. ; Aleixo, Alexandre . Temporal and spatial diversification of Pteroglossus araçaris (AVES: Ramphastidae) in the neotropics: Constant rate of diversification does not support an increase in radiation during the Pleistocene. Molecular Phylogenetics and Evolution (Print), v. 58, p. 105-115, 2011.

2.
Parham, J. F.2011 Parham, J. F. ; Donoghue, P. C. J. ; Bell, C. J. ; Calway, T. D. ; Head, J. J. ; Holroyd, P. A. ; Inoue, J. G. ; Irmis, R. B. ; Joyce, W. G. ; Ksepka, D. T. ; Patane, J. S. L. ; Smith, N. D. ; Tarver, J. E. ; Van Tuinen, M. ; Yang, Z. ; Angielczyk, K. D. ; Greenwood, J. M. ; Hipsley, C. A. ; Jacobs, L. ; Makovicky, P. J. ; Muller, J. ; Smith, K. T. ; Theodor, J. M. ; Warnock, R. C. M. ; Benton, M. J. . Best Practices for Justifying Fossil Calibrations. Systematic Biology (Philadelphia. Print), v. -, p. -, 2011.

3.
Ksepka, D. T.2011 Ksepka, D. T. ; Benton, M. J. ; Carrano, M. T. ; Gandolfo, M. A. ; Head, J. J. ; Hermsen, E. J. ; Joyce, W. G. ; Lamm, K. S. ; Patane, J. S. L. ; Phillips, M. J. ; Polly, P. D. ; Van Tuinen, M. ; Ware, J. L. ; Warnock, R. C. M. ; Parham, J. F. . Synthesizing and databasing fossil calibrations: divergence dating and beyond. Biology Letters (Print), v. 7, p. 801-803, 2011.

4.
PATANÉ, J.S.L.;Patané, José S.L.;Patane, J. S. L., Patane, JSL2009 PATANÉ, J.S.L. ; Weckstein, Jason D. ; Aleixo, Alexandre ; Bates, John M. . Evolutionary history of Ramphastos toucans: molecular phylogenetics, temporal diversification, and biogeography. Molecular Phylogenetics and Evolution, p. -, 2009.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
Weckstein, Jason D. ; Patel, Swati ; Lutz, H. ; PATANÉ, J.S.L. ; Bates, John M. ; Aleixo, Alexandre . Molecular phylogenetics and the pattern and timing of diversification of toucans (Family: Ramphastidae). In: 25th International Ornithological Congress, 2010, Campos do Jordão. 25th International Ornithological Congress, 2010.

2.
Almeida, Keila A. ; PATANÉ, J.S.L. ; Silva, M.J.J. . Análises filogenéticas de roedores do gênero Euryoryzomys (Rodentia: Cricetidae) baseadas em sequências do gene mitocondrial citocromo-b. In: 56o Congresso Brasileiro de Genética, 2010, Guarujá. 56o Congresso Brasileiro de Genética, 2010.

3.
PATANÉ, J.S.L. . PEGA - Programa para download e extração de sequências gênicas anotadas do GenBank. In: 56o Congresso Brasileiro de Genética, 2010, Guarujá. 56o Congresso Brasileiro de Genética, 2010.

4.
PATANÉ, J.S.L. ; WAJNTAL, A. . Evolução das espécies do gênero Ramphastos (Aves: Piciformes) a partir de sequências de DNA mitocondrial. In: XII Congresso Brasileiro de Ornitologia, 2004, Blumenau, SC. XII Congresso Brasileiro de Ornitologia, 2004.

5.
PATANÉ, J.S.L. ; WAJNTAL, A. . Filogenia preliminar do gênero Ramphastos baseada em seqüências da região controladora e do 12S mitocondriais. In: 50º Congresso Brasileiro de Genética, 2004, Florianópolis - SC. 50º Congresso Brasileiro de Genética, 2004.

6.
PATANÉ, J.S.L. ; WAJNTAL, A. . Análise filogenética preliminar de espécies do gênero Ramphastos (Aves: Piciformes: Ramphastidae) baseada em um fragmento de 387pb do gene mitocondrial 12S. In: 49º Congresso Brasileiro de Genética, 2003, Águas de Lindóia, SP. 49º Congresso Brasileiro de Genética, 2003.

7.
PATANÉ, J.S.L. ; MATIOLI, S. R. . Análise da herança de marcadores ISSR (Inter-Simple Sequence Repeat) em Anastrepha fraterculus (Diptera: Tephritidae). In: 48º Congresso Brasileiro de Genética, 2002, Águas de Lindóia, SP. 48º Congresso Brasileiro de Genética, 2002.

8.
PATANÉ, J.S.L. ; MATIOLI, S. R. . Marcadores de microssatélites em Anastrepha spp.. In: 44º Congresso Brasileiro de Genética, 1998, Águas de Lindóia, SP. 44º Congresso Brasileiro de Genética, 1998.

Apresentações de Trabalho
1.
Patané, José S.L. . Diversificação genética de populações de Bothrops jararaca. 2012. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

2.
Patané, José S.L. . Introdução à análise filogenética envolvendo muitos táxons. 2012. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

3.
Patané, José S.L. . Relações filogenéticas profundas em aves, baseadas no maior número possível de táxons e genes. 2011. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

4.
PATANÉ, J.S.L. . Filogenia e Filogeografia: avanços e perspectivas. 2011. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

5.
PATANÉ, J.S.L. . Histórico, avanços e perspectivas em Filogeografia. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

6.
PATANÉ, J. S. L. ; Ferrarezzi, H. . Supermatrix, Supertrees, and individual gene phylogenetic analyses in assessing deep avian phylogeny. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

7.
PATANÉ, J.S.L. . Métodos de Reconstrução Filogenética. 2009. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

8.
Patané, José S.L. . Filogeografia de populações de Bothrops jararaca (Serpentes: Viperidae) continentais e formas insulares associadas, baseadas em marcadores microssatélites. 2009. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

9.
PATANÉ, J. S. L. . Uso do software BEAST para inferência de datações filogenéticas. 2009. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

10.
PATANÉ, J. S. L. . Aspectos de Evolução Molecular. 2009. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

11.
PATANÉ, J. S. L. . Evolução Molecular Biológica. 2009. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

12.
PATANÉ, J.S.L. . Evolução Molecular. 2008. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

13.
PATANÉ, J.S.L. ; WECKSTEIN, J. D. ; ALEIXO, A. ; WAJNTAL, A. . Phylogenetic and biogeographic aspects of toucans of the genus Ramphastos (Piciformes: Ramphastidae). 2007. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

14.
PATANÉ, J.S.L. ; WECKSTEIN, J. D. ; WAJNTAL, A. . Filogenias moleculares e distâncias genéticas indicam ausência de diferenciação genética entre 2 subespécies de R. vitellinus ssp. e de R. tucanus ssp.. 2006. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

15.
PATANÉ, J.S.L. ; TAKATA, R. . Ciências Biológicas. 2006. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

Outras produções bibliográficas
1.
PATANÉ, J.S.L. . Filogenia Molecular e Biogeografia das Espécies e Subespécies do Gênero Ramphastos (Piciformes: Ramphastidae) 2007 (Tese de Doutorado).

2.
PATANÉ, J.S.L. . Avaliação do emprego da técnica ISSR (Inter-Simple Sequence Repeat) em Anastrepha fraterculus (Diptera: Tephritidae) 2001 (Dissertação de Mestrado).


Produção técnica
Programas de computador sem registro
1.
PATANÉ, J.S.L. . PEGA 1.0 - Program for Extraction of GenBank Annotated sequences. 2010.


Demais tipos de produção técnica
1.
PATANÉ, J. S. L. . Análise Filogenética Computacional. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

2.
Patané, José S.L. . Filogeografia: detectando processos e padrões. 2012. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

3.
Patané, José S.L. . Análise filogenética envolvendo milhares de táxons. 2012. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

4.
PATANÉ, J. S. L. . Decifrando a árvore da vida: algumas aplicações práticas da filogenética. 2009. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).



Bancas

Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
Sílvia Nassif Del Lama; Érika Martins Braga.; PATANÉ, J.S.L.. Participação em banca de Cynthia Martins Villar. Prevalência e identificação de linhagens de hemoparasitas em populações brasileiras e africanas de Bubulcus ibis (Ardeidae, Pelecaniformes, Aves). 2013. Dissertação (Mestrado em Genética Evolutiva e Biologia Molecular) - Universidade Federal de São Carlos.

2.
Alexandre Luís Padovan Aleixo; Fernando Jorge Guimarães Sequeira; Luciano Nicolás Naka; PATANÉ, J. S. L.. Participação em banca de LUCAS EDUARDO ARAÚJO SILVA. Filogeografia de Phaethornis bourcieri (Aves: Trochilidae): implicações taxonômicas e biogeográficas. 2012. Dissertação (Mestrado em Zoologia) - Museu Paraense Emílio Goeldi.




Eventos

Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
56o Congresso Brasileiro de Genética. PEGA - Programa para download e extração de sequências gênicas anotadas do GenBank. 2011. (Congresso).

2.
NESCent Working Group on Fossil Calibrations.Synthesizing and databasing fossil calibrations: divergence dating and beyond. 2011. (Encontro).

3.
25th International Ornithological Congress. Supermatrix, Supertrees, and individual gene phylogenetic analyses in assessing deep avian phylogeny. 2010. (Congresso).

4.
Descobertas recentes e perspectivas em Bioinformática e da Genômica: uma tripla comemoração. 2010. (Simpósio).

5.
XI Semana da Biologia.Aspectos de Evolução Molecular. 2009. (Encontro).

6.
X São Paulo Research Conference (Origens da Vida). 2008. (Simpósio).

7.
VIII Neotropical Ornithological Congress. Phylogenetic and biogeographic aspects of toucans of the genus Ramphastos (Piciformes: Ramphastidae). 2007. (Congresso).

8.
XIV Congresso Brasileiro de Ornitologia. Filogenias moleculares e distâncias genéticas indicam ausência de diferenciação entre 2 subespécies de R. vitellinus spp. e de R. tucanus ssp.. 2006. (Congresso).

9.
50º Congresso Brasileiro de Genética. Filogenia preliminar do gênero Ramphastos baseada em seqüências da região controladora e do 12S mitocondriais. 2004. (Congresso).

10.
XII Congresso Brasileiro de Ornitologia. Evolução das espécies do gênero Ramphastos (Aves: Piciformes) a partir de sequências de DNA mitocondrial. 2004. (Congresso).

11.
Conferências André Dreyfus - 2004. 2004. (Seminário).

12.
49º Congresso Brasileiro de Genética. Análise filogenética preliminar de espécies do gênero Ramphastos (Aves: Piciformes: Ramphastidae) baseada em um fragmento de 387pb do gene mitocondrial 12S. 2003. (Congresso).

13.
48º Congresso Brasileiro de Genética. Análise da herança de marcadores ISSR (Inter-Simple Sequence Repeat) em Anastrepha fraterculus. 2002. (Congresso).

14.
I Simpósio de Genética de Aves Neotropicais. 2002. (Simpósio).

15.
44º Congresso Brasileiro de Genética. Marcadores de microssatélites em Anastrepha spp.. 1998. (Congresso).

16.
I Semana Temática do Instituto de Biociências da USP. 1998. (Simpósio).

17.
Evolução e filogenias moleculares. 1998. (Simpósio).

18.
Conferências André Dreyfus sobre Evolução. 1997. (Simpósio).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
PATANÉ, J.S.L. . Curso "Análise Filogenética Computacional". 2013. (Outro).

2.
Patané, José S.L. ; BRAZ, H. . Seminários do Laboratório de Ecologia e Evolução. 2011. (Outro).




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