Gustavo Antonio de Souza

Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 2

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  • Última atualização do currículo em 12/11/2018


Possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade Federal do Paraná (1999) e doutorado em Biologia Celular e Molecular pela Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto- USP (2004). Realizou pós-doutorado com o Dr. Matthias Mann no Dept. de Proteômica e Tradução de Sinais do Instituto Max-Planck em Munique (ALE) (2005-2006). Atuou como Pesquisador Principal e como líder do laboratório multi-usuário de Proteômica e Espectrometria de Massas junto ao Hospital Universitário de Oslo (Universidade de Oslo, Noruega) (2010-2015). Atualmente está vinculado a Universidade Federal do Rio Grande do Norte. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Gustavo Antonio de Souza
Nome em citações bibliográficas
de SOUZA, G. A.;de Souza, G. A.;de Souza, Gustavo A;de Souza, Gustavo A.;De Souza, Gustavo Antonio;de Souza, Gustavo;de Souza, G.;SOUZA, GUSTAVO A.;DE SOUZA, G.A.;ANTONIO DE SOUZA, GUSTAVO;DE SOUZA, GUSTAVO A.

Endereço


Endereço Profissional
Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Centro de Biociências, Departamento de Bioquímica.
Avenida Odilon Gomes de Lima 1722
Capim Macio
59078400 - Natal, RN - Brasil
Telefone: (84) 33422216
Ramal: 123
URL da Homepage: http://www.neuro.ufrn.br/?lang=pt


Formação acadêmica/titulação


2002 - 2004
Doutorado em Biologia Celular e Molecular.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Modificação do Proteoma dos Estágios Iniciais da Transformação Maligna de Melanomas, Ano de obtenção: 2004.
Orientador: Lewis Joel Greene.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Palavras-chave: proteoma; melanoma; progressão tumoral; espectrometria de massa.
Grande área: Ciências Biológicas
2000 - 2002
Mestrado em Biologia Celular e Molecular.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Determinação da Estrutura Primária da Lectina Cramoll (Iso 1) de Cratylia mollis,Ano de Obtenção: 2002.
Orientador: Lewis Joel Greene.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Palavras-chave: Lectina; Estrutura primária de proteínas; Cratylia mollis; Cristalografia de proteínas; Estrutura de proteínas.
Grande área: Ciências Biológicas
Setores de atividade: Outros Setores.
1996 - 1999
Graduação em Ciências Biológicas.
Universidade Federal do Paraná, UFPR, Brasil.


Pós-doutorado


2005 - 2007
Pós-Doutorado.
Max-Planck-Institut für Biochemie, BIOCHEM, Alemanha.
Grande área: Ciências Biológicas


Atuação Profissional



Universidade Federal do Rio Grande do Norte, UFRN, Brasil.
Vínculo institucional

2015 - Atual
Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor Associado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.


University of Oslo, UiO, Noruega.
Vínculo institucional

2015 - Atual
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Colaborador

Vínculo institucional

2010 - 2015
Vínculo: , Enquadramento Funcional: Pesquisador Principal, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.


University of Bergen, UiB, Noruega.
Vínculo institucional

2010 - 2015
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Colaborador

Vínculo institucional

2007 - 2010
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Pesquisador associado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.


Max-Planck-Institut für Biochemie, BIOCHEM, Alemanha.
Vínculo institucional

2012 - 2014
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Colaborador

Vínculo institucional

2005 - 2007
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Pesquisador, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.


Stellenbosch University, SUN, África do Sul.
Vínculo institucional

2008 - 2015
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Colaborador
Outras informações
DST/NRF Centre of Excelence for Biomedical TB Research


Norwegian School of Veterinary Science, NVH, Noruega.
Vínculo institucional

2012 - 2015
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Colaborador



Projetos de pesquisa


2015 - Atual
Development of computational approaches for the analysis of proteomic data
Descrição: Protein analysis by mass spectrometry (MS) went through big technological improvements in the past decade, in a manner almost similar to developments in genomic research. However, the development of computational approaches targeting analysis of MS data lagged behind. This is particularly relevant regarding meta-analysis, i.e., the combined analysis of MS data collected independently by different research groups. Such type of analysis is relevant because, while data collected for a specific project can fulfill only narrow objectives (for example, a project studying membrane fractions from a cell of the immune system), meta-analysis can explore wider questions (using the same example above, the analysis of many datasets where different fractionation methods were used can help to evaluate and optimize the efficiency of such methods). The worst bottleneck on this type of analysis is how to handle the normalization of the data that was collected by different groups using unique instruments and approaches. This raises the need for computational tools using mathematical approaches that will allow for that. Therefore, the main aim of this project is to employ computational biology in the proteomics field, being able to normalize and compare samples collected independently and which can be applied to several topics..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) .

Integrantes: Gustavo Antonio de Souza - Coordenador / KROLL, JOSÉ E. - Integrante / DE SOUZA, SANDRO J. - Integrante / Vandeclecio Lira dos Santos - Integrante / FONSECA, ANDRÉ - Integrante / Lucas Marques Cunha - Integrante / Jade Marina Dias Gomes - Integrante / Karla Cristina Tabosa Machado - Integrante / Tayná da Silva Fiúza - Integrante.
Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Número de produções C, T & A: 3 / Número de orientações: 1
2012 - 2015
Implementing high-resolution proteomics for System Biology in the Norwegian FUGE community
Descrição: Mass spectrometry-based proteomics has taken great strides in development, and is now considered to be on par with most genomic technologies in throughput and comprehensiveness. Analyzing peptide mixtures by liquid chromatography coupled to high-resolution mass spectrometry has emerged as the main technology for in-depth proteomic characterization, with publications now reporting the analysis of 5 to 6 thousand proteins in routine single experiments using diverse eukaryotic samples. Such data is not only qualitative, but also became quantitative through the use of both label-free and stable isotopic labelling methods. The project will focus in acquiring expertise at the hardware level, i.e. to better understand instrument setup parameters and optimization in order to achieve a satisfactory level of protein identification in a single experiment. The aim is to be able to apply the approach at a routine level independent of the project, while reaching high standard outputs. This will allow implementation of service to the local and national community and further cooperation with other national FUGE nodes..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Gustavo Antonio de Souza - Coordenador / Matthias Mann - Integrante / Astrid Tutturen - Integrante / Maria Stensland - Integrante.
Financiador(es): The Research Council of Norway - Auxílio financeiro.
Número de produções C, T & A: 1
2012 - 2015
Development of hormone-refractory prostate cancer: identification of prognosis biomarkers
Descrição: Prostate cancer is the most common male malignancy in Norway and the number of men diagnosed with prostate cancer is rapidly increasing (year 2008: 4168 cases (Cancer Register of Norway)). The clinical course is highly variable following diagnosis. In present practice, about one third of the patients receive treatment with curative intention by surgery or radiation. However, these patients may experience treatment-related problems, which may overshadow the threat represented by the cancer itself. This is a challenge for the urologists as they in their decision making, lack tools for deciding in a reliable way whether a histological proven tumour will give rise to a clinically significant disease. Thus, over-treatment of prostate cancer patients with non-aggressive disease is a major problem both for the patients and the health care system. Active Surveillance has been introduced as a protocol to reduce over-treatment of patients with low-risk prostate cancer. The challenge, however, is to distinguish low-risk patients who will show slow progression of the disease (and are true candidates for active surveillance) from those who are at risk for progression to a more aggressive disease (false candidates). Misclassification is observed with the current definitions of low-risk prostate cancer and better prediction tools are wanted that distinguish true indolent from aggressive disease..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado: (1) .

Integrantes: Gustavo Antonio de Souza - Coordenador / Bernd Thiede - Integrante / Astrid Tutturen - Integrante / Maria Stensland - Integrante / Aud Svindland - Integrante / Lars Magne Eri - Integrante / Viktor Berge - Integrante / Hakon Ramberg - Integrante / Olov Ogren - Integrante / Kristin Tasken - Integrante.
2012 - 2012
Changes in the proteome of M. tuberculosis during acquisition of drug resistance phenotype
Descrição: In this project we selected four strains with previously acknowledge different degrees of drug resistance, and submitted then to further resistance stress through in vitro exposure to clinical drugs. Mass spectrometry data showed diverse pathways and mechanisms that were related to stress, survival and transport across membrane actively activated after drug stimuli. We also delimited ORFs not previously described in resistance phenotype which are now potential targets for future research..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado: (1) .

Integrantes: Gustavo Antonio de Souza - Coordenador / Warren, R. M. - Integrante / Suereta Fortuin - Integrante / Gisele Guicardi Tomazella - Integrante.
2010 - 2017
Using MS-based methods to identify immunogenic gluten peptides
Descrição: Celiac disease is caused by intolerance to cereal gluten proteins, and HLA-DQ molecules are involved in the disease pathogenesis by presentation of gluten peptides to CD4+ T cells. It has recently been shown that T cells of DQ2.5 and DQ2.2 patients recognize different sets of gluten epitopes suggesting that these celiac disease associated DQ molecules select different peptides for display. To explore whether this is the case, we employ a comprehensive, large-scale quantitative comparison of the endogenous self-peptides bound to HLA-DQ molecules of B-lymphoblastoid cell lines (B-LCLs). Peptides were eluted from affinity-purified HLA molecules of cell lines and subjected to quadrupole orbitrap mass spectrometry and MaxQuant software analysis. We are able to demonstrates that quantitative comparison of endogenous peptides sampled from our protein metabolism by HLA molecules provides clues to understand HLA association with disease..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Gustavo Antonio de Souza - Integrante / Siri Dørum - Integrante / Ludvig M. Sollid - Coordenador.

Número de produções C, T & A: 6
2010 - 2015
Immune cells system biology
Descrição: By comparing related, yet different, cell samples, we aim to identify protein targets with different expression levels between such samples, which might explain molecular mechanisms participating in the process under study. For example, we are currently working with the characterization of the proteomic content of T-helper cells with different cytokine production profiles (Th1, Th2, Th17). We are also interested in determine key protein components of immature dendritic cells, as well as dendritic cells after maturation with different stimuli. Such comparisons of related cell models are done through label-free quantitative methods, or Stable-Isotopic Labeling of Amino acids in Cell Culture (SILAC)..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado: (1) .

Integrantes: Gustavo Antonio de Souza - Coordenador / Gisele Guiçardi Tomazella - Integrante / Tahira Riaz - Integrante.
Financiador(es): Helse Sor-Øst - Bolsa.
Número de produções C, T & A: 9
2010 - 2010
Proteomic characterization of highly-virulent and drug-resistant phenotypes in relevant clinical isolates of nosocomial infection
Descrição: M. tuberculosis strains observed in clinical samples present a variable degree of virulence and resistance to drugs. Genotyping the strains offer precise information regarding is genetic background and presence of specific mutations, but only limited knowledge regarding their gene expression profile differences. In this project we employed mass spectrometry-based proteomics in a panel of 8 clinical strains with variable degrees of virulence and resistance, and identified operon regions which are deferentially controlled in specific strains..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Gustavo Antonio de Souza - Integrante / Wiker, Harald G. - Coordenador / Tomazella, Gisele G. - Integrante.

Número de produções C, T & A: 1
2008 - 2010
Building protein inventories of resting human neutrophils
Descrição: Neutrophils are the most abundant leukocytes in peripheral blood and represent one of the most important elements of innate immunity. Recent subcellular proteomic studies have focused on the identification of human neutrophil proteins in various subcellular membrane and granular fractions. Although there are relatively few studies dealing with the analysis of the total extract of human neutrophils, many biological problems such as the role of chemokines, adhesion molecules, and other activating inputs involved in neutrophil responses and signaling can be approached on the basis of the identification of the total cellular proteins..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Gustavo Antonio de Souza - Coordenador / Gisele Guiçardi Tomazella - Integrante / Wiker, Harald G. - Integrante.

Número de produções C, T & A: 3
2007 - 2010
Proteomics and bioinformatics of Mycobacterium tuberculosis
Descrição: Tuberculose, a doenca causada pelo patógeno Mycobacterium tuberculosis, causa aproximadamente 2 milhões de mortes por ano. Seu genoma é composto por aproximadamente 4000 ORFs, muito dos quais contendo regiões gênicas ainda nao caracterizadas. Predicão computacional apresenta variado grau de confiabilidade e predicões conflitantes sao routineiras. Nosso grupo estabeleceu uma estratégia proteogenômica onde dados de LC-MS/MS são usados para validar a expressao e consequentemente existência de genes. Assim que esses genes sao propriamente validados, bancos de dados de sequência de proteínas contendo uma anotacão mais precisa são refeitos para análises subsequentes. Esses bancos auxiliaram a identificacão de proteínas envolvidas em aumento de fenótipo de virulência em linhagens obtidas de pacientes com remissao a tuberculose..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Gustavo Antonio de Souza - Integrante / Wiker, Harald G. - Coordenador.

Número de produções C, T & A: 17
2005 - 2007
Proteomic characterization of clinically relevant body fluids
Descrição: Fluidos corporais (por exemplo samgue, urina, fluido cerebroespinal) contem proteinas que são secretadas por múltiplos tecidos e órgãos do corpo. Assim sendo mudancas no proteoma desses fluidos refletem mudancas no estado do corpo, e podem determinar doencas. Análise de proteínas em fluidos corporais é minimamente invasivo, tornando-os alvos ideais para diagnose clínica. No entanto, análise de sangue ou plasma apresenta complicacoes devido a alta concentracão de certas proteínas numa ordem de magnitude de e10, dificultando a identificacão de proteínas de baixa expressão. Caracterizacão dos componentes que constituem esses fluidos é uma etapa inicial em pesquisa de biomarcadores e outros alvos diagnósticos..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Gustavo Antonio de Souza - Coordenador.

Número de produções C, T & A: 6


Revisor de periódico


2009 - Atual
Periódico: Experimental and Molecular Pathology (Print)
2008 - Atual
Periódico: Proteomics (Weinheim. Print)
2010 - Atual
Periódico: Bioinformatics (Oxford)
2010 - Atual
Periódico: BMC Bioinformatics
2010 - Atual
Periódico: BMC Genomics
2011 - Atual
Periódico: Journal of Virological Methods
2011 - Atual
Periódico: AIDS Research and Human Retroviruses
2011 - Atual
Periódico: Oral Diseases
2011 - Atual
Periódico: Scandinavian Journal of Immunology (Print)
2011 - Atual
Periódico: Journal of Proteome Research (Print)
2012 - Atual
Periódico: Plos One
2012 - Atual
Periódico: Journal of Proteomics (Print)
2013 - Atual
Periódico: Genome Research


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Química de Macromoléculas.
2.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Química de Macromoléculas/Especialidade: Proteínas.
3.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Proteoma.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.


Prêmios e títulos


2010
2010 Publication of the Year, The Gade Institute, UiB.
1998
SIMEC 98 Young Investigator Award, 5o. Simpósio Brasileiro sobre Matriz Extracelular.


Produções



Produção bibliográfica
Citações

Web of Science
Total de trabalhos:49
Total de citações:1713
Fator H:21
de souza ga OR de souza g  Data: 04/07/2017

Artigos completos publicados em periódicos

1.
KOSTAS, MICHAL2018KOSTAS, MICHAL ; HAUGSTEN, ELLEN MARGRETHE ; ZHEN, YAN ; SORENSEN, VIGDIS ; SZYBOWSKA, PATRYCJA ; FIORITO, ELISA ; LORENZ, SUSANNE ; De Souza, Gustavo Antonio ; WIEDLOCHA, ANTONI ; WESCHE, JØRGEN . The phosphatase PTPRG controls FGFR1 activity and influences sensitivity to FGFR kinase inhibitors. MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS, v. e, p. mcp.RA117.000538, 2018.

2.
TUTTUREN, ASTRID E.V.2018TUTTUREN, ASTRID E.V. ; DØRUM, SIRI ; CLANCY, TREVOR ; REIMS, HENRIK M. ; CHRISTOPHERSEN, ASBJØRN ; LUNDIN, KNUT E.A. ; SOLLID, LUDVIG M. ; de Souza, Gustavo A. ; STAMNAES, JORUNN . Characterization of the Small Intestinal Lesion in Celiac Disease by Label-Free Quantitative Mass Spectrometry. AMERICAN JOURNAL OF PATHOLOGY, v. x, p. 1-12, 2018.

3.
SIKORSKI, KRZYSZTOF2018 SIKORSKI, KRZYSZTOF ; MEHTA, ADI ; INNGJERDINGEN, MARIT ; THAKOR, FLOURINA ; KLING, SIMON ; KALINA, TOMAS ; NYMAN, TUULA A. ; STENSLAND, MARIA EKMAN ; ZHOU, WEI ; de Souza, Gustavo A. ; HOLDEN, LARS ; STUCHLY, JAN ; TEMPLIN, MARKUS ; LUND-JOHANSEN, FRIDTJOF . A high-throughput pipeline for validation of antibodies. NATURE METHODS, v. 15, p. 909-912, 2018.

4.
SANCHUKI, HELOISA B.S.2017SANCHUKI, HELOISA B.S. ; GRAVINA, FERNANDA ; RODRIGUES, THIAGO E. ; GERHARDT, EDILEUSA C.M. ; PEDROSA, FÁBIO O. ; SOUZA, EMANUEL M. ; RAITTZ, ROBERTO T. ; VALDAMERI, GLAUCIO ; de Souza, Gustavo A. ; HUERGO, LUCIANO F. . Dynamics of the Escherichia coli proteome in response to nitrogen starvation and entry into the stationary phase. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS, v. 1865, p. 344-352, 2017.

5.
CITRANGULO TORTELLI JUNIOR, THARCISIO2017CITRANGULO TORTELLI JUNIOR, THARCISIO ; MARTINS FRANCO DE GODOY, LYRIS ; ANTONIO DE SOUZA, GUSTAVO ; BONATTO, DIEGO ; HANADA OTAKE, ANDREIA ; DE FREITAS SAITO, RENATA ; CESAR ROSA, JOSE ; JOEL GREENE, LEWIS ; ROGER CHAMMAS, AND . Accumulation of prohibitin is a common cellular response to different stressing stimuli and protects melanoma cells from ER stress and chemotherapy-induced cell death. Oncotarget, v. e, p. 1, 2017.

6.
KROLL, JOSÉ EDUARDO2017KROLL, JOSÉ EDUARDO ; DA SILVA, VANDECLÉCIO LIRA ; DE SOUZA, SANDRO JOSÉ ; De Souza, Gustavo Antonio . A tool for integrating genetic and mass spectrometry-based peptide data: Proteogenomics Viewer. BIOESSAYS, v. e, p. e201700015, 2017.

7.
ROWCZENIO, DOROTA2017ROWCZENIO, DOROTA ; STENSLAND, MARIA ; de Souza, Gustavo A. ; STRØM, ERIK H. ; GILBERTSON, JANET A. ; TAYLOR, GRAHAM ; RENDELL, NIGEL ; MINOGUE, SHANE ; EFEBERA, YVONNE A. ; LACHMANN, HELEN J. ; WECHALEKAR, ASHUTOSH D. ; HAWKINS, PHILIP N. ; HEIMDAL, KETIL R. ; SELVIG, KRISTIAN ; LÆGREID, INGER K. ; DEMOULIN, NATHALIE ; AYDIN, SELDA ; GILLMORE, JULIAN D. ; WIEN, TALE N. . Renal Amyloidosis Associated With 5 Novel Variants in the Fibrinogen A Alpha Chain Protein. Kidney International Reports, v. 2, p. 461-469, 2017.

8.
HASSEL, BJØRNAR2017HASSEL, BJØRNAR ; De Souza, Gustavo Antonio ; STENSLAND, MARIA EKMAN ; IVANOVIC, JUGOSLAV ; VOIE, ØYVIND ; DAHLBERG, DANIEL . The proteome of pus from human brain abscesses: host-derived neurotoxic proteins and the cell-type diversity of CNS pus. JOURNAL OF NEUROSURGERY, v. e, p. 1-9, 2017.

9.
IVERSEN, RASMUS2017IVERSEN, RASMUS ; SNIR, OMRI ; STENSLAND, MARIA ; KROLL, JOSÉ E. ; STEINSBØ, ØYVIND ; KORPONAY-SZABÓ, ILMA R. ; LUNDIN, KNUT E.A. ; de Souza, Gustavo A. ; SOLLID, LUDVIG M. . Strong Clonal Relatedness between Serum and Gut IgA despite Different Plasma Cell Origins. Cell Reports, v. 20, p. 2357-2367, 2017.

10.
DA SILVA, VANDECLECIO2017DA SILVA, VANDECLECIO ; FONSECA, ANDRÉ ; FONSECA, MARBELLA ; DA SILVA, THAYNA ; COELHO, ANA ; KROLL, JOSÉ ; DE SOUZA, JORGE ; STRANSKY, BEATRIZ ; de Souza, Gustavo ; DE SOUZA, SANDRO . Genome-wide identification of cancer/testis genes and their association with prognosis in a pan-cancer analysis. Oncotarget, v. e, p. e-e, 2017.

11.
GRAVINA, FERNANDA2017GRAVINA, FERNANDA ; SANCHUKI, HELOISA S. ; RODRIGUES, THIAGO E. ; GERHARDT, EDILEUSA C.M. ; PEDROSA, FÁBIO O. ; SOUZA, EMANUEL M. ; VALDAMERI, GLÁUCIO ; de Souza, Gustavo A. ; HUERGO, LUCIANO F. . Proteome analysis of an Escherichia coli ptsN -null strain under different nitrogen regimes. Journal of Proteomics, v. e, p. 1, 2017.

12.
SHAO, WENGUANG2017SHAO, WENGUANG PEDRIOLI, PATRICK G.A. WOLSKI, WITOLD SCURTESCU, CRISTIAN SCHMID, EMANUEL VIZCAÍNO, JUAN A. COURCELLES, MATHIEU SCHUSTER, HEIKO KOWALEWSKI, DANIEL MARINO, FABIO ARLEHAMN, CECILIA S.L. VAUGHAN, KERRIE PETERS, BJOERN SETTE, ALESSANDRO OTTENHOFF, TOM H.M. MEIJGAARDEN, KRISTA E. NIEUWENHUIZEN, NATALIE KAUFMANN, STEFAN H.E. SCHLAPBACH, RALPH CASTLE, JOHN C. NESVIZHSKII, ALEXEY I. NIELSEN, MORTEN DEUTSCH, ERIC W. CAMPBELL, DAVID S. MORITZ, ROBERT L. , et al.ZUBAREV, ROMAN A. YTTERBERG, ANDERS JIMMY PURCELL, ANTHONY W. MARCILLA, MIGUEL PARADELA, ALBERTO WANG, QI COSTELLO, CATHERINE E. TERNETTE, NICOLA VAN VEELEN, PETER A. VAN ELS, CÉCILE A.C.M. HECK, ALBERT J.R. DE SOUZA, GUSTAVO A. SOLLID, LUDVIG M. ADMON, ARIE STEVANOVIC, STEFAN RAMMENSEE, HANS-GEORG THIBAULT, PIERRE PERREAULT, CLAUDE BASSANI-STERNBERG, MICHAL AEBERSOLD, RUEDI CARON, ETIENNE ; The SysteMHC Atlas project. NUCLEIC ACIDS RESEARCH, v. e, p. 1-11, 2017.

13.
LUBELWANA HAFVER, TANDEKILE2017LUBELWANA HAFVER, TANDEKILE ; WANICHAWAN, PIMTHANYA ; MANFRA, ORNELLA ; De Souza, Gustavo Antonio ; LUNDE, MARIANNE ; MARTINSEN, MARITA ; LOUCH, WILLIAM EDWARD ; SEJERSTED, OLE MATHIAS ; CARLSON, CATHRINE REIN . Mapping the in vitro interactome of cardiac sodium (Na )-calcium (Ca ) exchanger 1 (NCX1). PROTEOMICS, v. 17, p. 1600417, 2017.

14.
RIAZ, T.2016RIAZ, T. ; SOLLID, L. M. ; OLSEN, I. ; de SOUZA, G. A. . Quantitative Proteomics of Gut-Derived Th1 and Th1/Th17 Clones Reveal the Presence of CD28+ NKG2D- Th1 Cytotoxic CD4+ T cells. MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS, v. 15, p. 1007-1016, 2016.

15.
DØRUM, SIRI2016DØRUM, SIRI ; STEINSBØ, ØYVIND ; BERGSENG, ELIN ; ARNTZEN, MAGNUS Ø. ; de Souza, Gustavo A. ; SOLLID, LUDVIG M. . Gluten-specific antibodies of celiac disease gut plasma cells recognize long proteolytic fragments that typically harbor T-cell epitopes. Scientific Reports, v. 6, p. 25565, 2016.

16.
LUND-JOHANSEN, FRIDTJOF2016 LUND-JOHANSEN, FRIDTJOF ; DE LA ROSA CARRILLO, DANIEL ; MEHTA, ADI ; SIKORSKI, KRZYSZTOF ; INNGJERDINGEN, MARIT ; KALINA, TOMAS ; RØYSLAND, KJETIL ; ANTONIO DE SOUZA, GUSTAVO ; BRADBURY, ANDREW R M ; LECREVISSE, QUENTIN ; STUCHLY, JAN . MetaMass, a tool for meta-analysis of subcellular proteomics data. Nature Methods, v. 1, p. 1, 2016.

17.
HAUGSTEN, ELLEN MARGRETHE2016HAUGSTEN, ELLEN MARGRETHE ; SØRENSEN, VIGDIS ; BOSAKOVA, MICHAELA KUNOVA ; De Souza, Gustavo Antonio ; KREJCI, PAVEL ; WIEDLOCHA, ANTONI ; WESCHE, JØRGEN . Proximity Labeling Reveals Molecular Determinants of FGFR4 Endosomal Transport. Journal of Proteome Research (Print), v. 1, p. acs.jproteome.6b00652, 2016.

18.
VASILEVSKA, JELENA2016VASILEVSKA, JELENA ; De Souza, Gustavo Antonio ; STENSLAND, MARIA ; SKRASTINA, DACE ; ZHULENVOVS, DMITRY ; PAPLAUSKS, RAIMONDS ; KURENA, BAIBA ; KOZLOVSKA, TATJANA ; ZAJAKINA, ANNA . Comparative protein profiling of B16 mouse melanoma cells susceptible and non-susceptible to alphavirus infection: Effect of the tumor microenvironment. Cancer Biology & Therapy, v. 1, p. 1-16, 2016.

19.
PAIVA, ANA L. S.2016PAIVA, ANA L. S. ; OLIVEIRA, JOSE T. A. ; de Souza, Gustavo A. ; VASCONCELOS, ILKA M. . Label-free Proteomic Reveals that Cowpea Severe Mosaic Virus Transiently Suppresses the Host Leaf Protein Accumulation During the Compatible Interaction with Cowpea ( Vigna unguiculata [L.] Walp.). JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH, v. 15, p. 4208-4220, 2016.

20.
KARLSEN, TOMMY A2016KARLSEN, TOMMY A ; De Souza, Gustavo Antonio ; ØDEGAARD, BJØRN ; ENGEBRETSEN, LARS ; BRINCHMANN, JAN E . microRNA-140 Inhibits Inflammation and Stimulates Chondrogenesis in a Model of Interleukin 1β-induced Osteoarthritis. Molecular Therapy-Nucleic Acids, v. 5, p. e373, 2016.

21.
FORTUIN, SUERETA2015FORTUIN, SUERETA ; Tomazella, Gisele G. ; NAGARAJ, NAGARJUNA ; SAMPSON, SAMANTHA L. ; GEY VAN PITTIUS, NICOLAAS C. ; SOARES, NELSON C. ; Wiker, Harald G. ; de Souza, Gustavo A. ; WARREN, ROBIN M. . Phosphoproteomics analysis of a clinical Mycobacterium tuberculosis Beijing isolate: expanding the mycobacterial phosphoproteome catalog. Frontiers in Microbiology (Online), v. 6, p. 1, 2015.

22.
JOHANSEN, JORUNN N.2015JOHANSEN, JORUNN N. ; VARTDAL, FRODE ; DESMARAIS, CINDY ; TUTTUREN, ASTRID E.V. ; de Souza, Gustavo A. ; LOSSIUS, ANDREAS ; HOLMØY, TRYGVE . Intrathecal BCR transcriptome in multiple sclerosis versus other neuroinflammation: Equally diverse and compartmentalized, but more mutated, biased and overlapping with the proteome. Clinical Immunology (Orlando, Fla. Print), v. 160, p. 211-225, 2015.

23.
CAMASSA, LAURA MARIA AZZURRA2015CAMASSA, LAURA MARIA AZZURRA ; LUNDE, LISA K. ; HODDEVIK, EYSTEIN H. ; STENSLAND, MARIA ; BOLDT, HENNING B. ; de Souza, Gustavo A. ; OTTERSEN, OLE P. ; AMIRY-MOGHADDAM, MAHMOOD . Mechanisms underlying AQP4 accumulation in astrocyte endfeet. GLIA (New York, N.Y. : Print), v. x, p. n/a-n/a, 2015.

24.
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RIBEIRO, A. S.1998RIBEIRO, A. S. ; de SOUZA, G. A. ; BUCHI, D. F. ; VEIGA, S. S. ; GREMSKI, W. . Production of Polyclonal Monospecific Antibodies Against Extracellular Matrix (ECM) Molecules as Matrix Research Tools. Acta Biológica Paranaense, Curitiba, v. 27, p. 111-121, 1998.

Capítulos de livros publicados
1.
de Souza, Gustavo A.; Wiker, Harald G. . Proteomic approaches to study immunity in infection. In: Stefan Kaufmann; Dieter Kabelitz. (Org.). Immunology of Infection, Methods in Microbiology. 3ed.Londres: Academic Press, Elsevier, 2010, v. 37, p. 101-114.

Resumos expandidos publicados em anais de congressos
1.
Mann, Matthias ; Schenk, Susann ; ADACHI, J. ; de Souza, G. A. ; Godoy, Lyris MF ; Olsen, Jesper V . High-accuracy analysis of bodily fluid proteomes using a linear ion trap Fourier Transformer instrument. In: 53th ASMS Conference on Mass Spectrometry, 2005. ASMS Archive, 2005.

Resumos publicados em anais de congressos
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de Souza, G. A.. Deep proteome characterization and label-free quantitation of primary cells, cell lines and tissues. In: Norwegian Biochemistry Society Contact Meeting, 2013, Lillehammer. Norwegian Biochemistry Society Contact Meeting, 2013. v. 1. p. 52.

2.
DØRUM, S. ; FALLANGES, L. E. ; BODD, M. ; BERGSENG, E. ; STAMNÆS, J. ; de SOUZA, G. A. ; SOLLID, L. M. . Rapid method for identification of gluten T-cell epitopes. In: Norwegian Biochemistry Society Contact Meeting, 2013, Lillehammer. Norwegian Biochemistry Society Contact Meeting, 2013. v. 1. p. 76.

3.
BERGSENG, E. ; DØRUM, S. ; ARNTZEN, M. O. ; de SOUZA, G. A. ; SOLLID, L. M. . The difference in the endogenous peptide repertoire of the similar HLA-DQ2.5 and DQ2.2 molecules. In: Norwegian Biochemistry Society Contact Meeting, 2013, Lillehammer. Norwegian Biochemistry Society Contact Meeting, 2013. v. 1. p. 77.

4.
TUTTUREN, A. ; HOLM, A. ; FLECKENSTEIN, B. ; SOLLID, L. M. ; de SOUZA, G. A. . A sensitive technique for the specific biotinylation and enrichment of citrullinated peptides. In: Norwegian Biochemistry Society Contact Meeting, 2013, Lillehammer. Norwegian Biochemistry Society Contact Meeting, 2013. v. 1. p. 116.

5.
de Souza, G. A.. The Proteomics Core Facility at Oslo University Hospital, Rikshospitalet: years 2010-11. In: 7th Norwegian National Proteomics Meeting, 2012, Tromso. Abstract Book of 7th NPS Meeting, 2012. v. 1. p. 19-19.

6.
RIAZ, T. ; OLSEN, I. ; SOLLID, L. M. ; de SOUZA, G. A. . Label-free quantitative proteomic analysis of IFNgamma-high and IL17-high T-helper cells. In: 7th Norwegian National Proteomics Meeting, 2012, Tromso. Abstract Book of 7th NPS Meeting, 2012. v. 1. p. 49-49.

7.
DØRUM, S. ; BODD, M. ; FALLANGES, L. E. ; STAMNÆS, J. ; de SOUZA, G. A. ; SOLLID, L. M. . Rapid method for identification of gluten T-cell epitopes. In: 14th International Coeliac Disease Symposium, 2011, Oslo, Norway. Abstract book of 14th Inernational CD Symposium, 2011.

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RIAZ, T. ; OLSEN, I. ; QIAO, S. ; SOLLID, L. M. ; de SOUZA, G. A. . Proteomics approach to study T-helper cells. In: 2011 Meeting of the Centre for Immune Regulation, 2011, Sundvolden. 2011 Meeting of the Centre for Immune Regulation, 2011. v. 1. p. 44-44.

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TUTTUREN, A. ; HOLM, A. ; FLECKENSTEIN, B. ; de SOUZA, G. A. ; MOLBERG, O. ; KVIEN, T. ; SOLLID, L. M. . A proteomics approach to identify citrullinated proteins recognized by antibodies in rheumatoid arthritis. In: 2011 Meeting of the Centre for Immune Regulation, 2011, Sundvolden. 2011 Meeting of the Centre for Immune Regulation, 2011. v. 1. p. 49-49.

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Tomazella, Gisele G. ; RISBERG, K. ; MYLVAGANAM, H. ; Thiede, Bernd ; de Souza, G. A. ; Wiker, H. G. . Establishing the proteomic signature of a multi-resistant clinical Escherichia coli isolate using tandem mass spectrometry. In: 6th National Proteomics Meeting from the Norwegian Proteomic Society, 2010, Trndheim. 6th National Proteomics Meeting from the Norwegian Proteomic Society, 2010. v. 1.

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de Souza, G. A.; LEVERSEN, N. A. ; MALEN, H. ; Wiker, H. G. . Bacterial proteins with cleaved or uncleaved SPI-signal peptides. In: 6th National Proteomics Meeting from the Norwegian Proteomic Society, 2010, Trondheim. 6th National Proteomics Meeting from the Norwegian Proteomic Society, 2010. v. 1.

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MALEN, H. ; PATHAK, S. ; SOFTELAND, T. ; de Souza, G. A. ; Wiker, H. G. . Definition of novel cell envelope associated proteins in Triton X114 extracts of Mycobacterium tuberculosis H37Rv. In: 6th National Proteomics Meeting from the Norwegian Proteomic Society, 2010, Trondheim. 6th National Proteomics Meeting from the Norwegian Proteomic Society, 2010. v. 1.

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de Souza, G. A.; ARNTZEN, M. O. ; Wiker, Harald G. . Merging closely related protein databases to improve proteomic characterization of prokaryotic microbes. In: 5th Norwegian Proteomics Society Meeting, 2009, Bergen. 4th NPS Meeting, 2009.

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de SOUZA, G. A.; MALEN, H. ; SOFTELAND, T. ; SAELESMINDE, G. ; PRASAD, S. ; JONASSEN, I. ; WIKER, H. . Validating divergent ORF annotation in M. tuberculosis datasets using a LTQ-Orbitrap. In: Seventh International Conference on the Pathogenesis of Mycobacterial Infections, 2008, Stockholm. Abstract Book, 2008. v. 1. p. 46-46.

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ZANETTI, V. C. ; DREYFUSS, J. L. ; HAOACH, J. ; de SOUZA, G. A. ; GOUVEIA, A. I. ; MANGILI, O. C. ; VEIGA, S. S. ; GREMSKI, W. . Structural and Biochemical Characterization of the Hemostatic Disorders Evoked by Brown Spider Venoms. In: XXIX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2000, Caxambu. Anais do XXIX SBBq, 2000. v. 1.

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RIBEIRO, A. S. ; de SOUZA, G. A. ; VEIGA, S. S. ; BRENTANI, R. R. ; GREMSKI, W. . Production of Research Tools: Monospecific Polyclonal Antibodies Against ECM. In: 5o. Simpósio Brasileiro sobre Matriz Extracelular, 1998, Angra dos Reis. Anais do congresso, 1998. v. 1.

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de SOUZA, G. A.; DREYFUSS, J. L. ; SILVEIRA, R. B. ; VIGGIANO, R. L. L. ; RIBEIRO, A. S. ; MANGILI, O. C. ; VEIGA, S. S. ; GREMSKI, W. . Effects of Loxosceles intermedia (Brown Spider) Venom Proteins on Basement Membrane Degradation. In: V Simpósio da Sociedade Brasileira de Toxinologia, 1998, Angra dos Reis. Anais do congresso, 1998. v. 1.

45.
de SOUZA, G. A.; DREYFUSS, J. L. ; SILVEIRA, R. B. ; VIGGIANO, R. L. L. ; RIBEIRO, A. S. ; MANGILI, O. C. ; VEIGA, S. S. ; GREMSKI, W. . Study of Basement Membrane Degradation by Loxosceles intermedia (Brown Spider) Venom Proteins. In: XXVII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 1998, Caxambu. Anais da XXVII SBBq, 1998. v. 1. p. 153-153.

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RIBEIRO, A. S. ; de SOUZA, G. A. ; DREYFUSS, J. L. ; PEREIRA, A. M. ; VEIGA, S. S. ; GREMSKI, W. . Production of Monospecific Polyclonal Antibodies Against Extracellular Matrix Molecules. In: XXVII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 1998, Caxambu. Anais da XXVII SBBq, 1998. v. 1. p. 159-159.

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de SOUZA, G. A.; SILVEIRA, R. B. ; RIBEIRO, A. S. ; MANGILI, O. C. ; VEIGA, S. S. ; GREMSKI, W. . Proteolytic Effect of Loxosceles intermedia (Brown Spider) Venom Protein on Basement Membrane. In: 5o. Simpósio Brasileiro sobre Matriz Extracelular, 1998, Angra dos Reis. Anais do Congresso, 1998. v. 1.

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de SOUZA, G. A.; VEIGA, S. S. ; GREMSKI, W. . Condroitin Sulfato Proteoglicano e Adesão Celular à Laminina. Modulação do Fenótipo Adesivo pela Dexametasona. In: 6o. Evento de Iniciação Científica - EVINCI, 1998, Curitiba. Anais do 6o. EVINCI, 1998. v. 1.

49.
FEITOSA, L. ; GREMSKI, W. ; VEIGA, S. S. ; ELIAS, M. C. Q. B. ; GRANER, E. ; RIBEIRO, A. S. ; de SOUZA, G. A. ; MANGILI, O. C. ; BRENTANI, R. R. . Identification of Metalloproteinases Involved in Fibronectinolytic and Fibrinogenolytic Activities in Brown Spider Venom. In: XXVI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 1997, Caxambu, MG. Anais da XXVI Reunião Anual, 1997. v. 1. p. 93-93.

Resumos publicados em anais de congressos (artigos)
1.
de SOUZA, G. A.;de Souza, G. A.;de Souza, Gustavo A;de Souza, Gustavo A.;De Souza, Gustavo Antonio;de Souza, Gustavo;de Souza, G.;SOUZA, GUSTAVO A.;DE SOUZA, G.A.;ANTONIO DE SOUZA, GUSTAVO;DE SOUZA, GUSTAVO A.2000de SOUZA, G. A.; DREYFUSS, J. L. ; SILVEIRA, R. B. ; VIGGIANO, R. L. L. ; RIBEIRO, A. S. ; MANGILI, O. C. ; VEIGA, S. S. . Effectt of Loxosceles intermedia (Brown spider) venom on basement membrane degradation. Toxicon, v. 38, p. 537-538, 2000.


Produção técnica
Programas de computador sem registro
1.
de Souza, G. A.; ARNTZEN, M. O. ; Wiker, Harald G. . MSMSpdbb (Multi Strain Mass Spectrometry proteome database builder). 2010.


Demais tipos de produção técnica
1.
de Souza, G. A.. Curso Teórico de Proteômica. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

2.
de Souza, G. A.. Proteômica baseada em espectrometria de massas. 2015. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

3.
de Souza, G. A.. Aplicações de Espectrometria de Massas. 2014. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

4.
de Souza, G. A.. Proteômica e Espectrometria de Massas - Rumo a análise de sistemas biológicos. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
MOREIRA, F. C.; de SOUZA, G. A.; LIMA, J. P. M.. Participação em banca de Vandeclécio Lira da Silva. Análise Evolutiva dos Sítios de Ligação a Fatores de Transcrição Específicos do Genoma Humano. 2016. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

Teses de doutorado
1.
PEDROSA, M. F. F.; MOREIRA, S. M. G.; DE SOUZA, G.A.; PENA, L. J.; MONTEIRO, N. K. V.. Participação em banca de Yamara Arruda Silva de Menezes. Caracterização proteômica e biológica da peçonha de escorpiões do gênero Tytius. 2018. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

2.
DE SOUZA, SANDRO J.; DE SOUZA, GUSTAVO A.; LIMA, L. F. A.; CARRARO, D. M.; BALBINO, V.. Participação em banca de Andre Luis Fonseca Faustino. Bioinformática aplicada à oncologia: estudos na prospecção de alvos terapêuticos, antígenos tumorais e na dinâmica de resistência a drogas. 2018. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

3.
de Souza, G. A.; SANTOS, E. A.; LIMA, D. C.; PFENNING, M. A. C.; MEDEIROS, S. R. B.. Participação em banca de Jonathas Diego Lima Santos. Análise Proteômica de Chromobacterium violaceum submetida a microgravidade simulada. 2017. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

4.
de Souza, Gustavo; Anyta Ryningen; Anne Jonansen. Participação em banca de Gyrid Nygard. Role of Epac1 in hemostasis. 2013. Tese (Doutorado em Molecular Biology) - University of Bergen.

Trabalhos de conclusão de curso de graduação
1.
de Souza, G. A.; COSTA, C. R.; DE SOUZA, SANDRO J.. Participação em banca de Amanda Kelly do Nascimento Mendonça.Abordagem Computacional para Detecção de Aneuploidias Fetais. 2016. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biomedicina) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.




Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
II Brain Institute House Symposium.Proteomic characterization of brain abscess and subdural empyema clinical cases. 2016. (Simpósio).

2.
I Simpósio Norte Nordeste de Bioinformática.Proteômica baseada em espectrometria de massas. 2016. (Simpósio).

3.
SB Meeting.Mass Spectrometry-based Proteomics. 2016. (Encontro).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
de Souza, G. A.; COSTA, C. R. . II Workshop em Bioinformática. 2017. (Outro).

2.
de Souza, G. A.; COSTA, C. R. . I Workshop de Bioinformática. 2016. (Outro).



Orientações



Orientações e supervisões em andamento
Dissertação de mestrado
1.
Tayna Fiuza. Predição de epítopos de MHC no surfaceoma de linhagens bacterianas. Início: 2018. Dissertação (Mestrado em Bioinformatica) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. (Orientador).

Tese de doutorado
1.
Karla Tabosa Machado. Deselvolvimento de abordagens computacionais para caracterização proteômica de biomas bacterianos. Início: 2018. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. (Orientador).

2.
Lucas Marques Cunha. Desenvolvimento de ferramentas para detecção e análise de SAAVs em dados de proteômica. Início: 2016. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte. (Orientador).


Orientações e supervisões concluídas
Dissertação de mestrado
1.
Karla Tabosa Machado. Desenvolvimento de abordagens computacionais para análise de dados de proteoma. 2018. Dissertação (Mestrado em Bioinformatica) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Gustavo Antonio de Souza.

Tese de doutorado
1.
Astrid Tutturen. Enrichment and identification of citrullinated proteins in biological samples. 2014. Tese (Doutorado em Immunology) - University of Oslo, Helse Sor-Øst. Orientador: Gustavo Antonio de Souza.

2.
Suereta Fortuin. The evolution of Mycobacterium tuberculosis proteome in response to the development of drug resistance. 2013. Tese (Doutorado em Biologia Molecular) - Stellenbosch University, . Coorientador: Gustavo Antonio de Souza.



Inovação



Projetos de pesquisa



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