Mário Tyago Murakami

Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 1D

Endereço para acessar este CV: http://lattes.cnpq.br/2119882299651306
Última atualização do currículo em 11/05/2013

Mario T. Murakami é Pesquisador (desde 2008) e Coordenador de instalações científicas de grande porte dedicadas à Cristalografia de Macromoléculas (MX2 & RoboLab) do LNBio/LNLS. Graduado em Engenharia (UNESP) e Doutor em Biofísica Molecular (IBILCE/UNESP) com período sanduíche na University of Hamburg (UH, Alemanha) sob a orientação dos Profs. Raghuvir K. Arni e Christian Betzel. Realizou Pós-doutorados nas áreas de Cristalografia de Macromoléculas (UNESP, 2007) e RMN biomolecular (Rutgers University, 2012) sob a supervisão de Charalampos Kalodimos. Tem experiência nas áreas de Biofísica e Bioquímica de Proteínas com ênfase em Cristalografia, RMN, bioinformática estrutural, SAXS, métodos de DNA recombinante e sistemas de expressão heteróloga. Atua como assessor ad hoc da FAPESP, CNPq e de revistas científicas como Biophysical Chemistry, Applied Microbiology & Biotechnology, Comparative Biochemistry & Physiology e Biochimie. Atualmente o grupo de Biologia Mecanística e Estrutural é formado por estudantes dos programas de pós-graduação em Biologia Funcional e Molecular, e Genética da UNICAMP, e nos últimos 2 anos publicou mais de 30 manuscritos científicos em revistas internacionais indexadas ISI. Seus interesses científicos estão focados no entendimento ao nível molecular de processos biológicos como tráfego intracelular mediado por miosinas não convencionais, doenças parasitárias humanas (Leishmaniose e Doença de Chagas) e enzimas com aplicações biotecnológicas. (Texto informado pelo autor)

Identificação

Nome

Mário Tyago Murakami

Nome em citações bibliográficas

Murakami, M. T.;Tyago Murakami, Mario;Murakami, Mario Tyago;Murakami, Mario T;Murakami, Mário T.;Murakami, Mário Murakami, M.T.;MURAKAMI, MARIO T.

Endereço

Endereço Profissional

Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Laboratório Nacional de Biociências.
Rua Giuseppe Máximo Scolfaro, 10000. LNBio - Sala 78
Pólo II de Alta Tecnologia de
13083-970 - Campinas, SP - Brasil - Caixa-postal: 6192
Telefone: (19) 35121106
Fax: (19) 35121004
URL da Homepage: www.lnbio.org.br

Formação acadêmica/titulação

2013

Livre-docência.
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Título: Estratégias moleculares para catálise, regulação e estabilidade de hidrolases glicosídicas com potenciais aplicações biotecnológicas, Ano de obtenção: 2013.
Palavras-chave: Biologia Estrutural; Enzimas; Mecanismos de Ação; Engenharia de Proteínas; Biotecnologia.
Setores de atividade: Educação.

2012 - 2012

Pós-Doutorado.
Rutgers University.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular / Especialidade: NMR.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular.

2006 - 2007

Pós-Doutorado.
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.

2004 - 2006

Doutorado em Biofísica Molecular.
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
com período sanduíche em Universität Hamburg (Orientador: Prof. Christian Betzel).
Título: Estratégias de inibição, mecanismos moleculares e interações intermoleculares em complexos macromoleculares, Ano de obtenção: 2006.
Orientador:

Raghuvir Krishnaswamy Arni.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.

1999 - 2003

Graduação em Engenharia.
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
Título: Estudos estruturais de uma lectina tipo C com potente atividade sobre a agregração plaquetária.
Orientador: Prof. Dr, Raghuvir Krishnaswamy Arni.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.

Formação Complementar

2010 - 2010

Faseamento Experimental de Macromoleculas. (Carga horária: 48h).
Laboratório Nacional de Biociências.

2009 - 2009

Curso de Cristalização de Macromoléculas. (Carga horária: 20h).
Laboratório Nacional de Luz Síncrotron.

2007 - 2007

RapiData. (Carga horária: 80h).
Brookhaven National Laboratory.

2006 - 2006

Automação em cristalização de proteínas. (Carga horária: 45h).
Universität Hamburg.

2005 - 2005

expressao de proteinas. (Carga horária: 120h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2004 - 2004

Determinacao de estruturas. (Carga horária: 120h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2003 - 2003

Caracterização funcional de toxinas. (Carga horária: 240h).
Instituto Butantan.

2002 - 2002

Expressao genica. (Carga horária: 360h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2002 - 2002

Espectrofotometria e Calorimetria. (Carga horária: 480h).
Laboratório Nacional de Luz Síncrotron.

2001 - 2001

Sequenciamento de Edman. (Carga horária: 120h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

Atuação Profissional

(FAPESP) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo.

Vínculo institucional

2012 - Atual

Vínculo: Membro de comitê assessor, Enquadramento Funcional:

Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.

Vínculo institucional

2009 - Atual

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Orientação e Docência em Pós-graduaçao, Carga horária: 5

Atividades

08/2011 - 12/2011

Ensino, BIOCIÊNCIAS E TECNOLOGIA DE PRODUTOS BIOATIVOS, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Técnicas Experimentais e Computacionais Aplicadas ao Estudo de Proteínas

03/2009 - 07/2009

Ensino, Biologia Funcional e Molecular, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Cristalografia de Macromoléculas

03/2009 - 07/2009

Ensino, Genética e Biologia Molecular, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Cristalografia de Macromoléculas

Laboratório Nacional de Luz Síncrotron, LNLS, Brasil.

Vínculo institucional

2008 - Atual

Vínculo: Celetista formal, Enquadramento Funcional: Pesquisador, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

08/2008 - Atual

Direção e administração, Centro de Biologia Molecular estrutural, .

Cargo ou função
Coordenador da linha de luz MX2 e ROBOLAB.

09/2010 - 09/2010

Treinamentos ministrados , Laboratório Nacional de Biociências, .

Treinamentos ministrados
Determinação de Estrutura de Macromoléculas por faseamento experimental utilizando espalhamento anômalo

05/2009 - 05/2009

Treinamentos ministrados , Laboratório Nacional de Biociências, .

Treinamentos ministrados
Cristalização de Macromoléculas

(ABTLUS) ABTLUS.

Vínculo institucional

2008 - Atual

Vínculo: Membro de comitê assessor, Enquadramento Funcional:

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

Vínculo institucional

2007 - 2008

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor - MS3, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

08/2007 - 12/2007

Ensino, Ciências Biológicas - Turma 1, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Biofísica

08/2007 - 12/2007

Ensino, Ciências Biológicas - Turma 2, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Biofísica

07/2007 - 11/2007

Ensino, Microbiologia, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Estrutura e função de proteínas

03/2007 - 08/2007

Ensino, Biofísica Molecular, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Estrutura e função de proteínas

02/2007 - 02/2007

Ensino, Biofisica Molecular, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Curso Tópicos em Bioquímica e Biofísica

03/2006 - 07/2006

Ensino, Química Ambiental, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Estágio Docência em Laboratório de Física II

Projetos de pesquisa

2010 - Atual

Mecanismos moleculares e sinalização de miosinas não-convencionais

Descrição: As miosinas não-convencionais apresentam grande importância em diversos processos fisiológicos da célula como transporte de organelas, RNA e vesículas; fluxo citoplasmático; formato celular; desenvolvimento embrionário; manutenção da arquitetura celular; tradução de sinais e morfogênese. De acordo com sua estrutura e especificidade interfere em uma série de mecanismos celulares e podem resultar em diversas anomalias em mamíferos, como a Síndrome de Griscelli, desordens na pigmentação, e em insetos, como defeitos na visão, citogênese, oôgenese, entre outros. Tais proteínas transportadoras usufruem de um sofisticado mecanismo de movimentação mecanoquímico e sua regulação e especificidade se baseiam em modificações conformacionais e acoplamento de co-transportadores protéicos. Dentro desta linha de pesquisa, visamos contribuir na elucidação de estruturas tridimensionais principalmente da região C-terminal globular de miosinas não-convencionais pertencentes a classe V (amplamente caracterizadas em mamíferos); a classe VI (primeiramente identificada em Drosophila) e as classes pertecentes as plantas (VIII, XI e XIII), e deste modo gerar informações imprescindíveis para elucidação dos mecanismos moleculares ainda desconhecidos do funcionamento, especificidade e regulação dessa superfamília de proteínas..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.

2010 - Atual

Secretoma e quinoma estrutural de tripanosomatídeos

Descrição: Tripanossomatídeos são protozoários flagelados responsáveis por uma variedade de doenças humanas incluindo doença de Chagas (causada pelo Trypanosoma cruzi), leishmaniose (causada por diferentes espécies do gênero Leishmania) e tripanossomíase Africana, comumente conhecida como doença do sono (causada pelo Trypanosoma brucei). Em particular, a leishmaniose e a doença de Chagas são doenças endêmicas na América Latina e estima-se que, desde o México até o sul da Argentina, exista cerca de 20 milhões de pessoas infectadas. Todos estes parasitas são transmitidos por insetos e invadem uma diversidade de tecidos ou tipos celulares em hospedeiros mamíferos possuindo um ciclo de vida digenético. A sobrevivência destes organismos dentro do micro-ambiente do hospedeiro requer a liberação e transporte regulado de inúmeras glicoproteínas e glicolípidios além de transportadores membranais, enzimas e receptores. A compreensão da biologia destes parasitas como diferenciação celular, ciclo de vida, fatores de virulência, invasão, sobrevivência no hospedeiro, redes metabólicas e interação parasita-hospedeiro é a chave para o desenvolvimento de novas terapias contra a doença de Chagas e leishmaniose, que onera e ainda representam um problema de saúde pública nacional. Nestas possíveis linhas de atuação, estaremos agindo na elucidação dos mecanismos moleculares envolvidos nas redes metabólicas do parasita e nas interações parasita-hospedeiro através de uma abordagem multi-disciplinar visando prover informações essenciais para a busca e desenho de novas drogas contra estes importantes patógenos humanos..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.

2009 - Atual

Especificidade e estabilidade de enzimas extremofílicas aplicadas a degradação de biomassa lignocelulósica

Descrição: Neste projeto visamos entender as bases moleculares da especificidade e a estabilidade de hidrolases glicosídicas e outras proteínas acessórios que participam da redução da biomassa lignocelulósica a açúcares fertementáveis..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Mário Tyago Murakami - Integrante / Roberto Ruller - Integrante / Richard John Ward - Integrante / Fabio Marcio Squina - Integrante / Rolf Alexander Prade - Integrante / Dominic Wong - Integrante.

2000 - 2009

Estrutura e Função de Toxinas Animais

Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Mário Tyago Murakami - Integrante / Raghuvir Krishnaswamy Arni - Integrante / Richard John Ward - Integrante / Nicolai Genov - Integrante / Christian Betzel - Integrante.

Revisor de periódico

2009 - Atual

Periódico: Comparative Biochemistry and Physiology (Online)

2009 - Atual

Periódico: Biophysical Chemistry (Print)

2010 - Atual

Periódico: Acta Crystallographica. Section F

2010 - Atual

Periódico: Toxicon (Oxford)

2011 - Atual

Periódico: The Protein Journal

2011 - Atual

Periódico: Protein and Peptide Letters

2011 - Atual

Periódico: Applied Microbiology and Biotechnology

2012 - Atual

Periódico: Biochimie (Paris. Print)

2013 - Atual

Periódico: Journal of Molecular Catalysis. B, Enzymatic (Print)

2013 - Atual

Periódico: Plant Physiology and Biochemistry (Paris)

2013 - Atual

Periódico: Plos One

Revisor de projeto de fomento

2009 - Atual

Projeto: (CNPq) Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico

2009 - Atual

Projeto: (FAPESP) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular/Especialidade: Cristalografia de Macromoléculas.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica.

Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Prêmios e títulos

2011

Melhor Poster - Unraveling the Molecular Basis of the Intriguing Structure-Function-Stability Relationships in Thermostable GH5 Cellulases (J-44)., Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular.

2006

1º Colocado no X Prêmio Jovem Talento em Ciências da Vida, Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular e General Eletric Health Care.

2005

Six Top choices, American Crystallographic Association.

1997

Posição de destaque nas Olimpiadas regional de matematica, UNESP - Campus Bauru.

Produções

Produção bibliográfica

Citações

Web of Science

Total de trabalhos:71

Total de citações:501

Fator H:13

Murakami, M. T.; Murakami, Mario Data: 11/04/2013

SCOPUS

Artigos completos publicados em periódicos

Ordenar por

21Ullah, Anwar2013Ullah, Anwar ; ; Zanphorlin, L.M. ; Mariutti, R.B. ; Santana, V. S. ; Murakami, Mário ; . Crystal structure of Jararacussin-I: The highly negatively charged catalytic interface contributes to macromolecular selectivity in snake venom thrombin-like enzymes. Protein Science (Print), v. 22, p. 128-132, 2013.

Morais, A.B.M.2013Morais, A.B.M. ; ; Murakami, M.T. . Cloning, expression, purification, crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of the mitochondrial tryparedoxin peroxidase from. Acta Crystallographica. Section F, v. 69, p. 408-411, 2013.

Cota, Junio2013 ; OLIVEIRA, LEANDRO C. ; ; CITADINI, ANA P. ; HOFFMAM, ZAIRA B. ; ALVAREZ, THABATA M. ; CODIMA, CARLA A. ; LEITE, VITOR B.P. ; PASTORE, GLAUCIA ; OLIVEIRA-NETO, MARIO DE ; MURAKAMI, MARIO T. ; ; SQUINA, FABIO M. . Assembling a xylanase-lichenase chimera through all-atom molecular dynamics simulations. Biochimica et Biophysica Acta. Proteins and Proteomics, v. x, p. x, 2013.

1Santos, Camila R.2012

Santos, Camila ; Paiva, Joice ; ; Neves, Jorge ; Navarro, Rodrigo ; ; Akao, Patrícia ; ; Meza, Andréia ; Smetana, Juliana ; Nogueira, Maria ; Polikarpov, Igor ; Xavier Neto, José ; ; Ward, Richard ; ; ; Murakami, Mário . Dissecting structure function stability relationships of a thermostable GH5-CBM3 cellulase from 168. Biochemical Journal (London. 1984), v. 441, p. 95-104, 2012.

8Souza, Tatiana A.C.B.2012 ; ; Ruiz, Diego M. ; ; ; Tersario, Ivarne L.S. ; ; De Castro, Rosana E. ; ; Murakami, Mário T. . Correlation between catalysis and tertiary structure arrangement in an archaeal halophilic subtilase. Biochimie (Paris. Print), v. 94, p. 798-805, 2012.

19Damásio, André R.L.2012 ; Ribeiro, Liliane F.C. ; ; ; ; ; Crivellari, Augusto C. ; ; ; Murakami, M. T. ; ; ; Polizeli MTM . Functional characterization and oligomerization of a recombinant xyloglucan-specific endo- -1,4-glucanase (GH12) from Aspergillus niveus. Biochimica et Biophysica Acta. Proteins and Proteomics, v. 1824, p. 461-467, 2012.

68Ullah, Anwar2012Ullah, Anwar ; ; Murakami, Mário T. ; Betzel, Christian ; . Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of an -amino-acid oxidase from venom. Acta Crystallographica. Section F, v. 68, p. 211-213, 2012.

3Santos, Camila Ramos dos2012 ; ; Meza, Andreia Navarro ; ; ; ; ; ; Murakami, Mario Tyago . Molecular insights into substrate specificity and thermal stability of a bacterial GH5-CBM27 endo-1,4- -d-mannanase. Journal of Structural Biology (Print), v. 177, p. 469-476, 2012.

28Ullah, A.2012 ; ; ; BETZEL, C. ; Murakami, M.T. ; . Structural insights into selectivity and cofactor binding in snake venom l-amino acid oxidases. Biochemical and Biophysical Research Communications (Print), v. 421, p. 124-128, 2012.

10.

13Cintra, A.C.O.2012Cintra, A.C.O. ; ; ; Franco, J.J. ; Caetano, R.C. ; Murakami, M.T. ; . Batroxase, a new metalloproteinase from B. atrox snake venom with strong fibrinolytic activity. Toxicon (Oxford), v. 60, p. 70-82, 2012.

11.

29Segato, Fernando2012 ; ; Goncalves, Thiago A ; Murakami, Mario T ; ; Polizeli, Maria L.T.M. ; Mort, Andrew ; . Two structurally discrete GH7-cellobiohydrolases compete for the same cellulosic substrate fiber. BIOTECHNOL BIOFUELS, v. 5, p. 21, 2012.

12.

15Ullah, A.2012 ; ; BETZEL, C. ; Murakami, M.T. ; . Crystallographic portrayal of different conformational states of a Lys49 phospholipase A2 homologue: Insights into structural determinants for myotoxicity and dimeric configuration. International Journal of Biological Macromolecules, v. 51, p. 209-214, 2012.

13.

20Gonçalves, T.A.2012Gonçalves, T.A. ; Damásio, A.R.L. ; ; Alvarez, T.M. ; Bragatto, J. ; Brenelli, L.B. ; Citadini, A.P.S. ; Murakami, M.T. ; ; Paes Leme, A.F. ; ; . Functional characterization and synergic action of fungal xylanase and arabinofuranosidase for production of xylooligosaccharides. Bioresource Technology, v. 119, p. 293-299, 2012.

14.

2Santos, C. R.2012 ; Polo, C. C. ; Correa, J.M. ; Simao, R.G.G. ; Seixas, F.A.V. ; Murakami, M. T. . The accessory domain changes the accessibility and molecular topography of the catalytic interface in monomeric GH39 β-xylosidases. Acta Crystallographica. Section D, Biological Crystallography, v. 68, p. 1339-1345, 2012.

15.

4Giuseppe, P. O.2012 ; Martins, N. H. ; Navarro, A. M. ; ; Pereira, H. M. ; Murakami, M. T. . Insights into phosphate cooperativity and influence of substrate modifications on binding and catalysis of hexameric purine nucleoside phosphorylases. Plos One, v. 7, p. e44282, 2012.

16.

56Ribeiro, D. A.2012 ; ; ; Bragato, J. ; Pereira, B. M. P. ; Jackson, G. ; Pimenta, M. T. B. ; Murakami, Mario Tyago ; ; Dillon, A. J. P. ; Pradella, J. G. C. ; Paes Leme, A.F. ; . The Penicillium echinulatum Secretome on Sugar Cane Bagasse. Plos One, v. 7, p. e50571, 2012.

17.

ULLAH, A.2012ULLAH, A. ; Murakami, M. T. ; SOUZA, T. A. C. B. ; MASOOD, R. ; ARNI, R. K. . Purification, crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of a class P-III metalloproteinase (BmMP-III) from the venom of. Acta Crystallographica. Section F, v. 68, p. 1222-1225, 2012.

18.

5Santos, C. R.2011

; ; Tonoli, C. C. C. ; Betzel, C. ; Takata, H. ; Kuriki, T. ; Kanai, T. ; Imanaka, T. ; ; Murakami, M. T. . Structural Basis for Branching-Enzyme Activity of Glycoside Hydrolase Family 57: Structure and Stability Studies of a Novel Branching Enzyme from the Hyperthermophilic Archaeon Thermococcus kodakaraensis KOD1. Proteins (Print), v. 79, p. 547-557, 2011.

19.

49Santos, C. R.2011 ; ; Navarro, A. M. ; ; ; ; Mort, A. ; ; Murakami, M. T. . Functional and biophysical characterization of a hyperthermostable GH51 alpha-L-arabinofuranosidase from Thermotoga petrophila RKU-1. Biotechnology Letters, v. 33, p. 131-137, 2011.

20.

31Ullah, A.2011 ; ; Murakami, M. T. ; Trevisan-Silva, D. ; ; ; ; Silveira, L. B. ; Sennf-Ribeiro, A. ; ; ; . Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of a class II phospholipase D from Loxosceles intermedia venom. Acta Crystallographica. Section F, v. 67, p. 234-236, 2011.

21.

35Santos-Filho, N. A.2011 ; ; ; ; ; Estevão-Costa, M. I. ; ; ; Murakami, M. T. ; . Molecular cloning and biochemical characterization of a myotoxin inhibitor from Bothrops alternatus snake plasma. Biochimie (Paris. Print), v. 93, p. 583-592, 2011.

22.

41Teixeira, S.S.2011Teixeira, S.S. ; Silveira, L.B. ; da Silva, F.M.N. ; ; ; ; Fuly, A.L. ; ; Murakami, M. T. ; ; ; . Molecular Characterization of an Acidic Phospholipase A2 from Bothrops pirajai Snake Venom: Synthetic C-terminal-Peptide Identifies its Anti- Platelet Region. Archives of Toxicology, v. 85, p. 1219-1233, 2011.

23.

30Furtado, G.P.2011 ; ; ; Tonoli, C. C. C. ; de Souza, A.R. ; Oliveira, R.R. ; Murakami, M. T. ; . Biochemical and Structural Characterization of a β-1,3-1,4-glucanase from Bacillus subtilis 168. Process Biochemistry (1991), v. 46, p. 1202-1206, 2011.

24.

40Cota-Silva, J.2011Cota-Silva, J. ; ; ; ; ; Oliveira, R.R. ; ; ; ; Murakami, M. T. ; . Mode of operation and low-resolution structure of a multi-domain and hyperthermophilic endo-beta-1,3-glucanase from Thermotoga petrophila. Biochemical and Biophysical Research Communications (Print), v. 406, p. 590-594, 2011.

25.

9Souza, T.A.C.B.2011 ; ; Tonoli, C. C. C. ; ; ; ; ; Murakami, M. T. . Molecular adaptability of nucleoside diphosphate kinase b from trypanosomatid parasites: Stability, oligomerization and structural determinants of nucleotide binding. Molecular Biosystems (Print), v. 7, p. 2189-2195, 2011.

26.

67Martins, N. H.2011Martins, N. H. ; ; ; ; Murakami, M. T. . Molecular cloning, overexpression, purification, crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of a purine nucleoside phosphorylase from Bacillus subtilis strain 168. Acta Crystallographica. Section F, v. 67, p. 618-622, 2011.

27.

38Ossa, D.M.H.2011Ossa, D.M.H. ; Oliveira, R.R. ; Murakami, M. T. ; ; ; ; Garcia, O. . Expression, purification and spectroscopic analysis of an HdrC: an iron-sulfur cluster-containing protein from Acidithiobacillus ferrooxidans. Process Biochemistry (1991), v. 46, p. 1335-1341, 2011.

28.

46Augusto Vicente Seixas, Flavio2011 ; Ribeiro da Silva, Milene ; Murakami, M. T. ; Tosqui, Priscilla ; Francisco Colombo, Marcio . The Water Effect on the Kinetics of the Bovine Liver Catalase. Protein and Peptide Letters, v. 18, p. 879-885, 2011.

29.

6Guimaraes, B.G.2011Guimaraes, B.G. ; Barbosa, R.L. ; Soprano, A.S. ; ; ; Tonoli, C. C. C. ; ; Murakami, M. T. ; . Plant pathogenic bacteria utilizes BigR, a novel winged-helix redox switch, to control hydrogen sulfide detoxification under hypoxia.. The Journal of Biological Chemistry (Print), v. 286, p. 26148-26157, 2011.

30.

42Giuseppe, P. O.2011 ; ; ; ; ; ; Ribeiro, A.S. ; ; ; Murakami, M. T. ; . Structure of a novel class II phospholipase D: Catalytic cleft is modified by a disulphide bridge. Biochemical and Biophysical Research Communications (Print), v. 409, p. 622-627, 2011.

31.

43Souza, T.A.C.B.2011 ; ; de Souza, A.R. ; ; ; ; ; Murakami, M. T. . Structure of a novel thermostable GH51 α-L-arabinofuranosidase from thermotoga petrophila RKU-1. Protein Science (Print), v. 20, p. 1632-1637, 2011.

32.

44Ribeiro, Daniela A2011Ribeiro, Daniela A ; ; ; Ferraz, Lúcio FC ; Murakami, Mario T ; . The small heat shock proteins from Acidithiobacillus ferrooxidans: gene expression, phylogenetic analysis and structural modeling. BMC Microbiology (Online), v. 11, p. 259, 2011.

33.

32Kang, TS2011Kang, TS ; Georgieva D ; Genov N ; Murakami, M. T. ; Sinha M ; Kumar RP ; Kaur P ; Kumar, S. ; Dey, S. ; Sharma, S. ; Vrielink, A. ; BETZEL, C. ; Takeda, S. ; ; Singh, T.P. ; Kini, M. R. . Enzymatic toxins from snake venom: structural characterization and mechanism of catalysis.. The FEBS Journal (Print), v. 278, p. 4544-4576, 2011.

34.

7Ribeiro, L. F.2011 ; ; ; ; ; Nogueira, S. C. P. ; Betini, J. A. ; Polizeli, M. d. L. T. M. ; Murakami, M. T. ; . Engineering Bifunctional Laccase-Xylanase Chimeras for Improved Catalytic Performance. The Journal of Biological Chemistry (Print), v. 286, p. 43026-43038, 2011.

35.

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17Murakami, M. T.;Tyago Murakami, Mario;Murakami, Mario Tyago;Murakami, Mario T;Murakami, Mário T.;Murakami, Mário Murakami, M.T.;MURAKAMI, MARIO T.2010Murakami, M. T. ; ; Neves, J. L. ; ; ; ; ; . The repeat domain of the type III effector protein PthA shows a TPR-like structure and undergoes large conformational rearrangements upon DNA interaction. Proteins (Print), v. 78, p. 3386-3395, 2010.

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36Santos, C. R.2010 ; Navarro, A. M. ; ; Cota-Silva, J. ; ; Geisel, G. M. ; Verli, H. ; ; ; Murakami, M. T. . Thermal-induced conformational changes in the product release area drive the enzymatic activity of xylanases 10B: Crystal structure, conformational stability and functional characterization of the xylanase 10B from Thermotoga petrophila RKU-1. Biochemical and Biophysical Research Communications (Print), v. 403, p. 214-219, 2010.

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57de Oliveira, D.G.O.2009 ; Murakami, M. T. ; ; Franco, J.J. ; ; . Functional and Structural Analyses of Two Fibrinogen-Activating Enzymes Isolated from the Venoms of Crotalus durissus terrificus and Crotalus durissus colillineatus. Acta Biochimica et Biophysica Sinica, v. 41, p. 21-29, 2009.

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51Santi-Ferrara, G.L.2009Santi-Ferrara, G.L. ; ; junqueira-de-azevedo, I.D. ; ; ; Manzoni-de-Almeida, D. ; Murakami, M. T. ; ; van den Berg, C.W. ; Ho, P.L. ; . SMase II, a new sphingomyelinase D from Loxosceles laeta venom gland: Molecular cloning, expression, function and structural analysis. Toxicon (Oxford), v. 53, p. 743-753, 2009.

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70Squina, F.M.2009 ; ; Wang, H. ; Murakami, M. T. . Expression, purification, crystallization and preliminary crystallographic analysis of an endo-1,5-alpha-L-arabinanase from hyperthermophilic Thermotoga petrphila. Acta Crystallographica. Section F, v. 95, p. 902-905, 2009.

44.

52Murakami, M. T.;Tyago Murakami, Mario;Murakami, Mario Tyago;Murakami, Mario T;Murakami, Mário T.;Murakami, Mário Murakami, M.T.;MURAKAMI, MARIO T.2009Murakami, M. T. ; Kini, M. R. ; . Structure of bucain, a three-fingered toxin from the venom of the Malayan Krait (Bungarus candidus). Protein and Peptide Letters, v. 16, p. 1473-1477, 2009.

45.

69Tonoli, C. C. C.2009Tonoli, C. C. C. ; ; ; ; ; Murakami, M. T. . Production, purification, crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of the nucleoside diphosphate kinase b from Leishmania major. Acta Crystallographica. Section F, v. 65, p. 1116-1119, 2009.

46.

39Murakami, M. T.;Tyago Murakami, Mario;Murakami, Mario Tyago;Murakami, Mario T;Murakami, Mário T.;Murakami, Mário Murakami, M.T.;MURAKAMI, MARIO T.2008Murakami, M. T. ; Kuch, U. ; Betzel, C. ; Mebs, D. ; . Crystal structure of a novel myotoxic Arg49 phospholipase A2 homolog (zhaoermiatoxin) from Zhaoermia mangshanensis snake venom: insights into Arg49 coordination and the role of Lys122 in the polarization of the C-terminus.. Toxicon (Oxford), v. 51, p. 723-735, 2008.

47.

53Murakami, M. T.;Tyago Murakami, Mario;Murakami, Mario Tyago;Murakami, Mario T;Murakami, Mário T.;Murakami, Mário Murakami, M.T.;MURAKAMI, MARIO T.2008Murakami, M. T. ; ; ; ; Viçoti, M. M. ; ; ; . Biochemical and structural investigations of Bothropstoxin-II, a myotoxic Asp49 phospholipase A2 from Bothrops jararacussu venom. Protein and Peptide Letters, v. 15, p. 1002-1008, 2008.

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50Moro, L.P.2008 ; Murakami, M. T. ; ; ; ; ; ; . Purification and preliminary characterization of miliin, a new protease isolated from the latex of Euphorbia milii. Protein and Peptide Letters, v. 15, p. 724-730, 2008.

49.

18Murakami, M. T.;Tyago Murakami, Mario;Murakami, Mario Tyago;Murakami, Mario T;Murakami, Mário T.;Murakami, Mário Murakami, M.T.;MURAKAMI, MARIO T.2007

Murakami, M. T. ; Rios-Steiner J ; Weaver, S. ; Tulinsky, A. ; Geiger, J. ; . Intermolecular Interactions and Characterization of the Novel Factor Xa Exosite Involved in Macromolecular Recognition and Inhibition: Crystal Structure of Human Gla-domainless Factor Xa Complexed with the Anticoagulant Protein NAPc2 from the Hematophagous Nematode Ancylostoma caninum. Journal of Molecular Biology, v. 366, p. 602-610, 2007.

50.

34Murakami, M. T.;Tyago Murakami, Mario;Murakami, Mario Tyago;Murakami, Mario T;Murakami, Mário T.;Murakami, Mário Murakami, M.T.;MURAKAMI, MARIO T.2007Murakami, M. T. ; Viçoti, M. M. ; ; ; ; ; Tomaz, P. A. ; ; . Interfacial surface charge and free accessibility to the PLA(2)-active site-like region are essential requirements for the activity of Lys49 PLA(2) homologues. Toxicon (Oxford), v. 49, p. 378-387, 2007.

51.

14Rios-Steiner J2007Rios-Steiner J ; Murakami, M. T. ; Tulinsky, A. ; . Active and Exo-site Inhibition of Human Factor Xa:Structure of des-Gla Factor Xa Inhibited byNAP5, a Potent Nematode AnticoagulantProtein from Ancylostoma caninum. Journal of Molecular Biology, v. 371, p. 774-786, 2007.

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63Santos, K. F.2007Santos, K. F. ; Murakami, M. T. ; ; Toyama, M. H. ; ; Forrer, P. ; Brandão Neto, J. R. ; ; . Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of the heterodimeric crotoxin complex and the isolated subunits crotapotin and phospholipase A2. Acta Crystallographica. Section F, v. 63, p. 287-290, 2007.

53.

64Murakami, M. T.;Tyago Murakami, Mario;Murakami, Mario Tyago;Murakami, Mario T;Murakami, Mário T.;Murakami, Mário Murakami, M.T.;MURAKAMI, MARIO T.2007Murakami, M. T. ; Kuch, U. ; Mebs, D. ; . Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of a novelArg49 phospholipase A2 homologue fromZhaoermiamangshanensis venom. Acta Crystallographica. Section F, v. 63, p. 605-607, 2007.

54.

61Betzel, C.2007Betzel, C. ; Georgieva, D. ; Murakami, M. T. ; ; Genov, N. . Phospholipase A2, as a biomarker of pathophysiological processes. Current Topics in Biochemical Research, v. 8, p. 87-93, 2007.

55.

66Murakami, M. T.;Tyago Murakami, Mario;Murakami, Mario Tyago;Murakami, Mario T;Murakami, Mário T.;Murakami, Mário Murakami, M.T.;MURAKAMI, MARIO T.2006Murakami, M. T. ; Cabral, C. ; Angulo, Y. ; Lomonte, B. ; . Structure of myotoxin-II, a catalytically inactive Lys49 phospholipase A2 homologue from Atropoides nummifer venom. Acta Crystallographica. Section F, v. 62, p. 423-426, 2006.

56.

33Murakami, M. T.;Tyago Murakami, Mario;Murakami, Mario Tyago;Murakami, Mario T;Murakami, Mário T.;Murakami, Mário Murakami, M.T.;MURAKAMI, MARIO T.2006Murakami, M. T. ; ; ; Gabdoulkhakov, A. ; Betzel, C. ; ; . Structural insights into the catalytic mechanism of sphingomyelinases D and evolutionary relationship to glycerophosphodiester phosphodiesterases. Biochemical and Biophysical Research Communications (Print), v. 342, p. 323-329, 2006.

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58.

11Murakami, M. T.;Tyago Murakami, Mario;Murakami, Mario Tyago;Murakami, Mario T;Murakami, Mário T.;Murakami, Mário Murakami, M.T.;MURAKAMI, MARIO T.2005

Murakami, M. T. ; ; ; . Structural Basis for Metal-Ion Coordination and the Catalytic Mechanism of Sphingomyelinases D. The Journal of Biological Chemistry (Print), United States, v. 280, n.14, p. 13658-13664, 2005.

59.

59Murakami, M. T.;Tyago Murakami, Mario;Murakami, Mario Tyago;Murakami, Mario T;Murakami, Mário T.;Murakami, Mário Murakami, M.T.;MURAKAMI, MARIO T.2005Murakami, M. T. ; ; ; . Crystallization and preliminary X-ray crystallographic studies of the mesophilic xylanase A from Bacillus subtilis 1A1. Acta Crystallographica. Section D, Biological Crystallography, v. 61, p. 219-220, 2005.

60.

60Murakami, M. T.;Tyago Murakami, Mario;Murakami, Mario Tyago;Murakami, Mario T;Murakami, Mário T.;Murakami, Mário Murakami, M.T.;MURAKAMI, MARIO T.2005Murakami, M. T. ; . Crystallization and preliminary X-ray crystallographic studies of protac, a commercial protein C activator isolated from Agkistrodon contortrix contortrix venom. Biochimica et Biophysica Acta. Protein Structure and Molecular Enzymology (Cessou em 2002. Cont. ISSN 1570-9639 Biochimica et Biophysica Acta. Protein, Orlando, v. 1752, p. 202-204, 2005.

61.

12Murakami, M. T.;Tyago Murakami, Mario;Murakami, Mario Tyago;Murakami, Mario T;Murakami, Mário T.;Murakami, Mário Murakami, M.T.;MURAKAMI, MARIO T.2005

Murakami, M. T. ; ; ; Martinez, A. B. ; ; Tomaz, P. A. ; Lomonte, B. ; Gutierrez, J. M. ; . Inhibition of myotoxic activity of Bothrops asper myotoxin II by the anti-trypanosomal drug suramin. Journal of Molecular Biology, v. 350, p. 416-426, 2005.

62.

16Murakami, M. T.;Tyago Murakami, Mario;Murakami, Mario Tyago;Murakami, Mario T;Murakami, Mário T.;Murakami, Mário Murakami, M.T.;MURAKAMI, MARIO T.2005Murakami, M. T. ; Gabdoulkhakov, A. ; Genov, N. ; Cintra, A. C. O. ; Betzel, C. ; . Insights to metal ion binding in phospholipases A2: ultra high-resolution crystal structures of an acidic phospholipase A2 in the Ca2+ free and bound states. Biochimie (Paris. Print), v. 88, p. 543-549, 2005.

63.

26Murakami, M. T.;Tyago Murakami, Mario;Murakami, Mario Tyago;Murakami, Mario T;Murakami, Mário T.;Murakami, Mário Murakami, M.T.;MURAKAMI, MARIO T.2005Murakami, M. T. ; ; ; ; ; . Correlation of temperature induced conformation change with optimum catalytic activity in the thermophilic G11 xylanase A from Bacillus subtilis 1A1. FEBS Letters (Print), v. 579, p. 6505-6510, 2005.

64.

10Murakami, M. T.;Tyago Murakami, Mario;Murakami, Mario Tyago;Murakami, Mario T;Murakami, Mário T.;Murakami, Mário Murakami, M.T.;MURAKAMI, MARIO T.2005Murakami, M. T. ; . Thrombomodulin-independent activation of protein C and specificity of hemostatically active snake venom serine proteinases: Crystal structures of native and inhibited Agkistrodon contortrix contortrix protein C activator. The Journal of Biological Chemistry (Print), v. 280, p. 39309-39315, 2005.

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55Zela, S. P.2004 ; ; Murakami, M. T. ; ; ; . Crystallization and preliminary crystallographic analysis of SMase I, a sphingomyelinase from Loxosceles laeta spider venom. Acta Crystallographica. Section D, Biological Crystallography, v. D60, p. 1112-1114, 2004.

66.

62Murakami, M. T.;Tyago Murakami, Mario;Murakami, Mario Tyago;Murakami, Mario T;Murakami, Mário T.;Murakami, Mário Murakami, M.T.;MURAKAMI, MARIO T.2004Murakami, M. T. ; ; ; . Crystallization and high-resolution X-ray diffraction data collection of an Asp49 PLA2 from Bothrops jararacussu venom both in the presence and absence of Ca2+ ions. Biochimica et Biophysica Acta. Protein Structure and Molecular Enzymology (Cessou em 2002. Cont. ISSN 1570-9639 Biochimica et Biophysica Acta. Protein, v. 1703, p. 79-81, 2004.

67.

58Murakami, M. T.;Tyago Murakami, Mario;Murakami, Mario Tyago;Murakami, Mario T;Murakami, Mário T.;Murakami, Mário Murakami, M.T.;MURAKAMI, MARIO T.2004Murakami, M. T. ; ; ; ; ; Gutierrez, J. M. ; . Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of suramin,a highly charged polysulfonated napthylurea, complexed with amyotoxic PLA2 from Bothrops asper venom. Biochimica et Biophysica Acta. Protein Structure and Molecular Enzymology (Cessou em 2002. Cont. ISSN 1570-9639 Biochimica et Biophysica Acta. Protein, v. 1703, p. 83-85, 2004.

68.

23Murakami, M. T.;Tyago Murakami, Mario;Murakami, Mario Tyago;Murakami, Mario T;Murakami, Mário T.;Murakami, Mário Murakami, M.T.;MURAKAMI, MARIO T.2004Murakami, M. T. ; ; ; ; ; . Crystal structure of an acidic platelet aggregation inhibitor and hypotensive phospholipase A2 in the monomeric and dimericstates: insights into its oligomeric state. Biochemical and Biophysical Research Communications (Print), v. 323, p. 24-31, 2004.

69.

54Murakami, M. T.;Tyago Murakami, Mario;Murakami, Mario Tyago;Murakami, Mario T;Murakami, Mário T.;Murakami, Mário Murakami, M.T.;MURAKAMI, MARIO T.2003Murakami, M. T. ; ; ; ; ; . Initial structural analysis of an a4b4 C-type lectin from the venom of Crotalus durissus terrificus. Acta Crystallographica. Section D, Biological Crystallography, v. D59, p. 1813-1815, 2003.

70.

22Murakami, M. T.;Tyago Murakami, Mario;Murakami, Mario Tyago;Murakami, Mario T;Murakami, Mário T.;Murakami, Mário Murakami, M.T.;MURAKAMI, MARIO T.2003Murakami, M. T. ; . A structure based model for liposome disruption and the role. Toxicon (Oxford), v. 42, p. 903-913, 2003.

71.

24Murakami, M. T.;Tyago Murakami, Mario;Murakami, Mario Tyago;Murakami, Mario T;Murakami, Mário T.;Murakami, Mário Murakami, M.T.;MURAKAMI, MARIO T.2003Murakami, M. T. ; ; ; ; ; . Crystal structure of the platelet activator convulxin,a disulfide-linked a4b4 cyclic tetramer from the venom of Crotalus durissus terrificus. Biochemical and Biophysical Research Communications (Print), v. 310, p. 478-482, 2003.

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25Ketelhut, D. F. J.2003Ketelhut, D. F. J. ; ; ; Esmeraldino, L. E. ; Murakami, M. T. ; ; ; Cintra, A. C. O. ; . Isolation, characterization and biological activity of acidic phospholipaseA2 isoforms from Bothrops jararacussu snake venom. Biochimie (Paris. Print), v. 85, p. 983-991, 2003.

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27Bortoleto, R. K.2002 ; Murakami, M. T. ; ; ; . Purification, characterization and crystallization of Jararacussin-I, a fibrinogen-clotting enzyme isolated from the venom of Bothrops jararacussu. Toxicon (Oxford), v. 40, p. 1307-1312, 2002.

Capítulos de livros publicados

Brasil de Souza, Tatiana de Arruda Campos ; de Giuseppe, Priscila Oliveira ; Arni, Raghuvir Krishnaswamy ; Murakami, Mario Tyago . BmooMPα-I (Bothrops moojeni). In: Neil D. Rawlings; Guy S. Salvesen. (Org.). Handbook of Proteolytic Enzymes. 3ed.Oxford: Academic Press, 2012, v. 216, p. 1001-1005.

Oliveira de Giuseppe, Priscila ; de Souza, Tatiana de Arruda Campos Brasil ; Tyago Murakami, Mario ; Betzel, Christian ; Krishnaswamy Arni, Raghuvir . Protein C Activators from Snake Venom. In: Neil D. Rawlings; Guy S. Salvesen. (Org.). Handbook of Proteolytic Enzymes. 3ed.Oxford: Academic Press, 2012, v. 668, p. 3045-3048.

; Pidde-Queiroz, G. ; Goncalves-de-Andrade, R. M. ; Okamoto, C. K. ; Sobreira, T. J. ; Oliveira, P.S.L. ; Murakami, M. T. ; van den Berg, C.W. . Molecular Cloning, Expression, Function, Structure and Immunoreactivities of a Sphingomyelinase D from Loxosceles adelaida, a Brazilian Brown Spider from Karstic Areas. In: Gregory G. Brown. (Org.). Molecular Cloning - Selected Applications in Medicine and Biology. 1ed.Rijeka: Intech, 2011, v. 11, p. 197-218.

Trabalhos completos publicados em anais de congressos

Candido, L.B. ; ; Murakami, M. T. . MX2 Beamline. In: 22 Reunião anual do usuarios do LNLS, 2012, campinas. Livro de Resumos da 22 RAU LNLS, 2012.

Polo, C. C. ; ; Murakami, M. T. . Cloning, Heterologous Expression and Spectroscopic Characterization of the B41 Domain from Insect Myosini. In: XL Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2011, Foz Iguaçu. Livro de Resumos da SBBq, 2011. v. E26.

Pinto, A.S. ; ; Murakami, M. T. . Cloning, expression, purification and preliminary biophysical characterization of the dilute domain from plant myosin. In: XL Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2011, Foz Iguaçu. Livro de Resumos da SBBq, 2011. v. F32.

; ; ; Cota-Silva, J. ; ; ; ; ; ; Murakami, M. T. . Unraveling the molecular basis of the intriguing structure-function-stability relationships in Thermostable GH5 Cellulases. In: XL Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2011, campinas. Livro de Resumos da SBBq, 2011. v. J44.

; Tonoli, C. C. C. ; ; Murakami, M. T. . GH13 and GH57 Branching Enzymes: Different Structural Scaffolds for a Common Glycosyltransferase Mechanism. In: XL Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2011, Foz Iguaçu. Livro de Resumos da SBBq, 2011. v. L92.

de Souza, A.R. ; ; ; ; ; ; Brandt, F. H. C. ; Murakami, M. T. . Structural Investigations of a Novel Thermostable GH51 α-L-Arabinofuranosidase from Thermotoga petrophila RKU-1. In: XL Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2011, Foz Iguaçu. Livro de Resumos da SBBq, 2011. v. L112.

Basei, F.L. ; Meirelles, G.V. ; Murakami, M. T. ; Kobarg, J. . Cloning, Expression and Purification of Human Kinases Nek4 and Nek11 for Structural and Functional Studies. In: XL Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2011, Foz Iguaçu. Livro de Resumos da SBBq, 2011. v. M13.

Nascimento, A.F.Z. ; ; Larson, R. E. ; Murakami, M. T. . Low-Resolution Structure and Stability Studies of the Myosin Va Globular Tail. In: XL Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2011, Foz Iguaçu. Livro de Resumos da SBBq, 2011. v. M51.

; ; Murakami, M. T. ; Souza, F. P. ; BETZEL, C. ; . Crystal Structure of a PIII Metaloproteinase from the Venom of Bothrops moojeni. In: XL Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2011, Foz Iguaçu. Livro de Resumos da SBBq, 2011. v. M57.

10.

Nogueira, M.L.C. ; Bedoya, M.O. ; CAMILOTTI, D. ; Silva, C.A. ; ; Smetana, J. ; Murakami, M. T. ; . Interaction Studies of the Ragulator Complex. In: XL Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2011, Foz Iguaçu. Livro de Resumos da SBBq, 2011. v. M64.

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; ; Tonoli, C. C. C. ; ; ; ; ; Murakami, M. T. . Nucleoside Diphosphate Kinase b from Trypanosomatids: Structural Adaptation as Secreted Proteins and Pathways for Selective Inhibition. In: XL Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2011, Foz Iguaçu. Livro de Resumos da SBBq, 2011. v. M115.

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; ; Murakami, M. T. . Expression, Purification and Biophysical Studies of an endo-1,4-β-Glucanase from Bacillus subtilis. In: XXXIX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2010, Foz Iguaçu. Livro de Resumos, 2010.

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Nakamatsu, E. H. ; Monteiro, G. ; Discola, K.F. ; Murakami, M. T. ; Netto, L.E.S. . Enzymatic and Structural Analysis of Thioredoxin Reductase 2 from Saccharomyces cerevisiae. In: XXXIX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2010, Foz Iguaçu. Livro de Resumos, 2010.

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; ; Murakami, M. T. . Biophysical Studies of the Effector Protein PthA. In: XXXIX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2010, Foz Iguaçu. Livro de Resumos, 2010.

15.

Polo, C. C. ; Murakami, M. T. . Purification, Functional and Structural Characterization of a G-Type Lysozyme from Struthio Camelus. In: XXXIX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2010, Foz Iguaçu. Livro de Resumos, 2010.

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; Cota-Silva, J. ; Testoni, F. M. ; ; ; Murakami, M. T. ; . Biochemical Characterization of a Hyper Thermostable Arabinanase from Thermotoga petrophila. In: XXXIX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2010, Foz Iguaçu. Livro de Resumos, 2010.

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Martins, N. H. ; Silva, T. C. L. ; Pierella-Karlusich, J. J. ; Murakami, M. T. . Structural studies of cystathionine-β-synthase, a Trypanosoma cruzi enzyme involved in sulfur-containing amino acids metabolism. In: XXXIX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2010, Foz Iguaçu. Livro de Resumos, 2010.

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24.

; Murakami, M. T. . Purificação, caracterização e cristalização da lisozima Tipo G de Gallus domesticus. In: XX Congresso de Iniciação Científica, 2008, São José dos Campos. Livro de Resumos, 2008.

25.

Murakami, M. T. . New anticoagulant drugs for bloog coagulation: New plataforms for drug design. In: X Conferência da International Union of Biochemistry and Molecular Biology, 2007, Salvador - Bahia. Livro de Resumos, 2007.

26.

; Murakami, M. T. ; ; . The dimeric structures of the Lys49 phospholipases A2: a comparative study by molecular dynamics. In: XXXV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2006, Aguas de Lindóia. Livro de Resumos da SBBq.

27.

Murakami, M. T. ; ; ; GABDOULKHAKOV, A. ; BETZEL, C. ; ; . Structural insights into the catalytic mechanism of sphingomyelinase D and evolutionary relationship to glycerophosphodiester phosphodiesterases. In: XXXV da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2006, Aguas de Lindoia. Livro de Resumos da SBBq.

28.

Murakami, M. T. ; . Structural basis for the activation of the anticoagulant pathway by the protein C activator isolated from Agkistrodon contortrix contortrix. In: XXXV da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2006, Aguas de Lindóia. Livro de Resumos da SBBq.

29.

Murakami, M. T. ; . Alternative activation of the protein C pathway by the protein C activator isolated from Agkistrodon contortrix contortrix. In: XXXVII - Latin-American School of Physics, 2006, São José do Rio Preto. Abstracts.

30.

Viçoti, M. M. ; Murakami, M. T. ; ; . Structural studies in solution of crotoxin by small angle X-ray scattering. In: XXXVII Latin-American School of Physics, 2006, São José do Rio Preto. Abstracts.

31.

; Ferreira, T. L. ; Murakami, M. T. ; ; . Directed evolution of thermostability in the xylanase A from Bacillus subtilis. In: XXXIV Reuniao anual da SBBq, 2005, Aguas de Lindoia. Livro de resumo da XXXIV reuniao anual da SBBq, 2005.

32.

Murakami, M. T. ; ; ; . Molecular basis for activity of Smases D from spider venoms. In: XXXIV reuniao anual da SBBq, 2005, Aguas de Lindoia. Livro de resumos da XXXIV reuniao anual da SBBq, 2005.

33.

Murakami, M. T. ; Cintra, A. C. O. ; . Degree of protonation of a D49 phospholipase A2 from ultra high-resolution diffraction data. In: XXXIV reuniao anual da SBBq, 2005, Aguas de Lindoia. Livro de resumos da XXXIV reuniao anual da SBBq, 2005.

34.

Cabral, C. ; ; Gaspar, R. T. ; Murakami, M. T. ; Angulo, Y. ; Lomonte, B. ; . pH dependence of the quaternary structure of K49 phospholipases: Crystal structure of Anum II from Bothrops nummifer venom and structural comparisons. In: XXXIII Reunião Anual da SBBq, 2004, Caxambu, MG, 2004.

35.

; Murakami, M. T. ; ; ; ; ; . Dynamic light scattering and preliminary structural analysis of Smase I, a sphingomyelinase isolated from the venom of Loxosceles laeta. In: XXXIII Reunião Anual da SBBq, 2004, Caxambu, 2004.

36.

Gaspar, R. T. ; Murakami, M. T. ; . Structure and stability of the dimeric from of K49 PLA2's. In: XXXIII Reunião Anual da SBBq, 2004, Caxambú, 2004.

37.

Murakami, M. T. ; ; ; ; ; ; . Convulxin, a C-type lectin, exists as a cyclic a4b4 tetramer: Crystal structure and analysis at 2.4A. In: XXXIII Reunião Anual da SBBq, 2004, Caxambú, 2004.

38.

Murakami, M. T. ; ; Brandt, F. H. C. ; ; ; ; . Atomic resolution crystal structure of two acidic PLA2s, Siiispiiia and Siiispiiib, from Bothrops jararacussu venom.. In: XXXIII Reunião Anual da SBBq, 2004, Caxambu, 2004.

39.

Gava, L. M. ; Murakami, M. T. ; ; Laure, J. C. ; . Structural studies of gyroxin, a serine protease from the venom of Crotalus durissus terrificus. In: XXXIII Reunião Anual da SBBq, 2004, Caxambú, 2004.

40.

; Murakami, M. T. ; ; Gava, L. M. ; . High-yield purification of serine proteases from snake venoms. In: VIII Symposium of the Pan American Section of the International Society on Toxinology, 2004, Angra dos Reis, RJ, 2004.

41.

Viçoti, M. M. ; Murakami, M. T. ; ; . Characterization of the pH and temperatura stability of convulxin using dynamic light scattering. In: VIII Symposium of the Pan American Section of the International Society on Toxinology, 2004, Angra dos Reis, RJ, 2004.

42.

Murakami, M. T. ; ; . Specificity and structural analysis of convulxin. In: VIII Symposium of the Pan American Section of the International Society on Toxinology, 2004, Angra dos Reis, RJ, 2004.

43.

Murakami, M. T. ; ; ; Gutierrez, J. M. ; ; . Binding of suramin in K49 PLA2s. In: VIII Symposium of the Pan American Section of the International Society on Toxinology, 2004, Angra dos Reis, RJ, 2004.

44.

Murakami, M. T. ; ; ; . Crystal structure fo the family 11 xylanase from Bacillus subtilis. In: 1st Latin American Protein Society Meeting, 2004, Angra dos Reis, RJ, 2004.

45.

Modesto, J. C. A. ; Murakami, M. T. ; ; Chudzinski-Tavassi . Profile of proteins involved on blood coagulation and fibrinolysis of the Bothrops insularis venom. In: XXXII Reunião Anual da SBBq, 2003, Caxambú, MG, 2003.

46.

Murakami, M. T. . A specific fibrinogen-clotting enzyme purified from the Bothrops jararacussu venom. In: XXXIII Reunião Anual da SBBq, 2003, Caxambú, MG, 2003.

47.

Murakami, M. T. ; Laure, H. J. ; Greene, L. J. ; . High yield purification and characterization of serine proteinases from the venoms of Bothrops jararaca, Bothrops jararacussu, Bothrops moojeni and Crotalus durissus terrificus. In: VII Simpósio da Sociedade Brasileira de Toxinologia, 2002, Pirenópolis, GO, 2002.

48.

Murakami, M. T. ; ; . Structural studies of thrombin-like enzymes, Jararacussin-I and Bothrombin, from the venoms of Bothrops jararacussu and Bothrops jararaca. In: Activity Report LNLS, 2002, Campinas, 2002.

49.

Murakami, M. T. ; ; . Crystallization and preliminary X-ray diffraction of jararacussin-I, a thrombin-like enzyme, from the snake venom of Bothrops jararacussu. In: XXXI Reunião Anual da SBBq, 2002, Caxambu, 2002.

50.

Murakami, M. T. ; ; Vieira, D. F. ; ; . Purification, characterization and functional studies of a fibrinolytic enzyme isolated from the venom of Bothrops jararacussu. In: XXX Reunião Anual da SBBq, 2001, Caxambú, MG, 2001.

51.

Vieira, D. F. ; Murakami, M. T. ; ; ; . Isolation and characterization of a phospholipase and a serine protease fro mthe venom of Bothrops jararaca. In: XXX Reunião Anual da SBBq, 2001, Caxambu, 2001.

52.

Murakami, M. T. ; ; ; ; Vieira, D. F. ; . Estudos funcionais e cristalização de uma Thrombin-like enzyme isolated do veneno da serpente Bothrops jararacussu. In: XIII Congresso de Iniciação Científica, 2001, Bauru, 2001.

53.

Videira, L. N. C. ; Vieira, D. F. ; Murakami, M. T. ; Nakahira, M. ; ; . Purificação de uma serino protease do veneno de Crotalus durissu terrificus. In: XIII Congresso de Iniciação Científica, 2001, Bauru, 2001.

54.

Nakahira, M. ; Murakami, M. T. ; Vieira, D. F. ; Videira, L. N. C. ; ; . Purificação e estudos comparativos de proteases asparticas isoladas do figado de Gallus domesticus e Hydrochoerus hydruchaeris. In: XIII Congresso de Iniciação Científica, 2001, Bauru, 2001.

55.

Vieira, D. F. ; Murakami, M. T. ; Videira, L. N. C. ; Nakahira, M. ; ; . Caracterização de uma serino protease co ação fibrinolítica isolada do veneno de Bothrops jararaca. In: XIII Congresso de Iniciação Científica, 2001, Bauru, 2001.

56.

Murakami, M. T. ; Vieira, D. F. ; Nakahira, M. ; . Caracterização bioquímica e estudos funcionais de uma enzima fibrinolítica purificada de Bothrops jararacussu. In: 28º Colóquio de Incentivo à Pesquisa, 2001, São José do Rio Preto, 2001.

57.

Murakami, M. T. ; Vieira, D. F. ; Nakahira, M. ; . Isolamento de três serino proteinases das serpentes B. atrox, B. moojeni e Crotalus durissus terrificus. In: 28º Colóquio de Incentivo à Pesquisa, 2001, São José do Rio Preto, 2001.

58.

Murakami, M. T. ; . Purificação e caracterização de jararacussin-I de Bothrops jararacussu. In: XII Congresso de Iniciação Científica, 2000, São José do Rio Preto, 2000.

59.

Murakami, M. T. ; . Purificação de uma enzima de importância biológica do veneno de serpente. In: 27º Colóquio de Incentivo à Pesquisa, 2000, São José do Rio Preto, 2000.

Resumos publicados em anais de congressos

Moraes, E.C. ; Meirelles, G.V. ; Souza, E.E. ; Murakami, M. T. ; Kobarg, J. . Exploration of Human Kinases of the NeK Family as Candidates for Cell Growth Inhibition. In: XL Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2011, Foz Iguaçu. Livro de Resumos da SBBq, 2011. v. P24.

Apresentações de Trabalho

Murakami, M.T. . Insights into novel molecular strategies adopted by evolutionary distinct glycosyl hydrolases for catalysis and stability. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

Murakami, M.T. . Bases Mecanistícas da Regulação e Sinalização do Transporte Intracelular mediado por miosinas V. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

Murakami, M. T. . MX2 macromolecular crystallography beamline: status & perspectives. 2012. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

Murakami, M. T. . Regulation, substrate specificity and stability of modular glycosyl hydrolases. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

Murakami, M.T. . Functional and structural aspects of cellulases and hemicellulases with potential biotechnological applications. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

Murakami, M. T. . Understanding the structure-stability-function relationships of multi-domain glycosyl hydrolases. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

Murakami, M. T. . Dissecting the Structure-function-stability Relationships of Extremophilic Modular Glycoside Hydrolases. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

Murakami, M. T. . Estrutura e função de hidrolases glicosídicas. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

Murakami, M. T. . Desvendando novos mecanismos moleculares para inibição de fatores de coagulação sanguínea. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

10.

Murakami, M. T. . The protein Sample - Preparation and Quality analysis. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

11.

Murakami, M. T. . Enzyme Structure and Function. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

12.

Murakami, M. T. . Specificity and Stability of extremophilic enzymes. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

13.

Murakami, M. T. . Faseamento experimental de Macromoléculas. 2010. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

14.

Murakami, M. T. . Biologia estrutural no LNBIo/LNLS. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

15.

Murakami, M. T. . Hemostatically-active proteins: new plataform for drug design. 2009. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

16.

Murakami, M. T. . Sphingomyelinases D: a structural view. 2009. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

17.

Murakami, M. T. . Novos modelos para desenho de farmacos: Coagulação sanguínea. 2009. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

18.

Murakami, M. T. . Pathways of blood coagulation inhibition and membrane-damaging proteins. 2009. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

19.

Murakami, M. T. . Protein Crystallization at the Brazilian Synchrotron Light Laboratory. 2009. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

20.

Murakami, M. T. . Membrane-damaging proteins. 2008. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

21.

Murakami, M. T. . New anticoagulant drugs for bloog coagulation. 2007. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

22.

Murakami, M. T. . Structural Aspects of Toxins: Blood Coagulation & Membrane disruption. 2006. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

23.

Murakami, M. T. . Structural investigations of haemostatically-active and membrane damaging proteins: potential targets for drug design and clinical application. 2006. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

24.

Murakami, M. T. . Aspectos Estruturais da Multi-Funcionalidade de Toxinas. 2006. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

25.

Murakami, M. T. . Base Molecular do Funcionamento de Toxinas na Hemostasia e Disrupção de Membranas Biológicas. 2005. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

Produção técnica

Programas de computador sem registro

Vidal, R.O. ; Carazzolle, M.A. ; ; Pereira, G.A. ; Murakami, M. T. . Structural Biology Helper. 2011.

Bancas

Participação em bancas de trabalhos de conclusão

Mestrado

; ; Murakami, M. T.. Participação em banca de Angelica Rodriguez de Souza. Aspectos estruturais de duas enzimas relacionadas: liquenase e arabinofuranosidase termoestável. 2012. Dissertação (Mestrado em Biofisica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Werneck, C. C.; Balan, A.; Murakami, M. T.. Participação em banca de Aline Sampaio Pinto. Investigações estruturas dos domínios funcionais das miosinas classes VIII e XI presentes em plantas. 2012. Dissertação (Mestrado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

; Figueira, A.C.M.; Murakami, M. T.. Participação em banca de Carla Cristina Polo. Caracterização molecular dos dominios funcionais de miosinas de D. melanogaster. 2012. Dissertação (Mestrado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Murakami, M. T.; ; . Participação em banca de Plinio Salmazo Vieira. Efeitos de mutações na estrutura em solução e na função da Nucleosídeo Difosfato Kinase de Leishmania major (LmNDK). 2012. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Ciências) - Universidade de São Paulo.

Murakami, M. T.; Canduri, F.; Fadel, V.. Participação em banca de Fernando Celestino Vacari. Cristalização e resolução da estrutura das proteínas Canavalia gladiata lectin (CGL) e Canavalia Maritma lectin (CML) complexada com açucares. 2010. Dissertação (Mestrado em Biofisica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Gaspar, J. O.; Murakami, M. T.; Cornelio, M.L.. Participação em banca de Ricardo Barros mariutti. Expressão da provável proteína do movimento do Southern Bean Mosaic Virus em E. coli e produção de antissoro policlonal. 2009. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

CAETANO, R. C.; Murakami, M. T.; . Participação em banca de Flávia Barboza Carmargo. Expressão, purificação e estudos estruturais da chaperona molecular Hsp65 kDa de Mycobacterium leprae. 2007. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Gaspar, J. O.; Souza, F. P.; Murakami, M. T.. Participação em banca de Livia José Regatieri. Expressão da possivel proteina do movimento do Pepper ringspot virus em E. coli e produção de anti-soro visando comprovação de função biologica. 2007. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Murakami, M. T.; CAETANO, R. C.; . Participação em banca de Karine Fernanda dos Santos. Estudos estruturais da proteina precursora dos peptideos potenciadores de bradicinina. 2007. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

10.

Gaspar, J. O.; Belintani, P.; Murakami, M. T.. Participação em banca de Ana Cecilia Bergamim Pereira. Proteína capsidial do Rupestris Stem pitting-associated virus: sequenciamento do gene, expressão em E. coli, purificação e produção de anti-soro policlonal.. 2007. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Teses de doutorado

Juliano L.; Tersario I.L.S.; ; Ferro, E.S.; Murakami, M. T.. Participação em banca de Márcia Yuri Kondo. Caracterização do mecanismo catalítico da SGP, enzima protótipo das glutâmico peptidases. 2012. Tese (Doutorado em Biociências Bioquímica) - Universidade Federal de São Paulo.

Canduri, F.; Nagem, R. A. P.; ; Balan, A.; Murakami, M. T.. Participação em banca de Nadia Helena Martins. Estudos estruturais e biofísicos da enzima purina nucleosideo fosforilase de Bacillus subtilis 168. 2011. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Estadual de Campinas.

Murakami, M. T.; Khater, L.; Almeida, W.P.; Marsaioli, A.J.. Participação em banca de Juliana Fattori. Resolução estrutural de proteínas hipotéticas, chaperonas de secreção da bactéria Xanthomonas axonopodis pv. citri. 2011. Tese (Doutorado em Doutorado) - Universidade Estadual de Campinas.

Oliva, G.; Reboredo, E.H.; ; Murakami, M. T.; Nagem, R. A. P.. Participação em banca de Tatiane Luciano Balliano. Estudos em biologia estrutural e química medicinal no planejamento de inibidores da gliceraldeido-3-fosfato desidrogenase de Trypanosoma cruzi. 2010. Tese (Doutorado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

Barbosa, J. A.; Farah, C. S.; Murakami, M. T.; Ho, P. L.. Participação em banca de Carolina Santacruz Perez. Estudos estruturais da proteína ModA e do sistema de transporte de molibdato da bactéria Xanthomonas axonopodis pv. citr. 2010. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

; Murakami, M. T.; Nonato, M.C.; Reboredo, E.H.; . Participação em banca de Daniella Barreto Barbosa Trivella. Bases moleculares e estruturais do reconhecimento de ligantes pela proteína transtirretina humana. 2010. Tese (Doutorado em Doutorado em Ciências) - Universidade de São Paulo.

Novello, J.C.; Werneck, C. C.; Pinto, L.M.A.; Kobarg, J.; Murakami, M. T.. Participação em banca de Bruno Menezes de Oliveira. Caracterização estrutural e funcional de proteínas através de espectrometria de massas MALDI-TOF. 2009. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Qualificações de Doutorado

Garratt, R.C.; Andrade, E.; Murakami, M.T.. Participação em banca de Julio Cesar Nunes. Investigação sobre o splicing alternativo mutuamente exclusivo e análise funcional das isoformas. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

Pereira, H.; Murakami, M. T.; . Participação em banca de Nadia Helena Martins. Estudos estruturais e biofísicos da enzima PNP de Bacillus subtilis. 2011. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Estadual de Campinas.

Kobarg, J.; Werneck, C. C.; Murakami, M. T.. Participação em banca de JULIANA FERREIRA DE OLIVEIRA. haracterization of the Trypanosoma cruzi ortholog of the SBDS protein. 2009. Exame de qualificação (Doutorando em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Werneck, C. C.; Paula, E.; Murakami, M. T.. Participação em banca de aline lima de oliveira. 1H, 15N AND 13C resonance assignments of cerato platanin, a phytotoxic proteins from Ceratocystis fimbriata. 2008 - Universidade Estadual de Campinas.

Trabalhos de conclusão de curso de graduação

Murakami, M. T.; ; . Participação em banca de Liliane Maria Fernandes Oliveira.Expressão, Purificação e Cristalização de Mutantes da Proteína Humana NUDEL (Nuclear Distribution Element-LIke)-Oligopeptidase. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciencias Biologicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Murakami, M. T.; Nery, J. G.; Fadel, V.. Participação em banca de Joane Kathelen Rodrigues Rustiguel.Estudos teóricos sobre difração de raios X e cristalografia de proteínas. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Murakami, M. T.. Participação em banca de Patricia Kimi Akao.Purificação e Cristalização da lisozima tipo G de Struthio camelus. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Murakami, M. T.. Participação em banca de Samantha Sayumi Okada.Expressão e purificação do domínio C-terminal da RdRp de SBMV. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Murakami, M. T.. Participação em banca de Leandro da Rocha.Expressão e purificação da proteina do movimento do PeRSV. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Gaspar, J. O.; Belintani, P.; Murakami, M. T.. Participação em banca de Juliana Silva Kawata Passos.Purificação e produção de anti-soro para a proteína capsidial do Southern bean mosaic virus. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciencias Biologicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

; Feitosa E. S.; Murakami, M. T.. Participação em banca de Matheus Sacilotto de Moura.Estudo das Variações Conformacionais das Albuminas de Diferentes Espécies Utilizando a Técnica de Espalhamento de Raios X a Baixos Ângulos (SAXS). 2007. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Ruggiero Neto, J.; Murakami, M. T.; Nery, J. G.. Participação em banca de Lívia Maria Faim.Estudo Estrutural da Chiquimato quinase de Mycobacterium tuberculosis em Complexo com Ligantes. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Participação em bancas de comissões julgadoras

Concurso público

Murakami, M. T.; ; Kobarg, J.. Tecnico Nivel Superior. 2010. Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais.

Murakami, M. T.; Ambrosio, A.; Mattos, F.. Físico. 2010. Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais.

Murakami, M. T.; ; Barbosa, J. A.. Tecnico nível superior. 2009. Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais.

Eventos

Participação em eventos, congressos, exposições e feiras

Workshop on Synthetic Biology and Robotics.Automação no LNBio/LNLS. 2011. (Oficina).

Encontro França-Brasil de Bioinformática.Bioinformática. 2010. (Encontro).

Global dialogues on emerging science and technology (GDEST): Conference on Bioinformatics.Bioinformática. 2006. (Simpósio).

Organização de eventos, congressos, exposições e feiras

Murakami, M. T. ; Ambrosio, A. . V Workshop de Cristalografia - Faseamento experimental. 2010. (Outro).

Barbosa, J. A. ; Murakami, M. T. . IV Worshop de Cristalografia - Cristalização de Proteínas. 2009. (Outro).

Murakami, M. T. . Curso de Verão em Biofísica Molecular 2008. 2007. (Outro).

Orientações

Orientações e supervisões em andamento

Tese de doutorado

Leandro M. de Assis. Human Myosin-5A and the Intracellular Transport of Cargoes: Studies of the Myosin-5A and Adapter Proteins Complexes. Início: 2012. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. (Orientador).

MARIANA ABRAHAO BUENO DE MORAIS. Estudos estruturais e busca de potenciais inibidores das proteína-quinases PK53 e Polo-símile de Trypanosoma cruzi candidatas a alvo para o desenvolvimento de drogas. Início: 2012. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Orientador).

Carla Cristina Polo. Caracterização estrutural e estabilidade de endo e exo-arabinanases obtidas de uma biblioteca metagenômica do rúmen bovino. Início: 2012. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Orientador).

Plinio Salmazo Vieira. Investigação molecular do funcionamento das NEK quinases de tripanosomatídeos: Estrutura, função e busca por potenciais inibidores. Início: 2012. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. (Orientador).

Joice Helena Paiva. Estudos estruturais da proteína efetora PthA de Xanthomonas citrii.. Início: 2009. Tese (Doutorado em Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. (Orientador).

Andrey Nascimento. Estudos funcionais e estuturais da miosina Va humana e aviaria. Início: 2009. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. (Orientador).

Orientações de outra natureza

Priscila Oliveira de Giuseppe. Estudos estruturais de quinases de tripanosomatídeos como alvo para desenho de fármacos. Início: 2011. Orientação de outra natureza. Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais. (Orientador).

Camila Ramos Santos. Especificidade e estabilidade de enzimas extremofílicas aplicadas a degradação de biomassa lignocelulósica. Início: 2011. Orientação de outra natureza. Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais. (Orientador).

Orientações e supervisões concluídas

Dissertação de mestrado

Aline Sampaio Pinto. Investigações estruturais dos domínios funcionais das miosinas classes VIII e XI presentes em plantas. 2012. Dissertação (Mestrado em Biologia Molecular e Funcional) - Laboratório Nacional de Luz Síncrotron, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Mário Tyago Murakami.

Carla Cristina Polo. Caracterização Molecular de domínios funcionais de miosinas de D. melanogaster. 2012. Dissertação (Mestrado em Biologia Molecular e Funcional) - Laboratório Nacional de Luz Síncrotron, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Mário Tyago Murakami.

Angelica Rodriguez de Souza. Aspectos estruturais de duas enzimas relacionadas: liquenase e arabinofuranosidase termoestável. 2012. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Mário Tyago Murakami.

Patricia Kimi Akao. Estudos estruturais e biofísicos de uma metaloproteinase isolada de Bothrops moojeni e da endo-glicanase de Bacillus subtilis. 2011. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Mário Tyago Murakami.

karine fernanda dos santos. ESTUDOS ESTRUTURAIS DO PRECURSOR DOS PEPTÍDEOS POTENCIADORES DE BRADICININA E DA PROTEÍNA NUDEL NUCLEAR DISTRIBUTION ELEMENT-LIKE. 2007. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Co-Orientador: Mário Tyago Murakami.

Daniella G. O. de Oliveira. Functional and Structural Analyses of Two Fibrinogen-Activating Enzymes Isolated from the Venoms of Crotalus durissus terrificus and Crotalus durissus collilineatus. 2006. Dissertação (Mestrado em Biofisica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Co-Orientador: Mário Tyago Murakami.

Tese de doutorado

Nadia Helena Martins. Estudos estruturais e biofísicos da enzima purina nucleosídeo fosforilase hexamérica de Bacillus subtilis 168. 2011. Tese (Doutorado em Genética) - Laboratório Nacional de Luz Síncrotron, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Mário Tyago Murakami.

Magno massolino viçoti. Estudos estruturais em solução de toxinas por SAXS.. 2009. Tese (Doutorado em Pós-Graduação em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Co-Orientador: Mário Tyago Murakami.

Supervisão de pós-doutorado

Daniel M. Trindade. 2012. Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Mário Tyago Murakami.

Tatiana de Arruda Campos Brasil de Souza. 2012. Laboratório Nacional de Luz Síncrotron, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Mário Tyago Murakami.

Camila Ramos Santos. 2010. Laboratório Nacional de Luz Síncrotron, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Mário Tyago Murakami.

Priscila Oliveira de Giuseppe. 2010. Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, ABTLUS. Mário Tyago Murakami.

Iniciação científica

MARIANA ABRAHAO BUENO DE MORAIS. Caracterização estrutural de enzimas do secretoma de T. cruzi e L. braziliensis. 2012. Iniciação Científica - Laboratório Nacional de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Mário Tyago Murakami.

BRUNA MARCATTO BELLI. Clonagem, expressão, purificação e cristalização de quinases de tripanosomatídeos. 2012. Iniciação Científica - Laboratório Nacional de Biociências, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Mário Tyago Murakami.

Leandro Assis. Interactoma da MVa em cérebro humano fetal.. 2010. Iniciação Científica. (Graduando em Química) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Mário Tyago Murakami.

Joice Helena Paiva. Expressão, purificação e cristalização de proteínas.. 2009. Iniciação Científica. (Graduando em Ciencias Biologicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Mário Tyago Murakami.

Carla Cristina Polo. Estudos estruturais de lisozimas tipo G do albume de Struthio camelus. 2009. Iniciação Científica - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Mário Tyago Murakami.

Aline Sampaio Pinto. Expressão, purificação e cristalização de proteínas envolvidas na via de sinalização sensível a rapamicina. 2009. Iniciação Científica. (Graduando em Ciências Biológicas) - Laboratório Nacional de Luz Síncrotron, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Mário Tyago Murakami.

Leandro da Rocha. Expressão, purificação e reenovelamento da proteína do movimento do Pepper ringspot virus. 2008. Iniciação Científica. (Graduando em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho. Orientador: Mário Tyago Murakami.

Samantha Sayumi Okada. Expressão, purificação e análise espectroscópica do domínio C-terminal da RNA polimerase dependente de RNA do SBMV. 2008. Iniciação Científica. (Graduando em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho. Orientador: Mário Tyago Murakami.

Patricia Kimi Akao. Purificação, caracterização e cristalização da lisozima tipo-G do albume de Struthio camelus. 2008. Iniciação Científica. (Graduando em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho. Orientador: Mário Tyago Murakami.

10.

Simone Michelan Duarte. Cristalização de esfingomielinases D. 2005. 10 f. Iniciação Científica. (Graduando em Ciencias Biologicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Mário Tyago Murakami.

11.

Fabio H C Brandt. Purificação e caracterização de enzimas envolvidas na coagulação sanguinea de venenos de serpente. 2004. 10 f. Iniciação Científica. (Graduando em Ciencias Biologicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho. Orientador: Mário Tyago Murakami.

Orientações de outra natureza

Daniel M. Trindade. Structural genomics of human myosins. 2012. Orientação de outra natureza - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Mário Tyago Murakami.

Mariana Abrahão Bueno. Expressão, purificação e cristalização da NEK kinase de Leishmania braziliensis. 2011. Orientação de outra natureza. (Biotecnologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, ABTLUS. Orientador: Mário Tyago Murakami.

Maria da Conceição Mendes Ferreira da Costa. Estrutura cristalográfica da endo-arabinanase de uma biblioteca metagenomica. 2011. Orientação de outra natureza. (Biologia) - Universidade Federal de Pernambuco, ABTLUS. Orientador: Mário Tyago Murakami.

Daiane Patricia Oldiges. Determinação da estrutura cristalina da arabinofuranosidase de T. petrophila. 2010. Orientação de outra natureza - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais. Orientador: Mário Tyago Murakami.

Tonielli Cristina Souza de Lacerda. Expressão, purificação e cristalização da nucleosídeo difosfato quinase b (NDKb) de Trypanosoma cruzi para estudos comparativos com a sua ortóloga de Leishmania major. 2010. Orientação de outra natureza - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais. Orientador: Mário Tyago Murakami.

Andrey Nascimento. Clonagem e expressão da cauda globular da miosina Va humana. 2009. Orientação de outra natureza - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais. Orientador: Mário Tyago Murakami.

Outras informações relevantes

Apoios financeiros como coordenador:
   
   CNPq UNIVERSAL - Enzimas biomédicas - encerrado (2008-2009).
   CNPq UNIVERSAL - Miosinas não-convencionais - encerrado (2010-2011).
   FAPESP - Miosinas não-convencionais - encerrado (2010-2012).
   FAPESP SMOLBNET2 - Enzimas com aplicações biotecnológicas - em vigência (desde 2011).

Apoios financeiros como co-coordenador ou pesquisador principal:

    FAPESP CEPID: Centro de Biotecnologia Molecular Estrutural - encerrado (participação entre 2009-2011)
    FAPESP SMOLBNET2 - Kinases de tripanosomatídeos - em vigência (desde 2011).
   

Colaborações internacionais

 Prof. Dr. Dominic W. S. Wong - Western Regional Research Center, USDA-ARS, California, USA.
 Prof. Dr. Rolf A. Prade - Okalahoma University, USA.
 Prof. Dr. Christian Betzel - Hamburg University, GER.
 Prof. Dr. Frank Von Delft - SGC, Oxford, UK.
Prof. Dr. Charalampos Kalodimos - Rutgers University, USA.

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