Cláudia Lemelle Fernandes

  • Endereço para acessar este CV: http://lattes.cnpq.br/6591259268553028
  • Última atualização do currículo em 03/10/2016


Possui graduação em Farmácia pela Universidade Federal do Rio Grande do Sul, (2001) mestrado em Ciências Biológicas (Bioquimica) pela Universidade Federal do Rio Grande do Sul (2006) e doutorado em Biologia Molecular pela Universidade Federal do Rio Grande do Sul (2011). Tem experiência na área de Bioquímica, com ênfase em Biologia Estrutural, atuando principalmente nos seguintes temas: dinâmica molecular, modelagem molecular e estrutura e conformação de glicídeos e glicoproteínas. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Cláudia Lemelle Fernandes
Nome em citações bibliográficas
FERNANDES, C. L.;Fernandes, Cláudia L.;Fernandes, C.L.;Fernandes, Claudia Lemelle;FERNANDES, CLÁUDIA LEMELLE

Endereço


Endereço Profissional
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Centro de Biotecnologia.
Avenida Bento Gonçalves 9500
Agronomia
90000-000 - Porto Alegre, RS - Brasil
Telefone: (51) 33087770
Ramal: 36
URL da Homepage: www.cbiot.ufrgs.br/bioinfo


Formação acadêmica/titulação


2007 - 2011
Doutorado em Biologia Celular e Molecular.
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.
Título: CARACTERIZAÇÃO CONFORMACIONAL DE CARBOIDRATOS E GLICOPROTEÍNAS: EFEITOS DA GLICOSILAÇÃO NA GLICOPROTEÍNA α1-ÁCIDA HUMANA, Ano de obtenção: 2011.
Orientador: Hugo Verli.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Palavras-chave: Modelagem molecular; Estrutura de macromoléculas biológicas; dinâmica molecular; estruturas de carboidratos.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Química de Macromoléculas.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Química de Macromoléculas / Especialidade: Proteínas.
2004 - 2006
Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica).
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.
Título: Modelagem molecular e estudos de Docking da enzima Corismato Sintase de Mycobacterium tuberculosis,Ano de Obtenção: 2006.
Orientador: Luiz Augusto Basso.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Palavras-chave: ácido chiquímico; Chorismate synthase; Modelagem molecular; Docking molecular.
Grande área: Ciências Biológicas
Setores de atividade: Desenvolvimento de Produtos Tecnológicos Voltados Para A Saúde Humana.
2002 - 2004
Especialização em Farmácia Bioquímica.
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.
Título: Perfil glicêmico da Diabete tipo MODY-2 na gestação: descrição de um caso.
Orientador: Carmen Regla Vargas.
1996 - 2001
Graduação em Farmácia.
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.
Título: Modelagem molecular da EPSP sintase de Mycobacterium tuberculosis por modelagem comparativa por homologia.
Orientador: Diógenes Santiago Santos.
1991 interrompida
Graduação interrompida em 1995 em Engenharia Química.
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.
Ano de interrupção: 1995


Pós-doutorado


2011 - 2013
Pós-Doutorado.
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas


Formação Complementar


2005 - 2005
Treinamento no Banco de Dados Hiv Base. (Carga horária: 30h).
Fiocruz Centro de Pesquisas Gonçalo Monuz, FIOCRUZ/CPQGM, Brasil.
2002 - 2002
Extensão universitária em Linux Básico. (Carga horária: 30h).
Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, PUCRS, Brasil.
2002 - 2002
Extensão universitária em Escola de modelagem molecular. (Carga horária: 22h).
Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC/MCT, Brasil.
2001 - 2001
Introdução Ao Fortran 90. (Carga horária: 15h).
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.


Atuação Profissional



Centro de ensino superior sul brasileiro, CESULBRA, Brasil.
Vínculo institucional

2011 - 2011
Vínculo: Prestador de serviço, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 2
Outras informações
Professor do curso de pós-gradução de Farmacologia Clínica nas disciplinas de Princípios Gerais de Fármacos e Farmacologia do Sistema Digestório


Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, PUCRS, Brasil.
Vínculo institucional

2002 - 2004
Vínculo: Outro, Enquadramento Funcional: estagiário, Carga horária: 30

Atividades

1/2002 - 10/2006
Estágios , Faculdade de Informática, Departamento de Computação Aplicada.

Estágio realizado
Estágio em Bioinformática.


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Química de Macromoléculas/Especialidade: Proteínas.
2.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
3.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.
Espanhol
Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Bem, Escreve Pouco.
Francês
Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
FERNANDES, C. L.2015 FERNANDES, C. L.; LIGABUE-BRAUN, R. ; VERLI, H. . Structural glycobiology of human α -acid glycoprotein and its implications for pharmacokinetics and inflammation. Glycobiology (Oxford), p. cwv041-1133, 2015.

2.
BRISOLARA-CORRÊA, LAUÍS2014BRISOLARA-CORRÊA, LAUÍS ; THOMPSON, CLAUDIA ELIZABETH ; FERNANDES, CLÁUDIA LEMELLE ; DE FREITAS, LORETA BRANDÃO . Diversification and distinctive structural features of S-RNase alleles in the genus Solanum. Molecular Genetics and Genomics (Print), v. xx, p. xx, 2014.

3.
DEFFERRARI, M.S.2013DEFFERRARI, M.S. ; LEE, D.H. ; Fernandes, C.L. ; ORCHARD, I. ; CARLINI, C.R. . A phospholipase A2 gene is linked to Jack bean urease toxicity in the Chagas' disease vector Rhodnius prolixus. Biochimica et Biophysica Acta. G, General Subjects (Print), v. 1840, p. 396-405, 2013.

4.
Fernandes, Cláudia L.2013 Fernandes, Cláudia L.; ESCOUTO, GABRIELA B. ; Verli, Hugo . Structural glycobiology of heparinase II from Pedobacter heparinus. Journal of Biomolecular Structure & Dynamics, v. 32, p. 1-11, 2013.

5.
Lazzarotto, Fernanda2011Lazzarotto, Fernanda ; Teixeira, Felipe Karam ; Rosa, Silvia Barcelos ; Dunand, Christophe ; Fernandes, Claudia Lemelle ; de Vasconcelos Fontenele, Adilton ; Silveira, Joaquim Albenisio Gomes ; Verli, Hugo ; Margis, Rogério ; Margis-Pinheiro, Marcia . Ascorbate peroxidase-related (APx-R) is a new heme-containing protein functionally associated with ascorbate peroxidase but evolutionarily divergent. New Phytologist (Print), v. 191, p. 234-250, 2011.

6.
Fernandes, C.L.2010 Fernandes, C.L.; Sachett, L.G. ; POL-FACHIN, L. ; VERLI, H. . GROMOS96 43a1 performance in predicting oligosaccharide conformational ensembles within glycoproteins. Carbohydrate Research (Chicago, Ill.. Print), v. 345, p. 663-671, 2010.

7.
POL-FACHIN, L.2009POL-FACHIN, L. ; FERNANDES, C. L. ; VERLI, H. . GROMOS96 43a1 performance on the characterization of glycoprotein conformational ensembles through molecular dynamics simulations. Carbohydrate Research, v. 344, p. 491-500, 2009.

8.
Thompson, Claudia E.2009Thompson, Claudia E. ; Fernandes, Cláudia L. ; Norberto de Souza, Osmar ; Freitas, Loreta B. ; Salzano, Francisco M. . Evaluation of the impact of functional diversification on Poaceae, Brassicaceae, Fabaceae, and Pinaceae alcohol dehydrogenase enzymes. Journal of Molecular Modeling, p. 1, 2009.

9.
FONSECA, I. O.2007FONSECA, I. O. ; SILVA, R. G. ; FERNANDES, C. L. ; SOUZA, O. N. ; BASSO, L. A. ; SANTOS, D. S. . Kinetic and chemical mechanisms of shikimate dehydrogenase from Mycobacterium. Archives of Biochemistry and Biophysics, v. 457, p. 123-133, 2007.

10.
FERNANDES, C. L.;Fernandes, Cláudia L.;Fernandes, C.L.;Fernandes, Claudia Lemelle;FERNANDES, CLÁUDIA LEMELLE2007 FERNANDES, C. L.; BREDA, Ardala ; SANTOS, D. S. ; BASSO, L. A. ; SOUZA, O. N. . A structural model for chorismate synthase from Mycobacterium tuberculosis in complex with coenzyme and substrate. Computers in Biology and Medicine, v. 37, p. 149-158, 2007.

11.
Thompson, Claudia E.2006Thompson, Claudia E. ; FERNANDES, C. L. ; de Souza, Osmar N. ; Salzano, Francisco M. ; Bonatto, Sandro L. ; Freitas, Loreta B. . Molecular Modeling of Pathogenesis-Related Proteins of Family 5. Cell Biochemistry and Biophysics, v. 44, n.3, p. 385-394, 2006.

12.
FERNANDES, C. L.;Fernandes, Cláudia L.;Fernandes, C.L.;Fernandes, Claudia Lemelle;FERNANDES, CLÁUDIA LEMELLE2005 FERNANDES, C. L.; SANTOS, D. S. ; BASSO, L. A. ; SOUZA, O. N. . Structure Prediction and Docking Studies of Chorismate Synthase from Mycobacterium. Lecture Notes in Computer Science, v. 3594, p. 118-127, 2005.

13.
BREDA, Ardala2005BREDA, Ardala ; FERNANDES, C. L. ; ALMEIDA, Sabrina Esteves de Matos ; FRANCO, H. M. ; ROSSETTI, Maria Lúcia Rosa ; RODRIGUES, Rosângela ; BRÍGIDO, Luís Fernando ; CORTEZ-HERRERA, Elizabeth . Bioinformatics Tools for HIV-1 Identification in Southern Brazilian States. Lecture Notes in Computer Science, v. 3594, p. 234-237, 2005.

Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1.
FERNANDES, C. L.; SANTOS, D. S. ; BASSO, L. A. ; SOUZA, O. N. . Structure Prediction and Docking Studies of Chorismate Synthase from Mycobacterium tuberculosis. In: Brazilian Symposium of Bioinformatics, 2005, 2005, São Leopoldo. Lecture Notes in Bioinformatics, 2005. v. 3594. p. 118-127.

Resumos expandidos publicados em anais de congressos
1.
BREDA, Ardala ; FERNANDES, C. L. ; ALMEIDA, Sabrina Esteves de Matos ; ROSSETTI, Maria Lúcia Rosa ; RODRIGUES, Rosângela ; BRÍGIDO, Luís Fernando ; CORTEZ-HERRERA, Elizabeth . Bioinformatics Tools for HIV-1 Identification in Southern Brazilian States. In: Brazilian Symposium of Bioinformatics, 2005, 2005, São Leopoldo. Lecture Notes in Bioinformatics, 2005. v. 3594. p. 234-237.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
FERNANDES, C. L.; VERLI, H. ; VAINSTEIN, M. H. . Cryptococcus neoformans Capsule: Structural Biology Study by Molecular and Meta Dynamics Simulations. In: XLII Reunião anual SBBq, 2013, Foz do Iguaçu. Program of XLII Annual Metting - SBBq, 2013.

2.
FERNANDES, C. L.; VERLI, H. . Effects of glycosilation in the human alpha1-acid glycoprotein (AGP) structure. In: V Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos, 2010, Petrópolis-RJ. V Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos, 2010.

3.
FERNANDES, C. L.; VERLI, H. . Effects of glycosylation in the human alpha1-Acid glycoprotein (AGP) conformation. In: XXXVIII annual Meeting of SBBq, 2009, Águas de Lindóia-SP. XXXVIII annual Meeting, 2009.

4.
CHIODI, C. G. ; FERNANDES, C. L. ; VERLI, H. . Structural and conformational characterization of human prothrombin. In: XXXVIII annual Meeting of SBBq, 2009, Águas de Lindóia-SP. XXXVIII annual Meeting, 2009.

5.
POL-FACHIN, L. ; FERNANDES, C. L. ; VERLI, H. . Prediction of glycoproteins conformational ensembles in solution. In: XXXVII Reunião Anual da SBBq, 2008, Águas de Lindóia-SP. XXXVII Reunião Anual da SBBq, 2008.

6.
FERNANDES, C. L.; POL-FACHIN, L. ; BERGAMINI, G. ; VERLI, H. . Prediction of Disaccharides Conformational Ensembles in Solution from Sequence. In: XXXVII Reunião Anual da SBBq, 2008, Águas de Lindóia/SP. XXXVII Reunião Anual da SBBq, 2008.

7.
FERNANDES, C. L.; BECKER, C. F. ; GIESEL, G. M. ; LIMA, M. ; VERLI, H. . The use of molecular dynamics simulations in the refinement of crystallografic structures. In: XXXVI Annual meeting of the brazilian society for biochemistry and molecular biology, 2007, Salvador. XXXVI Annual Meeting Program 2007, 2007. p. 106-106.

8.
ALMEIDA, Sabrina Esteves de Matos ; SPERHACKE, R. D. ; BREDA, Ardala ; FERNANDES, C. L. ; ROSSETTI, Maria Lúcia Rosa ; CORTEZ-HERRERA, Elizabeth ; BACIN, T. ; RODRIGUES, Rosângela ; BRÍGIDO, Luís Fernando . Hiv-1 subtype analysis at Rio Grande do Sul. In: XXIII Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2005, Santos- SP, 2005.

9.
FERNANDES, C. L.; SANTOS, D. S. ; BASSO, L. A. ; SOUZA, O. N. . STRUCTURE PREDICTION AND DOCKING STUDIES OF CHORISMATE SYNTHASE FROM Mycobacterium tuberculosis. In: SBBq 2004 - XXXIII Reunião Anual, 2004, Caxambu -MG. Programa e Resumos, 2004.

10.
THOMPSON, C. E. ; FERNANDES, C. L. ; SOUZA, O. N. ; SALZANO, Francisco Mauro ; BONATTO, Sandro Luís ; FREITAS, Loreta Brandão de . Métodos de Máxima Verossimilhança e Modelagem Molecular Comparativa por Homologia no estudo da Evolução Molecular das Proteínas de Defesa do Grupo PR5 em Plantas.. In: XIV Encontro de Geneticistas do Rio Grande do Sul, 2004, Porto Alegre, 2004.

11.
THOMPSON, C. E. ; FERNANDES, C. L. ; SOUZA, O. N. ; SALZANO, Francisco Mauro ; MENEGHINI, Rogério ; FREITAS, Loreta Brandão de . Comparative Modelling by Homology in the study of the Molecular Evolution of the Pathognesis-Related Protein 5. In: First Latin American Protein Society Meeting, 2004, Angra dos Reis, 2004.

12.
FERNANDES, C. L.; SCHROEDER, E. K. ; SANTOS, D. S. ; BASSO, L. A. ; SOUZA, O. N. . STRUCTURE PREDICTION AND INHIBITOR DOCKING STUDIES OF KasA AND KasB ENZYMES FROM Mycobacterium tuberculosis. In: SBBq 2003 - XXXII Reunião Anual, 2003, Caxambú - MG. Programa e Resumos, 2003.

13.
FERNANDES, C. L.; SCHROEDER, E. K. ; SANTOS, D. S. ; BASSO, L. A. ; SOUZA, O. N. . HOMOLOGY MODELING OF KasA AND KasB ENZYMES FROM Mycobacterium tuberculosis AND INHIBITOR DOCKING STUDIES WITH CERULENIN AND THIOLACTOMYCIN. In: V Ibero-American Congress of Biophysics, 2003, Rio de Janeiro -RJ. V Ibero-American Congress of Biophysics, 2003.

14.
FERNANDES, C. L.; OLIVEIRA, J. S. ; SCHROEDER, E. K. ; BASSO, L. A. ; SANTOS, D. S. ; SOUZA, O. N. . Genômica e bioinformática estrutural: utilizando a EPSP Sintase de Mycobacterium tuberculosis como alvo para o desenho de novos fármacos antituberculose. In: Escola de modelagem molecular em sistemas biológicos, 2002, Rio de Janeiro, 2002.

15.
FERNANDES, C. L.; OLIVEIRA, J. S. ; SCHROEDER, E. K. ; BASSO, L. A. ; SANTOS, D. S. ; SOUZA, O. N. . Genômica e Bioinformática estrutural: utilizando a EPSP Sintase de Mycobacterium tuberculosis como alvo para o desenho de novos fármacos antituberculose. In: XII Encontro de geneticistas do Rio Grande do Sul, 2002, Porto Alegre, 2002.

16.
KOLBERG, M. L. ; FERNANDES, C. L. ; SCHROEDER, E. K. ; BASSO, L. A. ; SANTOS, D. S. ; SOUZA, O. N. . EXPLORANDO GENÔMICA E BIOINFORMÁTICA PARA DESCOBRIR DOMÍNIOS FUNCIONAIS NA CORISMATO SINTASE DE Mycobacterium tuberculosis. In: XII Encontro de geneticistas do Rio Grande do Sul, 2002, Porto Alegre, 2002.



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
VERLI, H.; FERNANDES, C. L.. Participação em banca de Carla de Carvalho Aguiar. Caracterização da dinâmica da complexação do receptor tipo Toll 4 humano a MD-2. 2013. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Trabalhos de conclusão de curso de graduação
1.
Fernandes, Claudia Lemelle. Participação em banca de Pedro Magno Mentges.Docking de inibidores planejados da trombina derivados do ácido glicirrético. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Farmácia) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

2.
VERLI, H.; FERNANDES, C. L.. Participação em banca de Eduarda Schultze.Análise conformacional das propriedades anticoagulantes de saponinas. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biomedicina) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

3.
VERLI, H.; FERNANDES, C. L.. Participação em banca de Laércio Pol Facchin.Characterization of the structure and flexibility of heparin using molecular dynamics simulations. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biomedicina) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.




Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
XLII Reunião anual SBBq. Cryptococcus neoformans Capsule: Structural Biology Study by Molecular and Meta Dynamics Simulations. 2013. (Congresso).

2.
XLI Reunião anual SBBq. 2012. (Congresso).

3.
XXXIX Annual meeting of SBBq. 2010. (Congresso).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
Fernandes, C.L.. XIV Reunião Anual do Programa de pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular. 2012. (Congresso).




Página gerada pelo Sistema Currículo Lattes em 11/12/2018 às 24:30:37