Jorge Guerra Pires

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  • Última atualização do currículo em 08/05/2018


I have accomplished my bachelor degree in Production Engineering (Engenharia de Produção), awarded by Federal University of Ouro Preto (UFOP, Universidade Federal de Ouro Preto, Brasil). My main focus was optimization, mainly mathematical-computational models (2005-2009). I have attended my master degree in science on the framework of the double diploma programme between Italy (University of L'Aquila) and Poland (Gdansk University of Technology): recognized in Brazil by USP as bioinformatics. I have focused on Systems Biology and Computational Intelligence (2010-2012), however the programme provided a strong background in physics and mathematics. I have accomplished my PhD in Information Engineering (focused on biomathematics), recognized by USP as Bioinformatics (2014-2017). (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Jorge Guerra Pires
Nome em citações bibliográficas
PIRES, J. G.;PIRES, J.G.;PIRES, JORGE GUERRA


Formação acadêmica/titulação


2014 - 2017
Doutorado em Ingegneria e scienze dell'informazione.
Università degli Studi dell'Aquila, UNIVAQ, Itália.
Título: Mathematical modeling in energy homeostasis, appetite control and food intake with a special attention to ghrelin, Ano de obtenção: 2017.
Orientador: Costanzo Manes.
Coorientador: Pasquale Palumbo.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Palavras-chave: ghrelin; mathematical physiology; mathematical biology; hormonal control; leptin; insulin.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
2010 - 2012
Mestrado em Technical physics.
Gdansk University of technology, GUT, Polônia.
Título: On the applicability of computational Intelligence in transcription network modelling,Ano de Obtenção: 2012.
Orientador: Pasquale Palumbo.
Coorientador: Amabile Tatone.
Palavras-chave: Gene Expression; Systems Biology; Computational Intelligence; Numerical Simulations; Neural Networks.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Engenharias / Área: Engenharia Biomédica / Subárea: Bioengenharia / Especialidade: Modelagem de Fenômenos Biológicos.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Systems Biology.
2010 - 2012
Mestrado em Mathematical Engineering.
University of L'Aquila, UAQ, Itália.
Título: On the applicability of Computational Intelligence in Transcription Networks Modeling,Ano de Obtenção: 2012.
Orientador: Pasquale Palumbo.
Coorientador: Amabile Tatone.
Palavras-chave: Systems Biology; Numerical Simulations; Gene Expression; Neural Networks; Modelagem matemática.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Engenharias / Área: Engenharia Biomédica / Subárea: Bioengenharia / Especialidade: Modelagem de Fenômenos Biológicos.
2005 - 2009
Graduação em Engenharia de Produção.
Universidade Federal de Ouro Preto, UFOP, Brasil.
Título: Engenharia do produto: desenvolvimento de um filme para auxiliar profissionais das áreas médica e médica no tratamento correto da icterícia.
Orientador: Prof. Dra. Andrea Gomes Campos Bianchi.




Formação Complementar


2016 - 2016
The Interplay Between Big Data and Sparsity in Control and Systems Identifi. (Carga horária: 20h).
Centrale Supelec, SACLAY, França.
2016 - 2016
Tools for nonlinear control, Lyapunov function, positivity, applications. (Carga horária: 21h).
University of L'Aquila, UAQ, Itália.
2016 - 2016
1st SYSBIO.IT School on Computational Systems Biology. (Carga horária: 15h).
Università degli Studi Milano-Bicocca, UNIMIB, Itália.
2015 - 2015
Mathematical Thermodynamics of complex fluids. (Carga horária: 21h).
Centro Internazionale Matematico Estivo, CIME, Itália.
2013 - 2013
An introduction to swarm intelligence. (Carga horária: 4h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2013 - 2013
On natural Computation. (Carga horária: 2h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2013 - 2013
Redes Neurais Artificiais. (Carga horária: 2h).
BRICS-CCI & CBIB 2013, BRICS-CCI & CBIB, Brasil.
2013 - 2013
Controle de sistemas inteligentes. (Carga horária: 2h).
BRICS-CCI & CBIC 2013, BRICS-CCI & CBIC, Brasil.
2013 - 2013
Spiking Neural Networks.
Pontifíca Universidade do Rio de Janeiro, PUC-RIO, Brasil.
2013 - 2013
Dynamics in Complex Networks. (Carga horária: 64h).
Instituto de Estudos Avançados - USP, IEA-USP, Brasil.
2012 - 2012
Intensive programme in biofluids.
University of L'Aquila, UAQ, Itália.


Atuação Profissional



Institute of Systems Analysis and Computer Science Biomathematics Laborator, IASI-CNR, Itália.
Vínculo institucional

2014 - 2017
Vínculo: Scholarship, Enquadramento Funcional: PhD student, Regime: Dedicação exclusiva.



Projetos de pesquisa


2014 - 2017
Ghrelin mathematical modeling
Descrição: Insulin has been the only well understood hormones so far. In this project we aim at designing a more complete picture regarding energy homeostasis, that is to say, linking ghrelin, insulin, and leptin mathematically..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Quantitativa.
2.
Grande área: Engenharias / Área: Engenharia de Produção / Subárea: Pesquisa Operacional/Especialidade: Programação Linear, Não-Linear, Mista e Dinâmica.
3.
Grande área: Engenharias / Área: Engenharia de Produção / Subárea: Engenharia do Produto/Especialidade: Desenvolvimento de Produto.
4.
Grande área: Engenharias / Área: Engenharia Biomédica / Subárea: Bioengenharia/Especialidade: Modelagem de Sistemas Biológicos.
5.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Systems Biology.
6.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Engenharia Elétrica / Subárea: Computational Intelligence.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Italiano
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Polonês
Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente.
Espanhol
Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Bem.


Prêmios e títulos


2018
Migliori tesi di dottorato di ricerca in discipline biomediche (best PhD thesis in biomedical disciplines), Fondazione Abruzzese per le Scienze della Vita ONLUS (FASVO).
2014
Best articles in teaching in engineering, UNESP-SIMPEP.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
3PIRES, J. G.;PIRES, J.G.;PIRES, JORGE GUERRA2017PIRES, J. G.. Taste and the regulation of food intake: insights and comments. REVISTA GESTÃO & SAÚDE (BRASÍLIA), v. 8, p. 180-195-195, 2017.

2.
1PIRES, J.G.2017PIRES, J.G.; BORRI, A. ; De Gaetano, A. ; MANES, C. ; PALUMBO, P. . A short-term dynamical model for ghrelin. IFAC-PAPERSONLINE, v. 50, p. 11011-11016, 2017.

3.
4PIRES, J. G.;PIRES, J.G.;PIRES, JORGE GUERRA2015PIRES, J. G.. Fisiologia matem?tica, biologia matem?tica, e biomatem?tica: leptina e a busca pelo controle de peso. REVISTA GESTÃO & SAÚDE (BRASÍLIA), v. 6, p. 2982, 2015.

4.
5PIRES, J. G.;PIRES, J.G.;PIRES, JORGE GUERRA2015PIRES, J. G.. Uma Iniciação às Equações Diferenciais Estocásticas: discussões e insights sem minudência matemática. Anais - SIMPEP, v. XXII, p. 1-15, 2015.

5.
8PIRES, J. G.;PIRES, J.G.;PIRES, JORGE GUERRA2014PIRES, J. G.. Biomechanics, computational Intelligence, and systems biology with application on vitreous dynamics using Java: An incipient discussion. Academia Journal of Scientific Research, v. 2, p. 007-018, 2014.

6.
6PIRES, J. G.;PIRES, J.G.;PIRES, JORGE GUERRA2014PIRES, J. G.; MANES, C. ; Palumbo, P. . On the importance of optimal control theory in engineering sciences as a complementary and supplementary methodology to Operations Research: a case-study analysis. Anais - SIMPEP, v. XXI, p. 1, 2014.

7.
2PIRES, J. G.;PIRES, J.G.;PIRES, JORGE GUERRA2014PIRES, J. G.; MAGGIO, R. ; MANES, C. ; Palumbo, P. . Engineering Sciences: pharmacokinetics and pharmacodynamics as an inter- and multidisciplinary field. Revista Eletrônica Gestão & Saúde, v. 6, p. 1055-67, 2014.

8.
7PIRES, J. G.;PIRES, J.G.;PIRES, JORGE GUERRA2014PIRES, J. G.; MAGGIO, R. ; MANES, C. ; Palumbo, P. . On the importance of pharmacokinetics and pharmacodynamics in engineering sciences as an inter- and multidisciplinary field: an introductory analysis. Anais - SIMPEP, v. XXI, p. 1, 2014.

Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1.
PIRES, JORGE GUERRA. Neural Networks in Transcription Networks: An Alternative and Complementary Approach for the Observer-Based Method. In: 2013 BRICS Congress on Computational Intelligence & 11th Brazilian Congress on Computational Intelligence (BRICSCCI & CBIC), 2013, Ipojuca. 2013 BRICS Congress on Computational Intelligence and 11th Brazilian Congress on Computational Intelligence, 2013. p. 282.

2.
PIRES, J. G.. ON THE IMPORTANCE OF BIOLOGY IN ENGINEERING SCIENCES: BIOMATHEMATICS AND BIOENGINEERING SCIENCES. In: SIMPEP (Simpósio de Engenharia de Produção), 2013, Bauru. Anais SIMPEP. Bauru: SIMPEP, 2013. v. XX. p. 1-12.

3.
PIRES, J. G.; Palumbo, P. . Software Engineering: Designing a program based on Computational Intelligence applied to Transcription Network Modeling. In: SIMPEP (Simpósio de Engenharia de Produçõa), 2012, Bauru, São Paulo. GESPRO. Bauru: UNESP, 2012. v. XIX.

4.
PIRES, J. G.. Design and Development of New Products: Modeling the Vitreous Dynamics. In: SIMPEP (Simpósio de Engenharia de Produçõa), 2012, Bauru, São Paulo. GESPRO. Bauru: UNESP, 2012. v. XIX.

5.
PIRES, J. G.; DUARTE, ANDRÉ SILVEIRA ; BIANCHI, RODRIGO FERNANDO ; SANTOS, ZIRLENE ALVES DA SILVA ; BIANCHI, Andrea . PROJETO E DESENVOLVIMENTO DE PRODUTO: PROPOSTA E DESENVOLVIMENTO DE DISPOSITIVO ELETRÔNICO ORGÂNICO PARA AUXILIAR NO TRATAMENTO DA ICTERÍCIA. In: SIMPEP, 2009, Bauru. SIMPEP, 2009.

6.
PIRES, J. G.. DESENVOLVIMENTO DE UM PROGRAMA BASEADO EM OTIMIZAÇÃO PARA O PROBLEMA DE MISTURA. In: SIMPEP, 2009, Bauru. Simpósio de Engenharia de Produção. Bauru: UNESP, 2009. v. XVI.

Apresentações de Trabalho
1.
PIRES, J. G.; Di Marco Antinisca ; MASEDU, F.Masedu . Introduction to Matlab for medical doctors and biologists. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

2.
PIRES, J. G.. A hybrid algorithm for parameter estimation of the ghrelin dynamics based on in vivo data. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

3.
PIRES, J. G.. A crash course in biomathematics: a tutorial. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

4.
PIRES, J. G.. Neural Networks in Transcription Networks: An alternative and complementary approach for the observer-based method. 2013. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

5.
PIRES, J. G.. On the mathematical modelling in gene expression estimation. 2013. (Apresentação de Trabalho/Outra).

6.
PIRES, J. G.. NA IMPORTÂNCIA DA BIOLOGIA EM ENGENHARIAS: BIOMATEMÁTICA E BIOENGENHARIAS. 2013. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

7.
PIRES, J. G.. Planejamento e desenvolvimento de Novos Produtos: Modelando a dinâmica do Vítreo. 2012. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

8.
PIRES, J. G.; Palumbo, P. . Software Enginnering: Design and development of program based on computational intelligence applied to transcription networks. 2012. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

9.
PIRES, J. G.. On the applicability of Computational Intelligence in Transcription Network Modeling: Designing a Neural Network for Transcription Networks. 2012. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

10.
PIRES, J. G.. Algumas discussões em Redes Biológicas: Teoria, perspectivas e aplicações. 2012. (Apresentação de Trabalho/Outra).

11.
PIRES, J. G.. DESIGNING A NEURAL NETWORK FOR TRANSCRIPTION NETWORKS WITH A SUGGESTIVE REFERENCE TO BIOFLUID DYNAMICS. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

12.
PIRES, J. G.. Neural Computing: designing a neural network for transcription network. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

13.
PIRES, J. G.; Felipe Campelo ; GUIMARAES., F. G. . Mutação por Matriz de Covariância Amostral da População em Estratégias Evolutivas. 2009. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

14.
PIRES, J. G.; BIANCHI, Andrea . MODELAGEM FÍSICO-MATEMÁTICA DE UM DISPOSITIVO AUXILIAR NO TRATAMENTO DA ICTERÍCIA. 2009. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

15.
PIRES, J. G.; DUARTE, ANDRÉ SILVEIRA ; BIANCHI, RODRIGO FERNANDO ; SANTOS, ZIRLENE ALVES DA SILVA ; BIANCHI, Andrea . Design and Development of New products: proposal and development of a electronic device for assisting in the neonatal jaundice treatment?. 2009. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

16.
PIRES, J. G.. Development of Program based on the blend problem. 2009. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

Outras produções bibliográficas
1.
DUARTE, ANDRÉ SILVEIRA ; PIRES, J. G. ; Vasconcelos, Cláudia K. ; Ferreira, Giovana R. ; BIANCHI, RODRIGO FERNANDO ; BIANCHI, Andrea . Blue-light dosimeter based on luminescent polymers and measuring device 2009 (Demostração).


Produção técnica
Redes sociais, websites e blogs
1.
PIRES, J. G.. Linkedin. 2015; Tema: General. (Rede social).

2.
PIRES, J. G.. ResearchGate. 2015; Tema: Scientific papers and discussions. (Rede social).

3.
PIRES, J. G.. Academia Edu. 2015; Tema: Scientific papers and discussions. (Rede social).

4.
PIRES, J. G.. Ghrelin, Insulin, and Leptin: a mathematical model approach. 2015; Tema: My current research as a PhD student. (Blog).

5.
PIRES, J. G.. Ghrelin, leptin, and insulin. 2015; Tema: My PhD research. (Rede social).

6.
PIRES, J. G.. Biologia Sistêmica. 2014; Tema: Biologia Sistêmica. (Blog).

7.
PIRES, J. G.. Systems Biology and Learning Machine. 2014; Tema: Systems biology, computational intelligence. (Blog).

8.
PIRES, J. G.. Stochastic models in life sciences and medicine. 2014; Tema: Stochastic models. (Blog).

9.
PIRES, J. G.. Jorge G Pires (Main). 2014; Tema: Short publications, papers, and miscellaneous topics, general purposes. (Blog).


Demais tipos de produção técnica
1.
PIRES, J. G.; Di Marco Antinisca ; MASEDU, F.Masedu . Introduction to Matlab for medical doctors and biologists. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

2.
PIRES, J. G.; Pietrantoni, I ; MAGGIO, R. .  Design and development of new products: a crash course in biomathematics . 2016. (Poster).

3.
PIRES, J. G.; Borri, A ; MANES, C. ; Palumbo, P. ; De Gaetano, A. . A Mathematical Model for Ghrelin: energy homeostasis and appetite control. 2016. (Poster).



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
2016 joint meeting of the European Society for Mathematical and Theoretical Biology and the Society for Mathematical Biology. "A Mathematical Model for Ghrelin: energy homeostasis and appetite control"/"Design and development of new products: a crash course in biomathematics". 2016. (Congresso).

2.
Poster week.On the mathematical modeling in gene expression estimation: an initial discussion on PBM and BM. 2016. (Oficina).

3.
Thursday Morning Science TMS.A Mathematical Model for Ghrelin: Energy homeostasis and appetite control. 2016. (Encontro).

4.
17th Portuguese Conference on Artificial Intelligence. 2015. (Congresso).

5.
The 1st SyBSyM Lake Como School, Systems Biology and Systems Medicine: precision biotechnology and therapies.On the mathematical modeling in gene expression estimation: an initial discussion on PBM and BM. 2014. (Outra).

6.
Bioinformatics and Compiutational Intelligence. 2013. (Simpósio).

7.
BRICS-CCI & CBIC 2013. Neural Networks in Transcription Networks: An alternative and complementary approach for the observer-based method. 2013. (Congresso).

8.
Complex Systems Symposium. 2013. (Simpósio).

9.
II Workshop and School on Dynamics, Transport and Control in Complex Networks ? ComplexNet.On the mathematical modelling in gene expression estimation. 2013. (Outra).

10.
Mathematical Models and Methods for Living Systems.On the mathematical modeling in gene expression estimation: an initial discussion on PBM and BM. 2013. (Outra).

11.
Intensive Programme on Biofluid.Designing a neural network for transcription Networks. 2012. (Seminário).

12.
SIMPEP (Simpósio de Engenharia de Produção).Papers accepted. 2012. (Simpósio).

13.
1º escola luso-brasileira de computação evolutiva. Mutação por Matriz de Covariância Amostral da População em Estratégias Evolutivas. 2009. (Congresso).

14.
IX Encontro brasileiro de Redes Neurais. 2009. (Congresso).

15.
XVI SIMPEP.DESENVOLVIMENTO DE UM PROGRAMA BASEADO EM OTIMIZAÇÃO PARA O PROBLEMA DE MISTURA. 2009. (Simpósio).

16.
XVI SIMPEP.PROJETO E DESENVOLVIMENTO DE PRODUTO: PROPOSTA E DESENVOLVIMENTO DE DISPOSITIVO ELETRÔNICO ORGÂNICO PARA AUXILIAR NO TRATAMENTO DA ICTERÍCIA. 2009. (Simpósio).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
PIRES, J. G.; Di Marco Antinisca ; MASEDU, F.Masedu ; REIS, A. J. R. . Computational Intelligence and Biomathematics. 2017. (Outro).



Orientações



Orientações e supervisões concluídas
Orientações de outra natureza
1.
Taisiya Shepelyuk. 2016 SMB/ECMTB mentoring programme. 2016. Orientação de outra natureza. (2016 joint meeting of the European Society for Mathematical and Theoretica) - University of Nottingham. Orientador: Jorge Guerra Pires.



Inovação



Projetos de pesquisa


Educação e Popularização de C & T



Artigos
Artigos completos publicados em periódicos
1.
8PIRES, J. G.;PIRES, J.G.;PIRES, JORGE GUERRA2014PIRES, J. G.. Biomechanics, computational Intelligence, and systems biology with application on vitreous dynamics using Java: An incipient discussion. Academia Journal of Scientific Research, v. 2, p. 007-018, 2014.

2.
3PIRES, J. G.;PIRES, J.G.;PIRES, JORGE GUERRA2017PIRES, J. G.. Taste and the regulation of food intake: insights and comments. REVISTA GESTÃO & SAÚDE (BRASÍLIA), v. 8, p. 180-195-195, 2017.

3.
7PIRES, J. G.;PIRES, J.G.;PIRES, JORGE GUERRA2014PIRES, J. G.; MAGGIO, R. ; MANES, C. ; Palumbo, P. . On the importance of pharmacokinetics and pharmacodynamics in engineering sciences as an inter- and multidisciplinary field: an introductory analysis. Anais - SIMPEP, v. XXI, p. 1, 2014.


Apresentações de Trabalho
1.
PIRES, J. G.. Development of Program based on the blend problem. 2009. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

2.
PIRES, J. G.. Planejamento e desenvolvimento de Novos Produtos: Modelando a dinâmica do Vítreo. 2012. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

3.
PIRES, J. G.; Palumbo, P. . Software Enginnering: Design and development of program based on computational intelligence applied to transcription networks. 2012. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

4.
PIRES, J. G.. On the applicability of Computational Intelligence in Transcription Network Modeling: Designing a Neural Network for Transcription Networks. 2012. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

5.
PIRES, J. G.. Algumas discussões em Redes Biológicas: Teoria, perspectivas e aplicações. 2012. (Apresentação de Trabalho/Outra).

6.
PIRES, J. G.. Neural Computing: designing a neural network for transcription network. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

7.
PIRES, J. G.. On the mathematical modelling in gene expression estimation. 2013. (Apresentação de Trabalho/Outra).

8.
PIRES, J. G.; Di Marco Antinisca ; MASEDU, F.Masedu . Introduction to Matlab for medical doctors and biologists. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).


Cursos de curta duração ministrados
1.
PIRES, J. G.; Di Marco Antinisca ; MASEDU, F.Masedu . Introduction to Matlab for medical doctors and biologists. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Outra).


Redes sociais, websites e blogs
1.
PIRES, J. G.. Biologia Sistêmica. 2014; Tema: Biologia Sistêmica. (Blog).

2.
PIRES, J. G.. Systems Biology and Learning Machine. 2014; Tema: Systems biology, computational intelligence. (Blog).

3.
PIRES, J. G.. Stochastic models in life sciences and medicine. 2014; Tema: Stochastic models. (Blog).

4.
PIRES, J. G.. Linkedin. 2015; Tema: General. (Rede social).

5.
PIRES, J. G.. ResearchGate. 2015; Tema: Scientific papers and discussions. (Rede social).

6.
PIRES, J. G.. Academia Edu. 2015; Tema: Scientific papers and discussions. (Rede social).

7.
PIRES, J. G.. Ghrelin, Insulin, and Leptin: a mathematical model approach. 2015; Tema: My current research as a PhD student. (Blog).

8.
PIRES, J. G.. Ghrelin, leptin, and insulin. 2015; Tema: My PhD research. (Rede social).

9.
PIRES, J. G.. Jorge G Pires (Main). 2014; Tema: Short publications, papers, and miscellaneous topics, general purposes. (Blog).



Outras informações relevantes


PhD validated by USP in Bioinformatics. 

Areas of interest:

1° group: Artificial Intelligence; Artificial Neural Networks; Machine Learning; Systems Biology;      bio-mathematics; continuum biomechanics; Systems Biology; Biomechanics; Molecular Dynamics; Finite Element Method (FEM). 
2° group: Traditional Optimization; Stochastic Search (Natural Computation); Software Engineering; Mathematics; physics; computational physics. . 
3° group: Theoretical Mathematics; Theoretical physics; Theoretical Chemistry.



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