Giovanni Marques de Castro

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  • Última atualização do currículo em 26/09/2017


Formado em Bacharelado em Biotecnologia pelo Centro de Ciências Agrárias(CCA) da Universidade Federal de São Carlos (UFSCar). Com Mestrado em Genética e Biologia Molecular na área de concentração em Bioinformática pela Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) realizado em colaboração com a Embrapa Informática Agropecuária sob orientação do Prof. Dr. Felipe Rodrigues da Silva e coorientação do Prof. Dr. Francisco Pereira Lobo no Laboratório Multiusuário de Bioinformática (LMB). Atualmente cursando o doutorado na Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG) no programa de bioinformática sob orientação do Prof. Dr. Francisco Pereira Lobo. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Giovanni Marques de Castro
Nome em citações bibliográficas
CASTRO, G. M.;DE CASTRO, GIOVANNI M.;DE CASTRO, GIOVANNI MARQUES;DE CASTRO, G.M.

Endereço


Endereço Profissional
Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Informática Agropecuária.
Avenida André Tosello
Cidade Universitária
13083886 - Campinas, SP - Brasil
Telefone: (19) 32115779


Formação acadêmica/titulação


2016
Doutorado em andamento em Bioinformática.
Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.
Título: Identificação de genes transferidos lateralmente em procariotos,
Orientador: Francisco Pereira Lobo.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
2013 - 2015
Mestrado em Genética e Biologia Molecular.
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Título: Identificação da quasispecies Papaya ringspot vírus em uma biblioteca de cDNA de Fevillea cordifolia,Ano de Obtenção: 2015.
Orientador: Felipe Rodrigues da Silva.
Coorientador: Francisco Pereira Lobo.
Bolsista do(a): Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, EMBRAPA, Brasil.
Palavras-chave: quasiespécies; variantes; haplótipos; transcriptoma; andiroba-de-rama; fevilha.
Grande área: Ciências Biológicas
2009 - 2013
Graduação em Biotecnologia.
Universidade Federal de São Carlos, UFSCAR, Brasil.
2006 - 2010
Curso técnico/profissionalizante.
Escola Técnica Estadual Getúlio Vargas, ETEC GV, Brasil.




Formação Complementar


2016 - 2016
I Curso de Verão em Bioinformática ("Metagenômica: conceitos e aplicações"). (Carga horária: 70h).
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
2014 - 2014
Análise de amplicons 16S rRNA por meio da ferram... (Carga horária: 21h).
Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, EMBRAPA, Brasil.
2013 - 2013
Análise de dados de RNA-seq usando o Galaxy. (Carga horária: 13h).
Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, EMBRAPA, Brasil.
2011 - 2011
III Curso de Bioinformática. (Carga horária: 30h).
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.


Atuação Profissional



Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, EMBRAPA, Brasil.
Vínculo institucional

2015 - 2016
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: DTI-B - Analista bioinformata, Carga horária: 40

Vínculo institucional

2013 - 2015
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Mestrando - Analista bioinformata, Carga horária: 30
Outras informações
Bolsista de mestrado

Vínculo institucional

2012 - 2013
Vínculo: Estagiário, Enquadramento Funcional: Estágio - Analista bioinformata, Carga horária: 30, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

05/2014 - 05/2014
Outras atividades técnico-científicas , Embrapa Informática Agropecuária, Embrapa Informática Agropecuária.

Atividade realizada
Monitor do curso "Análise de amplicons 16S rRNA por meio da ferramenta Mothur", Campinas, SP, de 28 a 30 de maio de 2014, carga horaria de 21 horas..
06/2013 - 06/2013
Outras atividades técnico-científicas , Embrapa Informática Agropecuária, Embrapa Informática Agropecuária.

Atividade realizada
Monitor do curso: ?Análise de dados de RNA-seq usando o Galaxy", Embrapa Informática Agropecuária, Campinas, SP, 11 a 12 de Junho de 2013, carga horária de 13 horas..
08/2012 - 02/2013
Estágios , Embrapa Informática Agropecuária, .

Estágio realizado
Busca de genes homologos em Alphaherpesvirus sob seleção positiva..


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Bioinformática.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Português
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
BELESINI, A.A.2017 BELESINI, A.A. ; CARVALHO, F.M.S. ; TELLES, B.R. ; DE CASTRO, G.M. ; GIACHETTO, P.F. ; VANTINI, J.S. ; CARLIN, S.D. ; CAZETTA, J.O. ; PINHEIRO, D.G. ; FERRO, M.I.T. . De novo transcriptome assembly of sugarcane leaves submitted to prolonged water-deficit stress. GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH, v. 16, p. 1-20, 2017.

2.
DE CASTRO, GIOVANNI MARQUES2016 DE CASTRO, GIOVANNI MARQUES; LIMA, MIRTES FREITAS ; FONSECA, MARIA ESTHER N. ; BOITEUX, LEONARDO SILVA ; LOBO, FRANCISCO PEREIRA ; DA SILVA, FELIPE RODRIGUES ; RECH, ELIBIO L. . First Report of Papaya ringspot virus-type W Infecting Fevillea species (Cucurbitaceae) in South America. Plant Disease, v. 100, p. PDIS-05-16-0662-PDN, 2016.

3.
HONGO, JORGE A.2015 HONGO, JORGE A. ; DE CASTRO, GIOVANNI M. ; CINTRA, LEANDRO C. ; ZERLOTINI, ADHEMAR ; LOBO, FRANCISCO P. . POTION: an end-to-end pipeline for positive Darwinian selection detection in genome-scale data through phylogenetic comparison of protein-coding genes. BMC Genomics, v. 16, p. 1-16, 2015.

Apresentações de Trabalho
1.
DE CASTRO, GIOVANNI M.; ZERLOTINI, ADHEMAR ; YAMAGISH, M. E. B. . Reconstructing the Whole Mitochondrial DNA (mtDNA) from Nuclear Genome. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

2.
Hongo, J.A. ; DE CASTRO, GIOVANNI M. ; CINTRA, LEANDRO C. ; ZERLOTINI, ADHEMAR ; LOBO, F.P. . POTION: an end-to-end pipeline for positive Darwinian selection detection in genome-scale data through phylogenetic comparison of protein-codin genes. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

3.
CASTRO, G. M.; LOBO, F.P. ; BOITEUX, L. S. ; Fonseca, M. E. N. ; RECH FILHO, E. L. ; da Silva, F. R. . Finding the unexpected: RNA-seq and Potyvirus in plants. 2014. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

4.
CASTRO, G. M.; Hongo, J.A. ; LOBO, F.P. . Positive Selection in Homologous Genes of Alphaherpesviruses. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

5.
PULSCHEN, A. A. ; CASTRO, G. M. ; MENEGUELLO, L. ; TANGANINI, I. C. . Studies with freezing tolerance of a common strain of Chlorella vulgaris: first results.. 2011. (Apresentação de Trabalho/Outra).

6.
PULSCHEN, A. A. ; CASTRO, G. M. ; NAGAI, L. A. E. ; MONTES, R. F. ; BARRETO, R. G. ; ROCHA, G. H. B. . Estudos de classificação, criptobiose, manuseio e sobrevivência de Tardigrados limno-terrestres da região de Araras-SP. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
10 anos de Biotecnologia: Permuta e Simpósio do Centro de Ciências Agrárias da UFSCar, campus Araras.Biotecnologia da graduação até agora. 2016. (Simpósio).

2.
X-Meeting 2015 - 11th International Conference of the AB3C + Brazilian Symposium of Bioinformatics. Reconstructing the Whole Mitochondrial DNA (mtDNA) from Nuclear Genome. 2015. (Congresso).

3.
X-Meeting 2015 - 11th International Conference of the AB3C + Brazilian Symposium of Bioinformatics. POTION: an end-to-end pipeline for positive Darwinian selection detection in genome-scale data through phylogenetic comparison of protein-codin genes. 2015. (Congresso).

4.
ISCB Latin American X-meeting on Bioinformatics with BSB & SoiBio 2014. Finding the unexpected: RNA-seq and Potyvirus in plants. 2014. (Congresso).

5.
8th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology - X-Meeting. Positive selection in homologous genes of Alphaherpesviruses.. 2012. (Congresso).

6.
III Curso de Bioinformática: "Algoritmos e Técnicas Computacionais para Montagem e Análise de Genomas. 2011. (Oficina).

7.
I Seminário de Biofábrica Produção Industrial de Plantas "in vitro". 2010. (Seminário).




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