Gabriela Bettella Cybis

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  • Última atualização do currículo em 20/06/2018


É professora do Departamento de estatística da Universidade Federal do Rio Grande do Sul. Possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade Federal do Rio Grande do Sul (2007), mestrado em Matemática pela Universidade Federal do Rio Grande do Sul (2009) e mestrado em Biomathematica pela University of California, Los Angeles (2010) e doutorado em Biomathematica pela University of California, Los Angeles (2014). (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Gabriela Bettella Cybis
Nome em citações bibliográficas
CYBIS, G. B.;CYBIS, GABRIELA B;CYBIS, GABRIELA B.

Endereço


Endereço Profissional
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Instituto de Matemática, Departamento de Estatística.
Universidade Federal do Rio Grande do Sul - Campus do Vale
Agronomia
91509900 - Porto Alegre, RS - Brasil
Telefone: (51) 33086178


Formação acadêmica/titulação


2009 - 2014
Doutorado em PhD in Biomathematics.
University of California, Los Angeles, UCLA, Estados Unidos.
Título: Phenotypic Bayesian phylodynamics: hierarchical graph models, antigenic clustering and latent liabilities, Ano de obtenção: 2014.
Orientador: Marc Suchard.
Coorientador: Janet S. Sinsheimer.
Bolsista do(a): The International Fulbright Science and Technology Award, FULBRIGHT-S&T, Estados Unidos.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Matemática / Subárea: Matemática Aplicada / Especialidade: Bioestatística.
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Química Orgânica / Especialidade: Evolução, Sistemática e Ecologia Química.
2009 - 2010
Mestrado em Master in Biomathematics.
University of California, Los Angeles, UCLA, Estados Unidos.
Título: [],Ano de Obtenção: 2010.
Orientador: Marc Suchard.
Coorientador: Janet S. Sinsheimer.
Bolsista do(a): The International Fulbright Science and Technology Award, FULBRIGHT-S&T, Estados Unidos.
2007 - 2009
Mestrado em Matemática.
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.
Título: (),Ano de Obtenção: 2009.
Orientador: Silvia da Costa Regina Lopes.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
2003 - 2007
Graduação em Licenciatura em Ciências Biológicas.
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio Grande do Sul, FAPERGS, Brasil.
2003 - 2007
Graduação em Bacharelado em Ciências Biológicas.
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.
Título: Dinâmica de Hemócitos cirvulantes em Larvas de Chrysomya megacephala.
Orientador: Carlos Eugênio Silva.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio Grande do Sul, FAPERGS, Brasil.




Formação Complementar


2011 - 2011
Summer Inst. Stat. and Modeling Infectious Disease. (Carga horária: 40h).
University of Washington, WASHINGTON, Estados Unidos.
2007 - 2007
Extensão universitária em Simpósio Gaucho sobre Terapia Gênica e Celular. (Carga horária: 16h).
Hospital de Clínicas de Porto Alegre, HCPA, Brasil.
2006 - 2006
Introdução à modelagem Físico-Biológica. (Carga horária: 48h).
Instituto Nacional de Matemática Pura e Aplicada, IMPA, Brasil.
2003 - 2005
Iniciação Científica Matemática para Biociências. (Carga horária: 800h).
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.


Atuação Profissional



Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.
Vínculo institucional

2013 - Atual
Vínculo: , Enquadramento Funcional: Professor, Regime: Dedicação exclusiva.


University of California, Los Angeles, UCLA, Estados Unidos.
Vínculo institucional

2015 - 2015
Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Visiting Professor
Outras informações
Disciplina ministrada na pós-graduação em biomatemática: BIOMATH 203 - Stochastic Models in Biology. // Projeto de Pesquisa desenvolvido durante a visita: Métodos filodinâmicos para estudos de correla ções evolutivas em agentes infecciosos


University of California, Los Angeles, UCLA, Estados Unidos.
Vínculo institucional

2012 - 2013
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Teaching assistent, Carga horária: 20
Outras informações
Institute for Society and Genetics Graduate Fellowship. Teaching assistant nas disciplinas - Society and Genetics 5 (Integrative Approaches to Human Biology and Society) e Society and Genetics M102 (Societal and Medical Issues in Human Genetics)

Vínculo institucional

2011 - 2011
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Teaching Assistant
Outras informações
Senior Teaching Assistant (Disciplina de Pós Graduação) Biomathematics 207b/ Biostatistics 237/Human Genetics 207b (Applied Genetic Modeling)


FK Biotecnologia, FK, Brasil.
Vínculo institucional

2007 - 2007
Vínculo: Estagiário, Enquadramento Funcional: Estagiário em Laboratório, Carga horária: 25
Outras informações
Trabalhando com produção de anticorpos monoclonais



Projetos de pesquisa


2018 - Atual
Statistical methods for analyzing the genetic epidemiology of Influenza
Descrição: Primeira chamada pública - Instituto Serrapilheira.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (1) .
Integrantes: Gabriela Bettella Cybis - Coordenador.
2017 - Atual
Métodos estatísticos para dados genéticos e suas estruturas de dependência
Descrição: Projeto de Pesquisa em Atendimento ao Edital ARD/FAPERGS 01/2017.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.


Revisor de periódico


2014 - Atual
Periódico: The Annals of Applied Statistics
2013 - Atual
Periódico: Bioinformatics


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Filogenias byesianas/ Filodinâmica.
2.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Biomatemática.
3.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Processos Estocásticos.
4.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Bioestatística.
5.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Modelagem matemática em imunologia.


Idiomas


Alemão
Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.
Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.


Prêmios e títulos


2014
ISBA 2014 travel award, International Society for Bayesian Analysis.
2013
Dissertation Year Fellowship, UCLA graduate Division.
2013
Carol Newton Travel Award (UCLA), Carol M. Newton Fund.
2012
Junior Travel Award, International Society for Bayesian Analysis.
2012
UCLA Institute for Society and Genetics Graduate Fellowship, UCLA Institute for Society and Genetics.
2009
Medalha de Ouro - IV Simpósio Nacional / Jornadas de Iniciação Científica, IMPA - INSTITUTO NACIONAL DE MATEMÁTICA PURA E APLICADA.
2009
International Fulbright Science and Technology Award, Fulbright.
2006
Prêmio Destaque no XVIII Salão de Iniciação Científica, UFRGS.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
CYBIS, GABRIELA B.2018 CYBIS, GABRIELA B.; VALK, MARCIO ; LOPES, SÍLVIA R. C. . Clustering and classification problems in genetics through U -statistics. JOURNAL OF STATISTICAL COMPUTATION AND SIMULATION, v. 88, p. 1882-1902, 2018.

2.
CYBIS, G. B.2017 CYBIS, G. B.; SINSHEIMER, J. S. ; BEDFORD, TREVOR ; LEMEY, P. ; SUCHARD, A. M. . Bayesian nonparametric clustering in phylogenetics: modeling antigenic evolution in influenza. STATISTICS IN MEDICINE, v. 1097, p. sim.7196, 2017.

3.
RAMOS-FREGONEZI, ALINE MC2015RAMOS-FREGONEZI, ALINE MC ; FREGONEZI, JEFERSON N ; CYBIS, GABRIELA B ; FAGUNDES, NELSON JR ; BONATTO, SANDRO L ; FREITAS, LORETA B . Were sea level changes during the Pleistocene in the South Atlantic Coastal Plain a driver of speciation in Petunia (Solanaceae)?. BMC Evolutionary Biology (Online), v. 15, p. 92, 2015.

4.
CYBIS, GABRIELA B.2015 CYBIS, GABRIELA B.; SINSHEIMER, JANET S. ; BEDFORD, TREVOR ; MATHER, ALISON E. ; LEMEY, PHILIPPE ; SUCHARD, MARC A. . Assessing phenotypic correlation through the multivariate phylogenetic latent liability model. The Annals of Applied Statistics, v. 9, p. 969-991, 2015.

5.
CYBIS, G. B.;CYBIS, GABRIELA B;CYBIS, GABRIELA B.2013 CYBIS, G. B.; SINSHEIMER, J. S. ; LEMEY, P. ; SUCHARD, M. A. . Graph hierarchies for phylogeography. Philosophical Transactions - Royal Society. Biological Sciences (Print), v. 368, p. 20120206-20120206, 2013.

6.
CYBIS, G. B.;CYBIS, GABRIELA B;CYBIS, GABRIELA B.2011 CYBIS, G. B.; LOPES, S. R. C. ; PINHEIRO, H. P. . Power of the likelihood ratio test for models of DNA base substitution. Journal of Applied Statistics, v. 38, p. 2723-2737, 2011.

Textos em jornais de notícias/revistas
1.
CYBIS, G. B.. What can data science tell us about influenza?. The Global Scientist, 03 nov. 2014.

Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1.
CYBIS, G. B.; SINSHEIMER, J. S. ; SUCHARD, A. M. . Family-Style Chinese Restaurant Process: Modeling Antigenic Evolution in Influenza. In: Brazilian Symposium on Bioinformatics, 2012, Campo Grande, MS. BSB & EBB Digital Proceedings, 2012.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
Valk, M ; CYBIS, G. B. ; LOPES, S. . U-statistics based inference in clustering analysis for genetic data. In: Simpósio Nacional de Probabilidade e Estatística, 2016, Porto Alegre. Anais do 22 o Simpósio Nacional de Probabilidade e Estatística, 2016.

2.
Wendt V ; CYBIS, G. B. . Estudo da estimação de correlações entre variáveis fenotípicas pelo modelo logenético de Variável Latente. In: Simpósio Nacional de Probabilidade e Estatística, 2016, Porto Alegre. Anais do 22 o Simpósio Nacional de Probabilidade e Estatística, 2016.

3.
CYBIS, G. B.; SUCHARD, A. M. . Estimating evolutionary correlation between multiple data types through the phylogenetic latent liability model. In: Workshop on mathematical methods and modeling of biophysical phenomena, 2015, Cabo Frio, RJ. Abstracts, 2015.

4.
CYBIS, G. B.. Phylodynamics : integrating multiple sources of data to understand epidemics. In: Regional Conference of Young Scientists of TWAS-ROLAC:Cross-talk of biology with other sciences, 2015, Rio de Janeiro, RJ. Regional Conference of Young Scientists of TWAS-ROLAC, 2015.

5.
CYBIS, G. B.; LEMEY, PHILIPPE ; SINSHEIMER, J. S. ; SUCHARD, A. M. . Multivariate phylogenetic latent liability model. In: ISBA World Meeting, 2014, Cancun, México. International Society for Bayesian Analysis. World Meeting (2014 jul. 14-18 : Cancún, México). Scientific Program, 2014.

6.
CYBIS, G. B.. Vigilância global da gripe e a filodinâmica Bayesiana. In: Semana Acadêmica do Departamento de Estatística da Universidade Federal do Rio Grande do Sul, 2014, Porto Alegre, RS. Anais : IV Semanística, 2014.

7.
CYBIS, G. B.; LEMEY, P. ; SINSHEIMER, J. S. ; SUCHARD, A. M. . A Phylogenetic Latent Liability Model for Assessing Correlations in Phenotype Evolution. In: Joint Statistical Meetings, 2013, Montreal, Canadá. Proceedings, 2013.

8.
CYBIS, G. B.; SINSHEIMER, J. S. ; SUCHARD, A. M. . Bayesian Hierarchical Graph models for Phylogeography. In: Joint Statistical Meetings, 2012, San Diego, USA. Proceedings, 2012.

9.
CYBIS, G. B.; BEDFORD, TREVOR ; SINSHEIMER, J. S. ; SUCHARD, A. M. . Bayesian Nonparametric Clustering in Phylogenetics: Modeling Antigenic Evolution in Influenza.. In: ISBA World Meeting, 2012, Kyoto, Japão. International Society for Bayesian Analysis World Meeting Scientific Program, 2012.

10.
CYBIS, G. B.; PINHEIRO, H. P. ; LOPES, S. . Poder do Teste da Razão de Verossimilhança em Sequências de DNA. In: Simpósio Nacional de Probabilidade e Estatística, 2009, Estância de São Pedro, SP. Resumos, 2009.

11.
CYBIS, G. B.. Teste da Razão de Verossimilhança para Modelos de Substituição de Bases do DNA. In: XIX Salão de Iniciação Científica, 2007, Porto Alegre, RS. Livro de Resumos / XIX Salão de Iniciação Científica. Porto Alegre: UFRGS, 2007. v. 1. p. 88.

12.
CYBIS, G. B.. Teste da Razão de Máxima Verossimilhança para Modelos de Substituição de Bases do DNA. In: XVIII Salão de Iniciação Científica, 2006, Porto Alegre, RS. Livro de Resumos / XVIII Salão de Iniciação Científica. Porto Alegre: UFRGS, 2006. v. 1. p. 118.

Apresentações de Trabalho
1.
CYBIS, G. B.. Modeling of complex data: Identification of new variability in Influenza though a Bayesian non-parametric clustering model. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

2.
CYBIS, G. B.. A Bayesian Non Parametric Model for the Characterization and Clustering of Antigenic Variability in Influenza.. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

3.
Wendt V ; CYBIS, G. B. . Estudo da estimação de correlações entre variáveis fenotípicas pelo modelo de Variável Latente. 2016. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

4.
Valk, M ; CYBIS, G. B. ; LOPES, S. . U-statistics based inference in clustering analysis for genetic data. 2016. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

5.
CYBIS, G. B.. Métodos filogenéticos para correlações evolutivas. 2016. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

6.
CYBIS, G. B.. Estimating evolutionary correlation between multiple data types through the phylogenetic latent liability model. 2015. (Apresentação de Trabalho/Outra).

7.
CYBIS, G. B.. Exploring phylogeography through graph hierarchies.. 2015. (Apresentação de Trabalho/Outra).

8.
CYBIS, G. B.. Phylodynamics : integrating multiple sources of data to understand epidemics.. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

9.
CYBIS, G. B.; SUCHARD, A. M. . Multivariate phylogenetic latent liability model. 2014. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

10.
CYBIS, G. B.. Vigilância global da gripe e a filodinâmica Bayesiana. 2014. (Apresentação de Trabalho/Outra).

11.
CYBIS, G. B.; SINSHEIMER, J. S. ; SUCHARD, M. A. . Bayesian Hierarchical Graph models for Phylogeography. In: Joint Statistical Meetings. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

12.
CYBIS, G. B.; BEDFORD, TREVOR ; SINSHEIMER, J. S. ; SUCHARD, A. M. . Bayesian Nonparametric Clustering in Phylogenetics: Modeling Antigenic Evolution in Influenza. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

13.
CYBIS, G. B.; SINSHEIMER, J. S. ; SUCHARD, M. A. . Family-Style Chinese Restaurant Process: Modeling Antigenic Evolution in Influenza.. 2012. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

14.
LOPES, S. ; CYBIS, G. B. . Teste da Razão de Máxima Verossimilhança para Modelos de Substituição de Bases do DNA. 2007. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

15.
CYBIS, G. B.. Teste da Razão de Verossimilhança para Modelos de Substituição de Bases do DNA. 2007. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

16.
CYBIS, G. B.; LOPES, S. . Teste da Razão de Verossimilhança Para Modelos de Substituição de bases do DNA. 2006. (Apresentação de Trabalho/Outra).

Outras produções bibliográficas
1.
REALES, G. ; PAIXAO-CORTES, V. R. ; CYBIS, G. B. ; GONCALVES, G. L. ; PISSINATTI, A. ; SALZANO, F. M. ; BORTOLINI, M. C. . Serotonin, behavior, and natural selection in New World monkeys 2018 (Artigo aceito para publicação no Journal of Evolutionary Biology).

2.
Valk, M ; CYBIS, G. B. . U-statistical inference for hierarchical clustering 2018 (Artigo submetido para publicação, disponível no Arxiv).

3.
CYBIS, G. B.. Phenotypic Bayesian phylodynamics : hierarchical graph models, antigenic clustering and latent liabilities.. Biomathematics Graduate Program, UCLA, 2014 (Tese de Doutorado).

4.
CYBIS, G. B.. Teste da Razão de Verossimilhança e seu Poder em Árvores Filogenéticas. Programa de pós-Graduação em Matemática, UFRGS, 2009 (Dissertação de Mestrado).

5.
CYBIS, G. B.. Dinâmica de Hemócitos cirvulantes em Larvas de Chrysomya megacephala. Ciências Biológicas, UFRGS, 2007 (Trabalho de Conclusão de Curso de Graduação).



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Teses de doutorado
1.
PUMI, G; PRASS T.S.; SOUZA R.M.; CYBIS, G. B.. Participação em banca de Cleonis Viater Figueira. Modelos paramétricos para dados categóricos. 2015. Tese (Doutorado em Pós-Graduação em Matemática) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Trabalhos de conclusão de curso de graduação
1.
CYBIS, G. B.. Participação em banca de Jacson Gabriel Feiten.Envelhecimento e teoria da informação integrada: Análise da teoria da regulação gênica em ratos. 2018. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Bioláogicas) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

2.
CYBIS, G. B.. Participação em banca de Lucas B Schmidt.Estimação de Máxima Verossimilhança em Processos AR(P)-Sa(0,Gama,0). 2014. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Estatística) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

3.
CYBIS, G. B.. Participação em banca de Elton Gonçalves.Estimação de Processos Estocásticos advindos da solução da equação de Langevin. 2014. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Estatística) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.




Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
5th Porto Alegre Biological Evolution Workshop. 2015. (Oficina).

2.
International Society for Bayesian Analysis. Bayesian Nonparametric Clustering in Phylogenetics: Modeling Antrigenic Evolution in Influenza. 2012. (Congresso).

3.
Joint statistica meetings. Bayesian hierarchical graph models for phylogeography. 2012. (Congresso).

4.
X Simpósio Brasileiro de Bioinformática.Family-Style Chinese Restaurant Process. 2012. (Simpósio).

5.
27o Colóquio Brasileiro de Matemática.Poder do teste da razão de máxima verossimilhança para evolução de DNA. 2009. (Simpósio).

6.
26o. Colóquio Brasileiro de Matemática. 2007. (Congresso).

7.
Workshop on Mathematical Methods and Modeling of Biophysical Phenomena. 2007. (Congresso).

8.
Workshop in Mathematical Methods and Modeling of Biophysical Phenomena. 2006. (Congresso).

9.
X Brazilian School of Probability and 69 Annual Scientific Meeting of the Institute of Mathematical Statistics. 2006. (Simpósio).

10.
Workshop on Mathematical Methods and Modeling Biophisical Phenomena. 2005. (Congresso).

11.
XXV Congresso da Sociedade Brasileira de Computação. 2005. (Congresso).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
WERNER, L. ; Valk, M ; CYBIS, G. B. ; PUMI, G. ; BISOGNIN, C. ; FLORES, J. H. . 22o Simpósio Nacional de Probabilidade e Estatística. 2016. (Congresso).



Orientações



Orientações e supervisões em andamento
Iniciação científica
1.
LAUREN REGINA ALVES VIEIRA. Estudo de teste do fator de Bayes para o modelo filogenático de variável latente. Início: 2016. Iniciação científica (Graduando em Estatística) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul. (Orientador).


Orientações e supervisões concluídas
Iniciação científica
1.
GUILHERME RODRIGUES BOFF. Similaridade e Classificação de Sequencias de DNA Advindas de Arvore Filogeneticas - U estatísticas. 2017. Iniciação Científica. (Graduando em Estatística) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Gabriela Bettella Cybis.

2.
RODRIGO ALAN KOCH. Simulação estocástica dos efeitos de terapias sobre a diversidade tumoral. 2017. Iniciação Científica. (Graduando em Estatística) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul. Orientador: Gabriela Bettella Cybis.

3.
VITÓRIA MARIA MARTINI WENDT. Estudo de simulação do modelo de variável latente filogenético. 2016. Iniciação Científica. (Graduando em Estatística) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul. Orientador: Gabriela Bettella Cybis.



Educação e Popularização de C & T



Textos em jornais de notícias/revistas
1.
CYBIS, G. B.. What can data science tell us about influenza?. The Global Scientist, 03 nov. 2014.




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