José Fernando Ruggiero Bachega

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  • Última atualização do currículo em 10/01/2019

Possui graduação em Química fundamental pela Universidade de São Paulo (2004), mestrado em Física aplicada (opção: Física Biomolecular) pela Universidade de São Paulo (2008) e doutorado em Física Aplicada (opção: Física Biomolecular) pela Universidade de São Paulo (2013). Tem experiência na área de biologia estrutural, com ênfase em cristalografia de proteínas e modelagem molecular. Atualmente é professor da Universidade Federal de Ciências da Saúde de Porto Alegre (UFCSPA). (Texto informado pelo autor)


Identificação
Nome
José Fernando Ruggiero Bachega
Nome em citações bibliográficas
BACHEGA, J. F. R.;Bachega, J. F. R.;Bachega, Jose Fernando Ruggiero;BACHEGA, JOSÉ FERNANDO R.;BACHEGA, JOSÉ FERNANDO RUGUIERO;BACHEGA, JOSÉ FERNANDO RUGGIERO;RUGGIERO BACHEGA, JOSÉ FERNANDO;BACHEGA, JOSÉ F.R.;BACHEGA, JOSÉ F.R.;RUGGIERO BACHEGA, JOSE FERNANDO

Endereço
Endereço Profissional
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Centro de Biotecnologia.
AC Campus UFRGS
Agronomia
91501970 - Porto Alegre, RS - Brasil
Telefone: (51) 33203621
Ramal: 602
URL da Homepage: http://www.cbiot.ufrgs.br/index.php/pesquisadores/


Formação acadêmica/titulação
2008 - 2013
Doutorado em Doutorado em Fisica Aplicada.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Estrutura cristalográfica da hemoglobina gigante de Glossoscolex paulistus, um complexo de 3,6 mega Daltons, Ano de obtenção: 2013.
Orientador: Richard Chales Garratt.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Palavras-chave: Hemoglobinas; Eritrocruorina; Glossoscolex paulistus; Cristalografia.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
2005 - 2008
Mestrado em Fisica (Sc).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Estrutura cristalográfica da enzima superóxido dismutase de Trypanosoma brucei e análise da especificidade do metal incorporado por acoplamento estatístico.,Ano de Obtenção: 2008.
Orientador: Richard Charles Garratt.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Palavras-chave: Trypanosoma brucei; Superoxido Dismutase; FeSOD; Cristalografia de Proteínas.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Cristalografia de Proteínas.
2001 - 2004
Graduação em Bacharelado em Química fundamental.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Bolsista do(a): Secretaria de Educação Superior, SESU, Brasil.


Pós-doutorado
2017
Pós-Doutorado.
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas
2014 - 2016
Pós-Doutorado.
Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, PUCRS, Brasil.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio Grande do Sul, FAPERGS, Brasil.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
2013 interrompida
Pós-Doutorado.
Universidade Federal do Paraná, UFPR, Brasil.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Ano de interrupção: 2014


Formação Complementar
2014 - 2014
EMSB. (Carga horária: 32h).
Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.
2014 - 2014
Macromolecular Crystallography School 2014. (Carga horária: 64h).
Instituto de Física de São Carlos, IFSC, Brasil.
2013 - 2013
pDynamo Workshop & Molecular Simulation ? 2013. (Carga horária: 21h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2012 - 2012
Computer Simulation of Biomolecular Reactions. (Carga horária: 36h).
Pittsburgh Super Computer Center, PSC, Estados Unidos.
2010 - 2010
Dinâmica Molecular Básica. (Carga horária: 6h).
Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.
2010 - 2010
Cálculos Quânticos de Estruturas Eletrônica. (Carga horária: 6h).
Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.
2009 - 2009
Biophysics Course.. (Carga horária: 56h).
Latin American Postgraduate Program., LAPP, Brasil.
2009 - 2009
RapiData 2009- Collection and Structure Solving.. (Carga horária: 40h).
Brookhaven National Laboratory, BNL, Estados Unidos.
2008 - 2008
EMSB. (Carga horária: 40h).
Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.
2001 - 2001
Introdução à Química Forense. (Carga horária: 8h).
Universidade Federal de São Carlos, UFSCAR, Brasil.
2001 - 2001
Introdução aos Polímeros Condutores. (Carga horária: 8h).
Universidade Federal de São Carlos, UFSCAR, Brasil.


Atuação Profissional

Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, PUCRS, Brasil.
Vínculo institucional

2014 - 2016
Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Voluntário, Carga horária: 8

Atividades

05/2014 - 05/2016
Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação
Disciplinas ministradas
Bioinformática 4611B-06
05/2014 - 05/2016
Ensino, Programa de Pós- Graduação Mestrado Profissional em Biotecnologia Farmacêut, Nível: Pós-Graduação
Disciplinas ministradas
Desenho de Fármacos e Modelagem Molecular - 66016-02
05/2014 - 05/2016
Ensino, Ciência da Computação, Nível: Pós-Graduação
Disciplinas ministradas
Bioinformática 73125-04

Fundação Universidade Federal de Ciências da Saúde de Porto Alegre, UFCSPA, Brasil.
Vínculo institucional

2018 - Atual
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor adjunto A1, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

2017 - 2017
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Prof. Substituto, Carga horária: 40

Atividades

03/2019 - Atual
Ensino, Química Medicinal, Nível: Graduação
Disciplinas ministradas
Química Quântica
03/2019 - Atual
Ensino, Química Medicinal, Nível: Graduação
Disciplinas ministradas
Química Computacional
03/2019 - Atual
Ensino, Tecnologia em Alimentos, Nível: Graduação
Disciplinas ministradas
Química Geral
03/2019 - Atual
Ensino, Tecnologia em Alimentos, Nível: Graduação
Disciplinas ministradas
Introdução ao Laboratório
08/2018 - 12/2018
Ensino, Tecnologia em Alimentos, Nível: Graduação
Disciplinas ministradas
Físico-Química
08/2018 - 12/2018
Ensino, Farmácia, Nível: Graduação
Disciplinas ministradas
Laboratório de Química Geral
08/2018 - 12/2018
Ensino, Química Medicinal, Nível: Graduação
Disciplinas ministradas
Físico-Química III
01/2017 - 07/2017
Ensino, Toxicologia Analítica, Nível: Graduação
Disciplinas ministradas
Métodos em Química Orgânica
01/2017 - 07/2017
Ensino, Nutrição, Nível: Graduação
Disciplinas ministradas
Química Aplicada à Nutrição
01/2017 - 07/2017
Ensino, Tecnologia em Alimentos, Nível: Graduação
Disciplinas ministradas
Introdução ao Laboratório
01/2017 - 07/2017
Ensino, Tecnologia em Alimentos, Nível: Graduação
Disciplinas ministradas
Química Geral


Áreas de atuação
1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Química de Macromoléculas/Especialidade: Proteínas.
2.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Modelagem molecular.
3.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Cristalografia de Proteínas.
4.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Química de Macromoléculas.
5.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Química.


Idiomas
Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.
Espanhol
Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.


Produções

Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
GALVAO FERRARINI, MARIANA2018GALVAO FERRARINI, MARIANA ; MUCHA, SCHEILA GABRIELE ; PARROT, DELPHINE ; MEIFFREIN, GUILLAUME ; RUGGIERO BACHEGA, JOSE FERNANDO ; COMTE, GILLES ; ZAHA, ARNALDO ; SAGOT, MARIE-FRANCE . Hydrogen peroxide production and myo-inositol metabolism as important traits for virulence of Mycoplasma hyopneumoniae. MOLECULAR MICROBIOLOGY, v. 00, p. 10.1111/mmi.139-14, 2018.

2.
DALBERTO, PEDRO FERRARI2017DALBERTO, PEDRO FERRARI ; MARTINELLI, LEONARDO KRAS BORGES ; Bachega, Jose Fernando Ruggiero ; TIMMERS, LUIS FERNANDO SARAIVA MACEDO ; PINTO, ANTONIO FREDERICO MICHEL ; DADDA, ADILIO DA SILVA ; PETERSEN, GUILHERME OLIVEIRA ; SUBTIL, FERNANDA TEIXEIRA ; GALINA, LUIZA ; VILLELA, ANNE DRUMOND ; PISSINATE, KENIA ; MACHADO, PABLO ; BIZARRO, CRISTIANO VALIM ; DE SOUZA, OSMAR NORBERTO ; DE CARVALHO FILHO, EDGAR MARCELINO ; BASSO, LUIZ AUGUSTO ; SANTOS, DIOGENES SANTIAGO . Thermodynamics, functional and structural characterization of inosine-uridine nucleoside hydrolase from Leishmania braziliensis. RSC Advances, v. 7, p. 48861-48875, 2017.

3.
ROESSLER, CHRISTIAN G.2016ROESSLER, CHRISTIAN G. AGARWAL, RAKHI ALLAIRE, MARC ALONSO-MORI, ROBERTO ANDI, BABAK BACHEGA, JOSÉ F.R. BOMMER, MARTIN BREWSTER, AARON S. BROWNE, MICHAEL C. CHATTERJEE, RUCHIRA CHO, EUNSUN COHEN, AINA E. COWAN, MATTHEW DATWANI, SAMMY DAVIDSON, VICTOR L. DEFEVER, JIM EATON, BRENT ELLSON, RICHARD FENG, YIPING GHISLAIN, LUCIEN P. GLOWNIA, JAMES M. HAN, GUANGYE HATTNE, JOHAN HELLMICH, JULIA HÉROUX, ANNIE , et al.IBRAHIM, MOHAMED KERN, JAN KUCZEWSKI, ANTHONY LEMKE, HENRIK T. LIU, PINGHUA MAJLOF, LARS MCCLINTOCK, WILLIAM M. MYERS, STUART NELSEN, SILKE OLECHNO, JOE ORVILLE, ALLEN M. SAUTER, NICHOLAS K. SOARES, ALEXEI S. SOLTIS, S. MICHAEL SONG, HENG STEARNS, RICHARD G. TRAN, ROSALIE TSAI, YINGSSU UERVIROJNANGKOORN, MONARIN WILMOT, CARRIE M. YACHANDRA, VITTAL YANO, JUNKO YUKL, ERIK T. ZHU, DILING ZOUNI, ATHINA ; Acoustic Injectors for Drop-On-Demand Serial Femtosecond Crystallography. Structure (London), v. 24, p. 631-640, 2016.

4.
CARUSO, CELIA S.2016CARUSO, CELIA S. ; BIAZIN, EZER ; CARVALHO, FRANCISCO A.O. ; TABAK, MARCEL ; BACHEGA, JOSÉ F.R. . Metals content of Glossoscolex paulistus extracellular hemoglobin: Its peroxidase activity and the importance of these ions in the protein stability. Journal of Inorganic Biochemistry, v. 161, p. 63-72, 2016.

5.
RUGGIERO BACHEGA, JOSÉ FERNANDO2015RUGGIERO BACHEGA, JOSÉ FERNANDO; VASCONCELOS MALUF, FERNANDO ; ANDI, BABAK ; D'MUNIZ PEREIRA, HUMBERTO ; FALSARELLA CARAZZOLLEA, MARCELO ; ORVILLE, ALLEN M. ; TABAK, MARCEL ; BRANDÃO-NETO, JOSÉ ; Garratt, Richard Charles ; HORJALES REBOREDO, EDUARDO . The structure of the giant haemoglobin from. Acta Crystallographica Section D Biological Crystallography, v. 71, p. 1257-1271, 2015.

6.
ROTTA, MARIANE2015ROTTA, MARIANE ; PISSINATE, KENIA ; VILLELA, ANNE DRUMOND ; BACK, DAVI FERNANDO ; TIMMERS, LUIS FERNANDO SARAIVA MACEDO ; BACHEGA, JOSÉ FERNANDO RUGGIERO ; DE SOUZA, OSMAR NORBERTO ; SANTOS, DIÓGENES SANTIAGO ; BASSO, LUIZ AUGUSTO ; MACHADO, PABLO . Piperazine derivatives: Synthesis, inhibition of the Mycobacterium tuberculosis enoyl-acyl carrier protein reductase and SAR studies. European Journal of Medicinal Chemistry, v. 90, p. 436-447, 2015.

7.
ROMANELLO, LARISSA2013ROMANELLO, LARISSA ; BACHEGA, JOSÉ FERNANDO RUGUIERO ; CASSAGO, ALEXANDRE ; BRANDÃO-NETO, JOSÉ ; DEMARCO, RICARDO ; Garratt, Richard Charles ; PEREIRA, HUMBERTO D'MUNIZ . Adenosine kinase from Schistosoma mansoni : structural basis for the differential incorporation of nucleoside analogues. Acta Crystallographica. Section D, Biological Crystallography, v. 69, p. 126-136, 2013.

8.
BACHEGA, JOSÉ FERNANDO R.2013BACHEGA, JOSÉ FERNANDO R.; TIMMERS, LUÍS FERNANDO S. M. ; ASSIRATI, LUCAS ; BACHEGA, LEONARDO R. ; FIELD, MARTIN J. ; WYMORE, TROY . GTKDynamo: A PyMOL plug-in for QC/MM hybrid potential simulations. Journal of Computational Chemistry, v. 34, p. 2190-2196, 2013.

9.
BACHEGA, J. F. R.;Bachega, J. F. R.;Bachega, Jose Fernando Ruggiero;BACHEGA, JOSÉ FERNANDO R.;BACHEGA, JOSÉ FERNANDO RUGUIERO;BACHEGA, JOSÉ FERNANDO RUGGIERO;RUGGIERO BACHEGA, JOSÉ FERNANDO;BACHEGA, JOSÉ F.R.;BACHEGA, JOSÉ F.R.;RUGGIERO BACHEGA, JOSE FERNANDO2011BACHEGA, J. F. R.; Bleicher, L. ; Horjales, E. R. ; Santiago, P. S. ; Garratt, R. C. ; Tabak, M. . Crystallization and preliminary structural analysis of the giant haemoglobin from Glossoscolex paulistus at 3.2 Å. Journal of Synchrotron Radiation, v. 18, p. 24-28, 2011.

10.
Bachega, Jose Fernando Ruggiero2009 Bachega, Jose Fernando Ruggiero; Navarro, Marcos Vicente Albuquerque Salles ; Bleicher, Lucas ; Bortoleto-Bugs, Raquel Kely ; Dive, Daniel ; Hoffmann, Pascal ; Viscogliosi, Eric ; Garratt, Richard Charles . Systematic structural studies of iron superoxide dismutases from human parasites and a statistical coupling analysis of metal binding specificity. Proteins (Online), v. 77, p. 26-37, 2009.

Capítulos de livros publicados
1.
Garratt, Richard C. ; Valadares, Napoleão Fonseca ; BACHEGA, JOSÉ FERNANDO RUGGIERO . Oligomeric Proteins. Encyclopedia of Biophysics. 1ed.: Springer Berlin Heidelberg, 2013, v. , p. 1781-1789.

2.
Tabak, M. ; CARVALHO F. A. ; CARVALHO, J. W. P. ; BACHEGA, J. F. R. ; Santiago, P. S. . Recent New Characterizations on the Giant Extracellular Hemoglobin of Glossoscolex paulistus and Some Other Giant Hemoglobins from Different Worms. In: Alessio Innocenti. (Org.). Stoichiometry and Research - The Importance of Quantity in Biomedicine.. Rijeka: , 2012, v. 1, p. 337-356.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
BACHEGA, JOSÉ FERNANDO RUGGIERO; TIMMERS, LUIS FERNANDO SARAIVA MACEDO ; WYMORE, TROY ; FIELD, MARTIN J. . GTKDynamo: Uma interface gráfica para simulações de potencial híbrido tipo QC/MM. In: Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos, 2014, Petrópolis. VII Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos, 2014.

2.
BACHEGA, JOSÉ FERNANDO RUGGIERO; HORJALES REBOREDO, EDUARDO ; Tabak, M. ; Garratt, Richard Charles . Preliminary Crystallographic Structure of Subunit D from the Giant Hemoglobin of Glossoscolex paulistus. In: The Brazilian Biochemistry and Molecular Biology Society - SBBQ, 2011, Foz do Iguaçu. The Brazilian Biochemistry and Molecular Biology Society - SBBQ, 2011.

3.
BACHEGA, JOSÉ FERNANDO RUGGIERO; Bleicher, Lucas ; TABAK, MARCEL ; HORJALES REBOREDO, EDUARDO ; Garratt, Richard Charles . Structural Studies and Sequencing of the Giant Hemoglobin from Glossoscolex paulistus. In: International Symposium on Diffraction Structural Biology, 2010, Orsay. 3rd International Symposium on Diffraction Structural Biology, 2010.

4.
BACHEGA, JOSÉ FERNANDO RUGUIERO; Bleicher, L. ; Horjales, E. R. ; Tabak, M. ; Garratt, R. C. . Crystallization and Preliminary Structural Analysis of the Giant Hemoglobin from Glossoscolex paulistus. In: INTERNATIONAL NETWORK OF PROTEIN ENGINEERING CENTERS, 2009, Intamanbuca. XVIII MEETING OF THE INTERNATIONAL NETWORK OF PROTEIN ENGINEERING CENTERS, 2009.

5.
BACHEGA, JOSÉ FERNANDO RUGGIERO; Bleicher, Lucas ; HORJALES REBOREDO, EDUARDO ; TABAK, MARCEL ; Garratt, Richard Charles . Preliminary Crystallizatiographic Structure of a Giant Hemoglobin from Glossoscolex paulistus. In: Iberoamerican Congress of Biophysiscs, 2009, Búsios. VII Iberoamerican Congress of Biophysiscs, 2009.

6.
BACHEGA, JOSÉ FERNANDO RUGGIERO; Bleicher, Lucas ; HORJALES REBOREDO, EDUARDO ; TABAK, MARCEL ; Garratt, Richard Charles . Workshop da Pós-graduação do IFSC. In: Estrutura cristalográfica da hemoglobina gigante do Glossoscolex paulistus, 2009, São Carlos. XIII Workshop da Pós-graduação do IFSC, 2009.

7.
Bachega, J. F. R.; Navarro, Marcos Vicente Albuquerque Salles ; Bleicher, Lucas ; Garratt, Richard Charles . Determination of a residues networks which determines the metal specificity in Fe/Mn Superoxide Dismutases. In: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2008, Águas de Lindóia. XXXVII Annual Meeting of the Brazilian Society of Biochemistry and Molecular Biology (SBBq).

8.
BACHEGA, JOSÉ FERNANDO RUGGIERO; Bleicher, L. ; Garratt, Richard Charles . Cystallization and Preliminary Studies of Iron-Superoxide Dismutase from Trypanosoma brucei. In: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBQ, 2006, Águas de Lindóia. Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBQ, 2006.

Apresentações de Trabalho
1.
BACHEGA, JOSÉ F.R.. Cristalografia de Proteínas e Modelagem Molecular. 2017. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

2.
BACHEGA, JOSÉ F.R.. Cristalografia de Proteínas. 2016. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

3.
Bachega, J. F. R.; TIMMERS, LUÍS FERNANDO S. M. . Modelagem de reações enzimáticas utilizando métodos híbridos (QC/MM). 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

4.
Bachega, J. F. R.; TIMMERS, LUÍS FERNANDO S. M. . GTKDynamo: a PyMOL plug-in for QC/MM hybrid potential simulations. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

5.
BACHEGA, JOSÉ FERNANDO RUGUIERO. QM/MM - Fundamentos e Aplicações em Sistemas Híbridos com pDynamo. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

6.
Bachega, J. F. R.. GTKDynamo:A graphical Interface for Hybrid Calculations. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).


Produção técnica
Programas de computador sem registro
1.
Bachega, J. F. R.; TIMMERS, LUÍS FERNANDO S. M. ; ASSIRATI, LUCAS ; BACHEGA, LEONARDO R. ; FIELD, MARTIN J. ; WYMORE, TROY . GTKDynamo: A PyMOL plug-in for QC/MM hybrid potential simulations. 2012.


Demais tipos de produção técnica
1.
BACHEGA, JOSÉ F.R.; TIMMERS, LUÍS FERNANDO S. M. . Cálculos híbridos (QM/MM) utilizando as ferramentas EasyHybrid/pDynamo. 2016. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

2.
BACHEGA, J. F. R.; TIMMERS, LUÍS FERNANDO S. M. . Modelagem de reações enzimáticas utilizando métodos híbridos (QC/MM). 2013. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).



Bancas

Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
BACHEGA, JOSÉ F.R.; THOMPSON, C. E.; SOUZA, K. C. B.; CACERES, R. A.. Participação em banca de Roger Kist. Triagem virtual de potenciais inibidores para o complexo enzimático mTOR (mechanistic target of rapamycin) empregando moedelos farmacofóricos. 2018. Dissertação (Mestrado em Ciências da Saúde) - Fundação Universidade Federal de Ciências da Saúde de Porto Alegre.

2.
BACHEGA, JOSÉ FERNANDO RUGUIERO. Participação em banca de Fausto Koga de Oliveira. Modelagem computacional das proteínas HSERO_0935, HSERO_1880, HSERO_2698, HSERO_2855 e HSERO_2872 de Herbaspirillun seropedicae SMR1 utilizando o servidor I-Tasser,,. 2014. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Paraná.

Teses de doutorado
1.
BACHEGA, JOSÉ F.R.; SILVA, C. G. R.; EL-BACHA, R. S.; BENEVIDES, R. G.. Participação em banca de Camila Carane Bitencourt Brito. Caracterização bioquímica de potenciais inibidores da enzima superóxido dismutase de leishmania braziliensis. 2018. Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia) - Universidade Estadual de Feira de Santana.

2.
BACHEGA, JOSÉ F.R.; STASSEN, H. K.; NETZ, P. A.; LIVOTTO, P. R.; LASCHUCK, E. F.. Participação em banca de Chiara Valsecchi. Estudos Teóricos de Pares Iônicos a Base de Imidazol em Nível atomístico e coarse-grained em Solução e Membranas Biológicas. 2018. Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Química) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

3.
BACHEGA, JOSÉ FERNANDO RUGUIERO; CHAHINE ,Chahine J.; OLIVEIRA, R. J.; SLADE, G. G.; MORAES, F. R.. Participação em banca de Luciane Sussuchi da Silva. Estudos Computacionais de Esfingomielinases D: Docking, Dinâmica Molecular e Métodos Híbridos QM/MM. 2015. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Qualificações de Doutorado
1.
NETZ, P. A.; LIVOTTO, P. R.; STASSEN, H. K.; BACHEGA, JOSÉ F.R.. Participação em banca de Chiara Valsecchi. Estudos Teóricos de Pares Iônicos a Base de Imidazol em Nível atomístico e coarse-grained em Solução e Membranas Biológicas. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Programa de Pós-Graduação em Química) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.



Participação em bancas de comissões julgadoras
Avaliação de cursos
1.
BACHEGA, JOSÉ F.R.; THOMPSON, C. E.. Informática II - Biomedicina Noturno. 2017. Fundação Universidade Federal de Ciências da Saúde de Porto Alegre.

2.
THOMPSON, C. E.; BACHEGA, JOSÉ F.R.. Informática II - Biomedicina Integral. 2017. Fundação Universidade Federal de Ciências da Saúde de Porto Alegre.



Eventos

Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
VII Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos.GTKDynamo: Uma interface gráfica para simulações de potencial híbrido tipo QC/MM. 2014. (Outra).

2.
pDynamo Workshop & Molecular Simulation ? 2013.GTKDynamo: a PyMOL plug-in for QC/MM hybrid potential simulations. 2013. (Oficina).

3.
SEMANA INTEGRADA DO INSTITUTO DE FÍSICA DE SÃO CARLOS.Modelagem de reações enzimáticas utilizando métodos híbridos (QC/MM). 2013. (Encontro).

4.
Computer Simulation of Biomolecular Dynamics and Reactions.GTKDynamo: A graphical Interface for Hybrid Calculations. 2012. (Oficina).

5.
XL Annual Meeting of the Brazilian Biochemistry and Molecular Biology Society - SBBq..Preliminary Crystallographic Structure of Subunit D from the Giant Hemoglobin of Glossoscolex paulistus.. 2011. (Encontro).

6.
3rd International Symposium Diffraction Structural Biology.Structural Studies and Sequencing of the Giant Heamoglobin from Glossoscolex paulistus. 2010. (Simpósio).

7.
VII Iberoamerican Congress of Biophysics 2009. Preliminary crystallograpric structure of a giant hemoglobin from glossoscolex paulistus. 2009. (Congresso).

8.
XVIII - INPEC.Crystalization and Preliminary structural Anaysis of the Giant Hemoglobin from Glossoscolex paulistus. 2009. (Encontro).

9.
Sociedade Brasileira de Bioquimica. Determination of a residues network which determines the metal specificity in Fe/Mn superoxide dismutases.. 2008. (Congresso).

10.
Workshop da Pós-graduação em Física do Intituto de Física de São Carlos. 2007. (Oficina).

11.
Sociedade Brasileira de Bioquímica. Resolução da Estrutura Cristalográfica da Superoxido Dismutase de T.brucei.. 2006. (Congresso).

12.
Workshop de pós-graduação.Resolução da Estrutura Cristalográfica da FeSOD de T.brucei e comparação com FeSODs de outros parasitas.. 2006. (Simpósio).

13.
Workshop de pós-graduação.Estudos estruturais de Septinas. 2005. (Simpósio).

14.
I Simpósio de Iniciação Científica PET.Isolamento e caracterização espectroscópica dos componentes majoritários do photogem. 2004. (Simpósio).

15.
Simpósio de Iniciação Científica PET - I SIcPET.Isolamento e caracterização espectroscópica dos componentes majoritários do photogem. 2004. (Simpósio).

16.
Encontro dos Grupo PET da USP. 2003. (Encontro).

17.
Feira de Profissões da USP. Curso de Química do IQSC. 2003. (Feira).

18.
III Sudeste PET. 2003. (Encontro).

19.
XIV Encontro regional da Sociedade Brasileira de Química. 2003. (Encontro).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
BACHEGA, J. F. R.; Marco A. Sanchez . I SIcPET. 2004. (Congresso).



Orientações

Orientações e supervisões concluídas
Dissertação de mestrado
1.
Osmar Norberto de Souza. Determinação de energia livre de ligação por métodos in silico para ligantes da enzima InhA (EC 1.3.1.9) de Mycobacterium tuberculosis. 2016. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós- Graduação Mestrado Profissional em Biotecnologia Farmacêut) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Coorientador: José Fernando Ruggiero Bachega.



Educação e Popularização de C & T

Apresentações de Trabalho
1.
Bachega, J. F. R.; TIMMERS, LUÍS FERNANDO S. M. . Modelagem de reações enzimáticas utilizando métodos híbridos (QC/MM). 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).




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