Victor Emanoel Armini Caldas

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  • Última atualização do currículo em 24/08/2016


Pesquisador em biofísica na Universidade de Amsterdam e no Insituto de Fisica Atomica e Molecular (AMOLF). Tenho interesse na interface entre física e biologia, com foco do desenvolvimento de tecnologias para análise de sistemas complexos a partir de imagens e microscopia. Atualmente trabalho com padrões de forrageamento (foraging patterns) e estrutura e coneções de redes em micorriza. Outros projetos involvem o desenvolvimento de dispositivos de microfluídica e programaçãoem código aberto para análise de imagens. Possui doutorado pela Universisidade de Groningen (Países Baixos - 2016) onde desenvolvi técnicas de microscopia de fluorescência para estudar o comportamento de proteínas envolvidas no reparo de DNA e maquinaria de replicação em procariotos. Ainda, possuo graduação em Ciências Físicas e Biomoleculares pela Universidade de São Paulo (2009) e mestrado em Fisica ? Física Biomolecular pela Universidade de São Paulo (2011). (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Victor Emanoel Armini Caldas
Nome em citações bibliográficas
CALDAS, V. E. A.;CALDAS, V.E.A.;CALDAS, VICTOR EMANOEL ARMINI;CALDAS, VICTOR E.A.;CALDAS, VICTOR E. A.

Endereço


Endereço Profissional
Vrije Universiteit Amsterdam.
De Boelelaan 1085,
Buitenveldert-West
1081HV - Amsterdam, - Holanda
Telefone: (064) 8612901
URL da Homepage: http://victorcaldas.com


Formação acadêmica/titulação


2011 - 2015
Doutorado em Biofísica.
University of Groningen, RUG, Holanda.
Título: Single-Molecule studies on DNA replication machinery, Ano de obtenção: 2016.
Orientador: Antoine van Oijen.
Coorientador: Andrew Robinson.
Bolsista do(a): Nederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk Onderzoek, NWO, Holanda.
Palavras-chave: Biofísica; Molécula única; DNA replication.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular.
2010 - 2011
Mestrado em Física.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Estudos cinéticos e estruturais da Adenosina Fosforibosil Transferase de Schistosoma mansoni,Ano de Obtenção: 2011.
Orientador: Otavio Henrique Thiemann.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Palavras-chave: Biofísica; DNA repair; Biologia Molecular Estrutural.
Grande área: Ciências Biológicas
2006 - 2009
Graduação em Ciências Físicas e Biomoleculares.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.


Pós-doutorado


2016
Pós-Doutorado.
Vrije Universiteit, VU, Holanda.
Bolsista do(a): European Research Council, ERC, Holanda.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: MIcroscopy.


Formação Complementar


2014 - 2014
Dresden Summer School in Systems Biology. (Carga horária: 55h).
Center for Systems Biology Dresden, CSBD, Alemanha.
2009 - 2009
Workshop - Biofísica Quimica. (Carga horária: 5h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2007 - 2007
Extensão universitária em Genômica, Proteômica e Células-tronco. (Carga horária: 6h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2007 - 2007
I Curso de Inverno de Bioinformática. (Carga horária: 35h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2006 - 2006
Extensão universitária em Fisiologia Humana Avançada Aplicada à pesquisas ... (Carga horária: 30h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.


Atuação Profissional



University of Groningen, RUG, Holanda.
Vínculo institucional

2011 - 2015
Vínculo: PhD Assistant, Enquadramento Funcional: PhD Assistant, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

10/2011 - 2/2012
Ensino, Biofísica Molecular, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Monitor - Biofísica Molecular

Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Vínculo institucional

2010 - 2011
Vínculo: Mestrado em Física Aplicada, Enquadramento Funcional: Aluno, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

2006 - 2010
Vínculo: Iniciação Científica, Enquadramento Funcional: Aluno, Carga horária: 20
Outras informações
Estágio no laboratório de Cristalografia sob orientação do Prof. Dr. Otávio H. Thiemann

Atividades

06/2008 - 08/2011
Estágios , Instituto de Física de São Carlos, Departamento de Física e Ciência Interdisciplinar.

Estágio realizado
Estudos Cinéticos e Estrtuturais das proteinas Adenosina Desaminase (ADA) e Fosfo-Ribosil Trasnferase ( APRT) de Schistosoma mansoni.
06/2010 - 12/2010
Ensino, Química, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Estágio PAE - Física Geral para Químicos
03/2010 - 06/2010
Ensino, Ciências Físicas e Biomoleculares, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Monitoria - Física Moderna
Física Moderna
05/2006 - 12/2009
Estágios , Instituto de Física de São Carlos, Departamento de Física e Ciência Interdisciplinar.

Estágio realizado
Análise de diversidade microbiana e parâmetros ecológicos baseada em técnicas de Biologia Molecular estudando o gene 16S rDNA.

University of Illinois at Urbana-Champaign, UIUC, Estados Unidos.
Vínculo institucional

2008 - 2009
Vínculo: Visiting Scholar in Physics, Enquadramento Funcional: Visiting Scholar, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

12/2008 - 03/2009
Estágios , Institute for Genomic Biology e Loomis Lab (Dept. of Physics), .

Estágio realizado
Mechanism of membrane fusion induced by SNARE proteins using fluorescence based single vesicle methods. Orientação: Prof. Taekjip Ha.

Vrije Universiteit Amsterdam, VU, Holanda.
Vínculo institucional

2016 - Atual
Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Pesquisador, Carga horária: 38, Regime: Dedicação exclusiva.



Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Single Molecule Microscopy.
2.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Biofísica Molecular.
3.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Biologia Celular.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.
Português
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.


Prêmios e títulos


2011
Prêmio M. Issao, SBPqO - Sociedade Brasileira de Pesquisa Odontológica.
2008
Bolsa de Estudos, University of Illinois at Urbana-Champaign - Howard Hughes Medical Institute (UIUC/HHMI).


Produções



Produção bibliográfica
Citações

Web of Science
Total de trabalhos:5
Total de citações:7
Fator H:1
Caldas, Victor E.A.  Data: 07/02/2016

Artigos completos publicados em periódicos

1.
2ROBINSON, ANDREW2015ROBINSON, ANDREW ; MCDONALD, JOHN P. ; CALDAS, VICTOR E. A. ; PATEL, MEGHNA ; WOOD, ELIZABETH A. ; PUNTER, CHRISTIAAN M. ; GHODKE, HARSHAD ; COX, MICHAEL M. ; WOODGATE, ROGER ; GOODMAN, MYRON F. ; VAN OIJEN, ANTOINE M. . Regulation of Mutagenic DNA Polymerase V Activation in Space and Time. PLOS Genetics (Online), v. 11, p. e1005482, 2015.

2.
1CALDAS, VICTOR E. A.2015CALDAS, VICTOR E. A.; PUNTER, CHRISTIAAN M. ; GHODKE, HARSHAD ; ROBINSON, ANDREW ; VAN OIJEN, ANTOINE M. . iSBatch: a batch-processing platform for data analysis and exploration of live-cell single-molecule microscopy images and other hierarchical datasets. Molecular Biosystems (Print), v. 11, p. 2699-2708, 2015.

3.
3POZZI, ELOISA2014POZZI, ELOISA ; MEGDA, CLAUDIA REGINA ; CALDAS, VICTOR E.A. ; DAMIANOVIC, MÁRCIA ; PIRES, EDUARDO CLETO . Microbial population in an aerated thermophilic reactor that treats recycled cardboard plant wastewater. Journal of Water Process Engineering, v. 4, p. 74-81, 2014.

4.
4Del Nery, V.2013 Del Nery, V. ; DAMIANOVIC, M.H.Z. ; Pozzi, E. ; DE NARDI, I.R. ; CALDAS, V. E. A. ; PIRES, E.C. . Long-term performance and operational strategies of a poultry slaughterhouse waste stabilization pond system in a tropical climate. Resources, Conservation and Recycling, v. 71, p. 7-14, 2013.

5.
5DA SILVA, M.T.A.2013DA SILVA, M.T.A. ; CALDAS, V.E.A. ; COSTA, F.C. ; SILVESTRE, D.A.M.M. ; THIEMANN, O.H. . Selenocysteine Biosynthesis and Insertion Machinery in Naegleria gruberi. Molecular and Biochemical Parasitology (Print), v. 188, p. 87/7-90, 2013.

6.
6SERRÃO, VITOR HUGO BALASCO2011SERRÃO, VITOR HUGO BALASCO ; ALESSANDRO, FERNANDO ; CALDAS, VICTOR EMANOEL ARMINI ; MARÇAL, RAFAELA LEITE ; D'MUNIZ PEREIRA, HUMBERTO ; THIEMANN, OTAVIO HENRIQUE ; GARRATT, RICHARD CHARLES . Promiscuous interactions of human septins: The GTP binding domain of SEPT7 forms filaments within the crystal. FEBS Letters (Print), v. 585, p. 3868-3873, 2011.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
CALDAS, V. E. A.; Alessandro, F ; Thiemann, O H . Study of microbial diversity of brazilian savanna conserved regions and a eucalyptus culture. In: XXXVII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2008, Águas de Lindóia - SP. Program and Index, 2008. v. 16. p. 133.

Artigos aceitos para publicação
1.
GHODKE, HARSHAD ; CALDAS, V. E. A. ; PUNTER, CHRISTIAAN M. ; VAN OIJEN, ANTOINE M. ; ROBINSON, ANDREW . Single-Molecule Specific Mislocalization of Red Fluorescent Proteins in Live Escherichia coli. Biophysical Journal (Print), 2016.

Apresentações de Trabalho
1.
CALDAS, R.A. ; CALDAS, V. E. A. ; PRADO, F.B. ; Groppo, FC ; CARIA, P.H.F. ; DARUGE JUNIOR, E. . Aplicação de métodos estatísticos e redes neurais em dados morfométricos da abertura piriforme e ossos nasais e sua importância forense. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

2.
Del Nery, V. ; Pozzi, E. ; Danianovic, M. ; CALDAS, V. E. A. ; Pires, E. . Caracterização das comunidades microbianas em lagoa facultativa em sobrecarga orgânica de um sistema de tratamento de água residuária de abaterouro de aves. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

3.
Megda, C. R. ; Pozzi, E. ; CALDAS, V. E. A. ; Pires, E. . Tratamento aeróbio termofílico de água residuária de industria de embalagem de papel em reator de leito móvel - desempenho e populações microbianas. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

4.
CALDAS, V. E. A.; Alessandro, F ; Thiemann, O H . Study of microbial diversity of brazilian savanna conserved regions and a eucalyptus culture. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).


Produção técnica
Redes sociais, websites e blogs
1.
CALDAS, V. E. A.. To leave or not to leave: O não tão complicado mundo da pós-graduação no exterior. 2013; Tema: Pós-graduação no exterior em seus diversos aspectos. (Blog).


Demais tipos de produção técnica


Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
Gordon Conference - Single Molecule Approaches to Biology. Single Molecule imaging of the SOS responde: tracking the DNA polymerases in live E. coli cells. 2012. (Congresso).

2.
XXVI Annual Meeting of Brazilian Society for Protozoology. Selenocysteine Incorporation Machinery in Naegleria gruberi. 2010. (Congresso).

3.
XXXVII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq) e XI Reunião da Panamerican Association for Biochemistry and Molecular Biology (PABMB). Study of Microbial Diversity of Brazilian Savanna Conserver Regions and a Eucalyptus Culture. 2008. (Congresso).

4.
I Escola de Física Computacional Moderna. 2006. (Seminário).

5.
São Carlos Special Medicinal Chemistry Meeting. 2006. (Encontro).



Educação e Popularização de C & T



Redes sociais, websites e blogs
1.
CALDAS, V. E. A.. To leave or not to leave: O não tão complicado mundo da pós-graduação no exterior. 2013; Tema: Pós-graduação no exterior em seus diversos aspectos. (Blog).



Outras informações relevantes


1 - Monitor voluntário do stand do Instituto de Física de São Carlos em diversas feiras de profissões da Universidade de São Paulo (USP) e Universidade Estadual Paulista (UNESP).



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